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Update python/clusters-multicpu to the new API.
[simgrid.git] / docs / source / Installing_SimGrid.rst
index cb7ebd7357c672e543af752b9a7c0d872ae2c615..39cc872e8fff1e922f9ce5ff40a516c8825f8958 100644 (file)
@@ -43,6 +43,17 @@ email.
 .. _simgrid AUR package: https://aur.archlinux.org/packages/simgrid/
 .. _AUR official documentation: https://wiki.archlinux.org/title/Arch_User_Repository
 
 .. _simgrid AUR package: https://aur.archlinux.org/packages/simgrid/
 .. _AUR official documentation: https://wiki.archlinux.org/title/Arch_User_Repository
 
+Binaries from macOS
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+SimGrid can be found in the Homebrew package manager. Troubleshooting:
+
+warning: dylib (libsimgrid.dylib) was built for newer macOS version (14.0) than being linked (13.3)
+  This was reported with the SimGrid version from Homebrew on a Mac book air M1 (ARM).
+  The solution is simply to export this variable before the compilation of your binaries:
+
+  ``export MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET=14.0``
+
 .. _deprecation_policy:
 
 Version numbering and deprecation
 .. _deprecation_policy:
 
 Version numbering and deprecation
@@ -75,6 +86,8 @@ but that's even more so for these unreleased versions).
 Installing from the Source
 --------------------------
 
 Installing from the Source
 --------------------------
 
+.. _install_src_deps:
+
 Getting the Dependencies
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
 Getting the Dependencies
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
@@ -88,15 +101,26 @@ cmake (v3.5).
   ``ccmake`` provides a nicer graphical interface compared to ``cmake``.
   Press ``t`` in ``ccmake`` if you need to see absolutely all
   configuration options (e.g., if your Python installation is not standard).
   ``ccmake`` provides a nicer graphical interface compared to ``cmake``.
   Press ``t`` in ``ccmake`` if you need to see absolutely all
   configuration options (e.g., if your Python installation is not standard).
-boost (at least v1.48, v1.59 recommended)
-  - On Debian / Ubuntu: ``apt install libboost-dev libboost-context-dev``
+boost mandatory components (at least v1.48, v1.59 recommended)
+  - On Debian / Ubuntu: ``apt install libboost-dev``
   - On CentOS / Fedora: ``dnf install boost-devel``
   - On macOS with homebrew: ``brew install boost``
   - On CentOS / Fedora: ``dnf install boost-devel``
   - On macOS with homebrew: ``brew install boost``
+boost recommended components (optional).
+  - boost-context may be used instead of our own fast context switching code which only works on amd64.
+  - boost-stacktrace is used to get nice stacktraces on errors in SimGrid.
+  - On Debian / Ubuntu: ``apt install libboost-context-dev libboost-stacktrace-dev``
+python bindings (optional):
+  - On Debian / Ubuntu: ``apt install pybind11-dev python3-dev``
+Model-checking mandatory dependencies
+  - On Debian / Ubuntu: ``apt install libevent-dev``
 Eigen3 (optional)
   - On Debian / Ubuntu: ``apt install libeigen3-dev``
   - On CentOS / Fedora: ``dnf install eigen3-devel``
   - On macOS with homebrew: ``brew install eigen``
 Eigen3 (optional)
   - On Debian / Ubuntu: ``apt install libeigen3-dev``
   - On CentOS / Fedora: ``dnf install eigen3-devel``
   - On macOS with homebrew: ``brew install eigen``
-  - Use EIGEN3_HINT to specify where it's installed if cmake doesn't find it automatically.
+  - Use EIGEN3_HINT to specify where it's installed if cmake doesn't find it automatically. Set EIGEN3_HINT=OFF to disable detection even if it could be found.
+JSON (optional, for the DAG wfcommons loader)
+  - On Debian / Ubuntu: ``apt install nlohmann-json3-dev``
+  - Use nlohmann_json_HINT to specify where it's installed if cmake doesn't find it automatically.
 
 For platform-specific details, please see below.
 
 
 For platform-specific details, please see below.
 
@@ -182,7 +206,7 @@ Note that the dot at the end is mandatory (see :ref:`install_cmake_outsrc`).
 
 .. code-block:: console
 
 
 .. code-block:: console
 
-   $ cmake -DCC=clang -DCXX=clang++ .
+   $ cmake -DCMAKE_C_COMPILER=clang -DCMAKE_CXX_COMPILER=clang++ .
 
 SimGrid compilation options
 """""""""""""""""""""""""""
 
 SimGrid compilation options
 """""""""""""""""""""""""""
@@ -228,10 +252,9 @@ enable_mallocators (ON/off)
   Activates our internal memory caching mechanism. This produces faster
   code, but it may fool the debuggers.
 
   Activates our internal memory caching mechanism. This produces faster
   code, but it may fool the debuggers.
 
-enable_model-checking (on/OFF)
-  Activates the formal verification mode. This will **hinder
-  simulation speed** even when the model checker is not activated at
-  run time.
+enable_model-checking (ON/off)
+  Activates the verification mode. This should not impact the performance of your simulations if you build it but don't use it,
+  but you can still disable it to save some compilation time.
 
 enable_ns3 (on/OFF)
   Activates the ns-3 bindings. See section :ref:`models_ns3`.
 
 enable_ns3 (on/OFF)
   Activates the ns-3 bindings. See section :ref:`models_ns3`.
@@ -239,10 +262,13 @@ enable_ns3 (on/OFF)
 enable_smpi (ON/off)
   Allows one to run MPI code on top of SimGrid.
 
 enable_smpi (ON/off)
   Allows one to run MPI code on top of SimGrid.
 
-enable_smpi_MBI_testsuite (on/OFF)
-  Adds many extra tests for the model checker module.
+enable_testsuite_McMini (on/OFF)
+  Adds several extra tests for the model checker module (targeting threaded applications).
+
+enable_testsuite_smpi_MBI (on/OFF)
+  Adds many extra tests for the model checker module (targeting MPI applications).
 
 
-enable_smpi_MPICH3_testsuite (on/OFF)
+enable_testsuite_smpi_MPICH3 (on/OFF)
   Adds many extra tests for the MPI module.
 
 minimal-bindings (on/OFF)
   Adds many extra tests for the MPI module.
 
 minimal-bindings (on/OFF)
@@ -254,10 +280,11 @@ NS3_HINT (empty by default)
 
 EIGEN3_HINT (empty by default)
   Alternative path into which Eigen3 should be searched for.
 
 EIGEN3_HINT (empty by default)
   Alternative path into which Eigen3 should be searched for.
+  Providing the value OFF as an hint will disable the detection alltogether.
 
 SIMGRID_PYTHON_LIBDIR (auto-detected)
 
 SIMGRID_PYTHON_LIBDIR (auto-detected)
-  Where to install the Python module library. By default, it is set to the cmake Python3_SITEARCH variable if installing to /usr, 
-  and a modified version of that variable if installing to another path. Just force another value if the auto-detected default 
+  Where to install the Python module library. By default, it is set to the cmake Python3_SITEARCH variable if installing to /usr,
+  and a modified version of that variable if installing to another path. Just force another value if the auto-detected default
   does not fit your setup.
 
 SMPI_C_FLAGS, SMPI_CXX_FLAGS, SMPI_Fortran_FLAGS (string)
   does not fit your setup.
 
 SMPI_C_FLAGS, SMPI_CXX_FLAGS, SMPI_Fortran_FLAGS (string)
@@ -310,7 +337,7 @@ existing targets are not really for public consumption so don't worry
 if some do not work for you.
 
 - **make**: Build the core of SimGrid that gets installed, but not any example.
 if some do not work for you.
 
 - **make**: Build the core of SimGrid that gets installed, but not any example.
-- **make tests**: Build the tests and examples.
+- **make examples**: Build the examples, which are needed by the tests.
 - **make simgrid**: Build only the SimGrid library. Not any example nor the helper tools.
 - **make s4u-comm-pingpong**: Build only this example (works for any example)
 - **make python-bindings**: Build the Python bindings
 - **make simgrid**: Build only the SimGrid library. Not any example nor the helper tools.
 - **make s4u-comm-pingpong**: Build only this example (works for any example)
 - **make python-bindings**: Build the Python bindings
@@ -386,7 +413,7 @@ Windows-specific instructions
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
 The best solution to get SimGrid working on windows is to install the
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
 The best solution to get SimGrid working on windows is to install the
-Ubuntu subsystem of Windows 10. All of SimGrid (but the model checker)
+Ubuntu subsystem of Windows 10. All of SimGrid 
 works in this setting. Native builds never really worked, and they are
 disabled starting with SimGrid v3.33.
 
 works in this setting. Native builds never really worked, and they are
 disabled starting with SimGrid v3.33.
 
@@ -394,7 +421,7 @@ Python-specific instructions
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
 Once you have the Python development headers installed as well as a
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
 Once you have the Python development headers installed as well as a
-recent version of the `pybind11 <https://pybind11.readthedocs.io/en/stable/>`
+recent version of the `pybind11 <https://pybind11.readthedocs.io/en/stable/>`_
 module (version at least 2.4), recompiling the Python bindings from
 the source should be as easy as:
 
 module (version at least 2.4), recompiling the Python bindings from
 the source should be as easy as:
 
@@ -410,29 +437,16 @@ simgrid without downloading the source with pip:
 
   $ pip install simgrid
 
 
   $ pip install simgrid
 
-Linux Multi-Arch specific instructions
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
-
-On a multiarch x86_64 Linux, it should be possible to compile a 32-bit
-version of SimGrid with something like:
+If you installed SimGrid to a non-standard directory (such as ``/opt/simgrid`` as advised earlier), you should tell python where
+to find the libraries as follows (notice the elements suffixed to the configured prefix).
 
 .. code-block:: console
 
 
 .. code-block:: console
 
-  $ CFLAGS=-m32                                                      \
-    CXXFLAGS=-m32                                                    \
-    FFLAGS=-m32                                                      \
-    PKG_CONFIG_LIBDIR=/usr/lib/i386-linux-gnu/pkgconfig/             \
-    cmake .                                                          \
-      -DCMAKE_SYSTEM_PROCESSOR=i386                                  \
-      -DCMAKE_Fortran_COMPILER=/some/path/to/i686-linux-gnu-gfortran \
-      -DGFORTRAN_EXE=/some/path/to/i686-linux-gnu-gfortran           \
-      -DSMPI_C_FLAGS=-m32                                            \
-      -DSMPI_CXX_FLAGS=-m32                                          \
-      -DSMPI_Fortran_FLAGS=-m32
+  $ PYTHONPATH="/opt/simgrid/lib/python3/dist-packages" LD_LIBRARY_PATH="/opt/simgrid/lib" python your_script.py
 
 
-If needed, implement ``i686-linux-gnu-gfortran`` as a script:
+You can add those variables to your bash profile to not specify it each time by adding these lines to your ``~/.profile``:
 
 
-.. code-block:: shell
+.. code-block:: console
 
 
-  #!/usr/bin/env sh
-  exec gfortran -m32 "$@"
+  export PYTHONPATH="$PYTHONPATH:/opt/simgrid/lib/python3/dist-packages"
+  export LD_LIBRARY_PATH="$PYTHONPATH:/opt/simgrid/lib"