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Private GIT Repository
3b19b2de33824a775e7438a9dc202f344890924b
[GMRES2stage.git] / paper.tex
1
2 %% bare_conf.tex
3 %% V1.3
4 %% 2007/01/11
5 %% by Michael Shell
6 %% See:
7 %% http://www.michaelshell.org/
8 %% for current contact information.
9 %%
10 %% This is a skeleton file demonstrating the use of IEEEtran.cls
11 %% (requires IEEEtran.cls version 1.7 or later) with an IEEE conference paper.
12 %%
13 %% Support sites:
14 %% http://www.michaelshell.org/tex/ieeetran/
15 %% http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/IEEEtran/
16 %% and
17 %% http://www.ieee.org/
18
19 %%*************************************************************************
20 %% Legal Notice:
21 %% This code is offered as-is without any warranty either expressed or
22 %% implied; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
23 %% FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE! 
24 %% User assumes all risk.
25 %% In no event shall IEEE or any contributor to this code be liable for
26 %% any damages or losses, including, but not limited to, incidental,
27 %% consequential, or any other damages, resulting from the use or misuse
28 %% of any information contained here.
29 %%
30 %% All comments are the opinions of their respective authors and are not
31 %% necessarily endorsed by the IEEE.
32 %%
33 %% This work is distributed under the LaTeX Project Public License (LPPL)
34 %% ( http://www.latex-project.org/ ) version 1.3, and may be freely used,
35 %% distributed and modified. A copy of the LPPL, version 1.3, is included
36 %% in the base LaTeX documentation of all distributions of LaTeX released
37 %% 2003/12/01 or later.
38 %% Retain all contribution notices and credits.
39 %% ** Modified files should be clearly indicated as such, including  **
40 %% ** renaming them and changing author support contact information. **
41 %%
42 %% File list of work: IEEEtran.cls, IEEEtran_HOWTO.pdf, bare_adv.tex,
43 %%                    bare_conf.tex, bare_jrnl.tex, bare_jrnl_compsoc.tex
44 %%*************************************************************************
45
46 % *** Authors should verify (and, if needed, correct) their LaTeX system  ***
47 % *** with the testflow diagnostic prior to trusting their LaTeX platform ***
48 % *** with production work. IEEE's font choices can trigger bugs that do  ***
49 % *** not appear when using other class files.                            ***
50 % The testflow support page is at:
51 % http://www.michaelshell.org/tex/testflow/
52
53
54
55 % Note that the a4paper option is mainly intended so that authors in
56 % countries using A4 can easily print to A4 and see how their papers will
57 % look in print - the typesetting of the document will not typically be
58 % affected with changes in paper size (but the bottom and side margins will).
59 % Use the testflow package mentioned above to verify correct handling of
60 % both paper sizes by the user's LaTeX system.
61 %
62 % Also note that the "draftcls" or "draftclsnofoot", not "draft", option
63 % should be used if it is desired that the figures are to be displayed in
64 % draft mode.
65 %
66 \documentclass[10pt, conference, compsocconf]{IEEEtran}
67 % Add the compsocconf option for Computer Society conferences.
68 %
69 % If IEEEtran.cls has not been installed into the LaTeX system files,
70 % manually specify the path to it like:
71 % \documentclass[conference]{../sty/IEEEtran}
72
73
74
75
76
77 % Some very useful LaTeX packages include:
78 % (uncomment the ones you want to load)
79
80
81 % *** MISC UTILITY PACKAGES ***
82 %
83 %\usepackage{ifpdf}
84 % Heiko Oberdiek's ifpdf.sty is very useful if you need conditional
85 % compilation based on whether the output is pdf or dvi.
86 % usage:
87 % \ifpdf
88 %   % pdf code
89 % \else
90 %   % dvi code
91 % \fi
92 % The latest version of ifpdf.sty can be obtained from:
93 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/oberdiek/
94 % Also, note that IEEEtran.cls V1.7 and later provides a builtin
95 % \ifCLASSINFOpdf conditional that works the same way.
96 % When switching from latex to pdflatex and vice-versa, the compiler may
97 % have to be run twice to clear warning/error messages.
98
99
100
101
102
103
104 % *** CITATION PACKAGES ***
105 %
106 %\usepackage{cite}
107 % cite.sty was written by Donald Arseneau
108 % V1.6 and later of IEEEtran pre-defines the format of the cite.sty package
109 % \cite{} output to follow that of IEEE. Loading the cite package will
110 % result in citation numbers being automatically sorted and properly
111 % "compressed/ranged". e.g., [1], [9], [2], [7], [5], [6] without using
112 % cite.sty will become [1], [2], [5]--[7], [9] using cite.sty. cite.sty's
113 % \cite will automatically add leading space, if needed. Use cite.sty's
114 % noadjust option (cite.sty V3.8 and later) if you want to turn this off.
115 % cite.sty is already installed on most LaTeX systems. Be sure and use
116 % version 4.0 (2003-05-27) and later if using hyperref.sty. cite.sty does
117 % not currently provide for hyperlinked citations.
118 % The latest version can be obtained at:
119 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/cite/
120 % The documentation is contained in the cite.sty file itself.
121
122
123
124
125
126
127 % *** GRAPHICS RELATED PACKAGES ***
128 %
129 \ifCLASSINFOpdf
130   % \usepackage[pdftex]{graphicx}
131   % declare the path(s) where your graphic files are
132   % \graphicspath{{../pdf/}{../jpeg/}}
133   % and their extensions so you won't have to specify these with
134   % every instance of \includegraphics
135   % \DeclareGraphicsExtensions{.pdf,.jpeg,.png}
136 \else
137   % or other class option (dvipsone, dvipdf, if not using dvips). graphicx
138   % will default to the driver specified in the system graphics.cfg if no
139   % driver is specified.
140   % \usepackage[dvips]{graphicx}
141   % declare the path(s) where your graphic files are
142   % \graphicspath{{../eps/}}
143   % and their extensions so you won't have to specify these with
144   % every instance of \includegraphics
145   % \DeclareGraphicsExtensions{.eps}
146 \fi
147 % graphicx was written by David Carlisle and Sebastian Rahtz. It is
148 % required if you want graphics, photos, etc. graphicx.sty is already
149 % installed on most LaTeX systems. The latest version and documentation can
150 % be obtained at: 
151 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/required/graphics/
152 % Another good source of documentation is "Using Imported Graphics in
153 % LaTeX2e" by Keith Reckdahl which can be found as epslatex.ps or
154 % epslatex.pdf at: http://www.ctan.org/tex-archive/info/
155 %
156 % latex, and pdflatex in dvi mode, support graphics in encapsulated
157 % postscript (.eps) format. pdflatex in pdf mode supports graphics
158 % in .pdf, .jpeg, .png and .mps (metapost) formats. Users should ensure
159 % that all non-photo figures use a vector format (.eps, .pdf, .mps) and
160 % not a bitmapped formats (.jpeg, .png). IEEE frowns on bitmapped formats
161 % which can result in "jaggedy"/blurry rendering of lines and letters as
162 % well as large increases in file sizes.
163 %
164 % You can find documentation about the pdfTeX application at:
165 % http://www.tug.org/applications/pdftex
166
167
168
169
170
171 % *** MATH PACKAGES ***
172 %
173 %\usepackage[cmex10]{amsmath}
174 % A popular package from the American Mathematical Society that provides
175 % many useful and powerful commands for dealing with mathematics. If using
176 % it, be sure to load this package with the cmex10 option to ensure that
177 % only type 1 fonts will utilized at all point sizes. Without this option,
178 % it is possible that some math symbols, particularly those within
179 % footnotes, will be rendered in bitmap form which will result in a
180 % document that can not be IEEE Xplore compliant!
181 %
182 % Also, note that the amsmath package sets \interdisplaylinepenalty to 10000
183 % thus preventing page breaks from occurring within multiline equations. Use:
184 %\interdisplaylinepenalty=2500
185 % after loading amsmath to restore such page breaks as IEEEtran.cls normally
186 % does. amsmath.sty is already installed on most LaTeX systems. The latest
187 % version and documentation can be obtained at:
188 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/required/amslatex/math/
189
190
191
192
193
194 % *** SPECIALIZED LIST PACKAGES ***
195 %
196 %\usepackage{algorithmic}
197 % algorithmic.sty was written by Peter Williams and Rogerio Brito.
198 % This package provides an algorithmic environment fo describing algorithms.
199 % You can use the algorithmic environment in-text or within a figure
200 % environment to provide for a floating algorithm. Do NOT use the algorithm
201 % floating environment provided by algorithm.sty (by the same authors) or
202 % algorithm2e.sty (by Christophe Fiorio) as IEEE does not use dedicated
203 % algorithm float types and packages that provide these will not provide
204 % correct IEEE style captions. The latest version and documentation of
205 % algorithmic.sty can be obtained at:
206 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/algorithms/
207 % There is also a support site at:
208 % http://algorithms.berlios.de/index.html
209 % Also of interest may be the (relatively newer and more customizable)
210 % algorithmicx.sty package by Szasz Janos:
211 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/algorithmicx/
212
213
214
215
216 % *** ALIGNMENT PACKAGES ***
217 %
218 %\usepackage{array}
219 % Frank Mittelbach's and David Carlisle's array.sty patches and improves
220 % the standard LaTeX2e array and tabular environments to provide better
221 % appearance and additional user controls. As the default LaTeX2e table
222 % generation code is lacking to the point of almost being broken with
223 % respect to the quality of the end results, all users are strongly
224 % advised to use an enhanced (at the very least that provided by array.sty)
225 % set of table tools. array.sty is already installed on most systems. The
226 % latest version and documentation can be obtained at:
227 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/required/tools/
228
229
230 %\usepackage{mdwmath}
231 %\usepackage{mdwtab}
232 % Also highly recommended is Mark Wooding's extremely powerful MDW tools,
233 % especially mdwmath.sty and mdwtab.sty which are used to format equations
234 % and tables, respectively. The MDWtools set is already installed on most
235 % LaTeX systems. The lastest version and documentation is available at:
236 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/mdwtools/
237
238
239 % IEEEtran contains the IEEEeqnarray family of commands that can be used to
240 % generate multiline equations as well as matrices, tables, etc., of high
241 % quality.
242
243
244 \usepackage{eqparbox}
245 % Also of notable interest is Scott Pakin's eqparbox package for creating
246 % (automatically sized) equal width boxes - aka "natural width parboxes".
247 % Available at:
248 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/eqparbox/
249
250
251
252
253
254 % *** SUBFIGURE PACKAGES ***
255 %\usepackage[tight,footnotesize]{subfigure}
256 % subfigure.sty was written by Steven Douglas Cochran. This package makes it
257 % easy to put subfigures in your figures. e.g., "Figure 1a and 1b". For IEEE
258 % work, it is a good idea to load it with the tight package option to reduce
259 % the amount of white space around the subfigures. subfigure.sty is already
260 % installed on most LaTeX systems. The latest version and documentation can
261 % be obtained at:
262 % http://www.ctan.org/tex-archive/obsolete/macros/latex/contrib/subfigure/
263 % subfigure.sty has been superceeded by subfig.sty.
264
265
266
267 %\usepackage[caption=false]{caption}
268 %\usepackage[font=footnotesize]{subfig}
269 % subfig.sty, also written by Steven Douglas Cochran, is the modern
270 % replacement for subfigure.sty. However, subfig.sty requires and
271 % automatically loads Axel Sommerfeldt's caption.sty which will override
272 % IEEEtran.cls handling of captions and this will result in nonIEEE style
273 % figure/table captions. To prevent this problem, be sure and preload
274 % caption.sty with its "caption=false" package option. This is will preserve
275 % IEEEtran.cls handing of captions. Version 1.3 (2005/06/28) and later 
276 % (recommended due to many improvements over 1.2) of subfig.sty supports
277 % the caption=false option directly:
278 %\usepackage[caption=false,font=footnotesize]{subfig}
279 %
280 % The latest version and documentation can be obtained at:
281 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/subfig/
282 % The latest version and documentation of caption.sty can be obtained at:
283 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/caption/
284
285
286
287
288 % *** FLOAT PACKAGES ***
289 %
290 %\usepackage{fixltx2e}
291 % fixltx2e, the successor to the earlier fix2col.sty, was written by
292 % Frank Mittelbach and David Carlisle. This package corrects a few problems
293 % in the LaTeX2e kernel, the most notable of which is that in current
294 % LaTeX2e releases, the ordering of single and double column floats is not
295 % guaranteed to be preserved. Thus, an unpatched LaTeX2e can allow a
296 % single column figure to be placed prior to an earlier double column
297 % figure. The latest version and documentation can be found at:
298 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/base/
299
300
301
302 %\usepackage{stfloats}
303 % stfloats.sty was written by Sigitas Tolusis. This package gives LaTeX2e
304 % the ability to do double column floats at the bottom of the page as well
305 % as the top. (e.g., "\begin{figure*}[!b]" is not normally possible in
306 % LaTeX2e). It also provides a command:
307 %\fnbelowfloat
308 % to enable the placement of footnotes below bottom floats (the standard
309 % LaTeX2e kernel puts them above bottom floats). This is an invasive package
310 % which rewrites many portions of the LaTeX2e float routines. It may not work
311 % with other packages that modify the LaTeX2e float routines. The latest
312 % version and documentation can be obtained at:
313 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/sttools/
314 % Documentation is contained in the stfloats.sty comments as well as in the
315 % presfull.pdf file. Do not use the stfloats baselinefloat ability as IEEE
316 % does not allow \baselineskip to stretch. Authors submitting work to the
317 % IEEE should note that IEEE rarely uses double column equations and
318 % that authors should try to avoid such use. Do not be tempted to use the
319 % cuted.sty or midfloat.sty packages (also by Sigitas Tolusis) as IEEE does
320 % not format its papers in such ways.
321
322
323
324
325
326 % *** PDF, URL AND HYPERLINK PACKAGES ***
327 %
328 %\usepackage{url}
329 % url.sty was written by Donald Arseneau. It provides better support for
330 % handling and breaking URLs. url.sty is already installed on most LaTeX
331 % systems. The latest version can be obtained at:
332 % http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/misc/
333 % Read the url.sty source comments for usage information. Basically,
334 % \url{my_url_here}.
335
336
337
338
339
340 % *** Do not adjust lengths that control margins, column widths, etc. ***
341 % *** Do not use packages that alter fonts (such as pslatex).         ***
342 % There should be no need to do such things with IEEEtran.cls V1.6 and later.
343 % (Unless specifically asked to do so by the journal or conference you plan
344 % to submit to, of course. )
345
346
347 % correct bad hyphenation here
348 \hyphenation{op-tical net-works semi-conduc-tor}
349
350
351 \usepackage[utf8]{inputenc}
352 \usepackage[T1]{fontenc}
353 \usepackage{algorithm}
354 \usepackage{algpseudocode}
355 \usepackage{amsmath}
356 \usepackage{amssymb}
357 \usepackage{multirow}
358 \usepackage{graphicx}
359
360 \algnewcommand\algorithmicinput{\textbf{Input:}}
361 \algnewcommand\Input{\item[\algorithmicinput]}
362
363 \algnewcommand\algorithmicoutput{\textbf{Output:}}
364 \algnewcommand\Output{\item[\algorithmicoutput]}
365
366 \newtheorem{proposition}{Proposition}
367
368 \begin{document}
369 %
370 % paper title
371 % can use linebreaks \\ within to get better formatting as desired
372 \title{TSIRM: A Two-Stage Iteration with least-squares Residual Minimization algorithm to solve large sparse linear systems}
373
374
375
376
377
378
379 % author names and affiliations
380 % use a multiple column layout for up to two different
381 % affiliations
382
383 \author{\IEEEauthorblockN{Rapha\"el Couturier\IEEEauthorrefmark{1}, Lilia Ziane Khodja \IEEEauthorrefmark{2}, and Christophe Guyeux\IEEEauthorrefmark{1}}
384 \IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{1} Femto-ST Institute, University of Franche Comte, France\\
385 Email: \{raphael.couturier,christophe.guyeux\}@univ-fcomte.fr}
386 \IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{2} INRIA Bordeaux Sud-Ouest, France\\
387 Email: lilia.ziane@inria.fr}
388 }
389
390
391
392 % conference papers do not typically use \thanks and this command
393 % is locked out in conference mode. If really needed, such as for
394 % the acknowledgment of grants, issue a \IEEEoverridecommandlockouts
395 % after \documentclass
396
397 % for over three affiliations, or if they all won't fit within the width
398 % of the page, use this alternative format:
399
400 %\author{\IEEEauthorblockN{Michael Shell\IEEEauthorrefmark{1},
401 %Homer Simpson\IEEEauthorrefmark{2},
402 %James Kirk\IEEEauthorrefmark{3}, 
403 %Montgomery Scott\IEEEauthorrefmark{3} and
404 %Eldon Tyrell\IEEEauthorrefmark{4}}
405 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{1}School of Electrical and Computer Engineering\\
406 %Georgia Institute of Technology,
407 %Atlanta, Georgia 30332--0250\\ Email: see http://www.michaelshell.org/contact.html}
408 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{2}Twentieth Century Fox, Springfield, USA\\
409 %Email: homer@thesimpsons.com}
410 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{3}Starfleet Academy, San Francisco, California 96678-2391\\
411 %Telephone: (800) 555--1212, Fax: (888) 555--1212}
412 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{4}Tyrell Inc., 123 Replicant Street, Los Angeles, California 90210--4321}}
413
414
415
416
417 % use for special paper notices
418 %\IEEEspecialpapernotice{(Invited Paper)}
419
420
421
422
423 % make the title area
424 \maketitle
425
426
427 \begin{abstract}
428 In  this article, a  two-stage iterative  algorithm is  proposed to  improve the
429 convergence  of  Krylov  based  iterative  methods,  typically  those  of  GMRES
430 variants.  The  principle of  the  proposed approach  is  to  build an  external
431 iteration over the  Krylov method, and to frequently  store its current residual
432 (at each GMRES restart for instance).  After a given number of outer iterations,
433 a least-squares minimization step is applied on the matrix composed by the saved
434 residuals, in order  to compute a better solution and to  make new iterations if
435 required.  It  is proven that the  proposal has the  same convergence properties
436 than the  inner embedded  method itself.  Experiments  using up to  16,394 cores
437 also  show that the  proposed algorithm  runs around  5 or  7 times  faster than
438 GMRES.
439 \end{abstract}
440
441 \begin{IEEEkeywords}
442 Iterative Krylov methods; sparse linear systems; residual minimization; PETSc; %à voir... 
443 \end{IEEEkeywords}
444
445
446 % For peer review papers, you can put extra information on the cover
447 % page as needed:
448 % \ifCLASSOPTIONpeerreview
449 % \begin{center} \bfseries EDICS Category: 3-BBND \end{center}
450 % \fi
451 %
452 % For peerreview papers, this IEEEtran command inserts a page break and
453 % creates the second title. It will be ignored for other modes.
454 \IEEEpeerreviewmaketitle
455
456
457
458
459 % An example of a floating figure using the graphicx package.
460 % Note that \label must occur AFTER (or within) \caption.
461 % For figures, \caption should occur after the \includegraphics.
462 % Note that IEEEtran v1.7 and later has special internal code that
463 % is designed to preserve the operation of \label within \caption
464 % even when the captionsoff option is in effect. However, because
465 % of issues like this, it may be the safest practice to put all your
466 % \label just after \caption rather than within \caption{}.
467 %
468 % Reminder: the "draftcls" or "draftclsnofoot", not "draft", class
469 % option should be used if it is desired that the figures are to be
470 % displayed while in draft mode.
471 %
472 %\begin{figure}[!t]
473 %\centering
474 %\includegraphics[width=2.5in]{myfigure}
475 % where an .eps filename suffix will be assumed under latex, 
476 % and a .pdf suffix will be assumed for pdflatex; or what has been declared
477 % via \DeclareGraphicsExtensions.
478 %\caption{Simulation Results}
479 %\label{fig_sim}
480 %\end{figure}
481
482 % Note that IEEE typically puts floats only at the top, even when this
483 % results in a large percentage of a column being occupied by floats.
484
485
486 % An example of a double column floating figure using two subfigures.
487 % (The subfig.sty package must be loaded for this to work.)
488 % The subfigure \label commands are set within each subfloat command, the
489 % \label for the overall figure must come after \caption.
490 % \hfil must be used as a separator to get equal spacing.
491 % The subfigure.sty package works much the same way, except \subfigure is
492 % used instead of \subfloat.
493 %
494 %\begin{figure*}[!t]
495 %\centerline{\subfloat[Case I]\includegraphics[width=2.5in]{subfigcase1}%
496 %\label{fig_first_case}}
497 %\hfil
498 %\subfloat[Case II]{\includegraphics[width=2.5in]{subfigcase2}%
499 %\label{fig_second_case}}}
500 %\caption{Simulation results}
501 %\label{fig_sim}
502 %\end{figure*}
503 %
504 % Note that often IEEE papers with subfigures do not employ subfigure
505 % captions (using the optional argument to \subfloat), but instead will
506 % reference/describe all of them (a), (b), etc., within the main caption.
507
508
509 % An example of a floating table. Note that, for IEEE style tables, the 
510 % \caption command should come BEFORE the table. Table text will default to
511 % \footnotesize as IEEE normally uses this smaller font for tables.
512 % The \label must come after \caption as always.
513 %
514 %\begin{table}[!t]
515 %% increase table row spacing, adjust to taste
516 %\renewcommand{\arraystretch}{1.3}
517 % if using array.sty, it might be a good idea to tweak the value of
518 % \extrarowheight as needed to properly center the text within the cells
519 %\caption{An Example of a Table}
520 %\label{table_example}
521 %\centering
522 %% Some packages, such as MDW tools, offer better commands for making tables
523 %% than the plain LaTeX2e tabular which is used here.
524 %\begin{tabular}{|c||c|}
525 %\hline
526 %One & Two\\
527 %\hline
528 %Three & Four\\
529 %\hline
530 %\end{tabular}
531 %\end{table}
532
533
534 % Note that IEEE does not put floats in the very first column - or typically
535 % anywhere on the first page for that matter. Also, in-text middle ("here")
536 % positioning is not used. Most IEEE journals/conferences use top floats
537 % exclusively. Note that, LaTeX2e, unlike IEEE journals/conferences, places
538 % footnotes above bottom floats. This can be corrected via the \fnbelowfloat
539 % command of the stfloats package.
540
541
542
543 %%%*********************************************************
544 %%%*********************************************************
545 \section{Introduction}
546 % no \IEEEPARstart
547 % You must have at least 2 lines in the paragraph with the drop letter
548 % (should never be an issue)
549
550 Iterative methods have recently become more attractive than  direct ones to  solve very large
551 sparse  linear systems.  They are more  efficient  in a  parallel
552 context,  supporting  thousands  of  cores,  and they require  less  memory  and  arithmetic
553 operations than direct  methods. This is why new iterative  methods are frequently 
554 proposed or adapted by researchers, and the increasing need to solve very large sparse
555 linear  systems  has triggered the  development  of such efficient iterative  techniques
556 suitable for parallel processing.
557
558 Most of the successful iterative methods currently available are based on so-called ``Krylov
559 subspaces''. They  consist in forming a  basis of successive matrix
560 powers multiplied by an initial vector, which can be for instance the residual. These methods use vectors orthogonality of the Krylov  subspace  basis in order to solve  linear
561 systems.  The  most known iterative  Krylov subspace methods  are conjugate
562 gradient and GMRES ones (Generalized Minimal RESidual).
563
564
565 However,  iterative  methods suffer  from scalability  problems  on parallel
566 computing  platforms  with many  processors, due  to  their need  of  reduction
567 operations, and to  collective    communications   to  achive   matrix-vector
568 multiplications. The  communications on large  clusters with thousands  of cores
569 and  large  sizes of  messages  can  significantly  affect the  performances  of these
570 iterative methods. As a consequence, Krylov subspace iteration methods are often used
571 with preconditioners in practice, to increase their convergence and accelerate their
572 performances.  However, most  of the  good preconditioners  are not  scalable on
573 large clusters.
574
575 In this research work, a two-stage algorithm based on  two nested iterations
576 called inner-outer  iterations is proposed.  This algorithm  consists in solving  the sparse
577 linear system iteratively  with a small number of  inner iterations, and restarting
578 the outer  step with a  new solution minimizing  some error functions  over some
579 previous residuals. This algorithm is iterative and easy to parallelize on large
580 clusters. Furthermore,  the   minimization  technique   improves  its   convergence  and
581 performances.
582
583 The present  article is  organized as follows.   Related works are  presented in
584 Section~\ref{sec:02}. Section~\ref{sec:03} details the two-stage algorithm using
585 a  least-squares  residual   minimization,  while  Section~\ref{sec:04}  provides
586 convergence  results  regarding this  method.   Section~\ref{sec:05} shows  some
587 experimental  results  obtained  on  large  clusters  using  routines  of  PETSc
588 toolkit. This research work ends by  a conclusion section, in which the proposal
589 is summarized while intended perspectives are provided.
590
591 %%%*********************************************************
592 %%%*********************************************************
593
594
595
596 %%%*********************************************************
597 %%%*********************************************************
598 \section{Related works}
599 \label{sec:02} 
600 %Wherever Times is specified, Times Roman or Times New Roman may be used. If neither is available on your system, please use the font closest in appearance to Times. Avoid using bit-mapped fonts if possible. True-Type 1 or Open Type fonts are preferred. Please embed symbol fonts, as well, for math, etc.
601 %%%*********************************************************
602 %%%*********************************************************
603
604
605
606 %%%*********************************************************
607 %%%*********************************************************
608 \section{Two-stage iteration with least-squares residuals minimization algorithm}
609 \label{sec:03}
610 A two-stage algorithm is proposed  to solve large  sparse linear systems  of the
611 form  $Ax=b$,  where  $A\in\mathbb{R}^{n\times   n}$  is  a  sparse  and  square
612 nonsingular   matrix,   $x\in\mathbb{R}^n$    is   the   solution   vector,   and
613 $b\in\mathbb{R}^n$ is  the right-hand side.  As explained previously, 
614 the algorithm is implemented  as an
615 inner-outer iteration  solver based  on iterative Krylov  methods. The  main 
616 key-points of the proposed solver are given in Algorithm~\ref{algo:01}.
617 It can be summarized as follows: the
618 inner solver is a Krylov based one. In order to accelerate its convergence, the 
619 outer solver periodically applies a least-squares minimization  on the residuals computed by  the inner one. %Tsolver which does not required to be changed.
620
621 At each outer iteration, the sparse linear system $Ax=b$ is partially 
622 solved using only $m$
623 iterations of an iterative method, this latter being initialized with the 
624 best known approximation previously obtained. 
625 GMRES method~\cite{Saad86}, or any of its variants, can be used for instance as an
626 inner solver. The current approximation of the Krylov method is then stored inside a matrix
627 $S$ composed by the successive solutions that are computed during inner iterations.
628
629 At each $s$ iterations, the minimization step is applied in order to
630 compute a new  solution $x$. For that, the previous  residuals of $Ax=b$ are computed by
631 the inner iterations with $(b-AS)$. The minimization of the residuals is obtained by  
632 \begin{equation}
633    \underset{\alpha\in\mathbb{R}^{s}}{min}\|b-R\alpha\|_2
634 \label{eq:01}
635 \end{equation}
636 with $R=AS$. Then the new solution $x$ is computed with $x=S\alpha$.
637
638
639 In  practice, $R$  is a  dense rectangular  matrix belonging in  $\mathbb{R}^{n\times s}$,
640 with $s\ll n$.   In order  to minimize~\eqref{eq:01}, a  least-squares method  such as
641 CGLS ~\cite{Hestenes52}  or LSQR~\cite{Paige82} is used. Remark that these  methods are more
642 appropriate than a single direct method in a parallel context.
643
644
645
646 \begin{algorithm}[t]
647 \caption{TSIRM}
648 \begin{algorithmic}[1]
649   \Input $A$ (sparse matrix), $b$ (right-hand side)
650   \Output $x$ (solution vector)\vspace{0.2cm}
651   \State Set the initial guess $x_0$
652   \For {$k=1,2,3,\ldots$ until convergence (error$<\epsilon_{tsirm}$)} \label{algo:conv}
653     \State  $x_k=Solve(A,b,x_{k-1},max\_iter_{kryl})$   \label{algo:solve}
654     \State retrieve error
655     \State $S_{k \mod s}=x_k$ \label{algo:store}
656     \If {$k \mod s=0$ {\bf and} error$>\epsilon_{kryl}$}
657       \State $R=AS$ \Comment{compute dense matrix} \label{algo:matrix_mul}
658             \State $\alpha=Least\_Squares(R,b,max\_iter_{ls})$ \label{algo:}
659       \State $x_k=S\alpha$  \Comment{compute new solution}
660     \EndIf
661   \EndFor
662 \end{algorithmic}
663 \label{algo:01}
664 \end{algorithm}
665
666 Algorithm~\ref{algo:01}  summarizes  the principle  of  our  method.  The  outer
667 iteration is  inside the for  loop. Line~\ref{algo:solve}, the Krylov  method is
668 called for a  maximum of $max\_iter_{kryl}$ iterations.  In practice, we  suggest to set this parameter
669 equals to  the restart  number of the  GMRES-like method. Moreover,  a tolerance
670 threshold must be specified for the  solver. In practice, this threshold must be
671 much  smaller  than the  convergence  threshold  of  the TSIRM  algorithm  (\emph{i.e.}
672 $\epsilon_{tsirm}$).  Line~\ref{algo:store}, $S_{k~ mod~ s}=x^k$ consists in copying the
673 solution  $x_k$  into the  column  $k~ mod~ s$ of  the  matrix  $S$. After  the
674 minimization, the matrix $S$ is reused with the new values of the residuals.  To
675 solve the minimization problem, an  iterative method is used. Two parameters are
676 required for that: the maximum number of iterations and the threshold to stop the
677 method.
678
679 Let us summarize the most important parameters of TSIRM:
680 \begin{itemize}
681 \item $\epsilon_{tsirm}$: the threshold to stop the TSIRM method;
682 \item $max\_iter_{kryl}$: the maximum number of iterations for the Krylov method;
683 \item $s$: the number of outer iterations before applying the minimization step;
684 \item $max\_iter_{ls}$: the maximum number of iterations for the iterative least-squares method;
685 \item $\epsilon_{ls}$: the threshold used to stop the least-squares method.
686 \end{itemize}
687
688
689 The  parallelisation  of  TSIRM  relies   on  the  parallelization  of  all  its
690 parts. More  precisely, except  the least-squares step,  all the other  parts are
691 obvious to  achieve out in parallel. In  order to develop a  parallel version of
692 our   code,   we   have   chosen  to   use   PETSc~\cite{petsc-web-page}.    For
693 line~\ref{algo:matrix_mul} the  matrix-matrix multiplication is  implemented and
694 efficient since the  matrix $A$ is sparse and since the  matrix $S$ contains few
695 colums in  practice. As explained  previously, at least  two methods seem  to be
696 interesting to solve the least-squares minimization, CGLS and LSQR.
697
698 In the following  we remind the CGLS algorithm. The LSQR  method follows more or
699 less the same principle but it takes more place, so we briefly explain the parallelization of CGLS which is similar to LSQR.
700
701 \begin{algorithm}[t]
702 \caption{CGLS}
703 \begin{algorithmic}[1]
704   \Input $A$ (matrix), $b$ (right-hand side)
705   \Output $x$ (solution vector)\vspace{0.2cm}
706   \State Let $x_0$ be an initial approximation
707   \State $r_0=b-Ax_0$
708   \State $p_1=A^Tr_0$
709   \State $s_0=p_1$
710   \State $\gamma=||s_0||^2_2$
711   \For {$k=1,2,3,\ldots$ until convergence ($\gamma<\epsilon_{ls}$)} \label{algo2:conv}
712     \State $q_k=Ap_k$
713     \State $\alpha_k=\gamma/||q_k||^2_2$
714     \State $x_k=x_{k-1}+\alpha_kp_k$
715     \State $r_k=r_{k-1}-\alpha_kq_k$
716     \State $s_k=A^Tr_k$
717     \State $\gamma_{old}=\gamma$
718     \State $\gamma=||s_k||^2_2$
719     \State $\beta_k=\gamma/\gamma_{old}$
720     \State $p_{k+1}=s_k+\beta_kp_k$
721   \EndFor
722 \end{algorithmic}
723 \label{algo:02}
724 \end{algorithm}
725
726
727 In each iteration  of CGLS, there is two  matrix-vector multiplications and some
728 classical operations:  dot product, norm, multiplication  and addition on  vectors. All
729 these operations are easy to implement in PETSc or similar environment.
730
731
732
733 %%%*********************************************************
734 %%%*********************************************************
735
736 \section{Convergence results}
737 \label{sec:04}
738 Let us recall the following result, see~\cite{Saad86}.
739 \begin{proposition}
740 Suppose that $A$ is a positive real matrix with symmetric part $M$. Then the residual norm provided at the $m$-th step of GMRES satisfies:
741 \begin{equation}
742 ||r_m|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{m}{2}} ||r_0|| ,
743 \end{equation}
744 where $\alpha = \lambda_min(M)^2$ and $\beta = \lambda_max(A^T A)$, which proves 
745 the convergence of GMRES($m$) for all $m$ under that assumption regarding $A$.
746 \end{proposition}
747
748 <<<<<<< HEAD
749
750 =======
751 We can now claim that,
752 \begin{proposition}
753 If $A$ is a positive real matrix and GMRES($m$) is used as solver, then the TSIRM algorithm is convergent.
754 \end{proposition}
755
756 \begin{proof}
757 Let $r_k = b-Ax_k$, where $x_k$ is the approximation of the solution after the
758 $k$-th iterate of TSIRM.
759 We will prove that $r_k \rightarrow 0$ when $k \rightarrow +\infty$.
760
761 Each step of the TSIRM algorithm 
762 \end{proof}
763 >>>>>>> 84e15020344b77e5497c4a516cc20b472b2914cd
764
765 %%%*********************************************************
766 %%%*********************************************************
767 \section{Experiments using PETSc}
768 \label{sec:05}
769
770
771 In order to see the influence of our algorithm with only one processor, we first
772 show  a comparison  with the  standard version  of GMRES  and our  algorithm. In
773 Table~\ref{tab:01},  we  show  the  matrices  we  have used  and  some  of  them
774 characteristics. For all  the matrices, the name, the field,  the number of rows
775 and the number of nonzero elements are given.
776
777 \begin{table}[htbp]
778 \begin{center}
779 \begin{tabular}{|c|c|r|r|r|} 
780 \hline
781 Matrix name              & Field             &\# Rows   & \# Nonzeros   \\\hline \hline
782 crashbasis         & Optimization      & 160,000  &  1,750,416  \\
783 parabolic\_fem     & Comput. fluid dynamics  & 525,825 & 2,100,225 \\
784 epb3               & Thermal problem   & 84,617  & 463,625  \\
785 atmosmodj          & Comput. fluid dynamics  & 1,270,432 & 8,814,880 \\
786 bfwa398            & Electromagnetics pb & 398 & 3,678 \\
787 torso3             & 2D/3D problem & 259,156 & 4,429,042 \\
788 \hline
789
790 \end{tabular}
791 \caption{Main characteristics of the sparse matrices chosen from the Davis collection}
792 \label{tab:01}
793 \end{center}
794 \end{table}
795
796 The following  parameters have been chosen  for our experiments.   As by default
797 the restart  of GMRES is performed every  30 iterations, we have  chosen to stop
798 the GMRES every 30 iterations (\emph{i.e.} $max\_iter_{kryl}=30$).  $s$ is set to 8. CGLS is
799 chosen  to minimize  the least-squares  problem with  the  following parameters:
800 $\epsilon_{ls}=1e-40$ and $max\_iter_{ls}=20$.  The external precision is set to
801 $\epsilon_{tsirm}=1e-10$.  Those  experiments have been performed  on a Intel(R)
802 Core(TM) i7-3630QM CPU @ 2.40GHz with the version 3.5.1 of PETSc.
803
804
805 In  Table~\ref{tab:02}, some  experiments comparing  the solving  of  the linear
806 systems obtained with the previous matrices  with a GMRES variant and with out 2
807 stage algorithm are  given. In the second column, it can  be noticed that either
808 gmres or fgmres is used to  solve the linear system.  According to the matrices,
809 different  preconditioner is used.   With TSIRM,  the same  solver and  the same
810 preconditionner are used.  This Table shows that TSIRM can drastically reduce the
811 number of iterations to reach the  convergence when the number of iterations for
812 the normal GMRES is more or less  greater than 500. In fact this also depends on
813 tow  parameters: the  number  of iterations  to  stop GMRES  and  the number  of
814 iterations to perform the minimization.
815
816
817 \begin{table}[htbp]
818 \begin{center}
819 \begin{tabular}{|c|c|r|r|r|r|} 
820 \hline
821
822  \multirow{2}{*}{Matrix name}  & Solver /   & \multicolumn{2}{c|}{GMRES} & \multicolumn{2}{c|}{TSIRM CGLS} \\ 
823 \cline{3-6}
824        &  precond             & Time  & \# Iter.  & Time  & \# Iter.  \\\hline \hline
825
826 crashbasis         & gmres / none             &  15.65     & 518  &  14.12 & 450  \\
827 parabolic\_fem     & gmres / ilu           & 1009.94   & 7573 & 401.52 & 2970 \\
828 epb3               & fgmres / sor             &  8.67     & 600  &  8.21 & 540  \\
829 atmosmodj          &  fgmres / sor & 104.23  & 451 & 88.97 & 366  \\
830 bfwa398            & gmres / none  & 1.42 & 9612 & 0.28 & 1650 \\
831 torso3             & fgmres / sor  & 37.70 & 565 & 34.97 & 510 \\
832 \hline
833
834 \end{tabular}
835 \caption{Comparison of (F)GMRES and 2 stage (F)GMRES algorithms in sequential with some matrices, time is expressed in seconds.}
836 \label{tab:02}
837 \end{center}
838 \end{table}
839
840
841
842
843
844 In order to perform larger  experiments, we have tested some example applications
845 of PETSc. Those  applications are available in the ksp part  which is suited for
846 scalable linear equations solvers:
847 \begin{itemize}
848 \item ex15  is an example  which solves in  parallel an operator using  a finite
849   difference  scheme.   The  diagonal  is  equal to  4  and  4  extra-diagonals
850   representing the neighbors in each directions  are equal to -1. This example is
851   used  in many  physical phenomena, for  example, heat  and fluid  flow, wave
852   propagation, etc.
853 \item ex54 is another example based on 2D problem discretized with quadrilateral
854   finite elements. For this example, the user can define the scaling of material
855   coefficient in embedded circle called $\alpha$.
856 \end{itemize}
857 For more technical details on  these applications, interested readers are invited
858 to  read the  codes available  in the  PETSc sources.   Those problems  have been
859 chosen because they  are scalable with many cores which is not the case of other problems that we have tested.
860
861 In the following larger experiments are described on two large scale architectures: Curie and Juqeen... {\bf description...}\\
862
863
864 {\bf Description of preconditioners}\\
865
866 \begin{table*}[htbp]
867 \begin{center}
868 \begin{tabular}{|r|r|r|r|r|r|r|r|r|} 
869 \hline
870
871   nb. cores & precond   & \multicolumn{2}{c|}{FGMRES} & \multicolumn{2}{c|}{TSIRM CGLS} &  \multicolumn{2}{c|}{TSIRM LSQR} & best gain \\ 
872 \cline{3-8}
873              &                       & Time  & \# Iter.  & Time  & \# Iter. & Time  & \# Iter. & \\\hline \hline
874   2,048      & mg                    & 403.49   & 18,210    & 73.89  & 3,060   & 77.84  & 3,270  & 5.46 \\
875   2,048      & sor                   & 745.37   & 57,060    & 87.31  & 6,150   & 104.21 & 7,230  & 8.53 \\
876   4,096      & mg                    & 562.25   & 25,170    & 97.23  & 3,990   & 89.71  & 3,630  & 6.27 \\
877   4,096      & sor                   & 912.12   & 70,194    & 145.57 & 9,750   & 168.97 & 10,980 & 6.26 \\
878   8,192      & mg                    & 917.02   & 40,290    & 148.81 & 5,730   & 143.03 & 5,280  & 6.41 \\
879   8,192      & sor                   & 1,404.53 & 106,530   & 212.55 & 12,990  & 180.97 & 10,470 & 7.76 \\
880   16,384     & mg                    & 1,430.56 & 63,930    & 237.17 & 8,310   & 244.26 & 7,950  & 6.03 \\
881   16,384     & sor                   & 2,852.14 & 216,240   & 418.46 & 21,690  & 505.26 & 23,970 & 6.82 \\
882 \hline
883
884 \end{tabular}
885 \caption{Comparison of FGMRES and TSIRM with FGMRES for example ex15 of PETSc with two preconditioners (mg and sor) with 25,000 components per core on Juqueen (threshold 1e-3, restart=30, s=12),  time is expressed in seconds.}
886 \label{tab:03}
887 \end{center}
888 \end{table*}
889
890 Table~\ref{tab:03} shows  the execution  times and the  number of  iterations of
891 example ex15  of PETSc on the  Juqueen architecture. Different  numbers of cores
892 are  studied ranging  from  2,048  up-to 16,383.   Two  preconditioners have  been
893 tested: {\it mg} and {\it sor}.   For those experiments,  the number  of components  (or unknowns  of the
894 problems)  per processor  is fixed  to 25,000,  also called  weak  scaling. This
895 number can seem relatively small. In fact, for some applications that need a lot
896 of  memory, the  number of  components per  processor requires  sometimes  to be
897 small.
898
899
900
901 In Table~\ref{tab:03}, we  can notice that TSIRM is always faster  than FGMRES. The last
902 column shows the ratio between FGMRES and the best version of TSIRM according to
903 the minimization  procedure: CGLS or  LSQR. Even if  we have computed  the worst
904 case  between CGLS  and LSQR,  it is  clear that  TSIRM is  always  faster than
905 FGMRES. For this example, the  multigrid preconditioner is faster than SOR. The
906 gain  between   TSIRM  and  FGMRES  is   more  or  less  similar   for  the  two
907 preconditioners.  Looking at the number  of iterations to reach the convergence,
908 it is  obvious that TSIRM allows the  reduction of the number  of iterations. It
909 should be noticed  that for TSIRM, in those experiments,  only the iterations of
910 the Krylov solver  are taken into account.  Iterations of CGLS  or LSQR were not
911 recorded but they are time-consuming. In general each $max\_iter_{kryl}*s$ which
912 corresponds to 30*12, there are $max\_iter_{ls}$ which corresponds to 15.
913
914 \begin{figure}[htbp]
915 \centering
916   \includegraphics[width=0.45\textwidth]{nb_iter_sec_ex15_juqueen}
917 \caption{Number of iterations per second with ex15 and the same parameters than in Table~\ref{tab:03} (weak scaling)}
918 \label{fig:01}
919 \end{figure}
920
921
922 In  Figure~\ref{fig:01}, the number  of iterations  per second  corresponding to
923 Table~\ref{tab:03}  is  displayed.   It  can  be  noticed  that  the  number  of
924 iterations per second of FMGRES is  constant whereas it decreases with TSIRM with
925 both preconditioners. This  can be explained by the fact that  when the number of
926 cores increases the time for the least-squares minimization step also increases but, generally,
927 when  the number  of cores  increases,  the number  of iterations  to reach  the
928 threshold also increases,  and, in that case, TSIRM is  more efficient to reduce
929 the number of iterations. So, the overall benefit of using TSIRM is interesting.
930
931
932
933
934
935
936 \begin{table*}[htbp]
937 \begin{center}
938 \begin{tabular}{|r|r|r|r|r|r|r|r|r|} 
939 \hline
940
941   nb. cores & threshold   & \multicolumn{2}{c|}{GMRES} & \multicolumn{2}{c|}{TSIRM CGLS} &  \multicolumn{2}{c|}{TSIRM LSQR} & best gain \\ 
942 \cline{3-8}
943              &                       & Time  & \# Iter.  & Time  & \# Iter. & Time  & \# Iter. & \\\hline \hline
944   2,048      & 8e-5                  & 108.88 & 16,560  & 23.06  &  3,630  & 22.79  & 3,630   & 4.77 \\
945   2,048      & 6e-5                  & 194.01 & 30,270  & 35.50  &  5,430  & 27.74  & 4,350   & 6.99 \\
946   4,096      & 7e-5                  & 160.59 & 22,530  & 35.15  &  5,130  & 29.21  & 4,350   & 5.49 \\
947   4,096      & 6e-5                  & 249.27 & 35,520  & 52.13  &  7,950  & 39.24  & 5,790   & 6.35 \\
948   8,192      & 6e-5                  & 149.54 & 17,280  & 28.68  &  3,810  & 29.05  & 3,990  & 5.21 \\
949   8,192      & 5e-5                  & 785.04 & 109,590 & 76.07  &  10,470  & 69.42 & 9,030  & 11.30 \\
950   16,384     & 4e-5                  & 718.61 & 86,400 & 98.98  &  10,830  & 131.86  & 14,790  & 7.26 \\
951 \hline
952
953 \end{tabular}
954 \caption{Comparison of FGMRES  and 2 stage FGMRES algorithms for ex54 of Petsc (both with the MG preconditioner) with 25000 components per core on Curie (restart=30, s=12),  time is expressed in seconds.}
955 \label{tab:04}
956 \end{center}
957 \end{table*}
958
959
960 In Table~\ref{tab:04}, some experiments with example ex54 on the Curie architecture are reported.
961
962
963 \begin{table*}[htbp]
964 \begin{center}
965 \begin{tabular}{|r|r|r|r|r|r|r|r|r|r|r|} 
966 \hline
967
968   nb. cores   & \multicolumn{2}{c|}{GMRES} & \multicolumn{2}{c|}{TSIRM CGLS} &  \multicolumn{2}{c|}{TSIRM LSQR} & best gain & \multicolumn{3}{c|}{efficiency} \\ 
969 \cline{2-7} \cline{9-11}
970                     & Time  & \# Iter.  & Time  & \# Iter. & Time  & \# Iter. &   & GMRES & TS CGLS & TS LSQR\\\hline \hline
971    512              & 3,969.69 & 33,120 & 709.57 & 5,790  & 622.76 & 5,070  & 6.37  &   1    &    1    &     1     \\
972    1024             & 1,530.06  & 25,860 & 290.95 & 4,830  & 307.71 & 5,070 & 5.25  &  1.30  &    1.21  &   1.01     \\
973    2048             & 919.62    & 31,470 & 237.52 & 8,040  & 194.22 & 6,510 & 4.73  & 1.08   &    .75   &   .80\\
974    4096             & 405.60    & 28,380 & 111.67 & 7,590  & 91.72  & 6,510 & 4.42  & 1.22   &  .79     &   .84 \\
975    8192             & 785.04   & 109,590 & 76.07  & 10,470 & 69.42 & 9,030  & 11.30 &   .32  &   .58    &  .56 \\
976
977 \hline
978
979 \end{tabular}
980 \caption{Comparison of FGMRES  and 2 stage FGMRES algorithms for ex54 of Petsc (both with the MG preconditioner) with 204,919,225 components on Curie with different number of cores (restart=30, s=12, threshol 5e-5),  time is expressed in seconds.}
981 \label{tab:05}
982 \end{center}
983 \end{table*}
984
985 \begin{figure}[htbp]
986 \centering
987   \includegraphics[width=0.45\textwidth]{nb_iter_sec_ex54_curie}
988 \caption{Number of iterations per second with ex54 and the same parameters than in Table~\ref{tab:05} (strong scaling)}
989 \label{fig:02}
990 \end{figure}
991
992 %%%*********************************************************
993 %%%*********************************************************
994
995
996
997 %%%*********************************************************
998 %%%*********************************************************
999 \section{Conclusion}
1000 \label{sec:06}
1001 %The conclusion goes here. this is more of the conclusion
1002 %%%*********************************************************
1003 %%%*********************************************************
1004
1005
1006 future plan : \\
1007 - study other kinds of matrices, problems, inner solvers\\
1008 - test the influence of all the parameters\\
1009 - adaptative number of outer iterations to minimize\\
1010 - other methods to minimize the residuals?\\
1011 - implement our solver inside PETSc
1012
1013
1014 % conference papers do not normally have an appendix
1015
1016
1017
1018 % use section* for acknowledgement
1019 %%%*********************************************************
1020 %%%*********************************************************
1021 \section*{Acknowledgment}
1022 This  paper  is   partially  funded  by  the  Labex   ACTION  program  (contract
1023 ANR-11-LABX-01-01).   We acknowledge PRACE  for awarding  us access  to resource
1024 Curie and Juqueen respectively based in France and Germany.
1025
1026
1027
1028 % trigger a \newpage just before the given reference
1029 % number - used to balance the columns on the last page
1030 % adjust value as needed - may need to be readjusted if
1031 % the document is modified later
1032 %\IEEEtriggeratref{8}
1033 % The "triggered" command can be changed if desired:
1034 %\IEEEtriggercmd{\enlargethispage{-5in}}
1035
1036 % references section
1037
1038 % can use a bibliography generated by BibTeX as a .bbl file
1039 % BibTeX documentation can be easily obtained at:
1040 % http://www.ctan.org/tex-archive/biblio/bibtex/contrib/doc/
1041 % The IEEEtran BibTeX style support page is at:
1042 % http://www.michaelshell.org/tex/ieeetran/bibtex/
1043 \bibliographystyle{IEEEtran}
1044 % argument is your BibTeX string definitions and bibliography database(s)
1045 \bibliography{biblio}
1046 %
1047 % <OR> manually copy in the resultant .bbl file
1048 % set second argument of \begin to the number of references
1049 % (used to reserve space for the reference number labels box)
1050 %% \begin{thebibliography}{1}
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