]> AND Private Git Repository - GMRES2stage.git/blobdiff - paper.tex
Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Private GIT Repository
new
[GMRES2stage.git] / paper.tex
index 87640739334500189fe37d1e42f428902550e45f..bfb7aa224beeacd558e81a59adba22ba7b4cf474 100644 (file)
--- a/paper.tex
+++ b/paper.tex
@@ -601,7 +601,37 @@ is summarized while intended perspectives are provided.
 %%%*********************************************************
 \section{Related works}
 \label{sec:02} 
-%Wherever Times is specified, Times Roman or Times New Roman may be used. If neither is available on your system, please use the font closest in appearance to Times. Avoid using bit-mapped fonts if possible. True-Type 1 or Open Type fonts are preferred. Please embed symbol fonts, as well, for math, etc.
+Krylov subspace iteration methods have increasingly become useful and successful
+techniques  for  solving  linear,  nonlinear systems  and  eigenvalue  problems,
+especially      since       the      increase      development       of      the
+preconditioners~\cite{Saad2003,Meijerink77}.  One reason  of  the popularity  of
+these methods is their generality, simplicity and efficiency to solve systems of
+equations arising from very large and complex problems.
+
+GMRES is one of the most  widely used Krylov iterative method for solving sparse
+and large  linear systems. It  is developed by  Saad and al.~\cite{Saad86}  as a
+generalized  method to  deal with  unsymmetric and  non-Hermitian  problems, and
+indefinite symmetric problems too. In its original version called full GMRES, it
+minimizes the residual over the  current Krylov subspace until convergence in at
+most $n$ iterations,  where $n$ is the  size of the sparse matrix.  It should be
+noticed that full GMRES is too expensive in the case of large matrices since the
+required orthogonalization  process per  iteration grows quadratically  with the
+number of iterations. For that reason, in practice GMRES is restarted after each
+$m\ll n$ iterations to avoid the  storage of a large orthonormal basis. However,
+the  convergence behavior  of the  restarted GMRES,  called GMRES($m$),  in many
+cases depends quite critically on  the value of $m$~\cite{Huang89}. Therefore in
+most cases, a preconditioning technique is applied to the restarted GMRES method
+in order to improve its convergence.
+
+In order to enhance the robustness of Krylov iterative solvers, some techniques have been proposed allowing the use of different preconditioners, if necessary, within the iteration instead of restarting. Those techniques may lead to considerable savings in CPU time and memory requirements. Van der Vorst in~\cite{Vorst94} has proposed variants of the GMRES algorithm in which a different preconditioner is applied in each iteration, so-called GMRESR family of nested methods. In fact, the GMRES method is effectively preconditioned with other iterative schemes (or GMRES itself), where the iterations of the GMRES method are called outer iterations while the iterations of the preconditioning process referred to as inner iterations. Saad in~\cite{Saad:1993} has proposed FGMRES which is another variant of the GMRES algorithm using a variable preconditioner. In FGMRES the search directions are preconditioned whereas in GMRESR the residuals are preconditioned. However in practice the good preconditioners are those based on direct methods, as ILU preconditioners, which are not easy to parallelize and suffer from the scalability problems on large clusters of thousands of cores.  
+
+Recently, communication-avoiding methods have been developed to reduce the communication overheads in Krylov subspace iterative solvers. On modern computer architectures, communications between processors are much slower than floating-point arithmetic operations on a given processor. Communication-avoiding techniques reduce either communications between processors or data movements between levels of the memory hierarchy, by reformulating the communication-bound kernels (more frequently SpMV kernels) and the orthogonalization operations within the Krylov iterative solver. Different works have studied the communication-avoiding techniques for the GMRES method, so-called CA-GMRES, on multicore processors and multi-GPU machines~\cite{Mohiyuddin2009,Hoemmen2010,Yamazaki2014}. 
+
+Compared  to all these  works and  to all  the other  works on  Krylov iterative
+method, the originality of our work is to build a second iteration over a Krylov
+iterative method and to minimize the residuals with a least-squares method after
+a given number of outer iterations.
+
 %%%*********************************************************
 %%%*********************************************************
 
@@ -609,7 +639,7 @@ is summarized while intended perspectives are provided.
 
 %%%*********************************************************
 %%%*********************************************************
-\section{Two-stage iteration with least-squares residuals minimization algorithm}
+\section{TSIRM: Two-stage iteration with least-squares residuals minimization algorithm}
 \label{sec:03}
 A two-stage algorithm is proposed  to solve large  sparse linear systems  of the
 form  $Ax=b$,  where  $A\in\mathbb{R}^{n\times   n}$  is  a  sparse  and  square
@@ -631,12 +661,6 @@ composed by  the $s$  last solutions  that have been  computed during  the inner
 iterations phase.   In the remainder,  the $i$-th column  vector of $S$  will be
 denoted by $S_i$.
 
-$\|r_n\| \leq \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{n/2} \|r_0\|,$
-In the general case, where A is not positive definite, we have
-
-$\|r_n\| \le \inf_{p \in P_n} \|p(A)\| \le \kappa_2(V) \inf_{p \in P_n} \max_{\lambda \in \sigma(A)} |p(\lambda)| \|r_0\|, \,$
-
-
 At each $s$ iterations, another kind of minimization step is applied in order to
 compute a new  solution $x$. For that, the previous  residuals of $Ax=b$ are computed by
 the inner iterations with $(b-AS)$. The minimization of the residuals is obtained by  
@@ -660,10 +684,10 @@ appropriate than a single direct method in a parallel context.
   \Input $A$ (sparse matrix), $b$ (right-hand side)
   \Output $x$ (solution vector)\vspace{0.2cm}
   \State Set the initial guess $x_0$
-  \For {$k=1,2,3,\ldots$ until convergence (error$<\epsilon_{tsirm}$)} \label{algo:conv}
+  \For {$k=1,2,3,\ldots$ until convergence ($error<\epsilon_{tsirm}$)} \label{algo:conv}
     \State  $[x_k,error]=Solve(A,b,x_{k-1},max\_iter_{kryl})$   \label{algo:solve}
-    \State $S_{k \mod s}=x_k$ \label{algo:store} \Comment{update column (k mod s) of S}
-    \If {$k \mod s=0$ {\bf and} error$>\epsilon_{kryl}$}
+    \State $S_{k \mod s}=x_k$ \label{algo:store} \Comment{update column ($k \mod s$) of $S$}
+    \If {$k \mod s=0$ {\bf and} $error>\epsilon_{kryl}$}
       \State $R=AS$ \Comment{compute dense matrix} \label{algo:matrix_mul}
             \State $\alpha=Least\_Squares(R,b,max\_iter_{ls})$ \label{algo:}
       \State $x_k=S\alpha$  \Comment{compute new solution}
@@ -679,16 +703,16 @@ method is called  for a maximum of $max\_iter_{kryl}$  iterations.  In practice,
 we suggest to  set this parameter equal to the restart  number in the GMRES-like
 method. Moreover,  a tolerance  threshold must be  specified for the  solver. In
 practice, this threshold must be  much smaller than the convergence threshold of
-the  TSIRM algorithm  (\emph{i.e.}, $\epsilon_{tsirm}$).  We also  consider that
-after the call of the $Solve$ function, we obtain the vector $x_k$ and the error
-which is defined by $||Ax^k-b||_2$.
+the TSIRM  algorithm (\emph{i.e.},  $\epsilon_{tsirm}$).  We also  consider that
+after  the call of  the $Solve$  function, we  obtain the  vector $x_k$  and the
+$error$ which is defined by $||Ax_k-b||_2$.
 
-  Line~\ref{algo:store},
-$S_{k \mod  s}=x^k$ consists in  copying the solution  $x_k$ into the  column $k
-\mod s$ of $S$.   After the minimization, the matrix $S$ is  reused with the new
-values of the residuals.  To solve the minimization problem, an iterative method
-is used. Two parameters are required  for that: the maximum number of iterations
-and the threshold to stop the method.
+  Line~\ref{algo:store},  $S_{k \mod  s}=x_k$ consists  in copying  the solution
+  $x_k$ into the  column $k \mod s$ of $S$.  After  the minimization, the matrix
+  $S$ is reused with the new values of the residuals.  To solve the minimization
+  problem, an  iterative method is used.  Two parameters are  required for that:
+  the maximum number of iterations  ($max\_iter_{ls}$) and the threshold to stop
+  the method ($\epsilon_{ls}$).
 
 Let us summarize the most important parameters of TSIRM:
 \begin{itemize}
@@ -709,8 +733,9 @@ efficient since the  matrix $A$ is sparse and since the  matrix $S$ contains few
 columns in  practice. As explained  previously, at least  two methods seem  to be
 interesting to solve the least-squares minimization, CGLS and LSQR.
 
-In the following  we remind the CGLS algorithm. The LSQR  method follows more or
-less the same principle but it takes more place, so we briefly explain the parallelization of CGLS which is similar to LSQR.
+In Algorithm~\ref{algo:02} we remind the CGLS algorithm. The LSQR method follows
+more or less the  same principle but it takes more place,  so we briefly explain
+the parallelization of CGLS which is  similar to LSQR.
 
 \begin{algorithm}[t]
 \caption{CGLS}
@@ -739,9 +764,10 @@ less the same principle but it takes more place, so we briefly explain the paral
 
 
 In each iteration  of CGLS, there is two  matrix-vector multiplications and some
-classical operations:  dot product, norm, multiplication  and addition on  vectors. All
-these operations are easy to implement in PETSc or similar environment.
-
+classical  operations:  dot  product,   norm,  multiplication  and  addition  on
+vectors.  All  these  operations are  easy  to  implement  in PETSc  or  similar
+environment.  It should be noticed that LSQR follows the same principle, it is a
+little bit longer but it performs more or less the same operations.
 
 
 %%%*********************************************************
@@ -749,41 +775,59 @@ these operations are easy to implement in PETSc or similar environment.
 
 \section{Convergence results}
 \label{sec:04}
-Let us recall the following result, see~\cite{Saad86} for further readings.
-\begin{proposition}
-\label{prop:saad}
-Suppose that $A$ is a positive real matrix with symmetric part $M$. Then the residual norm provided at the $m$-th step of GMRES satisfies:
-\begin{equation}
-||r_m|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{m}{2}} ||r_0|| ,
-\end{equation}
-where $\alpha = \lambda_{min}(M)^2$ and $\beta = \lambda_{max}(A^T A)$, which proves 
-the convergence of GMRES($m$) for all $m$ under that assumption regarding $A$.
-\end{proposition}
 
 
 We can now claim that,
 \begin{proposition}
-If $A$ is a positive real matrix and GMRES($m$) is used as solver, then the TSIRM algorithm is convergent. Furthermore, 
-let $r_k$ be the
+\label{prop:saad}
+If $A$ is either a definite positive or a positive matrix and GMRES($m$) is used as solver, then the TSIRM algorithm is convergent. 
+
+Furthermore, let $r_k$ be the
 $k$-th residue of TSIRM, then
-we still have:
+we have the following boundaries:
+\begin{itemize}
+\item when $A$ is positive:
 \begin{equation}
 ||r_k|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0|| ,
 \end{equation}
-where $\alpha$ and $\beta$ are defined as in Proposition~\ref{prop:saad}.
+where $M$ is the symmetric part of $A$, $\alpha = \lambda_{min}(M)^2$ and $\beta = \lambda_{max}(A^T A)$;
+\item when $A$ is positive definite:
+\begin{equation}
+\|r_k\| \leq \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{km/2} \|r_0\|.
+\end{equation}
+\end{itemize}
+%In the general case, where A is not positive definite, we have
+%$\|r_n\| \le \inf_{p \in P_n} \|p(A)\| \le \kappa_2(V) \inf_{p \in P_n} \max_{\lambda \in \sigma(A)} |p(\lambda)| \|r_0\|, .$
 \end{proposition}
 
 \begin{proof}
-We will prove by a mathematical induction that, for each $k \in \mathbb{N}^\ast$, 
-$||r_k|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{mk}{2}} ||r_0||.$
+Let us first recall that the residue is under control when considering the GMRES algorithm on a positive definite matrix, and it is bounded as follows:
+\begin{equation*}
+\|r_k\| \leq \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{k/2} \|r_0\| .
+\end{equation*}
+Additionally, when $A$ is a positive real matrix with symmetric part $M$, then the residual norm provided at the $m$-th step of GMRES satisfies:
+\begin{equation*}
+||r_m|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{m}{2}} ||r_0|| ,
+\end{equation*}
+where $\alpha$ and $\beta$ are defined as in Proposition~\ref{prop:saad}, which proves 
+the convergence of GMRES($m$) for all $m$ under such assumptions regarding $A$.
+These well-known results can be found, \emph{e.g.}, in~\cite{Saad86}.
 
-The base case is obvious, as for $k=1$, the TSIRM algorithm simply consists in applying GMRES($m$) once, leading to a new residual $r_1$ which follows the inductive hypothesis due to Proposition~\ref{prop:saad}.
+We will now prove by a mathematical induction that, for each $k \in \mathbb{N}^\ast$, 
+$||r_k|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{mk}{2}} ||r_0||$ when $A$ is positive, and $\|r_k\| \leq \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{km/2} \|r_0\|$ when $A$ is positive definite.
 
-Suppose now that the claim holds for all $m=1, 2, \hdots, k-1$, that is, $\forall m \in \{1,2,\hdots, k-1\}$, $||r_m|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||$.
+The base case is obvious, as for $k=1$, the TSIRM algorithm simply consists in applying GMRES($m$) once, leading to a new residual $r_1$ that follows the inductive hypothesis due, to the results recalled above.
+
+Suppose now that the claim holds for all $m=1, 2, \hdots, k-1$, that is, $\forall m \in \{1,2,\hdots, k-1\}$, $||r_m|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||$ in the positive case, and $\|r_k\| \leq \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{km/2} \|r_0\|$ in the definite positive one.
 We will show that the statement holds too for $r_k$. Two situations can occur:
 \begin{itemize}
-\item If $k \mod m \neq 0$, then the TSIRM algorithm consists in executing GMRES once. In that case, we obtain $||r_k|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{m}{2}} ||r_{k-1}||\leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||$ by the inductive hypothesis.
-\item Else, the TSIRM algorithm consists in two stages: a first GMRES($m$) execution leads to a temporary $x_k$ whose residue satisfies $||r_k|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{m}{2}} ||r_{k-1}||\leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||$, and a least squares resolution.
+\item If $k \not\equiv 0 ~(\textrm{mod}\ m)$, then the TSIRM algorithm consists in executing GMRES once. In that case and by using the inductive hypothesis, we obtain either $||r_k|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{m}{2}} ||r_{k-1}||\leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||$ if $A$ is positive, or $\|r_k\| \leqslant \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{m/2} \|r_{k-1}\|$ $\leqslant$ $\left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{km/2} \|r_{0}\|$ in the positive definite case.
+\item Else, the TSIRM algorithm consists in two stages: a first GMRES($m$) execution leads to a temporary $x_k$ whose residue satisfies:
+\begin{itemize}
+\item $||r_k|| \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{m}{2}} ||r_{k-1}||\leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||$ in the positive case, 
+\item $\|r_k\| \leqslant \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{m/2} \|r_{k-1}\|$ $\leqslant$ $\left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{km/2} \|r_{0}\|$ in the positive definite one,
+\end{itemize}
+and a least squares resolution.
 Let $\operatorname{span}(S) = \left \{ {\sum_{i=1}^k \lambda_i v_i \Big| k \in \mathbb{N}, v_i \in S, \lambda _i \in \mathbb{R}} \right \}$ be the linear span of a set of real vectors $S$. So,\\
 $\min_{\alpha \in \mathbb{R}^s} ||b-R\alpha ||_2 = \min_{\alpha \in \mathbb{R}^s} ||b-AS\alpha ||_2$
 
@@ -794,14 +838,16 @@ $\begin{array}{ll}
 & \leqslant \min_{\lambda \in \mathbb{R}} ||b-\lambda Ax_{k} ||_2\\
 & \leqslant ||b-Ax_{k}||_2\\
 & = ||r_k||_2\\
-& \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||,
+& \leqslant \left(1-\dfrac{\alpha}{\beta}\right)^{\frac{km}{2}} ||r_0||, \textrm{ if $A$ is positive,}\\
+& \leqslant \left( 1-\frac{\lambda_{\mathrm{min}}^2(1/2(A^T + A))}{ \lambda_{\mathrm{max}}(A^T A)} \right)^{km/2} \|r_{0}\|, \textrm{ if $A$ is}\\
+& \textrm{positive definite,} 
 \end{array}$
 \end{itemize}
 which concludes the induction and the proof.
 \end{proof}
 
-We can remark that, at each iterate, the residue of the TSIRM algorithm is lower 
-than the one of the GMRES method.
+%We can remark that, at each iterate, the residue of the TSIRM algorithm is lower 
+%than the one of the GMRES method.
 
 %%%*********************************************************
 %%%*********************************************************
@@ -809,13 +855,13 @@ than the one of the GMRES method.
 \label{sec:05}
 
 
-In order to see the influence of our algorithm with only one processor, we first
-show a comparison with GMRES or FGMRES and our algorithm. In Table~\ref{tab:01},
-we  show the  matrices we  have  used and  some of  them characteristics.  Those
-matrices  are   chosen  from   the  Davis  collection   of  the   University  of
-Florida~\cite{Dav97}. They are matrices arising in real-world applications.  For
-all the  matrices, the name,  the field,  the number of  rows and the  number of
-nonzero elements are given.
+In order to see the behavior of the proposal when considering only one processor, a first
+comparison with GMRES or FGMRES and the new algorithm detailed previously has been experimented. 
+Matrices that have been used with their characteristics (names, fields, rows, and nonzero coefficients) are detailed in 
+Table~\ref{tab:01}.  These latter, which are real-world applications matrices, 
+have been extracted 
+ from   the  Davis  collection,   University  of
+Florida~\cite{Dav97}.
 
 \begin{table}[htbp]
 \begin{center}
@@ -835,8 +881,9 @@ torso3             & 2D/3D problem & 259,156 & 4,429,042 \\
 \label{tab:01}
 \end{center}
 \end{table}
-
-The following  parameters have been chosen  for our experiments.   As by default
+Chosen parameters are detailed below.
+%The following  parameters have been chosen  for our experiments.   
+As by default
 the restart  of GMRES is performed every  30 iterations, we have  chosen to stop
 the GMRES every 30 iterations (\emph{i.e.} $max\_iter_{kryl}=30$).  $s$ is set to 8. CGLS is
 chosen  to minimize  the least-squares  problem with  the  following parameters:
@@ -846,16 +893,15 @@ Core(TM) i7-3630QM CPU @ 2.40GHz with the version 3.5.1 of PETSc.
 
 
 In  Table~\ref{tab:02}, some  experiments comparing  the solving  of  the linear
-systems obtained with the previous matrices  with a GMRES variant and with out 2
-stage algorithm are  given. In the second column, it can  be noticed that either
-GRMES or  FGMRES (Flexible  GMRES)~\cite{Saad:1993} is used  to solve  the linear
-system.   According to  the matrices,  different preconditioner  is  used.  With
-TSIRM, the same solver and the  same preconditionner are used.  This Table shows
-that  TSIRM  can  drastically reduce  the  number  of  iterations to  reach  the
-convergence when the  number of iterations for the normal GMRES  is more or less
-greater than  500. In fact  this also depends  on tow parameters: the  number of
-iterations  to  stop  GMRES  and   the  number  of  iterations  to  perform  the
-minimization.
+systems obtained with the previous matrices  with a GMRES variant and with TSIRM
+are given. In the  second column, it can be noticed that  either GRMES or FGMRES
+(Flexible GMRES)~\cite{Saad:1993} is used to solve the linear system.  According
+to the matrices, different preconditioner  is used.  With TSIRM, the same solver
+and  the  same  preconditionner are  used.   This  Table  shows that  TSIRM  can
+drastically reduce  the number of iterations  to reach the  convergence when the
+number of iterations for  the normal GMRES is more or less  greater than 500. In
+fact this also depends on tow parameters: the number of iterations to stop GMRES
+and the number of iterations to perform the minimization.
 
 
 \begin{table}[htbp]
@@ -916,8 +962,16 @@ by core. The Juqueen architecture is composed  of IBM PowerPC A2 at 1.6 GHz with
 speed network.
 
 
+In  many situations, using  preconditioners is  essential in  order to  find the
+solution of a linear system.  There are many preconditioners available in PETSc.
+For parallel applications all  the preconditioners based on matrix factorization
+are  not  available. In  our  experiments, we  have  tested  different kinds  of
+preconditioners, however  as it is  not the subject  of this paper, we  will not
+present results with many preconditioners. In  practise, we have chosen to use a
+multigrid (mg)  and successive  over-relaxation (sor). For  more details  on the
+preconditioner in PETSc please consult~\cite{petsc-web-page}.
+
 
-{\bf Description of preconditioners}\\
 
 \begin{table*}[htbp]
 \begin{center}
@@ -938,15 +992,14 @@ speed network.
 \hline
 
 \end{tabular}
-\caption{Comparison of FGMRES and TSIRM with FGMRES for example ex15 of PETSc with two preconditioners (mg and sor) with 25,000 components per core on Juqueen (threshold 1e-3, restart=30, s=12),  time is expressed in seconds.}
+\caption{Comparison of FGMRES and TSIRM with FGMRES for example ex15 of PETSc with two preconditioners (mg and sor) with 25,000 components per core on Juqueen ($\epsilon_{tsirm}=1e-3$, $max\_iter_{kryl}=30$, $s=12$, $max\_iter_{ls}=15$, $\epsilon_{ls}=1e-40$),  time is expressed in seconds.}
 \label{tab:03}
 \end{center}
 \end{table*}
 
 Table~\ref{tab:03} shows  the execution  times and the  number of  iterations of
 example ex15  of PETSc on the  Juqueen architecture. Different  numbers of cores
-are  studied ranging  from  2,048  up-to 16,383.   Two  preconditioners have  been
-tested: {\it mg} and {\it sor}.   For those experiments,  the number  of components  (or unknowns  of the
+are  studied ranging  from  2,048  up-to 16,383 with the two preconditioners {\it mg} and {\it sor}.   For those experiments,  the number  of components  (or unknowns  of the
 problems)  per core  is fixed  to 25,000,  also called  weak  scaling. This
 number can seem relatively small. In fact, for some applications that need a lot
 of  memory, the  number of  components per  processor requires  sometimes  to be
@@ -994,7 +1047,7 @@ the number of iterations. So, the overall benefit of using TSIRM is interesting.
 \begin{tabular}{|r|r|r|r|r|r|r|r|r|} 
 \hline
 
-  nb. cores & threshold   & \multicolumn{2}{c|}{FGMRES} & \multicolumn{2}{c|}{TSIRM CGLS} &  \multicolumn{2}{c|}{TSIRM LSQR} & best gain \\ 
+  nb. cores & $\epsilon_{tsirm}$  & \multicolumn{2}{c|}{FGMRES} & \multicolumn{2}{c|}{TSIRM CGLS} &  \multicolumn{2}{c|}{TSIRM LSQR} & best gain \\ 
 \cline{3-8}
              &                       & Time  & \# Iter.  & Time  & \# Iter. & Time  & \# Iter. & \\\hline \hline
   2,048      & 8e-5                  & 108.88 & 16,560  & 23.06  &  3,630  & 22.79  & 3,630   & 4.77 \\
@@ -1007,14 +1060,46 @@ the number of iterations. So, the overall benefit of using TSIRM is interesting.
 \hline
 
 \end{tabular}
-\caption{Comparison of FGMRES  and TSIRM with FGMRES algorithms for ex54 of Petsc (both with the MG preconditioner) with 25,000 components per core on Curie (restart=30, s=12),  time is expressed in seconds.}
+\caption{Comparison of FGMRES  and TSIRM with FGMRES algorithms for ex54 of Petsc (both with the MG preconditioner) with 25,000 components per core on Curie ($max\_iter_{kryl}=30$, $s=12$, $max\_iter_{ls}=15$, $\epsilon_{ls}=1e-40$),  time is expressed in seconds.}
 \label{tab:04}
 \end{center}
 \end{table*}
 
 
-In Table~\ref{tab:04}, some experiments with example ex54 on the Curie architecture are reported.
-
+In  Table~\ref{tab:04},  some  experiments   with  example  ex54  on  the  Curie
+architecture are reported.  For this  application, we fixed $\alpha=0.6$.  As it
+can be seen in that Table, the size of the problem has a strong influence on the
+number of iterations to reach the  convergence. That is why we have preferred to
+change the threshold.  If we set  it to $1e-3$ as with the previous application,
+only one iteration is necessray  to reach the convergence. So Table~\ref{tab:04}
+shows the results  of differents executions with differents  number of cores and
+differents thresholds. As  with the previous example, we  can observe that TSIRM
+is faster than FGMRES. The ratio greatly depends on the number of iterations for
+FMGRES to reach the threshold. The greater the number of iterations to reach the
+convergence is, the  better the ratio between our algorithm  and FMGRES is. This
+experiment is  also a  weak scaling with  approximately $25,000$  components per
+core. It can also  be observed that the difference between CGLS  and LSQR is not
+significant. Both can be good but it seems not possible to know in advance which
+one will be the best.
+
+Table~\ref{tab:05} show a strong scaling experiment with the exemple ex54 on the
+Curie  architecture. So  in  this case,  the  number of  unknownws  is fixed  to
+$204,919,225$ and the number of cores ranges from $512$ to $8192$ with the power
+of two.  The  threshold is fixed to $5e-5$ and only  the $mg$ preconditioner has
+been tested. Here  again we can see that TSIRM is  faster that FGMRES. Efficiecy
+of each algorithms is reported. It  can be noticed that FGMRES is more efficient
+than TSIRM except with $8,192$ cores and that its efficiency is greater that one
+whereas the  efficiency of TSIRM is  lower than one. Nevertheless,  the ratio of
+TSIRM  with any  version  of the  least-squares  method is  always faster.  With
+$8,192$ cores when the number of iterations is far more important for FGMRES, we
+can see that it is only slightly more important for TSIRM.
+
+In  Figure~\ref{fig:02}  we report  the  number  of  iterations per  second  for
+experiments  reported in  Table~\ref{tab:05}.  This Figure  highlights that  the
+number of iterations per  seconds is more of less the same  for FGMRES and TSIRM
+with a little advantage for FGMRES. It  can be explained by the fact that, as we
+have previously explained, that the iterations of the least-sqaure steps are not
+taken into account with TSIRM.
 
 \begin{table*}[htbp]
 \begin{center}
@@ -1033,7 +1118,7 @@ In Table~\ref{tab:04}, some experiments with example ex54 on the Curie architect
 \hline
 
 \end{tabular}
-\caption{Comparison of FGMRES  and TSIRM with FGMRES for ex54 of Petsc (both with the MG preconditioner) with 204,919,225 components on Curie with different number of cores (restart=30, s=12, threshold 5e-5),  time is expressed in seconds.}
+\caption{Comparison of FGMRES  and TSIRM with FGMRES for ex54 of Petsc (both with the MG preconditioner) with 204,919,225 components on Curie with different number of cores ($\epsilon_{tsirm}=5e-5$, $max\_iter_{kryl}=30$, $s=12$, $max\_iter_{ls}=15$, $\epsilon_{ls}=1e-40$),  time is expressed in seconds.}
 \label{tab:05}
 \end{center}
 \end{table*}
@@ -1045,6 +1130,26 @@ In Table~\ref{tab:04}, some experiments with example ex54 on the Curie architect
 \label{fig:02}
 \end{figure}
 
+
+Concerning the  experiments some  other remarks are  interesting.
+\begin{itemize}
+\item We  can tested other examples of  PETSc (ex29, ex45, ex49).  For all these
+  examples,  we also obtained  similar gain  between GMRES  and TSIRM  but those
+  examples are  not scalable with many  cores. In general, we  had some problems
+  with more than $4,096$ cores.
+\item We have tested many iterative  solvers available in PETSc.  In fast, it is
+  possible to use most of them with TSIRM. From our point of view, the condition
+  to  use  a  solver inside  TSIRM  is  that  the  solver  must have  a  restart
+  feature. More  precisely, the solver must  support to be  stoped and restarted
+  without decrease its  converge. That is why  with GMRES we stop it  when it is
+  naturraly  restarted (i.e.  with  $m$ the  restart parameter).   The Conjugate
+  Gradient (CG) and all its variants do not have ``restarted'' version in PETSc,
+  so they  are not  efficient.  They  will converge with  TSIRM but  not quickly
+  because if  we compare  a normal CG  with a CG  for which  we stop it  each 16
+  iterations  for example,  the  normal CG  will  be for  more efficient.   Some
+  restarted CG  or CG variant versions exist  and may be interested  to study in
+  future works.
+\end{itemize}
 %%%*********************************************************
 %%%*********************************************************
 
@@ -1067,13 +1172,14 @@ experiments up to 16,394 cores have been led to verify that TSIRM runs
 5 or  7 times  faster than GMRES.
 
 
-For future work, the authors' intention is to investigate 
-other kinds of matrices, problems, and inner solvers. The 
-influence of all parameters must be tested too, while 
-other methods to minimize the residuals must be regarded.
-The number of outer iterations to minimize should become 
-adaptative to improve the overall performances of the proposal.
-Finally, this solver will be implemented inside PETSc.
+For  future  work, the  authors'  intention is  to  investigate  other kinds  of
+matrices, problems, and  inner solvers. The influence of  all parameters must be
+tested too, while other methods to minimize the residuals must be regarded.  The
+number of outer  iterations to minimize should become  adaptative to improve the
+overall performances of the proposal.   Finally, this solver will be implemented
+inside PETSc. This  would be very interesting because it would  allow us to test
+all the non-linear  examples and compare our algorithm  with the other algorithm
+implemented in PETSc.
 
 
 % conference papers do not normally have an appendix