BookGPU/Chapters/chapter5/biblio5.bib

   1 % This file was created with JabRef 2.8.1.
   2 % Encoding: Cp1252
   3
   4 @INCOLLECTION{ch5:Bajrovic2011,
   5   author = {Bajrovic, E. and Traff, J.},
   6   title = {Using {MPI} Derived Datatypes in Numerical Libraries},
   7   booktitle = {Recent Advances in the Message Passing Interface},
   8   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
   9   year = {2011},
  10   editor = {Cotronis, Y. and Danalis, A. and Nikolopoulos, D.
  11         and Dongarra, J.},
  12   volume = {6960},
  13   series = {Lecture Notes in Computer Science},
  14   pages = {29-38},
  15   affiliation = {Faculty of Computer Science, University of Vienna, Nordbergstrasse
  16         15/3C, A-1090 Vienna, Austria},
  17   file = {Bajrovic2011.pdf:Bajrovic2011.pdf:PDF},
  18   isbn = {978-3-642-24448-3},
  19   keyword = {Computer Science},
  20   owner = {slgl},
  21   timestamp = {2012.09.10},
  22   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-24449-0_6}
  23 }
  24
  25 @ARTICLE{ch5:Bell2011,
  26   author = {N. Bell and J. Hoberock},
  27   title = {Thrust: A Productivity-Oriented Library for {CUDA}},
  28   journal = {In GPU Computing Gems, {\rm Jade Edition, Edited by Wen-mei W. Hwu. Elsevier Science}},
  29   year = {2011},
  30   volume = {2},
  31   pages = {359-371},
  32 }
  33
  34 @ARTICLE{ch5:Engsig-Karup2011,
  35   author = {Allan Peter Engsig-Karup and Morten Gorm Madsen and Stefan Lemvig
  36         Glimberg},
  37   title = {A massively parallel GPU-accelerated model for analysis of fully
  38         nonlinear free surface waves},
  39   journal = {International Journal for Numerical Methods in Fluids},
  40   year = {2011},
  41   owner = {slgl},
  42   timestamp = {2011.11.06}
  43 }
  44
  45 @BOOK{ch5:Gamma1995,
  46   title = {Design Patterns--Elements of Reusable Object-Oriented Software},
  47   publisher = {Addison-Wesley Professional Computing Series},
  48   year = {1995},
  49   author = {E. Gamma and R. Helm and R. Johnson and J. Vlissides},
  50   owner = {slgl},
  51   timestamp = {2012.09.10}
  52 }
  53
  54 @BOOK{ch5:Gropp1999,
  55   title = {Using {MPI}: Portable Parallel Programming with the Message Passing
  56         Interface, {\rm 2nd edition}},
  57   publisher = {MIT Press},
  58   year = {1999},
  59   author = {W. Gropp and E. Lusk and A. Skjellum},
  60   address = {Cambridge, MA},
  61   area = {M},
  62   areaseq = {0}
  63 }
  64
  65 @BOOK{ch5:Gropp1999a,
  66   title = {Using {MPI-2}: Advanced Features of the Message-Passing Interface},
  67   publisher = {MIT Press},
  68   year = {1999},
  69   author = {William Gropp and Ewing Lusk and Rajeev Thakur},
  70   address = {Cambridge, MA},
  71   area = {M},
  72   areaseq = {0}
  73 }
  74
  75 @INCOLLECTION{ch5:Hoefler2011,
  76   author = {Hoefler, T. and Snir, M.},
  77   title = {Writing Parallel Libraries with {MPI}--{C}ommon Practice, Issues, and
  78         Extensions},
  79   booktitle = {Recent Advances in the Message Passing Interface},
  80   publisher = {Springer, Berlin/Heidelberg},
  81   year = {2011},
  82   editor = {Cotronis, Y. and Danalis, A. and Nikolopoulos, D.
  83         and Dongarra, J.},
  84   volume = {6960},
  85   series = {Lecture Notes in Computer Science},
  86   pages = {345-355},
  87   affiliation = {University of Illinois, Urbana, IL 61801, USA},
  88   file = {Hoefler2011.pdf:Hoefler2011.pdf:PDF},
  89   isbn = {978-3-642-24448-3},
  90   keyword = {Computer Science},
  91   owner = {slgl},
  92   timestamp = {2012.09.10},
  93   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-24449-0_45}
  94 }
  95
  96 @BOOK{ch5:LeVeque2007,
  97   title = {Finite Difference Methods for Ordinary and Partial Differential Equations--Steady-state and Time-dependent Problems},
  98   publisher = {SIAM},
  99   address = {Philadelphia, PA},
 100   year = {2007},
 101   author = {R. J. LeVeque},
 102   pages = {I-XV, 1-341},
 103   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 104   ee = {http://www.ec-securehost.com/SIAM/OT98.html},
 105   isbn = {978-0-89871-629-0}
 106 }
 107
 108 @TECHREPORT{ch5:Skjellum1994,
 109   author = {A. Skjellum and N. E. Doss and P. V. Bangaloret},
 110   title = {Writing Libraries in {MPI}},
 111   institution = {Department of Computer Science and NSF Engineering Research Center
 112         for Computational Fiels Simulation. Mississippi State University},
 113   year = {1994},
 114   file = {Skjellum1994.pdf:Skjellum1994.pdf:PDF},
 115   type = {Technical {R}eport},
 116 }
 117
 118 @BOOK{ch5:Smith1996,
 119   title = {Domain Decomposition: Parallel Multilevel Methods for Elliptic Partial
 120         Differential Equations},
 121   publisher = {Cambridge University Press},
 122   year = {1996},
 123   author = {B. F. Smith and P. E. Bj{\o}rstad and W. D. Gropp},
 124   address = {New York},
 125   area = {D},
 126   areaseq = {0}
 127 }
 128
 129 @BOOK{ch5:Vandevoorde2002,
 130   title = {C++ Templates: The Complete Guide},
 131   publisher = {Addison-Wesley Professional},
 132   year = {2002},
 133   author = {D. Vandevoorde and N. M. Josuttis},
 134   pages = {552},
 135   month = {November},
 136   owner = {slgl},
 137   timestamp = {2011.07.15},
 138   url = {http://www.amazon.com/Templates-Complete-Guide-David-Vandevoorde/dp/0201734842/ref=sr_1_3?ie=UTF8&qid=1310721621&sr=8-3}
 139 }
 140
 141 @article{ch5:Korson1992,
 142  author = {Korson, T. and McGregor, J. D.},
 143  title = {Technical criteria for the specification and evaluation of object-oriented libraries},
 144  journal = {Softw. Eng. J.},
 145  issue_date = {March 1992},
 146  volume = {7},
 147  number = {2},
 148  month = mar,
 149  year = {1992},
 150  issn = {0268-6961},
 151  pages = {85--94},
 152  numpages = {10},
 153  url = {http://dx.doi.org/10.1049/sej.1992.0009},
 154  doi = {10.1049/sej.1992.0009},
 155  acmid = {148991},
 156  publisher = {Michael Faraday House},
 157  address = {Herts, UK, UK},
 158 }
 159
 160 @MISC{ch5:Acklam1998,
 161     author = {Elizabeth Acklam and Hans Petter Langtangen and Hans Petter Langtangen and Are Magnus Bruaset},
 162     title = {Parallelization of Explicit Finite Difference Schemes via Domain Decomposition},
 163     year = {1998}
 164 }
 165
 166 @INPROCEEDINGS{ch5:Glimberg2011,
 167   AUTHOR =       {S. L. Glimberg and A. P. Engsig-Karup and M. G. Madsen},
 168   TITLE =        {A Fast GPU-accelerated Mixed-precision Strategy for Fully Nonlinear Water Wave Computations},
 169   BOOKTITLE =    {Numerical Mathematics and Advanced Applications 2011, Proceedings of ENUMATH 2011, the 9th European Conference on Numerical Mathematics and Advanced Applications, Leicester, September 2011},
 170   YEAR =         {2011},
 171   editor =       {A. Cangiani and R. L. Davidchack and E. Georgoulis and A.N. Gorban and J. Levesley and M. V. Tretyakov},
 172   publisher =    {Springer},
 173 }
 174
 175 @techreport{ch5:Asanovic:EECS-2006-183,
 176   Author = {Asanovic, K. and Bodik, R. and Catanzaro, B. C. and Gebis, J. J. and Husbands, P. and Keutzer, K. and Patterson, D. A. and Plishker, W. L. and Shalf, J. and Williams, S. W. and Yelick, K. A.},
 177   Title = {The Landscape of Parallel Computing Research: A View from {B}erkeley},
 178   Institution = {EECS Department, University of California, Berkeley},
 179   Year = {2006},
 180   Month = {Dec},
 181   Number = {UCB/EECS-2006-183},
 182 }
 183
 184 @article{ch5:mooreslaw1965,
 185   author =  {Gordon E. Moore},
 186   title =   {Cramming more components onto integrated circuits},
 187   journal = {Electronics},
 188   year = {1965},
 189   volume =  {38},
 190   number =  {8},
 191   pages =   {114-117}
 192 }
 193
 194 @techreport{ch5:Kloeckner2011,
 195   title = "{High-Order Discontinuous Galerkin Methods by GPU Metaprogramming}",
 196   author = "A. Kloeckner, T. Warburton and J. S. Hesthaven",
 197   institution = "Scientific Computing Group, Brown University",
 198   number = "2011-13",
 199   address = "Providence, RI",
 200   year = "2011",
 201   month = jun,
 202 }
 203
 204 @book{ch5:Ferziger1996,
 205   title={Computational Methods for Fluid Dynamics},
 206   author={Ferziger, J.H. and Peri{\'c}, M.},
 207   isbn={9783540594345},
 208   lccn={98231766},
 209   series={Numerical Methods: Research and Development},
 210   url={http://books.google.dk/books?id=SJkeAQAAIAAJ},
 211   year={1996},
 212   publisher={Springer-Verlag, Berlin Heidelberg New York}
 213 }
 214
 215 @book{ch5:chorin1993,
 216   title={A Mathematical Introduction to Fluid Mechanics},
 217   author={Chorin, A. J. and Marsden, J. E.},
 218   isbn={9780387979182},
 219   lccn={98115991},
 220   series={Texts in Applied Mathematics},
 221   url={http://books.google.dk/books?id=0Iglq1WA5PQC},
 222   year={1993},
 223   publisher={Springer, New York, NY},
 224   edition={3rd},
 225 }
 226
 227
 228 @book{ch5:Saad2003,
 229  author = {Saad, Y.},
 230  title = {Iterative Methods for Sparse Linear Systems},
 231  year = {2003},
 232  isbn = {0898715342},
 233  edition = {2nd},
 234  publisher = {Society for Industrial and Applied Mathematics},
 235  address = {Philadelphia, PA},
 236 }
 237
 238 @book{ch5:Kelley1995,
 239   title={Iterative Methods for Linear and Nonlinear Equations},
 240   author={Kelley, C. T.},
 241   isbn={9780898713527},
 242   lccn={lc95032249},
 243   series={Frontiers in Applied Mathematics Series},
 244   url={http://books.google.dk/books?id=3J4XEAooQOoC},
 245   year={1995},
 246   publisher={Society for Industrial and Applied Mathematics, Philadelphia, PA,}
 247 }
 248
 249 @techreport{ch5:YMTR08,
 250         author = {Y. Maday},
 251         title = {The parareal in time algorithm},
 252         institution = {Universite Pierr\'{e} et Marie Curie, Paris},
 253         year = {2008},
 254         type = {Technical Report},
 255         number = {R08030}
 256 }
 257
 258 @article{ch5:MS07,
 259         author = {M. Gander and S. Vandewalle},
 260         title = {Analysis of the parareal time-parallel time-integration method},
 261         journal = {SIAM Journal of Scientific Computing},
 262         year = {2007},
 263         volume = {29},
 264         number = {2},
 265         pages = {556-578}
 266 }
 267
 268 @article{ch5:LMT01,
 269         author = {J.-L. Lions and Y. Maday and G. Turinici},
 270         title = {R\'{e}solution d'EDP par un sch\'{e}ma en temps parar\'{e}el},
 271         journal = {C.R. Acad. Sci. Paris S\'{e}r. I Math},
 272         year = {2001},
 273         volume = {332},
 274         pages = {661-668}
 275 }
 276
 277 @article{ch5:LSY02,
 278   title = {Parallel-in-time molecular-dynamics simulations},
 279   author = {Baffico, L. and Bernard, S. and Maday, Y. and Turinici, G. and Z\'erah, G.},
 280   journal = {Phys. Rev. E},
 281   volume = {66},
 282   issue = {5},
 283   pages = {057701},
 284   numpages = {4},
 285   year = {2002},
 286   month = {Nov},
 287   doi = {10.1103/PhysRevE.66.057701},
 288   url = {http://link.aps.org/doi/10.1103/PhysRevE.66.057701},
 289   publisher = {American Physical Society}
 290 }
 291
 292 @mastersthesis{ch5:ASNP12,
 293         author = {A. S. Nielsen},
 294         title = {Feasibility study of the Parareal algorithm},
 295         school = {Technical University of Denmark, Department of Informatics and Mathematical Modeling, Lyngby},
 296         year = {2012},
 297         type = {Master Thesis}
 298 }
 299
 300 @article{ch5:EA10,
 301         author = {Aubanel, E.},
 302         title = {Scheduling of tasks in the Parareal algorithm},
 303         journal = {Parallel Computing},
 304         year = {2010},
 305         volume = {37},
 306         pages = {172-182}
 307 }
 308
 309 @BOOK{ch5:Barrett1994,
 310   AUTHOR = {R. Barrett and M. Berry and T. F. Chan and J. Demmel and J. Donato and J. Dongarra and V. Eijkhout and R. Pozo and C. Romine and H. Van der Vorst },
 311   TITLE = {Templates for the Solution of Linear Systems: Building Blocks for Iterative Methods},
 312   edition = {2nd},
 313   PUBLISHER = {SIAM},
 314   YEAR = {1994},
 315   ADDRESS = {Philadelphia, PA}
 316 }
 317
 318 @TECHREPORT{ch5:ScientificGrandChallenges2010,
 319   author = {D. L. Brown, P. Messina et. al},
 320   title = {Scientific Grand Challenges, Crosscutting technologies for computing at the exascale},
 321   institution = {U.S. Department of Energy},
 322   year = {2010},
 323   month = {February},
 324   address = {Washington, D.C.},
 325   type = {Technical {R}eport},
 326 }
 327
 328 @article{ch5:Keyes2011,
 329 author = {D. E. Keyes},
 330 title = {{Exaflop/s: The why and the how}},
 331 journal = {Comptes Rendus Mecanique},
 332 volume = {339},
 333 year = {2011},
 334 pages = {70--77},
 335 issue = {2},
 336 doi = {10.1016/j.crme.2010.11.002},
 337 masid = {49649121}
 338 }
 339
 340 @ARTICLE{ch5:Cai2005,
 341   author = {X. Cai and G.K. Pedersen and H.P. Langtangen},
 342   title = {A parallel multi-subdomain strategy for solving Boussinesq water wave equations},
 343   journal = {Elsevier - Advances in Water Resources},
 344   year = {2005},
 345   volume = {28},
 346   pages = {215-233},
 347 }
 348
 349 @ARTICLE{ch5:GlimbergEtAl2012,
 350   AUTHOR =       {Stefan L. Glimberg and Allan P. Engsig-Karup},
 351   TITLE =        {On a Multi-GPU Implementation of a Free Surface Water Wave Model for Large-scale Simulations},
 352   JOURNAL =      {Submitted to: Special Issue of the Journal Parallel Computing},
 353   YEAR =         {2012},
 354   volume =       {7th Special Issue devoted to PMAA 2012},
 355 }
 356
 357 @misc{ch5:cudaguide,
 358    author = {{NVIDIA Corporation}},
 359    title = {{CUDA C} {P}rogramming {G}uide},
 360    publisher = {NVIDIA Corporation},
 361    year = {2012},
 362    url = {http://docs.nvidia.com/cuda/cuda-c-programming-guide/index.html}
 363 }
 364
 365 @misc{ch5:cudapractice,
 366    author = {{NVIDIA Corporation}},
 367    title = {\rm {CUDA C} {B}est {P}ractices {G}uide},
 368    publisher = {NVIDIA Corporation},
 369    year = {2012},
 370    url = {http://docs.nvidia.com/cuda/cuda-c-best-practices-guide/index.html}
 371 }
 372
 373 @inproceedings{ch5:Bell2009,
 374  author = {Bell, N. and Garland, M.},
 375  title = {Implementing sparse matrix-vector multiplication on throughput-oriented processors},
 376  booktitle = {SC '09: Proceedings of the Conference on High Performance Computing Networking, Storage and Analysis},
 377  year = {2009},
 378  isbn = {978-1-60558-744-8},
 379  pages = {1--11},
 380  location = {Portland, Oregon},
 381  doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1654059.1654078},
 382  publisher = {ACM},
 383  address = {New York, NY},
 384  }
 385
 386 @book{ch5:Kirk2010,
 387  author = {Kirk, D. B. and Hwu, W.-M. W.},
 388  title = {Programming Massively Parallel Processors: A Hands-on Approach},
 389  year = {2010},
 390  isbn = {0123814723, 9780123814722},
 391  publisher = {Morgan Kaufmann Publishers Inc.},
 392  address = {San Francisco, CA},
 393 }
 394
 395 @book{ch5:Trottenberg2001,
 396   title={Multigrid},
 397   author={Trottenberg, U. and Oosterlee, C. W. and Sch{\"u}ller, A.},
 398   isbn={9780127010700},
 399   lccn={00103940},
 400   url={http://books.google.dk/books?id=9ysyNPZoR24C},
 401   year={2001},
 402   publisher={Elsevier Academic Press},
 403   address={London}
 404 }