pour laquelle j'ai été recruté dans l'équipe AND du département
DISC. Enfin la section~\ref{sub:gen} présente comment j'ai réinvesti le
domaine de la bio-informatique à l'aide de compétences connexes.
-Ces travaux ont été valorisées par des publications dont les références sont données.
+Ces travaux ont été valorisés par des publications dont les références sont données.
\subsection{Vérification de programmes par
preuve automatique}\label{sub:verif}
en synchrone ou en asynchrone.
%Ils ont été étudiés à de maintes reprises ~\cite{Rob95,Bah00,bcv02}.
Pour chacun de ces modes, il existe des critères (suffisants) de convergence
-globale ou locale, souvent basés sur le fait que $f$ est
+globale ou locale, souvent basés sur le fait que $f$
est un opérateur contractant dans un espace.
Les modes asynchrones ont une dynamique avec plus de liberté
qui combine synchronisme et asynchronisme.
Intuitivement, les n{\oe}uds qui pourraient engendrer des cycles dans
les itérations asynchrones sont regroupés dans une même classe.
-Les noeuds à l'intérieur celle-ci seront itérés de manière
+Les noeuds à l'intérieur de celle-ci seront itérés de manière
synchrone et les itérations asynchrones sont conservées entre les groupes.
Pour gommer les différences entre les n{\oe}uds d'une même classe
lorsqu'ils sont vus depuis des n{\oe}uds extérieurs, j'ai défini le
Des méthodes de simulation basées sur des stratégies et des délais générés aléatoirement avaient déjà été présentées.
Cependant, comme ces implantations ne sont pas exhaustives, elles ne sont intéressantes que lorsqu'elles fournissent un contre-exemple.
Lorsqu'elles exhibent une convergence,
-cela ne permet que donner une intuition de convergence, pas une preuve.
+cela ne permet que de donner une intuition de convergence, pas une preuve.
Autant que je sache, aucune démarche de preuve formelle automatique
de convergence n'avait jamais été établie.
Je me suis intéressé ensuite à l'étude du problème dual
de l'étude de divergence d'un SDD.
Le Pr. C. Guyeux de l'équipe AND a proposé dans sa thèse en 2010
-une caractérisation des fonctions $f$ de $\{0,1\}^n$ dans lui même
+une caractérisation des fonctions $f$ de $\{0,1\}^n$ dans lui-même
dont les itérations sont chaotiques selon Devanney pour un mode donné:
il est nécessaire et suffisant que son graphe des itérations soit
fortement connexe.
apprentissage par un réseau de neurones.
J'ai notamment pu contribuer à montrer pratiquement qu'il
est très difficile (voir impossible) de les prédire
-à l'aide de tels outils d'intelligence artificielle~\cite{bcgs12:ij}.
+à l'aide d'outils d'intelligence artificielle~\cite{bcgs12:ij}.
Nous nous sommes attaqués parallèlement
$n$-cube revient à trouver un code
de Gray dans un mot de $n$-bits. Les compétences acquises lors du travail
sur les chemins hamiltoniens ont ainsi pu être réutilisées et approfondies.
-Les résultats pratiques quant à l'utilisation de ces codes ce sont cependant
+Les résultats pratiques quant à l'utilisation de ces codes se sont cependant
révélés comme moins pertinents que l'utilisation de $n$ sorties.
Ceci a été valorisé dans les publications~\cite{cds12:ip,cds13:ij}.
pseudo-aléatoires (PRNG)
basé sur une seule fonction dont nous avions prouvé la chaoticité
des itérations, à savoir la négation booléenne vectorielle. Cependant pour
-réussir les tests statistiques dédiées aux PRNGs, il était nécessaire d'itérer
+réussir les tests statistiques dédiés aux PRNGs, il était nécessaire d'itérer
un grand nombre (arbitraire) de fois cette fonction entre deux
sorties.
De plus, je me suis attaché à montrer l'importance
de l'équilibrage du chemin hamiltonien à enlever.
-Les générateurs produits ont d'abord été évalués avec succès
-ont confirmé la qualité de
-ceux-ci~\cite{bcgw11:ip,chgw+14:onp,chgw+14:oip} en se confrontant à
+
+Les qualités statistiques des générateurs produits
+ont été évalués avec succès
+~\cite{bcgw11:ip,chgw+14:onp,chgw+14:oip} en se confrontant à
des batteries de tests telles que Die-Hard, NIST, TestU01.
Plus récemment, nous avons entrepris de trouver des bornes du temps d'arrêt
construit en enlevant un chemin hamiltonien équilibré dans un $n$-cube. Le travail
en collaboration avec Pr. P.-C. Heam du DISC
est en cours de soumission
-dans un international.
+dans un journal international.
Enfin j'ai été sollicité pour encadrer une thèse sur l'implantation
de générateurs de nombre pseudo-aléatoires à bases d'itérations
élevée~\cite{bcfg12b:ip,bcfg+13:ip} soit pour masquer l'information dans le média
et être le moins détectable possible~\cite{bcfg12a:ip}.
-D'autre méthodes de watermarking ont été investies
+D'autre méthodes de watermarking ont été investies,
particulièrement celles basées sur la Quantization Index Modulation (QIM), méthodes
étant supposées comme les plus robustes. Mes principales contributions
-sur ce travail --en collaboration avec Dr R. Darzy de l'Université Antonine au Liban
+sur ce travail --en collaboration avec Dr R. Darazy de l'Université Antonine au Liban
et en co-encadrant le stage de M2 de Ahmad Bittar--,
ont été
d'intégrer ceci à du marquage de document PDF puis de
présenter ce problème comme un problème d'optimisation.
Grâce à une telle présentation nous avons pu trouver les paramètre optimaux
des méthodes QIM assurant à la fois robustesse et indétectabilité.
-Le travail est en cours de soumission dans un international.
+Le travail est en cours de soumission dans un journal international.
Lorsque l'objectif visé est l'indétectabilité, on parle de \emph{stéganographie}.
Ce domaine a été adressé en critiquant notamment les scénarios usuels d'évaluation
\subsection{Les fonctions de hachage}\label{sub:hash}
Une fonction qui calcule une empreinte servant à identifier rapidement toute
-donnée fournie en entrée est une fonction de hachage. On utilse ce genre
+donnée fournie en entrée est une fonction de hachage. On utilise ce genre
de fonctions dès qu'on veut comparer des éléments de grande taille car il
suffit de comparer leurs empreintes (généralement de taille plus réduite).
Une telle fonction doit induire de grandes variations dans l'empreinte
-lorsque l'entrée varie même très peu. C'est l'effet avalanche. Cet
+lorsque l'entrée varie même très peu. C'est l'effet avalanche. Cette
condition fait penser à la forte sensibilité aux conditions initiales
d'une fonction chaotique.
-Fort de nos compétences sur les fonctions dont les itérations sont
+Forts de nos compétences sur les fonctions dont les itérations sont
chaotiques, nous avons proposé de nouvelles fonctions de hachage.
Celles-ci combinent des outils classiques utilisés dans les
fonctions de hachage
usuelles et des itérations de systèmes dynamiques discrets étudiés
-au préallable.
+au préalable.
Nous avons prouvé que ces fonctions sont résistantes à la
-seconde préimage. Leur complexité, polynomiale en la taille
+seconde pré-image. Leur complexité, polynomiale en la taille
du message et la taille de l'empreinte, a été évaluée et correspond
-à ce qu'on attend d'une telle fonction.
+à ce que l'on attend d'une telle fonction.
Nous avons de plus vérifié statistiquement le critère d'avalanche.
Ces résultats ont été valorisés dans les publications~\cite{bcg11:ip,bcg12:ij}.
\subsection{Application à la génomique}\label{sub:gen}
Ayant acquis des compétences sur certaines structures de mathématiques
-discrètes (particulièrement théorie des graphe,
-relation d'équivalence,\ldots), j'ai pu contribuer en bio-informatique
+discrètes (particulièrement théorie des graphes,
+relations d'équivalence,\ldots), j'ai pu contribuer en bio-informatique
en les réappliquant notamment.
-Une de mes première piste de travail a été de proposer une méthode automatique
+Une de mes premières pistes de travail a été de proposer une méthode automatique
de construction d'un ensemble de gènes communs (nommés core-génome)
à une famille de génomes.
La méthode s'appuie sur la construction du graphe de similarité
entre les gènes quotienté selon une relation d'équivalence pour en
-réduire sa taille. Chaque gènes est assimilé à son représentant de
+réduire sa taille. Chaque gène est assimilé à son représentant de
classe dans chaque génome. Le core-génome se déduit comme l'intersection
-de tous les génome. Ceci a donné lieu aux
+de tous les génomes. Ceci a donné lieu aux
publications~\cite{acgs13:onp,akgcs+14:oip,acgm+14:ij}.
L'approche précédente souffrait de n'engendrer que des core-génomes de (trop)
à l'amélioration de la méthode en proposant une étape d'optimisation issue
d'une adaptation discrète la méthode d'essaims particulaires~\cite{aagp+15:ip}.
-Tout ces travaux ont été réalisés en collaboration avec M. Salomon et en co-encadrant
+Tous ces travaux ont été réalisés en collaboration avec M. Salomon et en co-encadrant
le doctorat de B. Alkindy.
Je pense ainsi réduire ce problème à un problème d'optimisation et dégager
une démarche de génération, comme je l'ai fait en bio-informatique.
-Jusqu'à présent, la production de codes de Gray équilibrés adaptés à ces
-contextes d'utilisation
-dans l'étape de construction de fonctions chaotiques pour la génération
-de nombres pseudo aléatoire bute sur des problèmes d'explosion combinatoire:
+Jusqu'à présent, la production de codes de Gray équilibrés pour la génération
+de nombres pseudo-aléatoires bute sur des problèmes d'explosion combinatoire:
les seuls algorithmes connus répondant à ce problème nécessitent a priori
plus de $10^{36}$ évaluations pour $n=8$.
Il n'est ainsi pas raisonnable de mettre en
pratique ce genre d'approche lorsque chacune de ces évaluations prend 1s.
On peut peut-être
-se contenter de code ``presque'' équilibrés , à défaut de pouvoir
+se contenter de codes ``presque'' équilibrés , à défaut de pouvoir
trouver ceux qui seront équilibrés.
Je propose d'investiguer
dans cette thématique en exploitant des approches itératives permettant
-d'obtenir des optimums locaux et trouver ainsi des codes presque équilibrés.x
+d'obtenir des optimums locaux et trouver ainsi des codes presque équilibrés.
La démarche actuelle de génération de nombres pseudo-aléatoires
consiste à marcher dans une partie d'un $n$-cube en choisissant son chemin
à l'aide d'un générateur fourni en entrée. Or ces générateurs sont tous des
-fonctions de $\{0,1\}^n$ dans lui même. Cette approche
+fonctions de $\{0,1\}^n$ dans lui-même. Cette approche
semble pouvoir se réécrire
comme un produit synchrone de deux automates.
L'intérêt d'une telle réécriture est qu'on pourrait exploiter
sur des dispositifs physiques comme les FPGAs a été réalisée. Celle-ci
s'est faite automatiquement à l'aide de l'outil Matlab. Si le code engendré
sur le circuit est bien une implantation fidèle à la spécification,
-il n'en est pas pour autant efficace: le nombre de bits généré par surface
-est plutôt faible. Nous allons exploiter les meilleurs démarches mises en
-exergue lors de la rédaction d'un état de l'art exhaustif sur les PRNG
+il n'en est pas pour autant efficace: le nombre de bits générés par surface
+est plutôt faible. Nous allons exploiter les meilleures démarches mises en
+exergue lors de la rédaction d'un état de l'art exhaustif sur les PRNGs
implantés sur FPGA pour produire du code optimisé.
Je prévois de réaliser ceci dans la thèse de M. Bakiri, en cours.
\newpage
\section{Insertion dans l'équipe de recherche}
-La thématique prinsipale de ma thèse et du post doctorat qui a suivi
+La thématique principale de ma thèse et du post-doctorat qui a suivi
était la vérification de programmes par preuve automatique, soit de
la logique informatique.
Suite à mon recrutement dans l'équipe AND, mes recherches se sont réorientées
-autours des SDDs et donc de l'analyse numérique plus généralement.
+autour des SDDs et donc de l'analyse numérique plus généralement.
En plus des publications obtenues avec les membres de l'équipe AND,
-ce qui suit récapitules quelques éléments permettant
+ce qui suit récapitule quelques éléments permettant
d'apprécier mon insertion dans l'équipe AND
J'ai monté une collaboration active avec l'Université Antonine au Liban.
J'y ai été invité en mai 2013. J'ai par la suite co-encadré trois stages de
-master 2 recherche avec des membres de cette université.
-J'ai un article en cours de soummission résumant un travail en collaboration
+Master 2 recherche avec des membres de cette université.
+J'ai un article en cours de soumission résumant un travail en collaboration
avec un ancien étudiant et un enseignant chercheur de cette université.
Je suis membre du GDR codes et cryptographie. J'ai à ce titre
J'ai été session chair de \og international conference on evolving internet\fg{}
en 2011 et IHTIAP en 2012
-J'ai reviewé des articles pour les journaux internationnaux
+J'ai reviewé des articles pour les journaux internationaux
suivants: The computer Journal, Springer Multimedia Tool and application,
Springer Annals in Telecommunication\ldots
Je suis régulièrement membre de jury des épreuves TIPE, épreuves communes
-à 90 concours d'ingénieurs (sessions 2012 et 2015) et fournit
+à 90 concours d'ingénieurs (sessions 2012 et 2015) et fournis
à chaque session des sujets scientifiques pour l'épreuve.
\subsection{Thèse d'université}
Je co-encadre (à hauteur de 40\%) avec Michel Salomon (40\%) et
-Jacques M. Bahi (20\%) le doctorat de Bassam Al Kindy
+Jacques M. Bahi (20\%) le doctorat de Bassam Alkindy
sur les combinaisons d'approches pour la prédiction de l'évolution génomique.
Le doctorat a commencé en septembre 2012 et devrait être soutenu en
novembre 2015.
Je co-encadre (à hauteur de 50\%) avec Christophe Guyeux (50\%)
-le doctorat de Youssra Fadili
+le doctorat de Youssra Fadil
sur
l'étude du comportement des outils d'intelligence artificielle
face à des dynamiques complexes.
Le doctorat a commencé en septembre 2014 et devrait être soutenu en
aout 2017.
Ce travail de thèse a donné lieu à 1 publication dans un journal international
-en cours de soummission.
+en cours de soumission.
\subsection{Master 2 recherche}
la
Steganography in PDF documents based on Unprintable Control ASCII Codes.
Le stage a commencé le 01 mai 2013 et a été soutenu le 30 septembre 2013.
-Ce travail de master a donné lieu à 1 publication dans un journal international
-en cours de soummission (en révision mineure).
+Ce travail de Master a donné lieu à 1 publication dans un journal international
+en cours de soumission (en révision mineure).
Je co-encadre (à hauteur de 80\%) avec
Talar Atechian -- Université Antonine au Liban--(20\%)
le stage de recherche de Master 2 de Khaled Daher
-sur la désynchronisation du calcul d'optimisatin de la durée de vie
+sur la désynchronisation du calcul d'optimisation de la durée de vie
d'un réseau de capteurs.
Le stage a commencé le 01 avril 2015 et sera soutenu le 31 août 2015.
Depuis septembre 2000, je suis titulaire à l'Université de Franche-Comté,
soit sur un poste de PrCe (de 2000 à 2008, sauf l'année 2006-2007) soit sur
un poste de MdC. J'ai assuré un grand nombre d'enseignements de la première
-année de licence ou de DUT jusqu'en senconde année de Master. Depuis mon
-recrutement comme MdC, j'ai recentré mes enseignements autours
+année de licence ou de DUT jusqu'en seconde année de Master. Depuis mon
+recrutement comme MdC, j'ai recentré mes enseignements autour
de mes thématiques de recherche, à savoir essentiellement les
mathématiques discrètes.
Je suis de plus le coordinateur des enseignements de mathématiques
J'ai été membre élu du conseil d'institut de l'IUT BM
de 2011 à 2014. A ce titre j'ai participé à la vie administrative de l'IUT,
-aux commissions de recrutement d'enseignants et d'enseignant-chercheurs\ldots
+aux commissions de recrutement d'enseignants et d'enseignants-chercheurs\ldots
Depuis septembre 2014, je suis élu au conseil du département d'informatique
de l'IUT BM.
-Depuis spetembre 2014, je suis le responsable du parcours TeProw
-de la Licence Pro Conception des Application Multi-tiers localisé
+Depuis septembre 2014, je suis le responsable du parcours TeProw
+de la Licence Pro Conception des Application Multi-tiers localisée
à l'IUT BM. Cette licence
a aussi un parcours à l'UFR ST. Je coordonne toute l'organisation
de cette licence avec mon collègue de Besançon.
\begin{itemize}
\item au Workshop \og Théorie des réseaux booléens et ses applications en biologie\fg{}
-à Nice en novembre 2014.
+à Nice en novembre 2014;
\item à la journée \og Advances in Mobile Technologies Day\fg{} par l'Université Antonine (Liban) en mai 2013;
