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[mpi-energy2.git] / mpi-energy2-extension / Heter_paper.tex
index 6b3fbb1fda6a1fd8cd7a382ab3fa909e466ba5fc..b6839ce0402ea1e9596cbbda03b2bc55a284cb3e 100644 (file)
@@ -1,11 +1,49 @@
-\documentclass[3p,times]{elsarticle-1}
-\usepackage{ecrc}
+\documentclass[review]{elsarticle}
+
+\usepackage{lineno,hyperref}
+\modulolinenumbers[5]
+
+\journal{Journal of Computational Science}
+
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
+%% Elsevier bibliography styles
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
+%% To change the style, put a % in front of the second line of the current style and
+%% remove the % from the second line of the style you would like to use.
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
+
+%% Numbered
+%\bibliographystyle{model1-num-names}
+
+%% Numbered without titles
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+
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+
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+
+%% `Elsevier LaTeX' style
+\bibliographystyle{elsarticle-num}
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
+
 \usepackage[T1]{fontenc}
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 \usepackage[english]{babel}
 \usepackage{algpseudocode}
 \usepackage{graphicx}
 \usepackage{algorithm}
+\usepackage{setspace}
 \usepackage{subfig}
 \usepackage{amsmath}
 \usepackage{url}
 \newcommand{\Told}{\Xsub{T}{Old}}
 
 
-%% The ecrc package defines commands needed for running heads and logos.
-%% For running heads, you can set the journal name, the volume, the starting page and the authors
-
-%% set the volume if you know. Otherwise `00'
-\volume{00}
-
-%% set the starting page if not 1
-\firstpage{1}
-
-%% Give the name of the journal
-\journalname{Procedia Computer Science}
-
-%% Give the author list to appear in the running head
-%% Example \runauth{C.V. Radhakrishnan et al.}
-\runauth{}
-
-%% The choice of journal logo is determined by the \jid and \jnltitlelogo commands.
-%% A user-supplied logo with the name <\jid>logo.pdf will be inserted if present.
-%% e.g. if \jid{yspmi} the system will look for a file yspmilogo.pdf
-%% Otherwise the content of \jnltitlelogo will be set between horizontal lines as a default logo
-
-%% Give the abbreviation of the Journal.
-\jid{procs}
-
-%% Give a short journal name for the dummy logo (if needed)
-\jnltitlelogo{Procedia Computer Science}
-
-%% Hereafter the template follows `elsarticle'.
-%% For more details see the existing template files elsarticle-template-harv.tex and elsarticle-template-num.tex.
 
-%% Elsevier CRC generally uses a numbered reference style
-%% For this, the conventions of elsarticle-template-num.tex should be followed (included below)
-%% If using BibTeX, use the style file elsarticle-num.bst
-
-%% End of ecrc-specific commands
-%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
-
-%% The amssymb package provides various useful mathematical symbols
-\usepackage{amssymb}
-%% The amsthm package provides extended theorem environments
-%% \usepackage{amsthm}
-
-%% The lineno packages adds line numbers. Start line numbering with
-%% \begin{linenumbers}, end it with \end{linenumbers}. Or switch it on
-%% for the whole article with \linenumbers after \end{frontmatter}.
-%% \usepackage{lineno}
-
-%% natbib.sty is loaded by default. However, natbib options can be
-%% provided with \biboptions{...} command. Following options are
-%% valid:
-
-%%   round  -  round parentheses are used (default)
-%%   square -  square brackets are used   [option]
-%%   curly  -  curly braces are used      {option}
-%%   angle  -  angle brackets are used    <option>
-%%   semicolon  -  multiple citations separated by semi-colon
-%%   colon  - same as semicolon, an earlier confusion
-%%   comma  -  separated by comma
-%%   numbers-  selects numerical citations
-%%   super  -  numerical citations as superscripts
-%%   sort   -  sorts multiple citations according to order in ref. list
-%%   sort&compress   -  like sort, but also compresses numerical citations
-%%   compress - compresses without sorting
-%%
-%% \biboptions{comma,round}
-
-% \biboptions{}
-
-% if you have landscape tables
-\usepackage[figuresright]{rotating}
-
-% put your own definitions here:
-%   \newcommand{\cZ}{\cal{Z}}
-%   \newtheorem{def}{Definition}[section]
-%   ...
-
-% add words to TeX's hyphenation exception list
-%\hyphenation{author another created financial paper re-commend-ed Post-Script}
-
-% declarations for front matter
 
 \begin{document}
 
 \begin{frontmatter}
 
-%% Title, authors and addresses
-
-%% use the tnoteref command within \title for footnotes;
-%% use the tnotetext command for the associated footnote;
-%% use the fnref command within \author or \address for footnotes;
-%% use the fntext command for the associated footnote;
-%% use the corref command within \author for corresponding author footnotes;
-%% use the cortext command for the associated footnote;
-%% use the ead command for the email address,
-%% and the form \ead[url] for the home page:
-%%
-%% \title{Title\tnoteref{label1}}
-%% \tnotetext[label1]{}
-%% \author{Name\corref{cor1}\fnref{label2}}
-%% \ead{email address}
-%% \ead[url]{home page}
-%% \fntext[label2]{}
-%% \cortext[cor1]{}
-%% \address{Address\fnref{label3}}
-%% \fntext[label3]{}
-
-\dochead{}
-%% Use \dochead if there is an article header, e.g. \dochead{Short communication}
-\title{Energy Consumption Reduction with DVFS for Message Passing \\
-       Iterative Applications on Grid Architecture} 
+
+
+\title{Energy Consumption Reduction with DVFS for Message \\
+         Passing Iterative Applications on \\
+                    Grid Architecture} 
   
 
-%% use optional labels to link authors explicitly to addresses:
-%% \author[label1,label2]{<author name>}
-%% \address[label1]{<address>}
-%% \address[label2]{<address>}
+
 
 \author{Ahmed Fanfakh,
         Jean-Claude Charr,
@@ -214,7 +150,7 @@ scaling (DVFS) is one of them. It can be used to reduce the power consumption of
   The proposed algorithm is evaluated on a real grid, the grid'5000 platform, while
   running the NAS parallel benchmarks.  The experiments show that it reduces the
   energy consumption on average by \np[\%]{30} while  the performance  is only degraded
-  on average by \np[\%]{3}. Finally, the algorithm is 
+  on average by \np[\%]{3.2}. Finally, the algorithm is 
   compared to an existing method. The comparison results show that it outperforms the
   latter in terms of energy consumption reduction and performance.
 \end{abstract}
@@ -288,11 +224,9 @@ consumption while minimizing the degradation of the program's performance.
 Section~\ref{sec.optim} details the proposed frequencies selecting algorithm.
 Section~\ref{sec.expe} presents the results of applying the algorithm on the 
 NAS parallel benchmarks and executing them on the grid'5000 testbed. 
-%It shows the results of running different scenarios using multi-cores and one core per node and comparing them. 
-It also evaluates the algorithm over three different power scenarios. Moreover, it shows the
+It also evaluates the algorithm over multi-cores per node architectures and over three different power scenarios. Moreover, it shows the
 comparison results between the proposed method and an existing method.  Finally,
 in Section~\ref{sec.concl} the paper ends with a summary and some future works.
-
 \section{Related works}
 \label{sec.relwork}
 
@@ -511,11 +445,11 @@ follows:
 \end{equation}
 Replacing $\Fnew$ in (\ref{eq:pd}) as in (\ref{eq:fnew}) gives the following
 equation for dynamic power consumption:
-\begin{equation}
+\begin{multline}
   \label{eq:pdnew}
-   \PdNew = \alpha \cdot \CL \cdot V^2 \cdot \Fnew = \alpha \cdot \CL \cdot \beta^2 \cdot \Fnew^3 
-    = \alpha \cdot \CL \cdot V^2 \cdot \Fmax \cdot S^{-3} = \PdOld \cdot S^{-3}
-\end{equation}
+   \PdNew = \alpha \cdot \CL \cdot V^2 \cdot \Fnew = \alpha \cdot \CL \cdot \beta^2 \cdot \Fnew^3 \\
+   {} = \alpha \cdot \CL \cdot V^2 \cdot \Fmax \cdot S^{-3} = \PdOld \cdot S^{-3}
+\end{multline}
 where $\PdNew$  and $\PdOld$ are the  dynamic power consumed with the
 new frequency and the maximum frequency respectively.
 
@@ -561,13 +495,14 @@ of one iteration multiplied by the static power of each processor.  The overall
 energy consumption of a message passing distributed application executed over a
 heterogeneous grid platform during one iteration is the summation of all dynamic and
 static energies for $M$ processors in $N$ clusters.  It is computed as follows:
-\begin{equation}
+\begin{multline}
   \label{eq:energy}
  E = \sum_{i=1}^{N} \sum_{i=1}^{M} {(S_{ij}^{-2} \cdot \Pd[ij] \cdot  \Tcp[ij])} +  
- \sum_{i=1}^{N} \sum_{j=1}^{M} (\Ps[ij] \cdot 
+ \sum_{i=1}^{N} \sum_{j=1}^{M} (\Ps[ij] \cdot {} \\
   (\mathop{\max_{i=1,\dots N}}_{j=1,\dots,M}({\Tcp[ij]} \cdot S_{ij}) 
   +\mathop{\min_{j=1,\dots M}} (\Tcm[hj]) ))
-\end{equation}
+\end{multline}
+
 
 Reducing the frequencies of the processors according to the vector of scaling
 factors $(S_{11}, S_{12},\dots, S_{NM})$ may degrade the performance of the application
@@ -662,9 +597,9 @@ equation, as follows:
 \begin{figure}
   \centering
   \subfloat[Homogeneous cluster]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/homo}\label{fig:r1}} \hspace{2cm}%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/homo}\label{fig:r1}} \hspace{2cm}%
   \subfloat[Heterogeneous grid]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/heter}\label{fig:r2}}
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/heter}\label{fig:r2}}
   \label{fig:rel}
   \caption{The energy and performance relation}
 \end{figure}
@@ -694,11 +629,13 @@ in~\cite{Zhuo_Energy.efficient.Dynamic.Task.Scheduling,Rauber_Analytical.Modelin
 \label{sec.optim}
 
 \begin{algorithm}
+\setstretch{1}
   \begin{algorithmic}[1]
     % \footnotesize
+    
     \Require ~
     \begin{description}
-    \item [{$N$}] number of clusters in the grid.
+    \item [{$N$}] number of clusters in the grid. 
     \item [{$M$}] number of nodes in each cluster.
     \item[{$\Tcp[ij]$}] array of all computation times for all nodes during one iteration and with the highest frequency.
     \item[{$\Tcm[ij]$}] array of all communication times for all nodes during one iteration and with the highest frequency.
@@ -726,8 +663,7 @@ in~\cite{Zhuo_Energy.efficient.Dynamic.Task.Scheduling,Rauber_Analytical.Modelin
         \EndIf
        \State $\Tnew \gets $ computed as  in equations (\ref{eq:perf}). 
        \State $\Ereduced \gets $ computed as  in equations (\ref{eq:energy}). 
-       \State $\Pnorm \gets \frac{\Told}{\Tnew}$
-       \State $\Enorm\gets \frac{\Ereduced}{\Eoriginal}$
+       \State $\Pnorm \gets \frac{\Told}{\Tnew}$,  $\Enorm\gets \frac{\Ereduced}{\Eoriginal}$
       \If{$(\Pnorm - \Enorm > \Dist)$}
         \State $\Sopt[ij] \gets S_{ij},~i=1,\dots,N,~j=1,\dots,M_i. $
         \State $\Dist \gets \Pnorm - \Enorm$
@@ -999,16 +935,7 @@ Table \ref{tab:sc} shows the number of nodes used from each cluster for each sce
 \end{table}
 
 
-\begin{figure}
-  \centering
-  \subfloat[The energy consumption by the nodes wile executing the NAS benchmarks over different scenarios    
-           ]{%
-    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/eng_con_scenarios.eps}\label{fig:eng_sen}} \hspace{1cm}%
-  \subfloat[The execution times of the NAS benchmarks over different scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/time_scenarios.eps}\label{fig:time_sen}}
-  \label{fig:exp-time-energy}
-  \caption{The  energy consumption and execution time of NAS  Benchmarks over different scenarios}
-\end{figure}
+
 
 The NAS parallel benchmarks are executed over these two platforms
  with different number of nodes, as in Table \ref{tab:sc}. 
@@ -1034,18 +961,6 @@ However, the  execution times and the energy consumptions of EP and MG benchmark
  in both scenarios. Even when the number of nodes is doubled. On the other hand, the communications of the rest of the benchmarks increases when using long distance communications between two sites or increasing the number of computing nodes.
 
 
-\begin{figure}
-  \centering
-  \subfloat[The energy reduction while executing the NAS benchmarks over different scenarios ]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/eng_s.eps}\label{fig:eng_s}} \hspace{0.08cm}%
-  \subfloat[The performance degradation of the NAS benchmarks over different scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/per_d.eps}\label{fig:per_d}}\hspace{0.08cm}%
-    \subfloat[The tradeoff distance between the energy reduction and the performance of the NAS benchmarks  
-      over different scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/dist.eps}\label{fig:dist}}
-  \label{fig:exp-res}
-  \caption{The experimental results of different scenarios}
-\end{figure}
 
 The energy saving percentage is computed as the ratio between the reduced 
 energy consumption, equation (\ref{eq:energy}), and the original energy consumption,
@@ -1059,6 +974,18 @@ is exponentially related to the CPU's frequency value. On the other side, the in
 increase the communication times and thus produces less energy saving depending on the 
 benchmarks being executed. The results of the benchmarks CG, MG, BT and FT show more 
 energy saving percentage in one site scenario when executed over 16 nodes comparing to 32 nodes. While, LU and SP consume more energy with 16 nodes than 32 in one site  because their computations to communications ratio is not affected by the increase of the number of local communications. 
+\begin{figure}
+  \centering
+  \subfloat[The energy consumption by the nodes wile executing the NAS benchmarks over different scenarios    
+           ]{%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/eng_con_scenarios.eps}\label{fig:eng_sen}} \hspace{1cm}%
+  \subfloat[The execution times of the NAS benchmarks over different scenarios]{%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/time_scenarios.eps}\label{fig:time_sen}}
+  \label{fig:exp-time-energy}
+  \caption{The  energy consumption and execution time of NAS  Benchmarks over different scenarios}
+\end{figure}
+
+
 
 
 The energy saving percentage is reduced for all the benchmarks because of the long distance communications in the two sites 
@@ -1074,12 +1001,23 @@ algorithm  select smaller frequencies for the powerful nodes which
 produces less energy consumption and thus more energy saving.
 The best energy saving percentage was obtained in the one site scenario with 16 nodes, the energy consumption was on average reduced up to 30\%.
 
-
+\begin{figure}
+  \centering
+  \subfloat[The energy reduction while executing the NAS benchmarks over different scenarios ]{%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/eng_s.eps}\label{fig:eng_s}} \hspace{2cm}%
+  \subfloat[The performance degradation of the NAS benchmarks over different scenarios]{%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/per_d.eps}\label{fig:per_d}}\hspace{2cm}%
+    \subfloat[The tradeoff distance between the energy reduction and the performance of the NAS benchmarks  
+      over different scenarios]{%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/dist.eps}\label{fig:dist}}
+  \label{fig:exp-res}
+  \caption{The experimental results of different scenarios}
+\end{figure}
 Figure \ref{fig:per_d} presents the performance degradation percentages for all benchmarks over the two scenarios.
 The performance degradation percentage for the benchmarks running on two sites  with
-16 or 32  nodes is on average equal to 8\% or 4\% respectively. 
+16 or 32  nodes is on average equal to 8.3\% or 4.7\% respectively. 
 For this scenario, the proposed scaling algorithm selects smaller frequencies for the executions with 32 nodes  without significantly degrading their performance because the communication times are higher with 32 nodes which results in smaller  computations to communications ratio.  On the other hand, the performance degradation percentage  for the benchmarks running  on one site  with
-16 or 32  nodes is on average equal to 3\% or 10\% respectively. In opposition to the two sites scenario, when the number of computing nodes is increased in the one site scenario, the performance degradation percentage is increased. Therefore, doubling the number of computing 
+16 or 32  nodes is on average equal to 3.2\% or 10.6\% respectively. In opposition to the two sites scenario, when the number of computing nodes is increased in the one site scenario, the performance degradation percentage is increased. Therefore, doubling the number of computing 
 nodes when the communications occur in high speed network does not decrease the computations to 
 communication ratio. 
 
@@ -1091,7 +1029,7 @@ when the communication times increase and vice versa.
 
 Figure \ref{fig:dist} presents the  distance percentage between the energy saving  and the performance degradation for each benchmark  over both  scenarios. The tradeoff distance percentage can be 
 computed as in equation \ref{eq:max}. The one site scenario with 16 nodes gives the best energy and performance 
-tradeoff, on average it is equal to  26\%. The one site scenario using both 16 and 32 nodes had better energy and performance 
+tradeoff, on average it is equal to  26.8\%. The one site scenario using both 16 and 32 nodes had better energy and performance 
 tradeoff comparing to the two sites scenario  because the former has high speed local communications 
 which increase the computations to communications ratio  and the latter uses long distance communications which decrease this ratio. 
 
@@ -1177,12 +1115,12 @@ in the figure \ref{fig:dist-mc}. These  tradeoff distance between energy consump
 \begin{figure}
   \centering
     \subfloat[The energy saving of running NAS benchmarks over one core and multicores scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/eng_s_mc.eps}\label{fig:eng-s-mc}} \hspace{0.08cm}%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/eng_s_mc.eps}\label{fig:eng-s-mc}} \hspace{2cm}%
     \subfloat[The performance degradation of running NAS benchmarks over one core and multicores scenarios
       ]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/per_d_mc.eps}\label{fig:per-d-mc}}\hspace{0.08cm}%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/per_d_mc.eps}\label{fig:per-d-mc}}\hspace{2cm}%
     \subfloat[The tradeoff distance of running NAS benchmarks over one core and multicores scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/dist_mc.eps}\label{fig:dist-mc}}
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/dist_mc.eps}\label{fig:dist-mc}}
   \label{fig:exp-res}
   \caption{The experimental results of one core and multi-cores scenarios}
 \end{figure}
@@ -1203,11 +1141,12 @@ In these experiments, the class D of the NAS parallel benchmarks are executed ov
 \begin{figure}
   \centering
   \subfloat[The energy saving percentages for the nodes executing the NAS benchmarks over the three power scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/eng_pow.eps}\label{fig:eng-pow}} \hspace{0.08cm}%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/eng_pow.eps}\label{fig:eng-pow}} \hspace{2cm}%
   \subfloat[The performance degradation percentages for the NAS benchmarks over the three power scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/per_pow.eps}\label{fig:per-pow}}\hspace{0.08cm}%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/per_pow.eps}\label{fig:per-pow}}\hspace{2cm}%
     \subfloat[The tradeoff distance between the energy reduction and the performance of the NAS benchmarks over the three power scenarios]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/dist_pow.eps}\label{fig:dist-pow}}
+      
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/dist_pow.eps}\label{fig:dist-pow}}
   \label{fig:exp-pow}
   \caption{The experimental results of different static power scenarios}
 \end{figure}
@@ -1267,11 +1206,11 @@ presented in the figures \ref{fig:edp-eng}, \ref{fig:edp-perf} and \ref{fig:edp-
 \begin{figure}
   \centering
   \subfloat[The energy reduction induced by the Maxdist method and the EDP method]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/edp_eng}\label{fig:edp-eng}} \hspace{0.08cm}%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/edp_eng}\label{fig:edp-eng}} \hspace{2cm}%
     \subfloat[The performance degradation induced by  the Maxdist method and the EDP method]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/edp_per}\label{fig:edp-perf}}\hspace{0.08cm}%
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/edp_per}\label{fig:edp-perf}}\hspace{2cm}%
     \subfloat[The tradeoff distance between the energy consumption reduction and the performance for the Maxdist method and the  EDP method]{%
-    \includegraphics[width=.33\textwidth]{fig/edp_dist}\label{fig:edp-dist}}
+    \includegraphics[width=.4\textwidth]{fig/edp_dist}\label{fig:edp-dist}}
   \label{fig:edp-comparison}
   \caption{The comparison results}
 \end{figure}
@@ -1300,8 +1239,8 @@ of the distributed iterative message passing application running over a grid arc
 To evaluate the proposed method on a real heterogeneous grid platform, it was applied on the  
  NAS parallel benchmarks   and the  class D instance was executed over the  grid'5000 testbed platform. 
  The experimental results showed that the algorithm reduces  on average 30\% of the energy consumption
-for all the NAS benchmarks   while  only degrading by 3\% on average  the performance. 
-The Maxdist algorithm was also evaluated in different scenarios that vary in the distribution of the computing nodes between different clusters' sites or \textcolor{blue}{between using one core and multi-cores per node} or in the values of the consumed static power. The algorithm selects different vector of frequencies according to the 
+for all the NAS benchmarks   while  only degrading by 3.2\% on average  the performance. 
+The Maxdist algorithm was also evaluated in different scenarios that vary in the distribution of the computing nodes between different clusters' sites or  use multi-cores per node architecture or consume different static power values. The algorithm selects different vector of frequencies according to the 
 computations and communication times ratios, and  the values of the static and measured dynamic powers of the CPUs. 
 Finally, the proposed algorithm was compared to another method that uses
 the well known energy and delay product as an objective function. The comparison results showed 
@@ -1323,8 +1262,7 @@ This work  has been  partially supported by  the Labex ACTION  project (contract
 Mr. Ahmed  Fanfakh, would  like to  thank the University  of Babylon  (Iraq) for
 supporting his work.
 
-
-\bibliographystyle{elsarticle-num}
+\section*{References}
 \bibliography{my_reference}
 
 \end{document}