mabase.bib

   1 % This file was created with JabRef 2.7.
   2 % Encoding: UTF8
   3
   4 @INPROCEEDINGS{AdelsbachKS06,
   5   author = {Andr{\'e} Adelsbach and Stefan Katzenbeisser and Ahmad-Reza Sadeghi},
   6   title = {A Computational Model for Watermark Robustness},
   7   booktitle = {Information Hiding},
   8   year = {2006},
   9   pages = {145-160},
  10   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  11   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
  12   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_10},
  13   owner = {guyeux},
  14   timestamp = {2009.06.29}
  15 }
  16
  17 @INPROCEEDINGS{BattiatoCGG99,
  18   author = {Sebastiano Battiato and Dario Catalano and Giovanni Gallo and Rosario
  19         Gennaro},
  20   title = {Robust Watermarking for Images Based on Color Manipulation},
  21   booktitle = {Information Hiding},
  22   year = {1999},
  23   pages = {302-317},
  24   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  25   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
  26   owner = {guyeux},
  27   timestamp = {2009.06.29}
  28 }
  29
  30 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05,
  31   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  32   title = {The Return of the Sensitivity Attack},
  33   booktitle = {IWDW},
  34   year = {2005},
  35   pages = {260-274},
  36   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  37   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
  38   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_20},
  39   owner = {guyeux},
  40   timestamp = {2009.06.29}
  41 }
  42
  43 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05bis,
  44   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  45   title = {Fundamentals of Data Hiding Security and Their Application to Spread-Spectrum
  46         Analysis},
  47   booktitle = {IH'05: Information Hiding Workshop},
  48   year = {2005},
  49   pages = {146-160},
  50   publisher = {Lectures Notes in Computer Science, Springer-Verlag},
  51   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  52   crossref = {DBLP:conf/ih/2005},
  53   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11558859_12},
  54   owner = {guyeux},
  55   timestamp = {2009.06.30}
  56 }
  57
  58 @INPROCEEDINGS{CongJQZ06,
  59   author = {Jin Cong and Yan Jiang and Zhiguo Qu and Zhongmei Zhang},
  60   title = {A Wavelet Packets Watermarking Algorithm Based on Chaos Encryption},
  61   booktitle = {ICCSA (1)},
  62   year = {2006},
  63   pages = {921-928},
  64   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  65   crossref = {DBLP:conf/iccsa/2006-1},
  66   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11751540_100}
  67 }
  68
  69 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/DziembowskiP08,
  70   author = {Stefan Dziembowski and Krzysztof Pietrzak},
  71   title = {Leakage-Resilient Cryptography},
  72   booktitle = {FOCS},
  73   year = {2008},
  74   pages = {293-302},
  75   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  76   crossref = {DBLP:conf/focs/2008},
  77   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/FOCS.2008.56}
  78 }
  79
  80 @INCOLLECTION{Filiol10,
  81   author = {Eric Filiol},
  82   title = {Viruses and Malware},
  83   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
  84   year = {2010},
  85   pages = {747-769},
  86   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  87   crossref = {DBLP:reference/icsec/2010},
  88   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4_34}
  89 }
  90
  91 @INPROCEEDINGS{Filiol00,
  92   author = {Eric Filiol},
  93   title = {Decimation Attack of Stream Ciphers},
  94   booktitle = {INDOCRYPT},
  95   year = {2000},
  96   pages = {31-42},
  97   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  98   crossref = {DBLP:conf/indocrypt/2000},
  99   ee = {http://link.springer.de/link/service/series/0558/bibs/1977/19770031.htm}
 100 }
 101
 102 @INPROCEEDINGS{Furon05,
 103   author = {Teddy Furon},
 104   title = {A Survey of Watermarking Security},
 105   booktitle = {IWDW},
 106   year = {2005},
 107   pages = {201-215},
 108   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 109   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
 110   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_16},
 111   owner = {guyeux},
 112   timestamp = {2009.06.29}
 113 }
 114
 115 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HiggsSHS10,
 116   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 117   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 118         prediction},
 119   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 120   year = {2010},
 121   pages = {1-8},
 122   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 123   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 124   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 125 }
 126
 127 @INPROCEEDINGS{Higgs2010,
 128   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 129   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 130         prediction},
 131   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 132   year = {2010},
 133   pages = {1-8},
 134   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 135   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 136   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 137 }
 138
 139 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HorvathC10,
 140   author = {Dragos Horvath and Camelia Chira},
 141   title = {Simplified chain folding models as metaheuristic benchmark for tuning
 142         real protein folding algorithms?},
 143   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 144   year = {2010},
 145   pages = {1-8},
 146   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 147   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 148   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5585932}
 149 }
 150
 151 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/IslamC10,
 152   author = {Md. Kamrul Islam and Madhu Chetty},
 153   title = {Clustered memetic algorithm for protein structure prediction},
 154   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 155   year = {2010},
 156   pages = {1-8},
 157   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 158   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 159   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586187}
 160 }
 161
 162 @INPROCEEDINGS{Ker06,
 163   author = {Andrew D. Ker},
 164   title = {Batch Steganography and Pooled Steganalysis},
 165   booktitle = {Information Hiding},
 166   year = {2006},
 167   pages = {265-281},
 168   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 169   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
 170   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_18},
 171   owner = {guyeux},
 172   timestamp = {2009.06.29}
 173 }
 174
 175 @INPROCEEDINGS{Lin2009,
 176   author = {H.-Y. Lin and T.-C. Chiang},
 177   title = {Cooperative Secure Data Aggregation in Sensor Networks Using Elliptic
 178         Curve Based Cryptosystems},
 179   booktitle = {CDVE},
 180   year = {2009},
 181   pages = {384-387},
 182   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 183   crossref = {DBLP:conf/cdve/2009},
 184   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04265-2_58}
 185 }
 186
 187 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/MaimourPH09,
 188   author = {Moufida Maimour and CongDuc Pham and Doan B. Hoang},
 189   title = {A Congestion Control Framework for Handling Video Surveillance Traffics
 190         on WSN},
 191   booktitle = {CSE (2)},
 192   year = {2009},
 193   pages = {943-948},
 194   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 195   crossref = {DBLP:conf/cse/2009},
 196   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CSE.2009.200}
 197 }
 198
 199 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/MakhoulSP09,
 200   author = {Abdallah Makhoul and Rachid Saadi and CongDuc Pham},
 201   title = {Coverage and adaptive scheduling algorithms for criticality management
 202         on video wireless sensor networks},
 203   booktitle = {ICUMT},
 204   year = {2009},
 205   pages = {1-8},
 206   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 207   crossref = {DBLP:conf/icumt/2009},
 208   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/ICUMT.2009.5345630}
 209 }
 210
 211 @INPROCEEDINGS{Mittelholzer99,
 212   author = {Thomas Mittelholzer},
 213   title = {An Information-Theoretic Approach to Steganography and Watermarking},
 214   booktitle = {Information Hiding},
 215   year = {1999},
 216   pages = {1-16},
 217   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 218   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
 219   owner = {guyeux},
 220   timestamp = {2009.06.29}
 221 }
 222
 223 @INPROCEEDINGS{PellegriniBA10,
 224   author = {Andrea Pellegrini and Valeria Bertacco and Todd M. Austin},
 225   title = {Fault-based attack of RSA authentication},
 226   booktitle = {DATE},
 227   year = {2010},
 228   pages = {855-860},
 229   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 230   crossref = {DBLP:conf/date/2010},
 231   ee = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5456933}
 232 }
 233
 234 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/Perez-HernandezRG10,
 235   author = {Luis Germ{\'a}n P{\'e}rez-Hern{\'a}ndez and Katya Rodr\'{\i}guez-V{\'a}zquez
 236         and Ram{\'o}n Gardu{\~n}o-Ju{\'a}rez},
 237   title = {Estimation of 3D Protein Structure by means of parallel Particle
 238         Swarm Optimization},
 239   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 240   year = {2010},
 241   pages = {1-8},
 242   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 243   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 244   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586549}
 245 }
 246
 247 @INPROCEEDINGS{WangNHZH07,
 248   author = {Chuntao Wang and Jiangqun Ni and Jiwu Huang and Rongyue Zhang and
 249         Meiying Huang},
 250   title = {Robust and High Capacity Image Watermarking Based on Jointly Coding
 251         and Embedding Optimization},
 252   booktitle = {Information Hiding},
 253   year = {2007},
 254   pages = {65-79},
 255   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 256   crossref = {DBLP:conf/ih/2007},
 257   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-77370-2_5},
 258   owner = {guyeux},
 259   timestamp = {2009.06.29}
 260 }
 261
 262 @INPROCEEDINGS{Zhao04,
 263   author = {Jian Zhao and Mingquan Zhou and Hongmei Xie and Jinye Peng and Xin
 264         Zhou},
 265   title = {A Novel Wavelet Image Watermarking Scheme Combined with Chaos Sequence
 266         and Neural Network},
 267   booktitle = {ISNN (2)},
 268   year = {2004},
 269   pages = {663-668},
 270   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 271   crossref = {DBLP:conf/isnn/2004-2},
 272   ee = {http://springerlink.metapress.com/openurl.asp?genre=article{\&}issn=0302-9743{\&}volume=3174{\&}spage=663}
 273 }
 274
 275 @INPROCEEDINGS{Acharya05securecomparison,
 276   author = {Acharya, Mithun and Girao, Joao and Westhoff, Dirk},
 277   title = {Secure Comparison of Encrypted Data in Wireless Sensor Networks},
 278   booktitle = {WIOPT '05: Proceedings of the Third International Symposium on Modeling
 279         and Optimization in Mobile, Ad Hoc, and Wireless Networks},
 280   year = {2005},
 281   pages = {47--53},
 282   address = {Washington, DC, USA},
 283   publisher = {IEEE Computer Society},
 284   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/WIOPT.2005.44},
 285   isbn = {0-7695-2267-X}
 286 }
 287
 288 @INPROCEEDINGS{Acimez07onthe,
 289   author = {Onur Acıi\c{c}mez and \c{C}etin Kaya Ko\c{c} and Jean-Pierre Seifert},
 290   title = {On the power of simple branch prediction analysis },
 291   booktitle = {2007 ACM Symposium on Information, Computer and Communications Security
 292         (ASIACCS'07)},
 293   year = {2007},
 294   pages = {312--320},
 295   publisher = {ACM Press}
 296 }
 297
 298 @ARTICLE{Adler65,
 299   author = {R. L. Adler and A. G. Konheim and M. H. McAndrew},
 300   title = {Topological entropy},
 301   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
 302   year = {1965},
 303   volume = {114},
 304   pages = {309-319},
 305   owner = {guyeux},
 306   timestamp = {2008.05.29}
 307 }
 308
 309 @INPROCEEDINGS{Agrawal04,
 310   author = {Agrawal, Rakesh and Kiernan, Jerry and Srikant, Ramakrishnan and
 311         Xu, Yirong},
 312   title = {Order preserving encryption for numeric data},
 313   booktitle = {SIGMOD '04: Proceedings of the 2004 ACM SIGMOD international conference
 314         on Management of data},
 315   year = {2004},
 316   pages = {563--574},
 317   address = {New York, NY, USA},
 318   publisher = {ACM},
 319   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1007568.1007632},
 320   isbn = {1-58113-859-8},
 321   location = {Paris, France}
 322 }
 323
 324 @ARTICLE{Anfinsen20071973,
 325   author = {Anfinsen, Christian B.},
 326   title = {Principles that Govern the Folding of Protein Chains},
 327   journal = {Science},
 328   year = {1973},
 329   volume = {181},
 330   pages = {223-230},
 331   number = {4096},
 332   doi = {10.1126/science.181.4096.223},
 333   eprint = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.full.pdf},
 334   url = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.short}
 335 }
 336
 337 @ARTICLE{Arques1994,
 338   author = {D. G. Arques and C. J. Michel},
 339   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine autocorrelation function
 340         after and before random mutations.},
 341   journal = {Math Biosci},
 342   year = {1994},
 343   volume = {123},
 344   pages = {103--125},
 345   number = {1},
 346   month = {Sep},
 347   abstract = {The mutation process is a classical evolutionary genetic process.
 348         The type of mutations studied here is the random substitutions of
 349         a purine base R (adenine or guanine) by a pyrimidine base Y (cytosine
 350         or thymine) and reciprocally (transversions). The analytical expressions
 351         derived allow us to analyze in genes the occurrence probabilities
 352         of motifs and d-motifs (two motifs separated by any d bases) on the
 353         R/Y alphabet under transversions. These motif probabilities can be
 354         obtained after transversions (in the evolutionary sense; from the
 355         past to the present) and, unexpectedly, also before transversions
 356         (after back transversions, in the inverse evolutionary sense, from
 357         the present to the past). This theoretical part in Section 2 is a
 358         first generalization of a particular formula recently derived. The
 359         application in Section 3 is based on the analytical expression giving
 360         the autocorrelation function (the d-motif probabilities) before transversions.
 361         It allows us to study primitive genes from actual genes. This approach
 362         solves a biological problem. The protein coding genes of chloroplasts
 363         and mitochondria have a preferential occurrence of the 6-motif YRY(N)6YRY
 364         (maximum of the autocorrelation function for d = 6, N = R or Y) with
 365         a periodicity modulo 3. The YRY(N)6YRY preferential occurrence without
 366         the periodicity modulo 3 is also observed in the RNA coding genes
 367         (ribosomal, transfer, and small nuclear RNA genes) and in the noncoding
 368         genes (introns and 5' regions of eukaryotic nuclei). However, there
 369         are two exceptions to this YRY(N)6YRY rule: the protein coding genes
 370         of eukaryotic nuclei, and prokaryotes, where YRY(N)6YRY has the second
 371         highest value after YRY(N)0YRY (YRYYRY) with a periodicity modulo
 372         3. When we go backward in time with the analytical expression, the
 373         protein coding genes of both eukaryotic nuclei and prokaryotes retrieve
 374         the YRY(N)6YRY preferential occurrence with a periodicity modulo
 375         3 after 0.2 back transversions per base. In other words, the actual
 376         protein coding genes of chloroplasts and mitochondria are similar
 377         to the primitive protein coding genes of eukaryotic nuclei and prokaryotes.
 378         On the other hand, this application represents the first result concerning
 379         the mutation process in the model of DNA sequence evolution we recently
 380         proposed. According to this model, the actual genes on the R/Y alphabet
 381         derive from two successive evolutionary genetic processes: an independent
 382         mixing of a few nonrandom types of oligonucleotides leading to genes
 383         called primitive followed by a mutation process in these primitive
 384         genes.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)},
 385   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 386         France.},
 387   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Mathematics; Models,
 388         Genetic; Mutation; Probability; Proteins, genetics; Purines; Pyrimidines},
 389   language = {eng},
 390   medline-pst = {ppublish},
 391   owner = {guyeux},
 392   pii = {0025-5564(94)90020-5},
 393   pmid = {7949744},
 394   timestamp = {2011.05.05}
 395 }
 396
 397 @ARTICLE{Arques1998,
 398   author = {D. G. Arquès and J. P. Fallot and C. J. Michel},
 399   title = {An evolutionary analytical model of a complementary circular code
 400         simulating the protein coding genes, the 5' and 3' regions.},
 401   journal = {Bull Math Biol},
 402   year = {1998},
 403   volume = {60},
 404   pages = {163--194},
 405   number = {1},
 406   month = {Jan},
 407   abstract = {The self-complementary subset T0 = X0 [symbol: see text] ¿AAA, TTT¿
 408         with X0 = ¿AAC, AAT, ACC, ATC, ATT, CAG, CTC, CTG, GAA, GAC, GAG,
 409         GAT, GCC, GGC, GGT, GTA, GTC, GTT, TAC, TTC¿ of 22 trinucleotides
 410         has a preferential occurrence in the frame 0 (reading frame established
 411         by the ATG start trinucleotide) of protein (coding) genes of both
 412         prokaryotes and eukaryotes. The subsets T1 = X1 [symbol: see text]
 413         ¿CCC¿ and T2 = X2 [symbol: see text] ¿GGG¿ of 21 trinucleotides have
 414         a preferential occurrence in the shifted frames 1 and 2 respectively
 415         (frame 0 shifted by one and two nucleotides respectively in the 5'-3'
 416         direction). T1 and T2 are complementary to each other. The subset
 417         T0 contains the subset X0 which has the rarity property (6 x 10(-8)
 418         to be a complementary maximal circular code with two permutated maximal
 419         circular codes X1 and X2 in the frames 1 and 2 respectively. X0 is
 420         called a C3 code. A quantitative study of these three subsets T0,
 421         T1, T2 in the three frames 0, 1, 2 of protein genes, and the 5' and
 422         3' regions of eukaryotes, shows that their occurrence frequencies
 423         are constant functions of the trinucleotide positions in the sequences.
 424         The frequencies of T0, T1, T2 in the frame 0 of protein genes are
 425         49, 28.5 and 22.5\% respectively. In contrast, the frequencies of
 426         T0, T1, T2 in the 5' and 3' regions of eukaryotes, are independent
 427         of the frame. Indeed, the frequency of T0 in the three frames of
 428         5' (respectively 3') regions is equal to 35.5\% (respectively 38\%)
 429         and is greater than the frequencies T1 and T2, both equal to 32.25\%
 430         (respectively 31\%) in the three frames. Several frequency asymmetries
 431         unexpectedly observed (e.g. the frequency difference between T1 and
 432         T2 in the frame 0), are related to a new property of the subset T0
 433         involving substitutions. An evolutionary analytical model at three
 434         parameters (p, q, t) based on an independent mixing of the 22 codons
 435         (trinucleotides in frame 0) of T0 with equiprobability (1/22) followed
 436         by t approximately 4 substitutions per codon according to the proportions
 437         p approximately 0.1, q approximately 0.1 and r = 1 - p - q approximately
 438         0.8 in the three codon sites respectively, retrieves the frequencies
 439         of T0, T1, T2 observed in the three frames of protein genes and explains
 440         these asymmetries. Furthermore, the same model (0.1, 0.1, t) after
 441         t approximately 22 substitutions per codon, retrieves the statistical
 442         properties observed in the three frames of the 5' and 3' regions.
 443         The complex behaviour of these analytical curves is totally unexpected
 444         and a priori difficult to imagine.},
 445   doi = {10.1006/bulm.1997.0033},
 446   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Marne la Vallée, Institut
 447         Gaspard Monge, Noisy Le Grand, France. arques@univ-mlv.fr},
 448   keywords = {Animals; Biological Evolution; Codon, genetics; Genetic Code; Humans;
 449         Mammals; Models, Genetic; Probability; Proteins, genetics; Rodentia;
 450         Vertebrates},
 451   language = {eng},
 452   medline-pst = {ppublish},
 453   owner = {guyeux},
 454   pii = {S0092-8240(97)90033-1},
 455   pmid = {9530018},
 456   timestamp = {2011.05.05},
 457   url = {http://dx.doi.org/10.1006/bulm.1997.0033}
 458 }
 459
 460 @ARTICLE{Arques1993,
 461   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 462   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine codon probability
 463         after and before random mutations.},
 464   journal = {Bull Math Biol},
 465   year = {1993},
 466   volume = {55},
 467   pages = {1025--1038},
 468   number = {6},
 469   month = {Nov},
 470   abstract = {Recently, we proposed a new model of DNA sequence evolution (Arquès
 471         and Michel. 1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772) according to which
 472         actual genes on the purine/pyrimidine (R/Y) alphabet (R = purine
 473         = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine) are the
 474         result of two successive evolutionary genetic processes: (i) a mixing
 475         (independent) process of non-random oligonucleotides (words of base
 476         length less than 10: YRY(N)6, YRYRYR and YRYYRY are so far identified;
 477         N = R or Y) leading to primitive genes (words of several hundreds
 478         of base length) and followed by (ii) a random mutation process, i.e.,
 479         transformations of a base R (respectively Y) into the base Y (respectively
 480         R) at random sites in these primitive genes. Following this model
 481         the problem investigated here is the study of the variation of the
 482         8 R/Y codon probabilities RRR, ..., YYY under random mutations. Two
 483         analytical expressions solved here allow analysis of this variation
 484         in the classical evolutionary sense (from the past to the present,
 485         i.e., after random mutations), but also in the inverted evolutionary
 486         sense (from the present to the past, i.e., before random mutations).
 487         Different properties are also derived from these formulae. Finally,
 488         a few applications of these formulae are presented. They prove the
 489         proposition in Arquès and Michel (1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772),
 490         Section 3.3.2, with the existence of a maximal mean number of random
 491         mutations per base of the order 0.3 in the protein coding genes.
 492         They also confirm the mixing process of oligonucleotides by excluding
 493         the purine/pyrimidine contiguous and alternating tracts from the
 494         formation process of primitive genes.},
 495   institution = {Université de Franche-Comté, Besançon, France.},
 496   keywords = {Base Sequence; Codon; DNA, chemistry/genetics; Mathematics; Models,
 497         Genetic; Mutation; Probability; Purines; Pyrimidines},
 498   language = {eng},
 499   medline-pst = {ppublish},
 500   owner = {guyeux},
 501   pmid = {8281128},
 502   timestamp = {2011.05.05}
 503 }
 504
 505 @ARTICLE{Arques1993b,
 506   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 507   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 508         common to different eukaryotic gene subpopulations.},
 509   journal = {Biochimie},
 510   year = {1993},
 511   volume = {75},
 512   pages = {399--407},
 513   number = {5},
 514   abstract = {The nucleotide distribution in protein coding genes, introns and transfer
 515         RNA genes of eukaryotic subpopulations (primates, rodent and mammals)
 516         is studied by autocorrelation functions. The autocorrelation function
 517         analysing the occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY (YRY-function)
 518         in protein coding genes and transfer RNA genes of these three eukaryotic
 519         subpopulations retrieves the preferential occurrence of YRY(N)6YRY
 520         (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine,
 521         N = R or Y). The autocorrelation functions analysing the occurrence
 522         probability of the i-motifs RRR(N)iRRR (RRR-function) and YYY(N)iYYY
 523         (YYY-function) identify new non-random genetic statistical properties
 524         in these three eukaryotic subpopulations, mainly: i) in their protein
 525         coding genes: local maxima for i identical to 6 [12] (peaks for i
 526         = 6, 18, 30, 42) with the RRR-function and local maxima for i identical
 527         to 8 [10] (peaks for i = 8, 18, 28) with the YYY-function; and ii)
 528         in their introns: local maxima for i identical to 3 [6] (peaks for
 529         i = 3, 9, 15) and a short linear decrease followed by a large exponential
 530         decrease both with the RRR- and YYY-functions. The non-random properties
 531         identified in eukaryotic intron subpopulations are modelised with
 532         a process of random insertions and deletions of nucleotides simulating
 533         the RNA editing.},
 534   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 535         d'Informatique de Besançon, France.},
 536   keywords = {Animals; Base Sequence; Data Interpretation, Statistical; Genes; Introns;
 537         Mammals; Models, Genetic; Primates; Probability; Proteins, genetics;
 538         RNA Editing; RNA, Transfer, genetics; Rodentia; Sequence Analysis,
 539         DNA},
 540   language = {eng},
 541   medline-pst = {ppublish},
 542   owner = {guyeux},
 543   pii = {0300-9084(93)90173-P},
 544   pmid = {8347726},
 545   timestamp = {2011.05.05}
 546 }
 547
 548 @ARTICLE{Arques1992,
 549   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 550   title = {A simulation of the genetic periodicities modulo 2 and 3 with processes
 551         of nucleotide insertions and deletions.},
 552   journal = {J Theor Biol},
 553   year = {1992},
 554   volume = {156},
 555   pages = {113--127},
 556   number = {1},
 557   month = {May},
 558   abstract = {Recently, a new genetic process termed RNA editing has been identified
 559         showing insertions and deletions of nucleotides in particular RNA
 560         molecules. On the other hand, there are a few non-random statistical
 561         properties in genes: in particular, the periodicity modulo 3 (P3)
 562         associated with an open reading frame, the periodicity modulo 2 (P2)
 563         associated with alternating purine/pyrimidine stretches, the YRY(N)6YRY
 564         preferential occurrence (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 565         = cytosine or thymine, N = R or Y) representing a "code" of the DNA
 566         helix pitch, etc. The problem investigated here is whether a process
 567         of the type RNA editing can lead to the non-random statistical properties
 568         commonly observed in genes. This paper will show in particular that:
 569         The process of insertions and deletions of mononucleotides in the
 570         initial sequence [YRY(N)3]* [series of YRY(N)3] can lead to the periodicity
 571         modulo 2 (P2). The process of insertions and deletions of trinucleotides
 572         in the initial sequence [YRY(N)6]* [series of YRY(N)6] can lead to
 573         the periodicity modulo 3 (P3) and the YRY(N)6YRY preferential occurrence.
 574         Furthermore, these two processes lead to a strong correlation with
 575         the reality, namely the mononucleotide insertion/deletion process,
 576         with the 5' eukaryotic regions and the trinucleotide insertion/deletion
 577         process, with the eukaryotic protein coding genes.},
 578   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 579         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 580   keywords = {Chromosome Deletion; Computer Simulation; Humans; Models, Genetic;
 581         Mutagenesis, genetics; RNA, genetics},
 582   language = {eng},
 583   medline-pst = {ppublish},
 584   owner = {guyeux},
 585   pmid = {1379311},
 586   timestamp = {2011.05.05}
 587 }
 588
 589 @ARTICLE{Arques1990,
 590   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 591   title = {Periodicities in coding and noncoding regions of the genes.},
 592   journal = {J Theor Biol},
 593   year = {1990},
 594   volume = {143},
 595   pages = {307--318},
 596   number = {3},
 597   month = {Apr},
 598   abstract = {Gene population statistical studies of protein coding genes and introns
 599         have identified two types of periodicities on the purine/pyrimidine
 600         alphabet: (i) the modulo 3 periodicity or coding periodicity (periodicity
 601         P3) in protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, viruses,
 602         chloroplasts, mitochondria, plasmids and in introns of viruses and
 603         mitochondria, and (ii) the modulo 2 periodicity (periodicity P2)
 604         in the eukaryotic introns. The periodicity study is herein extended
 605         to the 5' and 3' regions of eukaryotes, prokaryotes and viruses and
 606         shows: (i) the periodicity P3 in the 5' and 3' regions of eukaryotes.
 607         Therefore, these observations suggest a unitary and dynamic concept
 608         for the genes as for a given genome, the 5' and 3' regions have the
 609         genetic information for protein coding genes and for introns: (1)
 610         In the eukaryotic genome, the 5' (P2 and P3) and 3' (P2 and P3) regions
 611         have the information for protein coding genes (P3) and for introns
 612         (P2). The intensity of P3 is high in 5' regions and weak in 3' regions,
 613         while the intensity of P2 is weak in 5' regions and high in 3' regions.
 614         (2) In the prokaryotic genome, the 5' (P3) and 3' (P3) regions have
 615         the information for protein coding genes (P3). (3) In the viral genome,
 616         the 5' (P3) and 3' (P3) regions have the information for protein
 617         coding genes (P3) and for introns (P3). The absence of P2 in viral
 618         introns (in opposition to eukaryotic introns) may be related to the
 619         absence of P2 in 5' and 3' regions of viruses.},
 620   institution = {Université de Franche-Comté, Unité Associée CNRS No. 822, Besançon,
 621         France.},
 622   keywords = {Animals; Base Sequence; Eukaryotic Cells; Genes; Introns; Prokaryotic
 623         Cells; Purine Nucleotides; Pyrimidine Nucleotides; Repetitive Sequences,
 624         Nucleic Acid; Viruses, genetics},
 625   language = {eng},
 626   medline-pst = {ppublish},
 627   owner = {guyeux},
 628   pmid = {2385108},
 629   timestamp = {2011.05.05}
 630 }
 631
 632 @ARTICLE{Arques1990a,
 633   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 634   title = {A model of DNA sequence evolution.},
 635   journal = {Bull Math Biol},
 636   year = {1990},
 637   volume = {52},
 638   pages = {741--772},
 639   number = {6},
 640   abstract = {Statistical studies of gene populations on the purine/pyrimidine alphabet
 641         have shown that the mean occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY
 642         (R = purine, Y = pyrimidine, N = R or Y) is not uniform by varying
 643         i in the range, but presents a maximum at i = 6 in the following
 644         populations: protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, chloroplasts
 645         and mitochondria, and also viral introns, ribosomal RNA genes and
 646         transfer RNA genes (Arquès and Michel, 1987b, J. theor. Biol. 128,
 647         457-461). From the "universality" of this observation, we suggested
 648         that the oligonucleotide YRY(N)6 is a primitive one and that it has
 649         a central function in DNA sequence evolution (Arquès and Michel,
 650         1987b, J. theor. Biol. 128, 457-461). Following this idea, we introduce
 651         a concept of a model of DNA sequence evolution which will be validated
 652         according to a schema presented in three parts. In the first part,
 653         using the last version of the gene database, the YRY(N)6YRY preferential
 654         occurrence (maximum at i = 6) is confirmed for the populations mentioned
 655         above and is extended to some newly analysed populations: chloroplast
 656         introns, chloroplast 5' regions, mitochondrial 5' regions and small
 657         nuclear RNA genes. On the other hand, the YRY(N)6YRY preferential
 658         occurrence and periodicities are used in order to classify 18 gene
 659         populations. In the second part, we will demonstrate that several
 660         statistical features characterizing different gene populations (in
 661         particular the YRY(N)6YRY preferential occurrence and the periodicities)
 662         can be retrieved from a simple Markov model based on the mixing of
 663         the two oligonucleotides YRY(N)6 and YRY(N)3 and based on the percentages
 664         of RYR and YRY in the unspecified trinucleotides (N)3 of YRY(N)6
 665         and YRY(N)3. Several properties are identified and prove in particular
 666         that the oligonucleotide mixing is an independent process and that
 667         several different features are functions of a unique parameter. In
 668         the third part, the return of the model to the reality shows a strong
 669         correlation between reality and simulation concerning the presence
 670         of a large alternating purine/pyrimidine stretches and of periodicities.
 671         It also contributes to a greater understanding of biological reality,
 672         e.g. the presence or the absence of large alternating purine/pyrimidine
 673         stretches can be explained as being a simple consequence of the mixing
 674         of two particular oligonucleotides. Finally, we believe that such
 675         an approach is the first step toward a unified model of DNA sequence
 676         evolution allowing the molecular understanding of both the origin
 677         of life and the actual biological reality.},
 678   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 679         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 680   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Genetics, Population;
 681         Models, Genetic},
 682   language = {eng},
 683   medline-pst = {ppublish},
 684   owner = {guyeux},
 685   pmid = {2279193},
 686   timestamp = {2011.05.05}
 687 }
 688
 689 @ARTICLE{Arques1993a,
 690   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel and K. Orieux},
 691   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 692         common to different populations of eukaryotic non-coding genes.},
 693   journal = {J Theor Biol},
 694   year = {1993},
 695   volume = {161},
 696   pages = {329--342},
 697   number = {3},
 698   month = {Apr},
 699   abstract = {The autocorrelation function analysing the occurrence probability
 700         of the i-motif YRY(N)iYRY in genes allows the identification of mainly
 701         two periodicities modulo 2, 3 and the preferential occurrence of
 702         the motif YRY(N)6YRY (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 703         = cytosine or thymine, N = R or Y). These non-random genetic statistical
 704         properties can be simulated by an independent mixing of the three
 705         oligonucleotides YRYRYR, YRYYRY and YRY(N)6 (Arquès & Michel, 1990b).
 706         The problem investigated in this study is whether new properties
 707         can be identified in genes with other autocorrelation functions and
 708         also simulated with an oligonucleotide mixing model. The two autocorrelation
 709         functions analysing the occurrence probability of the i-motifs RRR(N)iRRR
 710         and YYY(N)iYYY simultaneously identify three new non-random genetic
 711         statistical properties: a short linear decrease, local maxima for
 712         i identical to 3[6] (i = 3, 9, etc) and a large exponential decrease.
 713         Furthermore, these properties are common to three different populations
 714         of eukaryotic non-coding genes: 5' regions, introns and 3' regions
 715         (see section 2). These three non-random properties can also be simulated
 716         by an independent mixing of the four oligonucleotides R8, Y8, RRRYRYRRR,
 717         YYYRYRYYY and large alternating R/Y series. The short linear decrease
 718         is a result of R8 and Y8, the local maxima for i identical to 3[6],
 719         of RRRYRYRRR and YYYRYRYYY, and the large exponential decrease, of
 720         large alternating R/Y series (section 3). The biological meaning
 721         of these results and their relation to the previous oligonucleotide
 722         mixing model are presented in the Discussion.},
 723   doi = {10.1006/jtbi.1993.1059},
 724   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 725         d'Informatique de Besançon, France.},
 726   keywords = {Animals; Biological Evolution; Genes, genetics; Models, Genetic; Models,
 727         Statistical; Mutation, genetics; Oligonucleotides, genetics; Probability},
 728   language = {eng},
 729   medline-pst = {ppublish},
 730   owner = {guyeux},
 731   pii = {S0022-5193(83)71059-3},
 732   pmid = {8331957},
 733   timestamp = {2011.05.05},
 734   url = {http://dx.doi.org/10.1006/jtbi.1993.1059}
 735 }
 736
 737 @ARTICLE{Arroyo08,
 738   author = {David Arroyo and Gonzalo Alvarez and Veronica Fernandez},
 739   title = {On the inadequacy of the logistic map for cryptographic applications},
 740   journal = {X Reunión Española sobre Criptología y Seguridad de la Información
 741         (X RECSI)},
 742   year = {2008},
 743   volume = {1},
 744   pages = {77-82},
 745   owner = {christophe},
 746   timestamp = {2010.03.01}
 747 }
 748
 749 @MISC{Backofen99algorithmicapproach,
 750   author = {R. Backofen and S. Will and P. Clote},
 751   title = {Algorithmic Approach To Quantifying The Hydrophobic Force Contribution
 752         In Protein Folding},
 753   year = {1999}
 754 }
 755
 756
 757 @inproceedings{Blum:1985:EPP:19478.19501,
 758  author = {Blum, Manuel and Goldwasser, Shafi},
 759  title = {An efficient probabilistic public key encryption scheme which hides all partial information},
 760  booktitle = {Proceedings of CRYPTO 84 on Advances in cryptology},
 761  year = {1985},
 762  isbn = {0-387-15658-5},
 763  location = {Santa Barbara, California, United States},
 764  pages = {289--302},
 765  numpages = {14},
 766  url = {http://dl.acm.org/citation.cfm?id=19478.19501},
 767  acmid = {19501},
 768  publisher = {Springer-Verlag New York, Inc.},
 769  address = {New York, NY, USA},
 770  keywords = {chosen cyphertext attack, integer factorization, partial information, passive adversaries, probabilistic encryption},
 771 }
 772
 773
 774 @INPROCEEDINGS{bcgr11:ip,
 775   author = {Bahi, Jacques M. and Couchot, Jean-fran\c{c}ois and Guyeux, Christophe
 776         and Richard, Adrien},
 777   title = {On the Link Between Strongly Connected Iteration Graphs and Chaotic
 778         Boolean Discrete-Time Dynamical Systems},
 779   booktitle = {FCT'11, 18th Int. Symp. on Fundamentals of Computation Theory},
 780   year = {2011},
 781   volume = {*},
 782   series = {LNCS},
 783   pages = {***--***},
 784   address = {Oslo, Norway},
 785   month = aug,
 786   note = {To appear},
 787   classement = {ACTI},
 788   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 789   equipe = {and},
 790   inhal = {no}
 791 }
 792
 793 @ARTICLE{bg10:ij,
 794   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 795   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
 796   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
 797   year = {2010},
 798   volume = {4},
 799   pages = {167--181},
 800   number = {2},
 801   classement = {ACLI},
 802   doi = {10.1260/1748-3018.4.2.167},
 803   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 804   equipe = {and},
 805   impact-factor = {#},
 806   inhal = {no},
 807   isi-acro = {#},
 808   url = {http://dx.doi.org/10.1260/1748-3018.4.2.167}
 809 }
 810
 811 @INPROCEEDINGS{guyeux10ter,
 812   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 813   title = {A new chaos-based watermarking algorithm},
 814   booktitle = {SECRYPT'10, Int. conf. on security and cryptography},
 815   year = {2010},
 816   pages = {455--458},
 817   address = {Athens, Greece},
 818   month = jul,
 819   publisher = {SciTePress},
 820   classement = {ACTI},
 821   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 822   equipe = {and},
 823   inhal = {no}
 824 }
 825
 826 @INPROCEEDINGS{bgc11:ip,
 827   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Cote, Nathalie},
 828   title = {Chaos of Protein Folding},
 829   booktitle = {IJCNN 2011, Int. Joint Conf. on Neural Networks},
 830   year = {2011},
 831   pages = {***--***},
 832   address = {San Jose, California, United States},
 833   month = jul,
 834   note = {To appear},
 835   classement = {ACTI},
 836   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 837   equipe = {and},
 838   inhal = {no}
 839 }
 840
 841 @INPROCEEDINGS{guyeux10bis,
 842   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 843   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 844         Networks},
 845   booktitle = {SENSORCOMM'10, 4-th Int. Conf. on Sensor Technologies and Applications},
 846   year = {2010},
 847   pages = {472--477},
 848   address = {Venice-Mestre, Italy},
 849   month = jul,
 850   classement = {ACTI},
 851   doi = {10.1109/SENSORCOMM.2010.76},
 852   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 853   equipe = {and},
 854   inhal = {no},
 855   url = {http://dx.doi.org/10.1109/SENSORCOMM.2010.76}
 856 }
 857
 858 @INPROCEEDINGS{guyeuxVictoria,
 859   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 860   title = {Secure Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. Homomorphism
 861         versus Watermarking Approach},
 862   booktitle = {ADHOCNETS 2010, 2nd Int. Conf. on Ad Hoc Networks},
 863   year = {2010},
 864   volume = {49},
 865   series = {Lecture Notes in ICST},
 866   pages = {344--358},
 867   address = {Victoria, Canada},
 868   month = aug,
 869   classement = {ACTI},
 870   doi = {10.1007/978-3-642-17994-5_23},
 871   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 872   equipe = {and},
 873   inhal = {no},
 874   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5_23}
 875 }
 876
 877 @INPROCEEDINGS{bgs11:ip,
 878   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Salomon, Michel},
 879   title = {Building a Chaotic Proven Neural Network},
 880   booktitle = {ICCANS 2011, IEEE Int. Conf. on Computer Applications and Network
 881         Security},
 882   year = {2011},
 883   pages = {***--***},
 884   address = {Maldives, Maldives},
 885   month = may,
 886   classement = {ACTI},
 887   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 888   equipe = {and},
 889   inhal = {no}
 890 }
 891
 892 @INPROCEEDINGS{bgw10:ip,
 893   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 894   title = {A Pseudo Random Numbers Generator Based on Chaotic Iterations. Application
 895         to Watermarking},
 896   booktitle = {WISM 2010, Int. Conf. on Web Information Systems and Mining},
 897   year = {2010},
 898   volume = {6318},
 899   series = {LNCS},
 900   pages = {202--211},
 901   address = {Sanya, China},
 902   month = oct,
 903   classement = {ACTI},
 904   doi = {10.1007/978-3-642-16515-3_26},
 905   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 906   equipe = {and},
 907   inhal = {no},
 908   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-16515-3_26}
 909 }
 910
 911 @INPROCEEDINGS{bgw09:ip,
 912   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 913   title = {A novel pseudo-random generator based on discrete chaotic iterations},
 914   booktitle = {INTERNET'09, 1-st Int. Conf. on Evolving Internet},
 915   year = {2009},
 916   pages = {71--76},
 917   address = {Cannes, France},
 918   month = aug,
 919   classement = {ACTI},
 920   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 921   equipe = {and},
 922   inhal = {no}
 923 }
 924
 925 @INPROCEEDINGS{bmg10:onp,
 926   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 927   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 928         Networks for critical applications},
 929   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 930         et Applications Critiques de Surveillance},
 931   year = {2010},
 932   address = {Bayonne, France},
 933   month = jun,
 934   note = {Communication orale},
 935   classement = {COM},
 936   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 937   equipe = {and},
 938   inhal = {no}
 939 }
 940
 941 @INPROCEEDINGS{guyeuxBayonne,
 942   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 943   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 944         Networks for critical applications},
 945   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 946         et Applications Critiques de Surveillance},
 947   year = {2010},
 948   address = {Bayonne, France},
 949   month = jun,
 950   note = {Communication orale},
 951   classement = {COM},
 952   equipe = {and},
 953   inhal = {no}
 954 }
 955
 956 @ARTICLE{bs10:ij,
 957   author = {Bahi, Jacques M. and Salomon, Michel},
 958   title = {A Decentralized Energy-based Diffusion Algorithm to Increase the
 959         Lifetime of {MANETs}},
 960   journal = {Computer Networks Journal},
 961   year = {2010},
 962   pages = {***--***},
 963   note = {Accepted manuscript. To appear},
 964   classement = {ACLI},
 965   equipe = {and},
 966   impact-factor = {1.201},
 967   inhal = {no},
 968   isi-acro = {#},
 969   publisher = {Elsevier}
 970 }
 971
 972 @ARTICLE{Bahi2000,
 973   author = {J. M. Bahi},
 974   title = {Boolean totally asynchronous iterations},
 975   journal = {Int. Journal of Mathematical Algorithms},
 976   year = {2000},
 977   volume = {1},
 978   pages = {331--346},
 979   owner = {guyeux},
 980   timestamp = {17/02/2008}
 981 }
 982
 983 @ARTICLE{Bahi2000bis,
 984   author = {Jacques M. Bahi},
 985   title = {Asynchronous iterative algorithms for nonexpansive linear systems},
 986   journal = {Journal of Parallel and Distributed Computing},
 987   year = {2000},
 988   volume = {60},
 989   pages = {92--112},
 990   owner = {guyeux},
 991   timestamp = {2009.01.10}
 992 }
 993
 994 @ARTICLE{Bahi1999,
 995   author = {J. M. Bahi},
 996   title = {Parallel synchronous chaotic iterations for singular linear systems},
 997   journal = {Parallel Algorithms and Applications},
 998   year = {1999},
 999   volume = {14},
1000   pages = {19--35},
1001   owner = {guyeux},
1002   timestamp = {17/02/2008}
1003 }
1004
1005 @ARTICLE{Bahi1998,
1006   author = {Jacques M. Bahi},
1007   title = {Algorithmes paralleles asynchrones pour les systemes singuliers},
1008   journal = {Comptes Rendus de l'Academie des Sciences},
1009   year = {1998},
1010   volume = {t. 326, serie 1},
1011   pages = {1421--1425},
1012   owner = {guyeux},
1013   timestamp = {2009.01.18}
1014 }
1015
1016 @PHDTHESIS{bahi98,
1017   author = {Jacques M. Bahi},
1018   title = {Méthodes itératives dans des espaces produits. Application au calcul
1019         parallèle},
1020   school = {Université de Franche-Comté},
1021   year = {1998},
1022   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1023   owner = {christophe},
1024   timestamp = {2010.08.24}
1025 }
1026
1027 @PHDTHESIS{bahi91,
1028   author = {Jacques M. Bahi},
1029   title = {Algorithmes asynchrones pour des systèmes différentiels-algébriques.
1030         Simulation numérique sur des exemples de circuits électriques},
1031   school = {Université de Franche-Comté},
1032   year = {1991},
1033   owner = {christophe},
1034   timestamp = {2010.08.24}
1035 }
1036
1037 @ARTICLE{bcv06:ij,
1038   author = {Jacques M. Bahi and Sylvain Contassot-Vivier},
1039   title = {Basins of attraction in fully asynchronous discrete-time discrete-state
1040         dynamic networks},
1041   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1042   year = {2006},
1043   volume = {17},
1044   pages = {397--408},
1045   number = {2},
1046   inhal = {no},
1047   owner = {guyeux},
1048   timestamp = {2009.12.04}
1049 }
1050
1051 @ARTICLE{Bahi2002,
1052   author = {J.~M. Bahi and S. Contassot-Vivier},
1053   title = {Stability of fully asynchronous discrete-time discrete state dynamic
1054         networks},
1055   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1056   year = {2002},
1057   volume = {13(6)},
1058   pages = {1353-1363},
1059   owner = {guyeux},
1060   timestamp = {2009.02.14}
1061 }
1062
1063 @TECHREPORT{bcgg10:ir,
1064   author = {Bahi, J. M. and Couchot, J.-F. and Grasset, O. and Guyeux, C.},
1065   title = {{D}iscrete {D}ynamical {S}ystems: {N}ecessary {D}ivergence {C}onditions
1066         for {S}ynchronous {I}terations},
1067   institution = {LIFC - Laboratoire d'{I}nformatique de l'{U}niversit\'{e} de {F}ranche
1068         {C}omt\'{e}},
1069   year = {2010},
1070   type = {Research Report},
1071   number = {RR2010-04},
1072   month = sep,
1073   pdf = {/~publis/papers/pub/2010/RR2010-04.pdf}
1074 }
1075
1076 @ARTICLE{guyeux09,
1077   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1078   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
1079   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
1080   year = {2010},
1081   volume = {4},
1082   pages = {167--181},
1083   number = {2},
1084   classement = {ACLNI},
1085   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1086   equipe = {and},
1087   impact-factor = {#},
1088   inhal = {no},
1089   isi-acro = {#}
1090 }
1091
1092 @INPROCEEDINGS{guyeux10,
1093   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1094   title = {Topological chaos and chaotic iterations, application to Hash functions},
1095   booktitle = {WCCI'10, IEEE World Congress on Computational Intelligence},
1096   year = {2010},
1097   pages = {1--7},
1098   address = {Barcelona, Spain},
1099   month = jul,
1100   note = {Best paper award},
1101   classement = {ACTI},
1102   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1103   equipe = {and},
1104   inhal = {no}
1105 }
1106
1107 @MISC{ih10,
1108   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1109   title = {A chaos-based approach for information hiding security.},
1110   howpublished = {arXiv},
1111   month = {April},
1112   year = {2010},
1113   institution = {Computer Science Laboratory LIFC, University of Franche-Comte, France}
1114 }
1115
1116 @ARTICLE{arxiv,
1117   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1118   title = {A watermarking algorithm satisfying topological chaos properties},
1119   journal = {CoRR},
1120   year = {2008},
1121   volume = {abs/0810.4713},
1122   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1123   ee = {http://arxiv.org/abs/0810.4713}
1124 }
1125
1126 @ARTICLE{Bahi2008,
1127   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1128   title = {Chaotic iterations and topological chaos},
1129   year = {2008},
1130   abstract = {Chaotic iterations have been introduced on the one hand by Chazan,
1131         Miranker [5] and Miellou [9] in a numerical analysis context, and
1132         on the other hand by Robert [11] and Pellegrin [10] in the discrete
1133         dynamical systems framework. In both cases, the objective was to
1134         derive conditions of convergence of such iterations to a fixed state.
1135         In this paper, a new point of view is presented, the goal here is
1136         to derive conditions under which chaotic iterations admit a chaotic
1137         behaviour in a rigorous mathematical sense. Contrary to what has
1138         been studied in the literature, convergence is not desired. More
1139         precisely, we establish in this paper a link between the concept
1140         of chaotic iterations on a finite set and the notion of topological
1141         chaos [8], [6], [7]. We are motivated by concrete applications of
1142         our approach, such as the use of chaotic boolean iterations in the
1143         computer security field. Indeed, the concept of chaos is used in
1144         many areas of data security without real rigorous theoretical foundations,
1145         and without using the fundamental properties that allow chaos. The
1146         wish of this paper is to bring a bit more mathematical rigour in
1147         this field.},
1148   citeseerurl = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1149   comment = {arXiv},
1150   comments = {6 pages},
1151   eprint = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1152   oai2identifier = {0810.3154},
1153   owner = {guyeux},
1154   timestamp = {2008.10.23},
1155   url = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}}
1156 }
1157
1158 @ARTICLE{arxivRNNchaos,
1159   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux and Michel Salomon},
1160   title = {Building a Chaotic Proved Neural Network},
1161   journal = {CoRR},
1162   year = {2011},
1163   volume = {abs/1101.4351},
1164   ee = {http://arxiv.org/abs/1101.4351}
1165 }
1166
1167 @INPROCEEDINGS{guyeuxTaiwan10,
1168   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
1169   title = {Improving random number generators by chaotic iterations. Application
1170         in data hiding},
1171   booktitle = {ICCASM 2010, Int. Conf. on Computer Application and System Modeling},
1172   year = {2010},
1173   pages = {V13-643--V13-647},
1174   address = {Taiyuan, China},
1175   month = oct,
1176   classement = {ACTI},
1177   doi = {10.1109/ICCASM.2010.5622199},
1178   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1179   equipe = {and},
1180   inhal = {no},
1181   url = {http://dx.doi.org/10.1109/ICCASM.2010.5622199}
1182 }
1183
1184 @ARTICLE{Bahi2009,
1185   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1186   title = {A stochastic model of gene evolution with time dependent pseudochaotic
1187         mutations.},
1188   journal = {Bull Math Biol},
1189   year = {2009},
1190   volume = {71},
1191   pages = {681--700},
1192   number = {3},
1193   month = {Apr},
1194   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1195         in which a random subset of the 64 possible trinucleotides mutates
1196         at each evolutionary time t according to some time dependent substitution
1197         probabilities. Therefore, at each time t, the numbers and the types
1198         of mutable trinucleotides are unknown. Thus, the mutation matrix
1199         changes at each time t. This pseudochaotic model developed generalizes
1200         the standard model in which all the trinucleotides mutate at each
1201         time t. It determines the occurrence probabilities at time t of trinucleotides
1202         which pseudochaotically mutate according to 3 time dependent substitution
1203         parameters associated with the 3 trinucleotide sites. The main result
1204         proves that under suitable assumptions, this pseudochaotic model
1205         converges to a uniform probability vector identical to that of the
1206         standard model. Furthermore, an application of this pseudochaotic
1207         model allows an evolutionary study of the 3 circular codes identified
1208         in both eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1209         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1210         frames in genes locally, i.e., anywhere in genes and particularly
1211         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1212         After a certain evolutionary time and with particular time dependent
1213         functions for the 3 substitution parameters, precisely an exponential
1214         decrease in the 1st and 2nd trinucleotide sites and an exponential
1215         increase in the 3rd one, this pseudochaotic model retrieves the main
1216         statistical properties of the 3 circular codes observed in genes.
1217         Furthermore, it leads to a circular code asymmetry stronger than
1218         the standard model (nonpseudochaotic) and, therefore, to a better
1219         correlation with the genes.},
1220   doi = {10.1007/s11538-008-9376-4},
1221   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1222         90016, Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1223   keywords = {Evolution, Molecular; Genes; Models, Genetic; Mutation; Stochastic
1224         Processes},
1225   language = {eng},
1226   medline-pst = {ppublish},
1227   owner = {guyeux},
1228   pmid = {19198957},
1229   timestamp = {2011.05.05},
1230   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-008-9376-4}
1231 }
1232
1233 @ARTICLE{Bahi2008a,
1234   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1235   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations.},
1236   journal = {J Theor Biol},
1237   year = {2008},
1238   volume = {255},
1239   pages = {53--63},
1240   number = {1},
1241   month = {Nov},
1242   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1243         in which the mutations are chaotic, i.e. a random subset of the 64
1244         possible trinucleotides mutates at each evolutionary time t according
1245         to some substitution probabilities. Therefore, at each time t, the
1246         numbers and the types of mutable trinucleotides are unknown. Thus,
1247         the mutation matrix changes at each time t. The chaotic model developed
1248         generalizes the standard model in which all the trinucleotides mutate
1249         at each time t. It determines the occurrence probabilities at time
1250         t of trinucleotides which chaotically mutate according to three substitution
1251         parameters associated with the three trinucleotide sites. Two theorems
1252         prove that this chaotic model has a probability vector at each time
1253         t and that it converges to a uniform probability vector identical
1254         to that of the standard model. Furthermore, four applications of
1255         this chaotic model (with a uniform random strategy for the 64 trinucleotides
1256         and with a particular strategy for the three stop codons) allow an
1257         evolutionary study of the three circular codes identified in both
1258         eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1259         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1260         frames in genes locally, i.e. anywhere in genes and particularly
1261         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1262         After a certain evolutionary time and with particular values for
1263         the three substitution parameters, the chaotic models retrieve the
1264         main statistical properties of the three circular codes observed
1265         in genes. These applications also allow an evolutionary comparison
1266         between the standard and chaotic models.},
1267   doi = {10.1016/j.jtbi.2008.07.028},
1268   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1269         90016 Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1270   keywords = {Animals; Computer Simulation; DNA, Circular, genetics; Evolution,
1271         Molecular; Genetic Code; Models, Genetic; Mutation; Nonlinear Dynamics;
1272         Stochastic Processes; Time},
1273   language = {eng},
1274   medline-pst = {ppublish},
1275   owner = {guyeux},
1276   pii = {S0022-5193(08)00395-0},
1277   pmid = {18706428},
1278   timestamp = {2011.05.05},
1279   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2008.07.028}
1280 }
1281
1282 @ARTICLE{Bahi2008bis,
1283   author = {Bahi, J. M. and Michel, C. J.},
1284   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations},
1285   journal = {Journal of Theoretical Biology},
1286   year = {2008},
1287   volume = {255},
1288   pages = {53-63},
1289   owner = {guyeux},
1290   timestamp = {2009.01.10}
1291 }
1292
1293 @ARTICLE{Bahi2004,
1294   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1295   title = {A stochastic gene evolution model with time dependent mutations.},
1296   journal = {Bull Math Biol},
1297   year = {2004},
1298   volume = {66},
1299   pages = {763--778},
1300   number = {4},
1301   month = {Jul},
1302   abstract = {We develop here a new class of gene evolution models in which the
1303         nucleotide mutations are time dependent. These models allow to study
1304         nonlinear gene evolution by accelerating or decelerating the mutation
1305         rates at different evolutionary times. They generalize the previous
1306         ones which are based on constant mutation rates. The stochastic model
1307         developed in this class determines at some time t the occurrence
1308         probabilities of trinucleotides mutating according to 3 time dependent
1309         substitution parameters associated with the 3 trinucleotide sites.
1310         Therefore, it allows to simulate the evolution of the circular code
1311         recently observed in genes. By varying the class of function for
1312         the substitution parameters, 1 among 12 models retrieves after mutation
1313         the statistical properties of the observed circular code in the 3
1314         frames of actual genes. In this model, the mutation rate in the 3rd
1315         trinucleotide site increases during gene evolution while the mutation
1316         rates in the 1st and 2nd sites decrease. This property agrees with
1317         the actual degeneracy of the genetic code. This approach can easily
1318         be generalized to study evolution of motifs of various lengths, e.g.,
1319         dicodons, etc., with time dependent mutations.},
1320   doi = {10.1016/j.bulm.2003.10.004},
1321   institution = {LIFC - FRE CNRS 2661, IUT de Belfort, Université de Franche-Comté,
1322         BP 527, 90016 Belfort Cédex, France. bahi@iut-bm.univ-fcomte.fr},
1323   keywords = {Codon, genetics; Evolution, Molecular; Genes, genetics; Genetic Code,
1324         genetics; Models, Genetic; Mutation; Stochastic Processes},
1325   language = {eng},
1326   medline-pst = {ppublish},
1327   owner = {guyeux},
1328   pii = {S0092824003001174},
1329   pmid = {15210317},
1330   timestamp = {2011.05.05},
1331   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.bulm.2003.10.004}
1332 }
1333
1334 @ARTICLE{Banks92,
1335   author = {J. Banks and J. Brooks and G. Cairns and P. Stacey},
1336   title = {On Devaney's Definition of Chaos},
1337   journal = {Amer. Math. Monthly},
1338   year = {1992},
1339   volume = {99},
1340   pages = {332--334},
1341   keywords = {(c+),},
1342   owner = {guyeux},
1343   timestamp = {27/01/2008}
1344 }
1345
1346 @MISC{Nist10,
1347   author = {E. Barker and A. Roginsky},
1348   title = {DRAFT NIST Special Publication 800-131 Recommendation for the Transitioning
1349         of Cryptographic Algorithms and Key Sizes},
1350   year = {2010},
1351   owner = {christophe},
1352   timestamp = {2010.08.18}
1353 }
1354
1355 @ARTICLE{BarniBF03,
1356   author = {Mauro Barni and Franco Bartolini and Teddy Furon},
1357   title = {A general framework for robust watermarking security},
1358   journal = {Signal Processing},
1359   year = {2003},
1360   volume = {83},
1361   pages = {2069-2084},
1362   number = {10},
1363   note = {Special issue on Security of Data Hiding Technologies, invited paper},
1364   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1365   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/S0165-1684(03)00168-3},
1366   owner = {guyeux},
1367   timestamp = {2009.06.30}
1368 }
1369
1370 @ARTICLE{Baudet78,
1371   author = {Baudet, G\'{e}rard M.},
1372   title = {Asynchronous Iterative Methods for Multiprocessors},
1373   journal = {J. ACM},
1374   year = {1978},
1375   volume = {25},
1376   pages = {226--244},
1377   number = {2},
1378   address = {New York, NY, USA},
1379   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/322063.322067},
1380   issn = {0004-5411},
1381   publisher = {ACM}
1382 }
1383
1384 @PHDTHESIS{Baz98,
1385   author = {Didier El Baz},
1386   title = {Contribution à l'algorithmique parallèle. Le concept d'asynchronisme
1387         : étude théorique, mise en œuvre, et application},
1388   school = {Institut national polytechnique de Toulouse},
1389   year = {1998},
1390   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1391   owner = {christophe},
1392   timestamp = {2010.08.24}
1393 }
1394
1395 @ARTICLE{bhr09c:bl,
1396   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1397   title = {Contention awareness and fault-tolerant scheduling for precedence
1398         constrained tasks in heterogeneous systems},
1399   journal = {Parallel Computing},
1400   year = {2009},
1401   volume = {35},
1402   pages = {83--108},
1403   number = {2},
1404   classement = {*},
1405   doi = {10.1016/j.parco.2008.11.001},
1406   equipe = {and},
1407   inhal = {no},
1408   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.parco.2008.11.001}
1409 }
1410
1411 @INPROCEEDINGS{bhr08b:bl,
1412   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1413   title = {Fault tolerant scheduling of precedence task graphs on heterogeneous
1414         platforms},
1415   booktitle = {IPDPS'08},
1416   year = {2008},
1417   pages = {1--8},
1418   publisher = {IEEE Computer Society Press},
1419   classement = {*},
1420   equipe = {and},
1421   inhal = {no}
1422 }
1423
1424 @INPROCEEDINGS{Berger98,
1425   author = {Berger, Bonnie and Leighton, Tom},
1426   title = {Protein folding in the hydrophobic-hydrophilic (HP) is NP-complete},
1427   booktitle = {Proceedings of the second annual international conference on Computational
1428         molecular biology},
1429   year = {1998},
1430   series = {RECOMB '98},
1431   pages = {30--39},
1432   address = {New York, NY, USA},
1433   publisher = {ACM},
1434   acmid = {279080},
1435   isbn = {0-89791-976-9},
1436   location = {New York, New York, United States},
1437   numpages = {10}
1438 }
1439
1440 @BOOK{Bertsekas89,
1441   title = {Parallel and distributed computation: numerical methods},
1442   publisher = {Prentice-Hall, Inc.},
1443   year = {1989},
1444   author = {Bertsekas, Dimitri P. and Tsitsiklis, John N.},
1445   address = {Upper Saddle River, NJ, USA},
1446   isbn = {0-13-648700-9}
1447 }
1448
1449 @MISC{Bertsekas88paralleland,
1450   author = {Dimitri P. Bertsekas and John N. Tsitsiklis},
1451   title = {Parallel and distributed iterative algorithms: a selective survey},
1452   year = {1988}
1453 }
1454
1455 @UNPUBLISHED{F.a,
1456   author = {F. Blanchard and E. Glasner and S. Kolyada and A.Maass},
1457   title = {On Li-Yorke pairs},
1458   note = {Preprint},
1459   optkey = {2000},
1460   owner = {guyeux},
1461   timestamp = {2008.01.02}
1462 }
1463
1464 @UNPUBLISHED{F.,
1465   author = {F. Blanchard and B. Host and S. Ruette},
1466   title = {Asymptotic pairs in positive-entropy systems},
1467   note = {Preprint},
1468   optannote = {to appear in Ergod. Th. Dynam. Sys.},
1469   optkey = {2000},
1470   owner = {guyeux},
1471   timestamp = {2008.01.02}
1472 }
1473
1474 @ARTICLE{BFibe,
1475   author = {Dan Boneh and Matt Franklin},
1476   title = {Identity-Based Encryption from the {Weil} Pairing},
1477   journal = {SIAM J. of Computing},
1478   year = {2003},
1479   volume = {32},
1480   pages = {586-615},
1481   number = {3},
1482   note = {Extended abstract in Crypto'01}
1483 }
1484
1485 @INCOLLECTION{boneh,
1486   author = {Boneh, Dan and Goh, Eu-Jin and Nissim, Kobbi},
1487   title = {Evaluating 2-DNF Formulas on Ciphertexts},
1488   year = {2005},
1489   pages = {325--341},
1490   abstract = {Let ψ be a 2-DNF formula on boolean variables x 1,..., x n ∈ {0,1}.
1491         We present a homomorphic public key encryption scheme that allows
1492         the public evaluation of ψ given an encryption of the variables x
1493         1,..., x n. In other words, given the encryption of the bits x 1,...,
1494         x n, anyone can create the encryption of ψ( x 1,..., x n). More generally,
1495         we can evaluate quadratic multi-variate polynomials on ciphertexts
1496         provided the resulting value falls within a small set. We present
1497         a number of applications of the system: 1 In a database of size n,
1498         the total communication in the basic step of the Kushilevitz-Ostrovsky
1499         PIR protocol is reduced from to . 2 An efficient election system
1500         based on homomorphic encryption where voters do not need to include
1501         non-interactive zero knowledge proofs that their ballots are valid.
1502         The election system is proved secure without random oracles but still
1503         efficient. 3 A protocol for universally verifiable computation.},
1504   citeulike-article-id = {2719460},
1505   citeulike-linkout-0 = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg},
1506   journal = {Theory of Cryptography},
1507   keywords = {homomorphic, pairings},
1508   posted-at = {2008-04-25 21:53:15},
1509   priority = {2},
1510   url = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg}
1511 }
1512
1513 @ARTICLE{Bonneau01,
1514   author = {Bonneau, Richard and Baker, David},
1515   title = {AB INITIO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION: Progress and Prospects},
1516   journal = {Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure},
1517   year = {2001},
1518   volume = {30},
1519   pages = {173-189},
1520   number = {1},
1521   doi = {10.1146/annurev.biophys.30.1.173}
1522 }
1523
1524 @ARTICLE{Bowen,
1525   author = {R. Bowen},
1526   title = {Entropy for group endomorphisms and homogeneous spaces},
1527   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1528   year = {1971},
1529   volume = {153},
1530   pages = {401-414},
1531   owner = {guyeux},
1532   timestamp = {15/02/2008}
1533 }
1534
1535 @ARTICLE{Bowen1971,
1536   author = {R. Bowen},
1537   title = {Periodic points and measures for Axiom A diffeomorphisms},
1538   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1539   year = {1971},
1540   volume = {154},
1541   pages = {377-397},
1542   owner = {guyeux},
1543   timestamp = {15/02/2008}
1544 }
1545
1546 @ARTICLE{Braxenthaler97,
1547   author = {Michael Braxenthaler and R. Ron Unger and Ditza Auerbach and John
1548         Moult},
1549   title = {Chaos in protein dynamics},
1550   journal = {Proteins-structure Function and Bioinformatics},
1551   year = {1997},
1552   volume = {29},
1553   pages = {417--425},
1554   doi = {10.1002/(SICI)1097-0134(199712)29:4<417::AID-PROT2>3.3.CO;2-O},
1555   masid = {2824140}
1556 }
1557
1558 @INPROCEEDINGS{Brumley03remotetiming,
1559   author = {David Brumley and Dan Boneh},
1560   title = {Remote Timing Attacks are Practical},
1561   booktitle = {Proceedings of the 12th USENIX Security Symposium},
1562   year = {2003},
1563   pages = {1--14}
1564 }
1565
1566 @ARTICLE{Bohm1991375,
1567   author = {Gerald Böhm},
1568   title = {Protein folding and deterministic chaos: Limits of protein folding
1569         simulations and calculations},
1570   journal = {Chaos, Solitons \& Fractals},
1571   year = {1991},
1572   volume = {1},
1573   pages = {375 - 382},
1574   number = {4},
1575   doi = {DOI: 10.1016/0960-0779(91)90028-8},
1576   issn = {0960-0779},
1577   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TJ4-46CBXVT-1X/2/370489c218e4c2732cd9b620ef50c696}
1578 }
1579
1580 @INCOLLECTION{Cachin2004,
1581   author = {Cachin, Christian},
1582   title = {An Information-Theoretic Model for Steganography},
1583   booktitle = {Information Hiding},
1584   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1585   year = {1998},
1586   volume = {1525},
1587   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1588   pages = {306-318},
1589   affiliation = {MIT Laboratory for Computer Science 545 Technology Square Cambridge
1590         MA 02139 USA}
1591 }
1592
1593 @ARTICLE{Cam2006,
1594   author = {H. Cam and S. Ozdemir and P. Nair and D. Muthuavinashinappan and
1595         H. O. Sanli},
1596   title = {ESPDA: Energy-efficient secure pattern based data aggregation for
1597         wireless sensor networks.},
1598   journal = {Computer Communication journal (29)},
1599   year = {2006},
1600   pages = {446-455}
1601 }
1602
1603 @ARTICLE{CarletCZ98,
1604   author = {Claude Carlet and Pascale Charpin and Victor Zinoviev},
1605   title = {Codes, Bent Functions and Permutations Suitable For DES-like Cryptosystems},
1606   journal = {Des. Codes Cryptography},
1607   year = {1998},
1608   volume = {15},
1609   pages = {125-156},
1610   number = {2},
1611   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de}
1612 }
1613
1614 @INPROCEEDINGS{Castelluccia05efficientaggregation,
1615   author = {Claude Castelluccia},
1616   title = {Efficient aggregation of encrypted data in wireless sensor networks},
1617   booktitle = {MobiQuitous},
1618   year = {2005},
1619   pages = {109--117},
1620   publisher = {IEEE Computer Society}
1621 }
1622
1623 @ARTICLE{Cayre2008,
1624   author = {Cayre, F. and Bas, P.},
1625   title = {Kerckhoffs-Based Embedding Security Classes for WOA Data Hiding},
1626   journal = {IEEE Transactions on Information Forensics and Security},
1627   year = {2008},
1628   volume = {3},
1629   pages = {1--15},
1630   number = {1},
1631   doi = {10.1109/TIFS.2007.916006},
1632   issn = {1556-6013},
1633   keywords = {cryptography, random sequences, spread spectrum communication, telecommunication
1634         security, watermarking, Kerckhoffs-based embedding security classes,
1635         WOA Data Hiding, pseudorandom sequences, spread-spectrum techniques,
1636         steganography security, watermark-only-attack, watermarking, Security,
1637         spread-spectrum (SS) watermarking},
1638   owner = {guyeux},
1639   timestamp = {2009.06.29}
1640 }
1641
1642 @ARTICLE{Cayre2005,
1643   author = {Cayre, F. and Fontaine, C. and Furon, T.},
1644   title = {Watermarking security: theory and practice},
1645   journal = {IEEE Transactions on Signal Processing},
1646   year = {2005},
1647   volume = {53},
1648   pages = {3976--3987},
1649   number = {10},
1650   doi = {10.1109/TSP.2005.855418},
1651   issn = {1053-587X},
1652   keywords = {blind source separation, cryptography, watermarking, Fisher information
1653         matrix, blind source separation, cryptanalysis, information theory,
1654         spread spectrum techniques, substitutive scheme, watermarking security,
1655         Blind source separation, Fisher information matrix, equivocation,
1656         security, watermarking},
1657   owner = {guyeux},
1658   timestamp = {2009.06.29}
1659 }
1660
1661 @ARTICLE{Chajakis91,
1662   author = {Chajakis, Emmanuel D. and Zenios, Stavros A.},
1663   title = {Synchronous and asynchronous implementations of relaxation algorithms
1664         for nonlinear network optimization},
1665   journal = {Parallel Comput.},
1666   year = {1991},
1667   volume = {17},
1668   pages = {873--894},
1669   number = {8},
1670   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1671   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/S0167-8191(05)80072-9},
1672   issn = {0167-8191},
1673   publisher = {Elsevier Science Publishers B. V.}
1674 }
1675
1676 @ARTICLE{Chan2007,
1677   author = {Chan, Haowen and Perrig, Adrian and Przydatek, Bartosz and Song,
1678         Dawn},
1679   title = {SIA: Secure information aggregation in sensor networks},
1680   journal = {J. Comput. Secur.},
1681   year = {2007},
1682   volume = {15},
1683   pages = {69--102},
1684   number = {1},
1685   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1686   issn = {0926-227X},
1687   publisher = {IOS Press}
1688 }
1689
1690 @ARTICLE{Chandramouli06,
1691   author = {R. Chandramouli and S. Bapatla and K.P. Subbalakshmi},
1692   title = {Battery power-aware encryption},
1693   journal = {ACM transactions on information and system security},
1694   year = {2006},
1695   pages = {162--180},
1696   owner = {christophe},
1697   timestamp = {2010.07.31}
1698 }
1699
1700 @ARTICLE{Charpin85,
1701   author = {Pascale Charpin},
1702   title = {A description of some extended cyclic codes with application to Reed-Solomon
1703         codes},
1704   journal = {Discrete Mathematics},
1705   year = {1985},
1706   volume = {56},
1707   pages = {117-124},
1708   number = {2-3},
1709   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1710   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/0012-365X(85)90019-6}
1711 }
1712
1713 @ARTICLE{Chazan69,
1714   author = {D. Chazan and W. Miranker},
1715   title = {Chaotic relaxation},
1716   journal = {Linear algebra and its applications},
1717   year = {1969},
1718   pages = {199-222},
1719   owner = {guyeux},
1720   timestamp = {2008.05.22}
1721 }
1722
1723 @ARTICLE{Cheon2006,
1724   author = {Cheon, Jung Hee and Kim, Woo-Hwan and Nam, Hyun Soo},
1725   title = {Known-plaintext cryptanalysis of the Domingo-Ferrer algebraic privacy
1726         homomorphism scheme},
1727   journal = {Inf. Process. Lett.},
1728   year = {2006},
1729   volume = {97},
1730   pages = {118--123},
1731   number = {3},
1732   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1733   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ipl.2005.09.016},
1734   issn = {0020-0190},
1735   publisher = {Elsevier North-Holland, Inc.}
1736 }
1737
1738 @MISC{Cheon03acryptanalysis,
1739   author = {Jung Hee Cheon and Hyun Soo Nam},
1740   title = {A Cryptanalysis of the Original Domingo-Ferrer's Algebraic Privacy
1741         Homomorphism},
1742   year = {2003}
1743 }
1744
1745 @ARTICLE{Cheung05,
1746   author = {R.C.C. Cheung and N.J. Telle and W. Luk and P.Y.K. Cheung},
1747   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
1748   journal = {IEEE Trans. on Very Large Scale Integration Systems},
1749   year = {2005},
1750   volume = {13},
1751   pages = {1048-1059},
1752   number = {9}
1753 }
1754
1755 @ARTICLE{Chivian2005,
1756   author = {Chivian, Dylan and Kim, David E. and Malmström, Lars and Schonbrun,
1757         Jack and Rohl, Carol A. and Baker, David},
1758   title = {Prediction of CASP6 structures using automated robetta protocols},
1759   journal = {Proteins},
1760   year = {2005},
1761   volume = {61},
1762   pages = {157--166},
1763   number = {S7},
1764   issn = {1097-0134},
1765   keywords = {Rosetta, fragment assembly, de novo modeling, homology modeling, parametric
1766         alignment ensemble},
1767   owner = {christophe},
1768   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
1769   timestamp = {2011.01.22},
1770   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20733}
1771 }
1772
1773 @ARTICLE{Zhu06,
1774   author = {Congxu, Zhu and Xuefeng, Liao and Zhihua, Li},
1775   title = {Chaos-based multipurpose image watermarking algorithm},
1776   journal = {Wuhan University Journal of Natural Sciences},
1777   year = {2006},
1778   volume = {11},
1779   pages = {1675-1678},
1780   note = {10.1007/BF02831848},
1781   abstract = {To achieve the goal of image content authentication and copyright
1782         protection simultaneously, this paper presents a novel image dual
1783         watermarking method based on chaotic map. Firstly, the host image
1784         was split into many nonoverlapping small blocks, and the block-wise
1785         discrete cosine transform (DCT) is computed. Secondly, the robust
1786         watermarks, shuffled by the chaotic sequences, are embedded in the
1787         DC coefficients of blocks to achieve the goal of copyright protection.
1788         The semi-fragile watermarks, generated by chaotic map, are embedded
1789         in the AC coefficients of blocks to obtain the aim of image authentication.
1790         Both of them can be extracted without the original image. Simulation
1791         results demonstrate the effectiveness of our algorithm in terms of
1792         robustness and fragility.},
1793   affiliation = {Central South University School of Information Science and Engineering
1794         410083 Changsha, Hunan China},
1795   issn = {1007-1202},
1796   issue = {6},
1797   keyword = {Mathematics, general},
1798   publisher = {Wuhan University, co-published with Springer},
1799   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF02831848}
1800 }
1801
1802 @ARTICLE{Conley1978,
1803   author = {C. Conley},
1804   title = {Isolated invariant sets and the Morse index},
1805   journal = {CBMS Regional Conference. AMS.},
1806   year = {1978},
1807   optvolume = {38},
1808   owner = {guyeux},
1809   timestamp = {2008.01.02}
1810 }
1811
1812 @ARTICLE{Cornu2002,
1813   author = {Philippe Cornu and André Smolarz},
1814   title = {Image characterization by texture},
1815   journal = {Traitement du signal},
1816   year = {2002},
1817   volume = {19},
1818   pages = {29-35},
1819   file = {:/home/guyeux/Documents/Bibliotheque/These/Watermarking/Caractérisation d'images par textures associées.pdf:PDF},
1820   owner = {guyeux},
1821   timestamp = {2008.05.12}
1822 }
1823
1824 @INPROCEEDINGS{Cox99,
1825   author = {Ingemar Cox and Matt L. Miller and Andrew L. Mckellips},
1826   title = {Watermarking as Communications With Side Information},
1827   booktitle = {Proceedings of the IEEE},
1828   year = {1999},
1829   pages = {1127--1141},
1830   owner = {christophe},
1831   timestamp = {2010.03.06}
1832 }
1833
1834 @ARTICLE{Cox97securespread,
1835   author = {Ingemar J. Cox and Senior Member and Joe Kilian and F. Thomson Leighton
1836         and Talal Shamoon},
1837   title = {Secure spread spectrum watermarking for multimedia},
1838   journal = {IEEE Transactions on Image Processing},
1839   year = {1997},
1840   volume = {6},
1841   pages = {1673--1687}
1842 }
1843
1844 @ARTICLE{Cramer96,
1845   author = {Christopher Cramer and Erol Gelenbe and Hakan Bakircioglu},
1846   title = {Video Compression with Random Neural Networks},
1847   journal = {Neural Networks for Identification, Control, and Robotics, International
1848         Workshop},
1849   year = {1996},
1850   volume = {0},
1851   pages = {0476},
1852   address = {Los Alamitos, CA, USA},
1853   isbn = {0-8186-7456-3},
1854   publisher = {IEEE Computer Society}
1855 }
1856
1857 @INPROCEEDINGS{Crescenzi98,
1858   author = {Crescenzi, Pierluigi and Goldman, Deborah and Papadimitriou, Christos
1859         and Piccolboni, Antonio and Yannakakis, Mihalis},
1860   title = {On the complexity of protein folding (extended abstract)},
1861   booktitle = {Proceedings of the thirtieth annual ACM symposium on Theory of computing},
1862   year = {1998},
1863   series = {STOC '98},
1864   pages = {597--603},
1865   address = {New York, NY, USA},
1866   publisher = {ACM},
1867   acmid = {276875},
1868   isbn = {0-89791-962-9},
1869   location = {Dallas, Texas, United States},
1870   numpages = {7}
1871 }
1872
1873 @ARTICLE{Dawei2004,
1874   author = {Zhao Dawei and Chen Guanrong and Liu Wenbo},
1875   title = {A chaos-based robust wavelet-domain watermarking algorithm},
1876   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
1877   year = {2004},
1878   volume = {22},
1879   pages = {47-54},
1880   owner = {guyeux},
1881   timestamp = {2008.10.07}
1882 }
1883
1884 @MISC{1011.1638,
1885   author = {Anthony Desnos and Robert Erra and Eric Filiol},
1886   title = {Processor-Dependent Malware... and codes},
1887   year = {2010},
1888   comment = {arXiv:1011.1638},
1889   eprint = {arXiv:1011.1638}
1890 }
1891
1892 @BOOK{devaney,
1893   title = {An Introduction to Chaotic Dynamical Systems},
1894   publisher = {Addison-Wesley},
1895   year = {1989},
1896   author = {Devaney, Robert L.},
1897   address = {Redwood City, CA},
1898   edition = {2nd}
1899 }
1900
1901 @ARTICLE{diffie76,
1902   author = {Whitfield Diffie and Martin E. Hellman},
1903   title = {New Directions in Cryptography},
1904   journal = {IEEE Transactions on Information Theory},
1905   year = {1976},
1906   volume = {IT-22},
1907   pages = {644--654},
1908   number = {6},
1909   date = {November 1976},
1910   owner = {guyeux},
1911   timestamp = {2009.06.30},
1912   url = {citeseer.ist.psu.edu/diffie76new.html}
1913 }
1914
1915 @INCOLLECTION{Dijk10,
1916   author = {van Dijk, Marten and Gentry, Craig and Halevi, Shai and Vaikuntanathan,
1917         Vinod},
1918   title = {Fully Homomorphic Encryption over the Integers},
1919   booktitle = {Advances in Cryptology – EUROCRYPT 2010},
1920   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1921   year = {2010},
1922   editor = {Gilbert, Henri},
1923   volume = {6110},
1924   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1925   pages = {24-43},
1926   abstract = {We construct a simple fully homomorphic encryption scheme, using only
1927         elementary modular arithmetic. We use Gentry’s technique to construct
1928         a fully homomorphic scheme from a bootstrappable somewhat homomorphic
1929         scheme. However, instead of using ideal lattices over a polynomial
1930         ring, our bootstrappable encryption scheme merely uses addition and
1931         multiplication over the integers. The main appeal of our scheme is
1932         the conceptual simplicity. We reduce the security of our scheme to
1933         finding an approximate integer gcd – i.e., given a list of integers
1934         that are near-multiples of a hidden integer, output that hidden integer.
1935         We investigate the hardness of this task, building on earlier work
1936         of Howgrave-Graham.},
1937   affiliation = {MIT CSAIL}
1938 }
1939
1940 @ARTICLE{Dill1985,
1941   author = {Dill, KA},
1942   title = {Theory for the folding and stability of globular proteins.},
1943   journal = {Biochemistry},
1944   year = {1985},
1945   volume = {24},
1946   pages = {1501-9--},
1947   number = {6},
1948   month = mar,
1949   abstract = {Using lattice statistical mechanics, we develop theory to account
1950         for the folding of a heteropolymer molecule such as a protein to
1951         the globular and soluble state. Folding is assumed to be driven by
1952         the association of solvophobic monomers to avoid solvent and opposed
1953         by the chain configurational entropy. Theory predicts a phase transition
1954         as a function of temperature or solvent character. Molecules that
1955         are too short or too long or that have too few solvophobic residues
1956         are predicted not to fold. Globular molecules should have a largely
1957         solvophobic core, but there is an entropic tendency for some residues
1958         to be "out of place", particularly in small molecules. For long chains,
1959         molecules comprised of globular domains are predicted to be thermodynamically
1960         more stable than spherical molecules. The number of accessible conformations
1961         in the globular state is calculated to be an exceedingly small fraction
1962         of the number available to the random coil. Previous estimates of
1963         this number, which have motivated kinetic theories of folding, err
1964         by many tens of orders of magnitude.},
1965   comment = {Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
1966   keywords = {Mathematics, Models, Chemical, Polymers, Protein Conformation},
1967   owner = {christophe},
1968   timestamp = {2011.01.22},
1969   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/3986190}
1970 }
1971
1972 @ARTICLE{Dill1995,
1973   author = {Dill, KA and Bromberg, S and Yue, K and Fiebig, KM and Yee, DP and
1974         Thomas, PD and Chan, HS},
1975   title = {Principles of protein folding--a perspective from simple exact models.},
1976   journal = {Protein Sci},
1977   year = {1995},
1978   volume = {4},
1979   pages = {561-602--},
1980   number = {4},
1981   month = apr,
1982   abstract = {General principles of protein structure, stability, and folding kinetics
1983         have recently been explored in computer simulations of simple exact
1984         lattice models. These models represent protein chains at a rudimentary
1985         level, but they involve few parameters, approximations, or implicit
1986         biases, and they allow complete explorations of conformational and
1987         sequence spaces. Such simulations have resulted in testable predictions
1988         that are sometimes unanticipated: The folding code is mainly binary
1989         and delocalized throughout the amino acid sequence. The secondary
1990         and tertiary structures of a protein are specified mainly by the
1991         sequence of polar and nonpolar monomers. More specific interactions
1992         may refine the structure, rather than dominate the folding code.
1993         Simple exact models can account for the properties that characterize
1994         protein folding: two-state cooperativity, secondary and tertiary
1995         structures, and multistage folding kinetics--fast hydrophobic collapse
1996         followed by slower annealing. These studies suggest the possibility
1997         of creating "foldable" chain molecules other than proteins. The encoding
1998         of a unique compact chain conformation may not require amino acids;
1999         it may require only the ability to synthesize specific monomer sequences
2000         in which at least one monomer type is solvent-averse.},
2001   address = {Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California,
2002         San Francisco 94143-1204, USA.},
2003   comment = {Review,Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't,
2004         Non-P.H.S.,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
2005   keywords = {Amino Acid Sequence, Biological Evolution, Hydrogen Bonding, Models,
2006         Molecular, Molecular Sequence Data, Mutation, Protein Conformation,
2007         Protein Denaturation, Protein Folding, Temperature, Thermodynamics},
2008   owner = {christophe},
2009   timestamp = {2011.01.22},
2010   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/7613459}
2011 }
2012
2013 @INPROCEEDINGS{Dobbertin96,
2014   author = {Dobbertin, Hans},
2015   title = {Cryptanalysis of MD4},
2016   booktitle = {Proceedings of the Third International Workshop on Fast Software
2017         Encryption},
2018   year = {1996},
2019   pages = {53--69},
2020   address = {London, UK},
2021   publisher = {Springer-Verlag},
2022   isbn = {3-540-60865-6}
2023 }
2024
2025 @INPROCEEDINGS{DomingoFerrer2002,
2026   author = {Domingo-Ferrer, Josep},
2027   title = {A Provably Secure Additive and Multiplicative Privacy Homomorphism},
2028   booktitle = {ISC '02: Proceedings of the 5th International Conference on Information
2029         Security},
2030   year = {2002},
2031   pages = {471--483},
2032   address = {London, UK},
2033   publisher = {Springer-Verlag},
2034   isbn = {3-540-44270-7}
2035 }
2036
2037 @ARTICLE{Dubchak1995,
2038   author = {I. Dubchak and I. Muchnik and S. R. Holbrook and S. H. Kim},
2039   title = {Prediction of protein folding class using global description of amino
2040         acid sequence.},
2041   journal = {Proc Natl Acad Sci U S A},
2042   year = {1995},
2043   volume = {92},
2044   pages = {8700--8704},
2045   number = {19},
2046   month = {Sep},
2047   __markedentry = {[guyeux]},
2048   abstract = {We present a method for predicting protein folding class based on
2049         global protein chain description and a voting process. Selection
2050         of the best descriptors was achieved by a computer-simulated neural
2051         network trained on a data base consisting of 83 folding classes.
2052         Protein-chain descriptors include overall composition, transition,
2053         and distribution of amino acid attributes, such as relative hydrophobicity,
2054         predicted secondary structure, and predicted solvent exposure. Cross-validation
2055         testing was performed on 15 of the largest classes. The test shows
2056         that proteins were assigned to the correct class (correct positive
2057         prediction) with an average accuracy of 71.7\%, whereas the inverse
2058         prediction of proteins as not belonging to a particular class (correct
2059         negative prediction) was 90-95\% accurate. When tested on 254 structures
2060         used in this study, the top two predictions contained the correct
2061         class in 91\% of the cases.},
2062   institution = {Department of Chemistry, University of California, Berkeley 94720,
2063         USA.},
2064   keywords = {Amino Acid Sequence; Amino Acids, chemistry; Computer Simulation;
2065         Databases, Factual; Models, Chemical; Neural Networks (Computer);
2066         Protein Folding; Protein Structure, Secondary; Proteins, chemistry/classification;
2067         Reproducibility of Results; Solvents},
2068   language = {eng},
2069   medline-pst = {ppublish},
2070   owner = {guyeux},
2071   pmid = {7568000},
2072   timestamp = {2011.07.18}
2073 }
2074
2075 @BOOK{Dudley,
2076   title = {Real analysis and probability},
2077   publisher = {Cambridge University Press},
2078   author = {Richard M. Dudley},
2079   optpages = {209},
2080   owner = {guyeux},
2081   timestamp = {2008.01.02}
2082 }
2083
2084 @ARTICLE{Tarazi84,
2085   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2086   title = {Algorithmes mixtes asynchrones. Etude de convergence monotone},
2087   journal = {Numerische Mathematik},
2088   year = {1984},
2089   volume = {44},
2090   pages = {363-369},
2091   note = {10.1007/BF01405568},
2092   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2093         Box 5969 Kuwait},
2094   issn = {0029-599X},
2095   issue = {3},
2096   keyword = {Mathematics and Statistics},
2097   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2098   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01405568}
2099 }
2100
2101 @ARTICLE{Tarazi82,
2102   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2103   title = {Some convergence results for asynchronous algorithms},
2104   journal = {Numerische Mathematik},
2105   year = {1982},
2106   volume = {39},
2107   pages = {325-340},
2108   note = {10.1007/BF01407866},
2109   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2110         Box 5969 Kuwait Kuwait},
2111   issn = {0029-599X},
2112   issue = {3},
2113   keyword = {Mathematics and Statistics},
2114   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2115   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01407866}
2116 }
2117
2118 @ARTICLE{Fei2005,
2119   author = {Peng Fei and Qiu Shui-Sheng and Long Min},
2120   title = {A secure digital signature algorithm based on elliptic curve and
2121         chaotic mappings},
2122   journal = {Circuits Systems Signal Processing},
2123   year = {2005},
2124   volume = {24, No. 5},
2125   pages = {585--597},
2126   owner = {guyeux},
2127   timestamp = {2009.01.16}
2128 }
2129
2130 @BOOK{Feigenbaum1908,
2131   title = {Universal behavior in nonlinear systems},
2132   publisher = {Los Alamos Science},
2133   year = {1908},
2134   author = {Feigenbaum},
2135   owner = {guyeux},
2136   timestamp = {2008.01.02}
2137 }
2138
2139 @ARTICLE{Felsenstein1980,
2140   author = {J. Felsenstein},
2141   title = {A view of population genetics.},
2142   journal = {Science},
2143   year = {1980},
2144   volume = {208},
2145   pages = {1253},
2146   number = {4449},
2147   month = {Jun},
2148   doi = {10.1126/science.208.4449.1253},
2149   language = {eng},
2150   medline-pst = {ppublish},
2151   owner = {guyeux},
2152   pii = {208/4449/1253},
2153   pmid = {17830806},
2154   timestamp = {2011.05.05},
2155   url = {http://dx.doi.org/10.1126/science.208.4449.1253}
2156 }
2157
2158 @BOOK{Filiol09,
2159   title = {Les virus informatiques : techniques virales et antivirales avancées},
2160   year = {2009},
2161   editor = {Springer},
2162   author = {Eric Filiol},
2163   owner = {christophe},
2164   timestamp = {2010.10.13}
2165 }
2166
2167 @INPROCEEDINGS{FiliolBlackHat,
2168   author = {Eric Filiol},
2169   title = {Passive and Active Leakage of Secret Data from Non Networked Computer},
2170   booktitle = {Black Hat},
2171   year = {2008},
2172   owner = {christophe},
2173   timestamp = {2010.11.28}
2174 }
2175
2176 @PHDTHESIS{Formenti2003,
2177   author = {Enrico Formenti},
2178   title = {De l'algorithmique du chaos dans les systèmes dynamiques discrets},
2179   school = {Université de Provence},
2180   year = {2003},
2181   owner = {guyeux},
2182   timestamp = {2008.01.02}
2183 }
2184
2185 @PHDTHESIS{Formenti1998,
2186   author = {Enrico Formenti},
2187   title = {Automates cellulaires et chaos : de la vision topologique à la vision
2188         algorithmique},
2189   school = {\'Ecole Normale Supérieure de Lyon},
2190   year = {1998},
2191   optmonth = {Octobre},
2192   owner = {guyeux},
2193   timestamp = {2008.01.02}
2194 }
2195
2196 @ARTICLE{Frey2006,
2197   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2198   title = {Identification of circular codes in bacterial genomes and their use
2199         in a factorization method for retrieving the reading frames of genes.},
2200   journal = {Comput Biol Chem},
2201   year = {2006},
2202   volume = {30},
2203   pages = {87--101},
2204   number = {2},
2205   month = {Apr},
2206   abstract = {We developed a statistical method that allows each trinucleotide to
2207         be associated with a unique frame among the three possible ones in
2208         a (protein coding) gene. An extensive gene study in 175 complete
2209         bacterial genomes based on this statistical approach resulted in
2210         identification of 72 new circular codes. Finding a circular code
2211         enables an immediate retrieval of the reading frame locally anywhere
2212         in a gene. No knowledge of location of the start codon is required
2213         and a short window of only a few nucleotides is sufficient for automatic
2214         retrieval. We have therefore developed a factorization method (that
2215         explores previously found circular codes) for retrieving the reading
2216         frames of bacterial genes. Its principle is new and easy to understand.
2217         Neither complex treatment nor specific information on the nucleotide
2218         sequences is necessary. Moreover, the method can be used for short
2219         regions in nucleotide sequences (less than 25 nucleotides in protein
2220         coding genes). Selected additional properties of circular codes and
2221         their possible biological consequences are also discussed.},
2222   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001},
2223   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2224         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2225         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2226   keywords = {Base Sequence; Computational Biology; Genes, Bacterial; Genome, Bacterial;
2227         Genomics, statistics /&/ numerical data; Models, Genetic; Models,
2228         Statistical; Reading Frames},
2229   language = {eng},
2230   medline-pst = {ppublish},
2231   owner = {guyeux},
2232   pii = {S1476-9271(05)00111-8},
2233   pmid = {16439185},
2234   timestamp = {2011.05.05},
2235   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001}
2236 }
2237
2238 @ARTICLE{Frey2006a,
2239   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2240   title = {An analytical model of gene evolution with six mutation parameters:
2241         an application to archaeal circular codes.},
2242   journal = {Comput Biol Chem},
2243   year = {2006},
2244   volume = {30},
2245   pages = {1--11},
2246   number = {1},
2247   month = {Feb},
2248   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
2249         mutation matrix 64 x 64 with six substitution parameters associated
2250         with the transitions and transversions in the three trinucleotide
2251         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
2252         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
2253         x 64 with three parameters. It determines at some time t the exact
2254         occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly according
2255         to six substitution parameters. An application of this model allows
2256         an evolutionary study of the common circular code COM and the 15
2257         archaeal circular codes X which have been recently identified in
2258         several archaeal genomes. The main property of a circular code is
2259         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
2260         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
2261         with a window of a few nucleotides. In genes, the circular code is
2262         superimposed on the traditional genetic one. Very unexpectedly, the
2263         evolutionary model demonstrates that the archaeal circular codes
2264         can derive from the common circular code subjected to random substitutions
2265         with particular values for six substitutions parameters. It has a
2266         strong correlation with the statistical observations of three archaeal
2267         codes in actual genes. Furthermore, the properties of these substitution
2268         rates allow proposal of an evolutionary classification of the 15
2269         archaeal codes into three main classes according to this model. In
2270         almost all the cases, they agree with the actual degeneracy of the
2271         genetic code with substitutions more frequent in the third trinucleotide
2272         site and with transitions more frequent that transversions in any
2273         trinucleotide site.},
2274   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001},
2275   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2276         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2277         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2278   keywords = {Archaea, genetics; DNA, Circular; Evolution, Molecular; Genetic Code;
2279         Genome, Archaeal; Models, Genetic; Mutation; Trinucleotide Repeats},
2280   language = {eng},
2281   medline-pst = {ppublish},
2282   owner = {guyeux},
2283   pii = {S1476-9271(05)00083-6},
2284   pmid = {16324886},
2285   timestamp = {2011.05.05},
2286   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001}
2287 }
2288
2289 @INPROCEEDINGS{fgb11:ip,
2290   author = {Friot, Nicolas and Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2291   title = {Chaotic Iterations for Steganography - Stego-security and chaos-security},
2292   booktitle = {SECRYPT'2011, Int. Conf. on Security and Cryptography},
2293   year = {2011},
2294   pages = {***--***},
2295   address = {Sevilla, Spain},
2296   month = jul,
2297   note = {To appear},
2298   classement = {ACTI},
2299   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2300   equipe = {and},
2301   inhal = {no}
2302 }
2303
2304 @MISC{Frisch,
2305   author = {Alain Frisch},
2306   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2307   year = {1998},
2308   note = {Rapport de tipe},
2309   file = {Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:Chaos/Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:PDF},
2310   keywords = {Chaos, Entropie Topologique, Tipe},
2311   owner = {guyeux},
2312   timestamp = {2008.01.02},
2313   url = {http://alain.frisch.fr/math.html}
2314 }
2315
2316 @MISC{Frisch98,
2317   author = {Alain Frisch},
2318   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2319   year = {1998},
2320   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2321   url = {\url{http://alain.frisch.fr/math.html}}
2322 }
2323
2324 @ARTICLE{Frommer97asynchronousweighted,
2325   author = {Andreas Frommer and Hartmut Schwandt and Daniel and Daniel B. Szyld},
2326   title = {Asynchronous Weighted Additive Schwarz Methods},
2327   journal = {Electronic Transactions on Numerical Analysis},
2328   year = {1997},
2329   volume = {5},
2330   pages = {48--61}
2331 }
2332
2333 @MISC{Frommer94asynchronoustwo-stage,
2334   author = {Andreas Frommer and Daniel B. Szyld},
2335   title = {Asynchronous Two-Stage Iterative Methods},
2336   year = {1994}
2337 }
2338
2339 @BOOK{J1992,
2340   title = {Introduction to Chaos and Coherence},
2341   publisher = {IOP Publishing},
2342   year = {1992},
2343   author = {J. Frøyland},
2344   owner = {guyeux},
2345   timestamp = {2008.01.02}
2346 }
2347
2348 @MISC{Furon2002,
2349   author = {T. Furon},
2350   title = {Security analysis},
2351   year = {2002},
2352   note = {European Project IST-1999-10987 CERTIMARK, Deliverable D.5.5},
2353   owner = {guyeux},
2354   timestamp = {2009.06.30}
2355 }
2356
2357 @ARTICLE{Furon08,
2358   author = {Furon, Teddy and Bas, Patrick},
2359   title = {Broken arrows},
2360   journal = {EURASIP J. Inf. Secur.},
2361   year = {2008},
2362   volume = {2008},
2363   pages = {1--13},
2364   address = {New York, NY, United States},
2365   doi = {http://dx.doi.org/10.1155/2008/597040},
2366   issn = {1687-4161},
2367   owner = {christophe},
2368   publisher = {Hindawi Publishing Corp.},
2369   timestamp = {2010.03.06}
2370 }
2371
2372 @ARTICLE{P1150442004,
2373   author = {G.S.El-Taweel and H.M. Onsi and M.Samy and M.G. Darwish},
2374   title = {Secure and Non-Blind Watermarking Scheme for Color Images Based on
2375         DWT},
2376   journal = {ICGST International Journal on Graphics, Vision and Image Processing},
2377   year = {2005},
2378   volume = {05},
2379   pages = {1--5},
2380   month = {April},
2381   issue = {4},
2382   owner = {christophe},
2383   timestamp = {2010.03.07}
2384 }
2385
2386 @INPROCEEDINGS{Gentry09,
2387   author = {Gentry, Craig},
2388   title = {Fully homomorphic encryption using ideal lattices},
2389   booktitle = {STOC '09: Proceedings of the 41st annual ACM symposium on Theory
2390         of computing},
2391   year = {2009},
2392   pages = {169--178},
2393   address = {New York, NY, USA},
2394   publisher = {ACM},
2395   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1536414.1536440},
2396   isbn = {978-1-60558-506-2},
2397   location = {Bethesda, MD, USA}
2398 }
2399
2400 @INPROCEEDINGS{Girao04,
2401   author = {J. Girao and M. Schneider and D. Westhoff},
2402   title = {CDA: Concealed data aggregation in wireless sensor networks},
2403   booktitle = {Proceedings of the ACM Workshop on Wireless Security},
2404   year = {2004},
2405   owner = {christophe},
2406   timestamp = {2010.07.31}
2407 }
2408
2409 @CONFERENCE{Gotsman88,
2410   author = {C. Gotsman and D. Lehmann and E. Shamir},
2411   title = {Asynchronous Dynamics of Random Boolean Networks},
2412   booktitle = {San Diego '88 Neural Networks Conference},
2413   year = {1988},
2414   owner = {guyeux},
2415   timestamp = {30/03/2008}
2416 }
2417
2418 @ARTICLE{Guckenheimer1979,
2419   author = {J. Guckenheimer},
2420   title = {Sensitive dependence to initial conditions for one-dimensional maps},
2421   journal = {Comm. Math. Phys.},
2422   year = {1979},
2423   optpages = {133-160},
2424   owner = {guyeux},
2425   timestamp = {2008.01.02}
2426 }
2427
2428 @BOOK{J.1983,
2429   title = {Nonlinear oscillations, dynamical systems, and bifurcations of vector
2430         fields},
2431   publisher = {Springer Verlag},
2432   year = {1983},
2433   author = {J. Guckenheimer and P. Holmes},
2434   owner = {guyeux},
2435   timestamp = {2008.01.02}
2436 }
2437
2438 @ARTICLE{Guo20093201,
2439   author = {Wei Guo and Xiaoming Wang and Dake He and Yang Cao},
2440   title = {Cryptanalysis on a parallel keyed hash function based on chaotic
2441         maps},
2442   journal = {Physics Letters A},
2443   year = {2009},
2444   volume = {373},
2445   pages = {3201 - 3206},
2446   number = {36},
2447   abstract = {This Letter analyzes the security of a novel parallel keyed hash function
2448         based on chaotic maps, proposed by Xiao et al. to improve the efficiency
2449         in parallel computing environment. We show how to devise forgery
2450         attacks on Xiao's scheme with differential cryptanalysis and give
2451         the experiment results of two kinds of forgery attacks firstly. Furthermore,
2452         we discuss the problem of weak keys in the scheme and demonstrate
2453         how to utilize weak keys to construct collision.},
2454   issn = {0375-9601},
2455   keywords = {Cryptanalysis}
2456 }
2457
2458 @PHDTHESIS{GuyeuxThese10,
2459   author = {Christophe Guyeux},
2460   title = {Le d\'{e}sordre des it\'{e}rations chaotiques et leur utilit\'{e}
2461         en s\'{e}curit\'{e} informatique},
2462   school = {Universit\'{e} de Franche-Comt\'{e}},
2463   year = {2010},
2464   owner = {christophe},
2465   timestamp = {2010.12.21}
2466 }
2467
2468 @MISC{gb11:onp,
2469   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2470   title = {\'Etude topologique de l'\'etalement de spectre},
2471   howpublished = {Journ\'ees Codes et St\'eganographie, \'Ecoles Militaires de Saint-Cyr,
2472         Co\"etquidan},
2473   month = jan,
2474   year = {2011},
2475   classement = {COM},
2476   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2477   equipe = {and},
2478   inhal = {no}
2479 }
2480
2481 @INPROCEEDINGS{bg10:ip,
2482   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2483   title = {An improved watermarking algorithm for Internet applications},
2484   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
2485   year = {2010},
2486   pages = {119--124},
2487   address = {Valencia, Spain},
2488   month = sep,
2489   classement = {ACTI},
2490   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2491   equipe = {and},
2492   inhal = {no}
2493 }
2494
2495 @INPROCEEDINGS{gfb10:ip,
2496   author = {Guyeux, Christophe and Friot, Nicolas and Bahi, Jacques},
2497   title = {Chaotic iterations versus Spread-spectrum: chaos and stego security},
2498   booktitle = {IIH-MSP'10, 6-th Int. Conf. on Intelligent Information Hiding and
2499         Multimedia Signal Processing},
2500   year = {2010},
2501   pages = {208--211},
2502   address = {Darmstadt, Germany},
2503   month = oct,
2504   classement = {ACTI},
2505   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2506   equipe = {and},
2507   inhal = {no}
2508 }
2509
2510 @ARTICLE{friot10,
2511   author = {Christophe Guyeux and Nicolas Friot and Jacques M. Bahi},
2512   title = {A more secure information hiding scheme than spread-spectrum obtained
2513         by chaos-security},
2514   journal = {arXiv 0032565},
2515   year = {2010},
2516   owner = {guyeux},
2517   timestamp = {2010.04.30}
2518 }
2519
2520 @BOOK{ECC,
2521   title = {Guide to Elliptic Curve Cryptography},
2522   publisher = {Springer Professional Computing},
2523   year = {2004},
2524   editor = {Springer},
2525   author = {D. Hankerson and A. Menezes and S. Vanstone},
2526   owner = {christophe},
2527   timestamp = {2010.07.31}
2528 }
2529
2530 @ARTICLE{Hasegawa1985,
2531   author = {M. Hasegawa and H. Kishino and T. Yano},
2532   title = {Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial
2533         DNA.},
2534   journal = {J Mol Evol},
2535   year = {1985},
2536   volume = {22},
2537   pages = {160--174},
2538   number = {2},
2539   abstract = {A new statistical method for estimating divergence dates of species
2540         from DNA sequence data by a molecular clock approach is developed.
2541         This method takes into account effectively the information contained
2542         in a set of DNA sequence data. The molecular clock of mitochondrial
2543         DNA (mtDNA) was calibrated by setting the date of divergence between
2544         primates and ungulates at the Cretaceous-Tertiary boundary (65 million
2545         years ago), when the extinction of dinosaurs occurred. A generalized
2546         least-squares method was applied in fitting a model to mtDNA sequence
2547         data, and the clock gave dates of 92.3 +/- 11.7, 13.3 +/- 1.5, 10.9
2548         +/- 1.2, 3.7 +/- 0.6, and 2.7 +/- 0.6 million years ago (where the
2549         second of each pair of numbers is the standard deviation) for the
2550         separation of mouse, gibbon, orangutan, gorilla, and chimpanzee,
2551         respectively, from the line leading to humans. Although there is
2552         some uncertainty in the clock, this dating may pose a problem for
2553         the widely believed hypothesis that the pipedal creature Australopithecus
2554         afarensis, which lived some 3.7 million years ago at Laetoli in Tanzania
2555         and at Hadar in Ethiopia, was ancestral to man and evolved after
2556         the human-ape splitting. Another likelier possibility is that mtDNA
2557         was transferred through hybridization between a proto-human and a
2558         proto-chimpanzee after the former had developed bipedalism.},
2559   keywords = {Animals; Biological Evolution; DNA, Mitochondrial, genetics; Genes;
2560         Haplorhini, genetics; Humans; Mathematics; Models, Genetic; Nucleic
2561         Acid Hybridization; Primates, genetics; Proteins, genetics; Species
2562         Specificity},
2563   language = {eng},
2564   medline-pst = {ppublish},
2565   owner = {guyeux},
2566   pmid = {3934395},
2567   timestamp = {2011.05.05}
2568 }
2569
2570 @BOOK{R1994,
2571   title = {A First Course in Discrete Dynamical Systems},
2572   publisher = {Springer-Verlag},
2573   year = {1994},
2574   author = {R. Homlgren},
2575   optpages = {106},
2576   owner = {guyeux},
2577   timestamp = {2008.01.02}
2578 }
2579
2580 @INCOLLECTION{Hoque09,
2581   author = {Hoque, Md. and Chetty, Madhu and Sattar, Abdul},
2582   title = {Genetic Algorithm in Ab Initio Protein Structure Prediction Using
2583         Low Resolution Model: A Review},
2584   booktitle = {Biomedical Data and Applications},
2585   publisher = {Springer Berlin Heidelberg},
2586   year = {2009},
2587   editor = {Sidhu, Amandeep and Dillon, Tharam},
2588   volume = {224},
2589   series = {Studies in Computational Intelligence},
2590   pages = {317-342},
2591   affiliation = {IIIS, Griffith University, Nathan, QLD-4111 Australia}
2592 }
2593
2594 @CONFERENCE{Houmansadr09,
2595   author = {A. Houmansadr and N. Kiyavash and N. Borisov},
2596   title = {Rainbow: A robust and invisible non-blind watermark for network flows},
2597   booktitle = {NDSS’09: 16th Annual Network and Distributed System Security Symposium},
2598   year = {2009},
2599   owner = {christophe},
2600   timestamp = {2010.03.07}
2601 }
2602
2603 @ARTICLE{Huang,
2604   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J.},
2605   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2606   journal = {Wireless Networks},
2607   abstract = {Abstract\&nbsp;\&nbsp;This paper proposes a secure encrypted-data
2608         aggregation scheme for wireless sensor networks. Our design for data
2609         aggregation eliminates redundant sensor readings without using encryption
2610         and maintains data secrecy and privacy during transmission. Conventional
2611         aggregation functions operate when readings are received in plaintext.
2612         If readings are encrypted, aggregation requires decryption creating
2613         extra overhead and key management issues. In contrast to conventional
2614         schemes, our proposed scheme provides security and privacy, and duplicate
2615         instances of original readings will be aggregated into a single packet.
2616         Our scheme is resilient to known-plaintext attacks, chosen-plaintext
2617         attacks, ciphertext-only attacks and man-in-the-middle attacks. Our
2618         experiments show that our proposed aggregation method significantly
2619         reduces communication overhead and can be practically implemented
2620         in on-the-shelf sensor platforms.},
2621   citeulike-article-id = {4499496},
2622   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2623   citeulike-linkout-1 = {http://www.springerlink.com/content/g573138072642u63},
2624   doi = {10.1007/s11276-009-0177-y},
2625   posted-at = {2009-05-10 09:55:44},
2626   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y}
2627 }
2628
2629 @ARTICLE{Huang10,
2630   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J. D.},
2631   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2632   journal = {Wirel. Netw.},
2633   year = {2010},
2634   volume = {16},
2635   pages = {915--927},
2636   number = {4},
2637   address = {Hingham, MA, USA},
2638   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2639   issn = {1022-0038},
2640   publisher = {Kluwer Academic Publishers}
2641 }
2642
2643 @ARTICLE{W.2001,
2644   author = {W. Huang and X. Ye},
2645   title = {Homeomorphisms with the whole compacta being scrambled sets},
2646   journal = {Ergod. Th. Dynam. Systems},
2647   year = {2001},
2648   optnumber = {1},
2649   optpages = {77-91},
2650   optvolume = {21},
2651   owner = {guyeux},
2652   timestamp = {2008.01.02}
2653 }
2654
2655 @ARTICLE{Hurley1982,
2656   author = {M. Hurley},
2657   title = {Attractors, persistence and density of their bassin},
2658   journal = {Transactions of AMS},
2659   year = {1982},
2660   optpages = {247-271},
2661   optvolume = {269},
2662   owner = {guyeux},
2663   timestamp = {2008.01.02}
2664 }
2665
2666 @INPROCEEDINGS{Islam:2009:NMA:1695134.1695181,
2667   author = {Islam, Md. Kamrul and Chetty, Madhu},
2668   title = {Novel Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction},
2669   booktitle = {Proceedings of the 22nd Australasian Joint Conference on Advances
2670         in Artificial Intelligence},
2671   year = {2009},
2672   series = {AI '09},
2673   pages = {412--421},
2674   address = {Berlin, Heidelberg},
2675   publisher = {Springer-Verlag},
2676   acmid = {1695181},
2677   isbn = {978-3-642-10438-1},
2678   keywords = {Guided search space, Memetic Algorithm, Modified fitness function,
2679         Pair-wise-interchange, Schema preservation, Tabu Search},
2680   location = {Melbourne, Australia},
2681   numpages = {10}
2682 }
2683
2684 @PHDTHESIS{Jacquemard77,
2685   author = {C. Jacquemard},
2686   title = {Contribution à l'étude d'algorithmes à convergence monotone},
2687   school = {Université de Franche-Comté},
2688   year = {1977},
2689   owner = {christophe},
2690   timestamp = {2010.08.25}
2691 }
2692
2693 @BOOK{Jukes69,
2694   title = {{Evolution of Protein Molecules}},
2695   publisher = {Academy Press},
2696   year = {1969},
2697   editor = {Munro, H. N.},
2698   author = {Jukes, T. H. and Cantor, C. R.},
2699   booktitle = {Evolution of Protein Molecules},
2700   citeulike-article-id = {1673661},
2701   keywords = {compbio, fresco},
2702   posted-at = {2007-09-19 06:23:18},
2703   priority = {2}
2704 }
2705
2706 @INPROCEEDINGS{Kalker2001,
2707   author = {Kalker, T.},
2708   title = {Considerations on watermarking security},
2709   year = {2001},
2710   pages = {201--206},
2711   abstract = {In this paper we address the usually implicit assumption that digital
2712         watermarking has as its main target copyright and copy protection
2713         applications. From these target applications a great many conclusions
2714         are drawn about the required security of a watermarking system, and
2715         in fact, a considerably percentage of the watermarking literature
2716         has this very topic as its main focus of attention. In this paper
2717         we take a step back, and try to do a more careful analysis of the
2718         'watermarking-is-for-security-applications' paradigm. The intention
2719         of this paper is to discuss the meaning of the concept security in
2720         the context of watermarking, and try to show that one has to be careful
2721         in using analogies from the related field of cryptography},
2722   citeulike-article-id = {1226513},
2723   journal = {2001 IEEE Fourth Workshop on Multimedia Signal Processing},
2724   keywords = {security, wateramarking},
2725   owner = {guyeux},
2726   posted-at = {2007-04-14 14:30:06},
2727   priority = {2},
2728   timestamp = {2009.06.30}
2729 }
2730
2731 @ARTICLE{Kerckhoffs83,
2732   author = {Kerckhoffs, Auguste},
2733   title = {La cryptographie militaire},
2734   journal = {Journal des sciences militaires},
2735   year = {1883},
2736   volume = {IX},
2737   pages = {5--83},
2738   month = {January},
2739   abstract = {pp. 161–191, Feb. 1883.},
2740   citeulike-article-id = {505508},
2741   keywords = {cryptography, master},
2742   owner = {guyeux},
2743   posted-at = {2006-02-15 04:49:15},
2744   priority = {2},
2745   timestamp = {2009.06.30}
2746 }
2747
2748 @ARTICLE{Kimura80,
2749   author = {Kimura, Motoo},
2750   title = {A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions
2751         through comparative studies of nucleotide sequences},
2752   journal = {Journal of Molecular Evolution},
2753   year = {1980},
2754   volume = {16},
2755   pages = {111-120},
2756   note = {10.1007/BF01731581},
2757   affiliation = {National Institute of Genetics 411 Mishima Japan},
2758   issn = {0022-2844},
2759   issue = {2},
2760   keyword = {Biomedical and Life Sciences},
2761   publisher = {Springer New York},
2762   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01731581}
2763 }
2764
2765 @ARTICLE{Knudsen94,
2766   author = {Knudsen},
2767   title = {Chaos Without Nonperiodicity},
2768   journal = {Amer. Math. Monthly},
2769   year = {1994},
2770   volume = {101},
2771   owner = {guyeux},
2772   timestamp = {27/01/2008}
2773 }
2774
2775 @PHDTHESIS{Knudsen1994a,
2776   author = {C. Knudsen},
2777   title = {Aspects of noninvertible dynamics and chaos},
2778   school = {Technical University of Denmark},
2779   year = {1994},
2780   owner = {guyeux},
2781   timestamp = {2008.01.02}
2782 }
2783
2784 @ARTICLE{Kocarev06,
2785   author = {L. Kocarev and J. Szczepanski and J.M. Amigo and I. Tomovski},
2786   title = {Discrete Chaos - I: Theory},
2787   journal = {IEEE Trans. on Circuits Systems},
2788   year = {2006},
2789   volume = {53},
2790   pages = {1300-1309},
2791   owner = {christophe},
2792   timestamp = {2010.10.10}
2793 }
2794
2795 @INPROCEEDINGS{Kocher95cryptanalysisof,
2796   author = {Paul C. Kocher},
2797   title = {Cryptanalysis of Diffie-Hellman, RSA, DSS, and Other Systems Using
2798         Timing Attacks (Extended Abstract)},
2799   booktitle = {Advances in Cryptology, CRYPTO '95: 15th Annual International Cryptology
2800         Conference},
2801   year = {1995},
2802   pages = {27--31},
2803   publisher = {Springer-Verlag}
2804 }
2805
2806 @ARTICLE{Kullback1951,
2807   author = {Kullback, Solomon and Leibler, Richard A.},
2808   title = {On Information and Sufficiency},
2809   journal = {The Annals of Mathematical Statistics},
2810   year = {1951},
2811   volume = {22},
2812   pages = {79--86},
2813   number = {1},
2814   citeulike-article-id = {3245942},
2815   keywords = {file-import-08-09-12},
2816   owner = {guyeux},
2817   posted-at = {2008-09-12 14:30:37},
2818   priority = {2},
2819   timestamp = {2009.06.29}
2820 }
2821
2822 @MISC{ledoux,
2823   author = {Eshter Ledoux},
2824   title = {Introduction à la théorie du chaos},
2825   year = {2002},
2826   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2827   url = {\url{http://www.nux.be/eledoux/mem/node1.html}}
2828 }
2829
2830 @BOOK{Lehning1997,
2831   title = {Analyse en dimension finie},
2832   publisher = {Masson},
2833   year = {1997},
2834   author = {Lehning},
2835   optpages = {28},
2836   optvolume = {4},
2837   owner = {guyeux},
2838   timestamp = {2008.01.02}
2839 }
2840
2841 @ARTICLE{Lenstra01,
2842   author = {A.K. Lenstra and E.R. Verheul},
2843   title = {Selecting Cryptographic Key Sizes},
2844   journal = {Jour. of the International Association for Cryptologic Research},
2845   year = {2001},
2846   volume = {14},
2847   pages = {255-293},
2848   number = {4}
2849 }
2850
2851 @ARTICLE{Pitts59,
2852   author = {Lettvin, J.Y. and Maturana, H.R. and McCulloch, W.S. and Pitts, W.H.},
2853   title = {What the Frog's Eye Tells the Frog's Brain},
2854   journal = {Proceedings of the IRE},
2855   year = {1959},
2856   volume = {47},
2857   pages = {1940--51},
2858   number = {11},
2859   owner = {christophe},
2860   timestamp = {2010.12.21}
2861 }
2862
2863 @ARTICLE{Li75,
2864   author = {T. Y. Li and J. A. Yorke},
2865   title = {Period three implies chaos},
2866   journal = {Amer. Math. Monthly},
2867   year = {1975},
2868   volume = {82},
2869   pages = {985--992},
2870   number = {10},
2871   owner = {guyeux},
2872   timestamp = {27/01/2008}
2873 }
2874
2875 @ARTICLE{Xiao10,
2876   author = {Li, Yantao and Deng, Shaojiang and Xiao, Di},
2877   title = {A novel Hash algorithm construction based on chaotic neural network},
2878   journal = {Neural Computing and Applications},
2879   year = {2010},
2880   pages = {1-9},
2881   affiliation = {Chongqing University College of Computer Science 400044 Chongqing
2882         China},
2883   issn = {0941-0643},
2884   keyword = {Computer Science},
2885   publisher = {Springer London}
2886 }
2887
2888 @INPROCEEDINGS{Lin09,
2889   author = {Lin, Hua-Yi and Chiang, Tzu-Chiang},
2890   title = {Cooperative secure data aggregation in sensor networks using elliptic
2891         curve based cryptosystems},
2892   booktitle = {CDVE'09: Proceedings of the 6th international conference on Cooperative
2893         design, visualization, and engineering},
2894   year = {2009},
2895   pages = {384--387},
2896   address = {Berlin, Heidelberg},
2897   publisher = {Springer-Verlag},
2898   isbn = {3-642-04264-3, 978-3-642-04264-5},
2899   location = {Luxembourg, Luxembourg}
2900 }
2901
2902 @INPROCEEDINGS{Liu2008,
2903   author = {Liu, An and Ning, Peng},
2904   title = {TinyECC: A Configurable Library for Elliptic Curve Cryptography in
2905         Wireless Sensor Networks},
2906   booktitle = {7th International Conference on Information Processing in Sensor
2907         Networks (IPSN 2008)},
2908   year = {2008},
2909   pages = {245--256},
2910   month = {April},
2911   citeulike-article-id = {3041699},
2912   howpublished = {SPOTS Track},
2913   keywords = {hagg},
2914   posted-at = {2008-07-25 05:25:05},
2915   priority = {2}
2916 }
2917
2918 @ARTICLE{Liu2007bis,
2919   author = {Shao-Hui Liu and Hong-Xun Yao and Wen Gao and Yong-Liang Liu},
2920   title = {An image fragile watermark scheme based on chaotic image pattern
2921         and pixel-pairs},
2922   journal = {Applied Mathematics and Computation},
2923   year = {2007},
2924   volume = {185},
2925   pages = {869-882},
2926   owner = {guyeux},
2927   timestamp = {2008.10.07}
2928 }
2929
2930 @INPROCEEDINGS{Liu07,
2931   author = {Liu, Zhen and Xi, Lifeng},
2932   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2933   booktitle = {KES '07: Knowledge-Based Intelligent Information and Engineering
2934         Systems and the XVII Italian Workshop on Neural Networks on Proceedings
2935         of the 11th International Conference},
2936   year = {2007},
2937   pages = {202--208},
2938   address = {Berlin, Heidelberg},
2939   publisher = {Springer-Verlag},
2940   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74827-4_26},
2941   isbn = {978-3-540-74826-7},
2942   location = {Vietri sul Mare, Italy}
2943 }
2944
2945 @ARTICLE{Liu2007,
2946   author = {Zhen Liu and Lifeng Xi},
2947   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2948   journal = {LNAI},
2949   year = {2007},
2950   volume = {4693},
2951   pages = {202-208},
2952   owner = {guyeux},
2953   timestamp = {11/04/2008}
2954 }
2955
2956 @ARTICLE{Lubachevsky86,
2957   author = {Lubachevsky, Boris and Mitra, Debasis},
2958   title = {A chaotic asynchronous algorithm for computing the fixed point of
2959         a nonnegative matrix of unit spectral radius},
2960   journal = {J. ACM},
2961   year = {1986},
2962   volume = {33},
2963   pages = {130--150},
2964   number = {1},
2965   address = {New York, NY, USA},
2966   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/4904.4801},
2967   issn = {0004-5411},
2968   publisher = {ACM}
2969 }
2970
2971 @ARTICLE{Larger10,
2972   author = {{L}arger, {L}. and {D}udley, {J}.{M}.},
2973   title = { {N}onlinear dynamics {O}ptoelectronic chaos},
2974   journal = {{N}ature },
2975   year = {2010},
2976   volume = {465 },
2977   pages = {41-42 },
2978   number = {7294 },
2979   month = {05},
2980   abstract = {{O}ptoelectronic circuits with delayed feedback provide a convenient
2981         bench-top platform to study a wide range of nonlinear dynamic systems,
2982         from ultrastable clocks to complex chaotic devices.},
2983   affiliation = {{F}ranche-{C}omt{\'e} {\'E}lectronique {M}{\'e}canique, {T}hermique
2984         et {O}ptique - {S}ciences et {T}echnologies - {FEMTO}-{ST} - {CNRS}
2985         : {UMR}6174 - {U}niversit{\'e} de {F}ranche-{C}omt{\'e} - {U}niversit{\'e}
2986         de {T}echnologie de {B}elfort-{M}ontbeliard - {E}cole {N}ationale
2987         {S}up{\'e}rieure de {M}{\'e}canique et des {M}icrotechniques },
2988   audience = {internationale },
2989   day = {05},
2990   doi = {10.1038/465041a },
2991   hal_id = {hal-00517696},
2992   language = {{A}nglais},
2993   url = {http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00517696/en/}
2994 }
2995
2996 @INPROCEEDINGS{Mahoney00,
2997   author = {Mahoney, Matthew V.},
2998   title = {Fast Text Compression with Neural Networks},
2999   booktitle = {Proceedings of the Thirteenth International Florida Artificial Intelligence
3000         Research Society Conference},
3001   year = {2000},
3002   pages = {230--234},
3003   publisher = {AAAI Press},
3004   acmid = {707654},
3005   isbn = {1-57735-113-4},
3006   numpages = {5}
3007 }
3008
3009 @INPROCEEDINGS{msp10:bl,
3010   author = {Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid and Pham, Congduc},
3011   title = {Risk Management in Intrusion Detection Applications with Wireless
3012         Video Sensor Networks},
3013   booktitle = {WCNC'10 IEEE Int. Conf.},
3014   year = {2010},
3015   pages = {***--***},
3016   address = {Sydney, Australia},
3017   month = apr,
3018   note = {To appear},
3019   classement = {*},
3020   equipe = {and},
3021   inhal = {no}
3022 }
3023
3024 @ARTICLE{Malvar03,
3025   author = {H.S. Malvar and D. Florêncio},
3026   title = {Improved Spread Spectrum: A New Modulation Technique for Robust Watermarking},
3027   journal = {IEEE Trans. Signal Proceeding},
3028   year = {2003},
3029   volume = {53},
3030   pages = {898--905},
3031   owner = {christophe},
3032   timestamp = {2010.03.07}
3033 }
3034
3035 @ARTICLE{Marsaglia2003,
3036   author = {G. Marsaglia},
3037   title = {Xorshift RNGs},
3038   journal = {Journal of Statistical Software},
3039   year = {2003},
3040   volume = {8(14)},
3041   pages = {1--6},
3042   owner = {qianxue},
3043   timestamp = {2009.10.28}
3044 }
3045
3046 @ARTICLE{Marsaglia1996,
3047   author = {G. Marsaglia},
3048   title = {DIEHARD: a battery of tests of randomness.},
3049   journal = {http://stat.fsu.edu/~geo/diehard.html},
3050   year = {1996},
3051   owner = {qianxue},
3052   timestamp = {2009.11.09}
3053 }
3054
3055 @ARTICLE{Simard07testu01:a,
3056     author = {Richard Simard and Université De Montréal},
3057     title = {TestU01: A C library for empirical testing of random number generators},
3058     journal = {ACM Transactions on Mathematical Software},
3059     year = {2007},
3060     pages = {2007}
3061 }
3062
3063 @ARTICLE{DefiningChaos,
3064   author = {M. Martelli and M. Dang and T. Seph},
3065   title = {Defining chaos},
3066   journal = {Mathematics Magazine},
3067   year = {1998},
3068   volume = {71},
3069   pages = {112--122},
3070   owner = {christophe},
3071   timestamp = {2010.08.11}
3072 }
3073
3074 @ARTICLE{Michel2007c,
3075   author = {Christian J Michel},
3076   title = {An analytical model of gene evolution with 9 mutation parameters:
3077         an application to the amino acids coded by the common circular code.},
3078   journal = {Bull Math Biol},
3079   year = {2007},
3080   volume = {69},
3081   pages = {677--698},
3082   number = {2},
3083   month = {Feb},
3084   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
3085         mutation matrix 64 x 64 with nine substitution parameters associated
3086         with the three types of substitutions in the three trinucleotide
3087         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
3088         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
3089         x 64 with three and six parameters. It determines at some time t
3090         the exact occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly
3091         according to these nine substitution parameters. An application of
3092         this model allows an evolutionary study of the common circular code
3093         [Formula: see text] of eukaryotes and prokaryotes and its 12 coded
3094         amino acids. The main property of this code [Formula: see text] is
3095         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
3096         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
3097         with a window of a few nucleotides. However, since its identification
3098         in 1996, amino acid information coded by [Formula: see text] has
3099         never been studied. Very unexpectedly, this evolutionary model demonstrates
3100         that random substitutions in this code [Formula: see text] and with
3101         particular values for the nine substitutions parameters retrieve
3102         after a certain time of evolution a frequency distribution of these
3103         12 amino acids very close to the one coded by the actual genes.},
3104   doi = {10.1007/s11538-006-9147-z},
3105   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
3106         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
3107         67400 Illkirch, France. michel@dpt-info.u-strasbg.fr},
3108   keywords = {Amino Acids, genetics; Codon, genetics; Eukaryotic Cells; Evolution,
3109         Molecular; Models, Genetic; Prokaryotic Cells},
3110   language = {eng},
3111   medline-pst = {ppublish},
3112   owner = {guyeux},
3113   pmid = {16952018},
3114   timestamp = {2011.05.05},
3115   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-006-9147-z}
3116 }
3117
3118 @ARTICLE{Miellou75,
3119   author = {J.-C. Miellou},
3120   title = {Algorithmes de relaxation chaotique \`{a} retards},
3121   journal = {Rairo},
3122   year = {1975},
3123   volume = {R1},
3124   pages = {148-162},
3125   owner = {guyeux},
3126   timestamp = {2008.05.22}
3127 }
3128
3129 @ARTICLE{Miellou75b,
3130   author = {Miellou, J.-C.},
3131   title = {Itérations chaotiques à retards, étude de la convergence dans le
3132         cas d'espaces partiellement ordonnés},
3133   journal = {C.R.A.S. Paris},
3134   year = {1975},
3135   volume = {280},
3136   pages = {233--236},
3137   owner = {christophe},
3138   timestamp = {2010.08.17}
3139 }
3140
3141 @ARTICLE{Spiteri85,
3142   author = {Jean-Claude Miellou and Pierre Spitéri},
3143   title = {Un critère de convergence pour des méthodes générales de point fixe},
3144   journal = {Rairo -- Modélisation mathématique et analyse numérique},
3145   year = {1985},
3146   volume = {19},
3147   pages = {645--669},
3148   number = {4},
3149   owner = {christophe},
3150   timestamp = {2010.10.13}
3151 }
3152
3153 @ARTICLE{Mooney08,
3154   author = {Aidan Mooney and John G. Keating and Ioannis Pitas},
3155   title = {A comparative study of chaotic and white noise signals in digital
3156         watermarking},
3157   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
3158   year = {2008},
3159   volume = {35},
3160   pages = {913-921},
3161   owner = {christophe},
3162   timestamp = {2010.03.01}
3163 }
3164
3165 @ARTICLE{Nakashima2003,
3166   author = {Nakashima, Y. and Tachibana, R. and Babaguchi, N.},
3167   title = {Watermarked Movie Soundtrack Finds the Position of the Camcorder
3168         in a Theater},
3169   journal = {IEEE Transactions on Multimedia},
3170   year = {2009},
3171   note = {Accepted for future publication Multimedia}
3172 }
3173
3174 @INCOLLECTION{springerlink:10.1007/978-3-642-04431-1_16,
3175   author = {Nelson, Michael and Nahapetian, Ani and Koushanfar, Farinaz and Potkonjak,
3176         Miodrag},
3177   title = {SVD-Based Ghost Circuitry Detection},
3178   booktitle = {Information Hiding},
3179   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
3180   year = {2009},
3181   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Sadeghi, Ahmad-Reza},
3182   volume = {5806},
3183   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3184   pages = {221-234},
3185   note = {10.1007/978-3-642-04431-1_16},
3186   affiliation = {Computer Science Department, UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA},
3187   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04431-1_16}
3188 }
3189
3190 @INPROCEEDINGS{Perez-Hernandez09,
3191   author = {P\'{e}rez-Hern\'{a}ndez, Luis Germ\'{a}n and Rodr\'{\i}guez-V\'{a}zquez,
3192         Katya and Gardu\~{n}o-Ju\'{a}rez, Ram\'{o}n},
3193   title = {Parallel particle swarm optimization applied to the protein folding
3194         problem},
3195   booktitle = {Proceedings of the 11th Annual conference on Genetic and evolutionary
3196         computation},
3197   year = {2009},
3198   series = {GECCO '09},
3199   pages = {1791--1792},
3200   address = {New York, NY, USA},
3201   publisher = {ACM},
3202   acmid = {1570163},
3203   isbn = {978-1-60558-325-9},
3204   keywords = {bioinformatics, biology and chemistry, combinatorial optimization,
3205         parallelization, swarm intelligence},
3206   location = {Montreal, Qu\&\#233;bec, Canada},
3207   numpages = {2}
3208 }
3209
3210 @PHDTHESIS{Pellegrin1986,
3211   author = {D. Pellegrin},
3212   title = {Algorithmique discr\`{e}te et r\'{e}seaux d'automates},
3213   school = {Grenoble},
3214   year = {1986},
3215   owner = {guyeux},
3216   timestamp = {2008.05.22}
3217 }
3218
3219 @ARTICLE{Peng2005,
3220   author = {F. Peng and S.-S. Qiu and M. Long},
3221   title = {One way Hash function construction based on two-dimensional hyperchaotic
3222         mappings},
3223   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3224   year = {2005},
3225   volume = {54},
3226   pages = {98--104},
3227   owner = {guyeux},
3228   timestamp = {2009.01.16}
3229 }
3230
3231 @INPROCEEDINGS{Perez06,
3232   author = {Luis Perez-Freire and F. Pérez-gonzalez and Pedro Comesaña},
3233   title = {Secret Dither Estimation in Lattice-Quantization Data Hiding: A Set-Membership
3234         Approach},
3235   booktitle = {Security, Steganography, and Watermarking of Multimedia Contents},
3236   year = {2006},
3237   editor = {Edward J. Delp and Ping W. Wong},
3238   address = {San Jose, California, USA},
3239   month = {January},
3240   organization = {SPIE},
3241   owner = {guyeux},
3242   timestamp = {2009.06.30}
3243 }
3244
3245 @INPROCEEDINGS{Perez-Freire06,
3246   author = {Luis Perez-Freire and Pedro Comesana and Juan Ramon Troncoso-Pastoriza
3247         and Fernando Perez-Gonzalez},
3248   title = {Watermarking Security: a Survey},
3249   booktitle = {LNCS Transactions on Data Hiding and Multimedia Security},
3250   year = {2006},
3251   owner = {guyeux},
3252   timestamp = {2009.06.29}
3253 }
3254
3255 @PROCEEDINGS{Peter07,
3256   title = {On Concealed Data Aggregation for WSNs},
3257   year = {2007},
3258   author = {Peter, Steffen and Piotrowski, Krzysztof and Langendoerfer, Peter},
3259   booktitle = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3260         4th IEEE},
3261   citeulike-article-id = {2281643},
3262   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45},
3263   citeulike-linkout-1 = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs\_all.jsp?arnumber=4199133},
3264   doi = {10.1109/CCNC.2007.45},
3265   journal = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3266         4th IEEE},
3267   keywords = {hagg},
3268   pages = {192--196},
3269   posted-at = {2008-01-23 19:36:19},
3270   priority = {3},
3271   url = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45}
3272 }
3273
3274 @ARTICLE{pms11:ij,
3275   author = {Pham, Congduc and Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid},
3276   title = {Risk-based Adaptive Scheduling in Randomly Deployed Video Sensor
3277         Networks for Critical Surveillance Applications},
3278   journal = {Journal of Network and Computer Applications},
3279   year = {2011},
3280   volume = {*},
3281   pages = {***--***},
3282   number = {*},
3283   note = {Accepted manuscript. To appear},
3284   classement = {ACLI},
3285   equipe = {and},
3286   impact-factor = {1.111},
3287   inhal = {no},
3288   isi-acro = {J NETW COMPU APPL},
3289   publisher = {Springer}
3290 }
3291
3292 @MISC{Poe,
3293   author = {Edgar Alan Poe},
3294   title = {The Raven},
3295   month = {April},
3296   year = {1839},
3297   note = {American Museum (Baltimore)},
3298   owner = {christophe},
3299   timestamp = {2010.11.23}
3300 }
3301
3302 @ARTICLE{Perez-Freire2006:Security,
3303   author = {L. P{\'e}rez-Freire and F. P{\'e}rez-González and T. Furon and P.
3304         Comesaña},
3305   title = {Security of lattice-based data hiding against the known message attack},
3306   journal = {IEEE Trans. on Information Forensics and Security},
3307   year = {2006},
3308   volume = {1},
3309   pages = {421-439},
3310   number = {4},
3311   month = {dec},
3312   owner = {guyeux},
3313   timestamp = {2009.12.06}
3314 }
3315
3316 @MISC{Quisquater02sidechannel,
3317   author = {J-J. Quisquater and D. Samyde and Université Catholique De Louvain
3318         and Groupe Crypto},
3319   title = {Side Channel Cryptanalysis},
3320   year = {2002}
3321 }
3322
3323 @ARTICLE{Raynal2001,
3324   author = {Frédéric Raynal and Fabien A. P. Petitcolas and Caroline Fontaine},
3325   title = {Evaluation automatique des méthodes de tatouage},
3326   journal = {Traitement du signal},
3327   year = {2001},
3328   volume = {18},
3329   pages = {271-282},
3330   owner = {guyeux},
3331   timestamp = {2008.05.21}
3332 }
3333
3334 @MISC{rijmen05,
3335   author = {Vincent Rijmen and Elisabeth Oswald},
3336   title = {Update on SHA-1},
3337   howpublished = {Cryptology ePrint Archive, Report 2005/010},
3338   year = {2005},
3339   note = {\url{http://eprint.iacr.org/}}
3340 }
3341
3342 @BOOK{Robert,
3343   title = {Discrete Iterations, a Metric Study},
3344   publisher = {Springer-Verlag},
3345   year = {1986},
3346   editor = {Berlin Heidelberg New-York},
3347   author = {François Robert},
3348   volume = {6},
3349   series = {Series in Computational Mathematics}
3350 }
3351
3352 @BOOK{Robert1986,
3353   title = {Discrete Iterations: A Metric Study},
3354   year = {1986},
3355   editor = {Springer-Verlag},
3356   author = {F. Robert},
3357   volume = {6},
3358   series = {Springer Series in Computational Mathematics},
3359   owner = {guyeux},
3360   timestamp = {17/02/2008}
3361 }
3362
3363 @ARTICLE{Rudenko08,
3364   author = {Rudenko, O. and Snytkin, M.},
3365   title = {Image compression based on the neural network art},
3366   journal = {Cybernetics and Systems Analysis},
3367   year = {2008},
3368   volume = {44},
3369   pages = {797-802},
3370   affiliation = {Kharkov National University of Radio Electronics Kharkov Ukraine},
3371   issn = {1060-0396},
3372   issue = {6},
3373   keyword = {Computer Science},
3374   publisher = {Springer New York}
3375 }
3376
3377 @PHDTHESIS{Ruette2001,
3378   author = {Sylvie Ruette},
3379   title = {Chaos en dynamique topologique, en particulier sur l'intervalle,
3380         mesures d'entropie maximale},
3381   school = {Université d'Aix-Marseille II},
3382   year = {2001},
3383   optmonth = {Novembre},
3384   owner = {guyeux},
3385   timestamp = {2008.01.02}
3386 }
3387
3388 @MASTERSTHESIS{Saulnier02,
3389   author = {Boris Saulnier},
3390   title = {Entropie topologique},
3391   school = {DEA Sémantique, Preuves et Langages, Paris 7},
3392   year = {2002},
3393   owner = {christophe},
3394   timestamp = {2010.08.12}
3395 }
3396
3397 @ARTICLE{Schmitz2001,
3398   author = {Roland Schmitz},
3399   title = {Use of chaotic dynamical systems in cryptography},
3400   journal = {Journal of Franklin Institute},
3401   year = {2001},
3402   volume = {338},
3403   pages = {429-441},
3404   owner = {guyeux},
3405   timestamp = {17/02/2008}
3406 }
3407
3408 @BOOK{Schwartz80,
3409   title = {Analyse: topologie g\'{e}n\'{e}rale et analyse fonctionnelle},
3410   publisher = {Hermann},
3411   year = {1980},
3412   editor = {Hermann},
3413   author = {Laurent Schwartz},
3414   owner = {christophe},
3415   timestamp = {2010.09.15}
3416 }
3417
3418 @ARTICLE{Shannon49,
3419   author = {Shannon, Claude E.},
3420   title = {Communication Theory of Secrecy Systems},
3421   journal = {Bell Systems Technical Journal},
3422   year = {1949},
3423   volume = {28},
3424   pages = {656--715},
3425   citeulike-article-id = {507362},
3426   keywords = {master, secrecy\_systems, teoria-informacao, theory\_communication,
3427         theory\_cryptography},
3428   owner = {guyeux},
3429   posted-at = {2006-02-16 23:24:09},
3430   priority = {2},
3431   timestamp = {2009.06.29}
3432 }
3433
3434 @ARTICLE{Shmygelska05,
3435   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger},
3436   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3437         polar protein folding problem},
3438   journal = {BMC Bioinformatics},
3439   year = {2005},
3440   volume = {6},
3441   pages = {30},
3442   number = {1},
3443   abstract = {BACKGROUND:The protein folding problem is a fundamental problems in
3444         computational molecular biology and biochemical physics. Various
3445         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3446         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3447         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3448         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3449         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3450         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3451         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3452         simple model - the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3453         (HP) model.RESULTS:We present an improvement of our previous ACO
3454         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3455         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3456         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3457         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3458         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3459         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3460         a more diverse set of native conformations.CONCLUSIONS:The application
3461         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3462         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3463         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3464         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3465         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3466         for more complex and realistic models of protein structure holds
3467         significant promise.},
3468   doi = {10.1186/1471-2105-6-30},
3469   issn = {1471-2105},
3470   pubmedid = {15710037}
3471 }
3472
3473 @OTHER{Shmygelska2005Feb,
3474   __markedentry = {[christophe]},
3475   abstract = {Abstract Background The protein folding problem is a fundamental problems
3476         in computational molecular biology and biochemical physics. Various
3477         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3478         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3479         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3480         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3481         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3482         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3483         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3484         simple model – the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3485         (HP) model. Results We present an improvement of our previous ACO
3486         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3487         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3488         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3489         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3490         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3491         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3492         a more diverse set of native conformations. Conclusions The application
3493         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3494         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3495         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3496         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3497         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3498         for more complex and realistic models of protein structure holds
3499         significant promise.},
3500   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger H},
3501   journal = {BMC Bioinformatics. 2005 Feb 14},
3502   number = {1},
3503   owner = {christophe},
3504   pages = {30},
3505   timestamp = {2011.01.24},
3506   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3507         polar protein folding problem},
3508   volume = {6},
3509   year = {2005 Feb}
3510 }
3511
3512 @ARTICLE{Shujun1,
3513   author = {Li Shujun and Li Qi and Li Wenmin and Mou Xuanqin and Cai Yuanlong},
3514   title = {Statistical Properties of Digital Piecewise Linear Chaotic Maps and
3515         Their Roles in Cryptography and Pseudo-Random Coding},
3516   journal = {Proceedings of the 8th IMA International Conference on Cryptography
3517         and Coding},
3518   year = {2001},
3519   volume = {1},
3520   pages = {205--221},
3521   owner = {christophe},
3522   timestamp = {2010.03.06}
3523 }
3524
3525 @INPROCEEDINGS{Simmons83,
3526   author = {Gustavus J. Simmons},
3527   title = {The Prisoners' Problem and the Subliminal Channel},
3528   booktitle = {Advances in Cryptology, Proc. CRYPTO'83},
3529   year = {1984},
3530   pages = {51--67},
3531   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3532   owner = {guyeux},
3533   timestamp = {2009.06.29}
3534 }
3535
3536 @ARTICLE{Solak2004389,
3537   author = {Ercan Solak},
3538   title = {On the security of a class of discrete-time chaotic cryptosystems},
3539   journal = {Physics Letters A},
3540   year = {2004},
3541   volume = {320},
3542   pages = {389 - 395},
3543   number = {5-6},
3544   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2003.11.008},
3545   issn = {0375-9601},
3546   keywords = {Communication using chaos},
3547   owner = {guyeux},
3548   timestamp = {2009.12.12},
3549   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4B22RC9-2/2/99a0af737c9b6ba8af47ae4d3c7a326d}
3550 }
3551
3552 @PHDTHESIS{Spiteri74,
3553   author = {Pierre Spitéri},
3554   title = {Contribution à l'étude de la stabilite au sens de liapounov de certains
3555         systemes differentiels non lineaires},
3556   school = {Université de Franche-Comté},
3557   year = {1974},
3558   owner = {christophe},
3559   timestamp = {2010.10.13}
3560 }
3561
3562 @BOOK{Stewart1989,
3563   title = {Does God Play Dices ?: the mathematics of chaos},
3564   publisher = {Penguin},
3565   year = {1989},
3566   author = {Ian Stewart},
3567   owner = {guyeux},
3568   timestamp = {2008.01.02}
3569 }
3570
3571 @BOOK{Stinson02,
3572   title = {Cryptography: Theory and Practice, Second Edition},
3573   publisher = {{Chapman \& Hall/CRC}},
3574   year = {2002},
3575   author = {Stinson, Douglas R.},
3576   month = {February},
3577   abstract = {{Douglas R. Stinson's <I>Cryptography: Theory and Practice</I> is
3578         a mathematically intensive examination of cryptography, including
3579         ciphers, the Data Encryption Standard (DES), public key cryptography,
3580         one-way hash functions, and digital signatures. Stinson's explication
3581         of "zero-sum proofs"--a process by which one person lets another
3582         person know that he or she has a password without actually revealing
3583         any information--is especially good.<P> If you are new to the math
3584         behind cryptography but want to tackle it, the author covers all
3585         of the required background to understand the real mathematics here.
3586         <I>Cryptography</I> includes extensive exercises with each chapter
3587         and makes an ideal introduction for any math-literate person willing
3588         to get acquainted with this material.} {<P>Major advances over the
3589         last five years precipitated this major revision of the bestselling
3590         Cryptography: Theory and Practice. With more than 40 percent new
3591         or updated material, the second edition now provides an even more
3592         comprehensive treatment of modern cryptography. It focuses on the
3593         new Advanced Encryption Standards and features an entirely new chapter
3594         on that subject. Another new chapter explores the applications of
3595         secret sharing schemes, including ramp schemes, visual cryptography,
3596         threshold cryptography, and broadcast encryption. This is an ideal
3597         introductory text for both computer science and mathematics students
3598         and a valuable reference for professionals.</P>}},
3599   citeulike-article-id = {2401855},
3600   day = {27},
3601   howpublished = {Hardcover},
3602   isbn = {1584882069},
3603   keywords = {security},
3604   posted-at = {2008-02-20 08:28:49},
3605   priority = {0},
3606   url = {http://www.amazon.com/exec/obidos/redirect?tag=citeulike07-20\&path=ASIN/1584882069}
3607 }
3608
3609 @INPROCEEDINGS{Takana90,
3610   author = {K. Tanaka and Y. Nakamura and K. Matsui},
3611   title = {Embedding Secret Information into a Dithered Multi-level Image},
3612   booktitle = {IEEE Military Communications Conference},
3613   year = {1990},
3614   owner = {christophe},
3615   timestamp = {2010.08.05}
3616 }
3617
3618 @PHDTHESIS{ElTarazi81,
3619   author = {M. N. El Tarazi},
3620   title = {Contraction et ordre partiel pour l'étude d'algorithmes synchrones
3621         et asynchrones en analyse numérique},
3622   school = {Faculté des Sciences et Techniques de l'Université de Franche-Comté,
3623         Besançon},
3624   year = {1981},
3625   owner = {christophe},
3626   timestamp = {2010.08.17}
3627 }
3628
3629 @INPROCEEDINGS{Unger93,
3630   author = {Unger, Ron and Moult, John},
3631   title = {Genetic Algorithm for 3D Protein Folding Simulations},
3632   booktitle = {Proceedings of the 5th International Conference on Genetic Algorithms},
3633   year = {1993},
3634   pages = {581--588},
3635   address = {San Francisco, CA, USA},
3636   publisher = {Morgan Kaufmann Publishers Inc.},
3637   acmid = {657747},
3638   isbn = {1-55860-299-2},
3639   numpages = {8}
3640 }
3641
3642 @MISC{Van93electronicwater,
3643   author = {Tirkel Rankin Van},
3644   title = {Electronic Water Mark},
3645   year = {1993}
3646 }
3647
3648 @ARTICLE{Venkatesan2007397,
3649   author = {R.C. Venkatesan},
3650   title = {Encryption of covert information into multiple statistical distributions},
3651   journal = {Physics Letters A},
3652   year = {2007},
3653   volume = {370},
3654   pages = {397 - 404},
3655   number = {5-6},
3656   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.05.117},
3657   issn = {0375-9601},
3658   keywords = {Statistical encryption/decryption},
3659   owner = {guyeux},
3660   timestamp = {2009.12.12},
3661   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4P4FV2M-1/2/cd11a2ec144526e3c4552d2a7e7906cc}
3662 }
3663
3664 @ARTICLE{pitas,
3665   author = {G. Voyatzis and I. Pitas},
3666   title = {Chaotic watermarks for embedding in the spatial digital image domain},
3667   journal = {Proceedings of IEEE ICIP},
3668   year = {1998},
3669   volume = {2},
3670   pages = {432-436},
3671   owner = {christophe},
3672   timestamp = {2010.03.06}
3673 }
3674
3675 @INCOLLECTION{Wagner03,
3676   author = {Wagner, David},
3677   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3678   booktitle = {Information Security},
3679   publisher = {Springer Berlin, Heidelberg},
3680   year = {2003},
3681   volume = {2851},
3682   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3683   pages = {234-239},
3684   abstract = {We use linear algebra to show that an algebraic privacy homomorphism
3685         proposed by Domingo-Ferrer is insecure for some parameter settings.},
3686   affiliation = {University of California, Berkeley USA}
3687 }
3688
3689 @INPROCEEDINGS{Wagner03cryptanalysisof,
3690   author = {David Wagner},
3691   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3692   booktitle = {Proc. Sixth Information Security Conf. (ISC03},
3693   year = {2003},
3694   pages = {234--239}
3695 }
3696
3697 @ARTICLE{Wang_ellipticcurve,
3698   author = {Haodong Wang and Bo Sheng and Qun Li},
3699   title = {Elliptic curve cryptography-based access control in sensor networks},
3700   journal = {Int. J. Security and Networks}
3701 }
3702
3703 @INPROCEEDINGS{wbg10:ip,
3704   author = {Wang, Qianxue and Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Fang,
3705         Xiaole},
3706   title = {Randomness quality of {CI} chaotic generators. Application to Internet
3707         security},
3708   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
3709   year = {2010},
3710   pages = {125--130},
3711   address = {Valencia, Spain},
3712   month = sep,
3713   publisher = {IEEE Computer Society Press},
3714   note = {Best Paper award},
3715   classement = {ACTI},
3716   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
3717   equipe = {and},
3718   inhal = {no}
3719 }
3720
3721 @ARTICLE{Wang2003,
3722   author = {X. M. Wang and J. S. Zhang and W. F. Zhang},
3723   title = {One-way hash function construction based on the extended chaotic
3724         maps switch},
3725   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3726   year = {2003},
3727   volume = {52, No. 11},
3728   pages = {2737--2742},
3729   owner = {guyeux},
3730   timestamp = {2009.01.16}
3731 }
3732
3733 @ARTICLE{Girao06,
3734   author = {Westhoff, Dirk and Girao, Joao and Acharya, Mithun},
3735   title = {Concealed Data Aggregation for Reverse Multicast Traffic in Sensor
3736         Networks: Encryption, Key Distribution, and Routing Adaptation},
3737   journal = {IEEE Transactions on Mobile Computing},
3738   year = {2006},
3739   volume = {5},
3740   pages = {1417--1431},
3741   number = {10},
3742   address = {Piscataway, NJ, USA},
3743   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/TMC.2006.144},
3744   issn = {1536-1233},
3745   publisher = {IEEE Educational Activities Department}
3746 }
3747
3748 @MISC{web:lyapunov,
3749   author = {Wikipédia},
3750   title = {Exposant de Lyapunov -- Site web d'André Lévesque},
3751   year = {2010},
3752   note = {[En ligne; Page disponible le 9-septembre-2010]},
3753   url = {\url{http://math.cmaisonneuve.qc.ca/alevesque/chaos_fract/Lyapunov/Exposant.html}}
3754 }
3755
3756 @MISC{wiki:complet,
3757   author = {Wikipédia},
3758   title = {Espace complet --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3759   year = {2010},
3760   note = {[En ligne; Page disponible le 9-août-2010]},
3761   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Espace_complet&oldid=52734266}}
3762 }
3763
3764 @MISC{wiki:densite,
3765   author = {Wikipédia},
3766   title = {Densité (mathématiques) --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3767   year = {2010},
3768   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3769   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Densit%C3%A9_(math%C3%A9matiques)&oldid=53938121}}
3770 }
3771
3772 @MISC{wiki:fisher,
3773   author = {Wikipédia},
3774   title = {Information de Fisher --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3775   year = {2010},
3776   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3777   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Information_de_Fisher&oldid=52877871}}
3778 }
3779
3780 @MISC{wiki:Kerkhoffs,
3781   author = {Wikipédia},
3782   title = {Principe de Kerckhoffs --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3783   year = {2010},
3784   note = {[En ligne; Page disponible le 20-août-2010]},
3785   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Principe_de_Kerckhoffs&oldid=52133114}}
3786 }
3787
3788 @MISC{wiki:sarkovskii,
3789   author = {Wikipédia},
3790   title = {Théorème de Sarkovskii --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3791   year = {2010},
3792   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3793   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Th%C3%A9or%C3%A8me_de_Sarkovskii&oldid=54196167}}
3794 }
3795
3796 @MISC{wiki:steganographie,
3797   author = {Wikipédia},
3798   title = {Stéganographie --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3799   year = {2010},
3800   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3801   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=St%C3%A9ganographie&oldid=54724435}}
3802 }
3803
3804 @MISC{wiki:tatouage,
3805   author = {Wikipédia},
3806   title = {Tatouage numérique --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3807   year = {2010},
3808   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3809   url = {https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Tatouage_num%C3%A9rique&oldid=55484940}
3810 }
3811
3812 @MISC{wiki:testsHypothese,
3813   author = {Wikipédia},
3814   title = {Test d'hypothèse --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3815   year = {2010},
3816   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3817   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Test_d%27hypoth%C3%A8se&oldid=55344108}}
3818 }
3819
3820 @ARTICLE{Wu2007bis,
3821   author = {Xianyong Wu and Zhi-Hong Guan},
3822   title = {A novel digital watermark algorithm based on chaotic maps},
3823   journal = {Physics Letters A},
3824   year = {2007},
3825   volume = {365},
3826   pages = {403 - 406},
3827   number = {5-6},
3828   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.01.034},
3829   issn = {0375-9601},
3830   keywords = {Watermarking},
3831   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4MY0MF3-8/2/0b4d1298fa84337d2e59b3fefe26f583}
3832 }
3833
3834 @INPROCEEDINGS{Wu2007,
3835   author = {Wu, Xianyong and Guan, Zhi-Hong and Wu, Zhengping},
3836   title = {A Chaos Based Robust Spatial Domain Watermarking Algorithm},
3837   booktitle = {ISNN '07: Proceedings of the 4th international symposium on Neural
3838         Networks},
3839   year = {2007},
3840   pages = {113--119},
3841   address = {Berlin, Heidelberg},
3842   publisher = {Springer-Verlag},
3843   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-72393-6_15},
3844   isbn = {978-3-540-72392-9},
3845   location = {Nanjing, China}
3846 }
3847
3848 @ARTICLE{Xiao20092288,
3849   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3850   title = {Parallel keyed hash function construction based on chaotic neural
3851         network},
3852   journal = {Neurocomputing},
3853   year = {2009},
3854   volume = {72},
3855   pages = {2288 - 2296},
3856   number = {10-12},
3857   note = {Lattice Computing and Natural Computing (JCIS 2007) / Neural Networks
3858         in Intelligent Systems Designn (ISDA 2007)},
3859   abstract = {Recently, various hash functions based on chaos or neural networks
3860         were proposed. Nevertheless, none of them works efficiently in parallel
3861         computing environment. In this paper, an algorithm for parallel keyed
3862         hash function construction based on chaotic neural network is proposed.
3863         The mechanism of changeable-parameter and self-synchronization establishes
3864         a close relation between the hash value bit and message, and the
3865         algorithm structure ensures the uniform sensitivity of the hash value
3866         to the message blocks at different positions. The proposed algorithm
3867         can satisfy the performance requirements of hash function. These
3868         properties make it a promising choice for hashing on parallel computing
3869         platform.},
3870   issn = {0925-2312},
3871   keywords = {Chaotic neural network}
3872 }
3873
3874 @ARTICLE{Xiao20094346,
3875   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3876   title = {Improving the security of a parallel keyed hash function based on
3877         chaotic maps},
3878   journal = {Physics Letters A},
3879   year = {2009},
3880   volume = {373},
3881   pages = {4346 - 4353},
3882   number = {47},
3883   issn = {0375-9601},
3884   keywords = {Hash function},
3885   owner = {guyeux},
3886   timestamp = {2009.12.12}
3887 }
3888
3889 @ARTICLE{Xiao20102254,
3890   author = {Di Xiao and Frank Y. Shih and Xiaofeng Liao},
3891   title = {A chaos-based hash function with both modification detection and
3892         localization capabilities},
3893   journal = {Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation},
3894   year = {2010},
3895   volume = {15},
3896   pages = {2254 - 2261},
3897   number = {9},
3898   abstract = {Recently, a variety of chaos-based hash functions have been proposed.
3899         Nevertheless, none of them can realize modification localization.
3900         In this paper, a hash function with both modification detection and
3901         localization capabilities is proposed, which can also support the
3902         parallel processing mode. By using the mechanism of changeable-parameter
3903         and self-synchronization, the keystream can establish a close relation
3904         with the algorithm key, the content, and the order of each message
3905         unit. Theoretical analysis and computer simulation indicate that
3906         the proposed algorithm can satisfy the performance requirements of
3907         hash functions.},
3908   issn = {1007-5704},
3909   keywords = {Hash function}
3910 }
3911
3912 @INPROCEEDINGS{Yu06,
3913   author = {Yu, Yu and Leiwo, Jussipekka and Premkumar, Benjamin},
3914   title = {A Study on the Security of Privacy Homomorphism},
3915   booktitle = {ITNG '06: Proceedings of the Third International Conference on Information
3916         Technology: New Generations},
3917   year = {2006},
3918   pages = {470--475},
3919   address = {Washington, DC, USA},
3920   publisher = {IEEE Computer Society},
3921   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/ITNG.2006.19},
3922   isbn = {0-7695-2497-4}
3923 }
3924
3925 @ARTICLE{Zhang2008658,
3926   author = {Wei Zhang and Yonghe Liu and Sajal K. Das and Pradip De},
3927   title = {Secure data aggregation in wireless sensor networks: A watermark
3928         based authentication supportive approach},
3929   journal = {Pervasive and Mobile Computing},
3930   year = {2008},
3931   volume = {4},
3932   pages = {658 - 680},
3933   number = {5},
3934   doi = {DOI: 10.1016/j.pmcj.2008.05.005},
3935   issn = {1574-1192},
3936   keywords = {Wireless sensor networks},
3937   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B7MF1-4SKB3MD-1/2/b73948dcaa3eb63a2c21d09041882625}
3938 }
3939
3940 @ARTICLE{Zhang2005,
3941   author = {Zhang, Yang and Arakaki, Adrian K. and Skolnick, Jeffrey},
3942   title = {TASSER: An automated method for the prediction of protein tertiary
3943         structures in CASP6},
3944   journal = {Proteins},
3945   year = {2005},
3946   volume = {61},
3947   pages = {91--98},
3948   number = {S7},
3949   issn = {1097-0134},
3950   keywords = {comparative modeling, threading, ab initio prediction, TASSER, PROSPECTOR_3},
3951   owner = {christophe},
3952   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
3953   timestamp = {2011.01.22},
3954   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20724}
3955 }
3956
3957 @ARTICLE{Zhou1997429,
3958   author = {Chang-song Zhou and Tian-lun Chen},
3959   title = {Extracting information masked by chaos and contaminated with noise:
3960         Some considerations on the security of communication approaches using
3961         chaos},
3962   journal = {Physics Letters A},
3963   year = {1997},
3964   volume = {234},
3965   pages = {429 - 435},
3966   number = {6},
3967   issn = {0375-9601},
3968   keywords = {Communication},
3969   owner = {guyeux},
3970   timestamp = {2009.12.12}
3971 }
3972
3973 @ARTICLE{Zhou96,
3974   author = {Zhou, Huai-bei and Wang, Lu},
3975   title = {Chaos in Biomolecular Dynamics},
3976   journal = {The Journal of Physical Chemistry},
3977   year = {1996},
3978   volume = {100},
3979   pages = {8101-8105},
3980   number = {20},
3981   doi = {10.1021/jp953409x}
3982 }
3983
3984 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iwdw/2005,
3985   title = {IWDW'05: 4th International Workshop on Digital Watermarking},
3986   year = {2005},
3987   editor = {Mauro Barni and Ingemar J. Cox and Ton Kalker and Hyoung Joong Kim},
3988   volume = {3710},
3989   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3990   address = {Siena, Italy},
3991   publisher = {Springer},
3992   month = {September 15-17},
3993   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3994   booktitle = {IWDW},
3995   isbn = {3-540-28768-X},
3996   owner = {guyeux},
3997   timestamp = {2009.06.29}
3998 }
3999
4000 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2006,
4001   title = {IH 2006: Information Hiding, 8th International Workshop},
4002   year = {2007},
4003   editor = {Jan Camenisch and Christian S. Collberg and Neil F. Johnson and Phil
4004         Sallee},
4005   volume = {4437},
4006   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4007   address = {Alexandria, VA, USA},
4008   publisher = {Springer},
4009   month = {July},
4010   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4011   booktitle = {Information Hiding},
4012   isbn = {978-3-540-74123-7},
4013   owner = {guyeux},
4014   timestamp = {2009.06.29}
4015 }
4016
4017 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2007,
4018   title = {Information Hiding, 9th International Workshop, IH 2007, Saint Malo,
4019         France, June 11-13, 2007, Revised Selected Papers},
4020   year = {2008},
4021   editor = {Teddy Furon and Fran\c{c}ois Cayre and Gwena{\"e}l J. Do{\"e}rr and
4022         Patrick Bas},
4023   volume = {4567},
4024   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4025   publisher = {Springer},
4026   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4027   booktitle = {Information Hiding},
4028   isbn = {978-3-540-77369-6},
4029   owner = {guyeux},
4030   timestamp = {2009.06.29}
4031 }
4032
4033 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iccsa/2006-1,
4034   title = {Computational Science and Its Applications - ICCSA 2006, International
4035         Conference, Glasgow, UK, May 8-11, 2006, Proceedings, Part I},
4036   year = {2006},
4037   editor = {Marina L. Gavrilova and Osvaldo Gervasi and Vipin Kumar and Chih
4038         Jeng Kenneth Tan and David Taniar and Antonio Lagan{\`a} and Youngsong
4039         Mun and Hyunseung Choo},
4040   volume = {3980},
4041   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4042   publisher = {Springer},
4043   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4044   booktitle = {ICCSA (1)},
4045   isbn = {3-540-34070-X}
4046 }
4047
4048 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/secrypt/2010,
4049   title = {SECRYPT 2010 - Proceedings of the International Conference on Security
4050         and Cryptography, Athens, Greece, July 26-28, 2010, SECRYPT is part
4051         of ICETE - The International Joint Conference on e-Business and Telecommunications},
4052   year = {2010},
4053   editor = {Sokratis K. Katsikas and Pierangela Samarati},
4054   publisher = {SciTePress},
4055   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4056   booktitle = {SECRYPT},
4057   isbn = {978-989-8425-18-8}
4058 }
4059
4060 @BOOK{Katzenbeisser00,
4061   title = {Information Hiding Techniques for Steganography and Digital Watermarking},
4062   publisher = {Artech House, Inc.},
4063   year = {2000},
4064   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Petitcolas, Fabien A.},
4065   address = {Norwood, MA, USA},
4066   isbn = {1580530354}
4067 }
4068
4069 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/1999,
4070   title = {IH'99: 3rd International Workshop on Information Hiding},
4071   year = {2000},
4072   editor = {Andreas Pfitzmann},
4073   volume = {1768},
4074   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4075   address = {Dresden, Germany},
4076   publisher = {Springer},
4077   month = {September 29 - October 1.},
4078   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4079   booktitle = {Information Hiding},
4080   isbn = {3-540-67182-X},
4081   owner = {guyeux},
4082   timestamp = {2009.06.29}
4083 }
4084
4085 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/indocrypt/2000,
4086   title = {Progress in Cryptology - INDOCRYPT 2000, First International Conference
4087         in Cryptology in India, Calcutta, India, December 10-13, 2000, Proceedings},
4088   year = {2000},
4089   editor = {Bimal K. Roy and Eiji Okamoto},
4090   volume = {1977},
4091   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4092   publisher = {Springer},
4093   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4094   booktitle = {INDOCRYPT},
4095   isbn = {3-540-41452-5}
4096 }
4097
4098 @BOOK{DBLP:reference/icsec/2010,
4099   title = {Handbook of Information and Communication Security},
4100   publisher = {Springer},
4101   year = {2010},
4102   editor = {Peter P. Stavroulakis and Mark Stamp},
4103   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4104   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
4105   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4},
4106   isbn = {978-3-642-04116-7}
4107 }
4108
4109 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/isnn/2004-2,
4110   title = {Advances in Neural Networks - ISNN 2004, International Symposium
4111         on Neural Networks, Dalian, China, August 19-21, 2004, Proceedings,
4112         Part II},
4113   year = {2004},
4114   editor = {Fuliang Yin and Jun Wang and Chengan Guo},
4115   volume = {3174},
4116   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4117   publisher = {Springer},
4118   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4119   booktitle = {ISNN (2)},
4120   isbn = {3-540-22843-8}
4121 }
4122
4123 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/adhocnets/2010,
4124   title = {Ad Hoc Networks - Second International Conference, ADHOCNETS 2010,
4125         Victoria, BC, Canada, August 18-20, 2010, Revised Selected Papers},
4126   year = {2010},
4127   editor = {Jun Zheng and David Simplot-Ryl and Victor C. M. Leung},
4128   volume = {49},
4129   series = {Lecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social Informatics
4130         and Telecommunications Engineering},
4131   publisher = {Springer},
4132   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4133   booktitle = {ADHOCNETS},
4134   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5},
4135   isbn = {978-3-642-17993-8}
4136 }
4137
4138 @INPROCEEDINGS{,
4139   owner = {guyeux},
4140   timestamp = {2011.03.29}
4141 }
4142
4143 @MISC{Delicious,
4144   title = {Delicious social bookmarking, http://delicious.com/},
4145   comment = {http://delicious.com/},
4146   type = {web page},
4147   url = {http://delicious.com/}
4148 }
4149
4150 @MISC{Frick,
4151   title = {The Frick Collection, http://www.frick.org/},
4152   comment = {http://www.frick.org/},
4153   type = {web page},
4154   url = {http://www.frick.org/}
4155 }
4156
4157 @PROCEEDINGS{2010,
4158   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4159         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4160   year = {2010},
4161   publisher = {IEEE},
4162   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4163   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4164 }
4165
4166 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4167   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4168         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4169   year = {2010},
4170   publisher = {IEEE},
4171   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4172   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4173 }
4174
4175 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/date/2010,
4176   title = {Design, Automation and Test in Europe, DATE 2010, Dresden, Germany,
4177         March 8-12, 2010},
4178   year = {2010},
4179   publisher = {IEEE},
4180   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4181   booktitle = {DATE}
4182 }
4183
4184 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/2009,
4185   title = {Proceedings IEEE CSE'09, 12th IEEE International Conference on Computational
4186         Science and Engineering, August 29-31, 2009, Vancouver, BC, Canada},
4187   year = {2009},
4188   publisher = {IEEE Computer Society},
4189   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4190   booktitle = {CSE}
4191 }
4192
4193 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/2009,
4194   title = {Proceedings of the International Conference on Ultra Modern Telecommunications,
4195         ICUMT 2009, 12-14 October 2009, St. Petersburg, Russia},
4196   year = {2009},
4197   publisher = {IEEE},
4198   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4199   booktitle = {ICUMT}
4200 }
4201
4202 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/2008,
4203   title = {49th Annual IEEE Symposium on Foundations of Computer Science, FOCS
4204         2008, October 25-28, 2008, Philadelphia, PA, USA},
4205   year = {2008},
4206   publisher = {IEEE Computer Society},
4207   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4208   booktitle = {FOCS}
4209 }
4210
4211 @comment{jabref-meta: selector_publisher:}
4212
4213 @comment{jabref-meta: selector_author:}
4214
4215 @comment{jabref-meta: selector_journal:}
4216
4217 @comment{jabref-meta: selector_keywords:Chaos;Entropie Topologique;Tip
4218
4219
4220
4221
4222 @InProceedings{Pang:2008:cec,
4223   author =      "Wai-Man Pang and Tien-Tsin Wong and Pheng-Ann Heng",
4224   title =       "Generating Massive High-Quality Random Numbers using
4225                  {GPU}",
4226   booktitle =   "2008 IEEE World Congress on Computational
4227                  Intelligence",
4228   year =        "2008",
4229   editor =      "Jun Wang",
4230   address =     "Hong Kong",
4231   organization = "IEEE Computational Intelligence Society",
4232   publisher =   "IEEE Press",
4233
4234 }
4235
4236 @Article{LEcuyerS07,
4237   title =       "Test{U01}: {A} {C} library for empirical testing of
4238                  random number generators",
4239   author =      "Pierre L'Ecuyer and Richard J. Simard",
4240   journal =     "ACM Trans. Math. Softw",
4241   year =        "2007",
4242   number =      "4",
4243   volume =      "33",
4244   bibdate =     "2007-11-06",
4245   bibsource =   "DBLP,
4246                  http://dblp.uni-trier.de/db/journals/toms/toms33.html#LEcuyerS07",
4247   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1268776.1268777",
4248 }
4249
4250 @Article{ZRKB10,
4251         author =                         {A. Zhmurov, K. Rybnikov, Y. Kholodov, and V. Barsegov},
4252         title =                          {Generation of Random Numbers on Graphics Processors: Forced Indentation In Silico of the Bacteriophage HK97},
4253         journal =                {J. Phys. Chem. B},
4254         year =                           {2011},
4255         volume =         {115},
4256         number =         {18},
4257         pages =                  {5278--5288},
4258 }
4259
4260
4261
4262 @comment {regarder : Pseudo-Random Number Generation for Brownian Dynamics and Dissipative Particle Dynamics Simulations on GPU Devices}
4263 @comment {CL Phillips, JA Anderson… - Journal of Computational Physics, 2011 - Elsevier}
4264
4265 @InProceedings{conf/fpga/ThomasHL09,
4266   title =       "A comparison of {CPU}s, {GPU}s, {FPGA}s, and massively
4267                  parallel processor arrays for random number
4268                  generation",
4269   author =      "David B. Thomas and Lee W. Howes and Wayne Luk",
4270 booktitle =     "Proceedings of the {ACM}/{SIGDA} 17th International
4271                  Symposium on Field Programmable Gate Arrays, {FPGA}
4272                  2009, Monterey, California, {USA}, February 22-24,
4273                  2009",
4274   bibdate =     "2010-06-29",
4275   publisher =   "ACM",
4276   year =        "2009",
4277   editor =      "Paul Chow and Peter Y. K. Cheung",
4278   ISBN =        "978-1-60558-410-2",
4279   pages =       "63--72",
4280   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1508128.1508139",
4281 }
4282
4283
4284
4285 @InProceedings{Jenkins96,
4286   author =      "Jenkins",
4287   title =       "{ISAAC}",
4288   booktitle =   "IWFSE: International Workshop on Fast Software
4289                  Encryption, LNCS",
4290   year =        "1996",
4291 }
4292
4293 @manual{Nvid10,
4294  author = {Nvidia},
4295  title = {Cuda cublas library},
4296  year = {2011},
4297  Note = {Version 4.0},
4298  }
4299
4300 @manual{curand11,
4301  author = {Nvidia},
4302  title = {Curand library},
4303  year = {2011},
4304  Note = {Version 4.0},
4305  }
4306
4307
4308
4309 @Article{BBS,
4310         author =                         {Lenore Blum and Manuel Blum and Michael Shub},
4311         title =                          {A Simple Unpredictable Pseudo-Random Number Generator},
4312         journal =                {SIAM Journal on Computing},
4313         year =                           {1986},
4314         volume =         {15},
4315         pages =                  {364--383},
4316 }