mabase.bib

   1 % This file was created with JabRef 2.7.
   2 % Encoding: UTF8
   3
   4 @INPROCEEDINGS{AdelsbachKS06,
   5   author = {Andr{\'e} Adelsbach and Stefan Katzenbeisser and Ahmad-Reza Sadeghi},
   6   title = {A Computational Model for Watermark Robustness},
   7   booktitle = {Information Hiding},
   8   year = {2006},
   9   pages = {145-160},
  10   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  11   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
  12   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_10},
  13   owner = {guyeux},
  14   timestamp = {2009.06.29}
  15 }
  16
  17 @INPROCEEDINGS{BattiatoCGG99,
  18   author = {Sebastiano Battiato and Dario Catalano and Giovanni Gallo and Rosario
  19         Gennaro},
  20   title = {Robust Watermarking for Images Based on Color Manipulation},
  21   booktitle = {Information Hiding},
  22   year = {1999},
  23   pages = {302-317},
  24   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  25   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
  26   owner = {guyeux},
  27   timestamp = {2009.06.29}
  28 }
  29
  30 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05,
  31   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  32   title = {The Return of the Sensitivity Attack},
  33   booktitle = {IWDW},
  34   year = {2005},
  35   pages = {260-274},
  36   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  37   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
  38   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_20},
  39   owner = {guyeux},
  40   timestamp = {2009.06.29}
  41 }
  42
  43 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05bis,
  44   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  45   title = {Fundamentals of Data Hiding Security and Their Application to Spread-Spectrum
  46         Analysis},
  47   booktitle = {IH'05: Information Hiding Workshop},
  48   year = {2005},
  49   pages = {146-160},
  50   publisher = {Lectures Notes in Computer Science, Springer-Verlag},
  51   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  52   crossref = {DBLP:conf/ih/2005},
  53   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11558859_12},
  54   owner = {guyeux},
  55   timestamp = {2009.06.30}
  56 }
  57
  58 @INPROCEEDINGS{CongJQZ06,
  59   author = {Jin Cong and Yan Jiang and Zhiguo Qu and Zhongmei Zhang},
  60   title = {A Wavelet Packets Watermarking Algorithm Based on Chaos Encryption},
  61   booktitle = {ICCSA (1)},
  62   year = {2006},
  63   pages = {921-928},
  64   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  65   crossref = {DBLP:conf/iccsa/2006-1},
  66   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11751540_100}
  67 }
  68
  69 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/DziembowskiP08,
  70   author = {Stefan Dziembowski and Krzysztof Pietrzak},
  71   title = {Leakage-Resilient Cryptography},
  72   booktitle = {FOCS},
  73   year = {2008},
  74   pages = {293-302},
  75   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  76   crossref = {DBLP:conf/focs/2008},
  77   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/FOCS.2008.56}
  78 }
  79
  80 @INCOLLECTION{Filiol10,
  81   author = {Eric Filiol},
  82   title = {Viruses and Malware},
  83   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
  84   year = {2010},
  85   pages = {747-769},
  86   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  87   crossref = {DBLP:reference/icsec/2010},
  88   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4_34}
  89 }
  90
  91 @INPROCEEDINGS{Filiol00,
  92   author = {Eric Filiol},
  93   title = {Decimation Attack of Stream Ciphers},
  94   booktitle = {INDOCRYPT},
  95   year = {2000},
  96   pages = {31-42},
  97   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  98   crossref = {DBLP:conf/indocrypt/2000},
  99   ee = {http://link.springer.de/link/service/series/0558/bibs/1977/19770031.htm}
 100 }
 101
 102 @INPROCEEDINGS{Furon05,
 103   author = {Teddy Furon},
 104   title = {A Survey of Watermarking Security},
 105   booktitle = {IWDW},
 106   year = {2005},
 107   pages = {201-215},
 108   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 109   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
 110   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_16},
 111   owner = {guyeux},
 112   timestamp = {2009.06.29}
 113 }
 114
 115 @Book{Goldreich,
 116   author =      {Oded Goldreich},
 117   ALTeditor =      {},
 118   title =      {Foundations of Cryptography: Basic Tools},
 119   publisher =      {Cambridge University Press},
 120   year =      {2007},
 121 }
 122
 123 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HiggsSHS10,
 124   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 125   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 126         prediction},
 127   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 128   year = {2010},
 129   pages = {1-8},
 130   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 131   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 132   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 133 }
 134
 135 @INPROCEEDINGS{Higgs2010,
 136   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 137   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 138         prediction},
 139   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 140   year = {2010},
 141   pages = {1-8},
 142   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 143   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 144   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 145 }
 146
 147 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HorvathC10,
 148   author = {Dragos Horvath and Camelia Chira},
 149   title = {Simplified chain folding models as metaheuristic benchmark for tuning
 150         real protein folding algorithms?},
 151   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 152   year = {2010},
 153   pages = {1-8},
 154   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 155   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 156   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5585932}
 157 }
 158
 159 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/IslamC10,
 160   author = {Md. Kamrul Islam and Madhu Chetty},
 161   title = {Clustered memetic algorithm for protein structure prediction},
 162   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 163   year = {2010},
 164   pages = {1-8},
 165   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 166   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 167   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586187}
 168 }
 169
 170 @INPROCEEDINGS{Ker06,
 171   author = {Andrew D. Ker},
 172   title = {Batch Steganography and Pooled Steganalysis},
 173   booktitle = {Information Hiding},
 174   year = {2006},
 175   pages = {265-281},
 176   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 177   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
 178   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_18},
 179   owner = {guyeux},
 180   timestamp = {2009.06.29}
 181 }
 182
 183 @INPROCEEDINGS{Lin2009,
 184   author = {H.-Y. Lin and T.-C. Chiang},
 185   title = {Cooperative Secure Data Aggregation in Sensor Networks Using Elliptic
 186         Curve Based Cryptosystems},
 187   booktitle = {CDVE},
 188   year = {2009},
 189   pages = {384-387},
 190   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 191   crossref = {DBLP:conf/cdve/2009},
 192   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04265-2_58}
 193 }
 194
 195 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/MaimourPH09,
 196   author = {Moufida Maimour and CongDuc Pham and Doan B. Hoang},
 197   title = {A Congestion Control Framework for Handling Video Surveillance Traffics
 198         on WSN},
 199   booktitle = {CSE (2)},
 200   year = {2009},
 201   pages = {943-948},
 202   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 203   crossref = {DBLP:conf/cse/2009},
 204   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CSE.2009.200}
 205 }
 206
 207 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/MakhoulSP09,
 208   author = {Abdallah Makhoul and Rachid Saadi and CongDuc Pham},
 209   title = {Coverage and adaptive scheduling algorithms for criticality management
 210         on video wireless sensor networks},
 211   booktitle = {ICUMT},
 212   year = {2009},
 213   pages = {1-8},
 214   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 215   crossref = {DBLP:conf/icumt/2009},
 216   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/ICUMT.2009.5345630}
 217 }
 218
 219 @INPROCEEDINGS{Mittelholzer99,
 220   author = {Thomas Mittelholzer},
 221   title = {An Information-Theoretic Approach to Steganography and Watermarking},
 222   booktitle = {Information Hiding},
 223   year = {1999},
 224   pages = {1-16},
 225   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 226   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
 227   owner = {guyeux},
 228   timestamp = {2009.06.29}
 229 }
 230
 231 @INPROCEEDINGS{PellegriniBA10,
 232   author = {Andrea Pellegrini and Valeria Bertacco and Todd M. Austin},
 233   title = {Fault-based attack of RSA authentication},
 234   booktitle = {DATE},
 235   year = {2010},
 236   pages = {855-860},
 237   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 238   crossref = {DBLP:conf/date/2010},
 239   ee = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5456933}
 240 }
 241
 242 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/Perez-HernandezRG10,
 243   author = {Luis Germ{\'a}n P{\'e}rez-Hern{\'a}ndez and Katya Rodr\'{\i}guez-V{\'a}zquez
 244         and Ram{\'o}n Gardu{\~n}o-Ju{\'a}rez},
 245   title = {Estimation of 3D Protein Structure by means of parallel Particle
 246         Swarm Optimization},
 247   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 248   year = {2010},
 249   pages = {1-8},
 250   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 251   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 252   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586549}
 253 }
 254
 255 @INPROCEEDINGS{WangNHZH07,
 256   author = {Chuntao Wang and Jiangqun Ni and Jiwu Huang and Rongyue Zhang and
 257         Meiying Huang},
 258   title = {Robust and High Capacity Image Watermarking Based on Jointly Coding
 259         and Embedding Optimization},
 260   booktitle = {Information Hiding},
 261   year = {2007},
 262   pages = {65-79},
 263   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 264   crossref = {DBLP:conf/ih/2007},
 265   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-77370-2_5},
 266   owner = {guyeux},
 267   timestamp = {2009.06.29}
 268 }
 269
 270 @INPROCEEDINGS{Zhao04,
 271   author = {Jian Zhao and Mingquan Zhou and Hongmei Xie and Jinye Peng and Xin
 272         Zhou},
 273   title = {A Novel Wavelet Image Watermarking Scheme Combined with Chaos Sequence
 274         and Neural Network},
 275   booktitle = {ISNN (2)},
 276   year = {2004},
 277   pages = {663-668},
 278   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 279   crossref = {DBLP:conf/isnn/2004-2},
 280   ee = {http://springerlink.metapress.com/openurl.asp?genre=article{\&}issn=0302-9743{\&}volume=3174{\&}spage=663}
 281 }
 282
 283 @INPROCEEDINGS{Acharya05securecomparison,
 284   author = {Acharya, Mithun and Girao, Joao and Westhoff, Dirk},
 285   title = {Secure Comparison of Encrypted Data in Wireless Sensor Networks},
 286   booktitle = {WIOPT '05: Proceedings of the Third International Symposium on Modeling
 287         and Optimization in Mobile, Ad Hoc, and Wireless Networks},
 288   year = {2005},
 289   pages = {47--53},
 290   address = {Washington, DC, USA},
 291   publisher = {IEEE Computer Society},
 292   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/WIOPT.2005.44},
 293   isbn = {0-7695-2267-X}
 294 }
 295
 296 @INPROCEEDINGS{Acimez07onthe,
 297   author = {Onur Acıi\c{c}mez and \c{C}etin Kaya Ko\c{c} and Jean-Pierre Seifert},
 298   title = {On the power of simple branch prediction analysis },
 299   booktitle = {2007 ACM Symposium on Information, Computer and Communications Security
 300         (ASIACCS'07)},
 301   year = {2007},
 302   pages = {312--320},
 303   publisher = {ACM Press}
 304 }
 305
 306 @ARTICLE{Adler65,
 307   author = {R. L. Adler and A. G. Konheim and M. H. McAndrew},
 308   title = {Topological entropy},
 309   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
 310   year = {1965},
 311   volume = {114},
 312   pages = {309-319},
 313   owner = {guyeux},
 314   timestamp = {2008.05.29}
 315 }
 316
 317 @INPROCEEDINGS{Agrawal04,
 318   author = {Agrawal, Rakesh and Kiernan, Jerry and Srikant, Ramakrishnan and
 319         Xu, Yirong},
 320   title = {Order preserving encryption for numeric data},
 321   booktitle = {SIGMOD '04: Proceedings of the 2004 ACM SIGMOD international conference
 322         on Management of data},
 323   year = {2004},
 324   pages = {563--574},
 325   address = {New York, NY, USA},
 326   publisher = {ACM},
 327   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1007568.1007632},
 328   isbn = {1-58113-859-8},
 329   location = {Paris, France}
 330 }
 331
 332 @ARTICLE{Anfinsen20071973,
 333   author = {Anfinsen, Christian B.},
 334   title = {Principles that Govern the Folding of Protein Chains},
 335   journal = {Science},
 336   year = {1973},
 337   volume = {181},
 338   pages = {223-230},
 339   number = {4096},
 340   doi = {10.1126/science.181.4096.223},
 341   eprint = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.full.pdf},
 342   url = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.short}
 343 }
 344
 345 @ARTICLE{Arques1994,
 346   author = {D. G. Arques and C. J. Michel},
 347   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine autocorrelation function
 348         after and before random mutations.},
 349   journal = {Math Biosci},
 350   year = {1994},
 351   volume = {123},
 352   pages = {103--125},
 353   number = {1},
 354   month = {Sep},
 355   abstract = {The mutation process is a classical evolutionary genetic process.
 356         The type of mutations studied here is the random substitutions of
 357         a purine base R (adenine or guanine) by a pyrimidine base Y (cytosine
 358         or thymine) and reciprocally (transversions). The analytical expressions
 359         derived allow us to analyze in genes the occurrence probabilities
 360         of motifs and d-motifs (two motifs separated by any d bases) on the
 361         R/Y alphabet under transversions. These motif probabilities can be
 362         obtained after transversions (in the evolutionary sense; from the
 363         past to the present) and, unexpectedly, also before transversions
 364         (after back transversions, in the inverse evolutionary sense, from
 365         the present to the past). This theoretical part in Section 2 is a
 366         first generalization of a particular formula recently derived. The
 367         application in Section 3 is based on the analytical expression giving
 368         the autocorrelation function (the d-motif probabilities) before transversions.
 369         It allows us to study primitive genes from actual genes. This approach
 370         solves a biological problem. The protein coding genes of chloroplasts
 371         and mitochondria have a preferential occurrence of the 6-motif YRY(N)6YRY
 372         (maximum of the autocorrelation function for d = 6, N = R or Y) with
 373         a periodicity modulo 3. The YRY(N)6YRY preferential occurrence without
 374         the periodicity modulo 3 is also observed in the RNA coding genes
 375         (ribosomal, transfer, and small nuclear RNA genes) and in the noncoding
 376         genes (introns and 5' regions of eukaryotic nuclei). However, there
 377         are two exceptions to this YRY(N)6YRY rule: the protein coding genes
 378         of eukaryotic nuclei, and prokaryotes, where YRY(N)6YRY has the second
 379         highest value after YRY(N)0YRY (YRYYRY) with a periodicity modulo
 380         3. When we go backward in time with the analytical expression, the
 381         protein coding genes of both eukaryotic nuclei and prokaryotes retrieve
 382         the YRY(N)6YRY preferential occurrence with a periodicity modulo
 383         3 after 0.2 back transversions per base. In other words, the actual
 384         protein coding genes of chloroplasts and mitochondria are similar
 385         to the primitive protein coding genes of eukaryotic nuclei and prokaryotes.
 386         On the other hand, this application represents the first result concerning
 387         the mutation process in the model of DNA sequence evolution we recently
 388         proposed. According to this model, the actual genes on the R/Y alphabet
 389         derive from two successive evolutionary genetic processes: an independent
 390         mixing of a few nonrandom types of oligonucleotides leading to genes
 391         called primitive followed by a mutation process in these primitive
 392         genes.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)},
 393   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 394         France.},
 395   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Mathematics; Models,
 396         Genetic; Mutation; Probability; Proteins, genetics; Purines; Pyrimidines},
 397   language = {eng},
 398   medline-pst = {ppublish},
 399   owner = {guyeux},
 400   pii = {0025-5564(94)90020-5},
 401   pmid = {7949744},
 402   timestamp = {2011.05.05}
 403 }
 404
 405 @ARTICLE{Arques1998,
 406   author = {D. G. Arquès and J. P. Fallot and C. J. Michel},
 407   title = {An evolutionary analytical model of a complementary circular code
 408         simulating the protein coding genes, the 5' and 3' regions.},
 409   journal = {Bull Math Biol},
 410   year = {1998},
 411   volume = {60},
 412   pages = {163--194},
 413   number = {1},
 414   month = {Jan},
 415   abstract = {The self-complementary subset T0 = X0 [symbol: see text] ¿AAA, TTT¿
 416         with X0 = ¿AAC, AAT, ACC, ATC, ATT, CAG, CTC, CTG, GAA, GAC, GAG,
 417         GAT, GCC, GGC, GGT, GTA, GTC, GTT, TAC, TTC¿ of 22 trinucleotides
 418         has a preferential occurrence in the frame 0 (reading frame established
 419         by the ATG start trinucleotide) of protein (coding) genes of both
 420         prokaryotes and eukaryotes. The subsets T1 = X1 [symbol: see text]
 421         ¿CCC¿ and T2 = X2 [symbol: see text] ¿GGG¿ of 21 trinucleotides have
 422         a preferential occurrence in the shifted frames 1 and 2 respectively
 423         (frame 0 shifted by one and two nucleotides respectively in the 5'-3'
 424         direction). T1 and T2 are complementary to each other. The subset
 425         T0 contains the subset X0 which has the rarity property (6 x 10(-8)
 426         to be a complementary maximal circular code with two permutated maximal
 427         circular codes X1 and X2 in the frames 1 and 2 respectively. X0 is
 428         called a C3 code. A quantitative study of these three subsets T0,
 429         T1, T2 in the three frames 0, 1, 2 of protein genes, and the 5' and
 430         3' regions of eukaryotes, shows that their occurrence frequencies
 431         are constant functions of the trinucleotide positions in the sequences.
 432         The frequencies of T0, T1, T2 in the frame 0 of protein genes are
 433         49, 28.5 and 22.5\% respectively. In contrast, the frequencies of
 434         T0, T1, T2 in the 5' and 3' regions of eukaryotes, are independent
 435         of the frame. Indeed, the frequency of T0 in the three frames of
 436         5' (respectively 3') regions is equal to 35.5\% (respectively 38\%)
 437         and is greater than the frequencies T1 and T2, both equal to 32.25\%
 438         (respectively 31\%) in the three frames. Several frequency asymmetries
 439         unexpectedly observed (e.g. the frequency difference between T1 and
 440         T2 in the frame 0), are related to a new property of the subset T0
 441         involving substitutions. An evolutionary analytical model at three
 442         parameters (p, q, t) based on an independent mixing of the 22 codons
 443         (trinucleotides in frame 0) of T0 with equiprobability (1/22) followed
 444         by t approximately 4 substitutions per codon according to the proportions
 445         p approximately 0.1, q approximately 0.1 and r = 1 - p - q approximately
 446         0.8 in the three codon sites respectively, retrieves the frequencies
 447         of T0, T1, T2 observed in the three frames of protein genes and explains
 448         these asymmetries. Furthermore, the same model (0.1, 0.1, t) after
 449         t approximately 22 substitutions per codon, retrieves the statistical
 450         properties observed in the three frames of the 5' and 3' regions.
 451         The complex behaviour of these analytical curves is totally unexpected
 452         and a priori difficult to imagine.},
 453   doi = {10.1006/bulm.1997.0033},
 454   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Marne la Vallée, Institut
 455         Gaspard Monge, Noisy Le Grand, France. arques@univ-mlv.fr},
 456   keywords = {Animals; Biological Evolution; Codon, genetics; Genetic Code; Humans;
 457         Mammals; Models, Genetic; Probability; Proteins, genetics; Rodentia;
 458         Vertebrates},
 459   language = {eng},
 460   medline-pst = {ppublish},
 461   owner = {guyeux},
 462   pii = {S0092-8240(97)90033-1},
 463   pmid = {9530018},
 464   timestamp = {2011.05.05},
 465   url = {http://dx.doi.org/10.1006/bulm.1997.0033}
 466 }
 467
 468 @ARTICLE{Arques1993,
 469   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 470   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine codon probability
 471         after and before random mutations.},
 472   journal = {Bull Math Biol},
 473   year = {1993},
 474   volume = {55},
 475   pages = {1025--1038},
 476   number = {6},
 477   month = {Nov},
 478   abstract = {Recently, we proposed a new model of DNA sequence evolution (Arquès
 479         and Michel. 1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772) according to which
 480         actual genes on the purine/pyrimidine (R/Y) alphabet (R = purine
 481         = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine) are the
 482         result of two successive evolutionary genetic processes: (i) a mixing
 483         (independent) process of non-random oligonucleotides (words of base
 484         length less than 10: YRY(N)6, YRYRYR and YRYYRY are so far identified;
 485         N = R or Y) leading to primitive genes (words of several hundreds
 486         of base length) and followed by (ii) a random mutation process, i.e.,
 487         transformations of a base R (respectively Y) into the base Y (respectively
 488         R) at random sites in these primitive genes. Following this model
 489         the problem investigated here is the study of the variation of the
 490         8 R/Y codon probabilities RRR, ..., YYY under random mutations. Two
 491         analytical expressions solved here allow analysis of this variation
 492         in the classical evolutionary sense (from the past to the present,
 493         i.e., after random mutations), but also in the inverted evolutionary
 494         sense (from the present to the past, i.e., before random mutations).
 495         Different properties are also derived from these formulae. Finally,
 496         a few applications of these formulae are presented. They prove the
 497         proposition in Arquès and Michel (1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772),
 498         Section 3.3.2, with the existence of a maximal mean number of random
 499         mutations per base of the order 0.3 in the protein coding genes.
 500         They also confirm the mixing process of oligonucleotides by excluding
 501         the purine/pyrimidine contiguous and alternating tracts from the
 502         formation process of primitive genes.},
 503   institution = {Université de Franche-Comté, Besançon, France.},
 504   keywords = {Base Sequence; Codon; DNA, chemistry/genetics; Mathematics; Models,
 505         Genetic; Mutation; Probability; Purines; Pyrimidines},
 506   language = {eng},
 507   medline-pst = {ppublish},
 508   owner = {guyeux},
 509   pmid = {8281128},
 510   timestamp = {2011.05.05}
 511 }
 512
 513 @ARTICLE{Arques1993b,
 514   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 515   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 516         common to different eukaryotic gene subpopulations.},
 517   journal = {Biochimie},
 518   year = {1993},
 519   volume = {75},
 520   pages = {399--407},
 521   number = {5},
 522   abstract = {The nucleotide distribution in protein coding genes, introns and transfer
 523         RNA genes of eukaryotic subpopulations (primates, rodent and mammals)
 524         is studied by autocorrelation functions. The autocorrelation function
 525         analysing the occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY (YRY-function)
 526         in protein coding genes and transfer RNA genes of these three eukaryotic
 527         subpopulations retrieves the preferential occurrence of YRY(N)6YRY
 528         (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine,
 529         N = R or Y). The autocorrelation functions analysing the occurrence
 530         probability of the i-motifs RRR(N)iRRR (RRR-function) and YYY(N)iYYY
 531         (YYY-function) identify new non-random genetic statistical properties
 532         in these three eukaryotic subpopulations, mainly: i) in their protein
 533         coding genes: local maxima for i identical to 6 [12] (peaks for i
 534         = 6, 18, 30, 42) with the RRR-function and local maxima for i identical
 535         to 8 [10] (peaks for i = 8, 18, 28) with the YYY-function; and ii)
 536         in their introns: local maxima for i identical to 3 [6] (peaks for
 537         i = 3, 9, 15) and a short linear decrease followed by a large exponential
 538         decrease both with the RRR- and YYY-functions. The non-random properties
 539         identified in eukaryotic intron subpopulations are modelised with
 540         a process of random insertions and deletions of nucleotides simulating
 541         the RNA editing.},
 542   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 543         d'Informatique de Besançon, France.},
 544   keywords = {Animals; Base Sequence; Data Interpretation, Statistical; Genes; Introns;
 545         Mammals; Models, Genetic; Primates; Probability; Proteins, genetics;
 546         RNA Editing; RNA, Transfer, genetics; Rodentia; Sequence Analysis,
 547         DNA},
 548   language = {eng},
 549   medline-pst = {ppublish},
 550   owner = {guyeux},
 551   pii = {0300-9084(93)90173-P},
 552   pmid = {8347726},
 553   timestamp = {2011.05.05}
 554 }
 555
 556 @ARTICLE{Arques1992,
 557   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 558   title = {A simulation of the genetic periodicities modulo 2 and 3 with processes
 559         of nucleotide insertions and deletions.},
 560   journal = {J Theor Biol},
 561   year = {1992},
 562   volume = {156},
 563   pages = {113--127},
 564   number = {1},
 565   month = {May},
 566   abstract = {Recently, a new genetic process termed RNA editing has been identified
 567         showing insertions and deletions of nucleotides in particular RNA
 568         molecules. On the other hand, there are a few non-random statistical
 569         properties in genes: in particular, the periodicity modulo 3 (P3)
 570         associated with an open reading frame, the periodicity modulo 2 (P2)
 571         associated with alternating purine/pyrimidine stretches, the YRY(N)6YRY
 572         preferential occurrence (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 573         = cytosine or thymine, N = R or Y) representing a "code" of the DNA
 574         helix pitch, etc. The problem investigated here is whether a process
 575         of the type RNA editing can lead to the non-random statistical properties
 576         commonly observed in genes. This paper will show in particular that:
 577         The process of insertions and deletions of mononucleotides in the
 578         initial sequence [YRY(N)3]* [series of YRY(N)3] can lead to the periodicity
 579         modulo 2 (P2). The process of insertions and deletions of trinucleotides
 580         in the initial sequence [YRY(N)6]* [series of YRY(N)6] can lead to
 581         the periodicity modulo 3 (P3) and the YRY(N)6YRY preferential occurrence.
 582         Furthermore, these two processes lead to a strong correlation with
 583         the reality, namely the mononucleotide insertion/deletion process,
 584         with the 5' eukaryotic regions and the trinucleotide insertion/deletion
 585         process, with the eukaryotic protein coding genes.},
 586   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 587         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 588   keywords = {Chromosome Deletion; Computer Simulation; Humans; Models, Genetic;
 589         Mutagenesis, genetics; RNA, genetics},
 590   language = {eng},
 591   medline-pst = {ppublish},
 592   owner = {guyeux},
 593   pmid = {1379311},
 594   timestamp = {2011.05.05}
 595 }
 596
 597 @ARTICLE{Arques1990,
 598   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 599   title = {Periodicities in coding and noncoding regions of the genes.},
 600   journal = {J Theor Biol},
 601   year = {1990},
 602   volume = {143},
 603   pages = {307--318},
 604   number = {3},
 605   month = {Apr},
 606   abstract = {Gene population statistical studies of protein coding genes and introns
 607         have identified two types of periodicities on the purine/pyrimidine
 608         alphabet: (i) the modulo 3 periodicity or coding periodicity (periodicity
 609         P3) in protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, viruses,
 610         chloroplasts, mitochondria, plasmids and in introns of viruses and
 611         mitochondria, and (ii) the modulo 2 periodicity (periodicity P2)
 612         in the eukaryotic introns. The periodicity study is herein extended
 613         to the 5' and 3' regions of eukaryotes, prokaryotes and viruses and
 614         shows: (i) the periodicity P3 in the 5' and 3' regions of eukaryotes.
 615         Therefore, these observations suggest a unitary and dynamic concept
 616         for the genes as for a given genome, the 5' and 3' regions have the
 617         genetic information for protein coding genes and for introns: (1)
 618         In the eukaryotic genome, the 5' (P2 and P3) and 3' (P2 and P3) regions
 619         have the information for protein coding genes (P3) and for introns
 620         (P2). The intensity of P3 is high in 5' regions and weak in 3' regions,
 621         while the intensity of P2 is weak in 5' regions and high in 3' regions.
 622         (2) In the prokaryotic genome, the 5' (P3) and 3' (P3) regions have
 623         the information for protein coding genes (P3). (3) In the viral genome,
 624         the 5' (P3) and 3' (P3) regions have the information for protein
 625         coding genes (P3) and for introns (P3). The absence of P2 in viral
 626         introns (in opposition to eukaryotic introns) may be related to the
 627         absence of P2 in 5' and 3' regions of viruses.},
 628   institution = {Université de Franche-Comté, Unité Associée CNRS No. 822, Besançon,
 629         France.},
 630   keywords = {Animals; Base Sequence; Eukaryotic Cells; Genes; Introns; Prokaryotic
 631         Cells; Purine Nucleotides; Pyrimidine Nucleotides; Repetitive Sequences,
 632         Nucleic Acid; Viruses, genetics},
 633   language = {eng},
 634   medline-pst = {ppublish},
 635   owner = {guyeux},
 636   pmid = {2385108},
 637   timestamp = {2011.05.05}
 638 }
 639
 640 @ARTICLE{Arques1990a,
 641   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 642   title = {A model of DNA sequence evolution.},
 643   journal = {Bull Math Biol},
 644   year = {1990},
 645   volume = {52},
 646   pages = {741--772},
 647   number = {6},
 648   abstract = {Statistical studies of gene populations on the purine/pyrimidine alphabet
 649         have shown that the mean occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY
 650         (R = purine, Y = pyrimidine, N = R or Y) is not uniform by varying
 651         i in the range, but presents a maximum at i = 6 in the following
 652         populations: protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, chloroplasts
 653         and mitochondria, and also viral introns, ribosomal RNA genes and
 654         transfer RNA genes (Arquès and Michel, 1987b, J. theor. Biol. 128,
 655         457-461). From the "universality" of this observation, we suggested
 656         that the oligonucleotide YRY(N)6 is a primitive one and that it has
 657         a central function in DNA sequence evolution (Arquès and Michel,
 658         1987b, J. theor. Biol. 128, 457-461). Following this idea, we introduce
 659         a concept of a model of DNA sequence evolution which will be validated
 660         according to a schema presented in three parts. In the first part,
 661         using the last version of the gene database, the YRY(N)6YRY preferential
 662         occurrence (maximum at i = 6) is confirmed for the populations mentioned
 663         above and is extended to some newly analysed populations: chloroplast
 664         introns, chloroplast 5' regions, mitochondrial 5' regions and small
 665         nuclear RNA genes. On the other hand, the YRY(N)6YRY preferential
 666         occurrence and periodicities are used in order to classify 18 gene
 667         populations. In the second part, we will demonstrate that several
 668         statistical features characterizing different gene populations (in
 669         particular the YRY(N)6YRY preferential occurrence and the periodicities)
 670         can be retrieved from a simple Markov model based on the mixing of
 671         the two oligonucleotides YRY(N)6 and YRY(N)3 and based on the percentages
 672         of RYR and YRY in the unspecified trinucleotides (N)3 of YRY(N)6
 673         and YRY(N)3. Several properties are identified and prove in particular
 674         that the oligonucleotide mixing is an independent process and that
 675         several different features are functions of a unique parameter. In
 676         the third part, the return of the model to the reality shows a strong
 677         correlation between reality and simulation concerning the presence
 678         of a large alternating purine/pyrimidine stretches and of periodicities.
 679         It also contributes to a greater understanding of biological reality,
 680         e.g. the presence or the absence of large alternating purine/pyrimidine
 681         stretches can be explained as being a simple consequence of the mixing
 682         of two particular oligonucleotides. Finally, we believe that such
 683         an approach is the first step toward a unified model of DNA sequence
 684         evolution allowing the molecular understanding of both the origin
 685         of life and the actual biological reality.},
 686   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 687         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 688   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Genetics, Population;
 689         Models, Genetic},
 690   language = {eng},
 691   medline-pst = {ppublish},
 692   owner = {guyeux},
 693   pmid = {2279193},
 694   timestamp = {2011.05.05}
 695 }
 696
 697 @ARTICLE{Arques1993a,
 698   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel and K. Orieux},
 699   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 700         common to different populations of eukaryotic non-coding genes.},
 701   journal = {J Theor Biol},
 702   year = {1993},
 703   volume = {161},
 704   pages = {329--342},
 705   number = {3},
 706   month = {Apr},
 707   abstract = {The autocorrelation function analysing the occurrence probability
 708         of the i-motif YRY(N)iYRY in genes allows the identification of mainly
 709         two periodicities modulo 2, 3 and the preferential occurrence of
 710         the motif YRY(N)6YRY (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 711         = cytosine or thymine, N = R or Y). These non-random genetic statistical
 712         properties can be simulated by an independent mixing of the three
 713         oligonucleotides YRYRYR, YRYYRY and YRY(N)6 (Arquès & Michel, 1990b).
 714         The problem investigated in this study is whether new properties
 715         can be identified in genes with other autocorrelation functions and
 716         also simulated with an oligonucleotide mixing model. The two autocorrelation
 717         functions analysing the occurrence probability of the i-motifs RRR(N)iRRR
 718         and YYY(N)iYYY simultaneously identify three new non-random genetic
 719         statistical properties: a short linear decrease, local maxima for
 720         i identical to 3[6] (i = 3, 9, etc) and a large exponential decrease.
 721         Furthermore, these properties are common to three different populations
 722         of eukaryotic non-coding genes: 5' regions, introns and 3' regions
 723         (see section 2). These three non-random properties can also be simulated
 724         by an independent mixing of the four oligonucleotides R8, Y8, RRRYRYRRR,
 725         YYYRYRYYY and large alternating R/Y series. The short linear decrease
 726         is a result of R8 and Y8, the local maxima for i identical to 3[6],
 727         of RRRYRYRRR and YYYRYRYYY, and the large exponential decrease, of
 728         large alternating R/Y series (section 3). The biological meaning
 729         of these results and their relation to the previous oligonucleotide
 730         mixing model are presented in the Discussion.},
 731   doi = {10.1006/jtbi.1993.1059},
 732   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 733         d'Informatique de Besançon, France.},
 734   keywords = {Animals; Biological Evolution; Genes, genetics; Models, Genetic; Models,
 735         Statistical; Mutation, genetics; Oligonucleotides, genetics; Probability},
 736   language = {eng},
 737   medline-pst = {ppublish},
 738   owner = {guyeux},
 739   pii = {S0022-5193(83)71059-3},
 740   pmid = {8331957},
 741   timestamp = {2011.05.05},
 742   url = {http://dx.doi.org/10.1006/jtbi.1993.1059}
 743 }
 744
 745 @ARTICLE{Arroyo08,
 746   author = {David Arroyo and Gonzalo Alvarez and Veronica Fernandez},
 747   title = {On the inadequacy of the logistic map for cryptographic applications},
 748   journal = {X Reunión Española sobre Criptología y Seguridad de la Información
 749         (X RECSI)},
 750   year = {2008},
 751   volume = {1},
 752   pages = {77-82},
 753   owner = {christophe},
 754   timestamp = {2010.03.01}
 755 }
 756
 757 @MISC{Backofen99algorithmicapproach,
 758   author = {R. Backofen and S. Will and P. Clote},
 759   title = {Algorithmic Approach To Quantifying The Hydrophobic Force Contribution
 760         In Protein Folding},
 761   year = {1999}
 762 }
 763
 764
 765 @inproceedings{Blum:1985:EPP:19478.19501,
 766  author = {Blum, Manuel and Goldwasser, Shafi},
 767  title = {An efficient probabilistic public key encryption scheme which hides all partial information},
 768  booktitle = {Proceedings of CRYPTO 84 on Advances in cryptology},
 769  year = {1985},
 770  isbn = {0-387-15658-5},
 771  location = {Santa Barbara, California, United States},
 772  pages = {289--302},
 773  numpages = {14},
 774  url = {http://dl.acm.org/citation.cfm?id=19478.19501},
 775  acmid = {19501},
 776  publisher = {Springer-Verlag New York, Inc.},
 777  address = {New York, NY, USA},
 778  keywords = {chosen cyphertext attack, integer factorization, partial information, passive adversaries, probabilistic encryption},
 779 }
 780
 781
 782 @INPROCEEDINGS{bcgr11:ip,
 783   author = {Bahi, Jacques M. and Couchot, Jean-fran\c{c}ois and Guyeux, Christophe
 784         and Richard, Adrien},
 785   title = {On the Link Between Strongly Connected Iteration Graphs and Chaotic
 786         Boolean Discrete-Time Dynamical Systems},
 787   booktitle = {FCT'11, 18th Int. Symp. on Fundamentals of Computation Theory},
 788   year = {2011},
 789   volume = {*},
 790   series = {LNCS},
 791   pages = {***--***},
 792   address = {Oslo, Norway},
 793   month = aug,
 794   note = {To appear},
 795   classement = {ACTI},
 796   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 797   equipe = {and},
 798   inhal = {no}
 799 }
 800
 801 @ARTICLE{bg10:ij,
 802   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 803   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
 804   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
 805   year = {2010},
 806   volume = {4},
 807   pages = {167--181},
 808   number = {2},
 809   classement = {ACLI},
 810   doi = {10.1260/1748-3018.4.2.167},
 811   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 812   equipe = {and},
 813   impact-factor = {#},
 814   inhal = {no},
 815   isi-acro = {#},
 816   url = {http://dx.doi.org/10.1260/1748-3018.4.2.167}
 817 }
 818
 819 @INPROCEEDINGS{guyeux10ter,
 820   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 821   title = {A new chaos-based watermarking algorithm},
 822   booktitle = {SECRYPT'10, Int. conf. on security and cryptography},
 823   year = {2010},
 824   pages = {455--458},
 825   address = {Athens, Greece},
 826   month = jul,
 827   publisher = {SciTePress},
 828   classement = {ACTI},
 829   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 830   equipe = {and},
 831   inhal = {no}
 832 }
 833
 834 @INPROCEEDINGS{bgc11:ip,
 835   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Cote, Nathalie},
 836   title = {Chaos of Protein Folding},
 837   booktitle = {IJCNN 2011, Int. Joint Conf. on Neural Networks},
 838   year = {2011},
 839   pages = {***--***},
 840   address = {San Jose, California, United States},
 841   month = jul,
 842   note = {To appear},
 843   classement = {ACTI},
 844   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 845   equipe = {and},
 846   inhal = {no}
 847 }
 848
 849 @INPROCEEDINGS{guyeux10bis,
 850   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 851   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 852         Networks},
 853   booktitle = {SENSORCOMM'10, 4-th Int. Conf. on Sensor Technologies and Applications},
 854   year = {2010},
 855   pages = {472--477},
 856   address = {Venice-Mestre, Italy},
 857   month = jul,
 858   classement = {ACTI},
 859   doi = {10.1109/SENSORCOMM.2010.76},
 860   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 861   equipe = {and},
 862   inhal = {no},
 863   url = {http://dx.doi.org/10.1109/SENSORCOMM.2010.76}
 864 }
 865
 866 @INPROCEEDINGS{guyeuxVictoria,
 867   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 868   title = {Secure Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. Homomorphism
 869         versus Watermarking Approach},
 870   booktitle = {ADHOCNETS 2010, 2nd Int. Conf. on Ad Hoc Networks},
 871   year = {2010},
 872   volume = {49},
 873   series = {Lecture Notes in ICST},
 874   pages = {344--358},
 875   address = {Victoria, Canada},
 876   month = aug,
 877   classement = {ACTI},
 878   doi = {10.1007/978-3-642-17994-5_23},
 879   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 880   equipe = {and},
 881   inhal = {no},
 882   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5_23}
 883 }
 884
 885 @INPROCEEDINGS{bgs11:ip,
 886   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Salomon, Michel},
 887   title = {Building a Chaotic Proven Neural Network},
 888   booktitle = {ICCANS 2011, IEEE Int. Conf. on Computer Applications and Network
 889         Security},
 890   year = {2011},
 891   pages = {***--***},
 892   address = {Maldives, Maldives},
 893   month = may,
 894   classement = {ACTI},
 895   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 896   equipe = {and},
 897   inhal = {no}
 898 }
 899
 900 @INPROCEEDINGS{bgw10:ip,
 901   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 902   title = {A Pseudo Random Numbers Generator Based on Chaotic Iterations. Application
 903         to Watermarking},
 904   booktitle = {WISM 2010, Int. Conf. on Web Information Systems and Mining},
 905   year = {2010},
 906   volume = {6318},
 907   series = {LNCS},
 908   pages = {202--211},
 909   address = {Sanya, China},
 910   month = oct,
 911   classement = {ACTI},
 912   doi = {10.1007/978-3-642-16515-3_26},
 913   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 914   equipe = {and},
 915   inhal = {no},
 916   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-16515-3_26}
 917 }
 918
 919 @INPROCEEDINGS{bgw09:ip,
 920   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 921   title = {A novel pseudo-random generator based on discrete chaotic iterations},
 922   booktitle = {INTERNET'09, 1-st Int. Conf. on Evolving Internet},
 923   year = {2009},
 924   pages = {71--76},
 925   address = {Cannes, France},
 926   month = aug,
 927   classement = {ACTI},
 928   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 929   equipe = {and},
 930   inhal = {no}
 931 }
 932
 933 @INPROCEEDINGS{bmg10:onp,
 934   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 935   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 936         Networks for critical applications},
 937   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 938         et Applications Critiques de Surveillance},
 939   year = {2010},
 940   address = {Bayonne, France},
 941   month = jun,
 942   note = {Communication orale},
 943   classement = {COM},
 944   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 945   equipe = {and},
 946   inhal = {no}
 947 }
 948
 949 @INPROCEEDINGS{guyeuxBayonne,
 950   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 951   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 952         Networks for critical applications},
 953   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 954         et Applications Critiques de Surveillance},
 955   year = {2010},
 956   address = {Bayonne, France},
 957   month = jun,
 958   note = {Communication orale},
 959   classement = {COM},
 960   equipe = {and},
 961   inhal = {no}
 962 }
 963
 964 @ARTICLE{bs10:ij,
 965   author = {Bahi, Jacques M. and Salomon, Michel},
 966   title = {A Decentralized Energy-based Diffusion Algorithm to Increase the
 967         Lifetime of {MANETs}},
 968   journal = {Computer Networks Journal},
 969   year = {2010},
 970   pages = {***--***},
 971   note = {Accepted manuscript. To appear},
 972   classement = {ACLI},
 973   equipe = {and},
 974   impact-factor = {1.201},
 975   inhal = {no},
 976   isi-acro = {#},
 977   publisher = {Elsevier}
 978 }
 979
 980 @ARTICLE{Bahi2000,
 981   author = {J. M. Bahi},
 982   title = {Boolean totally asynchronous iterations},
 983   journal = {Int. Journal of Mathematical Algorithms},
 984   year = {2000},
 985   volume = {1},
 986   pages = {331--346},
 987   owner = {guyeux},
 988   timestamp = {17/02/2008}
 989 }
 990
 991 @ARTICLE{Bahi2000bis,
 992   author = {Jacques M. Bahi},
 993   title = {Asynchronous iterative algorithms for nonexpansive linear systems},
 994   journal = {Journal of Parallel and Distributed Computing},
 995   year = {2000},
 996   volume = {60},
 997   pages = {92--112},
 998   owner = {guyeux},
 999   timestamp = {2009.01.10}
1000 }
1001
1002 @ARTICLE{Bahi1999,
1003   author = {J. M. Bahi},
1004   title = {Parallel synchronous chaotic iterations for singular linear systems},
1005   journal = {Parallel Algorithms and Applications},
1006   year = {1999},
1007   volume = {14},
1008   pages = {19--35},
1009   owner = {guyeux},
1010   timestamp = {17/02/2008}
1011 }
1012
1013 @ARTICLE{Bahi1998,
1014   author = {Jacques M. Bahi},
1015   title = {Algorithmes paralleles asynchrones pour les systemes singuliers},
1016   journal = {Comptes Rendus de l'Academie des Sciences},
1017   year = {1998},
1018   volume = {t. 326, serie 1},
1019   pages = {1421--1425},
1020   owner = {guyeux},
1021   timestamp = {2009.01.18}
1022 }
1023
1024 @PHDTHESIS{bahi98,
1025   author = {Jacques M. Bahi},
1026   title = {Méthodes itératives dans des espaces produits. Application au calcul
1027         parallèle},
1028   school = {Université de Franche-Comté},
1029   year = {1998},
1030   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1031   owner = {christophe},
1032   timestamp = {2010.08.24}
1033 }
1034
1035 @PHDTHESIS{bahi91,
1036   author = {Jacques M. Bahi},
1037   title = {Algorithmes asynchrones pour des systèmes différentiels-algébriques.
1038         Simulation numérique sur des exemples de circuits électriques},
1039   school = {Université de Franche-Comté},
1040   year = {1991},
1041   owner = {christophe},
1042   timestamp = {2010.08.24}
1043 }
1044
1045 @ARTICLE{bcv06:ij,
1046   author = {Jacques M. Bahi and Sylvain Contassot-Vivier},
1047   title = {Basins of attraction in fully asynchronous discrete-time discrete-state
1048         dynamic networks},
1049   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1050   year = {2006},
1051   volume = {17},
1052   pages = {397--408},
1053   number = {2},
1054   inhal = {no},
1055   owner = {guyeux},
1056   timestamp = {2009.12.04}
1057 }
1058
1059 @ARTICLE{Bahi2002,
1060   author = {J.~M. Bahi and S. Contassot-Vivier},
1061   title = {Stability of fully asynchronous discrete-time discrete state dynamic
1062         networks},
1063   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1064   year = {2002},
1065   volume = {13(6)},
1066   pages = {1353-1363},
1067   owner = {guyeux},
1068   timestamp = {2009.02.14}
1069 }
1070
1071 @TECHREPORT{bcgg10:ir,
1072   author = {Bahi, J. M. and Couchot, J.-F. and Grasset, O. and Guyeux, C.},
1073   title = {{D}iscrete {D}ynamical {S}ystems: {N}ecessary {D}ivergence {C}onditions
1074         for {S}ynchronous {I}terations},
1075   institution = {LIFC - Laboratoire d'{I}nformatique de l'{U}niversit\'{e} de {F}ranche
1076         {C}omt\'{e}},
1077   year = {2010},
1078   type = {Research Report},
1079   number = {RR2010-04},
1080   month = sep,
1081   pdf = {/~publis/papers/pub/2010/RR2010-04.pdf}
1082 }
1083
1084 @ARTICLE{guyeux09,
1085   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1086   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
1087   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
1088   year = {2010},
1089   volume = {4},
1090   pages = {167--181},
1091   number = {2},
1092   classement = {ACLNI},
1093   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1094   equipe = {and},
1095   impact-factor = {#},
1096   inhal = {no},
1097   isi-acro = {#}
1098 }
1099
1100 @INPROCEEDINGS{guyeux10,
1101   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1102   title = {Topological chaos and chaotic iterations, application to Hash functions},
1103   booktitle = {WCCI'10, IEEE World Congress on Computational Intelligence},
1104   year = {2010},
1105   pages = {1--7},
1106   address = {Barcelona, Spain},
1107   month = jul,
1108   note = {Best paper award},
1109   classement = {ACTI},
1110   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1111   equipe = {and},
1112   inhal = {no}
1113 }
1114
1115 @MISC{ih10,
1116   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1117   title = {A chaos-based approach for information hiding security.},
1118   howpublished = {arXiv},
1119   month = {April},
1120   year = {2010},
1121   institution = {Computer Science Laboratory LIFC, University of Franche-Comte, France}
1122 }
1123
1124 @ARTICLE{arxiv,
1125   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1126   title = {A watermarking algorithm satisfying topological chaos properties},
1127   journal = {CoRR},
1128   year = {2008},
1129   volume = {abs/0810.4713},
1130   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1131   ee = {http://arxiv.org/abs/0810.4713}
1132 }
1133
1134 @ARTICLE{Bahi2008,
1135   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1136   title = {Chaotic iterations and topological chaos},
1137   year = {2008},
1138   abstract = {Chaotic iterations have been introduced on the one hand by Chazan,
1139         Miranker [5] and Miellou [9] in a numerical analysis context, and
1140         on the other hand by Robert [11] and Pellegrin [10] in the discrete
1141         dynamical systems framework. In both cases, the objective was to
1142         derive conditions of convergence of such iterations to a fixed state.
1143         In this paper, a new point of view is presented, the goal here is
1144         to derive conditions under which chaotic iterations admit a chaotic
1145         behaviour in a rigorous mathematical sense. Contrary to what has
1146         been studied in the literature, convergence is not desired. More
1147         precisely, we establish in this paper a link between the concept
1148         of chaotic iterations on a finite set and the notion of topological
1149         chaos [8], [6], [7]. We are motivated by concrete applications of
1150         our approach, such as the use of chaotic boolean iterations in the
1151         computer security field. Indeed, the concept of chaos is used in
1152         many areas of data security without real rigorous theoretical foundations,
1153         and without using the fundamental properties that allow chaos. The
1154         wish of this paper is to bring a bit more mathematical rigour in
1155         this field.},
1156   citeseerurl = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1157   comment = {arXiv},
1158   comments = {6 pages},
1159   eprint = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1160   oai2identifier = {0810.3154},
1161   owner = {guyeux},
1162   timestamp = {2008.10.23},
1163   url = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}}
1164 }
1165
1166 @ARTICLE{arxivRNNchaos,
1167   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux and Michel Salomon},
1168   title = {Building a Chaotic Proved Neural Network},
1169   journal = {CoRR},
1170   year = {2011},
1171   volume = {abs/1101.4351},
1172   ee = {http://arxiv.org/abs/1101.4351}
1173 }
1174
1175 @INPROCEEDINGS{guyeuxTaiwan10,
1176   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
1177   title = {Improving random number generators by chaotic iterations. Application
1178         in data hiding},
1179   booktitle = {ICCASM 2010, Int. Conf. on Computer Application and System Modeling},
1180   year = {2010},
1181   pages = {V13-643--V13-647},
1182   address = {Taiyuan, China},
1183   month = oct,
1184   classement = {ACTI},
1185   doi = {10.1109/ICCASM.2010.5622199},
1186   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1187   equipe = {and},
1188   inhal = {no},
1189   url = {http://dx.doi.org/10.1109/ICCASM.2010.5622199}
1190 }
1191
1192 @ARTICLE{Bahi2009,
1193   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1194   title = {A stochastic model of gene evolution with time dependent pseudochaotic
1195         mutations.},
1196   journal = {Bull Math Biol},
1197   year = {2009},
1198   volume = {71},
1199   pages = {681--700},
1200   number = {3},
1201   month = {Apr},
1202   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1203         in which a random subset of the 64 possible trinucleotides mutates
1204         at each evolutionary time t according to some time dependent substitution
1205         probabilities. Therefore, at each time t, the numbers and the types
1206         of mutable trinucleotides are unknown. Thus, the mutation matrix
1207         changes at each time t. This pseudochaotic model developed generalizes
1208         the standard model in which all the trinucleotides mutate at each
1209         time t. It determines the occurrence probabilities at time t of trinucleotides
1210         which pseudochaotically mutate according to 3 time dependent substitution
1211         parameters associated with the 3 trinucleotide sites. The main result
1212         proves that under suitable assumptions, this pseudochaotic model
1213         converges to a uniform probability vector identical to that of the
1214         standard model. Furthermore, an application of this pseudochaotic
1215         model allows an evolutionary study of the 3 circular codes identified
1216         in both eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1217         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1218         frames in genes locally, i.e., anywhere in genes and particularly
1219         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1220         After a certain evolutionary time and with particular time dependent
1221         functions for the 3 substitution parameters, precisely an exponential
1222         decrease in the 1st and 2nd trinucleotide sites and an exponential
1223         increase in the 3rd one, this pseudochaotic model retrieves the main
1224         statistical properties of the 3 circular codes observed in genes.
1225         Furthermore, it leads to a circular code asymmetry stronger than
1226         the standard model (nonpseudochaotic) and, therefore, to a better
1227         correlation with the genes.},
1228   doi = {10.1007/s11538-008-9376-4},
1229   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1230         90016, Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1231   keywords = {Evolution, Molecular; Genes; Models, Genetic; Mutation; Stochastic
1232         Processes},
1233   language = {eng},
1234   medline-pst = {ppublish},
1235   owner = {guyeux},
1236   pmid = {19198957},
1237   timestamp = {2011.05.05},
1238   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-008-9376-4}
1239 }
1240
1241 @ARTICLE{Bahi2008a,
1242   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1243   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations.},
1244   journal = {J Theor Biol},
1245   year = {2008},
1246   volume = {255},
1247   pages = {53--63},
1248   number = {1},
1249   month = {Nov},
1250   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1251         in which the mutations are chaotic, i.e. a random subset of the 64
1252         possible trinucleotides mutates at each evolutionary time t according
1253         to some substitution probabilities. Therefore, at each time t, the
1254         numbers and the types of mutable trinucleotides are unknown. Thus,
1255         the mutation matrix changes at each time t. The chaotic model developed
1256         generalizes the standard model in which all the trinucleotides mutate
1257         at each time t. It determines the occurrence probabilities at time
1258         t of trinucleotides which chaotically mutate according to three substitution
1259         parameters associated with the three trinucleotide sites. Two theorems
1260         prove that this chaotic model has a probability vector at each time
1261         t and that it converges to a uniform probability vector identical
1262         to that of the standard model. Furthermore, four applications of
1263         this chaotic model (with a uniform random strategy for the 64 trinucleotides
1264         and with a particular strategy for the three stop codons) allow an
1265         evolutionary study of the three circular codes identified in both
1266         eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1267         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1268         frames in genes locally, i.e. anywhere in genes and particularly
1269         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1270         After a certain evolutionary time and with particular values for
1271         the three substitution parameters, the chaotic models retrieve the
1272         main statistical properties of the three circular codes observed
1273         in genes. These applications also allow an evolutionary comparison
1274         between the standard and chaotic models.},
1275   doi = {10.1016/j.jtbi.2008.07.028},
1276   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1277         90016 Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1278   keywords = {Animals; Computer Simulation; DNA, Circular, genetics; Evolution,
1279         Molecular; Genetic Code; Models, Genetic; Mutation; Nonlinear Dynamics;
1280         Stochastic Processes; Time},
1281   language = {eng},
1282   medline-pst = {ppublish},
1283   owner = {guyeux},
1284   pii = {S0022-5193(08)00395-0},
1285   pmid = {18706428},
1286   timestamp = {2011.05.05},
1287   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2008.07.028}
1288 }
1289
1290 @ARTICLE{Bahi2008bis,
1291   author = {Bahi, J. M. and Michel, C. J.},
1292   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations},
1293   journal = {Journal of Theoretical Biology},
1294   year = {2008},
1295   volume = {255},
1296   pages = {53-63},
1297   owner = {guyeux},
1298   timestamp = {2009.01.10}
1299 }
1300
1301 @ARTICLE{Bahi2004,
1302   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1303   title = {A stochastic gene evolution model with time dependent mutations.},
1304   journal = {Bull Math Biol},
1305   year = {2004},
1306   volume = {66},
1307   pages = {763--778},
1308   number = {4},
1309   month = {Jul},
1310   abstract = {We develop here a new class of gene evolution models in which the
1311         nucleotide mutations are time dependent. These models allow to study
1312         nonlinear gene evolution by accelerating or decelerating the mutation
1313         rates at different evolutionary times. They generalize the previous
1314         ones which are based on constant mutation rates. The stochastic model
1315         developed in this class determines at some time t the occurrence
1316         probabilities of trinucleotides mutating according to 3 time dependent
1317         substitution parameters associated with the 3 trinucleotide sites.
1318         Therefore, it allows to simulate the evolution of the circular code
1319         recently observed in genes. By varying the class of function for
1320         the substitution parameters, 1 among 12 models retrieves after mutation
1321         the statistical properties of the observed circular code in the 3
1322         frames of actual genes. In this model, the mutation rate in the 3rd
1323         trinucleotide site increases during gene evolution while the mutation
1324         rates in the 1st and 2nd sites decrease. This property agrees with
1325         the actual degeneracy of the genetic code. This approach can easily
1326         be generalized to study evolution of motifs of various lengths, e.g.,
1327         dicodons, etc., with time dependent mutations.},
1328   doi = {10.1016/j.bulm.2003.10.004},
1329   institution = {LIFC - FRE CNRS 2661, IUT de Belfort, Université de Franche-Comté,
1330         BP 527, 90016 Belfort Cédex, France. bahi@iut-bm.univ-fcomte.fr},
1331   keywords = {Codon, genetics; Evolution, Molecular; Genes, genetics; Genetic Code,
1332         genetics; Models, Genetic; Mutation; Stochastic Processes},
1333   language = {eng},
1334   medline-pst = {ppublish},
1335   owner = {guyeux},
1336   pii = {S0092824003001174},
1337   pmid = {15210317},
1338   timestamp = {2011.05.05},
1339   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.bulm.2003.10.004}
1340 }
1341
1342 @ARTICLE{Banks92,
1343   author = {J. Banks and J. Brooks and G. Cairns and P. Stacey},
1344   title = {On Devaney's Definition of Chaos},
1345   journal = {Amer. Math. Monthly},
1346   year = {1992},
1347   volume = {99},
1348   pages = {332--334},
1349   keywords = {(c+),},
1350   owner = {guyeux},
1351   timestamp = {27/01/2008}
1352 }
1353
1354 @MISC{Nist10,
1355   author = {E. Barker and A. Roginsky},
1356   title = {DRAFT NIST Special Publication 800-131 Recommendation for the Transitioning
1357         of Cryptographic Algorithms and Key Sizes},
1358   year = {2010},
1359   owner = {christophe},
1360   timestamp = {2010.08.18}
1361 }
1362
1363 @ARTICLE{BarniBF03,
1364   author = {Mauro Barni and Franco Bartolini and Teddy Furon},
1365   title = {A general framework for robust watermarking security},
1366   journal = {Signal Processing},
1367   year = {2003},
1368   volume = {83},
1369   pages = {2069-2084},
1370   number = {10},
1371   note = {Special issue on Security of Data Hiding Technologies, invited paper},
1372   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1373   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/S0165-1684(03)00168-3},
1374   owner = {guyeux},
1375   timestamp = {2009.06.30}
1376 }
1377
1378 @ARTICLE{Baudet78,
1379   author = {Baudet, G\'{e}rard M.},
1380   title = {Asynchronous Iterative Methods for Multiprocessors},
1381   journal = {J. ACM},
1382   year = {1978},
1383   volume = {25},
1384   pages = {226--244},
1385   number = {2},
1386   address = {New York, NY, USA},
1387   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/322063.322067},
1388   issn = {0004-5411},
1389   publisher = {ACM}
1390 }
1391
1392 @PHDTHESIS{Baz98,
1393   author = {Didier El Baz},
1394   title = {Contribution à l'algorithmique parallèle. Le concept d'asynchronisme
1395         : étude théorique, mise en œuvre, et application},
1396   school = {Institut national polytechnique de Toulouse},
1397   year = {1998},
1398   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1399   owner = {christophe},
1400   timestamp = {2010.08.24}
1401 }
1402
1403 @ARTICLE{bhr09c:bl,
1404   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1405   title = {Contention awareness and fault-tolerant scheduling for precedence
1406         constrained tasks in heterogeneous systems},
1407   journal = {Parallel Computing},
1408   year = {2009},
1409   volume = {35},
1410   pages = {83--108},
1411   number = {2},
1412   classement = {*},
1413   doi = {10.1016/j.parco.2008.11.001},
1414   equipe = {and},
1415   inhal = {no},
1416   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.parco.2008.11.001}
1417 }
1418
1419 @INPROCEEDINGS{bhr08b:bl,
1420   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1421   title = {Fault tolerant scheduling of precedence task graphs on heterogeneous
1422         platforms},
1423   booktitle = {IPDPS'08},
1424   year = {2008},
1425   pages = {1--8},
1426   publisher = {IEEE Computer Society Press},
1427   classement = {*},
1428   equipe = {and},
1429   inhal = {no}
1430 }
1431
1432 @INPROCEEDINGS{Berger98,
1433   author = {Berger, Bonnie and Leighton, Tom},
1434   title = {Protein folding in the hydrophobic-hydrophilic (HP) is NP-complete},
1435   booktitle = {Proceedings of the second annual international conference on Computational
1436         molecular biology},
1437   year = {1998},
1438   series = {RECOMB '98},
1439   pages = {30--39},
1440   address = {New York, NY, USA},
1441   publisher = {ACM},
1442   acmid = {279080},
1443   isbn = {0-89791-976-9},
1444   location = {New York, New York, United States},
1445   numpages = {10}
1446 }
1447
1448 @BOOK{Bertsekas89,
1449   title = {Parallel and distributed computation: numerical methods},
1450   publisher = {Prentice-Hall, Inc.},
1451   year = {1989},
1452   author = {Bertsekas, Dimitri P. and Tsitsiklis, John N.},
1453   address = {Upper Saddle River, NJ, USA},
1454   isbn = {0-13-648700-9}
1455 }
1456
1457 @MISC{Bertsekas88paralleland,
1458   author = {Dimitri P. Bertsekas and John N. Tsitsiklis},
1459   title = {Parallel and distributed iterative algorithms: a selective survey},
1460   year = {1988}
1461 }
1462
1463 @UNPUBLISHED{F.a,
1464   author = {F. Blanchard and E. Glasner and S. Kolyada and A.Maass},
1465   title = {On Li-Yorke pairs},
1466   note = {Preprint},
1467   optkey = {2000},
1468   owner = {guyeux},
1469   timestamp = {2008.01.02}
1470 }
1471
1472 @UNPUBLISHED{F.,
1473   author = {F. Blanchard and B. Host and S. Ruette},
1474   title = {Asymptotic pairs in positive-entropy systems},
1475   note = {Preprint},
1476   optannote = {to appear in Ergod. Th. Dynam. Sys.},
1477   optkey = {2000},
1478   owner = {guyeux},
1479   timestamp = {2008.01.02}
1480 }
1481
1482 @ARTICLE{BFibe,
1483   author = {Dan Boneh and Matt Franklin},
1484   title = {Identity-Based Encryption from the {Weil} Pairing},
1485   journal = {SIAM J. of Computing},
1486   year = {2003},
1487   volume = {32},
1488   pages = {586-615},
1489   number = {3},
1490   note = {Extended abstract in Crypto'01}
1491 }
1492
1493 @INCOLLECTION{boneh,
1494   author = {Boneh, Dan and Goh, Eu-Jin and Nissim, Kobbi},
1495   title = {Evaluating 2-DNF Formulas on Ciphertexts},
1496   year = {2005},
1497   pages = {325--341},
1498   abstract = {Let ψ be a 2-DNF formula on boolean variables x 1,..., x n ∈ {0,1}.
1499         We present a homomorphic public key encryption scheme that allows
1500         the public evaluation of ψ given an encryption of the variables x
1501         1,..., x n. In other words, given the encryption of the bits x 1,...,
1502         x n, anyone can create the encryption of ψ( x 1,..., x n). More generally,
1503         we can evaluate quadratic multi-variate polynomials on ciphertexts
1504         provided the resulting value falls within a small set. We present
1505         a number of applications of the system: 1 In a database of size n,
1506         the total communication in the basic step of the Kushilevitz-Ostrovsky
1507         PIR protocol is reduced from to . 2 An efficient election system
1508         based on homomorphic encryption where voters do not need to include
1509         non-interactive zero knowledge proofs that their ballots are valid.
1510         The election system is proved secure without random oracles but still
1511         efficient. 3 A protocol for universally verifiable computation.},
1512   citeulike-article-id = {2719460},
1513   citeulike-linkout-0 = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg},
1514   journal = {Theory of Cryptography},
1515   keywords = {homomorphic, pairings},
1516   posted-at = {2008-04-25 21:53:15},
1517   priority = {2},
1518   url = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg}
1519 }
1520
1521 @ARTICLE{Bonneau01,
1522   author = {Bonneau, Richard and Baker, David},
1523   title = {AB INITIO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION: Progress and Prospects},
1524   journal = {Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure},
1525   year = {2001},
1526   volume = {30},
1527   pages = {173-189},
1528   number = {1},
1529   doi = {10.1146/annurev.biophys.30.1.173}
1530 }
1531
1532 @ARTICLE{Bowen,
1533   author = {R. Bowen},
1534   title = {Entropy for group endomorphisms and homogeneous spaces},
1535   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1536   year = {1971},
1537   volume = {153},
1538   pages = {401-414},
1539   owner = {guyeux},
1540   timestamp = {15/02/2008}
1541 }
1542
1543 @ARTICLE{Bowen1971,
1544   author = {R. Bowen},
1545   title = {Periodic points and measures for Axiom A diffeomorphisms},
1546   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1547   year = {1971},
1548   volume = {154},
1549   pages = {377-397},
1550   owner = {guyeux},
1551   timestamp = {15/02/2008}
1552 }
1553
1554 @ARTICLE{Braxenthaler97,
1555   author = {Michael Braxenthaler and R. Ron Unger and Ditza Auerbach and John
1556         Moult},
1557   title = {Chaos in protein dynamics},
1558   journal = {Proteins-structure Function and Bioinformatics},
1559   year = {1997},
1560   volume = {29},
1561   pages = {417--425},
1562   doi = {10.1002/(SICI)1097-0134(199712)29:4<417::AID-PROT2>3.3.CO;2-O},
1563   masid = {2824140}
1564 }
1565
1566 @INPROCEEDINGS{Brumley03remotetiming,
1567   author = {David Brumley and Dan Boneh},
1568   title = {Remote Timing Attacks are Practical},
1569   booktitle = {Proceedings of the 12th USENIX Security Symposium},
1570   year = {2003},
1571   pages = {1--14}
1572 }
1573
1574 @ARTICLE{Bohm1991375,
1575   author = {Gerald Böhm},
1576   title = {Protein folding and deterministic chaos: Limits of protein folding
1577         simulations and calculations},
1578   journal = {Chaos, Solitons \& Fractals},
1579   year = {1991},
1580   volume = {1},
1581   pages = {375 - 382},
1582   number = {4},
1583   doi = {DOI: 10.1016/0960-0779(91)90028-8},
1584   issn = {0960-0779},
1585   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TJ4-46CBXVT-1X/2/370489c218e4c2732cd9b620ef50c696}
1586 }
1587
1588 @INCOLLECTION{Cachin2004,
1589   author = {Cachin, Christian},
1590   title = {An Information-Theoretic Model for Steganography},
1591   booktitle = {Information Hiding},
1592   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1593   year = {1998},
1594   volume = {1525},
1595   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1596   pages = {306-318},
1597   affiliation = {MIT Laboratory for Computer Science 545 Technology Square Cambridge
1598         MA 02139 USA}
1599 }
1600
1601 @ARTICLE{Cam2006,
1602   author = {H. Cam and S. Ozdemir and P. Nair and D. Muthuavinashinappan and
1603         H. O. Sanli},
1604   title = {ESPDA: Energy-efficient secure pattern based data aggregation for
1605         wireless sensor networks.},
1606   journal = {Computer Communication journal (29)},
1607   year = {2006},
1608   pages = {446-455}
1609 }
1610
1611 @ARTICLE{CarletCZ98,
1612   author = {Claude Carlet and Pascale Charpin and Victor Zinoviev},
1613   title = {Codes, Bent Functions and Permutations Suitable For DES-like Cryptosystems},
1614   journal = {Des. Codes Cryptography},
1615   year = {1998},
1616   volume = {15},
1617   pages = {125-156},
1618   number = {2},
1619   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de}
1620 }
1621
1622 @INPROCEEDINGS{Castelluccia05efficientaggregation,
1623   author = {Claude Castelluccia},
1624   title = {Efficient aggregation of encrypted data in wireless sensor networks},
1625   booktitle = {MobiQuitous},
1626   year = {2005},
1627   pages = {109--117},
1628   publisher = {IEEE Computer Society}
1629 }
1630
1631 @ARTICLE{Cayre2008,
1632   author = {Cayre, F. and Bas, P.},
1633   title = {Kerckhoffs-Based Embedding Security Classes for WOA Data Hiding},
1634   journal = {IEEE Transactions on Information Forensics and Security},
1635   year = {2008},
1636   volume = {3},
1637   pages = {1--15},
1638   number = {1},
1639   doi = {10.1109/TIFS.2007.916006},
1640   issn = {1556-6013},
1641   keywords = {cryptography, random sequences, spread spectrum communication, telecommunication
1642         security, watermarking, Kerckhoffs-based embedding security classes,
1643         WOA Data Hiding, pseudorandom sequences, spread-spectrum techniques,
1644         steganography security, watermark-only-attack, watermarking, Security,
1645         spread-spectrum (SS) watermarking},
1646   owner = {guyeux},
1647   timestamp = {2009.06.29}
1648 }
1649
1650 @ARTICLE{Cayre2005,
1651   author = {Cayre, F. and Fontaine, C. and Furon, T.},
1652   title = {Watermarking security: theory and practice},
1653   journal = {IEEE Transactions on Signal Processing},
1654   year = {2005},
1655   volume = {53},
1656   pages = {3976--3987},
1657   number = {10},
1658   doi = {10.1109/TSP.2005.855418},
1659   issn = {1053-587X},
1660   keywords = {blind source separation, cryptography, watermarking, Fisher information
1661         matrix, blind source separation, cryptanalysis, information theory,
1662         spread spectrum techniques, substitutive scheme, watermarking security,
1663         Blind source separation, Fisher information matrix, equivocation,
1664         security, watermarking},
1665   owner = {guyeux},
1666   timestamp = {2009.06.29}
1667 }
1668
1669 @ARTICLE{Chajakis91,
1670   author = {Chajakis, Emmanuel D. and Zenios, Stavros A.},
1671   title = {Synchronous and asynchronous implementations of relaxation algorithms
1672         for nonlinear network optimization},
1673   journal = {Parallel Comput.},
1674   year = {1991},
1675   volume = {17},
1676   pages = {873--894},
1677   number = {8},
1678   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1679   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/S0167-8191(05)80072-9},
1680   issn = {0167-8191},
1681   publisher = {Elsevier Science Publishers B. V.}
1682 }
1683
1684 @ARTICLE{Chan2007,
1685   author = {Chan, Haowen and Perrig, Adrian and Przydatek, Bartosz and Song,
1686         Dawn},
1687   title = {SIA: Secure information aggregation in sensor networks},
1688   journal = {J. Comput. Secur.},
1689   year = {2007},
1690   volume = {15},
1691   pages = {69--102},
1692   number = {1},
1693   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1694   issn = {0926-227X},
1695   publisher = {IOS Press}
1696 }
1697
1698 @ARTICLE{Chandramouli06,
1699   author = {R. Chandramouli and S. Bapatla and K.P. Subbalakshmi},
1700   title = {Battery power-aware encryption},
1701   journal = {ACM transactions on information and system security},
1702   year = {2006},
1703   pages = {162--180},
1704   owner = {christophe},
1705   timestamp = {2010.07.31}
1706 }
1707
1708 @ARTICLE{Charpin85,
1709   author = {Pascale Charpin},
1710   title = {A description of some extended cyclic codes with application to Reed-Solomon
1711         codes},
1712   journal = {Discrete Mathematics},
1713   year = {1985},
1714   volume = {56},
1715   pages = {117-124},
1716   number = {2-3},
1717   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1718   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/0012-365X(85)90019-6}
1719 }
1720
1721 @ARTICLE{Chazan69,
1722   author = {D. Chazan and W. Miranker},
1723   title = {Chaotic relaxation},
1724   journal = {Linear algebra and its applications},
1725   year = {1969},
1726   pages = {199-222},
1727   owner = {guyeux},
1728   timestamp = {2008.05.22}
1729 }
1730
1731 @ARTICLE{Cheon2006,
1732   author = {Cheon, Jung Hee and Kim, Woo-Hwan and Nam, Hyun Soo},
1733   title = {Known-plaintext cryptanalysis of the Domingo-Ferrer algebraic privacy
1734         homomorphism scheme},
1735   journal = {Inf. Process. Lett.},
1736   year = {2006},
1737   volume = {97},
1738   pages = {118--123},
1739   number = {3},
1740   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1741   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ipl.2005.09.016},
1742   issn = {0020-0190},
1743   publisher = {Elsevier North-Holland, Inc.}
1744 }
1745
1746 @MISC{Cheon03acryptanalysis,
1747   author = {Jung Hee Cheon and Hyun Soo Nam},
1748   title = {A Cryptanalysis of the Original Domingo-Ferrer's Algebraic Privacy
1749         Homomorphism},
1750   year = {2003}
1751 }
1752
1753 @ARTICLE{Cheung05,
1754   author = {R.C.C. Cheung and N.J. Telle and W. Luk and P.Y.K. Cheung},
1755   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
1756   journal = {IEEE Trans. on Very Large Scale Integration Systems},
1757   year = {2005},
1758   volume = {13},
1759   pages = {1048-1059},
1760   number = {9}
1761 }
1762
1763 @ARTICLE{Chivian2005,
1764   author = {Chivian, Dylan and Kim, David E. and Malmström, Lars and Schonbrun,
1765         Jack and Rohl, Carol A. and Baker, David},
1766   title = {Prediction of CASP6 structures using automated robetta protocols},
1767   journal = {Proteins},
1768   year = {2005},
1769   volume = {61},
1770   pages = {157--166},
1771   number = {S7},
1772   issn = {1097-0134},
1773   keywords = {Rosetta, fragment assembly, de novo modeling, homology modeling, parametric
1774         alignment ensemble},
1775   owner = {christophe},
1776   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
1777   timestamp = {2011.01.22},
1778   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20733}
1779 }
1780
1781 @ARTICLE{Zhu06,
1782   author = {Congxu, Zhu and Xuefeng, Liao and Zhihua, Li},
1783   title = {Chaos-based multipurpose image watermarking algorithm},
1784   journal = {Wuhan University Journal of Natural Sciences},
1785   year = {2006},
1786   volume = {11},
1787   pages = {1675-1678},
1788   note = {10.1007/BF02831848},
1789   abstract = {To achieve the goal of image content authentication and copyright
1790         protection simultaneously, this paper presents a novel image dual
1791         watermarking method based on chaotic map. Firstly, the host image
1792         was split into many nonoverlapping small blocks, and the block-wise
1793         discrete cosine transform (DCT) is computed. Secondly, the robust
1794         watermarks, shuffled by the chaotic sequences, are embedded in the
1795         DC coefficients of blocks to achieve the goal of copyright protection.
1796         The semi-fragile watermarks, generated by chaotic map, are embedded
1797         in the AC coefficients of blocks to obtain the aim of image authentication.
1798         Both of them can be extracted without the original image. Simulation
1799         results demonstrate the effectiveness of our algorithm in terms of
1800         robustness and fragility.},
1801   affiliation = {Central South University School of Information Science and Engineering
1802         410083 Changsha, Hunan China},
1803   issn = {1007-1202},
1804   issue = {6},
1805   keyword = {Mathematics, general},
1806   publisher = {Wuhan University, co-published with Springer},
1807   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF02831848}
1808 }
1809
1810 @ARTICLE{Conley1978,
1811   author = {C. Conley},
1812   title = {Isolated invariant sets and the Morse index},
1813   journal = {CBMS Regional Conference. AMS.},
1814   year = {1978},
1815   optvolume = {38},
1816   owner = {guyeux},
1817   timestamp = {2008.01.02}
1818 }
1819
1820 @ARTICLE{Cornu2002,
1821   author = {Philippe Cornu and André Smolarz},
1822   title = {Image characterization by texture},
1823   journal = {Traitement du signal},
1824   year = {2002},
1825   volume = {19},
1826   pages = {29-35},
1827   file = {:/home/guyeux/Documents/Bibliotheque/These/Watermarking/Caractérisation d'images par textures associées.pdf:PDF},
1828   owner = {guyeux},
1829   timestamp = {2008.05.12}
1830 }
1831
1832 @INPROCEEDINGS{Cox99,
1833   author = {Ingemar Cox and Matt L. Miller and Andrew L. Mckellips},
1834   title = {Watermarking as Communications With Side Information},
1835   booktitle = {Proceedings of the IEEE},
1836   year = {1999},
1837   pages = {1127--1141},
1838   owner = {christophe},
1839   timestamp = {2010.03.06}
1840 }
1841
1842 @ARTICLE{Cox97securespread,
1843   author = {Ingemar J. Cox and Senior Member and Joe Kilian and F. Thomson Leighton
1844         and Talal Shamoon},
1845   title = {Secure spread spectrum watermarking for multimedia},
1846   journal = {IEEE Transactions on Image Processing},
1847   year = {1997},
1848   volume = {6},
1849   pages = {1673--1687}
1850 }
1851
1852 @ARTICLE{Cramer96,
1853   author = {Christopher Cramer and Erol Gelenbe and Hakan Bakircioglu},
1854   title = {Video Compression with Random Neural Networks},
1855   journal = {Neural Networks for Identification, Control, and Robotics, International
1856         Workshop},
1857   year = {1996},
1858   volume = {0},
1859   pages = {0476},
1860   address = {Los Alamitos, CA, USA},
1861   isbn = {0-8186-7456-3},
1862   publisher = {IEEE Computer Society}
1863 }
1864
1865 @INPROCEEDINGS{Crescenzi98,
1866   author = {Crescenzi, Pierluigi and Goldman, Deborah and Papadimitriou, Christos
1867         and Piccolboni, Antonio and Yannakakis, Mihalis},
1868   title = {On the complexity of protein folding (extended abstract)},
1869   booktitle = {Proceedings of the thirtieth annual ACM symposium on Theory of computing},
1870   year = {1998},
1871   series = {STOC '98},
1872   pages = {597--603},
1873   address = {New York, NY, USA},
1874   publisher = {ACM},
1875   acmid = {276875},
1876   isbn = {0-89791-962-9},
1877   location = {Dallas, Texas, United States},
1878   numpages = {7}
1879 }
1880
1881 @ARTICLE{Dawei2004,
1882   author = {Zhao Dawei and Chen Guanrong and Liu Wenbo},
1883   title = {A chaos-based robust wavelet-domain watermarking algorithm},
1884   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
1885   year = {2004},
1886   volume = {22},
1887   pages = {47-54},
1888   owner = {guyeux},
1889   timestamp = {2008.10.07}
1890 }
1891
1892 @MISC{1011.1638,
1893   author = {Anthony Desnos and Robert Erra and Eric Filiol},
1894   title = {Processor-Dependent Malware... and codes},
1895   year = {2010},
1896   comment = {arXiv:1011.1638},
1897   eprint = {arXiv:1011.1638}
1898 }
1899
1900 @BOOK{devaney,
1901   title = {An Introduction to Chaotic Dynamical Systems},
1902   publisher = {Addison-Wesley},
1903   year = {1989},
1904   author = {Devaney, Robert L.},
1905   address = {Redwood City, CA},
1906   edition = {2nd}
1907 }
1908
1909 @ARTICLE{diffie76,
1910   author = {Whitfield Diffie and Martin E. Hellman},
1911   title = {New Directions in Cryptography},
1912   journal = {IEEE Transactions on Information Theory},
1913   year = {1976},
1914   volume = {IT-22},
1915   pages = {644--654},
1916   number = {6},
1917   date = {November 1976},
1918   owner = {guyeux},
1919   timestamp = {2009.06.30},
1920   url = {citeseer.ist.psu.edu/diffie76new.html}
1921 }
1922
1923 @INCOLLECTION{Dijk10,
1924   author = {van Dijk, Marten and Gentry, Craig and Halevi, Shai and Vaikuntanathan,
1925         Vinod},
1926   title = {Fully Homomorphic Encryption over the Integers},
1927   booktitle = {Advances in Cryptology – EUROCRYPT 2010},
1928   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1929   year = {2010},
1930   editor = {Gilbert, Henri},
1931   volume = {6110},
1932   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1933   pages = {24-43},
1934   abstract = {We construct a simple fully homomorphic encryption scheme, using only
1935         elementary modular arithmetic. We use Gentry’s technique to construct
1936         a fully homomorphic scheme from a bootstrappable somewhat homomorphic
1937         scheme. However, instead of using ideal lattices over a polynomial
1938         ring, our bootstrappable encryption scheme merely uses addition and
1939         multiplication over the integers. The main appeal of our scheme is
1940         the conceptual simplicity. We reduce the security of our scheme to
1941         finding an approximate integer gcd – i.e., given a list of integers
1942         that are near-multiples of a hidden integer, output that hidden integer.
1943         We investigate the hardness of this task, building on earlier work
1944         of Howgrave-Graham.},
1945   affiliation = {MIT CSAIL}
1946 }
1947
1948 @ARTICLE{Dill1985,
1949   author = {Dill, KA},
1950   title = {Theory for the folding and stability of globular proteins.},
1951   journal = {Biochemistry},
1952   year = {1985},
1953   volume = {24},
1954   pages = {1501-9--},
1955   number = {6},
1956   month = mar,
1957   abstract = {Using lattice statistical mechanics, we develop theory to account
1958         for the folding of a heteropolymer molecule such as a protein to
1959         the globular and soluble state. Folding is assumed to be driven by
1960         the association of solvophobic monomers to avoid solvent and opposed
1961         by the chain configurational entropy. Theory predicts a phase transition
1962         as a function of temperature or solvent character. Molecules that
1963         are too short or too long or that have too few solvophobic residues
1964         are predicted not to fold. Globular molecules should have a largely
1965         solvophobic core, but there is an entropic tendency for some residues
1966         to be "out of place", particularly in small molecules. For long chains,
1967         molecules comprised of globular domains are predicted to be thermodynamically
1968         more stable than spherical molecules. The number of accessible conformations
1969         in the globular state is calculated to be an exceedingly small fraction
1970         of the number available to the random coil. Previous estimates of
1971         this number, which have motivated kinetic theories of folding, err
1972         by many tens of orders of magnitude.},
1973   comment = {Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
1974   keywords = {Mathematics, Models, Chemical, Polymers, Protein Conformation},
1975   owner = {christophe},
1976   timestamp = {2011.01.22},
1977   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/3986190}
1978 }
1979
1980 @ARTICLE{Dill1995,
1981   author = {Dill, KA and Bromberg, S and Yue, K and Fiebig, KM and Yee, DP and
1982         Thomas, PD and Chan, HS},
1983   title = {Principles of protein folding--a perspective from simple exact models.},
1984   journal = {Protein Sci},
1985   year = {1995},
1986   volume = {4},
1987   pages = {561-602--},
1988   number = {4},
1989   month = apr,
1990   abstract = {General principles of protein structure, stability, and folding kinetics
1991         have recently been explored in computer simulations of simple exact
1992         lattice models. These models represent protein chains at a rudimentary
1993         level, but they involve few parameters, approximations, or implicit
1994         biases, and they allow complete explorations of conformational and
1995         sequence spaces. Such simulations have resulted in testable predictions
1996         that are sometimes unanticipated: The folding code is mainly binary
1997         and delocalized throughout the amino acid sequence. The secondary
1998         and tertiary structures of a protein are specified mainly by the
1999         sequence of polar and nonpolar monomers. More specific interactions
2000         may refine the structure, rather than dominate the folding code.
2001         Simple exact models can account for the properties that characterize
2002         protein folding: two-state cooperativity, secondary and tertiary
2003         structures, and multistage folding kinetics--fast hydrophobic collapse
2004         followed by slower annealing. These studies suggest the possibility
2005         of creating "foldable" chain molecules other than proteins. The encoding
2006         of a unique compact chain conformation may not require amino acids;
2007         it may require only the ability to synthesize specific monomer sequences
2008         in which at least one monomer type is solvent-averse.},
2009   address = {Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California,
2010         San Francisco 94143-1204, USA.},
2011   comment = {Review,Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't,
2012         Non-P.H.S.,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
2013   keywords = {Amino Acid Sequence, Biological Evolution, Hydrogen Bonding, Models,
2014         Molecular, Molecular Sequence Data, Mutation, Protein Conformation,
2015         Protein Denaturation, Protein Folding, Temperature, Thermodynamics},
2016   owner = {christophe},
2017   timestamp = {2011.01.22},
2018   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/7613459}
2019 }
2020
2021 @INPROCEEDINGS{Dobbertin96,
2022   author = {Dobbertin, Hans},
2023   title = {Cryptanalysis of MD4},
2024   booktitle = {Proceedings of the Third International Workshop on Fast Software
2025         Encryption},
2026   year = {1996},
2027   pages = {53--69},
2028   address = {London, UK},
2029   publisher = {Springer-Verlag},
2030   isbn = {3-540-60865-6}
2031 }
2032
2033 @INPROCEEDINGS{DomingoFerrer2002,
2034   author = {Domingo-Ferrer, Josep},
2035   title = {A Provably Secure Additive and Multiplicative Privacy Homomorphism},
2036   booktitle = {ISC '02: Proceedings of the 5th International Conference on Information
2037         Security},
2038   year = {2002},
2039   pages = {471--483},
2040   address = {London, UK},
2041   publisher = {Springer-Verlag},
2042   isbn = {3-540-44270-7}
2043 }
2044
2045 @ARTICLE{Dubchak1995,
2046   author = {I. Dubchak and I. Muchnik and S. R. Holbrook and S. H. Kim},
2047   title = {Prediction of protein folding class using global description of amino
2048         acid sequence.},
2049   journal = {Proc Natl Acad Sci U S A},
2050   year = {1995},
2051   volume = {92},
2052   pages = {8700--8704},
2053   number = {19},
2054   month = {Sep},
2055   __markedentry = {[guyeux]},
2056   abstract = {We present a method for predicting protein folding class based on
2057         global protein chain description and a voting process. Selection
2058         of the best descriptors was achieved by a computer-simulated neural
2059         network trained on a data base consisting of 83 folding classes.
2060         Protein-chain descriptors include overall composition, transition,
2061         and distribution of amino acid attributes, such as relative hydrophobicity,
2062         predicted secondary structure, and predicted solvent exposure. Cross-validation
2063         testing was performed on 15 of the largest classes. The test shows
2064         that proteins were assigned to the correct class (correct positive
2065         prediction) with an average accuracy of 71.7\%, whereas the inverse
2066         prediction of proteins as not belonging to a particular class (correct
2067         negative prediction) was 90-95\% accurate. When tested on 254 structures
2068         used in this study, the top two predictions contained the correct
2069         class in 91\% of the cases.},
2070   institution = {Department of Chemistry, University of California, Berkeley 94720,
2071         USA.},
2072   keywords = {Amino Acid Sequence; Amino Acids, chemistry; Computer Simulation;
2073         Databases, Factual; Models, Chemical; Neural Networks (Computer);
2074         Protein Folding; Protein Structure, Secondary; Proteins, chemistry/classification;
2075         Reproducibility of Results; Solvents},
2076   language = {eng},
2077   medline-pst = {ppublish},
2078   owner = {guyeux},
2079   pmid = {7568000},
2080   timestamp = {2011.07.18}
2081 }
2082
2083 @BOOK{Dudley,
2084   title = {Real analysis and probability},
2085   publisher = {Cambridge University Press},
2086   author = {Richard M. Dudley},
2087   optpages = {209},
2088   owner = {guyeux},
2089   timestamp = {2008.01.02}
2090 }
2091
2092 @ARTICLE{Tarazi84,
2093   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2094   title = {Algorithmes mixtes asynchrones. Etude de convergence monotone},
2095   journal = {Numerische Mathematik},
2096   year = {1984},
2097   volume = {44},
2098   pages = {363-369},
2099   note = {10.1007/BF01405568},
2100   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2101         Box 5969 Kuwait},
2102   issn = {0029-599X},
2103   issue = {3},
2104   keyword = {Mathematics and Statistics},
2105   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2106   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01405568}
2107 }
2108
2109 @ARTICLE{Tarazi82,
2110   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2111   title = {Some convergence results for asynchronous algorithms},
2112   journal = {Numerische Mathematik},
2113   year = {1982},
2114   volume = {39},
2115   pages = {325-340},
2116   note = {10.1007/BF01407866},
2117   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2118         Box 5969 Kuwait Kuwait},
2119   issn = {0029-599X},
2120   issue = {3},
2121   keyword = {Mathematics and Statistics},
2122   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2123   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01407866}
2124 }
2125
2126 @ARTICLE{Fei2005,
2127   author = {Peng Fei and Qiu Shui-Sheng and Long Min},
2128   title = {A secure digital signature algorithm based on elliptic curve and
2129         chaotic mappings},
2130   journal = {Circuits Systems Signal Processing},
2131   year = {2005},
2132   volume = {24, No. 5},
2133   pages = {585--597},
2134   owner = {guyeux},
2135   timestamp = {2009.01.16}
2136 }
2137
2138 @BOOK{Feigenbaum1908,
2139   title = {Universal behavior in nonlinear systems},
2140   publisher = {Los Alamos Science},
2141   year = {1908},
2142   author = {Feigenbaum},
2143   owner = {guyeux},
2144   timestamp = {2008.01.02}
2145 }
2146
2147 @ARTICLE{Felsenstein1980,
2148   author = {J. Felsenstein},
2149   title = {A view of population genetics.},
2150   journal = {Science},
2151   year = {1980},
2152   volume = {208},
2153   pages = {1253},
2154   number = {4449},
2155   month = {Jun},
2156   doi = {10.1126/science.208.4449.1253},
2157   language = {eng},
2158   medline-pst = {ppublish},
2159   owner = {guyeux},
2160   pii = {208/4449/1253},
2161   pmid = {17830806},
2162   timestamp = {2011.05.05},
2163   url = {http://dx.doi.org/10.1126/science.208.4449.1253}
2164 }
2165
2166 @BOOK{Filiol09,
2167   title = {Les virus informatiques : techniques virales et antivirales avancées},
2168   year = {2009},
2169   editor = {Springer},
2170   author = {Eric Filiol},
2171   owner = {christophe},
2172   timestamp = {2010.10.13}
2173 }
2174
2175 @INPROCEEDINGS{FiliolBlackHat,
2176   author = {Eric Filiol},
2177   title = {Passive and Active Leakage of Secret Data from Non Networked Computer},
2178   booktitle = {Black Hat},
2179   year = {2008},
2180   owner = {christophe},
2181   timestamp = {2010.11.28}
2182 }
2183
2184 @PHDTHESIS{Formenti2003,
2185   author = {Enrico Formenti},
2186   title = {De l'algorithmique du chaos dans les systèmes dynamiques discrets},
2187   school = {Université de Provence},
2188   year = {2003},
2189   owner = {guyeux},
2190   timestamp = {2008.01.02}
2191 }
2192
2193 @PHDTHESIS{Formenti1998,
2194   author = {Enrico Formenti},
2195   title = {Automates cellulaires et chaos : de la vision topologique à la vision
2196         algorithmique},
2197   school = {\'Ecole Normale Supérieure de Lyon},
2198   year = {1998},
2199   optmonth = {Octobre},
2200   owner = {guyeux},
2201   timestamp = {2008.01.02}
2202 }
2203
2204 @ARTICLE{Frey2006,
2205   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2206   title = {Identification of circular codes in bacterial genomes and their use
2207         in a factorization method for retrieving the reading frames of genes.},
2208   journal = {Comput Biol Chem},
2209   year = {2006},
2210   volume = {30},
2211   pages = {87--101},
2212   number = {2},
2213   month = {Apr},
2214   abstract = {We developed a statistical method that allows each trinucleotide to
2215         be associated with a unique frame among the three possible ones in
2216         a (protein coding) gene. An extensive gene study in 175 complete
2217         bacterial genomes based on this statistical approach resulted in
2218         identification of 72 new circular codes. Finding a circular code
2219         enables an immediate retrieval of the reading frame locally anywhere
2220         in a gene. No knowledge of location of the start codon is required
2221         and a short window of only a few nucleotides is sufficient for automatic
2222         retrieval. We have therefore developed a factorization method (that
2223         explores previously found circular codes) for retrieving the reading
2224         frames of bacterial genes. Its principle is new and easy to understand.
2225         Neither complex treatment nor specific information on the nucleotide
2226         sequences is necessary. Moreover, the method can be used for short
2227         regions in nucleotide sequences (less than 25 nucleotides in protein
2228         coding genes). Selected additional properties of circular codes and
2229         their possible biological consequences are also discussed.},
2230   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001},
2231   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2232         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2233         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2234   keywords = {Base Sequence; Computational Biology; Genes, Bacterial; Genome, Bacterial;
2235         Genomics, statistics /&/ numerical data; Models, Genetic; Models,
2236         Statistical; Reading Frames},
2237   language = {eng},
2238   medline-pst = {ppublish},
2239   owner = {guyeux},
2240   pii = {S1476-9271(05)00111-8},
2241   pmid = {16439185},
2242   timestamp = {2011.05.05},
2243   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001}
2244 }
2245
2246 @ARTICLE{Frey2006a,
2247   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2248   title = {An analytical model of gene evolution with six mutation parameters:
2249         an application to archaeal circular codes.},
2250   journal = {Comput Biol Chem},
2251   year = {2006},
2252   volume = {30},
2253   pages = {1--11},
2254   number = {1},
2255   month = {Feb},
2256   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
2257         mutation matrix 64 x 64 with six substitution parameters associated
2258         with the transitions and transversions in the three trinucleotide
2259         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
2260         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
2261         x 64 with three parameters. It determines at some time t the exact
2262         occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly according
2263         to six substitution parameters. An application of this model allows
2264         an evolutionary study of the common circular code COM and the 15
2265         archaeal circular codes X which have been recently identified in
2266         several archaeal genomes. The main property of a circular code is
2267         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
2268         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
2269         with a window of a few nucleotides. In genes, the circular code is
2270         superimposed on the traditional genetic one. Very unexpectedly, the
2271         evolutionary model demonstrates that the archaeal circular codes
2272         can derive from the common circular code subjected to random substitutions
2273         with particular values for six substitutions parameters. It has a
2274         strong correlation with the statistical observations of three archaeal
2275         codes in actual genes. Furthermore, the properties of these substitution
2276         rates allow proposal of an evolutionary classification of the 15
2277         archaeal codes into three main classes according to this model. In
2278         almost all the cases, they agree with the actual degeneracy of the
2279         genetic code with substitutions more frequent in the third trinucleotide
2280         site and with transitions more frequent that transversions in any
2281         trinucleotide site.},
2282   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001},
2283   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2284         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2285         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2286   keywords = {Archaea, genetics; DNA, Circular; Evolution, Molecular; Genetic Code;
2287         Genome, Archaeal; Models, Genetic; Mutation; Trinucleotide Repeats},
2288   language = {eng},
2289   medline-pst = {ppublish},
2290   owner = {guyeux},
2291   pii = {S1476-9271(05)00083-6},
2292   pmid = {16324886},
2293   timestamp = {2011.05.05},
2294   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001}
2295 }
2296
2297 @INPROCEEDINGS{fgb11:ip,
2298   author = {Friot, Nicolas and Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2299   title = {Chaotic Iterations for Steganography - Stego-security and chaos-security},
2300   booktitle = {SECRYPT'2011, Int. Conf. on Security and Cryptography},
2301   year = {2011},
2302   pages = {***--***},
2303   address = {Sevilla, Spain},
2304   month = jul,
2305   note = {To appear},
2306   classement = {ACTI},
2307   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2308   equipe = {and},
2309   inhal = {no}
2310 }
2311
2312 @MISC{Frisch,
2313   author = {Alain Frisch},
2314   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2315   year = {1998},
2316   note = {Rapport de tipe},
2317   file = {Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:Chaos/Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:PDF},
2318   keywords = {Chaos, Entropie Topologique, Tipe},
2319   owner = {guyeux},
2320   timestamp = {2008.01.02},
2321   url = {http://alain.frisch.fr/math.html}
2322 }
2323
2324 @MISC{Frisch98,
2325   author = {Alain Frisch},
2326   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2327   year = {1998},
2328   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2329   url = {\url{http://alain.frisch.fr/math.html}}
2330 }
2331
2332 @ARTICLE{Frommer97asynchronousweighted,
2333   author = {Andreas Frommer and Hartmut Schwandt and Daniel and Daniel B. Szyld},
2334   title = {Asynchronous Weighted Additive Schwarz Methods},
2335   journal = {Electronic Transactions on Numerical Analysis},
2336   year = {1997},
2337   volume = {5},
2338   pages = {48--61}
2339 }
2340
2341 @MISC{Frommer94asynchronoustwo-stage,
2342   author = {Andreas Frommer and Daniel B. Szyld},
2343   title = {Asynchronous Two-Stage Iterative Methods},
2344   year = {1994}
2345 }
2346
2347 @BOOK{J1992,
2348   title = {Introduction to Chaos and Coherence},
2349   publisher = {IOP Publishing},
2350   year = {1992},
2351   author = {J. Frøyland},
2352   owner = {guyeux},
2353   timestamp = {2008.01.02}
2354 }
2355
2356 @MISC{Furon2002,
2357   author = {T. Furon},
2358   title = {Security analysis},
2359   year = {2002},
2360   note = {European Project IST-1999-10987 CERTIMARK, Deliverable D.5.5},
2361   owner = {guyeux},
2362   timestamp = {2009.06.30}
2363 }
2364
2365 @ARTICLE{Furon08,
2366   author = {Furon, Teddy and Bas, Patrick},
2367   title = {Broken arrows},
2368   journal = {EURASIP J. Inf. Secur.},
2369   year = {2008},
2370   volume = {2008},
2371   pages = {1--13},
2372   address = {New York, NY, United States},
2373   doi = {http://dx.doi.org/10.1155/2008/597040},
2374   issn = {1687-4161},
2375   owner = {christophe},
2376   publisher = {Hindawi Publishing Corp.},
2377   timestamp = {2010.03.06}
2378 }
2379
2380 @ARTICLE{P1150442004,
2381   author = {G.S.El-Taweel and H.M. Onsi and M.Samy and M.G. Darwish},
2382   title = {Secure and Non-Blind Watermarking Scheme for Color Images Based on
2383         DWT},
2384   journal = {ICGST International Journal on Graphics, Vision and Image Processing},
2385   year = {2005},
2386   volume = {05},
2387   pages = {1--5},
2388   month = {April},
2389   issue = {4},
2390   owner = {christophe},
2391   timestamp = {2010.03.07}
2392 }
2393
2394 @INPROCEEDINGS{Gentry09,
2395   author = {Gentry, Craig},
2396   title = {Fully homomorphic encryption using ideal lattices},
2397   booktitle = {STOC '09: Proceedings of the 41st annual ACM symposium on Theory
2398         of computing},
2399   year = {2009},
2400   pages = {169--178},
2401   address = {New York, NY, USA},
2402   publisher = {ACM},
2403   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1536414.1536440},
2404   isbn = {978-1-60558-506-2},
2405   location = {Bethesda, MD, USA}
2406 }
2407
2408 @INPROCEEDINGS{Girao04,
2409   author = {J. Girao and M. Schneider and D. Westhoff},
2410   title = {CDA: Concealed data aggregation in wireless sensor networks},
2411   booktitle = {Proceedings of the ACM Workshop on Wireless Security},
2412   year = {2004},
2413   owner = {christophe},
2414   timestamp = {2010.07.31}
2415 }
2416
2417 @CONFERENCE{Gotsman88,
2418   author = {C. Gotsman and D. Lehmann and E. Shamir},
2419   title = {Asynchronous Dynamics of Random Boolean Networks},
2420   booktitle = {San Diego '88 Neural Networks Conference},
2421   year = {1988},
2422   owner = {guyeux},
2423   timestamp = {30/03/2008}
2424 }
2425
2426 @ARTICLE{Guckenheimer1979,
2427   author = {J. Guckenheimer},
2428   title = {Sensitive dependence to initial conditions for one-dimensional maps},
2429   journal = {Comm. Math. Phys.},
2430   year = {1979},
2431   optpages = {133-160},
2432   owner = {guyeux},
2433   timestamp = {2008.01.02}
2434 }
2435
2436 @BOOK{J.1983,
2437   title = {Nonlinear oscillations, dynamical systems, and bifurcations of vector
2438         fields},
2439   publisher = {Springer Verlag},
2440   year = {1983},
2441   author = {J. Guckenheimer and P. Holmes},
2442   owner = {guyeux},
2443   timestamp = {2008.01.02}
2444 }
2445
2446 @ARTICLE{Guo20093201,
2447   author = {Wei Guo and Xiaoming Wang and Dake He and Yang Cao},
2448   title = {Cryptanalysis on a parallel keyed hash function based on chaotic
2449         maps},
2450   journal = {Physics Letters A},
2451   year = {2009},
2452   volume = {373},
2453   pages = {3201 - 3206},
2454   number = {36},
2455   abstract = {This Letter analyzes the security of a novel parallel keyed hash function
2456         based on chaotic maps, proposed by Xiao et al. to improve the efficiency
2457         in parallel computing environment. We show how to devise forgery
2458         attacks on Xiao's scheme with differential cryptanalysis and give
2459         the experiment results of two kinds of forgery attacks firstly. Furthermore,
2460         we discuss the problem of weak keys in the scheme and demonstrate
2461         how to utilize weak keys to construct collision.},
2462   issn = {0375-9601},
2463   keywords = {Cryptanalysis}
2464 }
2465
2466 @PHDTHESIS{GuyeuxThese10,
2467   author = {Christophe Guyeux},
2468   title = {Le d\'{e}sordre des it\'{e}rations chaotiques et leur utilit\'{e}
2469         en s\'{e}curit\'{e} informatique},
2470   school = {Universit\'{e} de Franche-Comt\'{e}},
2471   year = {2010},
2472   owner = {christophe},
2473   timestamp = {2010.12.21}
2474 }
2475
2476 @MISC{gb11:onp,
2477   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2478   title = {\'Etude topologique de l'\'etalement de spectre},
2479   howpublished = {Journ\'ees Codes et St\'eganographie, \'Ecoles Militaires de Saint-Cyr,
2480         Co\"etquidan},
2481   month = jan,
2482   year = {2011},
2483   classement = {COM},
2484   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2485   equipe = {and},
2486   inhal = {no}
2487 }
2488
2489 @INPROCEEDINGS{bg10:ip,
2490   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2491   title = {An improved watermarking algorithm for Internet applications},
2492   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
2493   year = {2010},
2494   pages = {119--124},
2495   address = {Valencia, Spain},
2496   month = sep,
2497   classement = {ACTI},
2498   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2499   equipe = {and},
2500   inhal = {no}
2501 }
2502
2503 @INPROCEEDINGS{gfb10:ip,
2504   author = {Guyeux, Christophe and Friot, Nicolas and Bahi, Jacques},
2505   title = {Chaotic iterations versus Spread-spectrum: chaos and stego security},
2506   booktitle = {IIH-MSP'10, 6-th Int. Conf. on Intelligent Information Hiding and
2507         Multimedia Signal Processing},
2508   year = {2010},
2509   pages = {208--211},
2510   address = {Darmstadt, Germany},
2511   month = oct,
2512   classement = {ACTI},
2513   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2514   equipe = {and},
2515   inhal = {no}
2516 }
2517
2518 @ARTICLE{friot10,
2519   author = {Christophe Guyeux and Nicolas Friot and Jacques M. Bahi},
2520   title = {A more secure information hiding scheme than spread-spectrum obtained
2521         by chaos-security},
2522   journal = {arXiv 0032565},
2523   year = {2010},
2524   owner = {guyeux},
2525   timestamp = {2010.04.30}
2526 }
2527
2528 @BOOK{ECC,
2529   title = {Guide to Elliptic Curve Cryptography},
2530   publisher = {Springer Professional Computing},
2531   year = {2004},
2532   editor = {Springer},
2533   author = {D. Hankerson and A. Menezes and S. Vanstone},
2534   owner = {christophe},
2535   timestamp = {2010.07.31}
2536 }
2537
2538 @ARTICLE{Hasegawa1985,
2539   author = {M. Hasegawa and H. Kishino and T. Yano},
2540   title = {Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial
2541         DNA.},
2542   journal = {J Mol Evol},
2543   year = {1985},
2544   volume = {22},
2545   pages = {160--174},
2546   number = {2},
2547   abstract = {A new statistical method for estimating divergence dates of species
2548         from DNA sequence data by a molecular clock approach is developed.
2549         This method takes into account effectively the information contained
2550         in a set of DNA sequence data. The molecular clock of mitochondrial
2551         DNA (mtDNA) was calibrated by setting the date of divergence between
2552         primates and ungulates at the Cretaceous-Tertiary boundary (65 million
2553         years ago), when the extinction of dinosaurs occurred. A generalized
2554         least-squares method was applied in fitting a model to mtDNA sequence
2555         data, and the clock gave dates of 92.3 +/- 11.7, 13.3 +/- 1.5, 10.9
2556         +/- 1.2, 3.7 +/- 0.6, and 2.7 +/- 0.6 million years ago (where the
2557         second of each pair of numbers is the standard deviation) for the
2558         separation of mouse, gibbon, orangutan, gorilla, and chimpanzee,
2559         respectively, from the line leading to humans. Although there is
2560         some uncertainty in the clock, this dating may pose a problem for
2561         the widely believed hypothesis that the pipedal creature Australopithecus
2562         afarensis, which lived some 3.7 million years ago at Laetoli in Tanzania
2563         and at Hadar in Ethiopia, was ancestral to man and evolved after
2564         the human-ape splitting. Another likelier possibility is that mtDNA
2565         was transferred through hybridization between a proto-human and a
2566         proto-chimpanzee after the former had developed bipedalism.},
2567   keywords = {Animals; Biological Evolution; DNA, Mitochondrial, genetics; Genes;
2568         Haplorhini, genetics; Humans; Mathematics; Models, Genetic; Nucleic
2569         Acid Hybridization; Primates, genetics; Proteins, genetics; Species
2570         Specificity},
2571   language = {eng},
2572   medline-pst = {ppublish},
2573   owner = {guyeux},
2574   pmid = {3934395},
2575   timestamp = {2011.05.05}
2576 }
2577
2578 @BOOK{R1994,
2579   title = {A First Course in Discrete Dynamical Systems},
2580   publisher = {Springer-Verlag},
2581   year = {1994},
2582   author = {R. Homlgren},
2583   optpages = {106},
2584   owner = {guyeux},
2585   timestamp = {2008.01.02}
2586 }
2587
2588 @INCOLLECTION{Hoque09,
2589   author = {Hoque, Md. and Chetty, Madhu and Sattar, Abdul},
2590   title = {Genetic Algorithm in Ab Initio Protein Structure Prediction Using
2591         Low Resolution Model: A Review},
2592   booktitle = {Biomedical Data and Applications},
2593   publisher = {Springer Berlin Heidelberg},
2594   year = {2009},
2595   editor = {Sidhu, Amandeep and Dillon, Tharam},
2596   volume = {224},
2597   series = {Studies in Computational Intelligence},
2598   pages = {317-342},
2599   affiliation = {IIIS, Griffith University, Nathan, QLD-4111 Australia}
2600 }
2601
2602 @CONFERENCE{Houmansadr09,
2603   author = {A. Houmansadr and N. Kiyavash and N. Borisov},
2604   title = {Rainbow: A robust and invisible non-blind watermark for network flows},
2605   booktitle = {NDSS’09: 16th Annual Network and Distributed System Security Symposium},
2606   year = {2009},
2607   owner = {christophe},
2608   timestamp = {2010.03.07}
2609 }
2610
2611 @ARTICLE{Huang,
2612   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J.},
2613   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2614   journal = {Wireless Networks},
2615   abstract = {Abstract\&nbsp;\&nbsp;This paper proposes a secure encrypted-data
2616         aggregation scheme for wireless sensor networks. Our design for data
2617         aggregation eliminates redundant sensor readings without using encryption
2618         and maintains data secrecy and privacy during transmission. Conventional
2619         aggregation functions operate when readings are received in plaintext.
2620         If readings are encrypted, aggregation requires decryption creating
2621         extra overhead and key management issues. In contrast to conventional
2622         schemes, our proposed scheme provides security and privacy, and duplicate
2623         instances of original readings will be aggregated into a single packet.
2624         Our scheme is resilient to known-plaintext attacks, chosen-plaintext
2625         attacks, ciphertext-only attacks and man-in-the-middle attacks. Our
2626         experiments show that our proposed aggregation method significantly
2627         reduces communication overhead and can be practically implemented
2628         in on-the-shelf sensor platforms.},
2629   citeulike-article-id = {4499496},
2630   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2631   citeulike-linkout-1 = {http://www.springerlink.com/content/g573138072642u63},
2632   doi = {10.1007/s11276-009-0177-y},
2633   posted-at = {2009-05-10 09:55:44},
2634   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y}
2635 }
2636
2637 @ARTICLE{Huang10,
2638   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J. D.},
2639   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2640   journal = {Wirel. Netw.},
2641   year = {2010},
2642   volume = {16},
2643   pages = {915--927},
2644   number = {4},
2645   address = {Hingham, MA, USA},
2646   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2647   issn = {1022-0038},
2648   publisher = {Kluwer Academic Publishers}
2649 }
2650
2651 @ARTICLE{W.2001,
2652   author = {W. Huang and X. Ye},
2653   title = {Homeomorphisms with the whole compacta being scrambled sets},
2654   journal = {Ergod. Th. Dynam. Systems},
2655   year = {2001},
2656   optnumber = {1},
2657   optpages = {77-91},
2658   optvolume = {21},
2659   owner = {guyeux},
2660   timestamp = {2008.01.02}
2661 }
2662
2663 @ARTICLE{Hurley1982,
2664   author = {M. Hurley},
2665   title = {Attractors, persistence and density of their bassin},
2666   journal = {Transactions of AMS},
2667   year = {1982},
2668   optpages = {247-271},
2669   optvolume = {269},
2670   owner = {guyeux},
2671   timestamp = {2008.01.02}
2672 }
2673
2674 @INPROCEEDINGS{Islam:2009:NMA:1695134.1695181,
2675   author = {Islam, Md. Kamrul and Chetty, Madhu},
2676   title = {Novel Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction},
2677   booktitle = {Proceedings of the 22nd Australasian Joint Conference on Advances
2678         in Artificial Intelligence},
2679   year = {2009},
2680   series = {AI '09},
2681   pages = {412--421},
2682   address = {Berlin, Heidelberg},
2683   publisher = {Springer-Verlag},
2684   acmid = {1695181},
2685   isbn = {978-3-642-10438-1},
2686   keywords = {Guided search space, Memetic Algorithm, Modified fitness function,
2687         Pair-wise-interchange, Schema preservation, Tabu Search},
2688   location = {Melbourne, Australia},
2689   numpages = {10}
2690 }
2691
2692 @PHDTHESIS{Jacquemard77,
2693   author = {C. Jacquemard},
2694   title = {Contribution à l'étude d'algorithmes à convergence monotone},
2695   school = {Université de Franche-Comté},
2696   year = {1977},
2697   owner = {christophe},
2698   timestamp = {2010.08.25}
2699 }
2700
2701 @BOOK{Jukes69,
2702   title = {{Evolution of Protein Molecules}},
2703   publisher = {Academy Press},
2704   year = {1969},
2705   editor = {Munro, H. N.},
2706   author = {Jukes, T. H. and Cantor, C. R.},
2707   booktitle = {Evolution of Protein Molecules},
2708   citeulike-article-id = {1673661},
2709   keywords = {compbio, fresco},
2710   posted-at = {2007-09-19 06:23:18},
2711   priority = {2}
2712 }
2713
2714 @INPROCEEDINGS{Kalker2001,
2715   author = {Kalker, T.},
2716   title = {Considerations on watermarking security},
2717   year = {2001},
2718   pages = {201--206},
2719   abstract = {In this paper we address the usually implicit assumption that digital
2720         watermarking has as its main target copyright and copy protection
2721         applications. From these target applications a great many conclusions
2722         are drawn about the required security of a watermarking system, and
2723         in fact, a considerably percentage of the watermarking literature
2724         has this very topic as its main focus of attention. In this paper
2725         we take a step back, and try to do a more careful analysis of the
2726         'watermarking-is-for-security-applications' paradigm. The intention
2727         of this paper is to discuss the meaning of the concept security in
2728         the context of watermarking, and try to show that one has to be careful
2729         in using analogies from the related field of cryptography},
2730   citeulike-article-id = {1226513},
2731   journal = {2001 IEEE Fourth Workshop on Multimedia Signal Processing},
2732   keywords = {security, wateramarking},
2733   owner = {guyeux},
2734   posted-at = {2007-04-14 14:30:06},
2735   priority = {2},
2736   timestamp = {2009.06.30}
2737 }
2738
2739 @ARTICLE{Kerckhoffs83,
2740   author = {Kerckhoffs, Auguste},
2741   title = {La cryptographie militaire},
2742   journal = {Journal des sciences militaires},
2743   year = {1883},
2744   volume = {IX},
2745   pages = {5--83},
2746   month = {January},
2747   abstract = {pp. 161–191, Feb. 1883.},
2748   citeulike-article-id = {505508},
2749   keywords = {cryptography, master},
2750   owner = {guyeux},
2751   posted-at = {2006-02-15 04:49:15},
2752   priority = {2},
2753   timestamp = {2009.06.30}
2754 }
2755
2756 @ARTICLE{Kimura80,
2757   author = {Kimura, Motoo},
2758   title = {A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions
2759         through comparative studies of nucleotide sequences},
2760   journal = {Journal of Molecular Evolution},
2761   year = {1980},
2762   volume = {16},
2763   pages = {111-120},
2764   note = {10.1007/BF01731581},
2765   affiliation = {National Institute of Genetics 411 Mishima Japan},
2766   issn = {0022-2844},
2767   issue = {2},
2768   keyword = {Biomedical and Life Sciences},
2769   publisher = {Springer New York},
2770   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01731581}
2771 }
2772
2773 @ARTICLE{Knudsen94,
2774   author = {Knudsen},
2775   title = {Chaos Without Nonperiodicity},
2776   journal = {Amer. Math. Monthly},
2777   year = {1994},
2778   volume = {101},
2779   owner = {guyeux},
2780   timestamp = {27/01/2008}
2781 }
2782
2783 @PHDTHESIS{Knudsen1994a,
2784   author = {C. Knudsen},
2785   title = {Aspects of noninvertible dynamics and chaos},
2786   school = {Technical University of Denmark},
2787   year = {1994},
2788   owner = {guyeux},
2789   timestamp = {2008.01.02}
2790 }
2791
2792 @ARTICLE{Kocarev06,
2793   author = {L. Kocarev and J. Szczepanski and J.M. Amigo and I. Tomovski},
2794   title = {Discrete Chaos - I: Theory},
2795   journal = {IEEE Trans. on Circuits Systems},
2796   year = {2006},
2797   volume = {53},
2798   pages = {1300-1309},
2799   owner = {christophe},
2800   timestamp = {2010.10.10}
2801 }
2802
2803 @INPROCEEDINGS{Kocher95cryptanalysisof,
2804   author = {Paul C. Kocher},
2805   title = {Cryptanalysis of Diffie-Hellman, RSA, DSS, and Other Systems Using
2806         Timing Attacks (Extended Abstract)},
2807   booktitle = {Advances in Cryptology, CRYPTO '95: 15th Annual International Cryptology
2808         Conference},
2809   year = {1995},
2810   pages = {27--31},
2811   publisher = {Springer-Verlag}
2812 }
2813
2814 @ARTICLE{Kullback1951,
2815   author = {Kullback, Solomon and Leibler, Richard A.},
2816   title = {On Information and Sufficiency},
2817   journal = {The Annals of Mathematical Statistics},
2818   year = {1951},
2819   volume = {22},
2820   pages = {79--86},
2821   number = {1},
2822   citeulike-article-id = {3245942},
2823   keywords = {file-import-08-09-12},
2824   owner = {guyeux},
2825   posted-at = {2008-09-12 14:30:37},
2826   priority = {2},
2827   timestamp = {2009.06.29}
2828 }
2829
2830 @MISC{ledoux,
2831   author = {Eshter Ledoux},
2832   title = {Introduction à la théorie du chaos},
2833   year = {2002},
2834   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2835   url = {\url{http://www.nux.be/eledoux/mem/node1.html}}
2836 }
2837
2838 @BOOK{Lehning1997,
2839   title = {Analyse en dimension finie},
2840   publisher = {Masson},
2841   year = {1997},
2842   author = {Lehning},
2843   optpages = {28},
2844   optvolume = {4},
2845   owner = {guyeux},
2846   timestamp = {2008.01.02}
2847 }
2848
2849 @ARTICLE{Lenstra01,
2850   author = {A.K. Lenstra and E.R. Verheul},
2851   title = {Selecting Cryptographic Key Sizes},
2852   journal = {Jour. of the International Association for Cryptologic Research},
2853   year = {2001},
2854   volume = {14},
2855   pages = {255-293},
2856   number = {4}
2857 }
2858
2859 @ARTICLE{Pitts59,
2860   author = {Lettvin, J.Y. and Maturana, H.R. and McCulloch, W.S. and Pitts, W.H.},
2861   title = {What the Frog's Eye Tells the Frog's Brain},
2862   journal = {Proceedings of the IRE},
2863   year = {1959},
2864   volume = {47},
2865   pages = {1940--51},
2866   number = {11},
2867   owner = {christophe},
2868   timestamp = {2010.12.21}
2869 }
2870
2871 @ARTICLE{Li75,
2872   author = {T. Y. Li and J. A. Yorke},
2873   title = {Period three implies chaos},
2874   journal = {Amer. Math. Monthly},
2875   year = {1975},
2876   volume = {82},
2877   pages = {985--992},
2878   number = {10},
2879   owner = {guyeux},
2880   timestamp = {27/01/2008}
2881 }
2882
2883 @ARTICLE{Xiao10,
2884   author = {Li, Yantao and Deng, Shaojiang and Xiao, Di},
2885   title = {A novel Hash algorithm construction based on chaotic neural network},
2886   journal = {Neural Computing and Applications},
2887   year = {2010},
2888   pages = {1-9},
2889   affiliation = {Chongqing University College of Computer Science 400044 Chongqing
2890         China},
2891   issn = {0941-0643},
2892   keyword = {Computer Science},
2893   publisher = {Springer London}
2894 }
2895
2896 @INPROCEEDINGS{Lin09,
2897   author = {Lin, Hua-Yi and Chiang, Tzu-Chiang},
2898   title = {Cooperative secure data aggregation in sensor networks using elliptic
2899         curve based cryptosystems},
2900   booktitle = {CDVE'09: Proceedings of the 6th international conference on Cooperative
2901         design, visualization, and engineering},
2902   year = {2009},
2903   pages = {384--387},
2904   address = {Berlin, Heidelberg},
2905   publisher = {Springer-Verlag},
2906   isbn = {3-642-04264-3, 978-3-642-04264-5},
2907   location = {Luxembourg, Luxembourg}
2908 }
2909
2910 @INPROCEEDINGS{Liu2008,
2911   author = {Liu, An and Ning, Peng},
2912   title = {TinyECC: A Configurable Library for Elliptic Curve Cryptography in
2913         Wireless Sensor Networks},
2914   booktitle = {7th International Conference on Information Processing in Sensor
2915         Networks (IPSN 2008)},
2916   year = {2008},
2917   pages = {245--256},
2918   month = {April},
2919   citeulike-article-id = {3041699},
2920   howpublished = {SPOTS Track},
2921   keywords = {hagg},
2922   posted-at = {2008-07-25 05:25:05},
2923   priority = {2}
2924 }
2925
2926 @ARTICLE{Liu2007bis,
2927   author = {Shao-Hui Liu and Hong-Xun Yao and Wen Gao and Yong-Liang Liu},
2928   title = {An image fragile watermark scheme based on chaotic image pattern
2929         and pixel-pairs},
2930   journal = {Applied Mathematics and Computation},
2931   year = {2007},
2932   volume = {185},
2933   pages = {869-882},
2934   owner = {guyeux},
2935   timestamp = {2008.10.07}
2936 }
2937
2938 @INPROCEEDINGS{Liu07,
2939   author = {Liu, Zhen and Xi, Lifeng},
2940   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2941   booktitle = {KES '07: Knowledge-Based Intelligent Information and Engineering
2942         Systems and the XVII Italian Workshop on Neural Networks on Proceedings
2943         of the 11th International Conference},
2944   year = {2007},
2945   pages = {202--208},
2946   address = {Berlin, Heidelberg},
2947   publisher = {Springer-Verlag},
2948   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74827-4_26},
2949   isbn = {978-3-540-74826-7},
2950   location = {Vietri sul Mare, Italy}
2951 }
2952
2953 @ARTICLE{Liu2007,
2954   author = {Zhen Liu and Lifeng Xi},
2955   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2956   journal = {LNAI},
2957   year = {2007},
2958   volume = {4693},
2959   pages = {202-208},
2960   owner = {guyeux},
2961   timestamp = {11/04/2008}
2962 }
2963
2964 @ARTICLE{Lubachevsky86,
2965   author = {Lubachevsky, Boris and Mitra, Debasis},
2966   title = {A chaotic asynchronous algorithm for computing the fixed point of
2967         a nonnegative matrix of unit spectral radius},
2968   journal = {J. ACM},
2969   year = {1986},
2970   volume = {33},
2971   pages = {130--150},
2972   number = {1},
2973   address = {New York, NY, USA},
2974   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/4904.4801},
2975   issn = {0004-5411},
2976   publisher = {ACM}
2977 }
2978
2979 @ARTICLE{Larger10,
2980   author = {{L}arger, {L}. and {D}udley, {J}.{M}.},
2981   title = { {N}onlinear dynamics {O}ptoelectronic chaos},
2982   journal = {{N}ature },
2983   year = {2010},
2984   volume = {465 },
2985   pages = {41-42 },
2986   number = {7294 },
2987   month = {05},
2988   abstract = {{O}ptoelectronic circuits with delayed feedback provide a convenient
2989         bench-top platform to study a wide range of nonlinear dynamic systems,
2990         from ultrastable clocks to complex chaotic devices.},
2991   affiliation = {{F}ranche-{C}omt{\'e} {\'E}lectronique {M}{\'e}canique, {T}hermique
2992         et {O}ptique - {S}ciences et {T}echnologies - {FEMTO}-{ST} - {CNRS}
2993         : {UMR}6174 - {U}niversit{\'e} de {F}ranche-{C}omt{\'e} - {U}niversit{\'e}
2994         de {T}echnologie de {B}elfort-{M}ontbeliard - {E}cole {N}ationale
2995         {S}up{\'e}rieure de {M}{\'e}canique et des {M}icrotechniques },
2996   audience = {internationale },
2997   day = {05},
2998   doi = {10.1038/465041a },
2999   hal_id = {hal-00517696},
3000   language = {{A}nglais},
3001   url = {http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00517696/en/}
3002 }
3003
3004 @INPROCEEDINGS{Mahoney00,
3005   author = {Mahoney, Matthew V.},
3006   title = {Fast Text Compression with Neural Networks},
3007   booktitle = {Proceedings of the Thirteenth International Florida Artificial Intelligence
3008         Research Society Conference},
3009   year = {2000},
3010   pages = {230--234},
3011   publisher = {AAAI Press},
3012   acmid = {707654},
3013   isbn = {1-57735-113-4},
3014   numpages = {5}
3015 }
3016
3017 @INPROCEEDINGS{msp10:bl,
3018   author = {Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid and Pham, Congduc},
3019   title = {Risk Management in Intrusion Detection Applications with Wireless
3020         Video Sensor Networks},
3021   booktitle = {WCNC'10 IEEE Int. Conf.},
3022   year = {2010},
3023   pages = {***--***},
3024   address = {Sydney, Australia},
3025   month = apr,
3026   note = {To appear},
3027   classement = {*},
3028   equipe = {and},
3029   inhal = {no}
3030 }
3031
3032 @ARTICLE{Malvar03,
3033   author = {H.S. Malvar and D. Florêncio},
3034   title = {Improved Spread Spectrum: A New Modulation Technique for Robust Watermarking},
3035   journal = {IEEE Trans. Signal Proceeding},
3036   year = {2003},
3037   volume = {53},
3038   pages = {898--905},
3039   owner = {christophe},
3040   timestamp = {2010.03.07}
3041 }
3042
3043 @ARTICLE{Marsaglia2003,
3044   author = {G. Marsaglia},
3045   title = {Xorshift RNGs},
3046   journal = {Journal of Statistical Software},
3047   year = {2003},
3048   volume = {8(14)},
3049   pages = {1--6},
3050   owner = {qianxue},
3051   timestamp = {2009.10.28}
3052 }
3053
3054 @ARTICLE{Marsaglia1996,
3055   author = {G. Marsaglia},
3056   title = {DIEHARD: a battery of tests of randomness.},
3057   journal = {http://stat.fsu.edu/~geo/diehard.html},
3058   year = {1996},
3059   owner = {qianxue},
3060   timestamp = {2009.11.09}
3061 }
3062
3063 @ARTICLE{Simard07testu01:a,
3064     author = {Richard Simard and Université De Montréal},
3065     title = {TestU01: A C library for empirical testing of random number generators},
3066     journal = {ACM Transactions on Mathematical Software},
3067     year = {2007},
3068     pages = {2007}
3069 }
3070
3071 @ARTICLE{DefiningChaos,
3072   author = {M. Martelli and M. Dang and T. Seph},
3073   title = {Defining chaos},
3074   journal = {Mathematics Magazine},
3075   year = {1998},
3076   volume = {71},
3077   pages = {112--122},
3078   owner = {christophe},
3079   timestamp = {2010.08.11}
3080 }
3081
3082 @ARTICLE{Michel2007c,
3083   author = {Christian J Michel},
3084   title = {An analytical model of gene evolution with 9 mutation parameters:
3085         an application to the amino acids coded by the common circular code.},
3086   journal = {Bull Math Biol},
3087   year = {2007},
3088   volume = {69},
3089   pages = {677--698},
3090   number = {2},
3091   month = {Feb},
3092   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
3093         mutation matrix 64 x 64 with nine substitution parameters associated
3094         with the three types of substitutions in the three trinucleotide
3095         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
3096         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
3097         x 64 with three and six parameters. It determines at some time t
3098         the exact occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly
3099         according to these nine substitution parameters. An application of
3100         this model allows an evolutionary study of the common circular code
3101         [Formula: see text] of eukaryotes and prokaryotes and its 12 coded
3102         amino acids. The main property of this code [Formula: see text] is
3103         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
3104         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
3105         with a window of a few nucleotides. However, since its identification
3106         in 1996, amino acid information coded by [Formula: see text] has
3107         never been studied. Very unexpectedly, this evolutionary model demonstrates
3108         that random substitutions in this code [Formula: see text] and with
3109         particular values for the nine substitutions parameters retrieve
3110         after a certain time of evolution a frequency distribution of these
3111         12 amino acids very close to the one coded by the actual genes.},
3112   doi = {10.1007/s11538-006-9147-z},
3113   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
3114         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
3115         67400 Illkirch, France. michel@dpt-info.u-strasbg.fr},
3116   keywords = {Amino Acids, genetics; Codon, genetics; Eukaryotic Cells; Evolution,
3117         Molecular; Models, Genetic; Prokaryotic Cells},
3118   language = {eng},
3119   medline-pst = {ppublish},
3120   owner = {guyeux},
3121   pmid = {16952018},
3122   timestamp = {2011.05.05},
3123   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-006-9147-z}
3124 }
3125
3126 @ARTICLE{Miellou75,
3127   author = {J.-C. Miellou},
3128   title = {Algorithmes de relaxation chaotique \`{a} retards},
3129   journal = {Rairo},
3130   year = {1975},
3131   volume = {R1},
3132   pages = {148-162},
3133   owner = {guyeux},
3134   timestamp = {2008.05.22}
3135 }
3136
3137 @ARTICLE{Miellou75b,
3138   author = {Miellou, J.-C.},
3139   title = {Itérations chaotiques à retards, étude de la convergence dans le
3140         cas d'espaces partiellement ordonnés},
3141   journal = {C.R.A.S. Paris},
3142   year = {1975},
3143   volume = {280},
3144   pages = {233--236},
3145   owner = {christophe},
3146   timestamp = {2010.08.17}
3147 }
3148
3149 @ARTICLE{Spiteri85,
3150   author = {Jean-Claude Miellou and Pierre Spitéri},
3151   title = {Un critère de convergence pour des méthodes générales de point fixe},
3152   journal = {Rairo -- Modélisation mathématique et analyse numérique},
3153   year = {1985},
3154   volume = {19},
3155   pages = {645--669},
3156   number = {4},
3157   owner = {christophe},
3158   timestamp = {2010.10.13}
3159 }
3160
3161 @ARTICLE{Mooney08,
3162   author = {Aidan Mooney and John G. Keating and Ioannis Pitas},
3163   title = {A comparative study of chaotic and white noise signals in digital
3164         watermarking},
3165   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
3166   year = {2008},
3167   volume = {35},
3168   pages = {913-921},
3169   owner = {christophe},
3170   timestamp = {2010.03.01}
3171 }
3172
3173 @ARTICLE{Nakashima2003,
3174   author = {Nakashima, Y. and Tachibana, R. and Babaguchi, N.},
3175   title = {Watermarked Movie Soundtrack Finds the Position of the Camcorder
3176         in a Theater},
3177   journal = {IEEE Transactions on Multimedia},
3178   year = {2009},
3179   note = {Accepted for future publication Multimedia}
3180 }
3181
3182 @INCOLLECTION{springerlink:10.1007/978-3-642-04431-1_16,
3183   author = {Nelson, Michael and Nahapetian, Ani and Koushanfar, Farinaz and Potkonjak,
3184         Miodrag},
3185   title = {SVD-Based Ghost Circuitry Detection},
3186   booktitle = {Information Hiding},
3187   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
3188   year = {2009},
3189   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Sadeghi, Ahmad-Reza},
3190   volume = {5806},
3191   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3192   pages = {221-234},
3193   note = {10.1007/978-3-642-04431-1_16},
3194   affiliation = {Computer Science Department, UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA},
3195   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04431-1_16}
3196 }
3197
3198 @INPROCEEDINGS{Perez-Hernandez09,
3199   author = {P\'{e}rez-Hern\'{a}ndez, Luis Germ\'{a}n and Rodr\'{\i}guez-V\'{a}zquez,
3200         Katya and Gardu\~{n}o-Ju\'{a}rez, Ram\'{o}n},
3201   title = {Parallel particle swarm optimization applied to the protein folding
3202         problem},
3203   booktitle = {Proceedings of the 11th Annual conference on Genetic and evolutionary
3204         computation},
3205   year = {2009},
3206   series = {GECCO '09},
3207   pages = {1791--1792},
3208   address = {New York, NY, USA},
3209   publisher = {ACM},
3210   acmid = {1570163},
3211   isbn = {978-1-60558-325-9},
3212   keywords = {bioinformatics, biology and chemistry, combinatorial optimization,
3213         parallelization, swarm intelligence},
3214   location = {Montreal, Qu\&\#233;bec, Canada},
3215   numpages = {2}
3216 }
3217
3218 @PHDTHESIS{Pellegrin1986,
3219   author = {D. Pellegrin},
3220   title = {Algorithmique discr\`{e}te et r\'{e}seaux d'automates},
3221   school = {Grenoble},
3222   year = {1986},
3223   owner = {guyeux},
3224   timestamp = {2008.05.22}
3225 }
3226
3227 @ARTICLE{Peng2005,
3228   author = {F. Peng and S.-S. Qiu and M. Long},
3229   title = {One way Hash function construction based on two-dimensional hyperchaotic
3230         mappings},
3231   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3232   year = {2005},
3233   volume = {54},
3234   pages = {98--104},
3235   owner = {guyeux},
3236   timestamp = {2009.01.16}
3237 }
3238
3239 @INPROCEEDINGS{Perez06,
3240   author = {Luis Perez-Freire and F. Pérez-gonzalez and Pedro Comesaña},
3241   title = {Secret Dither Estimation in Lattice-Quantization Data Hiding: A Set-Membership
3242         Approach},
3243   booktitle = {Security, Steganography, and Watermarking of Multimedia Contents},
3244   year = {2006},
3245   editor = {Edward J. Delp and Ping W. Wong},
3246   address = {San Jose, California, USA},
3247   month = {January},
3248   organization = {SPIE},
3249   owner = {guyeux},
3250   timestamp = {2009.06.30}
3251 }
3252
3253 @INPROCEEDINGS{Perez-Freire06,
3254   author = {Luis Perez-Freire and Pedro Comesana and Juan Ramon Troncoso-Pastoriza
3255         and Fernando Perez-Gonzalez},
3256   title = {Watermarking Security: a Survey},
3257   booktitle = {LNCS Transactions on Data Hiding and Multimedia Security},
3258   year = {2006},
3259   owner = {guyeux},
3260   timestamp = {2009.06.29}
3261 }
3262
3263 @PROCEEDINGS{Peter07,
3264   title = {On Concealed Data Aggregation for WSNs},
3265   year = {2007},
3266   author = {Peter, Steffen and Piotrowski, Krzysztof and Langendoerfer, Peter},
3267   booktitle = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3268         4th IEEE},
3269   citeulike-article-id = {2281643},
3270   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45},
3271   citeulike-linkout-1 = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs\_all.jsp?arnumber=4199133},
3272   doi = {10.1109/CCNC.2007.45},
3273   journal = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3274         4th IEEE},
3275   keywords = {hagg},
3276   pages = {192--196},
3277   posted-at = {2008-01-23 19:36:19},
3278   priority = {3},
3279   url = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45}
3280 }
3281
3282 @ARTICLE{pms11:ij,
3283   author = {Pham, Congduc and Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid},
3284   title = {Risk-based Adaptive Scheduling in Randomly Deployed Video Sensor
3285         Networks for Critical Surveillance Applications},
3286   journal = {Journal of Network and Computer Applications},
3287   year = {2011},
3288   volume = {*},
3289   pages = {***--***},
3290   number = {*},
3291   note = {Accepted manuscript. To appear},
3292   classement = {ACLI},
3293   equipe = {and},
3294   impact-factor = {1.111},
3295   inhal = {no},
3296   isi-acro = {J NETW COMPU APPL},
3297   publisher = {Springer}
3298 }
3299
3300 @MISC{Poe,
3301   author = {Edgar Alan Poe},
3302   title = {The Raven},
3303   month = {April},
3304   year = {1839},
3305   note = {American Museum (Baltimore)},
3306   owner = {christophe},
3307   timestamp = {2010.11.23}
3308 }
3309
3310 @ARTICLE{Perez-Freire2006:Security,
3311   author = {L. P{\'e}rez-Freire and F. P{\'e}rez-González and T. Furon and P.
3312         Comesaña},
3313   title = {Security of lattice-based data hiding against the known message attack},
3314   journal = {IEEE Trans. on Information Forensics and Security},
3315   year = {2006},
3316   volume = {1},
3317   pages = {421-439},
3318   number = {4},
3319   month = {dec},
3320   owner = {guyeux},
3321   timestamp = {2009.12.06}
3322 }
3323
3324 @MISC{Quisquater02sidechannel,
3325   author = {J-J. Quisquater and D. Samyde and Université Catholique De Louvain
3326         and Groupe Crypto},
3327   title = {Side Channel Cryptanalysis},
3328   year = {2002}
3329 }
3330
3331 @ARTICLE{Raynal2001,
3332   author = {Frédéric Raynal and Fabien A. P. Petitcolas and Caroline Fontaine},
3333   title = {Evaluation automatique des méthodes de tatouage},
3334   journal = {Traitement du signal},
3335   year = {2001},
3336   volume = {18},
3337   pages = {271-282},
3338   owner = {guyeux},
3339   timestamp = {2008.05.21}
3340 }
3341
3342 @MISC{rijmen05,
3343   author = {Vincent Rijmen and Elisabeth Oswald},
3344   title = {Update on SHA-1},
3345   howpublished = {Cryptology ePrint Archive, Report 2005/010},
3346   year = {2005},
3347   note = {\url{http://eprint.iacr.org/}}
3348 }
3349
3350 @BOOK{Robert,
3351   title = {Discrete Iterations, a Metric Study},
3352   publisher = {Springer-Verlag},
3353   year = {1986},
3354   editor = {Berlin Heidelberg New-York},
3355   author = {François Robert},
3356   volume = {6},
3357   series = {Series in Computational Mathematics}
3358 }
3359
3360 @BOOK{Robert1986,
3361   title = {Discrete Iterations: A Metric Study},
3362   year = {1986},
3363   editor = {Springer-Verlag},
3364   author = {F. Robert},
3365   volume = {6},
3366   series = {Springer Series in Computational Mathematics},
3367   owner = {guyeux},
3368   timestamp = {17/02/2008}
3369 }
3370
3371 @ARTICLE{Rudenko08,
3372   author = {Rudenko, O. and Snytkin, M.},
3373   title = {Image compression based on the neural network art},
3374   journal = {Cybernetics and Systems Analysis},
3375   year = {2008},
3376   volume = {44},
3377   pages = {797-802},
3378   affiliation = {Kharkov National University of Radio Electronics Kharkov Ukraine},
3379   issn = {1060-0396},
3380   issue = {6},
3381   keyword = {Computer Science},
3382   publisher = {Springer New York}
3383 }
3384
3385 @PHDTHESIS{Ruette2001,
3386   author = {Sylvie Ruette},
3387   title = {Chaos en dynamique topologique, en particulier sur l'intervalle,
3388         mesures d'entropie maximale},
3389   school = {Université d'Aix-Marseille II},
3390   year = {2001},
3391   optmonth = {Novembre},
3392   owner = {guyeux},
3393   timestamp = {2008.01.02}
3394 }
3395
3396 @MASTERSTHESIS{Saulnier02,
3397   author = {Boris Saulnier},
3398   title = {Entropie topologique},
3399   school = {DEA Sémantique, Preuves et Langages, Paris 7},
3400   year = {2002},
3401   owner = {christophe},
3402   timestamp = {2010.08.12}
3403 }
3404
3405 @ARTICLE{Schmitz2001,
3406   author = {Roland Schmitz},
3407   title = {Use of chaotic dynamical systems in cryptography},
3408   journal = {Journal of Franklin Institute},
3409   year = {2001},
3410   volume = {338},
3411   pages = {429-441},
3412   owner = {guyeux},
3413   timestamp = {17/02/2008}
3414 }
3415
3416 @BOOK{Schwartz80,
3417   title = {Analyse: topologie g\'{e}n\'{e}rale et analyse fonctionnelle},
3418   publisher = {Hermann},
3419   year = {1980},
3420   editor = {Hermann},
3421   author = {Laurent Schwartz},
3422   owner = {christophe},
3423   timestamp = {2010.09.15}
3424 }
3425
3426 @ARTICLE{Shannon49,
3427   author = {Shannon, Claude E.},
3428   title = {Communication Theory of Secrecy Systems},
3429   journal = {Bell Systems Technical Journal},
3430   year = {1949},
3431   volume = {28},
3432   pages = {656--715},
3433   citeulike-article-id = {507362},
3434   keywords = {master, secrecy\_systems, teoria-informacao, theory\_communication,
3435         theory\_cryptography},
3436   owner = {guyeux},
3437   posted-at = {2006-02-16 23:24:09},
3438   priority = {2},
3439   timestamp = {2009.06.29}
3440 }
3441
3442 @ARTICLE{Shmygelska05,
3443   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger},
3444   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3445         polar protein folding problem},
3446   journal = {BMC Bioinformatics},
3447   year = {2005},
3448   volume = {6},
3449   pages = {30},
3450   number = {1},
3451   abstract = {BACKGROUND:The protein folding problem is a fundamental problems in
3452         computational molecular biology and biochemical physics. Various
3453         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3454         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3455         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3456         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3457         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3458         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3459         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3460         simple model - the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3461         (HP) model.RESULTS:We present an improvement of our previous ACO
3462         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3463         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3464         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3465         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3466         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3467         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3468         a more diverse set of native conformations.CONCLUSIONS:The application
3469         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3470         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3471         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3472         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3473         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3474         for more complex and realistic models of protein structure holds
3475         significant promise.},
3476   doi = {10.1186/1471-2105-6-30},
3477   issn = {1471-2105},
3478   pubmedid = {15710037}
3479 }
3480
3481 @OTHER{Shmygelska2005Feb,
3482   __markedentry = {[christophe]},
3483   abstract = {Abstract Background The protein folding problem is a fundamental problems
3484         in computational molecular biology and biochemical physics. Various
3485         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3486         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3487         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3488         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3489         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3490         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3491         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3492         simple model – the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3493         (HP) model. Results We present an improvement of our previous ACO
3494         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3495         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3496         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3497         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3498         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3499         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3500         a more diverse set of native conformations. Conclusions The application
3501         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3502         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3503         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3504         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3505         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3506         for more complex and realistic models of protein structure holds
3507         significant promise.},
3508   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger H},
3509   journal = {BMC Bioinformatics. 2005 Feb 14},
3510   number = {1},
3511   owner = {christophe},
3512   pages = {30},
3513   timestamp = {2011.01.24},
3514   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3515         polar protein folding problem},
3516   volume = {6},
3517   year = {2005 Feb}
3518 }
3519
3520 @ARTICLE{Shujun1,
3521   author = {Li Shujun and Li Qi and Li Wenmin and Mou Xuanqin and Cai Yuanlong},
3522   title = {Statistical Properties of Digital Piecewise Linear Chaotic Maps and
3523         Their Roles in Cryptography and Pseudo-Random Coding},
3524   journal = {Proceedings of the 8th IMA International Conference on Cryptography
3525         and Coding},
3526   year = {2001},
3527   volume = {1},
3528   pages = {205--221},
3529   owner = {christophe},
3530   timestamp = {2010.03.06}
3531 }
3532
3533 @INPROCEEDINGS{Simmons83,
3534   author = {Gustavus J. Simmons},
3535   title = {The Prisoners' Problem and the Subliminal Channel},
3536   booktitle = {Advances in Cryptology, Proc. CRYPTO'83},
3537   year = {1984},
3538   pages = {51--67},
3539   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3540   owner = {guyeux},
3541   timestamp = {2009.06.29}
3542 }
3543
3544 @ARTICLE{Solak2004389,
3545   author = {Ercan Solak},
3546   title = {On the security of a class of discrete-time chaotic cryptosystems},
3547   journal = {Physics Letters A},
3548   year = {2004},
3549   volume = {320},
3550   pages = {389 - 395},
3551   number = {5-6},
3552   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2003.11.008},
3553   issn = {0375-9601},
3554   keywords = {Communication using chaos},
3555   owner = {guyeux},
3556   timestamp = {2009.12.12},
3557   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4B22RC9-2/2/99a0af737c9b6ba8af47ae4d3c7a326d}
3558 }
3559
3560 @PHDTHESIS{Spiteri74,
3561   author = {Pierre Spitéri},
3562   title = {Contribution à l'étude de la stabilite au sens de liapounov de certains
3563         systemes differentiels non lineaires},
3564   school = {Université de Franche-Comté},
3565   year = {1974},
3566   owner = {christophe},
3567   timestamp = {2010.10.13}
3568 }
3569
3570 @BOOK{Stewart1989,
3571   title = {Does God Play Dices ?: the mathematics of chaos},
3572   publisher = {Penguin},
3573   year = {1989},
3574   author = {Ian Stewart},
3575   owner = {guyeux},
3576   timestamp = {2008.01.02}
3577 }
3578
3579 @BOOK{Stinson02,
3580   title = {Cryptography: Theory and Practice, Second Edition},
3581   publisher = {{Chapman \& Hall/CRC}},
3582   year = {2002},
3583   author = {Stinson, Douglas R.},
3584   month = {February},
3585   abstract = {{Douglas R. Stinson's <I>Cryptography: Theory and Practice</I> is
3586         a mathematically intensive examination of cryptography, including
3587         ciphers, the Data Encryption Standard (DES), public key cryptography,
3588         one-way hash functions, and digital signatures. Stinson's explication
3589         of "zero-sum proofs"--a process by which one person lets another
3590         person know that he or she has a password without actually revealing
3591         any information--is especially good.<P> If you are new to the math
3592         behind cryptography but want to tackle it, the author covers all
3593         of the required background to understand the real mathematics here.
3594         <I>Cryptography</I> includes extensive exercises with each chapter
3595         and makes an ideal introduction for any math-literate person willing
3596         to get acquainted with this material.} {<P>Major advances over the
3597         last five years precipitated this major revision of the bestselling
3598         Cryptography: Theory and Practice. With more than 40 percent new
3599         or updated material, the second edition now provides an even more
3600         comprehensive treatment of modern cryptography. It focuses on the
3601         new Advanced Encryption Standards and features an entirely new chapter
3602         on that subject. Another new chapter explores the applications of
3603         secret sharing schemes, including ramp schemes, visual cryptography,
3604         threshold cryptography, and broadcast encryption. This is an ideal
3605         introductory text for both computer science and mathematics students
3606         and a valuable reference for professionals.</P>}},
3607   citeulike-article-id = {2401855},
3608   day = {27},
3609   howpublished = {Hardcover},
3610   isbn = {1584882069},
3611   keywords = {security},
3612   posted-at = {2008-02-20 08:28:49},
3613   priority = {0},
3614   url = {http://www.amazon.com/exec/obidos/redirect?tag=citeulike07-20\&path=ASIN/1584882069}
3615 }
3616
3617 @INPROCEEDINGS{Takana90,
3618   author = {K. Tanaka and Y. Nakamura and K. Matsui},
3619   title = {Embedding Secret Information into a Dithered Multi-level Image},
3620   booktitle = {IEEE Military Communications Conference},
3621   year = {1990},
3622   owner = {christophe},
3623   timestamp = {2010.08.05}
3624 }
3625
3626 @PHDTHESIS{ElTarazi81,
3627   author = {M. N. El Tarazi},
3628   title = {Contraction et ordre partiel pour l'étude d'algorithmes synchrones
3629         et asynchrones en analyse numérique},
3630   school = {Faculté des Sciences et Techniques de l'Université de Franche-Comté,
3631         Besançon},
3632   year = {1981},
3633   owner = {christophe},
3634   timestamp = {2010.08.17}
3635 }
3636
3637 @INPROCEEDINGS{Unger93,
3638   author = {Unger, Ron and Moult, John},
3639   title = {Genetic Algorithm for 3D Protein Folding Simulations},
3640   booktitle = {Proceedings of the 5th International Conference on Genetic Algorithms},
3641   year = {1993},
3642   pages = {581--588},
3643   address = {San Francisco, CA, USA},
3644   publisher = {Morgan Kaufmann Publishers Inc.},
3645   acmid = {657747},
3646   isbn = {1-55860-299-2},
3647   numpages = {8}
3648 }
3649
3650 @MISC{Van93electronicwater,
3651   author = {Tirkel Rankin Van},
3652   title = {Electronic Water Mark},
3653   year = {1993}
3654 }
3655
3656 @ARTICLE{Venkatesan2007397,
3657   author = {R.C. Venkatesan},
3658   title = {Encryption of covert information into multiple statistical distributions},
3659   journal = {Physics Letters A},
3660   year = {2007},
3661   volume = {370},
3662   pages = {397 - 404},
3663   number = {5-6},
3664   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.05.117},
3665   issn = {0375-9601},
3666   keywords = {Statistical encryption/decryption},
3667   owner = {guyeux},
3668   timestamp = {2009.12.12},
3669   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4P4FV2M-1/2/cd11a2ec144526e3c4552d2a7e7906cc}
3670 }
3671
3672 @ARTICLE{pitas,
3673   author = {G. Voyatzis and I. Pitas},
3674   title = {Chaotic watermarks for embedding in the spatial digital image domain},
3675   journal = {Proceedings of IEEE ICIP},
3676   year = {1998},
3677   volume = {2},
3678   pages = {432-436},
3679   owner = {christophe},
3680   timestamp = {2010.03.06}
3681 }
3682
3683 @INCOLLECTION{Wagner03,
3684   author = {Wagner, David},
3685   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3686   booktitle = {Information Security},
3687   publisher = {Springer Berlin, Heidelberg},
3688   year = {2003},
3689   volume = {2851},
3690   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3691   pages = {234-239},
3692   abstract = {We use linear algebra to show that an algebraic privacy homomorphism
3693         proposed by Domingo-Ferrer is insecure for some parameter settings.},
3694   affiliation = {University of California, Berkeley USA}
3695 }
3696
3697 @INPROCEEDINGS{Wagner03cryptanalysisof,
3698   author = {David Wagner},
3699   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3700   booktitle = {Proc. Sixth Information Security Conf. (ISC03},
3701   year = {2003},
3702   pages = {234--239}
3703 }
3704
3705 @ARTICLE{Wang_ellipticcurve,
3706   author = {Haodong Wang and Bo Sheng and Qun Li},
3707   title = {Elliptic curve cryptography-based access control in sensor networks},
3708   journal = {Int. J. Security and Networks}
3709 }
3710
3711 @INPROCEEDINGS{wbg10:ip,
3712   author = {Wang, Qianxue and Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Fang,
3713         Xiaole},
3714   title = {Randomness quality of {CI} chaotic generators. Application to Internet
3715         security},
3716   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
3717   year = {2010},
3718   pages = {125--130},
3719   address = {Valencia, Spain},
3720   month = sep,
3721   publisher = {IEEE Computer Society Press},
3722   note = {Best Paper award},
3723   classement = {ACTI},
3724   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
3725   equipe = {and},
3726   inhal = {no}
3727 }
3728
3729 @ARTICLE{Wang2003,
3730   author = {X. M. Wang and J. S. Zhang and W. F. Zhang},
3731   title = {One-way hash function construction based on the extended chaotic
3732         maps switch},
3733   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3734   year = {2003},
3735   volume = {52, No. 11},
3736   pages = {2737--2742},
3737   owner = {guyeux},
3738   timestamp = {2009.01.16}
3739 }
3740
3741 @ARTICLE{Girao06,
3742   author = {Westhoff, Dirk and Girao, Joao and Acharya, Mithun},
3743   title = {Concealed Data Aggregation for Reverse Multicast Traffic in Sensor
3744         Networks: Encryption, Key Distribution, and Routing Adaptation},
3745   journal = {IEEE Transactions on Mobile Computing},
3746   year = {2006},
3747   volume = {5},
3748   pages = {1417--1431},
3749   number = {10},
3750   address = {Piscataway, NJ, USA},
3751   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/TMC.2006.144},
3752   issn = {1536-1233},
3753   publisher = {IEEE Educational Activities Department}
3754 }
3755
3756 @MISC{web:lyapunov,
3757   author = {Wikipédia},
3758   title = {Exposant de Lyapunov -- Site web d'André Lévesque},
3759   year = {2010},
3760   note = {[En ligne; Page disponible le 9-septembre-2010]},
3761   url = {\url{http://math.cmaisonneuve.qc.ca/alevesque/chaos_fract/Lyapunov/Exposant.html}}
3762 }
3763
3764 @MISC{wiki:complet,
3765   author = {Wikipédia},
3766   title = {Espace complet --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3767   year = {2010},
3768   note = {[En ligne; Page disponible le 9-août-2010]},
3769   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Espace_complet&oldid=52734266}}
3770 }
3771
3772 @MISC{wiki:densite,
3773   author = {Wikipédia},
3774   title = {Densité (mathématiques) --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3775   year = {2010},
3776   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3777   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Densit%C3%A9_(math%C3%A9matiques)&oldid=53938121}}
3778 }
3779
3780 @MISC{wiki:fisher,
3781   author = {Wikipédia},
3782   title = {Information de Fisher --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3783   year = {2010},
3784   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3785   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Information_de_Fisher&oldid=52877871}}
3786 }
3787
3788 @MISC{wiki:Kerkhoffs,
3789   author = {Wikipédia},
3790   title = {Principe de Kerckhoffs --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3791   year = {2010},
3792   note = {[En ligne; Page disponible le 20-août-2010]},
3793   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Principe_de_Kerckhoffs&oldid=52133114}}
3794 }
3795
3796 @MISC{wiki:sarkovskii,
3797   author = {Wikipédia},
3798   title = {Théorème de Sarkovskii --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3799   year = {2010},
3800   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3801   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Th%C3%A9or%C3%A8me_de_Sarkovskii&oldid=54196167}}
3802 }
3803
3804 @MISC{wiki:steganographie,
3805   author = {Wikipédia},
3806   title = {Stéganographie --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3807   year = {2010},
3808   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3809   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=St%C3%A9ganographie&oldid=54724435}}
3810 }
3811
3812 @MISC{wiki:tatouage,
3813   author = {Wikipédia},
3814   title = {Tatouage numérique --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3815   year = {2010},
3816   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3817   url = {https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Tatouage_num%C3%A9rique&oldid=55484940}
3818 }
3819
3820 @MISC{wiki:testsHypothese,
3821   author = {Wikipédia},
3822   title = {Test d'hypothèse --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3823   year = {2010},
3824   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3825   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Test_d%27hypoth%C3%A8se&oldid=55344108}}
3826 }
3827
3828 @ARTICLE{Wu2007bis,
3829   author = {Xianyong Wu and Zhi-Hong Guan},
3830   title = {A novel digital watermark algorithm based on chaotic maps},
3831   journal = {Physics Letters A},
3832   year = {2007},
3833   volume = {365},
3834   pages = {403 - 406},
3835   number = {5-6},
3836   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.01.034},
3837   issn = {0375-9601},
3838   keywords = {Watermarking},
3839   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4MY0MF3-8/2/0b4d1298fa84337d2e59b3fefe26f583}
3840 }
3841
3842 @INPROCEEDINGS{Wu2007,
3843   author = {Wu, Xianyong and Guan, Zhi-Hong and Wu, Zhengping},
3844   title = {A Chaos Based Robust Spatial Domain Watermarking Algorithm},
3845   booktitle = {ISNN '07: Proceedings of the 4th international symposium on Neural
3846         Networks},
3847   year = {2007},
3848   pages = {113--119},
3849   address = {Berlin, Heidelberg},
3850   publisher = {Springer-Verlag},
3851   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-72393-6_15},
3852   isbn = {978-3-540-72392-9},
3853   location = {Nanjing, China}
3854 }
3855
3856 @ARTICLE{Xiao20092288,
3857   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3858   title = {Parallel keyed hash function construction based on chaotic neural
3859         network},
3860   journal = {Neurocomputing},
3861   year = {2009},
3862   volume = {72},
3863   pages = {2288 - 2296},
3864   number = {10-12},
3865   note = {Lattice Computing and Natural Computing (JCIS 2007) / Neural Networks
3866         in Intelligent Systems Designn (ISDA 2007)},
3867   abstract = {Recently, various hash functions based on chaos or neural networks
3868         were proposed. Nevertheless, none of them works efficiently in parallel
3869         computing environment. In this paper, an algorithm for parallel keyed
3870         hash function construction based on chaotic neural network is proposed.
3871         The mechanism of changeable-parameter and self-synchronization establishes
3872         a close relation between the hash value bit and message, and the
3873         algorithm structure ensures the uniform sensitivity of the hash value
3874         to the message blocks at different positions. The proposed algorithm
3875         can satisfy the performance requirements of hash function. These
3876         properties make it a promising choice for hashing on parallel computing
3877         platform.},
3878   issn = {0925-2312},
3879   keywords = {Chaotic neural network}
3880 }
3881
3882 @ARTICLE{Xiao20094346,
3883   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3884   title = {Improving the security of a parallel keyed hash function based on
3885         chaotic maps},
3886   journal = {Physics Letters A},
3887   year = {2009},
3888   volume = {373},
3889   pages = {4346 - 4353},
3890   number = {47},
3891   issn = {0375-9601},
3892   keywords = {Hash function},
3893   owner = {guyeux},
3894   timestamp = {2009.12.12}
3895 }
3896
3897 @ARTICLE{Xiao20102254,
3898   author = {Di Xiao and Frank Y. Shih and Xiaofeng Liao},
3899   title = {A chaos-based hash function with both modification detection and
3900         localization capabilities},
3901   journal = {Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation},
3902   year = {2010},
3903   volume = {15},
3904   pages = {2254 - 2261},
3905   number = {9},
3906   abstract = {Recently, a variety of chaos-based hash functions have been proposed.
3907         Nevertheless, none of them can realize modification localization.
3908         In this paper, a hash function with both modification detection and
3909         localization capabilities is proposed, which can also support the
3910         parallel processing mode. By using the mechanism of changeable-parameter
3911         and self-synchronization, the keystream can establish a close relation
3912         with the algorithm key, the content, and the order of each message
3913         unit. Theoretical analysis and computer simulation indicate that
3914         the proposed algorithm can satisfy the performance requirements of
3915         hash functions.},
3916   issn = {1007-5704},
3917   keywords = {Hash function}
3918 }
3919
3920 @INPROCEEDINGS{Yu06,
3921   author = {Yu, Yu and Leiwo, Jussipekka and Premkumar, Benjamin},
3922   title = {A Study on the Security of Privacy Homomorphism},
3923   booktitle = {ITNG '06: Proceedings of the Third International Conference on Information
3924         Technology: New Generations},
3925   year = {2006},
3926   pages = {470--475},
3927   address = {Washington, DC, USA},
3928   publisher = {IEEE Computer Society},
3929   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/ITNG.2006.19},
3930   isbn = {0-7695-2497-4}
3931 }
3932
3933 @ARTICLE{Zhang2008658,
3934   author = {Wei Zhang and Yonghe Liu and Sajal K. Das and Pradip De},
3935   title = {Secure data aggregation in wireless sensor networks: A watermark
3936         based authentication supportive approach},
3937   journal = {Pervasive and Mobile Computing},
3938   year = {2008},
3939   volume = {4},
3940   pages = {658 - 680},
3941   number = {5},
3942   doi = {DOI: 10.1016/j.pmcj.2008.05.005},
3943   issn = {1574-1192},
3944   keywords = {Wireless sensor networks},
3945   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B7MF1-4SKB3MD-1/2/b73948dcaa3eb63a2c21d09041882625}
3946 }
3947
3948 @ARTICLE{Zhang2005,
3949   author = {Zhang, Yang and Arakaki, Adrian K. and Skolnick, Jeffrey},
3950   title = {TASSER: An automated method for the prediction of protein tertiary
3951         structures in CASP6},
3952   journal = {Proteins},
3953   year = {2005},
3954   volume = {61},
3955   pages = {91--98},
3956   number = {S7},
3957   issn = {1097-0134},
3958   keywords = {comparative modeling, threading, ab initio prediction, TASSER, PROSPECTOR_3},
3959   owner = {christophe},
3960   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
3961   timestamp = {2011.01.22},
3962   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20724}
3963 }
3964
3965 @ARTICLE{Zhou1997429,
3966   author = {Chang-song Zhou and Tian-lun Chen},
3967   title = {Extracting information masked by chaos and contaminated with noise:
3968         Some considerations on the security of communication approaches using
3969         chaos},
3970   journal = {Physics Letters A},
3971   year = {1997},
3972   volume = {234},
3973   pages = {429 - 435},
3974   number = {6},
3975   issn = {0375-9601},
3976   keywords = {Communication},
3977   owner = {guyeux},
3978   timestamp = {2009.12.12}
3979 }
3980
3981 @ARTICLE{Zhou96,
3982   author = {Zhou, Huai-bei and Wang, Lu},
3983   title = {Chaos in Biomolecular Dynamics},
3984   journal = {The Journal of Physical Chemistry},
3985   year = {1996},
3986   volume = {100},
3987   pages = {8101-8105},
3988   number = {20},
3989   doi = {10.1021/jp953409x}
3990 }
3991
3992 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iwdw/2005,
3993   title = {IWDW'05: 4th International Workshop on Digital Watermarking},
3994   year = {2005},
3995   editor = {Mauro Barni and Ingemar J. Cox and Ton Kalker and Hyoung Joong Kim},
3996   volume = {3710},
3997   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3998   address = {Siena, Italy},
3999   publisher = {Springer},
4000   month = {September 15-17},
4001   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4002   booktitle = {IWDW},
4003   isbn = {3-540-28768-X},
4004   owner = {guyeux},
4005   timestamp = {2009.06.29}
4006 }
4007
4008 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2006,
4009   title = {IH 2006: Information Hiding, 8th International Workshop},
4010   year = {2007},
4011   editor = {Jan Camenisch and Christian S. Collberg and Neil F. Johnson and Phil
4012         Sallee},
4013   volume = {4437},
4014   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4015   address = {Alexandria, VA, USA},
4016   publisher = {Springer},
4017   month = {July},
4018   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4019   booktitle = {Information Hiding},
4020   isbn = {978-3-540-74123-7},
4021   owner = {guyeux},
4022   timestamp = {2009.06.29}
4023 }
4024
4025 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2007,
4026   title = {Information Hiding, 9th International Workshop, IH 2007, Saint Malo,
4027         France, June 11-13, 2007, Revised Selected Papers},
4028   year = {2008},
4029   editor = {Teddy Furon and Fran\c{c}ois Cayre and Gwena{\"e}l J. Do{\"e}rr and
4030         Patrick Bas},
4031   volume = {4567},
4032   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4033   publisher = {Springer},
4034   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4035   booktitle = {Information Hiding},
4036   isbn = {978-3-540-77369-6},
4037   owner = {guyeux},
4038   timestamp = {2009.06.29}
4039 }
4040
4041 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iccsa/2006-1,
4042   title = {Computational Science and Its Applications - ICCSA 2006, International
4043         Conference, Glasgow, UK, May 8-11, 2006, Proceedings, Part I},
4044   year = {2006},
4045   editor = {Marina L. Gavrilova and Osvaldo Gervasi and Vipin Kumar and Chih
4046         Jeng Kenneth Tan and David Taniar and Antonio Lagan{\`a} and Youngsong
4047         Mun and Hyunseung Choo},
4048   volume = {3980},
4049   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4050   publisher = {Springer},
4051   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4052   booktitle = {ICCSA (1)},
4053   isbn = {3-540-34070-X}
4054 }
4055
4056 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/secrypt/2010,
4057   title = {SECRYPT 2010 - Proceedings of the International Conference on Security
4058         and Cryptography, Athens, Greece, July 26-28, 2010, SECRYPT is part
4059         of ICETE - The International Joint Conference on e-Business and Telecommunications},
4060   year = {2010},
4061   editor = {Sokratis K. Katsikas and Pierangela Samarati},
4062   publisher = {SciTePress},
4063   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4064   booktitle = {SECRYPT},
4065   isbn = {978-989-8425-18-8}
4066 }
4067
4068 @BOOK{Katzenbeisser00,
4069   title = {Information Hiding Techniques for Steganography and Digital Watermarking},
4070   publisher = {Artech House, Inc.},
4071   year = {2000},
4072   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Petitcolas, Fabien A.},
4073   address = {Norwood, MA, USA},
4074   isbn = {1580530354}
4075 }
4076
4077 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/1999,
4078   title = {IH'99: 3rd International Workshop on Information Hiding},
4079   year = {2000},
4080   editor = {Andreas Pfitzmann},
4081   volume = {1768},
4082   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4083   address = {Dresden, Germany},
4084   publisher = {Springer},
4085   month = {September 29 - October 1.},
4086   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4087   booktitle = {Information Hiding},
4088   isbn = {3-540-67182-X},
4089   owner = {guyeux},
4090   timestamp = {2009.06.29}
4091 }
4092
4093 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/indocrypt/2000,
4094   title = {Progress in Cryptology - INDOCRYPT 2000, First International Conference
4095         in Cryptology in India, Calcutta, India, December 10-13, 2000, Proceedings},
4096   year = {2000},
4097   editor = {Bimal K. Roy and Eiji Okamoto},
4098   volume = {1977},
4099   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4100   publisher = {Springer},
4101   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4102   booktitle = {INDOCRYPT},
4103   isbn = {3-540-41452-5}
4104 }
4105
4106 @BOOK{DBLP:reference/icsec/2010,
4107   title = {Handbook of Information and Communication Security},
4108   publisher = {Springer},
4109   year = {2010},
4110   editor = {Peter P. Stavroulakis and Mark Stamp},
4111   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4112   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
4113   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4},
4114   isbn = {978-3-642-04116-7}
4115 }
4116
4117 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/isnn/2004-2,
4118   title = {Advances in Neural Networks - ISNN 2004, International Symposium
4119         on Neural Networks, Dalian, China, August 19-21, 2004, Proceedings,
4120         Part II},
4121   year = {2004},
4122   editor = {Fuliang Yin and Jun Wang and Chengan Guo},
4123   volume = {3174},
4124   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4125   publisher = {Springer},
4126   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4127   booktitle = {ISNN (2)},
4128   isbn = {3-540-22843-8}
4129 }
4130
4131 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/adhocnets/2010,
4132   title = {Ad Hoc Networks - Second International Conference, ADHOCNETS 2010,
4133         Victoria, BC, Canada, August 18-20, 2010, Revised Selected Papers},
4134   year = {2010},
4135   editor = {Jun Zheng and David Simplot-Ryl and Victor C. M. Leung},
4136   volume = {49},
4137   series = {Lecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social Informatics
4138         and Telecommunications Engineering},
4139   publisher = {Springer},
4140   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4141   booktitle = {ADHOCNETS},
4142   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5},
4143   isbn = {978-3-642-17993-8}
4144 }
4145
4146 @INPROCEEDINGS{,
4147   owner = {guyeux},
4148   timestamp = {2011.03.29}
4149 }
4150
4151 @MISC{Delicious,
4152   title = {Delicious social bookmarking, http://delicious.com/},
4153   comment = {http://delicious.com/},
4154   type = {web page},
4155   url = {http://delicious.com/}
4156 }
4157
4158 @MISC{Frick,
4159   title = {The Frick Collection, http://www.frick.org/},
4160   comment = {http://www.frick.org/},
4161   type = {web page},
4162   url = {http://www.frick.org/}
4163 }
4164
4165 @PROCEEDINGS{2010,
4166   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4167         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4168   year = {2010},
4169   publisher = {IEEE},
4170   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4171   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4172 }
4173
4174 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4175   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4176         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4177   year = {2010},
4178   publisher = {IEEE},
4179   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4180   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4181 }
4182
4183 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/date/2010,
4184   title = {Design, Automation and Test in Europe, DATE 2010, Dresden, Germany,
4185         March 8-12, 2010},
4186   year = {2010},
4187   publisher = {IEEE},
4188   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4189   booktitle = {DATE}
4190 }
4191
4192 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/2009,
4193   title = {Proceedings IEEE CSE'09, 12th IEEE International Conference on Computational
4194         Science and Engineering, August 29-31, 2009, Vancouver, BC, Canada},
4195   year = {2009},
4196   publisher = {IEEE Computer Society},
4197   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4198   booktitle = {CSE}
4199 }
4200
4201 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/2009,
4202   title = {Proceedings of the International Conference on Ultra Modern Telecommunications,
4203         ICUMT 2009, 12-14 October 2009, St. Petersburg, Russia},
4204   year = {2009},
4205   publisher = {IEEE},
4206   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4207   booktitle = {ICUMT}
4208 }
4209
4210 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/2008,
4211   title = {49th Annual IEEE Symposium on Foundations of Computer Science, FOCS
4212         2008, October 25-28, 2008, Philadelphia, PA, USA},
4213   year = {2008},
4214   publisher = {IEEE Computer Society},
4215   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4216   booktitle = {FOCS}
4217 }
4218
4219 @comment{jabref-meta: selector_publisher:}
4220
4221 @comment{jabref-meta: selector_author:}
4222
4223 @comment{jabref-meta: selector_journal:}
4224
4225 @comment{jabref-meta: selector_keywords:Chaos;Entropie Topologique;Tip
4226
4227
4228
4229
4230 @InProceedings{Pang:2008:cec,
4231   author =      "Wai-Man Pang and Tien-Tsin Wong and Pheng-Ann Heng",
4232   title =       "Generating Massive High-Quality Random Numbers using
4233                  {GPU}",
4234   booktitle =   "2008 IEEE World Congress on Computational
4235                  Intelligence",
4236   year =        "2008",
4237   editor =      "Jun Wang",
4238   address =     "Hong Kong",
4239   organization = "IEEE Computational Intelligence Society",
4240   publisher =   "IEEE Press",
4241
4242 }
4243
4244 @Article{LEcuyerS07,
4245   title =       "Test{U01}: {A} {C} library for empirical testing of
4246                  random number generators",
4247   author =      "Pierre L'Ecuyer and Richard J. Simard",
4248   journal =     "ACM Trans. Math. Softw",
4249   year =        "2007",
4250   number =      "4",
4251   volume =      "33",
4252   bibdate =     "2007-11-06",
4253   bibsource =   "DBLP,
4254                  http://dblp.uni-trier.de/db/journals/toms/toms33.html#LEcuyerS07",
4255   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1268776.1268777",
4256 }
4257
4258 @Article{ZRKB10,
4259         author =                         {A. Zhmurov, K. Rybnikov, Y. Kholodov, and V. Barsegov},
4260         title =                          {Generation of Random Numbers on Graphics Processors: Forced Indentation In Silico of the Bacteriophage HK97},
4261         journal =                {J. Phys. Chem. B},
4262         year =                           {2011},
4263         volume =         {115},
4264         number =         {18},
4265         pages =                  {5278--5288},
4266 }
4267
4268
4269
4270 @comment {regarder : Pseudo-Random Number Generation for Brownian Dynamics and Dissipative Particle Dynamics Simulations on GPU Devices}
4271 @comment {CL Phillips, JA Anderson… - Journal of Computational Physics, 2011 - Elsevier}
4272
4273 @InProceedings{conf/fpga/ThomasHL09,
4274   title =       "A comparison of {CPU}s, {GPU}s, {FPGA}s, and massively
4275                  parallel processor arrays for random number
4276                  generation",
4277   author =      "David B. Thomas and Lee W. Howes and Wayne Luk",
4278 booktitle =     "Proceedings of the {ACM}/{SIGDA} 17th International
4279                  Symposium on Field Programmable Gate Arrays, {FPGA}
4280                  2009, Monterey, California, {USA}, February 22-24,
4281                  2009",
4282   bibdate =     "2010-06-29",
4283   publisher =   "ACM",
4284   year =        "2009",
4285   editor =      "Paul Chow and Peter Y. K. Cheung",
4286   ISBN =        "978-1-60558-410-2",
4287   pages =       "63--72",
4288   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1508128.1508139",
4289 }
4290
4291
4292
4293 @InProceedings{Jenkins96,
4294   author =      "Jenkins",
4295   title =       "{ISAAC}",
4296   booktitle =   "IWFSE: International Workshop on Fast Software
4297                  Encryption, LNCS",
4298   year =        "1996",
4299 }
4300
4301 @manual{Nvid10,
4302  author = {Nvidia},
4303  title = {Cuda cublas library},
4304  year = {2011},
4305  Note = {Version 4.0},
4306  }
4307
4308 @manual{curand11,
4309  author = {Nvidia},
4310  title = {Curand library},
4311  year = {2011},
4312  Note = {Version 4.0},
4313  }
4314
4315
4316
4317 @Article{BBS,
4318         author =                         {Lenore Blum and Manuel Blum and Michael Shub},
4319         title =                          {A Simple Unpredictable Pseudo-Random Number Generator},
4320         journal =                {SIAM Journal on Computing},
4321         year =                           {1986},
4322         volume =         {15},
4323         pages =                  {364--383},
4324 }
4325
4326 @Book{Goldreich,
4327   author =       {Oded Goldreich},
4328   ALTeditor =    {},
4329   title =        {Foundations of Cryptography: Basic Tools},
4330   publisher =    {Cambridge University Press},
4331   year =         {2007},
4332 }
4333
4334