mabase.bib

   1 % This file was created with JabRef 2.7.
   2 % Encoding: UTF8
   3
   4 @INPROCEEDINGS{AdelsbachKS06,
   5   author = {Andr{\'e} Adelsbach and Stefan Katzenbeisser and Ahmad-Reza Sadeghi},
   6   title = {A Computational Model for Watermark Robustness},
   7   booktitle = {Information Hiding},
   8   year = {2006},
   9   pages = {145-160},
  10   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  11   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
  12   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_10},
  13   owner = {guyeux},
  14   timestamp = {2009.06.29}
  15 }
  16
  17 @inproceedings{bfg12a:ip,
  18 inhal = {no},
  19 domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
  20 equipe = {and},
  21 classement = {ACTI},
  22 author = {Bahi, Jacques and Fang, Xiaole and Guyeux, Christophe},
  23 title = {An optimization technique on pseudorandom generators based on chaotic iterations},
  24 booktitle = {INTERNET'2012, 4-th Int. Conf. on Evolving Internet},
  25 pages = {***--***},
  26 address = {Venice, Italy},
  27 month = jun,
  28 year = 2012,
  29 note = {To appear},
  30
  31 }
  32
  33 @UNPUBLISHED{ANDREW2008,
  34   author = {NIST Special Publication 800-22 rev. 1},
  35   title = {A Statistical Test Suite for Random and Pseudorandom Number Generators
  36         for Cryptographic Applications},
  37   year = {August 2008},
  38   owner = {qianxue},
  39   timestamp = {2009.01.22}
  40 }
  41
  42 @Article{combined_lcg,
  43         title = "Efficient and portable combined random number generators",
  44         journal = "Communications of the ACM",
  45         volume = "31",
  46         number = "6",
  47         pages = "742--749",
  48         year = "1988",
  49 }
  50
  51
  52 @INPROCEEDINGS{Fischlin,
  53   author = {Fischlin, R. and Schnorr, C. P.},
  54   title = {Stronger security proofs for RSA and rabin bits},
  55   booktitle = {Proceedings of the 16th annual international conference on Theory
  56         and application of cryptographic techniques},
  57   year = {1997},
  58   series = {EUROCRYPT'97},
  59   pages = {267--279},
  60   address = {Berlin, Heidelberg},
  61   publisher = {Springer-Verlag},
  62   acmid = {1754569},
  63   isbn = {3-540-62975-0},
  64   location = {Konstanz, Germany},
  65   numpages = {13},
  66   url = {http://dl.acm.org/citation.cfm?id=1754542.1754569}
  67 }
  68
  69 @INPROCEEDINGS{BattiatoCGG99,
  70   author = {Sebastiano Battiato and Dario Catalano and Giovanni Gallo and Rosario
  71         Gennaro},
  72   title = {Robust Watermarking for Images Based on Color Manipulation},
  73   booktitle = {Information Hiding},
  74   year = {1999},
  75   pages = {302-317},
  76   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  77   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
  78   owner = {guyeux},
  79   timestamp = {2009.06.29}
  80 }
  81
  82 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05,
  83   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  84   title = {The Return of the Sensitivity Attack},
  85   booktitle = {IWDW},
  86   year = {2005},
  87   pages = {260-274},
  88   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  89   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
  90   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_20},
  91   owner = {guyeux},
  92   timestamp = {2009.06.29}
  93 }
  94
  95 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05bis,
  96   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  97   title = {Fundamentals of Data Hiding Security and Their Application to Spread-Spectrum
  98         Analysis},
  99   booktitle = {IH'05: Information Hiding Workshop},
 100   year = {2005},
 101   pages = {146-160},
 102   publisher = {Lectures Notes in Computer Science, Springer-Verlag},
 103   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 104   crossref = {DBLP:conf/ih/2005},
 105   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11558859_12},
 106   owner = {guyeux},
 107   timestamp = {2009.06.30}
 108 }
 109
 110 @INPROCEEDINGS{CongJQZ06,
 111   author = {Jin Cong and Yan Jiang and Zhiguo Qu and Zhongmei Zhang},
 112   title = {A Wavelet Packets Watermarking Algorithm Based on Chaos Encryption},
 113   booktitle = {ICCSA (1)},
 114   year = {2006},
 115   pages = {921-928},
 116   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 117   crossref = {DBLP:conf/iccsa/2006-1},
 118   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11751540_100}
 119 }
 120
 121 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/DziembowskiP08,
 122   author = {Stefan Dziembowski and Krzysztof Pietrzak},
 123   title = {Leakage-Resilient Cryptography},
 124   booktitle = {FOCS},
 125   year = {2008},
 126   pages = {293-302},
 127   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 128   crossref = {DBLP:conf/focs/2008},
 129   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/FOCS.2008.56}
 130 }
 131
 132 @INCOLLECTION{Filiol10,
 133   author = {Eric Filiol},
 134   title = {Viruses and Malware},
 135   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
 136   year = {2010},
 137   pages = {747-769},
 138   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 139   crossref = {DBLP:reference/icsec/2010},
 140   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4_34}
 141 }
 142
 143 @INPROCEEDINGS{Filiol00,
 144   author = {Eric Filiol},
 145   title = {Decimation Attack of Stream Ciphers},
 146   booktitle = {INDOCRYPT},
 147   year = {2000},
 148   pages = {31-42},
 149   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 150   crossref = {DBLP:conf/indocrypt/2000},
 151   ee = {http://link.springer.de/link/service/series/0558/bibs/1977/19770031.htm}
 152 }
 153
 154 @INPROCEEDINGS{Furon05,
 155   author = {Teddy Furon},
 156   title = {A Survey of Watermarking Security},
 157   booktitle = {IWDW},
 158   year = {2005},
 159   pages = {201-215},
 160   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 161   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
 162   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_16},
 163   owner = {guyeux},
 164   timestamp = {2009.06.29}
 165 }
 166
 167 @Book{Goldreich,
 168   author =      {Oded Goldreich},
 169   ALTeditor =      {},
 170   title =      {Foundations of Cryptography: Basic Tools},
 171   publisher =      {Cambridge University Press},
 172   year =      {2007},
 173 }
 174
 175 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HiggsSHS10,
 176   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 177   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 178         prediction},
 179   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 180   year = {2010},
 181   pages = {1-8},
 182   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 183   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 184   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 185 }
 186
 187 @INPROCEEDINGS{Higgs2010,
 188   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 189   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 190         prediction},
 191   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 192   year = {2010},
 193   pages = {1-8},
 194   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 195   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 196   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 197 }
 198
 199 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HorvathC10,
 200   author = {Dragos Horvath and Camelia Chira},
 201   title = {Simplified chain folding models as metaheuristic benchmark for tuning
 202         real protein folding algorithms?},
 203   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 204   year = {2010},
 205   pages = {1-8},
 206   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 207   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 208   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5585932}
 209 }
 210
 211 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/IslamC10,
 212   author = {Md. Kamrul Islam and Madhu Chetty},
 213   title = {Clustered memetic algorithm for protein structure prediction},
 214   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 215   year = {2010},
 216   pages = {1-8},
 217   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 218   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 219   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586187}
 220 }
 221
 222 @INPROCEEDINGS{Ker06,
 223   author = {Andrew D. Ker},
 224   title = {Batch Steganography and Pooled Steganalysis},
 225   booktitle = {Information Hiding},
 226   year = {2006},
 227   pages = {265-281},
 228   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 229   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
 230   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_18},
 231   owner = {guyeux},
 232   timestamp = {2009.06.29}
 233 }
 234
 235 @INPROCEEDINGS{Lin2009,
 236   author = {H.-Y. Lin and T.-C. Chiang},
 237   title = {Cooperative Secure Data Aggregation in Sensor Networks Using Elliptic
 238         Curve Based Cryptosystems},
 239   booktitle = {CDVE},
 240   year = {2009},
 241   pages = {384-387},
 242   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 243   crossref = {DBLP:conf/cdve/2009},
 244   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04265-2_58}
 245 }
 246
 247 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/MaimourPH09,
 248   author = {Moufida Maimour and CongDuc Pham and Doan B. Hoang},
 249   title = {A Congestion Control Framework for Handling Video Surveillance Traffics
 250         on WSN},
 251   booktitle = {CSE (2)},
 252   year = {2009},
 253   pages = {943-948},
 254   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 255   crossref = {DBLP:conf/cse/2009},
 256   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CSE.2009.200}
 257 }
 258
 259 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/MakhoulSP09,
 260   author = {Abdallah Makhoul and Rachid Saadi and CongDuc Pham},
 261   title = {Coverage and adaptive scheduling algorithms for criticality management
 262         on video wireless sensor networks},
 263   booktitle = {ICUMT},
 264   year = {2009},
 265   pages = {1-8},
 266   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 267   crossref = {DBLP:conf/icumt/2009},
 268   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/ICUMT.2009.5345630}
 269 }
 270
 271 @INPROCEEDINGS{Mittelholzer99,
 272   author = {Thomas Mittelholzer},
 273   title = {An Information-Theoretic Approach to Steganography and Watermarking},
 274   booktitle = {Information Hiding},
 275   year = {1999},
 276   pages = {1-16},
 277   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 278   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
 279   owner = {guyeux},
 280   timestamp = {2009.06.29}
 281 }
 282
 283 @INPROCEEDINGS{PellegriniBA10,
 284   author = {Andrea Pellegrini and Valeria Bertacco and Todd M. Austin},
 285   title = {Fault-based attack of RSA authentication},
 286   booktitle = {DATE},
 287   year = {2010},
 288   pages = {855-860},
 289   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 290   crossref = {DBLP:conf/date/2010},
 291   ee = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5456933}
 292 }
 293
 294 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/Perez-HernandezRG10,
 295   author = {Luis Germ{\'a}n P{\'e}rez-Hern{\'a}ndez and Katya Rodr\'{\i}guez-V{\'a}zquez
 296         and Ram{\'o}n Gardu{\~n}o-Ju{\'a}rez},
 297   title = {Estimation of 3D Protein Structure by means of parallel Particle
 298         Swarm Optimization},
 299   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 300   year = {2010},
 301   pages = {1-8},
 302   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 303   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 304   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586549}
 305 }
 306
 307 @INPROCEEDINGS{WangNHZH07,
 308   author = {Chuntao Wang and Jiangqun Ni and Jiwu Huang and Rongyue Zhang and
 309         Meiying Huang},
 310   title = {Robust and High Capacity Image Watermarking Based on Jointly Coding
 311         and Embedding Optimization},
 312   booktitle = {Information Hiding},
 313   year = {2007},
 314   pages = {65-79},
 315   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 316   crossref = {DBLP:conf/ih/2007},
 317   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-77370-2_5},
 318   owner = {guyeux},
 319   timestamp = {2009.06.29}
 320 }
 321
 322 @INPROCEEDINGS{Zhao04,
 323   author = {Jian Zhao and Mingquan Zhou and Hongmei Xie and Jinye Peng and Xin
 324         Zhou},
 325   title = {A Novel Wavelet Image Watermarking Scheme Combined with Chaos Sequence
 326         and Neural Network},
 327   booktitle = {ISNN (2)},
 328   year = {2004},
 329   pages = {663-668},
 330   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 331   crossref = {DBLP:conf/isnn/2004-2},
 332   ee = {http://springerlink.metapress.com/openurl.asp?genre=article{\&}issn=0302-9743{\&}volume=3174{\&}spage=663}
 333 }
 334
 335 @INPROCEEDINGS{Acharya05securecomparison,
 336   author = {Acharya, Mithun and Girao, Joao and Westhoff, Dirk},
 337   title = {Secure Comparison of Encrypted Data in Wireless Sensor Networks},
 338   booktitle = {WIOPT '05: Proceedings of the Third International Symposium on Modeling
 339         and Optimization in Mobile, Ad Hoc, and Wireless Networks},
 340   year = {2005},
 341   pages = {47--53},
 342   address = {Washington, DC, USA},
 343   publisher = {IEEE Computer Society},
 344   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/WIOPT.2005.44},
 345   isbn = {0-7695-2267-X}
 346 }
 347
 348 @INPROCEEDINGS{Acimez07onthe,
 349   author = {Onur Acıi\c{c}mez and \c{C}etin Kaya Ko\c{c} and Jean-Pierre Seifert},
 350   title = {On the power of simple branch prediction analysis },
 351   booktitle = {2007 ACM Symposium on Information, Computer and Communications Security
 352         (ASIACCS'07)},
 353   year = {2007},
 354   pages = {312--320},
 355   publisher = {ACM Press}
 356 }
 357
 358 @ARTICLE{Adler65,
 359   author = {R. L. Adler and A. G. Konheim and M. H. McAndrew},
 360   title = {Topological entropy},
 361   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
 362   year = {1965},
 363   volume = {114},
 364   pages = {309-319},
 365   owner = {guyeux},
 366   timestamp = {2008.05.29}
 367 }
 368
 369 @INPROCEEDINGS{Agrawal04,
 370   author = {Agrawal, Rakesh and Kiernan, Jerry and Srikant, Ramakrishnan and
 371         Xu, Yirong},
 372   title = {Order preserving encryption for numeric data},
 373   booktitle = {SIGMOD '04: Proceedings of the 2004 ACM SIGMOD international conference
 374         on Management of data},
 375   year = {2004},
 376   pages = {563--574},
 377   address = {New York, NY, USA},
 378   publisher = {ACM},
 379   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1007568.1007632},
 380   isbn = {1-58113-859-8},
 381   location = {Paris, France}
 382 }
 383
 384 @ARTICLE{Anfinsen20071973,
 385   author = {Anfinsen, Christian B.},
 386   title = {Principles that Govern the Folding of Protein Chains},
 387   journal = {Science},
 388   year = {1973},
 389   volume = {181},
 390   pages = {223-230},
 391   number = {4096},
 392   doi = {10.1126/science.181.4096.223},
 393   eprint = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.full.pdf},
 394   url = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.short}
 395 }
 396
 397 @ARTICLE{Arques1994,
 398   author = {D. G. Arques and C. J. Michel},
 399   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine autocorrelation function
 400         after and before random mutations.},
 401   journal = {Math Biosci},
 402   year = {1994},
 403   volume = {123},
 404   pages = {103--125},
 405   number = {1},
 406   month = {Sep},
 407   abstract = {The mutation process is a classical evolutionary genetic process.
 408         The type of mutations studied here is the random substitutions of
 409         a purine base R (adenine or guanine) by a pyrimidine base Y (cytosine
 410         or thymine) and reciprocally (transversions). The analytical expressions
 411         derived allow us to analyze in genes the occurrence probabilities
 412         of motifs and d-motifs (two motifs separated by any d bases) on the
 413         R/Y alphabet under transversions. These motif probabilities can be
 414         obtained after transversions (in the evolutionary sense; from the
 415         past to the present) and, unexpectedly, also before transversions
 416         (after back transversions, in the inverse evolutionary sense, from
 417         the present to the past). This theoretical part in Section 2 is a
 418         first generalization of a particular formula recently derived. The
 419         application in Section 3 is based on the analytical expression giving
 420         the autocorrelation function (the d-motif probabilities) before transversions.
 421         It allows us to study primitive genes from actual genes. This approach
 422         solves a biological problem. The protein coding genes of chloroplasts
 423         and mitochondria have a preferential occurrence of the 6-motif YRY(N)6YRY
 424         (maximum of the autocorrelation function for d = 6, N = R or Y) with
 425         a periodicity modulo 3. The YRY(N)6YRY preferential occurrence without
 426         the periodicity modulo 3 is also observed in the RNA coding genes
 427         (ribosomal, transfer, and small nuclear RNA genes) and in the noncoding
 428         genes (introns and 5' regions of eukaryotic nuclei). However, there
 429         are two exceptions to this YRY(N)6YRY rule: the protein coding genes
 430         of eukaryotic nuclei, and prokaryotes, where YRY(N)6YRY has the second
 431         highest value after YRY(N)0YRY (YRYYRY) with a periodicity modulo
 432         3. When we go backward in time with the analytical expression, the
 433         protein coding genes of both eukaryotic nuclei and prokaryotes retrieve
 434         the YRY(N)6YRY preferential occurrence with a periodicity modulo
 435         3 after 0.2 back transversions per base. In other words, the actual
 436         protein coding genes of chloroplasts and mitochondria are similar
 437         to the primitive protein coding genes of eukaryotic nuclei and prokaryotes.
 438         On the other hand, this application represents the first result concerning
 439         the mutation process in the model of DNA sequence evolution we recently
 440         proposed. According to this model, the actual genes on the R/Y alphabet
 441         derive from two successive evolutionary genetic processes: an independent
 442         mixing of a few nonrandom types of oligonucleotides leading to genes
 443         called primitive followed by a mutation process in these primitive
 444         genes.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)},
 445   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 446         France.},
 447   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Mathematics; Models,
 448         Genetic; Mutation; Probability; Proteins, genetics; Purines; Pyrimidines},
 449   language = {eng},
 450   medline-pst = {ppublish},
 451   owner = {guyeux},
 452   pii = {0025-5564(94)90020-5},
 453   pmid = {7949744},
 454   timestamp = {2011.05.05}
 455 }
 456
 457 @ARTICLE{Arques1998,
 458   author = {D. G. Arquès and J. P. Fallot and C. J. Michel},
 459   title = {An evolutionary analytical model of a complementary circular code
 460         simulating the protein coding genes, the 5' and 3' regions.},
 461   journal = {Bull Math Biol},
 462   year = {1998},
 463   volume = {60},
 464   pages = {163--194},
 465   number = {1},
 466   month = {Jan},
 467   abstract = {The self-complementary subset T0 = X0 [symbol: see text] ¿AAA, TTT¿
 468         with X0 = ¿AAC, AAT, ACC, ATC, ATT, CAG, CTC, CTG, GAA, GAC, GAG,
 469         GAT, GCC, GGC, GGT, GTA, GTC, GTT, TAC, TTC¿ of 22 trinucleotides
 470         has a preferential occurrence in the frame 0 (reading frame established
 471         by the ATG start trinucleotide) of protein (coding) genes of both
 472         prokaryotes and eukaryotes. The subsets T1 = X1 [symbol: see text]
 473         ¿CCC¿ and T2 = X2 [symbol: see text] ¿GGG¿ of 21 trinucleotides have
 474         a preferential occurrence in the shifted frames 1 and 2 respectively
 475         (frame 0 shifted by one and two nucleotides respectively in the 5'-3'
 476         direction). T1 and T2 are complementary to each other. The subset
 477         T0 contains the subset X0 which has the rarity property (6 x 10(-8)
 478         to be a complementary maximal circular code with two permutated maximal
 479         circular codes X1 and X2 in the frames 1 and 2 respectively. X0 is
 480         called a C3 code. A quantitative study of these three subsets T0,
 481         T1, T2 in the three frames 0, 1, 2 of protein genes, and the 5' and
 482         3' regions of eukaryotes, shows that their occurrence frequencies
 483         are constant functions of the trinucleotide positions in the sequences.
 484         The frequencies of T0, T1, T2 in the frame 0 of protein genes are
 485         49, 28.5 and 22.5\% respectively. In contrast, the frequencies of
 486         T0, T1, T2 in the 5' and 3' regions of eukaryotes, are independent
 487         of the frame. Indeed, the frequency of T0 in the three frames of
 488         5' (respectively 3') regions is equal to 35.5\% (respectively 38\%)
 489         and is greater than the frequencies T1 and T2, both equal to 32.25\%
 490         (respectively 31\%) in the three frames. Several frequency asymmetries
 491         unexpectedly observed (e.g. the frequency difference between T1 and
 492         T2 in the frame 0), are related to a new property of the subset T0
 493         involving substitutions. An evolutionary analytical model at three
 494         parameters (p, q, t) based on an independent mixing of the 22 codons
 495         (trinucleotides in frame 0) of T0 with equiprobability (1/22) followed
 496         by t approximately 4 substitutions per codon according to the proportions
 497         p approximately 0.1, q approximately 0.1 and r = 1 - p - q approximately
 498         0.8 in the three codon sites respectively, retrieves the frequencies
 499         of T0, T1, T2 observed in the three frames of protein genes and explains
 500         these asymmetries. Furthermore, the same model (0.1, 0.1, t) after
 501         t approximately 22 substitutions per codon, retrieves the statistical
 502         properties observed in the three frames of the 5' and 3' regions.
 503         The complex behaviour of these analytical curves is totally unexpected
 504         and a priori difficult to imagine.},
 505   doi = {10.1006/bulm.1997.0033},
 506   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Marne la Vallée, Institut
 507         Gaspard Monge, Noisy Le Grand, France. arques@univ-mlv.fr},
 508   keywords = {Animals; Biological Evolution; Codon, genetics; Genetic Code; Humans;
 509         Mammals; Models, Genetic; Probability; Proteins, genetics; Rodentia;
 510         Vertebrates},
 511   language = {eng},
 512   medline-pst = {ppublish},
 513   owner = {guyeux},
 514   pii = {S0092-8240(97)90033-1},
 515   pmid = {9530018},
 516   timestamp = {2011.05.05},
 517   url = {http://dx.doi.org/10.1006/bulm.1997.0033}
 518 }
 519
 520 @ARTICLE{Arques1993,
 521   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 522   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine codon probability
 523         after and before random mutations.},
 524   journal = {Bull Math Biol},
 525   year = {1993},
 526   volume = {55},
 527   pages = {1025--1038},
 528   number = {6},
 529   month = {Nov},
 530   abstract = {Recently, we proposed a new model of DNA sequence evolution (Arquès
 531         and Michel. 1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772) according to which
 532         actual genes on the purine/pyrimidine (R/Y) alphabet (R = purine
 533         = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine) are the
 534         result of two successive evolutionary genetic processes: (i) a mixing
 535         (independent) process of non-random oligonucleotides (words of base
 536         length less than 10: YRY(N)6, YRYRYR and YRYYRY are so far identified;
 537         N = R or Y) leading to primitive genes (words of several hundreds
 538         of base length) and followed by (ii) a random mutation process, i.e.,
 539         transformations of a base R (respectively Y) into the base Y (respectively
 540         R) at random sites in these primitive genes. Following this model
 541         the problem investigated here is the study of the variation of the
 542         8 R/Y codon probabilities RRR, ..., YYY under random mutations. Two
 543         analytical expressions solved here allow analysis of this variation
 544         in the classical evolutionary sense (from the past to the present,
 545         i.e., after random mutations), but also in the inverted evolutionary
 546         sense (from the present to the past, i.e., before random mutations).
 547         Different properties are also derived from these formulae. Finally,
 548         a few applications of these formulae are presented. They prove the
 549         proposition in Arquès and Michel (1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772),
 550         Section 3.3.2, with the existence of a maximal mean number of random
 551         mutations per base of the order 0.3 in the protein coding genes.
 552         They also confirm the mixing process of oligonucleotides by excluding
 553         the purine/pyrimidine contiguous and alternating tracts from the
 554         formation process of primitive genes.},
 555   institution = {Université de Franche-Comté, Besançon, France.},
 556   keywords = {Base Sequence; Codon; DNA, chemistry/genetics; Mathematics; Models,
 557         Genetic; Mutation; Probability; Purines; Pyrimidines},
 558   language = {eng},
 559   medline-pst = {ppublish},
 560   owner = {guyeux},
 561   pmid = {8281128},
 562   timestamp = {2011.05.05}
 563 }
 564
 565 @ARTICLE{Arques1993b,
 566   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 567   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 568         common to different eukaryotic gene subpopulations.},
 569   journal = {Biochimie},
 570   year = {1993},
 571   volume = {75},
 572   pages = {399--407},
 573   number = {5},
 574   abstract = {The nucleotide distribution in protein coding genes, introns and transfer
 575         RNA genes of eukaryotic subpopulations (primates, rodent and mammals)
 576         is studied by autocorrelation functions. The autocorrelation function
 577         analysing the occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY (YRY-function)
 578         in protein coding genes and transfer RNA genes of these three eukaryotic
 579         subpopulations retrieves the preferential occurrence of YRY(N)6YRY
 580         (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine,
 581         N = R or Y). The autocorrelation functions analysing the occurrence
 582         probability of the i-motifs RRR(N)iRRR (RRR-function) and YYY(N)iYYY
 583         (YYY-function) identify new non-random genetic statistical properties
 584         in these three eukaryotic subpopulations, mainly: i) in their protein
 585         coding genes: local maxima for i identical to 6 [12] (peaks for i
 586         = 6, 18, 30, 42) with the RRR-function and local maxima for i identical
 587         to 8 [10] (peaks for i = 8, 18, 28) with the YYY-function; and ii)
 588         in their introns: local maxima for i identical to 3 [6] (peaks for
 589         i = 3, 9, 15) and a short linear decrease followed by a large exponential
 590         decrease both with the RRR- and YYY-functions. The non-random properties
 591         identified in eukaryotic intron subpopulations are modelised with
 592         a process of random insertions and deletions of nucleotides simulating
 593         the RNA editing.},
 594   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 595         d'Informatique de Besançon, France.},
 596   keywords = {Animals; Base Sequence; Data Interpretation, Statistical; Genes; Introns;
 597         Mammals; Models, Genetic; Primates; Probability; Proteins, genetics;
 598         RNA Editing; RNA, Transfer, genetics; Rodentia; Sequence Analysis,
 599         DNA},
 600   language = {eng},
 601   medline-pst = {ppublish},
 602   owner = {guyeux},
 603   pii = {0300-9084(93)90173-P},
 604   pmid = {8347726},
 605   timestamp = {2011.05.05}
 606 }
 607
 608 @ARTICLE{Arques1992,
 609   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 610   title = {A simulation of the genetic periodicities modulo 2 and 3 with processes
 611         of nucleotide insertions and deletions.},
 612   journal = {J Theor Biol},
 613   year = {1992},
 614   volume = {156},
 615   pages = {113--127},
 616   number = {1},
 617   month = {May},
 618   abstract = {Recently, a new genetic process termed RNA editing has been identified
 619         showing insertions and deletions of nucleotides in particular RNA
 620         molecules. On the other hand, there are a few non-random statistical
 621         properties in genes: in particular, the periodicity modulo 3 (P3)
 622         associated with an open reading frame, the periodicity modulo 2 (P2)
 623         associated with alternating purine/pyrimidine stretches, the YRY(N)6YRY
 624         preferential occurrence (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 625         = cytosine or thymine, N = R or Y) representing a "code" of the DNA
 626         helix pitch, etc. The problem investigated here is whether a process
 627         of the type RNA editing can lead to the non-random statistical properties
 628         commonly observed in genes. This paper will show in particular that:
 629         The process of insertions and deletions of mononucleotides in the
 630         initial sequence [YRY(N)3]* [series of YRY(N)3] can lead to the periodicity
 631         modulo 2 (P2). The process of insertions and deletions of trinucleotides
 632         in the initial sequence [YRY(N)6]* [series of YRY(N)6] can lead to
 633         the periodicity modulo 3 (P3) and the YRY(N)6YRY preferential occurrence.
 634         Furthermore, these two processes lead to a strong correlation with
 635         the reality, namely the mononucleotide insertion/deletion process,
 636         with the 5' eukaryotic regions and the trinucleotide insertion/deletion
 637         process, with the eukaryotic protein coding genes.},
 638   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 639         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 640   keywords = {Chromosome Deletion; Computer Simulation; Humans; Models, Genetic;
 641         Mutagenesis, genetics; RNA, genetics},
 642   language = {eng},
 643   medline-pst = {ppublish},
 644   owner = {guyeux},
 645   pmid = {1379311},
 646   timestamp = {2011.05.05}
 647 }
 648
 649 @ARTICLE{Arques1990,
 650   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 651   title = {Periodicities in coding and noncoding regions of the genes.},
 652   journal = {J Theor Biol},
 653   year = {1990},
 654   volume = {143},
 655   pages = {307--318},
 656   number = {3},
 657   month = {Apr},
 658   abstract = {Gene population statistical studies of protein coding genes and introns
 659         have identified two types of periodicities on the purine/pyrimidine
 660         alphabet: (i) the modulo 3 periodicity or coding periodicity (periodicity
 661         P3) in protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, viruses,
 662         chloroplasts, mitochondria, plasmids and in introns of viruses and
 663         mitochondria, and (ii) the modulo 2 periodicity (periodicity P2)
 664         in the eukaryotic introns. The periodicity study is herein extended
 665         to the 5' and 3' regions of eukaryotes, prokaryotes and viruses and
 666         shows: (i) the periodicity P3 in the 5' and 3' regions of eukaryotes.
 667         Therefore, these observations suggest a unitary and dynamic concept
 668         for the genes as for a given genome, the 5' and 3' regions have the
 669         genetic information for protein coding genes and for introns: (1)
 670         In the eukaryotic genome, the 5' (P2 and P3) and 3' (P2 and P3) regions
 671         have the information for protein coding genes (P3) and for introns
 672         (P2). The intensity of P3 is high in 5' regions and weak in 3' regions,
 673         while the intensity of P2 is weak in 5' regions and high in 3' regions.
 674         (2) In the prokaryotic genome, the 5' (P3) and 3' (P3) regions have
 675         the information for protein coding genes (P3). (3) In the viral genome,
 676         the 5' (P3) and 3' (P3) regions have the information for protein
 677         coding genes (P3) and for introns (P3). The absence of P2 in viral
 678         introns (in opposition to eukaryotic introns) may be related to the
 679         absence of P2 in 5' and 3' regions of viruses.},
 680   institution = {Université de Franche-Comté, Unité Associée CNRS No. 822, Besançon,
 681         France.},
 682   keywords = {Animals; Base Sequence; Eukaryotic Cells; Genes; Introns; Prokaryotic
 683         Cells; Purine Nucleotides; Pyrimidine Nucleotides; Repetitive Sequences,
 684         Nucleic Acid; Viruses, genetics},
 685   language = {eng},
 686   medline-pst = {ppublish},
 687   owner = {guyeux},
 688   pmid = {2385108},
 689   timestamp = {2011.05.05}
 690 }
 691
 692 @ARTICLE{Arques1990a,
 693   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 694   title = {A model of DNA sequence evolution.},
 695   journal = {Bull Math Biol},
 696   year = {1990},
 697   volume = {52},
 698   pages = {741--772},
 699   number = {6},
 700   abstract = {Statistical studies of gene populations on the purine/pyrimidine alphabet
 701         have shown that the mean occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY
 702         (R = purine, Y = pyrimidine, N = R or Y) is not uniform by varying
 703         i in the range, but presents a maximum at i = 6 in the following
 704         populations: protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, chloroplasts
 705         and mitochondria, and also viral introns, ribosomal RNA genes and
 706         transfer RNA genes (Arquès and Michel, 1987b, J. theor. Biol. 128,
 707         457-461). From the "universality" of this observation, we suggested
 708         that the oligonucleotide YRY(N)6 is a primitive one and that it has
 709         a central function in DNA sequence evolution (Arquès and Michel,
 710         1987b, J. theor. Biol. 128, 457-461). Following this idea, we introduce
 711         a concept of a model of DNA sequence evolution which will be validated
 712         according to a schema presented in three parts. In the first part,
 713         using the last version of the gene database, the YRY(N)6YRY preferential
 714         occurrence (maximum at i = 6) is confirmed for the populations mentioned
 715         above and is extended to some newly analysed populations: chloroplast
 716         introns, chloroplast 5' regions, mitochondrial 5' regions and small
 717         nuclear RNA genes. On the other hand, the YRY(N)6YRY preferential
 718         occurrence and periodicities are used in order to classify 18 gene
 719         populations. In the second part, we will demonstrate that several
 720         statistical features characterizing different gene populations (in
 721         particular the YRY(N)6YRY preferential occurrence and the periodicities)
 722         can be retrieved from a simple Markov model based on the mixing of
 723         the two oligonucleotides YRY(N)6 and YRY(N)3 and based on the percentages
 724         of RYR and YRY in the unspecified trinucleotides (N)3 of YRY(N)6
 725         and YRY(N)3. Several properties are identified and prove in particular
 726         that the oligonucleotide mixing is an independent process and that
 727         several different features are functions of a unique parameter. In
 728         the third part, the return of the model to the reality shows a strong
 729         correlation between reality and simulation concerning the presence
 730         of a large alternating purine/pyrimidine stretches and of periodicities.
 731         It also contributes to a greater understanding of biological reality,
 732         e.g. the presence or the absence of large alternating purine/pyrimidine
 733         stretches can be explained as being a simple consequence of the mixing
 734         of two particular oligonucleotides. Finally, we believe that such
 735         an approach is the first step toward a unified model of DNA sequence
 736         evolution allowing the molecular understanding of both the origin
 737         of life and the actual biological reality.},
 738   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 739         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 740   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Genetics, Population;
 741         Models, Genetic},
 742   language = {eng},
 743   medline-pst = {ppublish},
 744   owner = {guyeux},
 745   pmid = {2279193},
 746   timestamp = {2011.05.05}
 747 }
 748
 749 @ARTICLE{Arques1993a,
 750   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel and K. Orieux},
 751   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 752         common to different populations of eukaryotic non-coding genes.},
 753   journal = {J Theor Biol},
 754   year = {1993},
 755   volume = {161},
 756   pages = {329--342},
 757   number = {3},
 758   month = {Apr},
 759   abstract = {The autocorrelation function analysing the occurrence probability
 760         of the i-motif YRY(N)iYRY in genes allows the identification of mainly
 761         two periodicities modulo 2, 3 and the preferential occurrence of
 762         the motif YRY(N)6YRY (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 763         = cytosine or thymine, N = R or Y). These non-random genetic statistical
 764         properties can be simulated by an independent mixing of the three
 765         oligonucleotides YRYRYR, YRYYRY and YRY(N)6 (Arquès & Michel, 1990b).
 766         The problem investigated in this study is whether new properties
 767         can be identified in genes with other autocorrelation functions and
 768         also simulated with an oligonucleotide mixing model. The two autocorrelation
 769         functions analysing the occurrence probability of the i-motifs RRR(N)iRRR
 770         and YYY(N)iYYY simultaneously identify three new non-random genetic
 771         statistical properties: a short linear decrease, local maxima for
 772         i identical to 3[6] (i = 3, 9, etc) and a large exponential decrease.
 773         Furthermore, these properties are common to three different populations
 774         of eukaryotic non-coding genes: 5' regions, introns and 3' regions
 775         (see section 2). These three non-random properties can also be simulated
 776         by an independent mixing of the four oligonucleotides R8, Y8, RRRYRYRRR,
 777         YYYRYRYYY and large alternating R/Y series. The short linear decrease
 778         is a result of R8 and Y8, the local maxima for i identical to 3[6],
 779         of RRRYRYRRR and YYYRYRYYY, and the large exponential decrease, of
 780         large alternating R/Y series (section 3). The biological meaning
 781         of these results and their relation to the previous oligonucleotide
 782         mixing model are presented in the Discussion.},
 783   doi = {10.1006/jtbi.1993.1059},
 784   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 785         d'Informatique de Besançon, France.},
 786   keywords = {Animals; Biological Evolution; Genes, genetics; Models, Genetic; Models,
 787         Statistical; Mutation, genetics; Oligonucleotides, genetics; Probability},
 788   language = {eng},
 789   medline-pst = {ppublish},
 790   owner = {guyeux},
 791   pii = {S0022-5193(83)71059-3},
 792   pmid = {8331957},
 793   timestamp = {2011.05.05},
 794   url = {http://dx.doi.org/10.1006/jtbi.1993.1059}
 795 }
 796
 797 @ARTICLE{Arroyo08,
 798   author = {David Arroyo and Gonzalo Alvarez and Veronica Fernandez},
 799   title = {On the inadequacy of the logistic map for cryptographic applications},
 800   journal = {X Reunión Española sobre Criptología y Seguridad de la Información
 801         (X RECSI)},
 802   year = {2008},
 803   volume = {1},
 804   pages = {77-82},
 805   owner = {christophe},
 806   timestamp = {2010.03.01}
 807 }
 808
 809 @MISC{Backofen99algorithmicapproach,
 810   author = {R. Backofen and S. Will and P. Clote},
 811   title = {Algorithmic Approach To Quantifying The Hydrophobic Force Contribution
 812         In Protein Folding},
 813   year = {1999}
 814 }
 815
 816
 817 @inproceedings{Blum:1985:EPP:19478.19501,
 818  author = {Blum, Manuel and Goldwasser, Shafi},
 819  title = {An efficient probabilistic public key encryption scheme which hides all partial information},
 820  booktitle = {Proceedings of CRYPTO 84 on Advances in cryptology},
 821  year = {1985},
 822  isbn = {0-387-15658-5},
 823  location = {Santa Barbara, California, United States},
 824  pages = {289--302},
 825  numpages = {14},
 826  url = {http://dl.acm.org/citation.cfm?id=19478.19501},
 827  acmid = {19501},
 828  publisher = {Springer-Verlag New York, Inc.},
 829  address = {New York, NY, USA},
 830  keywords = {chosen cyphertext attack, integer factorization, partial information, passive adversaries, probabilistic encryption},
 831 }
 832
 833
 834 @INPROCEEDINGS{bcgr11:ip,
 835   author = {Bahi, Jacques M. and Couchot, Jean-fran\c{c}ois and Guyeux, Christophe
 836         and Richard, Adrien},
 837   title = {On the Link Between Strongly Connected Iteration Graphs and Chaotic
 838         Boolean Discrete-Time Dynamical Systems},
 839   booktitle = {FCT'11, 18th Int. Symp. on Fundamentals of Computation Theory},
 840   year = {2011},
 841   volume = {*},
 842   series = {LNCS},
 843   pages = {***--***},
 844   address = {Oslo, Norway},
 845   month = aug,
 846   note = {To appear},
 847   classement = {ACTI},
 848   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 849   equipe = {and},
 850   inhal = {no}
 851 }
 852
 853 @ARTICLE{bg10:ij,
 854   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 855   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
 856   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
 857   year = {2010},
 858   volume = {4},
 859   pages = {167--181},
 860   number = {2},
 861   classement = {ACLI},
 862   doi = {10.1260/1748-3018.4.2.167},
 863   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 864   equipe = {and},
 865   impact-factor = {#},
 866   inhal = {no},
 867   isi-acro = {#},
 868   url = {http://dx.doi.org/10.1260/1748-3018.4.2.167}
 869 }
 870
 871 @INPROCEEDINGS{guyeux10ter,
 872   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 873   title = {A new chaos-based watermarking algorithm},
 874   booktitle = {SECRYPT'10, Int. conf. on security and cryptography},
 875   year = {2010},
 876   pages = {455--458},
 877   address = {Athens, Greece},
 878   month = jul,
 879   publisher = {SciTePress},
 880   classement = {ACTI},
 881   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 882   equipe = {and},
 883   inhal = {no}
 884 }
 885
 886 @INPROCEEDINGS{bgc11:ip,
 887   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Cote, Nathalie},
 888   title = {Chaos of Protein Folding},
 889   booktitle = {IJCNN 2011, Int. Joint Conf. on Neural Networks},
 890   year = {2011},
 891   pages = {***--***},
 892   address = {San Jose, California, United States},
 893   month = jul,
 894   note = {To appear},
 895   classement = {ACTI},
 896   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 897   equipe = {and},
 898   inhal = {no}
 899 }
 900
 901 @INPROCEEDINGS{guyeux10bis,
 902   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 903   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 904         Networks},
 905   booktitle = {SENSORCOMM'10, 4-th Int. Conf. on Sensor Technologies and Applications},
 906   year = {2010},
 907   pages = {472--477},
 908   address = {Venice-Mestre, Italy},
 909   month = jul,
 910   classement = {ACTI},
 911   doi = {10.1109/SENSORCOMM.2010.76},
 912   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 913   equipe = {and},
 914   inhal = {no},
 915   url = {http://dx.doi.org/10.1109/SENSORCOMM.2010.76}
 916 }
 917
 918 @INPROCEEDINGS{guyeuxVictoria,
 919   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 920   title = {Secure Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. Homomorphism
 921         versus Watermarking Approach},
 922   booktitle = {ADHOCNETS 2010, 2nd Int. Conf. on Ad Hoc Networks},
 923   year = {2010},
 924   volume = {49},
 925   series = {Lecture Notes in ICST},
 926   pages = {344--358},
 927   address = {Victoria, Canada},
 928   month = aug,
 929   classement = {ACTI},
 930   doi = {10.1007/978-3-642-17994-5_23},
 931   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 932   equipe = {and},
 933   inhal = {no},
 934   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5_23}
 935 }
 936
 937 @INPROCEEDINGS{bgs11:ip,
 938   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Salomon, Michel},
 939   title = {Building a Chaotic Proven Neural Network},
 940   booktitle = {ICCANS 2011, IEEE Int. Conf. on Computer Applications and Network
 941         Security},
 942   year = {2011},
 943   pages = {***--***},
 944   address = {Maldives, Maldives},
 945   month = may,
 946   classement = {ACTI},
 947   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 948   equipe = {and},
 949   inhal = {no}
 950 }
 951
 952 @INPROCEEDINGS{bgw10:ip,
 953   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 954   title = {A Pseudo Random Numbers Generator Based on Chaotic Iterations. Application
 955         to Watermarking},
 956   booktitle = {WISM 2010, Int. Conf. on Web Information Systems and Mining},
 957   year = {2010},
 958   volume = {6318},
 959   series = {LNCS},
 960   pages = {202--211},
 961   address = {Sanya, China},
 962   month = oct,
 963   classement = {ACTI},
 964   doi = {10.1007/978-3-642-16515-3_26},
 965   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 966   equipe = {and},
 967   inhal = {no},
 968   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-16515-3_26}
 969 }
 970
 971 @INPROCEEDINGS{bgw09:ip,
 972   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 973   title = {A novel pseudo-random generator based on discrete chaotic iterations},
 974   booktitle = {INTERNET'09, 1-st Int. Conf. on Evolving Internet},
 975   year = {2009},
 976   pages = {71--76},
 977   address = {Cannes, France},
 978   month = aug,
 979   classement = {ACTI},
 980   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 981   equipe = {and},
 982   inhal = {no}
 983 }
 984
 985 @INPROCEEDINGS{bmg10:onp,
 986   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 987   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 988         Networks for critical applications},
 989   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 990         et Applications Critiques de Surveillance},
 991   year = {2010},
 992   address = {Bayonne, France},
 993   month = jun,
 994   note = {Communication orale},
 995   classement = {COM},
 996   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 997   equipe = {and},
 998   inhal = {no}
 999 }
1000
1001 @INPROCEEDINGS{guyeuxBayonne,
1002   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
1003   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
1004         Networks for critical applications},
1005   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
1006         et Applications Critiques de Surveillance},
1007   year = {2010},
1008   address = {Bayonne, France},
1009   month = jun,
1010   note = {Communication orale},
1011   classement = {COM},
1012   equipe = {and},
1013   inhal = {no}
1014 }
1015
1016 @ARTICLE{bs10:ij,
1017   author = {Bahi, Jacques M. and Salomon, Michel},
1018   title = {A Decentralized Energy-based Diffusion Algorithm to Increase the
1019         Lifetime of {MANETs}},
1020   journal = {Computer Networks Journal},
1021   year = {2010},
1022   pages = {***--***},
1023   note = {Accepted manuscript. To appear},
1024   classement = {ACLI},
1025   equipe = {and},
1026   impact-factor = {1.201},
1027   inhal = {no},
1028   isi-acro = {#},
1029   publisher = {Elsevier}
1030 }
1031
1032 @ARTICLE{Bahi2000,
1033   author = {J. M. Bahi},
1034   title = {Boolean totally asynchronous iterations},
1035   journal = {Int. Journal of Mathematical Algorithms},
1036   year = {2000},
1037   volume = {1},
1038   pages = {331--346},
1039   owner = {guyeux},
1040   timestamp = {17/02/2008}
1041 }
1042
1043 @ARTICLE{Bahi2000bis,
1044   author = {Jacques M. Bahi},
1045   title = {Asynchronous iterative algorithms for nonexpansive linear systems},
1046   journal = {Journal of Parallel and Distributed Computing},
1047   year = {2000},
1048   volume = {60},
1049   pages = {92--112},
1050   owner = {guyeux},
1051   timestamp = {2009.01.10}
1052 }
1053
1054 @ARTICLE{Bahi1999,
1055   author = {J. M. Bahi},
1056   title = {Parallel synchronous chaotic iterations for singular linear systems},
1057   journal = {Parallel Algorithms and Applications},
1058   year = {1999},
1059   volume = {14},
1060   pages = {19--35},
1061   owner = {guyeux},
1062   timestamp = {17/02/2008}
1063 }
1064
1065 @ARTICLE{Bahi1998,
1066   author = {Jacques M. Bahi},
1067   title = {Algorithmes paralleles asynchrones pour les systemes singuliers},
1068   journal = {Comptes Rendus de l'Academie des Sciences},
1069   year = {1998},
1070   volume = {t. 326, serie 1},
1071   pages = {1421--1425},
1072   owner = {guyeux},
1073   timestamp = {2009.01.18}
1074 }
1075
1076 @PHDTHESIS{bahi98,
1077   author = {Jacques M. Bahi},
1078   title = {Méthodes itératives dans des espaces produits. Application au calcul
1079         parallèle},
1080   school = {Université de Franche-Comté},
1081   year = {1998},
1082   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1083   owner = {christophe},
1084   timestamp = {2010.08.24}
1085 }
1086
1087 @PHDTHESIS{bahi91,
1088   author = {Jacques M. Bahi},
1089   title = {Algorithmes asynchrones pour des systèmes différentiels-algébriques.
1090         Simulation numérique sur des exemples de circuits électriques},
1091   school = {Université de Franche-Comté},
1092   year = {1991},
1093   owner = {christophe},
1094   timestamp = {2010.08.24}
1095 }
1096
1097 @ARTICLE{bcv06:ij,
1098   author = {Jacques M. Bahi and Sylvain Contassot-Vivier},
1099   title = {Basins of attraction in fully asynchronous discrete-time discrete-state
1100         dynamic networks},
1101   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1102   year = {2006},
1103   volume = {17},
1104   pages = {397--408},
1105   number = {2},
1106   inhal = {no},
1107   owner = {guyeux},
1108   timestamp = {2009.12.04}
1109 }
1110
1111 @ARTICLE{Bahi2002,
1112   author = {J.~M. Bahi and S. Contassot-Vivier},
1113   title = {Stability of fully asynchronous discrete-time discrete state dynamic
1114         networks},
1115   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1116   year = {2002},
1117   volume = {13(6)},
1118   pages = {1353-1363},
1119   owner = {guyeux},
1120   timestamp = {2009.02.14}
1121 }
1122
1123 @TECHREPORT{bcgg10:ir,
1124   author = {Bahi, J. M. and Couchot, J.-F. and Grasset, O. and Guyeux, C.},
1125   title = {{D}iscrete {D}ynamical {S}ystems: {N}ecessary {D}ivergence {C}onditions
1126         for {S}ynchronous {I}terations},
1127   institution = {LIFC - Laboratoire d'{I}nformatique de l'{U}niversit\'{e} de {F}ranche
1128         {C}omt\'{e}},
1129   year = {2010},
1130   type = {Research Report},
1131   number = {RR2010-04},
1132   month = sep,
1133   pdf = {/~publis/papers/pub/2010/RR2010-04.pdf}
1134 }
1135
1136 @ARTICLE{guyeux09,
1137   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1138   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
1139   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
1140   year = {2010},
1141   volume = {4},
1142   pages = {167--181},
1143   number = {2},
1144   classement = {ACLNI},
1145   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1146   equipe = {and},
1147   impact-factor = {#},
1148   inhal = {no},
1149   isi-acro = {#}
1150 }
1151
1152 @INPROCEEDINGS{guyeux10,
1153   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1154   title = {Topological chaos and chaotic iterations, application to Hash functions},
1155   booktitle = {WCCI'10, IEEE World Congress on Computational Intelligence},
1156   year = {2010},
1157   pages = {1--7},
1158   address = {Barcelona, Spain},
1159   month = jul,
1160   note = {Best paper award},
1161   classement = {ACTI},
1162   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1163   equipe = {and},
1164   inhal = {no}
1165 }
1166
1167 @MISC{ih10,
1168   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1169   title = {A chaos-based approach for information hiding security.},
1170   howpublished = {arXiv},
1171   month = {April},
1172   year = {2010},
1173   institution = {Computer Science Laboratory LIFC, University of Franche-Comte, France}
1174 }
1175
1176 @ARTICLE{arxiv,
1177   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1178   title = {A watermarking algorithm satisfying topological chaos properties},
1179   journal = {CoRR},
1180   year = {2008},
1181   volume = {abs/0810.4713},
1182   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1183   ee = {http://arxiv.org/abs/0810.4713}
1184 }
1185
1186 @ARTICLE{Bahi2008,
1187   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1188   title = {Chaotic iterations and topological chaos},
1189   year = {2008},
1190   abstract = {Chaotic iterations have been introduced on the one hand by Chazan,
1191         Miranker [5] and Miellou [9] in a numerical analysis context, and
1192         on the other hand by Robert [11] and Pellegrin [10] in the discrete
1193         dynamical systems framework. In both cases, the objective was to
1194         derive conditions of convergence of such iterations to a fixed state.
1195         In this paper, a new point of view is presented, the goal here is
1196         to derive conditions under which chaotic iterations admit a chaotic
1197         behaviour in a rigorous mathematical sense. Contrary to what has
1198         been studied in the literature, convergence is not desired. More
1199         precisely, we establish in this paper a link between the concept
1200         of chaotic iterations on a finite set and the notion of topological
1201         chaos [8], [6], [7]. We are motivated by concrete applications of
1202         our approach, such as the use of chaotic boolean iterations in the
1203         computer security field. Indeed, the concept of chaos is used in
1204         many areas of data security without real rigorous theoretical foundations,
1205         and without using the fundamental properties that allow chaos. The
1206         wish of this paper is to bring a bit more mathematical rigour in
1207         this field.},
1208   citeseerurl = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1209   comment = {arXiv},
1210   comments = {6 pages},
1211   eprint = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1212   oai2identifier = {0810.3154},
1213   owner = {guyeux},
1214   timestamp = {2008.10.23},
1215   url = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}}
1216 }
1217
1218 @ARTICLE{arxivRNNchaos,
1219   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux and Michel Salomon},
1220   title = {Building a Chaotic Proved Neural Network},
1221   journal = {CoRR},
1222   year = {2011},
1223   volume = {abs/1101.4351},
1224   ee = {http://arxiv.org/abs/1101.4351}
1225 }
1226
1227 @INPROCEEDINGS{guyeuxTaiwan10,
1228   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
1229   title = {Improving random number generators by chaotic iterations. Application
1230         in data hiding},
1231   booktitle = {ICCASM 2010, Int. Conf. on Computer Application and System Modeling},
1232   year = {2010},
1233   pages = {V13-643--V13-647},
1234   address = {Taiyuan, China},
1235   month = oct,
1236   classement = {ACTI},
1237   doi = {10.1109/ICCASM.2010.5622199},
1238   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1239   equipe = {and},
1240   inhal = {no},
1241   url = {http://dx.doi.org/10.1109/ICCASM.2010.5622199}
1242 }
1243
1244 @ARTICLE{Bahi2009,
1245   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1246   title = {A stochastic model of gene evolution with time dependent pseudochaotic
1247         mutations.},
1248   journal = {Bull Math Biol},
1249   year = {2009},
1250   volume = {71},
1251   pages = {681--700},
1252   number = {3},
1253   month = {Apr},
1254   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1255         in which a random subset of the 64 possible trinucleotides mutates
1256         at each evolutionary time t according to some time dependent substitution
1257         probabilities. Therefore, at each time t, the numbers and the types
1258         of mutable trinucleotides are unknown. Thus, the mutation matrix
1259         changes at each time t. This pseudochaotic model developed generalizes
1260         the standard model in which all the trinucleotides mutate at each
1261         time t. It determines the occurrence probabilities at time t of trinucleotides
1262         which pseudochaotically mutate according to 3 time dependent substitution
1263         parameters associated with the 3 trinucleotide sites. The main result
1264         proves that under suitable assumptions, this pseudochaotic model
1265         converges to a uniform probability vector identical to that of the
1266         standard model. Furthermore, an application of this pseudochaotic
1267         model allows an evolutionary study of the 3 circular codes identified
1268         in both eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1269         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1270         frames in genes locally, i.e., anywhere in genes and particularly
1271         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1272         After a certain evolutionary time and with particular time dependent
1273         functions for the 3 substitution parameters, precisely an exponential
1274         decrease in the 1st and 2nd trinucleotide sites and an exponential
1275         increase in the 3rd one, this pseudochaotic model retrieves the main
1276         statistical properties of the 3 circular codes observed in genes.
1277         Furthermore, it leads to a circular code asymmetry stronger than
1278         the standard model (nonpseudochaotic) and, therefore, to a better
1279         correlation with the genes.},
1280   doi = {10.1007/s11538-008-9376-4},
1281   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1282         90016, Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1283   keywords = {Evolution, Molecular; Genes; Models, Genetic; Mutation; Stochastic
1284         Processes},
1285   language = {eng},
1286   medline-pst = {ppublish},
1287   owner = {guyeux},
1288   pmid = {19198957},
1289   timestamp = {2011.05.05},
1290   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-008-9376-4}
1291 }
1292
1293 @ARTICLE{Bahi2008a,
1294   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1295   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations.},
1296   journal = {J Theor Biol},
1297   year = {2008},
1298   volume = {255},
1299   pages = {53--63},
1300   number = {1},
1301   month = {Nov},
1302   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1303         in which the mutations are chaotic, i.e. a random subset of the 64
1304         possible trinucleotides mutates at each evolutionary time t according
1305         to some substitution probabilities. Therefore, at each time t, the
1306         numbers and the types of mutable trinucleotides are unknown. Thus,
1307         the mutation matrix changes at each time t. The chaotic model developed
1308         generalizes the standard model in which all the trinucleotides mutate
1309         at each time t. It determines the occurrence probabilities at time
1310         t of trinucleotides which chaotically mutate according to three substitution
1311         parameters associated with the three trinucleotide sites. Two theorems
1312         prove that this chaotic model has a probability vector at each time
1313         t and that it converges to a uniform probability vector identical
1314         to that of the standard model. Furthermore, four applications of
1315         this chaotic model (with a uniform random strategy for the 64 trinucleotides
1316         and with a particular strategy for the three stop codons) allow an
1317         evolutionary study of the three circular codes identified in both
1318         eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1319         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1320         frames in genes locally, i.e. anywhere in genes and particularly
1321         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1322         After a certain evolutionary time and with particular values for
1323         the three substitution parameters, the chaotic models retrieve the
1324         main statistical properties of the three circular codes observed
1325         in genes. These applications also allow an evolutionary comparison
1326         between the standard and chaotic models.},
1327   doi = {10.1016/j.jtbi.2008.07.028},
1328   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1329         90016 Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1330   keywords = {Animals; Computer Simulation; DNA, Circular, genetics; Evolution,
1331         Molecular; Genetic Code; Models, Genetic; Mutation; Nonlinear Dynamics;
1332         Stochastic Processes; Time},
1333   language = {eng},
1334   medline-pst = {ppublish},
1335   owner = {guyeux},
1336   pii = {S0022-5193(08)00395-0},
1337   pmid = {18706428},
1338   timestamp = {2011.05.05},
1339   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2008.07.028}
1340 }
1341
1342 @ARTICLE{Bahi2008bis,
1343   author = {Bahi, J. M. and Michel, C. J.},
1344   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations},
1345   journal = {Journal of Theoretical Biology},
1346   year = {2008},
1347   volume = {255},
1348   pages = {53-63},
1349   owner = {guyeux},
1350   timestamp = {2009.01.10}
1351 }
1352
1353 @ARTICLE{Bahi2004,
1354   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1355   title = {A stochastic gene evolution model with time dependent mutations.},
1356   journal = {Bull Math Biol},
1357   year = {2004},
1358   volume = {66},
1359   pages = {763--778},
1360   number = {4},
1361   month = {Jul},
1362   abstract = {We develop here a new class of gene evolution models in which the
1363         nucleotide mutations are time dependent. These models allow to study
1364         nonlinear gene evolution by accelerating or decelerating the mutation
1365         rates at different evolutionary times. They generalize the previous
1366         ones which are based on constant mutation rates. The stochastic model
1367         developed in this class determines at some time t the occurrence
1368         probabilities of trinucleotides mutating according to 3 time dependent
1369         substitution parameters associated with the 3 trinucleotide sites.
1370         Therefore, it allows to simulate the evolution of the circular code
1371         recently observed in genes. By varying the class of function for
1372         the substitution parameters, 1 among 12 models retrieves after mutation
1373         the statistical properties of the observed circular code in the 3
1374         frames of actual genes. In this model, the mutation rate in the 3rd
1375         trinucleotide site increases during gene evolution while the mutation
1376         rates in the 1st and 2nd sites decrease. This property agrees with
1377         the actual degeneracy of the genetic code. This approach can easily
1378         be generalized to study evolution of motifs of various lengths, e.g.,
1379         dicodons, etc., with time dependent mutations.},
1380   doi = {10.1016/j.bulm.2003.10.004},
1381   institution = {LIFC - FRE CNRS 2661, IUT de Belfort, Université de Franche-Comté,
1382         BP 527, 90016 Belfort Cédex, France. bahi@iut-bm.univ-fcomte.fr},
1383   keywords = {Codon, genetics; Evolution, Molecular; Genes, genetics; Genetic Code,
1384         genetics; Models, Genetic; Mutation; Stochastic Processes},
1385   language = {eng},
1386   medline-pst = {ppublish},
1387   owner = {guyeux},
1388   pii = {S0092824003001174},
1389   pmid = {15210317},
1390   timestamp = {2011.05.05},
1391   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.bulm.2003.10.004}
1392 }
1393
1394 @ARTICLE{Banks92,
1395   author = {J. Banks and J. Brooks and G. Cairns and P. Stacey},
1396   title = {On Devaney's Definition of Chaos},
1397   journal = {Amer. Math. Monthly},
1398   year = {1992},
1399   volume = {99},
1400   pages = {332--334},
1401   keywords = {(c+),},
1402   owner = {guyeux},
1403   timestamp = {27/01/2008}
1404 }
1405
1406 @MISC{Nist10,
1407   author = {E. Barker and A. Roginsky},
1408   title = {DRAFT NIST Special Publication 800-131 Recommendation for the Transitioning
1409         of Cryptographic Algorithms and Key Sizes},
1410   year = {2010},
1411   owner = {christophe},
1412   timestamp = {2010.08.18}
1413 }
1414
1415 @ARTICLE{BarniBF03,
1416   author = {Mauro Barni and Franco Bartolini and Teddy Furon},
1417   title = {A general framework for robust watermarking security},
1418   journal = {Signal Processing},
1419   year = {2003},
1420   volume = {83},
1421   pages = {2069-2084},
1422   number = {10},
1423   note = {Special issue on Security of Data Hiding Technologies, invited paper},
1424   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1425   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/S0165-1684(03)00168-3},
1426   owner = {guyeux},
1427   timestamp = {2009.06.30}
1428 }
1429
1430 @ARTICLE{Baudet78,
1431   author = {Baudet, G\'{e}rard M.},
1432   title = {Asynchronous Iterative Methods for Multiprocessors},
1433   journal = {J. ACM},
1434   year = {1978},
1435   volume = {25},
1436   pages = {226--244},
1437   number = {2},
1438   address = {New York, NY, USA},
1439   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/322063.322067},
1440   issn = {0004-5411},
1441   publisher = {ACM}
1442 }
1443
1444 @PHDTHESIS{Baz98,
1445   author = {Didier El Baz},
1446   title = {Contribution à l'algorithmique parallèle. Le concept d'asynchronisme
1447         : étude théorique, mise en œuvre, et application},
1448   school = {Institut national polytechnique de Toulouse},
1449   year = {1998},
1450   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1451   owner = {christophe},
1452   timestamp = {2010.08.24}
1453 }
1454
1455 @ARTICLE{bhr09c:bl,
1456   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1457   title = {Contention awareness and fault-tolerant scheduling for precedence
1458         constrained tasks in heterogeneous systems},
1459   journal = {Parallel Computing},
1460   year = {2009},
1461   volume = {35},
1462   pages = {83--108},
1463   number = {2},
1464   classement = {*},
1465   doi = {10.1016/j.parco.2008.11.001},
1466   equipe = {and},
1467   inhal = {no},
1468   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.parco.2008.11.001}
1469 }
1470
1471 @INPROCEEDINGS{bhr08b:bl,
1472   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1473   title = {Fault tolerant scheduling of precedence task graphs on heterogeneous
1474         platforms},
1475   booktitle = {IPDPS'08},
1476   year = {2008},
1477   pages = {1--8},
1478   publisher = {IEEE Computer Society Press},
1479   classement = {*},
1480   equipe = {and},
1481   inhal = {no}
1482 }
1483
1484 @INPROCEEDINGS{Berger98,
1485   author = {Berger, Bonnie and Leighton, Tom},
1486   title = {Protein folding in the hydrophobic-hydrophilic (HP) is NP-complete},
1487   booktitle = {Proceedings of the second annual international conference on Computational
1488         molecular biology},
1489   year = {1998},
1490   series = {RECOMB '98},
1491   pages = {30--39},
1492   address = {New York, NY, USA},
1493   publisher = {ACM},
1494   acmid = {279080},
1495   isbn = {0-89791-976-9},
1496   location = {New York, New York, United States},
1497   numpages = {10}
1498 }
1499
1500 @BOOK{Bertsekas89,
1501   title = {Parallel and distributed computation: numerical methods},
1502   publisher = {Prentice-Hall, Inc.},
1503   year = {1989},
1504   author = {Bertsekas, Dimitri P. and Tsitsiklis, John N.},
1505   address = {Upper Saddle River, NJ, USA},
1506   isbn = {0-13-648700-9}
1507 }
1508
1509 @MISC{Bertsekas88paralleland,
1510   author = {Dimitri P. Bertsekas and John N. Tsitsiklis},
1511   title = {Parallel and distributed iterative algorithms: a selective survey},
1512   year = {1988}
1513 }
1514
1515 @UNPUBLISHED{F.a,
1516   author = {F. Blanchard and E. Glasner and S. Kolyada and A.Maass},
1517   title = {On Li-Yorke pairs},
1518   note = {Preprint},
1519   optkey = {2000},
1520   owner = {guyeux},
1521   timestamp = {2008.01.02}
1522 }
1523
1524 @UNPUBLISHED{F.,
1525   author = {F. Blanchard and B. Host and S. Ruette},
1526   title = {Asymptotic pairs in positive-entropy systems},
1527   note = {Preprint},
1528   optannote = {to appear in Ergod. Th. Dynam. Sys.},
1529   optkey = {2000},
1530   owner = {guyeux},
1531   timestamp = {2008.01.02}
1532 }
1533
1534 @ARTICLE{BFibe,
1535   author = {Dan Boneh and Matt Franklin},
1536   title = {Identity-Based Encryption from the {Weil} Pairing},
1537   journal = {SIAM J. of Computing},
1538   year = {2003},
1539   volume = {32},
1540   pages = {586-615},
1541   number = {3},
1542   note = {Extended abstract in Crypto'01}
1543 }
1544
1545 @INCOLLECTION{boneh,
1546   author = {Boneh, Dan and Goh, Eu-Jin and Nissim, Kobbi},
1547   title = {Evaluating 2-DNF Formulas on Ciphertexts},
1548   year = {2005},
1549   pages = {325--341},
1550   abstract = {Let ψ be a 2-DNF formula on boolean variables x 1,..., x n ∈ {0,1}.
1551         We present a homomorphic public key encryption scheme that allows
1552         the public evaluation of ψ given an encryption of the variables x
1553         1,..., x n. In other words, given the encryption of the bits x 1,...,
1554         x n, anyone can create the encryption of ψ( x 1,..., x n). More generally,
1555         we can evaluate quadratic multi-variate polynomials on ciphertexts
1556         provided the resulting value falls within a small set. We present
1557         a number of applications of the system: 1 In a database of size n,
1558         the total communication in the basic step of the Kushilevitz-Ostrovsky
1559         PIR protocol is reduced from to . 2 An efficient election system
1560         based on homomorphic encryption where voters do not need to include
1561         non-interactive zero knowledge proofs that their ballots are valid.
1562         The election system is proved secure without random oracles but still
1563         efficient. 3 A protocol for universally verifiable computation.},
1564   citeulike-article-id = {2719460},
1565   citeulike-linkout-0 = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg},
1566   journal = {Theory of Cryptography},
1567   keywords = {homomorphic, pairings},
1568   posted-at = {2008-04-25 21:53:15},
1569   priority = {2},
1570   url = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg}
1571 }
1572
1573 @ARTICLE{Bonneau01,
1574   author = {Bonneau, Richard and Baker, David},
1575   title = {AB INITIO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION: Progress and Prospects},
1576   journal = {Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure},
1577   year = {2001},
1578   volume = {30},
1579   pages = {173-189},
1580   number = {1},
1581   doi = {10.1146/annurev.biophys.30.1.173}
1582 }
1583
1584 @ARTICLE{Bowen,
1585   author = {R. Bowen},
1586   title = {Entropy for group endomorphisms and homogeneous spaces},
1587   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1588   year = {1971},
1589   volume = {153},
1590   pages = {401-414},
1591   owner = {guyeux},
1592   timestamp = {15/02/2008}
1593 }
1594
1595 @ARTICLE{Bowen1971,
1596   author = {R. Bowen},
1597   title = {Periodic points and measures for Axiom A diffeomorphisms},
1598   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1599   year = {1971},
1600   volume = {154},
1601   pages = {377-397},
1602   owner = {guyeux},
1603   timestamp = {15/02/2008}
1604 }
1605
1606 @ARTICLE{Braxenthaler97,
1607   author = {Michael Braxenthaler and R. Ron Unger and Ditza Auerbach and John
1608         Moult},
1609   title = {Chaos in protein dynamics},
1610   journal = {Proteins-structure Function and Bioinformatics},
1611   year = {1997},
1612   volume = {29},
1613   pages = {417--425},
1614   doi = {10.1002/(SICI)1097-0134(199712)29:4<417::AID-PROT2>3.3.CO;2-O},
1615   masid = {2824140}
1616 }
1617
1618 @INPROCEEDINGS{Brumley03remotetiming,
1619   author = {David Brumley and Dan Boneh},
1620   title = {Remote Timing Attacks are Practical},
1621   booktitle = {Proceedings of the 12th USENIX Security Symposium},
1622   year = {2003},
1623   pages = {1--14}
1624 }
1625
1626 @ARTICLE{Bohm1991375,
1627   author = {Gerald Böhm},
1628   title = {Protein folding and deterministic chaos: Limits of protein folding
1629         simulations and calculations},
1630   journal = {Chaos, Solitons \& Fractals},
1631   year = {1991},
1632   volume = {1},
1633   pages = {375 - 382},
1634   number = {4},
1635   doi = {DOI: 10.1016/0960-0779(91)90028-8},
1636   issn = {0960-0779},
1637   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TJ4-46CBXVT-1X/2/370489c218e4c2732cd9b620ef50c696}
1638 }
1639
1640 @INCOLLECTION{Cachin2004,
1641   author = {Cachin, Christian},
1642   title = {An Information-Theoretic Model for Steganography},
1643   booktitle = {Information Hiding},
1644   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1645   year = {1998},
1646   volume = {1525},
1647   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1648   pages = {306-318},
1649   affiliation = {MIT Laboratory for Computer Science 545 Technology Square Cambridge
1650         MA 02139 USA}
1651 }
1652
1653 @ARTICLE{Cam2006,
1654   author = {H. Cam and S. Ozdemir and P. Nair and D. Muthuavinashinappan and
1655         H. O. Sanli},
1656   title = {ESPDA: Energy-efficient secure pattern based data aggregation for
1657         wireless sensor networks.},
1658   journal = {Computer Communication journal (29)},
1659   year = {2006},
1660   pages = {446-455}
1661 }
1662
1663 @ARTICLE{CarletCZ98,
1664   author = {Claude Carlet and Pascale Charpin and Victor Zinoviev},
1665   title = {Codes, Bent Functions and Permutations Suitable For DES-like Cryptosystems},
1666   journal = {Des. Codes Cryptography},
1667   year = {1998},
1668   volume = {15},
1669   pages = {125-156},
1670   number = {2},
1671   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de}
1672 }
1673
1674 @INPROCEEDINGS{Castelluccia05efficientaggregation,
1675   author = {Claude Castelluccia},
1676   title = {Efficient aggregation of encrypted data in wireless sensor networks},
1677   booktitle = {MobiQuitous},
1678   year = {2005},
1679   pages = {109--117},
1680   publisher = {IEEE Computer Society}
1681 }
1682
1683 @ARTICLE{Cayre2008,
1684   author = {Cayre, F. and Bas, P.},
1685   title = {Kerckhoffs-Based Embedding Security Classes for WOA Data Hiding},
1686   journal = {IEEE Transactions on Information Forensics and Security},
1687   year = {2008},
1688   volume = {3},
1689   pages = {1--15},
1690   number = {1},
1691   doi = {10.1109/TIFS.2007.916006},
1692   issn = {1556-6013},
1693   keywords = {cryptography, random sequences, spread spectrum communication, telecommunication
1694         security, watermarking, Kerckhoffs-based embedding security classes,
1695         WOA Data Hiding, pseudorandom sequences, spread-spectrum techniques,
1696         steganography security, watermark-only-attack, watermarking, Security,
1697         spread-spectrum (SS) watermarking},
1698   owner = {guyeux},
1699   timestamp = {2009.06.29}
1700 }
1701
1702 @ARTICLE{Cayre2005,
1703   author = {Cayre, F. and Fontaine, C. and Furon, T.},
1704   title = {Watermarking security: theory and practice},
1705   journal = {IEEE Transactions on Signal Processing},
1706   year = {2005},
1707   volume = {53},
1708   pages = {3976--3987},
1709   number = {10},
1710   doi = {10.1109/TSP.2005.855418},
1711   issn = {1053-587X},
1712   keywords = {blind source separation, cryptography, watermarking, Fisher information
1713         matrix, blind source separation, cryptanalysis, information theory,
1714         spread spectrum techniques, substitutive scheme, watermarking security,
1715         Blind source separation, Fisher information matrix, equivocation,
1716         security, watermarking},
1717   owner = {guyeux},
1718   timestamp = {2009.06.29}
1719 }
1720
1721 @ARTICLE{Chajakis91,
1722   author = {Chajakis, Emmanuel D. and Zenios, Stavros A.},
1723   title = {Synchronous and asynchronous implementations of relaxation algorithms
1724         for nonlinear network optimization},
1725   journal = {Parallel Comput.},
1726   year = {1991},
1727   volume = {17},
1728   pages = {873--894},
1729   number = {8},
1730   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1731   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/S0167-8191(05)80072-9},
1732   issn = {0167-8191},
1733   publisher = {Elsevier Science Publishers B. V.}
1734 }
1735
1736 @ARTICLE{Chan2007,
1737   author = {Chan, Haowen and Perrig, Adrian and Przydatek, Bartosz and Song,
1738         Dawn},
1739   title = {SIA: Secure information aggregation in sensor networks},
1740   journal = {J. Comput. Secur.},
1741   year = {2007},
1742   volume = {15},
1743   pages = {69--102},
1744   number = {1},
1745   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1746   issn = {0926-227X},
1747   publisher = {IOS Press}
1748 }
1749
1750 @ARTICLE{Chandramouli06,
1751   author = {R. Chandramouli and S. Bapatla and K.P. Subbalakshmi},
1752   title = {Battery power-aware encryption},
1753   journal = {ACM transactions on information and system security},
1754   year = {2006},
1755   pages = {162--180},
1756   owner = {christophe},
1757   timestamp = {2010.07.31}
1758 }
1759
1760 @ARTICLE{Charpin85,
1761   author = {Pascale Charpin},
1762   title = {A description of some extended cyclic codes with application to Reed-Solomon
1763         codes},
1764   journal = {Discrete Mathematics},
1765   year = {1985},
1766   volume = {56},
1767   pages = {117-124},
1768   number = {2-3},
1769   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1770   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/0012-365X(85)90019-6}
1771 }
1772
1773 @ARTICLE{Chazan69,
1774   author = {D. Chazan and W. Miranker},
1775   title = {Chaotic relaxation},
1776   journal = {Linear algebra and its applications},
1777   year = {1969},
1778   pages = {199-222},
1779   owner = {guyeux},
1780   timestamp = {2008.05.22}
1781 }
1782
1783 @ARTICLE{Cheon2006,
1784   author = {Cheon, Jung Hee and Kim, Woo-Hwan and Nam, Hyun Soo},
1785   title = {Known-plaintext cryptanalysis of the Domingo-Ferrer algebraic privacy
1786         homomorphism scheme},
1787   journal = {Inf. Process. Lett.},
1788   year = {2006},
1789   volume = {97},
1790   pages = {118--123},
1791   number = {3},
1792   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1793   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ipl.2005.09.016},
1794   issn = {0020-0190},
1795   publisher = {Elsevier North-Holland, Inc.}
1796 }
1797
1798 @MISC{Cheon03acryptanalysis,
1799   author = {Jung Hee Cheon and Hyun Soo Nam},
1800   title = {A Cryptanalysis of the Original Domingo-Ferrer's Algebraic Privacy
1801         Homomorphism},
1802   year = {2003}
1803 }
1804
1805 @ARTICLE{Cheung05,
1806   author = {R.C.C. Cheung and N.J. Telle and W. Luk and P.Y.K. Cheung},
1807   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
1808   journal = {IEEE Trans. on Very Large Scale Integration Systems},
1809   year = {2005},
1810   volume = {13},
1811   pages = {1048-1059},
1812   number = {9}
1813 }
1814
1815 @ARTICLE{Chivian2005,
1816   author = {Chivian, Dylan and Kim, David E. and Malmström, Lars and Schonbrun,
1817         Jack and Rohl, Carol A. and Baker, David},
1818   title = {Prediction of CASP6 structures using automated robetta protocols},
1819   journal = {Proteins},
1820   year = {2005},
1821   volume = {61},
1822   pages = {157--166},
1823   number = {S7},
1824   issn = {1097-0134},
1825   keywords = {Rosetta, fragment assembly, de novo modeling, homology modeling, parametric
1826         alignment ensemble},
1827   owner = {christophe},
1828   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
1829   timestamp = {2011.01.22},
1830   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20733}
1831 }
1832
1833 @ARTICLE{Zhu06,
1834   author = {Congxu, Zhu and Xuefeng, Liao and Zhihua, Li},
1835   title = {Chaos-based multipurpose image watermarking algorithm},
1836   journal = {Wuhan University Journal of Natural Sciences},
1837   year = {2006},
1838   volume = {11},
1839   pages = {1675-1678},
1840   note = {10.1007/BF02831848},
1841   abstract = {To achieve the goal of image content authentication and copyright
1842         protection simultaneously, this paper presents a novel image dual
1843         watermarking method based on chaotic map. Firstly, the host image
1844         was split into many nonoverlapping small blocks, and the block-wise
1845         discrete cosine transform (DCT) is computed. Secondly, the robust
1846         watermarks, shuffled by the chaotic sequences, are embedded in the
1847         DC coefficients of blocks to achieve the goal of copyright protection.
1848         The semi-fragile watermarks, generated by chaotic map, are embedded
1849         in the AC coefficients of blocks to obtain the aim of image authentication.
1850         Both of them can be extracted without the original image. Simulation
1851         results demonstrate the effectiveness of our algorithm in terms of
1852         robustness and fragility.},
1853   affiliation = {Central South University School of Information Science and Engineering
1854         410083 Changsha, Hunan China},
1855   issn = {1007-1202},
1856   issue = {6},
1857   keyword = {Mathematics, general},
1858   publisher = {Wuhan University, co-published with Springer},
1859   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF02831848}
1860 }
1861
1862 @ARTICLE{Conley1978,
1863   author = {C. Conley},
1864   title = {Isolated invariant sets and the Morse index},
1865   journal = {CBMS Regional Conference. AMS.},
1866   year = {1978},
1867   optvolume = {38},
1868   owner = {guyeux},
1869   timestamp = {2008.01.02}
1870 }
1871
1872 @ARTICLE{Cornu2002,
1873   author = {Philippe Cornu and André Smolarz},
1874   title = {Image characterization by texture},
1875   journal = {Traitement du signal},
1876   year = {2002},
1877   volume = {19},
1878   pages = {29-35},
1879   file = {:/home/guyeux/Documents/Bibliotheque/These/Watermarking/Caractérisation d'images par textures associées.pdf:PDF},
1880   owner = {guyeux},
1881   timestamp = {2008.05.12}
1882 }
1883
1884 @INPROCEEDINGS{Cox99,
1885   author = {Ingemar Cox and Matt L. Miller and Andrew L. Mckellips},
1886   title = {Watermarking as Communications With Side Information},
1887   booktitle = {Proceedings of the IEEE},
1888   year = {1999},
1889   pages = {1127--1141},
1890   owner = {christophe},
1891   timestamp = {2010.03.06}
1892 }
1893
1894 @ARTICLE{Cox97securespread,
1895   author = {Ingemar J. Cox and Senior Member and Joe Kilian and F. Thomson Leighton
1896         and Talal Shamoon},
1897   title = {Secure spread spectrum watermarking for multimedia},
1898   journal = {IEEE Transactions on Image Processing},
1899   year = {1997},
1900   volume = {6},
1901   pages = {1673--1687}
1902 }
1903
1904 @ARTICLE{Cramer96,
1905   author = {Christopher Cramer and Erol Gelenbe and Hakan Bakircioglu},
1906   title = {Video Compression with Random Neural Networks},
1907   journal = {Neural Networks for Identification, Control, and Robotics, International
1908         Workshop},
1909   year = {1996},
1910   volume = {0},
1911   pages = {0476},
1912   address = {Los Alamitos, CA, USA},
1913   isbn = {0-8186-7456-3},
1914   publisher = {IEEE Computer Society}
1915 }
1916
1917 @INPROCEEDINGS{Crescenzi98,
1918   author = {Crescenzi, Pierluigi and Goldman, Deborah and Papadimitriou, Christos
1919         and Piccolboni, Antonio and Yannakakis, Mihalis},
1920   title = {On the complexity of protein folding (extended abstract)},
1921   booktitle = {Proceedings of the thirtieth annual ACM symposium on Theory of computing},
1922   year = {1998},
1923   series = {STOC '98},
1924   pages = {597--603},
1925   address = {New York, NY, USA},
1926   publisher = {ACM},
1927   acmid = {276875},
1928   isbn = {0-89791-962-9},
1929   location = {Dallas, Texas, United States},
1930   numpages = {7}
1931 }
1932
1933 @ARTICLE{Dawei2004,
1934   author = {Zhao Dawei and Chen Guanrong and Liu Wenbo},
1935   title = {A chaos-based robust wavelet-domain watermarking algorithm},
1936   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
1937   year = {2004},
1938   volume = {22},
1939   pages = {47-54},
1940   owner = {guyeux},
1941   timestamp = {2008.10.07}
1942 }
1943
1944 @MISC{1011.1638,
1945   author = {Anthony Desnos and Robert Erra and Eric Filiol},
1946   title = {Processor-Dependent Malware... and codes},
1947   year = {2010},
1948   comment = {arXiv:1011.1638},
1949   eprint = {arXiv:1011.1638}
1950 }
1951
1952 @BOOK{devaney,
1953   title = {An Introduction to Chaotic Dynamical Systems},
1954   publisher = {Addison-Wesley},
1955   year = {1989},
1956   author = {Devaney, Robert L.},
1957   address = {Redwood City, CA},
1958   edition = {2nd}
1959 }
1960
1961 @ARTICLE{diffie76,
1962   author = {Whitfield Diffie and Martin E. Hellman},
1963   title = {New Directions in Cryptography},
1964   journal = {IEEE Transactions on Information Theory},
1965   year = {1976},
1966   volume = {IT-22},
1967   pages = {644--654},
1968   number = {6},
1969   date = {November 1976},
1970   owner = {guyeux},
1971   timestamp = {2009.06.30},
1972   url = {citeseer.ist.psu.edu/diffie76new.html}
1973 }
1974
1975 @INCOLLECTION{Dijk10,
1976   author = {van Dijk, Marten and Gentry, Craig and Halevi, Shai and Vaikuntanathan,
1977         Vinod},
1978   title = {Fully Homomorphic Encryption over the Integers},
1979   booktitle = {Advances in Cryptology – EUROCRYPT 2010},
1980   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1981   year = {2010},
1982   editor = {Gilbert, Henri},
1983   volume = {6110},
1984   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1985   pages = {24-43},
1986   abstract = {We construct a simple fully homomorphic encryption scheme, using only
1987         elementary modular arithmetic. We use Gentry’s technique to construct
1988         a fully homomorphic scheme from a bootstrappable somewhat homomorphic
1989         scheme. However, instead of using ideal lattices over a polynomial
1990         ring, our bootstrappable encryption scheme merely uses addition and
1991         multiplication over the integers. The main appeal of our scheme is
1992         the conceptual simplicity. We reduce the security of our scheme to
1993         finding an approximate integer gcd – i.e., given a list of integers
1994         that are near-multiples of a hidden integer, output that hidden integer.
1995         We investigate the hardness of this task, building on earlier work
1996         of Howgrave-Graham.},
1997   affiliation = {MIT CSAIL}
1998 }
1999
2000 @ARTICLE{Dill1985,
2001   author = {Dill, KA},
2002   title = {Theory for the folding and stability of globular proteins.},
2003   journal = {Biochemistry},
2004   year = {1985},
2005   volume = {24},
2006   pages = {1501-9--},
2007   number = {6},
2008   month = mar,
2009   abstract = {Using lattice statistical mechanics, we develop theory to account
2010         for the folding of a heteropolymer molecule such as a protein to
2011         the globular and soluble state. Folding is assumed to be driven by
2012         the association of solvophobic monomers to avoid solvent and opposed
2013         by the chain configurational entropy. Theory predicts a phase transition
2014         as a function of temperature or solvent character. Molecules that
2015         are too short or too long or that have too few solvophobic residues
2016         are predicted not to fold. Globular molecules should have a largely
2017         solvophobic core, but there is an entropic tendency for some residues
2018         to be "out of place", particularly in small molecules. For long chains,
2019         molecules comprised of globular domains are predicted to be thermodynamically
2020         more stable than spherical molecules. The number of accessible conformations
2021         in the globular state is calculated to be an exceedingly small fraction
2022         of the number available to the random coil. Previous estimates of
2023         this number, which have motivated kinetic theories of folding, err
2024         by many tens of orders of magnitude.},
2025   comment = {Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
2026   keywords = {Mathematics, Models, Chemical, Polymers, Protein Conformation},
2027   owner = {christophe},
2028   timestamp = {2011.01.22},
2029   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/3986190}
2030 }
2031
2032 @ARTICLE{Dill1995,
2033   author = {Dill, KA and Bromberg, S and Yue, K and Fiebig, KM and Yee, DP and
2034         Thomas, PD and Chan, HS},
2035   title = {Principles of protein folding--a perspective from simple exact models.},
2036   journal = {Protein Sci},
2037   year = {1995},
2038   volume = {4},
2039   pages = {561-602--},
2040   number = {4},
2041   month = apr,
2042   abstract = {General principles of protein structure, stability, and folding kinetics
2043         have recently been explored in computer simulations of simple exact
2044         lattice models. These models represent protein chains at a rudimentary
2045         level, but they involve few parameters, approximations, or implicit
2046         biases, and they allow complete explorations of conformational and
2047         sequence spaces. Such simulations have resulted in testable predictions
2048         that are sometimes unanticipated: The folding code is mainly binary
2049         and delocalized throughout the amino acid sequence. The secondary
2050         and tertiary structures of a protein are specified mainly by the
2051         sequence of polar and nonpolar monomers. More specific interactions
2052         may refine the structure, rather than dominate the folding code.
2053         Simple exact models can account for the properties that characterize
2054         protein folding: two-state cooperativity, secondary and tertiary
2055         structures, and multistage folding kinetics--fast hydrophobic collapse
2056         followed by slower annealing. These studies suggest the possibility
2057         of creating "foldable" chain molecules other than proteins. The encoding
2058         of a unique compact chain conformation may not require amino acids;
2059         it may require only the ability to synthesize specific monomer sequences
2060         in which at least one monomer type is solvent-averse.},
2061   address = {Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California,
2062         San Francisco 94143-1204, USA.},
2063   comment = {Review,Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't,
2064         Non-P.H.S.,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
2065   keywords = {Amino Acid Sequence, Biological Evolution, Hydrogen Bonding, Models,
2066         Molecular, Molecular Sequence Data, Mutation, Protein Conformation,
2067         Protein Denaturation, Protein Folding, Temperature, Thermodynamics},
2068   owner = {christophe},
2069   timestamp = {2011.01.22},
2070   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/7613459}
2071 }
2072
2073 @INPROCEEDINGS{Dobbertin96,
2074   author = {Dobbertin, Hans},
2075   title = {Cryptanalysis of MD4},
2076   booktitle = {Proceedings of the Third International Workshop on Fast Software
2077         Encryption},
2078   year = {1996},
2079   pages = {53--69},
2080   address = {London, UK},
2081   publisher = {Springer-Verlag},
2082   isbn = {3-540-60865-6}
2083 }
2084
2085 @INPROCEEDINGS{DomingoFerrer2002,
2086   author = {Domingo-Ferrer, Josep},
2087   title = {A Provably Secure Additive and Multiplicative Privacy Homomorphism},
2088   booktitle = {ISC '02: Proceedings of the 5th International Conference on Information
2089         Security},
2090   year = {2002},
2091   pages = {471--483},
2092   address = {London, UK},
2093   publisher = {Springer-Verlag},
2094   isbn = {3-540-44270-7}
2095 }
2096
2097 @ARTICLE{Dubchak1995,
2098   author = {I. Dubchak and I. Muchnik and S. R. Holbrook and S. H. Kim},
2099   title = {Prediction of protein folding class using global description of amino
2100         acid sequence.},
2101   journal = {Proc Natl Acad Sci U S A},
2102   year = {1995},
2103   volume = {92},
2104   pages = {8700--8704},
2105   number = {19},
2106   month = {Sep},
2107   __markedentry = {[guyeux]},
2108   abstract = {We present a method for predicting protein folding class based on
2109         global protein chain description and a voting process. Selection
2110         of the best descriptors was achieved by a computer-simulated neural
2111         network trained on a data base consisting of 83 folding classes.
2112         Protein-chain descriptors include overall composition, transition,
2113         and distribution of amino acid attributes, such as relative hydrophobicity,
2114         predicted secondary structure, and predicted solvent exposure. Cross-validation
2115         testing was performed on 15 of the largest classes. The test shows
2116         that proteins were assigned to the correct class (correct positive
2117         prediction) with an average accuracy of 71.7\%, whereas the inverse
2118         prediction of proteins as not belonging to a particular class (correct
2119         negative prediction) was 90-95\% accurate. When tested on 254 structures
2120         used in this study, the top two predictions contained the correct
2121         class in 91\% of the cases.},
2122   institution = {Department of Chemistry, University of California, Berkeley 94720,
2123         USA.},
2124   keywords = {Amino Acid Sequence; Amino Acids, chemistry; Computer Simulation;
2125         Databases, Factual; Models, Chemical; Neural Networks (Computer);
2126         Protein Folding; Protein Structure, Secondary; Proteins, chemistry/classification;
2127         Reproducibility of Results; Solvents},
2128   language = {eng},
2129   medline-pst = {ppublish},
2130   owner = {guyeux},
2131   pmid = {7568000},
2132   timestamp = {2011.07.18}
2133 }
2134
2135 @BOOK{Dudley,
2136   title = {Real analysis and probability},
2137   publisher = {Cambridge University Press},
2138   author = {Richard M. Dudley},
2139   optpages = {209},
2140   owner = {guyeux},
2141   timestamp = {2008.01.02}
2142 }
2143
2144 @ARTICLE{Tarazi84,
2145   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2146   title = {Algorithmes mixtes asynchrones. Etude de convergence monotone},
2147   journal = {Numerische Mathematik},
2148   year = {1984},
2149   volume = {44},
2150   pages = {363-369},
2151   note = {10.1007/BF01405568},
2152   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2153         Box 5969 Kuwait},
2154   issn = {0029-599X},
2155   issue = {3},
2156   keyword = {Mathematics and Statistics},
2157   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2158   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01405568}
2159 }
2160
2161 @ARTICLE{Tarazi82,
2162   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2163   title = {Some convergence results for asynchronous algorithms},
2164   journal = {Numerische Mathematik},
2165   year = {1982},
2166   volume = {39},
2167   pages = {325-340},
2168   note = {10.1007/BF01407866},
2169   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2170         Box 5969 Kuwait Kuwait},
2171   issn = {0029-599X},
2172   issue = {3},
2173   keyword = {Mathematics and Statistics},
2174   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2175   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01407866}
2176 }
2177
2178 @ARTICLE{Fei2005,
2179   author = {Peng Fei and Qiu Shui-Sheng and Long Min},
2180   title = {A secure digital signature algorithm based on elliptic curve and
2181         chaotic mappings},
2182   journal = {Circuits Systems Signal Processing},
2183   year = {2005},
2184   volume = {24, No. 5},
2185   pages = {585--597},
2186   owner = {guyeux},
2187   timestamp = {2009.01.16}
2188 }
2189
2190 @BOOK{Feigenbaum1908,
2191   title = {Universal behavior in nonlinear systems},
2192   publisher = {Los Alamos Science},
2193   year = {1908},
2194   author = {Feigenbaum},
2195   owner = {guyeux},
2196   timestamp = {2008.01.02}
2197 }
2198
2199 @ARTICLE{Felsenstein1980,
2200   author = {J. Felsenstein},
2201   title = {A view of population genetics.},
2202   journal = {Science},
2203   year = {1980},
2204   volume = {208},
2205   pages = {1253},
2206   number = {4449},
2207   month = {Jun},
2208   doi = {10.1126/science.208.4449.1253},
2209   language = {eng},
2210   medline-pst = {ppublish},
2211   owner = {guyeux},
2212   pii = {208/4449/1253},
2213   pmid = {17830806},
2214   timestamp = {2011.05.05},
2215   url = {http://dx.doi.org/10.1126/science.208.4449.1253}
2216 }
2217
2218 @BOOK{Filiol09,
2219   title = {Les virus informatiques : techniques virales et antivirales avancées},
2220   year = {2009},
2221   editor = {Springer},
2222   author = {Eric Filiol},
2223   owner = {christophe},
2224   timestamp = {2010.10.13}
2225 }
2226
2227 @INPROCEEDINGS{FiliolBlackHat,
2228   author = {Eric Filiol},
2229   title = {Passive and Active Leakage of Secret Data from Non Networked Computer},
2230   booktitle = {Black Hat},
2231   year = {2008},
2232   owner = {christophe},
2233   timestamp = {2010.11.28}
2234 }
2235
2236 @PHDTHESIS{Formenti2003,
2237   author = {Enrico Formenti},
2238   title = {De l'algorithmique du chaos dans les systèmes dynamiques discrets},
2239   school = {Université de Provence},
2240   year = {2003},
2241   owner = {guyeux},
2242   timestamp = {2008.01.02}
2243 }
2244
2245 @PHDTHESIS{Formenti1998,
2246   author = {Enrico Formenti},
2247   title = {Automates cellulaires et chaos : de la vision topologique à la vision
2248         algorithmique},
2249   school = {\'Ecole Normale Supérieure de Lyon},
2250   year = {1998},
2251   optmonth = {Octobre},
2252   owner = {guyeux},
2253   timestamp = {2008.01.02}
2254 }
2255
2256 @ARTICLE{Frey2006,
2257   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2258   title = {Identification of circular codes in bacterial genomes and their use
2259         in a factorization method for retrieving the reading frames of genes.},
2260   journal = {Comput Biol Chem},
2261   year = {2006},
2262   volume = {30},
2263   pages = {87--101},
2264   number = {2},
2265   month = {Apr},
2266   abstract = {We developed a statistical method that allows each trinucleotide to
2267         be associated with a unique frame among the three possible ones in
2268         a (protein coding) gene. An extensive gene study in 175 complete
2269         bacterial genomes based on this statistical approach resulted in
2270         identification of 72 new circular codes. Finding a circular code
2271         enables an immediate retrieval of the reading frame locally anywhere
2272         in a gene. No knowledge of location of the start codon is required
2273         and a short window of only a few nucleotides is sufficient for automatic
2274         retrieval. We have therefore developed a factorization method (that
2275         explores previously found circular codes) for retrieving the reading
2276         frames of bacterial genes. Its principle is new and easy to understand.
2277         Neither complex treatment nor specific information on the nucleotide
2278         sequences is necessary. Moreover, the method can be used for short
2279         regions in nucleotide sequences (less than 25 nucleotides in protein
2280         coding genes). Selected additional properties of circular codes and
2281         their possible biological consequences are also discussed.},
2282   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001},
2283   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2284         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2285         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2286   keywords = {Base Sequence; Computational Biology; Genes, Bacterial; Genome, Bacterial;
2287         Genomics, statistics /&/ numerical data; Models, Genetic; Models,
2288         Statistical; Reading Frames},
2289   language = {eng},
2290   medline-pst = {ppublish},
2291   owner = {guyeux},
2292   pii = {S1476-9271(05)00111-8},
2293   pmid = {16439185},
2294   timestamp = {2011.05.05},
2295   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001}
2296 }
2297
2298 @ARTICLE{Frey2006a,
2299   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2300   title = {An analytical model of gene evolution with six mutation parameters:
2301         an application to archaeal circular codes.},
2302   journal = {Comput Biol Chem},
2303   year = {2006},
2304   volume = {30},
2305   pages = {1--11},
2306   number = {1},
2307   month = {Feb},
2308   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
2309         mutation matrix 64 x 64 with six substitution parameters associated
2310         with the transitions and transversions in the three trinucleotide
2311         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
2312         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
2313         x 64 with three parameters. It determines at some time t the exact
2314         occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly according
2315         to six substitution parameters. An application of this model allows
2316         an evolutionary study of the common circular code COM and the 15
2317         archaeal circular codes X which have been recently identified in
2318         several archaeal genomes. The main property of a circular code is
2319         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
2320         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
2321         with a window of a few nucleotides. In genes, the circular code is
2322         superimposed on the traditional genetic one. Very unexpectedly, the
2323         evolutionary model demonstrates that the archaeal circular codes
2324         can derive from the common circular code subjected to random substitutions
2325         with particular values for six substitutions parameters. It has a
2326         strong correlation with the statistical observations of three archaeal
2327         codes in actual genes. Furthermore, the properties of these substitution
2328         rates allow proposal of an evolutionary classification of the 15
2329         archaeal codes into three main classes according to this model. In
2330         almost all the cases, they agree with the actual degeneracy of the
2331         genetic code with substitutions more frequent in the third trinucleotide
2332         site and with transitions more frequent that transversions in any
2333         trinucleotide site.},
2334   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001},
2335   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2336         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2337         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2338   keywords = {Archaea, genetics; DNA, Circular; Evolution, Molecular; Genetic Code;
2339         Genome, Archaeal; Models, Genetic; Mutation; Trinucleotide Repeats},
2340   language = {eng},
2341   medline-pst = {ppublish},
2342   owner = {guyeux},
2343   pii = {S1476-9271(05)00083-6},
2344   pmid = {16324886},
2345   timestamp = {2011.05.05},
2346   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001}
2347 }
2348
2349 @INPROCEEDINGS{fgb11:ip,
2350   author = {Friot, Nicolas and Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2351   title = {Chaotic Iterations for Steganography - Stego-security and chaos-security},
2352   booktitle = {SECRYPT'2011, Int. Conf. on Security and Cryptography},
2353   year = {2011},
2354   pages = {***--***},
2355   address = {Sevilla, Spain},
2356   month = jul,
2357   note = {To appear},
2358   classement = {ACTI},
2359   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2360   equipe = {and},
2361   inhal = {no}
2362 }
2363
2364 @MISC{Frisch,
2365   author = {Alain Frisch},
2366   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2367   year = {1998},
2368   note = {Rapport de tipe},
2369   file = {Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:Chaos/Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:PDF},
2370   keywords = {Chaos, Entropie Topologique, Tipe},
2371   owner = {guyeux},
2372   timestamp = {2008.01.02},
2373   url = {http://alain.frisch.fr/math.html}
2374 }
2375
2376 @MISC{Frisch98,
2377   author = {Alain Frisch},
2378   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2379   year = {1998},
2380   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2381   url = {\url{http://alain.frisch.fr/math.html}}
2382 }
2383
2384 @ARTICLE{Frommer97asynchronousweighted,
2385   author = {Andreas Frommer and Hartmut Schwandt and Daniel and Daniel B. Szyld},
2386   title = {Asynchronous Weighted Additive Schwarz Methods},
2387   journal = {Electronic Transactions on Numerical Analysis},
2388   year = {1997},
2389   volume = {5},
2390   pages = {48--61}
2391 }
2392
2393 @MISC{Frommer94asynchronoustwo-stage,
2394   author = {Andreas Frommer and Daniel B. Szyld},
2395   title = {Asynchronous Two-Stage Iterative Methods},
2396   year = {1994}
2397 }
2398
2399 @BOOK{J1992,
2400   title = {Introduction to Chaos and Coherence},
2401   publisher = {IOP Publishing},
2402   year = {1992},
2403   author = {J. Frøyland},
2404   owner = {guyeux},
2405   timestamp = {2008.01.02}
2406 }
2407
2408 @MISC{Furon2002,
2409   author = {T. Furon},
2410   title = {Security analysis},
2411   year = {2002},
2412   note = {European Project IST-1999-10987 CERTIMARK, Deliverable D.5.5},
2413   owner = {guyeux},
2414   timestamp = {2009.06.30}
2415 }
2416
2417 @ARTICLE{Furon08,
2418   author = {Furon, Teddy and Bas, Patrick},
2419   title = {Broken arrows},
2420   journal = {EURASIP J. Inf. Secur.},
2421   year = {2008},
2422   volume = {2008},
2423   pages = {1--13},
2424   address = {New York, NY, United States},
2425   doi = {http://dx.doi.org/10.1155/2008/597040},
2426   issn = {1687-4161},
2427   owner = {christophe},
2428   publisher = {Hindawi Publishing Corp.},
2429   timestamp = {2010.03.06}
2430 }
2431
2432 @ARTICLE{P1150442004,
2433   author = {G.S.El-Taweel and H.M. Onsi and M.Samy and M.G. Darwish},
2434   title = {Secure and Non-Blind Watermarking Scheme for Color Images Based on
2435         DWT},
2436   journal = {ICGST International Journal on Graphics, Vision and Image Processing},
2437   year = {2005},
2438   volume = {05},
2439   pages = {1--5},
2440   month = {April},
2441   issue = {4},
2442   owner = {christophe},
2443   timestamp = {2010.03.07}
2444 }
2445
2446 @INPROCEEDINGS{Gentry09,
2447   author = {Gentry, Craig},
2448   title = {Fully homomorphic encryption using ideal lattices},
2449   booktitle = {STOC '09: Proceedings of the 41st annual ACM symposium on Theory
2450         of computing},
2451   year = {2009},
2452   pages = {169--178},
2453   address = {New York, NY, USA},
2454   publisher = {ACM},
2455   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1536414.1536440},
2456   isbn = {978-1-60558-506-2},
2457   location = {Bethesda, MD, USA}
2458 }
2459
2460 @INPROCEEDINGS{Girao04,
2461   author = {J. Girao and M. Schneider and D. Westhoff},
2462   title = {CDA: Concealed data aggregation in wireless sensor networks},
2463   booktitle = {Proceedings of the ACM Workshop on Wireless Security},
2464   year = {2004},
2465   owner = {christophe},
2466   timestamp = {2010.07.31}
2467 }
2468
2469 @CONFERENCE{Gotsman88,
2470   author = {C. Gotsman and D. Lehmann and E. Shamir},
2471   title = {Asynchronous Dynamics of Random Boolean Networks},
2472   booktitle = {San Diego '88 Neural Networks Conference},
2473   year = {1988},
2474   owner = {guyeux},
2475   timestamp = {30/03/2008}
2476 }
2477
2478 @ARTICLE{Guckenheimer1979,
2479   author = {J. Guckenheimer},
2480   title = {Sensitive dependence to initial conditions for one-dimensional maps},
2481   journal = {Comm. Math. Phys.},
2482   year = {1979},
2483   optpages = {133-160},
2484   owner = {guyeux},
2485   timestamp = {2008.01.02}
2486 }
2487
2488 @BOOK{J.1983,
2489   title = {Nonlinear oscillations, dynamical systems, and bifurcations of vector
2490         fields},
2491   publisher = {Springer Verlag},
2492   year = {1983},
2493   author = {J. Guckenheimer and P. Holmes},
2494   owner = {guyeux},
2495   timestamp = {2008.01.02}
2496 }
2497
2498 @ARTICLE{Guo20093201,
2499   author = {Wei Guo and Xiaoming Wang and Dake He and Yang Cao},
2500   title = {Cryptanalysis on a parallel keyed hash function based on chaotic
2501         maps},
2502   journal = {Physics Letters A},
2503   year = {2009},
2504   volume = {373},
2505   pages = {3201 - 3206},
2506   number = {36},
2507   abstract = {This Letter analyzes the security of a novel parallel keyed hash function
2508         based on chaotic maps, proposed by Xiao et al. to improve the efficiency
2509         in parallel computing environment. We show how to devise forgery
2510         attacks on Xiao's scheme with differential cryptanalysis and give
2511         the experiment results of two kinds of forgery attacks firstly. Furthermore,
2512         we discuss the problem of weak keys in the scheme and demonstrate
2513         how to utilize weak keys to construct collision.},
2514   issn = {0375-9601},
2515   keywords = {Cryptanalysis}
2516 }
2517
2518 @PHDTHESIS{GuyeuxThese10,
2519   author = {Christophe Guyeux},
2520   title = {Le d\'{e}sordre des it\'{e}rations chaotiques et leur utilit\'{e}
2521         en s\'{e}curit\'{e} informatique},
2522   school = {Universit\'{e} de Franche-Comt\'{e}},
2523   year = {2010},
2524   owner = {christophe},
2525   timestamp = {2010.12.21}
2526 }
2527
2528 @MISC{gb11:onp,
2529   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2530   title = {\'Etude topologique de l'\'etalement de spectre},
2531   howpublished = {Journ\'ees Codes et St\'eganographie, \'Ecoles Militaires de Saint-Cyr,
2532         Co\"etquidan},
2533   month = jan,
2534   year = {2011},
2535   classement = {COM},
2536   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2537   equipe = {and},
2538   inhal = {no}
2539 }
2540
2541 @INPROCEEDINGS{bg10:ip,
2542   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2543   title = {An improved watermarking algorithm for Internet applications},
2544   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
2545   year = {2010},
2546   pages = {119--124},
2547   address = {Valencia, Spain},
2548   month = sep,
2549   classement = {ACTI},
2550   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2551   equipe = {and},
2552   inhal = {no}
2553 }
2554
2555 @INPROCEEDINGS{gfb10:ip,
2556   author = {Guyeux, Christophe and Friot, Nicolas and Bahi, Jacques},
2557   title = {Chaotic iterations versus Spread-spectrum: chaos and stego security},
2558   booktitle = {IIH-MSP'10, 6-th Int. Conf. on Intelligent Information Hiding and
2559         Multimedia Signal Processing},
2560   year = {2010},
2561   pages = {208--211},
2562   address = {Darmstadt, Germany},
2563   month = oct,
2564   classement = {ACTI},
2565   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2566   equipe = {and},
2567   inhal = {no}
2568 }
2569
2570 @ARTICLE{friot10,
2571   author = {Christophe Guyeux and Nicolas Friot and Jacques M. Bahi},
2572   title = {A more secure information hiding scheme than spread-spectrum obtained
2573         by chaos-security},
2574   journal = {arXiv 0032565},
2575   year = {2010},
2576   owner = {guyeux},
2577   timestamp = {2010.04.30}
2578 }
2579
2580 @BOOK{ECC,
2581   title = {Guide to Elliptic Curve Cryptography},
2582   publisher = {Springer Professional Computing},
2583   year = {2004},
2584   editor = {Springer},
2585   author = {D. Hankerson and A. Menezes and S. Vanstone},
2586   owner = {christophe},
2587   timestamp = {2010.07.31}
2588 }
2589
2590 @ARTICLE{Hasegawa1985,
2591   author = {M. Hasegawa and H. Kishino and T. Yano},
2592   title = {Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial
2593         DNA.},
2594   journal = {J Mol Evol},
2595   year = {1985},
2596   volume = {22},
2597   pages = {160--174},
2598   number = {2},
2599   abstract = {A new statistical method for estimating divergence dates of species
2600         from DNA sequence data by a molecular clock approach is developed.
2601         This method takes into account effectively the information contained
2602         in a set of DNA sequence data. The molecular clock of mitochondrial
2603         DNA (mtDNA) was calibrated by setting the date of divergence between
2604         primates and ungulates at the Cretaceous-Tertiary boundary (65 million
2605         years ago), when the extinction of dinosaurs occurred. A generalized
2606         least-squares method was applied in fitting a model to mtDNA sequence
2607         data, and the clock gave dates of 92.3 +/- 11.7, 13.3 +/- 1.5, 10.9
2608         +/- 1.2, 3.7 +/- 0.6, and 2.7 +/- 0.6 million years ago (where the
2609         second of each pair of numbers is the standard deviation) for the
2610         separation of mouse, gibbon, orangutan, gorilla, and chimpanzee,
2611         respectively, from the line leading to humans. Although there is
2612         some uncertainty in the clock, this dating may pose a problem for
2613         the widely believed hypothesis that the pipedal creature Australopithecus
2614         afarensis, which lived some 3.7 million years ago at Laetoli in Tanzania
2615         and at Hadar in Ethiopia, was ancestral to man and evolved after
2616         the human-ape splitting. Another likelier possibility is that mtDNA
2617         was transferred through hybridization between a proto-human and a
2618         proto-chimpanzee after the former had developed bipedalism.},
2619   keywords = {Animals; Biological Evolution; DNA, Mitochondrial, genetics; Genes;
2620         Haplorhini, genetics; Humans; Mathematics; Models, Genetic; Nucleic
2621         Acid Hybridization; Primates, genetics; Proteins, genetics; Species
2622         Specificity},
2623   language = {eng},
2624   medline-pst = {ppublish},
2625   owner = {guyeux},
2626   pmid = {3934395},
2627   timestamp = {2011.05.05}
2628 }
2629
2630 @BOOK{R1994,
2631   title = {A First Course in Discrete Dynamical Systems},
2632   publisher = {Springer-Verlag},
2633   year = {1994},
2634   author = {R. Homlgren},
2635   optpages = {106},
2636   owner = {guyeux},
2637   timestamp = {2008.01.02}
2638 }
2639
2640 @INCOLLECTION{Hoque09,
2641   author = {Hoque, Md. and Chetty, Madhu and Sattar, Abdul},
2642   title = {Genetic Algorithm in Ab Initio Protein Structure Prediction Using
2643         Low Resolution Model: A Review},
2644   booktitle = {Biomedical Data and Applications},
2645   publisher = {Springer Berlin Heidelberg},
2646   year = {2009},
2647   editor = {Sidhu, Amandeep and Dillon, Tharam},
2648   volume = {224},
2649   series = {Studies in Computational Intelligence},
2650   pages = {317-342},
2651   affiliation = {IIIS, Griffith University, Nathan, QLD-4111 Australia}
2652 }
2653
2654 @CONFERENCE{Houmansadr09,
2655   author = {A. Houmansadr and N. Kiyavash and N. Borisov},
2656   title = {Rainbow: A robust and invisible non-blind watermark for network flows},
2657   booktitle = {NDSS’09: 16th Annual Network and Distributed System Security Symposium},
2658   year = {2009},
2659   owner = {christophe},
2660   timestamp = {2010.03.07}
2661 }
2662
2663 @ARTICLE{Huang,
2664   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J.},
2665   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2666   journal = {Wireless Networks},
2667   abstract = {Abstract\&nbsp;\&nbsp;This paper proposes a secure encrypted-data
2668         aggregation scheme for wireless sensor networks. Our design for data
2669         aggregation eliminates redundant sensor readings without using encryption
2670         and maintains data secrecy and privacy during transmission. Conventional
2671         aggregation functions operate when readings are received in plaintext.
2672         If readings are encrypted, aggregation requires decryption creating
2673         extra overhead and key management issues. In contrast to conventional
2674         schemes, our proposed scheme provides security and privacy, and duplicate
2675         instances of original readings will be aggregated into a single packet.
2676         Our scheme is resilient to known-plaintext attacks, chosen-plaintext
2677         attacks, ciphertext-only attacks and man-in-the-middle attacks. Our
2678         experiments show that our proposed aggregation method significantly
2679         reduces communication overhead and can be practically implemented
2680         in on-the-shelf sensor platforms.},
2681   citeulike-article-id = {4499496},
2682   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2683   citeulike-linkout-1 = {http://www.springerlink.com/content/g573138072642u63},
2684   doi = {10.1007/s11276-009-0177-y},
2685   posted-at = {2009-05-10 09:55:44},
2686   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y}
2687 }
2688
2689 @ARTICLE{Huang10,
2690   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J. D.},
2691   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2692   journal = {Wirel. Netw.},
2693   year = {2010},
2694   volume = {16},
2695   pages = {915--927},
2696   number = {4},
2697   address = {Hingham, MA, USA},
2698   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2699   issn = {1022-0038},
2700   publisher = {Kluwer Academic Publishers}
2701 }
2702
2703 @ARTICLE{W.2001,
2704   author = {W. Huang and X. Ye},
2705   title = {Homeomorphisms with the whole compacta being scrambled sets},
2706   journal = {Ergod. Th. Dynam. Systems},
2707   year = {2001},
2708   optnumber = {1},
2709   optpages = {77-91},
2710   optvolume = {21},
2711   owner = {guyeux},
2712   timestamp = {2008.01.02}
2713 }
2714
2715 @ARTICLE{Hurley1982,
2716   author = {M. Hurley},
2717   title = {Attractors, persistence and density of their bassin},
2718   journal = {Transactions of AMS},
2719   year = {1982},
2720   optpages = {247-271},
2721   optvolume = {269},
2722   owner = {guyeux},
2723   timestamp = {2008.01.02}
2724 }
2725
2726 @INPROCEEDINGS{Islam:2009:NMA:1695134.1695181,
2727   author = {Islam, Md. Kamrul and Chetty, Madhu},
2728   title = {Novel Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction},
2729   booktitle = {Proceedings of the 22nd Australasian Joint Conference on Advances
2730         in Artificial Intelligence},
2731   year = {2009},
2732   series = {AI '09},
2733   pages = {412--421},
2734   address = {Berlin, Heidelberg},
2735   publisher = {Springer-Verlag},
2736   acmid = {1695181},
2737   isbn = {978-3-642-10438-1},
2738   keywords = {Guided search space, Memetic Algorithm, Modified fitness function,
2739         Pair-wise-interchange, Schema preservation, Tabu Search},
2740   location = {Melbourne, Australia},
2741   numpages = {10}
2742 }
2743
2744 @PHDTHESIS{Jacquemard77,
2745   author = {C. Jacquemard},
2746   title = {Contribution à l'étude d'algorithmes à convergence monotone},
2747   school = {Université de Franche-Comté},
2748   year = {1977},
2749   owner = {christophe},
2750   timestamp = {2010.08.25}
2751 }
2752
2753 @BOOK{Jukes69,
2754   title = {{Evolution of Protein Molecules}},
2755   publisher = {Academy Press},
2756   year = {1969},
2757   editor = {Munro, H. N.},
2758   author = {Jukes, T. H. and Cantor, C. R.},
2759   booktitle = {Evolution of Protein Molecules},
2760   citeulike-article-id = {1673661},
2761   keywords = {compbio, fresco},
2762   posted-at = {2007-09-19 06:23:18},
2763   priority = {2}
2764 }
2765
2766 @INPROCEEDINGS{Kalker2001,
2767   author = {Kalker, T.},
2768   title = {Considerations on watermarking security},
2769   year = {2001},
2770   pages = {201--206},
2771   abstract = {In this paper we address the usually implicit assumption that digital
2772         watermarking has as its main target copyright and copy protection
2773         applications. From these target applications a great many conclusions
2774         are drawn about the required security of a watermarking system, and
2775         in fact, a considerably percentage of the watermarking literature
2776         has this very topic as its main focus of attention. In this paper
2777         we take a step back, and try to do a more careful analysis of the
2778         'watermarking-is-for-security-applications' paradigm. The intention
2779         of this paper is to discuss the meaning of the concept security in
2780         the context of watermarking, and try to show that one has to be careful
2781         in using analogies from the related field of cryptography},
2782   citeulike-article-id = {1226513},
2783   journal = {2001 IEEE Fourth Workshop on Multimedia Signal Processing},
2784   keywords = {security, wateramarking},
2785   owner = {guyeux},
2786   posted-at = {2007-04-14 14:30:06},
2787   priority = {2},
2788   timestamp = {2009.06.30}
2789 }
2790
2791 @ARTICLE{Kerckhoffs83,
2792   author = {Kerckhoffs, Auguste},
2793   title = {La cryptographie militaire},
2794   journal = {Journal des sciences militaires},
2795   year = {1883},
2796   volume = {IX},
2797   pages = {5--83},
2798   month = {January},
2799   abstract = {pp. 161–191, Feb. 1883.},
2800   citeulike-article-id = {505508},
2801   keywords = {cryptography, master},
2802   owner = {guyeux},
2803   posted-at = {2006-02-15 04:49:15},
2804   priority = {2},
2805   timestamp = {2009.06.30}
2806 }
2807
2808 @ARTICLE{Kimura80,
2809   author = {Kimura, Motoo},
2810   title = {A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions
2811         through comparative studies of nucleotide sequences},
2812   journal = {Journal of Molecular Evolution},
2813   year = {1980},
2814   volume = {16},
2815   pages = {111-120},
2816   note = {10.1007/BF01731581},
2817   affiliation = {National Institute of Genetics 411 Mishima Japan},
2818   issn = {0022-2844},
2819   issue = {2},
2820   keyword = {Biomedical and Life Sciences},
2821   publisher = {Springer New York},
2822   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01731581}
2823 }
2824
2825 @ARTICLE{Knudsen94,
2826   author = {Knudsen},
2827   title = {Chaos Without Nonperiodicity},
2828   journal = {Amer. Math. Monthly},
2829   year = {1994},
2830   volume = {101},
2831   owner = {guyeux},
2832   timestamp = {27/01/2008}
2833 }
2834
2835 @PHDTHESIS{Knudsen1994a,
2836   author = {C. Knudsen},
2837   title = {Aspects of noninvertible dynamics and chaos},
2838   school = {Technical University of Denmark},
2839   year = {1994},
2840   owner = {guyeux},
2841   timestamp = {2008.01.02}
2842 }
2843
2844 @ARTICLE{Kocarev06,
2845   author = {L. Kocarev and J. Szczepanski and J.M. Amigo and I. Tomovski},
2846   title = {Discrete Chaos - I: Theory},
2847   journal = {IEEE Trans. on Circuits Systems},
2848   year = {2006},
2849   volume = {53},
2850   pages = {1300-1309},
2851   owner = {christophe},
2852   timestamp = {2010.10.10}
2853 }
2854
2855 @INPROCEEDINGS{Kocher95cryptanalysisof,
2856   author = {Paul C. Kocher},
2857   title = {Cryptanalysis of Diffie-Hellman, RSA, DSS, and Other Systems Using
2858         Timing Attacks (Extended Abstract)},
2859   booktitle = {Advances in Cryptology, CRYPTO '95: 15th Annual International Cryptology
2860         Conference},
2861   year = {1995},
2862   pages = {27--31},
2863   publisher = {Springer-Verlag}
2864 }
2865
2866 @ARTICLE{Kullback1951,
2867   author = {Kullback, Solomon and Leibler, Richard A.},
2868   title = {On Information and Sufficiency},
2869   journal = {The Annals of Mathematical Statistics},
2870   year = {1951},
2871   volume = {22},
2872   pages = {79--86},
2873   number = {1},
2874   citeulike-article-id = {3245942},
2875   keywords = {file-import-08-09-12},
2876   owner = {guyeux},
2877   posted-at = {2008-09-12 14:30:37},
2878   priority = {2},
2879   timestamp = {2009.06.29}
2880 }
2881
2882 @MISC{ledoux,
2883   author = {Eshter Ledoux},
2884   title = {Introduction à la théorie du chaos},
2885   year = {2002},
2886   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2887   url = {\url{http://www.nux.be/eledoux/mem/node1.html}}
2888 }
2889
2890 @BOOK{Lehning1997,
2891   title = {Analyse en dimension finie},
2892   publisher = {Masson},
2893   year = {1997},
2894   author = {Lehning},
2895   optpages = {28},
2896   optvolume = {4},
2897   owner = {guyeux},
2898   timestamp = {2008.01.02}
2899 }
2900
2901 @ARTICLE{Lenstra01,
2902   author = {A.K. Lenstra and E.R. Verheul},
2903   title = {Selecting Cryptographic Key Sizes},
2904   journal = {Jour. of the International Association for Cryptologic Research},
2905   year = {2001},
2906   volume = {14},
2907   pages = {255-293},
2908   number = {4}
2909 }
2910
2911 @ARTICLE{Pitts59,
2912   author = {Lettvin, J.Y. and Maturana, H.R. and McCulloch, W.S. and Pitts, W.H.},
2913   title = {What the Frog's Eye Tells the Frog's Brain},
2914   journal = {Proceedings of the IRE},
2915   year = {1959},
2916   volume = {47},
2917   pages = {1940--51},
2918   number = {11},
2919   owner = {christophe},
2920   timestamp = {2010.12.21}
2921 }
2922
2923 @ARTICLE{Li75,
2924   author = {T. Y. Li and J. A. Yorke},
2925   title = {Period three implies chaos},
2926   journal = {Amer. Math. Monthly},
2927   year = {1975},
2928   volume = {82},
2929   pages = {985--992},
2930   number = {10},
2931   owner = {guyeux},
2932   timestamp = {27/01/2008}
2933 }
2934
2935 @ARTICLE{Xiao10,
2936   author = {Li, Yantao and Deng, Shaojiang and Xiao, Di},
2937   title = {A novel Hash algorithm construction based on chaotic neural network},
2938   journal = {Neural Computing and Applications},
2939   year = {2010},
2940   pages = {1-9},
2941   affiliation = {Chongqing University College of Computer Science 400044 Chongqing
2942         China},
2943   issn = {0941-0643},
2944   keyword = {Computer Science},
2945   publisher = {Springer London}
2946 }
2947
2948 @INPROCEEDINGS{Lin09,
2949   author = {Lin, Hua-Yi and Chiang, Tzu-Chiang},
2950   title = {Cooperative secure data aggregation in sensor networks using elliptic
2951         curve based cryptosystems},
2952   booktitle = {CDVE'09: Proceedings of the 6th international conference on Cooperative
2953         design, visualization, and engineering},
2954   year = {2009},
2955   pages = {384--387},
2956   address = {Berlin, Heidelberg},
2957   publisher = {Springer-Verlag},
2958   isbn = {3-642-04264-3, 978-3-642-04264-5},
2959   location = {Luxembourg, Luxembourg}
2960 }
2961
2962 @INPROCEEDINGS{Liu2008,
2963   author = {Liu, An and Ning, Peng},
2964   title = {TinyECC: A Configurable Library for Elliptic Curve Cryptography in
2965         Wireless Sensor Networks},
2966   booktitle = {7th International Conference on Information Processing in Sensor
2967         Networks (IPSN 2008)},
2968   year = {2008},
2969   pages = {245--256},
2970   month = {April},
2971   citeulike-article-id = {3041699},
2972   howpublished = {SPOTS Track},
2973   keywords = {hagg},
2974   posted-at = {2008-07-25 05:25:05},
2975   priority = {2}
2976 }
2977
2978 @ARTICLE{Liu2007bis,
2979   author = {Shao-Hui Liu and Hong-Xun Yao and Wen Gao and Yong-Liang Liu},
2980   title = {An image fragile watermark scheme based on chaotic image pattern
2981         and pixel-pairs},
2982   journal = {Applied Mathematics and Computation},
2983   year = {2007},
2984   volume = {185},
2985   pages = {869-882},
2986   owner = {guyeux},
2987   timestamp = {2008.10.07}
2988 }
2989
2990 @INPROCEEDINGS{Liu07,
2991   author = {Liu, Zhen and Xi, Lifeng},
2992   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2993   booktitle = {KES '07: Knowledge-Based Intelligent Information and Engineering
2994         Systems and the XVII Italian Workshop on Neural Networks on Proceedings
2995         of the 11th International Conference},
2996   year = {2007},
2997   pages = {202--208},
2998   address = {Berlin, Heidelberg},
2999   publisher = {Springer-Verlag},
3000   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74827-4_26},
3001   isbn = {978-3-540-74826-7},
3002   location = {Vietri sul Mare, Italy}
3003 }
3004
3005 @ARTICLE{Liu2007,
3006   author = {Zhen Liu and Lifeng Xi},
3007   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
3008   journal = {LNAI},
3009   year = {2007},
3010   volume = {4693},
3011   pages = {202-208},
3012   owner = {guyeux},
3013   timestamp = {11/04/2008}
3014 }
3015
3016 @ARTICLE{Lubachevsky86,
3017   author = {Lubachevsky, Boris and Mitra, Debasis},
3018   title = {A chaotic asynchronous algorithm for computing the fixed point of
3019         a nonnegative matrix of unit spectral radius},
3020   journal = {J. ACM},
3021   year = {1986},
3022   volume = {33},
3023   pages = {130--150},
3024   number = {1},
3025   address = {New York, NY, USA},
3026   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/4904.4801},
3027   issn = {0004-5411},
3028   publisher = {ACM}
3029 }
3030
3031 @ARTICLE{Larger10,
3032   author = {{L}arger, {L}. and {D}udley, {J}.{M}.},
3033   title = { {N}onlinear dynamics {O}ptoelectronic chaos},
3034   journal = {{N}ature },
3035   year = {2010},
3036   volume = {465 },
3037   pages = {41-42 },
3038   number = {7294 },
3039   month = {05},
3040   abstract = {{O}ptoelectronic circuits with delayed feedback provide a convenient
3041         bench-top platform to study a wide range of nonlinear dynamic systems,
3042         from ultrastable clocks to complex chaotic devices.},
3043   affiliation = {{F}ranche-{C}omt{\'e} {\'E}lectronique {M}{\'e}canique, {T}hermique
3044         et {O}ptique - {S}ciences et {T}echnologies - {FEMTO}-{ST} - {CNRS}
3045         : {UMR}6174 - {U}niversit{\'e} de {F}ranche-{C}omt{\'e} - {U}niversit{\'e}
3046         de {T}echnologie de {B}elfort-{M}ontbeliard - {E}cole {N}ationale
3047         {S}up{\'e}rieure de {M}{\'e}canique et des {M}icrotechniques },
3048   audience = {internationale },
3049   day = {05},
3050   doi = {10.1038/465041a },
3051   hal_id = {hal-00517696},
3052   language = {{A}nglais},
3053   url = {http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00517696/en/}
3054 }
3055
3056 @INPROCEEDINGS{Mahoney00,
3057   author = {Mahoney, Matthew V.},
3058   title = {Fast Text Compression with Neural Networks},
3059   booktitle = {Proceedings of the Thirteenth International Florida Artificial Intelligence
3060         Research Society Conference},
3061   year = {2000},
3062   pages = {230--234},
3063   publisher = {AAAI Press},
3064   acmid = {707654},
3065   isbn = {1-57735-113-4},
3066   numpages = {5}
3067 }
3068
3069 @INPROCEEDINGS{msp10:bl,
3070   author = {Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid and Pham, Congduc},
3071   title = {Risk Management in Intrusion Detection Applications with Wireless
3072         Video Sensor Networks},
3073   booktitle = {WCNC'10 IEEE Int. Conf.},
3074   year = {2010},
3075   pages = {***--***},
3076   address = {Sydney, Australia},
3077   month = apr,
3078   note = {To appear},
3079   classement = {*},
3080   equipe = {and},
3081   inhal = {no}
3082 }
3083
3084 @ARTICLE{Malvar03,
3085   author = {H.S. Malvar and D. Florêncio},
3086   title = {Improved Spread Spectrum: A New Modulation Technique for Robust Watermarking},
3087   journal = {IEEE Trans. Signal Proceeding},
3088   year = {2003},
3089   volume = {53},
3090   pages = {898--905},
3091   owner = {christophe},
3092   timestamp = {2010.03.07}
3093 }
3094
3095 @ARTICLE{Marsaglia2003,
3096   author = {G. Marsaglia},
3097   title = {Xorshift RNGs},
3098   journal = {Journal of Statistical Software},
3099   year = {2003},
3100   volume = {8(14)},
3101   pages = {1--6},
3102   owner = {qianxue},
3103   timestamp = {2009.10.28}
3104 }
3105
3106 @ARTICLE{Marsaglia1996,
3107   author = {G. Marsaglia},
3108   title = {DIEHARD: a battery of tests of randomness.},
3109   journal = {http://stat.fsu.edu/~geo/diehard.html},
3110   year = {1996},
3111   owner = {qianxue},
3112   timestamp = {2009.11.09}
3113 }
3114
3115 @ARTICLE{Simard07testu01:a,
3116     author = {Richard Simard and Université De Montréal},
3117     title = {TestU01: A C library for empirical testing of random number generators},
3118     journal = {ACM Transactions on Mathematical Software},
3119     year = {2007},
3120     pages = {2007}
3121 }
3122
3123 @ARTICLE{DefiningChaos,
3124   author = {M. Martelli and M. Dang and T. Seph},
3125   title = {Defining chaos},
3126   journal = {Mathematics Magazine},
3127   year = {1998},
3128   volume = {71},
3129   pages = {112--122},
3130   owner = {christophe},
3131   timestamp = {2010.08.11}
3132 }
3133
3134 @ARTICLE{Michel2007c,
3135   author = {Christian J Michel},
3136   title = {An analytical model of gene evolution with 9 mutation parameters:
3137         an application to the amino acids coded by the common circular code.},
3138   journal = {Bull Math Biol},
3139   year = {2007},
3140   volume = {69},
3141   pages = {677--698},
3142   number = {2},
3143   month = {Feb},
3144   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
3145         mutation matrix 64 x 64 with nine substitution parameters associated
3146         with the three types of substitutions in the three trinucleotide
3147         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
3148         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
3149         x 64 with three and six parameters. It determines at some time t
3150         the exact occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly
3151         according to these nine substitution parameters. An application of
3152         this model allows an evolutionary study of the common circular code
3153         [Formula: see text] of eukaryotes and prokaryotes and its 12 coded
3154         amino acids. The main property of this code [Formula: see text] is
3155         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
3156         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
3157         with a window of a few nucleotides. However, since its identification
3158         in 1996, amino acid information coded by [Formula: see text] has
3159         never been studied. Very unexpectedly, this evolutionary model demonstrates
3160         that random substitutions in this code [Formula: see text] and with
3161         particular values for the nine substitutions parameters retrieve
3162         after a certain time of evolution a frequency distribution of these
3163         12 amino acids very close to the one coded by the actual genes.},
3164   doi = {10.1007/s11538-006-9147-z},
3165   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
3166         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
3167         67400 Illkirch, France. michel@dpt-info.u-strasbg.fr},
3168   keywords = {Amino Acids, genetics; Codon, genetics; Eukaryotic Cells; Evolution,
3169         Molecular; Models, Genetic; Prokaryotic Cells},
3170   language = {eng},
3171   medline-pst = {ppublish},
3172   owner = {guyeux},
3173   pmid = {16952018},
3174   timestamp = {2011.05.05},
3175   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-006-9147-z}
3176 }
3177
3178 @ARTICLE{Miellou75,
3179   author = {J.-C. Miellou},
3180   title = {Algorithmes de relaxation chaotique \`{a} retards},
3181   journal = {Rairo},
3182   year = {1975},
3183   volume = {R1},
3184   pages = {148-162},
3185   owner = {guyeux},
3186   timestamp = {2008.05.22}
3187 }
3188
3189 @ARTICLE{Miellou75b,
3190   author = {Miellou, J.-C.},
3191   title = {Itérations chaotiques à retards, étude de la convergence dans le
3192         cas d'espaces partiellement ordonnés},
3193   journal = {C.R.A.S. Paris},
3194   year = {1975},
3195   volume = {280},
3196   pages = {233--236},
3197   owner = {christophe},
3198   timestamp = {2010.08.17}
3199 }
3200
3201 @ARTICLE{Spiteri85,
3202   author = {Jean-Claude Miellou and Pierre Spitéri},
3203   title = {Un critère de convergence pour des méthodes générales de point fixe},
3204   journal = {Rairo -- Modélisation mathématique et analyse numérique},
3205   year = {1985},
3206   volume = {19},
3207   pages = {645--669},
3208   number = {4},
3209   owner = {christophe},
3210   timestamp = {2010.10.13}
3211 }
3212
3213 @ARTICLE{Mooney08,
3214   author = {Aidan Mooney and John G. Keating and Ioannis Pitas},
3215   title = {A comparative study of chaotic and white noise signals in digital
3216         watermarking},
3217   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
3218   year = {2008},
3219   volume = {35},
3220   pages = {913-921},
3221   owner = {christophe},
3222   timestamp = {2010.03.01}
3223 }
3224
3225 @ARTICLE{Nakashima2003,
3226   author = {Nakashima, Y. and Tachibana, R. and Babaguchi, N.},
3227   title = {Watermarked Movie Soundtrack Finds the Position of the Camcorder
3228         in a Theater},
3229   journal = {IEEE Transactions on Multimedia},
3230   year = {2009},
3231   note = {Accepted for future publication Multimedia}
3232 }
3233
3234 @INCOLLECTION{springerlink:10.1007/978-3-642-04431-1_16,
3235   author = {Nelson, Michael and Nahapetian, Ani and Koushanfar, Farinaz and Potkonjak,
3236         Miodrag},
3237   title = {SVD-Based Ghost Circuitry Detection},
3238   booktitle = {Information Hiding},
3239   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
3240   year = {2009},
3241   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Sadeghi, Ahmad-Reza},
3242   volume = {5806},
3243   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3244   pages = {221-234},
3245   note = {10.1007/978-3-642-04431-1_16},
3246   affiliation = {Computer Science Department, UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA},
3247   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04431-1_16}
3248 }
3249
3250 @INPROCEEDINGS{Perez-Hernandez09,
3251   author = {P\'{e}rez-Hern\'{a}ndez, Luis Germ\'{a}n and Rodr\'{\i}guez-V\'{a}zquez,
3252         Katya and Gardu\~{n}o-Ju\'{a}rez, Ram\'{o}n},
3253   title = {Parallel particle swarm optimization applied to the protein folding
3254         problem},
3255   booktitle = {Proceedings of the 11th Annual conference on Genetic and evolutionary
3256         computation},
3257   year = {2009},
3258   series = {GECCO '09},
3259   pages = {1791--1792},
3260   address = {New York, NY, USA},
3261   publisher = {ACM},
3262   acmid = {1570163},
3263   isbn = {978-1-60558-325-9},
3264   keywords = {bioinformatics, biology and chemistry, combinatorial optimization,
3265         parallelization, swarm intelligence},
3266   location = {Montreal, Qu\&\#233;bec, Canada},
3267   numpages = {2}
3268 }
3269
3270 @PHDTHESIS{Pellegrin1986,
3271   author = {D. Pellegrin},
3272   title = {Algorithmique discr\`{e}te et r\'{e}seaux d'automates},
3273   school = {Grenoble},
3274   year = {1986},
3275   owner = {guyeux},
3276   timestamp = {2008.05.22}
3277 }
3278
3279 @ARTICLE{Peng2005,
3280   author = {F. Peng and S.-S. Qiu and M. Long},
3281   title = {One way Hash function construction based on two-dimensional hyperchaotic
3282         mappings},
3283   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3284   year = {2005},
3285   volume = {54},
3286   pages = {98--104},
3287   owner = {guyeux},
3288   timestamp = {2009.01.16}
3289 }
3290
3291 @INPROCEEDINGS{Perez06,
3292   author = {Luis Perez-Freire and F. Pérez-gonzalez and Pedro Comesaña},
3293   title = {Secret Dither Estimation in Lattice-Quantization Data Hiding: A Set-Membership
3294         Approach},
3295   booktitle = {Security, Steganography, and Watermarking of Multimedia Contents},
3296   year = {2006},
3297   editor = {Edward J. Delp and Ping W. Wong},
3298   address = {San Jose, California, USA},
3299   month = {January},
3300   organization = {SPIE},
3301   owner = {guyeux},
3302   timestamp = {2009.06.30}
3303 }
3304
3305 @INPROCEEDINGS{Perez-Freire06,
3306   author = {Luis Perez-Freire and Pedro Comesana and Juan Ramon Troncoso-Pastoriza
3307         and Fernando Perez-Gonzalez},
3308   title = {Watermarking Security: a Survey},
3309   booktitle = {LNCS Transactions on Data Hiding and Multimedia Security},
3310   year = {2006},
3311   owner = {guyeux},
3312   timestamp = {2009.06.29}
3313 }
3314
3315 @PROCEEDINGS{Peter07,
3316   title = {On Concealed Data Aggregation for WSNs},
3317   year = {2007},
3318   author = {Peter, Steffen and Piotrowski, Krzysztof and Langendoerfer, Peter},
3319   booktitle = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3320         4th IEEE},
3321   citeulike-article-id = {2281643},
3322   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45},
3323   citeulike-linkout-1 = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs\_all.jsp?arnumber=4199133},
3324   doi = {10.1109/CCNC.2007.45},
3325   journal = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3326         4th IEEE},
3327   keywords = {hagg},
3328   pages = {192--196},
3329   posted-at = {2008-01-23 19:36:19},
3330   priority = {3},
3331   url = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45}
3332 }
3333
3334 @ARTICLE{pms11:ij,
3335   author = {Pham, Congduc and Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid},
3336   title = {Risk-based Adaptive Scheduling in Randomly Deployed Video Sensor
3337         Networks for Critical Surveillance Applications},
3338   journal = {Journal of Network and Computer Applications},
3339   year = {2011},
3340   volume = {*},
3341   pages = {***--***},
3342   number = {*},
3343   note = {Accepted manuscript. To appear},
3344   classement = {ACLI},
3345   equipe = {and},
3346   impact-factor = {1.111},
3347   inhal = {no},
3348   isi-acro = {J NETW COMPU APPL},
3349   publisher = {Springer}
3350 }
3351
3352 @MISC{Poe,
3353   author = {Edgar Alan Poe},
3354   title = {The Raven},
3355   month = {April},
3356   year = {1839},
3357   note = {American Museum (Baltimore)},
3358   owner = {christophe},
3359   timestamp = {2010.11.23}
3360 }
3361
3362 @ARTICLE{Perez-Freire2006:Security,
3363   author = {L. P{\'e}rez-Freire and F. P{\'e}rez-González and T. Furon and P.
3364         Comesaña},
3365   title = {Security of lattice-based data hiding against the known message attack},
3366   journal = {IEEE Trans. on Information Forensics and Security},
3367   year = {2006},
3368   volume = {1},
3369   pages = {421-439},
3370   number = {4},
3371   month = {dec},
3372   owner = {guyeux},
3373   timestamp = {2009.12.06}
3374 }
3375
3376 @MISC{Quisquater02sidechannel,
3377   author = {J-J. Quisquater and D. Samyde and Université Catholique De Louvain
3378         and Groupe Crypto},
3379   title = {Side Channel Cryptanalysis},
3380   year = {2002}
3381 }
3382
3383 @ARTICLE{Raynal2001,
3384   author = {Frédéric Raynal and Fabien A. P. Petitcolas and Caroline Fontaine},
3385   title = {Evaluation automatique des méthodes de tatouage},
3386   journal = {Traitement du signal},
3387   year = {2001},
3388   volume = {18},
3389   pages = {271-282},
3390   owner = {guyeux},
3391   timestamp = {2008.05.21}
3392 }
3393
3394 @MISC{rijmen05,
3395   author = {Vincent Rijmen and Elisabeth Oswald},
3396   title = {Update on SHA-1},
3397   howpublished = {Cryptology ePrint Archive, Report 2005/010},
3398   year = {2005},
3399   note = {\url{http://eprint.iacr.org/}}
3400 }
3401
3402 @BOOK{Robert,
3403   title = {Discrete Iterations, a Metric Study},
3404   publisher = {Springer-Verlag},
3405   year = {1986},
3406   editor = {Berlin Heidelberg New-York},
3407   author = {François Robert},
3408   volume = {6},
3409   series = {Series in Computational Mathematics}
3410 }
3411
3412 @BOOK{Robert1986,
3413   title = {Discrete Iterations: A Metric Study},
3414   year = {1986},
3415   editor = {Springer-Verlag},
3416   author = {F. Robert},
3417   volume = {6},
3418   series = {Springer Series in Computational Mathematics},
3419   owner = {guyeux},
3420   timestamp = {17/02/2008}
3421 }
3422
3423 @ARTICLE{Rudenko08,
3424   author = {Rudenko, O. and Snytkin, M.},
3425   title = {Image compression based on the neural network art},
3426   journal = {Cybernetics and Systems Analysis},
3427   year = {2008},
3428   volume = {44},
3429   pages = {797-802},
3430   affiliation = {Kharkov National University of Radio Electronics Kharkov Ukraine},
3431   issn = {1060-0396},
3432   issue = {6},
3433   keyword = {Computer Science},
3434   publisher = {Springer New York}
3435 }
3436
3437 @PHDTHESIS{Ruette2001,
3438   author = {Sylvie Ruette},
3439   title = {Chaos en dynamique topologique, en particulier sur l'intervalle,
3440         mesures d'entropie maximale},
3441   school = {Université d'Aix-Marseille II},
3442   year = {2001},
3443   optmonth = {Novembre},
3444   owner = {guyeux},
3445   timestamp = {2008.01.02}
3446 }
3447
3448 @MASTERSTHESIS{Saulnier02,
3449   author = {Boris Saulnier},
3450   title = {Entropie topologique},
3451   school = {DEA Sémantique, Preuves et Langages, Paris 7},
3452   year = {2002},
3453   owner = {christophe},
3454   timestamp = {2010.08.12}
3455 }
3456
3457 @ARTICLE{Schmitz2001,
3458   author = {Roland Schmitz},
3459   title = {Use of chaotic dynamical systems in cryptography},
3460   journal = {Journal of Franklin Institute},
3461   year = {2001},
3462   volume = {338},
3463   pages = {429-441},
3464   owner = {guyeux},
3465   timestamp = {17/02/2008}
3466 }
3467
3468 @BOOK{Schwartz80,
3469   title = {Analyse: topologie g\'{e}n\'{e}rale et analyse fonctionnelle},
3470   publisher = {Hermann},
3471   year = {1980},
3472   editor = {Hermann},
3473   author = {Laurent Schwartz},
3474   owner = {christophe},
3475   timestamp = {2010.09.15}
3476 }
3477
3478 @ARTICLE{Shannon49,
3479   author = {Shannon, Claude E.},
3480   title = {Communication Theory of Secrecy Systems},
3481   journal = {Bell Systems Technical Journal},
3482   year = {1949},
3483   volume = {28},
3484   pages = {656--715},
3485   citeulike-article-id = {507362},
3486   keywords = {master, secrecy\_systems, teoria-informacao, theory\_communication,
3487         theory\_cryptography},
3488   owner = {guyeux},
3489   posted-at = {2006-02-16 23:24:09},
3490   priority = {2},
3491   timestamp = {2009.06.29}
3492 }
3493
3494 @ARTICLE{Shmygelska05,
3495   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger},
3496   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3497         polar protein folding problem},
3498   journal = {BMC Bioinformatics},
3499   year = {2005},
3500   volume = {6},
3501   pages = {30},
3502   number = {1},
3503   abstract = {BACKGROUND:The protein folding problem is a fundamental problems in
3504         computational molecular biology and biochemical physics. Various
3505         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3506         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3507         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3508         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3509         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3510         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3511         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3512         simple model - the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3513         (HP) model.RESULTS:We present an improvement of our previous ACO
3514         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3515         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3516         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3517         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3518         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3519         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3520         a more diverse set of native conformations.CONCLUSIONS:The application
3521         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3522         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3523         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3524         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3525         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3526         for more complex and realistic models of protein structure holds
3527         significant promise.},
3528   doi = {10.1186/1471-2105-6-30},
3529   issn = {1471-2105},
3530   pubmedid = {15710037}
3531 }
3532
3533 @OTHER{Shmygelska2005Feb,
3534   __markedentry = {[christophe]},
3535   abstract = {Abstract Background The protein folding problem is a fundamental problems
3536         in computational molecular biology and biochemical physics. Various
3537         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3538         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3539         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3540         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3541         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3542         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3543         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3544         simple model – the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3545         (HP) model. Results We present an improvement of our previous ACO
3546         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3547         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3548         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3549         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3550         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3551         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3552         a more diverse set of native conformations. Conclusions The application
3553         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3554         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3555         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3556         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3557         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3558         for more complex and realistic models of protein structure holds
3559         significant promise.},
3560   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger H},
3561   journal = {BMC Bioinformatics. 2005 Feb 14},
3562   number = {1},
3563   owner = {christophe},
3564   pages = {30},
3565   timestamp = {2011.01.24},
3566   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3567         polar protein folding problem},
3568   volume = {6},
3569   year = {2005 Feb}
3570 }
3571
3572 @ARTICLE{Shujun1,
3573   author = {Li Shujun and Li Qi and Li Wenmin and Mou Xuanqin and Cai Yuanlong},
3574   title = {Statistical Properties of Digital Piecewise Linear Chaotic Maps and
3575         Their Roles in Cryptography and Pseudo-Random Coding},
3576   journal = {Proceedings of the 8th IMA International Conference on Cryptography
3577         and Coding},
3578   year = {2001},
3579   volume = {1},
3580   pages = {205--221},
3581   owner = {christophe},
3582   timestamp = {2010.03.06}
3583 }
3584
3585 @INPROCEEDINGS{Simmons83,
3586   author = {Gustavus J. Simmons},
3587   title = {The Prisoners' Problem and the Subliminal Channel},
3588   booktitle = {Advances in Cryptology, Proc. CRYPTO'83},
3589   year = {1984},
3590   pages = {51--67},
3591   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3592   owner = {guyeux},
3593   timestamp = {2009.06.29}
3594 }
3595
3596 @ARTICLE{Solak2004389,
3597   author = {Ercan Solak},
3598   title = {On the security of a class of discrete-time chaotic cryptosystems},
3599   journal = {Physics Letters A},
3600   year = {2004},
3601   volume = {320},
3602   pages = {389 - 395},
3603   number = {5-6},
3604   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2003.11.008},
3605   issn = {0375-9601},
3606   keywords = {Communication using chaos},
3607   owner = {guyeux},
3608   timestamp = {2009.12.12},
3609   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4B22RC9-2/2/99a0af737c9b6ba8af47ae4d3c7a326d}
3610 }
3611
3612 @PHDTHESIS{Spiteri74,
3613   author = {Pierre Spitéri},
3614   title = {Contribution à l'étude de la stabilite au sens de liapounov de certains
3615         systemes differentiels non lineaires},
3616   school = {Université de Franche-Comté},
3617   year = {1974},
3618   owner = {christophe},
3619   timestamp = {2010.10.13}
3620 }
3621
3622 @BOOK{Stewart1989,
3623   title = {Does God Play Dices ?: the mathematics of chaos},
3624   publisher = {Penguin},
3625   year = {1989},
3626   author = {Ian Stewart},
3627   owner = {guyeux},
3628   timestamp = {2008.01.02}
3629 }
3630
3631 @BOOK{Stinson02,
3632   title = {Cryptography: Theory and Practice, Second Edition},
3633   publisher = {{Chapman \& Hall/CRC}},
3634   year = {2002},
3635   author = {Stinson, Douglas R.},
3636   month = {February},
3637   abstract = {{Douglas R. Stinson's <I>Cryptography: Theory and Practice</I> is
3638         a mathematically intensive examination of cryptography, including
3639         ciphers, the Data Encryption Standard (DES), public key cryptography,
3640         one-way hash functions, and digital signatures. Stinson's explication
3641         of "zero-sum proofs"--a process by which one person lets another
3642         person know that he or she has a password without actually revealing
3643         any information--is especially good.<P> If you are new to the math
3644         behind cryptography but want to tackle it, the author covers all
3645         of the required background to understand the real mathematics here.
3646         <I>Cryptography</I> includes extensive exercises with each chapter
3647         and makes an ideal introduction for any math-literate person willing
3648         to get acquainted with this material.} {<P>Major advances over the
3649         last five years precipitated this major revision of the bestselling
3650         Cryptography: Theory and Practice. With more than 40 percent new
3651         or updated material, the second edition now provides an even more
3652         comprehensive treatment of modern cryptography. It focuses on the
3653         new Advanced Encryption Standards and features an entirely new chapter
3654         on that subject. Another new chapter explores the applications of
3655         secret sharing schemes, including ramp schemes, visual cryptography,
3656         threshold cryptography, and broadcast encryption. This is an ideal
3657         introductory text for both computer science and mathematics students
3658         and a valuable reference for professionals.</P>}},
3659   citeulike-article-id = {2401855},
3660   day = {27},
3661   howpublished = {Hardcover},
3662   isbn = {1584882069},
3663   keywords = {security},
3664   posted-at = {2008-02-20 08:28:49},
3665   priority = {0},
3666   url = {http://www.amazon.com/exec/obidos/redirect?tag=citeulike07-20\&path=ASIN/1584882069}
3667 }
3668
3669 @INPROCEEDINGS{Takana90,
3670   author = {K. Tanaka and Y. Nakamura and K. Matsui},
3671   title = {Embedding Secret Information into a Dithered Multi-level Image},
3672   booktitle = {IEEE Military Communications Conference},
3673   year = {1990},
3674   owner = {christophe},
3675   timestamp = {2010.08.05}
3676 }
3677
3678 @PHDTHESIS{ElTarazi81,
3679   author = {M. N. El Tarazi},
3680   title = {Contraction et ordre partiel pour l'étude d'algorithmes synchrones
3681         et asynchrones en analyse numérique},
3682   school = {Faculté des Sciences et Techniques de l'Université de Franche-Comté,
3683         Besançon},
3684   year = {1981},
3685   owner = {christophe},
3686   timestamp = {2010.08.17}
3687 }
3688
3689 @INPROCEEDINGS{Unger93,
3690   author = {Unger, Ron and Moult, John},
3691   title = {Genetic Algorithm for 3D Protein Folding Simulations},
3692   booktitle = {Proceedings of the 5th International Conference on Genetic Algorithms},
3693   year = {1993},
3694   pages = {581--588},
3695   address = {San Francisco, CA, USA},
3696   publisher = {Morgan Kaufmann Publishers Inc.},
3697   acmid = {657747},
3698   isbn = {1-55860-299-2},
3699   numpages = {8}
3700 }
3701
3702 @MISC{Van93electronicwater,
3703   author = {Tirkel Rankin Van},
3704   title = {Electronic Water Mark},
3705   year = {1993}
3706 }
3707
3708 @ARTICLE{Venkatesan2007397,
3709   author = {R.C. Venkatesan},
3710   title = {Encryption of covert information into multiple statistical distributions},
3711   journal = {Physics Letters A},
3712   year = {2007},
3713   volume = {370},
3714   pages = {397 - 404},
3715   number = {5-6},
3716   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.05.117},
3717   issn = {0375-9601},
3718   keywords = {Statistical encryption/decryption},
3719   owner = {guyeux},
3720   timestamp = {2009.12.12},
3721   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4P4FV2M-1/2/cd11a2ec144526e3c4552d2a7e7906cc}
3722 }
3723
3724 @ARTICLE{pitas,
3725   author = {G. Voyatzis and I. Pitas},
3726   title = {Chaotic watermarks for embedding in the spatial digital image domain},
3727   journal = {Proceedings of IEEE ICIP},
3728   year = {1998},
3729   volume = {2},
3730   pages = {432-436},
3731   owner = {christophe},
3732   timestamp = {2010.03.06}
3733 }
3734
3735 @INCOLLECTION{Wagner03,
3736   author = {Wagner, David},
3737   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3738   booktitle = {Information Security},
3739   publisher = {Springer Berlin, Heidelberg},
3740   year = {2003},
3741   volume = {2851},
3742   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3743   pages = {234-239},
3744   abstract = {We use linear algebra to show that an algebraic privacy homomorphism
3745         proposed by Domingo-Ferrer is insecure for some parameter settings.},
3746   affiliation = {University of California, Berkeley USA}
3747 }
3748
3749 @INPROCEEDINGS{Wagner03cryptanalysisof,
3750   author = {David Wagner},
3751   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3752   booktitle = {Proc. Sixth Information Security Conf. (ISC03},
3753   year = {2003},
3754   pages = {234--239}
3755 }
3756
3757 @ARTICLE{Wang_ellipticcurve,
3758   author = {Haodong Wang and Bo Sheng and Qun Li},
3759   title = {Elliptic curve cryptography-based access control in sensor networks},
3760   journal = {Int. J. Security and Networks}
3761 }
3762
3763 @INPROCEEDINGS{wbg10:ip,
3764   author = {Wang, Qianxue and Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Fang,
3765         Xiaole},
3766   title = {Randomness quality of {CI} chaotic generators. Application to Internet
3767         security},
3768   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
3769   year = {2010},
3770   pages = {125--130},
3771   address = {Valencia, Spain},
3772   month = sep,
3773   publisher = {IEEE Computer Society Press},
3774   note = {Best Paper award},
3775   classement = {ACTI},
3776   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
3777   equipe = {and},
3778   inhal = {no}
3779 }
3780
3781 @ARTICLE{Wang2003,
3782   author = {X. M. Wang and J. S. Zhang and W. F. Zhang},
3783   title = {One-way hash function construction based on the extended chaotic
3784         maps switch},
3785   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3786   year = {2003},
3787   volume = {52, No. 11},
3788   pages = {2737--2742},
3789   owner = {guyeux},
3790   timestamp = {2009.01.16}
3791 }
3792
3793 @ARTICLE{Girao06,
3794   author = {Westhoff, Dirk and Girao, Joao and Acharya, Mithun},
3795   title = {Concealed Data Aggregation for Reverse Multicast Traffic in Sensor
3796         Networks: Encryption, Key Distribution, and Routing Adaptation},
3797   journal = {IEEE Transactions on Mobile Computing},
3798   year = {2006},
3799   volume = {5},
3800   pages = {1417--1431},
3801   number = {10},
3802   address = {Piscataway, NJ, USA},
3803   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/TMC.2006.144},
3804   issn = {1536-1233},
3805   publisher = {IEEE Educational Activities Department}
3806 }
3807
3808 @MISC{web:lyapunov,
3809   author = {Wikipédia},
3810   title = {Exposant de Lyapunov -- Site web d'André Lévesque},
3811   year = {2010},
3812   note = {[En ligne; Page disponible le 9-septembre-2010]},
3813   url = {\url{http://math.cmaisonneuve.qc.ca/alevesque/chaos_fract/Lyapunov/Exposant.html}}
3814 }
3815
3816 @MISC{wiki:complet,
3817   author = {Wikipédia},
3818   title = {Espace complet --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3819   year = {2010},
3820   note = {[En ligne; Page disponible le 9-août-2010]},
3821   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Espace_complet&oldid=52734266}}
3822 }
3823
3824 @MISC{wiki:densite,
3825   author = {Wikipédia},
3826   title = {Densité (mathématiques) --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3827   year = {2010},
3828   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3829   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Densit%C3%A9_(math%C3%A9matiques)&oldid=53938121}}
3830 }
3831
3832 @MISC{wiki:fisher,
3833   author = {Wikipédia},
3834   title = {Information de Fisher --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3835   year = {2010},
3836   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3837   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Information_de_Fisher&oldid=52877871}}
3838 }
3839
3840 @MISC{wiki:Kerkhoffs,
3841   author = {Wikipédia},
3842   title = {Principe de Kerckhoffs --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3843   year = {2010},
3844   note = {[En ligne; Page disponible le 20-août-2010]},
3845   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Principe_de_Kerckhoffs&oldid=52133114}}
3846 }
3847
3848 @MISC{wiki:sarkovskii,
3849   author = {Wikipédia},
3850   title = {Théorème de Sarkovskii --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3851   year = {2010},
3852   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3853   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Th%C3%A9or%C3%A8me_de_Sarkovskii&oldid=54196167}}
3854 }
3855
3856 @MISC{wiki:steganographie,
3857   author = {Wikipédia},
3858   title = {Stéganographie --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3859   year = {2010},
3860   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3861   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=St%C3%A9ganographie&oldid=54724435}}
3862 }
3863
3864 @MISC{wiki:tatouage,
3865   author = {Wikipédia},
3866   title = {Tatouage numérique --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3867   year = {2010},
3868   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3869   url = {https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Tatouage_num%C3%A9rique&oldid=55484940}
3870 }
3871
3872 @MISC{wiki:testsHypothese,
3873   author = {Wikipédia},
3874   title = {Test d'hypothèse --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3875   year = {2010},
3876   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3877   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Test_d%27hypoth%C3%A8se&oldid=55344108}}
3878 }
3879
3880 @ARTICLE{Wu2007bis,
3881   author = {Xianyong Wu and Zhi-Hong Guan},
3882   title = {A novel digital watermark algorithm based on chaotic maps},
3883   journal = {Physics Letters A},
3884   year = {2007},
3885   volume = {365},
3886   pages = {403 - 406},
3887   number = {5-6},
3888   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.01.034},
3889   issn = {0375-9601},
3890   keywords = {Watermarking},
3891   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4MY0MF3-8/2/0b4d1298fa84337d2e59b3fefe26f583}
3892 }
3893
3894 @INPROCEEDINGS{Wu2007,
3895   author = {Wu, Xianyong and Guan, Zhi-Hong and Wu, Zhengping},
3896   title = {A Chaos Based Robust Spatial Domain Watermarking Algorithm},
3897   booktitle = {ISNN '07: Proceedings of the 4th international symposium on Neural
3898         Networks},
3899   year = {2007},
3900   pages = {113--119},
3901   address = {Berlin, Heidelberg},
3902   publisher = {Springer-Verlag},
3903   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-72393-6_15},
3904   isbn = {978-3-540-72392-9},
3905   location = {Nanjing, China}
3906 }
3907
3908 @ARTICLE{Xiao20092288,
3909   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3910   title = {Parallel keyed hash function construction based on chaotic neural
3911         network},
3912   journal = {Neurocomputing},
3913   year = {2009},
3914   volume = {72},
3915   pages = {2288 - 2296},
3916   number = {10-12},
3917   note = {Lattice Computing and Natural Computing (JCIS 2007) / Neural Networks
3918         in Intelligent Systems Designn (ISDA 2007)},
3919   abstract = {Recently, various hash functions based on chaos or neural networks
3920         were proposed. Nevertheless, none of them works efficiently in parallel
3921         computing environment. In this paper, an algorithm for parallel keyed
3922         hash function construction based on chaotic neural network is proposed.
3923         The mechanism of changeable-parameter and self-synchronization establishes
3924         a close relation between the hash value bit and message, and the
3925         algorithm structure ensures the uniform sensitivity of the hash value
3926         to the message blocks at different positions. The proposed algorithm
3927         can satisfy the performance requirements of hash function. These
3928         properties make it a promising choice for hashing on parallel computing
3929         platform.},
3930   issn = {0925-2312},
3931   keywords = {Chaotic neural network}
3932 }
3933
3934 @ARTICLE{Xiao20094346,
3935   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3936   title = {Improving the security of a parallel keyed hash function based on
3937         chaotic maps},
3938   journal = {Physics Letters A},
3939   year = {2009},
3940   volume = {373},
3941   pages = {4346 - 4353},
3942   number = {47},
3943   issn = {0375-9601},
3944   keywords = {Hash function},
3945   owner = {guyeux},
3946   timestamp = {2009.12.12}
3947 }
3948
3949 @ARTICLE{Xiao20102254,
3950   author = {Di Xiao and Frank Y. Shih and Xiaofeng Liao},
3951   title = {A chaos-based hash function with both modification detection and
3952         localization capabilities},
3953   journal = {Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation},
3954   year = {2010},
3955   volume = {15},
3956   pages = {2254 - 2261},
3957   number = {9},
3958   abstract = {Recently, a variety of chaos-based hash functions have been proposed.
3959         Nevertheless, none of them can realize modification localization.
3960         In this paper, a hash function with both modification detection and
3961         localization capabilities is proposed, which can also support the
3962         parallel processing mode. By using the mechanism of changeable-parameter
3963         and self-synchronization, the keystream can establish a close relation
3964         with the algorithm key, the content, and the order of each message
3965         unit. Theoretical analysis and computer simulation indicate that
3966         the proposed algorithm can satisfy the performance requirements of
3967         hash functions.},
3968   issn = {1007-5704},
3969   keywords = {Hash function}
3970 }
3971
3972 @INPROCEEDINGS{Yu06,
3973   author = {Yu, Yu and Leiwo, Jussipekka and Premkumar, Benjamin},
3974   title = {A Study on the Security of Privacy Homomorphism},
3975   booktitle = {ITNG '06: Proceedings of the Third International Conference on Information
3976         Technology: New Generations},
3977   year = {2006},
3978   pages = {470--475},
3979   address = {Washington, DC, USA},
3980   publisher = {IEEE Computer Society},
3981   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/ITNG.2006.19},
3982   isbn = {0-7695-2497-4}
3983 }
3984
3985 @ARTICLE{Zhang2008658,
3986   author = {Wei Zhang and Yonghe Liu and Sajal K. Das and Pradip De},
3987   title = {Secure data aggregation in wireless sensor networks: A watermark
3988         based authentication supportive approach},
3989   journal = {Pervasive and Mobile Computing},
3990   year = {2008},
3991   volume = {4},
3992   pages = {658 - 680},
3993   number = {5},
3994   doi = {DOI: 10.1016/j.pmcj.2008.05.005},
3995   issn = {1574-1192},
3996   keywords = {Wireless sensor networks},
3997   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B7MF1-4SKB3MD-1/2/b73948dcaa3eb63a2c21d09041882625}
3998 }
3999
4000 @ARTICLE{Zhang2005,
4001   author = {Zhang, Yang and Arakaki, Adrian K. and Skolnick, Jeffrey},
4002   title = {TASSER: An automated method for the prediction of protein tertiary
4003         structures in CASP6},
4004   journal = {Proteins},
4005   year = {2005},
4006   volume = {61},
4007   pages = {91--98},
4008   number = {S7},
4009   issn = {1097-0134},
4010   keywords = {comparative modeling, threading, ab initio prediction, TASSER, PROSPECTOR_3},
4011   owner = {christophe},
4012   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
4013   timestamp = {2011.01.22},
4014   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20724}
4015 }
4016
4017 @ARTICLE{Zhou1997429,
4018   author = {Chang-song Zhou and Tian-lun Chen},
4019   title = {Extracting information masked by chaos and contaminated with noise:
4020         Some considerations on the security of communication approaches using
4021         chaos},
4022   journal = {Physics Letters A},
4023   year = {1997},
4024   volume = {234},
4025   pages = {429 - 435},
4026   number = {6},
4027   issn = {0375-9601},
4028   keywords = {Communication},
4029   owner = {guyeux},
4030   timestamp = {2009.12.12}
4031 }
4032
4033 @ARTICLE{Zhou96,
4034   author = {Zhou, Huai-bei and Wang, Lu},
4035   title = {Chaos in Biomolecular Dynamics},
4036   journal = {The Journal of Physical Chemistry},
4037   year = {1996},
4038   volume = {100},
4039   pages = {8101-8105},
4040   number = {20},
4041   doi = {10.1021/jp953409x}
4042 }
4043
4044 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iwdw/2005,
4045   title = {IWDW'05: 4th International Workshop on Digital Watermarking},
4046   year = {2005},
4047   editor = {Mauro Barni and Ingemar J. Cox and Ton Kalker and Hyoung Joong Kim},
4048   volume = {3710},
4049   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4050   address = {Siena, Italy},
4051   publisher = {Springer},
4052   month = {September 15-17},
4053   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4054   booktitle = {IWDW},
4055   isbn = {3-540-28768-X},
4056   owner = {guyeux},
4057   timestamp = {2009.06.29}
4058 }
4059
4060 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2006,
4061   title = {IH 2006: Information Hiding, 8th International Workshop},
4062   year = {2007},
4063   editor = {Jan Camenisch and Christian S. Collberg and Neil F. Johnson and Phil
4064         Sallee},
4065   volume = {4437},
4066   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4067   address = {Alexandria, VA, USA},
4068   publisher = {Springer},
4069   month = {July},
4070   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4071   booktitle = {Information Hiding},
4072   isbn = {978-3-540-74123-7},
4073   owner = {guyeux},
4074   timestamp = {2009.06.29}
4075 }
4076
4077 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2007,
4078   title = {Information Hiding, 9th International Workshop, IH 2007, Saint Malo,
4079         France, June 11-13, 2007, Revised Selected Papers},
4080   year = {2008},
4081   editor = {Teddy Furon and Fran\c{c}ois Cayre and Gwena{\"e}l J. Do{\"e}rr and
4082         Patrick Bas},
4083   volume = {4567},
4084   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4085   publisher = {Springer},
4086   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4087   booktitle = {Information Hiding},
4088   isbn = {978-3-540-77369-6},
4089   owner = {guyeux},
4090   timestamp = {2009.06.29}
4091 }
4092
4093 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iccsa/2006-1,
4094   title = {Computational Science and Its Applications - ICCSA 2006, International
4095         Conference, Glasgow, UK, May 8-11, 2006, Proceedings, Part I},
4096   year = {2006},
4097   editor = {Marina L. Gavrilova and Osvaldo Gervasi and Vipin Kumar and Chih
4098         Jeng Kenneth Tan and David Taniar and Antonio Lagan{\`a} and Youngsong
4099         Mun and Hyunseung Choo},
4100   volume = {3980},
4101   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4102   publisher = {Springer},
4103   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4104   booktitle = {ICCSA (1)},
4105   isbn = {3-540-34070-X}
4106 }
4107
4108 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/secrypt/2010,
4109   title = {SECRYPT 2010 - Proceedings of the International Conference on Security
4110         and Cryptography, Athens, Greece, July 26-28, 2010, SECRYPT is part
4111         of ICETE - The International Joint Conference on e-Business and Telecommunications},
4112   year = {2010},
4113   editor = {Sokratis K. Katsikas and Pierangela Samarati},
4114   publisher = {SciTePress},
4115   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4116   booktitle = {SECRYPT},
4117   isbn = {978-989-8425-18-8}
4118 }
4119
4120 @BOOK{Katzenbeisser00,
4121   title = {Information Hiding Techniques for Steganography and Digital Watermarking},
4122   publisher = {Artech House, Inc.},
4123   year = {2000},
4124   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Petitcolas, Fabien A.},
4125   address = {Norwood, MA, USA},
4126   isbn = {1580530354}
4127 }
4128
4129 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/1999,
4130   title = {IH'99: 3rd International Workshop on Information Hiding},
4131   year = {2000},
4132   editor = {Andreas Pfitzmann},
4133   volume = {1768},
4134   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4135   address = {Dresden, Germany},
4136   publisher = {Springer},
4137   month = {September 29 - October 1.},
4138   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4139   booktitle = {Information Hiding},
4140   isbn = {3-540-67182-X},
4141   owner = {guyeux},
4142   timestamp = {2009.06.29}
4143 }
4144
4145 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/indocrypt/2000,
4146   title = {Progress in Cryptology - INDOCRYPT 2000, First International Conference
4147         in Cryptology in India, Calcutta, India, December 10-13, 2000, Proceedings},
4148   year = {2000},
4149   editor = {Bimal K. Roy and Eiji Okamoto},
4150   volume = {1977},
4151   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4152   publisher = {Springer},
4153   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4154   booktitle = {INDOCRYPT},
4155   isbn = {3-540-41452-5}
4156 }
4157
4158 @BOOK{DBLP:reference/icsec/2010,
4159   title = {Handbook of Information and Communication Security},
4160   publisher = {Springer},
4161   year = {2010},
4162   editor = {Peter P. Stavroulakis and Mark Stamp},
4163   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4164   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
4165   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4},
4166   isbn = {978-3-642-04116-7}
4167 }
4168
4169 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/isnn/2004-2,
4170   title = {Advances in Neural Networks - ISNN 2004, International Symposium
4171         on Neural Networks, Dalian, China, August 19-21, 2004, Proceedings,
4172         Part II},
4173   year = {2004},
4174   editor = {Fuliang Yin and Jun Wang and Chengan Guo},
4175   volume = {3174},
4176   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4177   publisher = {Springer},
4178   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4179   booktitle = {ISNN (2)},
4180   isbn = {3-540-22843-8}
4181 }
4182
4183 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/adhocnets/2010,
4184   title = {Ad Hoc Networks - Second International Conference, ADHOCNETS 2010,
4185         Victoria, BC, Canada, August 18-20, 2010, Revised Selected Papers},
4186   year = {2010},
4187   editor = {Jun Zheng and David Simplot-Ryl and Victor C. M. Leung},
4188   volume = {49},
4189   series = {Lecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social Informatics
4190         and Telecommunications Engineering},
4191   publisher = {Springer},
4192   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4193   booktitle = {ADHOCNETS},
4194   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5},
4195   isbn = {978-3-642-17993-8}
4196 }
4197
4198 @INPROCEEDINGS{,
4199   owner = {guyeux},
4200   timestamp = {2011.03.29}
4201 }
4202
4203 @MISC{Delicious,
4204   title = {Delicious social bookmarking, http://delicious.com/},
4205   comment = {http://delicious.com/},
4206   type = {web page},
4207   url = {http://delicious.com/}
4208 }
4209
4210 @MISC{Frick,
4211   title = {The Frick Collection, http://www.frick.org/},
4212   comment = {http://www.frick.org/},
4213   type = {web page},
4214   url = {http://www.frick.org/}
4215 }
4216
4217 @PROCEEDINGS{2010,
4218   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4219         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4220   year = {2010},
4221   publisher = {IEEE},
4222   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4223   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4224 }
4225
4226 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4227   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4228         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4229   year = {2010},
4230   publisher = {IEEE},
4231   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4232   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4233 }
4234
4235 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/date/2010,
4236   title = {Design, Automation and Test in Europe, DATE 2010, Dresden, Germany,
4237         March 8-12, 2010},
4238   year = {2010},
4239   publisher = {IEEE},
4240   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4241   booktitle = {DATE}
4242 }
4243
4244 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/2009,
4245   title = {Proceedings IEEE CSE'09, 12th IEEE International Conference on Computational
4246         Science and Engineering, August 29-31, 2009, Vancouver, BC, Canada},
4247   year = {2009},
4248   publisher = {IEEE Computer Society},
4249   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4250   booktitle = {CSE}
4251 }
4252
4253 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/2009,
4254   title = {Proceedings of the International Conference on Ultra Modern Telecommunications,
4255         ICUMT 2009, 12-14 October 2009, St. Petersburg, Russia},
4256   year = {2009},
4257   publisher = {IEEE},
4258   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4259   booktitle = {ICUMT}
4260 }
4261
4262 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/2008,
4263   title = {49th Annual IEEE Symposium on Foundations of Computer Science, FOCS
4264         2008, October 25-28, 2008, Philadelphia, PA, USA},
4265   year = {2008},
4266   publisher = {IEEE Computer Society},
4267   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4268   booktitle = {FOCS}
4269 }
4270
4271 @comment{jabref-meta: selector_publisher:}
4272
4273 @comment{jabref-meta: selector_author:}
4274
4275 @comment{jabref-meta: selector_journal:}
4276
4277 @comment{jabref-meta: selector_keywords:Chaos;Entropie Topologique;Tip
4278
4279
4280
4281
4282 @InProceedings{Pang:2008:cec,
4283   author =      "Wai-Man Pang and Tien-Tsin Wong and Pheng-Ann Heng",
4284   title =       "Generating Massive High-Quality Random Numbers using
4285                  {GPU}",
4286   booktitle =   "2008 IEEE World Congress on Computational
4287                  Intelligence",
4288   year =        "2008",
4289   editor =      "Jun Wang",
4290   address =     "Hong Kong",
4291   organization = "IEEE Computational Intelligence Society",
4292   publisher =   "IEEE Press",
4293
4294 }
4295
4296 @Article{LEcuyerS07,
4297   title =       "Test{U01}: {A} {C} library for empirical testing of
4298                  random number generators",
4299   author =      "Pierre L'Ecuyer and Richard J. Simard",
4300   journal =     "ACM Trans. Math. Softw",
4301   year =        "2007",
4302   number =      "4",
4303   volume =      "33",
4304   bibdate =     "2007-11-06",
4305   bibsource =   "DBLP,
4306                  http://dblp.uni-trier.de/db/journals/toms/toms33.html#LEcuyerS07",
4307   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1268776.1268777",
4308 }
4309
4310 @Article{ZRKB10,
4311         author =                         {A. Zhmurov, K. Rybnikov, Y. Kholodov, and V. Barsegov},
4312         title =                          {Generation of Random Numbers on Graphics Processors: Forced Indentation In Silico of the Bacteriophage HK97},
4313         journal =                {J. Phys. Chem. B},
4314         year =                           {2011},
4315         volume =         {115},
4316         number =         {18},
4317         pages =                  {5278--5288},
4318 }
4319
4320
4321
4322 @comment {regarder : Pseudo-Random Number Generation for Brownian Dynamics and Dissipative Particle Dynamics Simulations on GPU Devices}
4323 @comment {CL Phillips, JA Anderson… - Journal of Computational Physics, 2011 - Elsevier}
4324
4325 @InProceedings{conf/fpga/ThomasHL09,
4326   title =       "A comparison of {CPU}s, {GPU}s, {FPGA}s, and massively
4327                  parallel processor arrays for random number
4328                  generation",
4329   author =      "David B. Thomas and Lee W. Howes and Wayne Luk",
4330 booktitle =     "Proceedings of the {ACM}/{SIGDA} 17th International
4331                  Symposium on Field Programmable Gate Arrays, {FPGA}
4332                  2009, Monterey, California, {USA}, February 22-24,
4333                  2009",
4334   bibdate =     "2010-06-29",
4335   publisher =   "ACM",
4336   year =        "2009",
4337   editor =      "Paul Chow and Peter Y. K. Cheung",
4338   ISBN =        "978-1-60558-410-2",
4339   pages =       "63--72",
4340   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1508128.1508139",
4341 }
4342
4343
4344
4345 @InProceedings{Jenkins96,
4346   author =      "Jenkins",
4347   title =       "{ISAAC}",
4348   booktitle =   "IWFSE: International Workshop on Fast Software
4349                  Encryption, LNCS",
4350   year =        "1996",
4351 }
4352
4353 @manual{Nvid10,
4354  author = {Nvidia},
4355  title = {Cuda cublas library},
4356  year = {2011},
4357  Note = {Version 4.0},
4358  }
4359
4360 @manual{curand11,
4361  author = {Nvidia},
4362  title = {Curand library},
4363  year = {2011},
4364  Note = {Version 4.0},
4365  }
4366
4367
4368
4369 @Article{BBS,
4370         author =                         {Lenore Blum and Manuel Blum and Michael Shub},
4371         title =                          {A Simple Unpredictable Pseudo-Random Number Generator},
4372         journal =                {SIAM Journal on Computing},
4373         year =                           {1986},
4374         volume =         {15},
4375         pages =                  {364--383},
4376 }
4377
4378 @Book{Goldreich,
4379   author =       {Oded Goldreich},
4380   ALTeditor =    {},
4381   title =        {Foundations of Cryptography: Basic Tools},
4382   publisher =    {Cambridge University Press},
4383   year =         {2007},
4384 }
4385
4386