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@@ -22,57 +22,383 @@
 \@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {1}Introduction}{7}{chapter.1}}
 \@writefile{lof}{\addvspace {10\p@ }}
 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
+\citation{Caselles99topographicmaps}
+\citation{cutrona1990synthetic}
 \@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {2}Le traitement des images bruit\IeC {\'e}es}{11}{chapter.2}}
 \@writefile{lof}{\addvspace {10\p@ }}
 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.1}Mod\IeC {\`e}le d'image bruit\IeC {\'e}e}{12}{section.2.1}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.1}Mod\IeC {\`e}le d'image bruit\IeC {\'e}e}{11}{section.2.1}}
+\citation{mancuso2001introduction}
+\citation{theuwissen2001ccd}
+\citation{healey1994radiometric}
+\citation{kodakccd}
 \@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.2}Mod\IeC {\`e}les de bruit}{12}{section.2.2}}
+\newlabel{sec_bruits}{{2.2}{12}{Modèles de bruit\relax }{section.2.2}{}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.2.1}Le bruit gaussien}{12}{subsection.2.2.1}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.2.2}Le speckle}{12}{subsection.2.2.2}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.2.3}Le bruit ``sel et poivre''}{13}{subsection.2.2.3}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.2.4}Le bruit de Poisson}{13}{subsection.2.2.4}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.3}Les techniques de r\IeC {\'e}duction de bruit}{13}{section.2.3}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.4}Les techniques de segmentation}{14}{section.2.4}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.1}Analyse d'histogramme}{14}{subsection.2.4.1}}
-\@writefile{loa}{\contentsline {algocf}{\numberline {1}{\ignorespaces Calcul du seuil de s\IeC {\'e}paration des segments de l'histogramme.}}{15}{algocfline.1}}
-\newlabel{algo-histo-cochon}{{1}{15}{Analyse d'histogramme\relax }{algocfline.1}{}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.2}Analyse de graphe}{15}{subsection.2.4.2}}
-\newlabel{fig-histo-cochon-a}{{2.1(a)}{16}{Subfigure 2 2.1(a)\relax }{subfigure.2.1.1}{}}
-\newlabel{sub@fig-histo-cochon-a}{{(a)}{16}{Subfigure 2 2.1(a)\relax }{subfigure.2.1.1}{}}
-\newlabel{fig-histo-cochon-b}{{2.1(b)}{16}{Subfigure 2 2.1(b)\relax }{subfigure.2.1.2}{}}
-\newlabel{sub@fig-histo-cochon-b}{{(b)}{16}{Subfigure 2 2.1(b)\relax }{subfigure.2.1.2}{}}
-\newlabel{fig-histo-cochon-c}{{2.1(c)}{16}{Subfigure 2 2.1(c)\relax }{subfigure.2.1.3}{}}
-\newlabel{sub@fig-histo-cochon-c}{{(c)}{16}{Subfigure 2 2.1(c)\relax }{subfigure.2.1.3}{}}
-\newlabel{fig-histo-cochon-d}{{2.1(d)}{16}{Subfigure 2 2.1(d)\relax }{subfigure.2.1.4}{}}
-\newlabel{sub@fig-histo-cochon-d}{{(d)}{16}{Subfigure 2 2.1(d)\relax }{subfigure.2.1.4}{}}
-\newlabel{fig-histo-cochon-e}{{2.1(e)}{16}{Subfigure 2 2.1(e)\relax }{subfigure.2.1.5}{}}
-\newlabel{sub@fig-histo-cochon-e}{{(e)}{16}{Subfigure 2 2.1(e)\relax }{subfigure.2.1.5}{}}
-\newlabel{fig-histo-cochon-f}{{2.1(f)}{16}{Subfigure 2 2.1(f)\relax }{subfigure.2.1.6}{}}
-\newlabel{sub@fig-histo-cochon-f}{{(f)}{16}{Subfigure 2 2.1(f)\relax }{subfigure.2.1.6}{}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.1}{\ignorespaces Segmentation par analyse simple d'histogramme. Colonne de gauche : image d'entr\IeC {\'e}e. Colonne centrale : histogramme des niveaux de gris. Colonne de droite : r\IeC {\'e}sultat de la segmentation.}}{16}{figure.2.1}}
-\newlabel{fig-histo-cochon}{{2.1}{16}{Segmentation par analyse simple d'histogramme. Colonne de gauche : image d'entrée. Colonne centrale : histogramme des niveaux de gris. Colonne de droite : résultat de la segmentation}{figure.2.1}{}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Image initiale comportant deux zones : le fond et le cochon (la cible)}}}{16}{figure.2.1}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {Histogramme des niveaux de gris}}}{16}{figure.2.1}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {Image binaire repr\IeC {\'e}sentant la segmentation. Seuil estim\IeC {\'e} \IeC {\`a} 101 apr\IeC {\`e}s 4 it\IeC {\'e}rations.}}}{16}{figure.2.1}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {Image initiale bruit\IeC {\'e}e}}}{16}{figure.2.1}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(e)}{\ignorespaces {Histogramme des niveaux de gris}}}{16}{figure.2.1}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(f)}{\ignorespaces {Image binaire repr\IeC {\'e}sentant la segmentation. Seuil estim\IeC {\'e} \IeC {\`a} 99 apr\IeC {\`e}s 5 it\IeC {\'e}rations.}}}{16}{figure.2.1}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.3}kernel-means, mean-shift et d\IeC {\'e}riv\IeC {\'e}s}{17}{subsection.2.4.3}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.4}Les contours actifs, ou \textit  {snakes}}{18}{subsection.2.4.4}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.5}M\IeC {\'e}thodes hybrides}{19}{subsection.2.4.5}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.5}L'\IeC {\'e}tat de l'art des impl\IeC {\'e}mentations GPU}{20}{section.2.5}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {3}La segmentation orient\IeC {\'e}e r\IeC {\'e}gions dans les images bruit\IeC {\'e}es}{21}{chapter.3}}
+\citation{coil}
+\citation{Wang04imagequality}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.1}{\ignorespaces Images 256$\times $256 en niveau de gris 8 bits utilis\IeC {\'e}es pour l'illustration des propri\IeC {\'e}t\IeC {\'e}s des filtres. a) l'image de r\IeC {\'e}f\IeC {\'e}rence non bruit\IeC {\'e}e. b) l'image corrompue par un bruit gaussien d'\IeC {\'e}cart type $\sigma =25$. c) l'image corrompue par un bruit impulsionnel \IeC {\`a} 25\%.}}{14}{figure.2.1}}
+\newlabel{fig-ny-noises}{{2.1}{14}{Images 256$\times $256 en niveau de gris 8 bits utilisées pour l'illustration des propriétés des filtres. a) l'image de référence non bruitée. b) l'image corrompue par un bruit gaussien d'écart type $\sigma =25$. c) l'image corrompue par un bruit impulsionnel à 25\%}{figure.2.1}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Sans bruit}}}{14}{figure.2.1}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {Bruit gaussien $\sigma =25$, PSNR=22.3~dB MSSIM=0.16}}}{14}{figure.2.1}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {Bruit impulsionnel 25\%, PSNR=9.48~dB MSSIM=0.04}}}{14}{figure.2.1}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.3.1}Les op\IeC {\'e}rateurs de base}{14}{subsection.2.3.1}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsubsection}{\numberline {2.3.1.1}Le filtre de convolution}{14}{subsubsection.2.3.1.1}}
+\citation{tukey77}
+\citation{4287006}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.2}{\ignorespaces Filtrage par convolution.}}{15}{figure.2.2}}
+\newlabel{fig-ny-convo}{{2.2}{15}{Filtrage par convolution}{figure.2.2}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Moyenneur 3$\times $3, PSNR=27.6dB MSSIM=0.34}}}{15}{figure.2.2}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {Moyenneur 5$\times $5, PSNR=27.7dB MSSIM=0.38}}}{15}{figure.2.2}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {Filtre gaussien 3$\times $3, PSNR=27.4dB MSSIM=0.33}}}{15}{figure.2.2}}
+\newlabel{convoDef}{{2.1}{15}{Le filtre de convolution\relax }{equation.2.3.1}{}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsubsection}{\numberline {2.3.1.2}Le filtre m\IeC {\'e}dian}{15}{subsubsection.2.3.1.2}}
+\citation{710815}
+\citation{1521458}
+\citation{4587843}
+\citation{BuadesCM06}
+\citation{bertaux2004speckle}
+\citation{Mallat:2008:WTS:1525499}
+\citation{Daubechies:1992:TLW:130655}
+\citation{1093941}
+\citation{strang1999discrete}
+\citation{elad2006image}
+\citation{elad2006image}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.3}{\ignorespaces R\IeC {\'e}duction du bruit impulsionnel par filtre m\IeC {\'e}dian.}}{16}{figure.2.3}}
+\newlabel{fig-ny-median}{{2.3}{16}{Réduction du bruit impulsionnel par filtre médian}{figure.2.3}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {M\IeC {\'e}dian 3$\times $3 une passe, PSNR=26.4~dB MSSIM=0.90}}}{16}{figure.2.3}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {M\IeC {\'e}dian 3$\times $3 deux passes, PSNR=34.4~dB MSSIM=0.98}}}{16}{figure.2.3}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {M\IeC {\'e}dian 5$\times $5 une passe, PSNR=35.1~dB MSSIM=0.98}}}{16}{figure.2.3}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsubsection}{\numberline {2.3.1.3}Le filtre bilat\IeC {\'e}ral}{16}{subsubsection.2.3.1.3}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.4}{\ignorespaces R\IeC {\'e}duction de bruit gaussien par filtrage bilat\IeC {\'e}ral de voisinage 5$\times $5. $\sigma _S$ et $\sigma _I$ sont les \IeC {\'e}carts type des fonctions gaussiennes de pond\IeC {\'e}ration spatiale et d'intensit\IeC {\'e}.}}{17}{figure.2.4}}
+\newlabel{fig-ny-bilat}{{2.4}{17}{Réduction de bruit gaussien par filtrage bilatéral de voisinage 5$\times $5. $\sigma _S$ et $\sigma _I$ sont les écarts type des fonctions gaussiennes de pondération spatiale et d'intensité}{figure.2.4}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {$\sigma _S=1.0$ et $\sigma _I=0.1$, PSNR=25.6~dB MSSIM=0.25}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {$\sigma _S=1.0$ et $\sigma _I=0.5$, PSNR=28.0~dB MSSIM=0.36}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {$\sigma _S=1.0$ et $\sigma _I=1.0$, PSNR=27.9~dB MSSIM=0.36}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {$\sigma _S=2.0$ et $\sigma _I=0.1$, PSNR=26.7~dB MSSIM=0.29}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(e)}{\ignorespaces {$\sigma _S=2.0$ et $\sigma _I=0.5$, PSNR=27.9~dB MSSIM=0.39}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(f)}{\ignorespaces {$\sigma _S=2.0$ et $\sigma _I=1.0$, PSNR=27.5~dB MSSIM=0.38}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(g)}{\ignorespaces {$\sigma _S=5.0$ et $\sigma _I=0.1$, PSNR=26.8~dB MSSIM=0.29}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(h)}{\ignorespaces {$\sigma _S=5.0$ et $\sigma _I=0.5$, PSNR=26.8~dB MSSIM=0.37}}}{17}{figure.2.4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(i)}{\ignorespaces {$\sigma _S=5.0$ et $\sigma _I=1.0$, PSNR=25.9~dB MSSIM=0.36}}}{17}{figure.2.4}}
+\citation{1467423}
+\citation{Dabov06imagedenoising}
+\citation{Dabov09bm3dimage}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.5}{\ignorespaces Filtrage par d\IeC {\'e}composition en ondelettes et seuillage dur des coefficients inf\IeC {\'e}rieurs au seuil $T$.}}{18}{figure.2.5}}
+\newlabel{fig-ny-dwt}{{2.5}{18}{Filtrage par décomposition en ondelettes et seuillage dur des coefficients inférieurs au seuil $T$}{figure.2.5}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {$T=20$, PSNR=26.9~dB MSSIM=0.30}}}{18}{figure.2.5}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {$T=35$, PSNR=27.6~dB MSSIM=0.36}}}{18}{figure.2.5}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {$T=70$, PSNR=26.7~dB MSSIM=0.37}}}{18}{figure.2.5}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsubsection}{\numberline {2.3.1.4}Les algorithmes de filtrage par dictionnaire}{18}{subsubsection.2.3.1.4}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.3.2}Les algorithmes de filtrage par patches}{18}{subsection.2.3.2}}
+\citation{cmla2009Kes}
+\citation{convolutionsoup}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.6}{\ignorespaces Filtrage par NL-means pour diff\IeC {\'e}rentes combinaisons des param\IeC {\`e}tres de similarit\IeC {\'e} $f$ et de non localit\IeC {\'e} $t$.}}{19}{figure.2.6}}
+\newlabel{fig-ny-nlm}{{2.6}{19}{Filtrage par NL-means pour différentes combinaisons des paramètres de similarité $f$ et de non localité $t$}{figure.2.6}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {$f=2$ et $t=2$, PSNR=28.5~dB MSSIM=0.37}}}{19}{figure.2.6}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {$f=2$ et $t=5$, PSNR=28.6~dB MSSIM=0.38}}}{19}{figure.2.6}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {$f=5$ et $t=2$, PSNR=29.0~dB MSSIM=0.39}}}{19}{figure.2.6}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {$f=5$ et $t=5$, PSNR=29.0~dB MSSIM=0.40}}}{19}{figure.2.6}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.7}{\ignorespaces Filtrage par BM3D, PSNR=29.3~dB MSSIM=0.41}}{19}{figure.2.7}}
+\newlabel{fig-ny-bm3d}{{2.7}{19}{Filtrage par BM3D, PSNR=29.3~dB MSSIM=0.41\relax }{figure.2.7}{}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.4}Les impl\IeC {\'e}mentations GPU des algorithmes de filtrage}{19}{section.2.4}}
+\citation{4287006}
+\citation{6288187}
+\citation{5402362}
+\citation{chen09}
+\citation{5402362}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.1}Le filtrage par convolution}{20}{subsection.2.4.1}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.2}Le filtre m\IeC {\'e}dian}{20}{subsection.2.4.2}}
+\citation{aldinucci2012parallel}
+\citation{5206542}
+\citation{zheng2011performance}
+\citation{zheng2011performance}
+\citation{zheng2011performance}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.3}Le filtre bilat\IeC {\'e}ral}{21}{subsection.2.4.3}}
+\citation{PALHANOXAVIERDEFONTES}
+\citation{nlmeansgpubelge}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.8}{\ignorespaces Illustration pr\IeC {\'e}-chargement en m\IeC {\'e}moire partag\IeC {\'e}e mise en \oe uvre dans \cite  {zheng2011performance} pour l'impl\IeC {\'e}mentation, entre autres, du filtre bilat\IeC {\'e}ral. a) en vert le bloc de threads associ\IeC {\'e} aux pixels centraux. b-e) les blocs de pixels successivement pr\IeC {\'e}-charg\IeC {\'e}s en m\IeC {\'e}moire partag\IeC {\'e}e. f) la configuration finale de la ROI en m\IeC {\'e}moire partag\IeC {\'e}e.}}{22}{figure.2.8}}
+\newlabel{fig-prefetch-zheng}{{2.8}{22}{Illustration pré-chargement en mémoire partagée mise en \oe uvre dans \cite {zheng2011performance} pour l'implémentation, entre autres, du filtre bilatéral. a) en vert le bloc de threads associé aux pixels centraux. b-e) les blocs de pixels successivement pré-chargés en mémoire partagée. f) la configuration finale de la ROI en mémoire partagée}{figure.2.8}{}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.4.4}Les filtres par patches}{22}{subsection.2.4.4}}
+\citation{humphrey1924psychology}
+\citation{4310076}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.5}Les techniques de segmentation}{23}{section.2.5}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.5.1}Analyse d'histogramme}{23}{subsection.2.5.1}}
+\newlabel{sec-histo}{{2.5.1}{23}{Analyse d'histogramme\relax }{subsection.2.5.1}{}}
+\newlabel{fig-histo-cochon-a}{{2.9(a)}{24}{Subfigure 2 2.9(a)\relax }{subfigure.2.9.1}{}}
+\newlabel{sub@fig-histo-cochon-a}{{(a)}{24}{Subfigure 2 2.9(a)\relax }{subfigure.2.9.1}{}}
+\newlabel{fig-histo-cochon-b}{{2.9(b)}{24}{Subfigure 2 2.9(b)\relax }{subfigure.2.9.2}{}}
+\newlabel{sub@fig-histo-cochon-b}{{(b)}{24}{Subfigure 2 2.9(b)\relax }{subfigure.2.9.2}{}}
+\newlabel{fig-histo-cochon-c}{{2.9(c)}{24}{Subfigure 2 2.9(c)\relax }{subfigure.2.9.3}{}}
+\newlabel{sub@fig-histo-cochon-c}{{(c)}{24}{Subfigure 2 2.9(c)\relax }{subfigure.2.9.3}{}}
+\newlabel{fig-histo-cochon-d}{{2.9(d)}{24}{Subfigure 2 2.9(d)\relax }{subfigure.2.9.4}{}}
+\newlabel{sub@fig-histo-cochon-d}{{(d)}{24}{Subfigure 2 2.9(d)\relax }{subfigure.2.9.4}{}}
+\newlabel{fig-histo-cochon-e}{{2.9(e)}{24}{Subfigure 2 2.9(e)\relax }{subfigure.2.9.5}{}}
+\newlabel{sub@fig-histo-cochon-e}{{(e)}{24}{Subfigure 2 2.9(e)\relax }{subfigure.2.9.5}{}}
+\newlabel{fig-histo-cochon-f}{{2.9(f)}{24}{Subfigure 2 2.9(f)\relax }{subfigure.2.9.6}{}}
+\newlabel{sub@fig-histo-cochon-f}{{(f)}{24}{Subfigure 2 2.9(f)\relax }{subfigure.2.9.6}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.9}{\ignorespaces Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par analyse simple d'histogramme. Colonne de gauche : image d'entr\IeC {\'e}e. Colonne centrale : histogramme des niveaux de gris. Colonne de droite : r\IeC {\'e}sultat de la segmentation.}}{24}{figure.2.9}}
+\newlabel{fig-histo-cochon}{{2.9}{24}{Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par analyse simple d'histogramme. Colonne de gauche : image d'entrée. Colonne centrale : histogramme des niveaux de gris. Colonne de droite : résultat de la segmentation}{figure.2.9}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Image initiale comportant deux zones : le fond et le cochon (la cible)}}}{24}{figure.2.9}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {Histogramme des niveaux de gris}}}{24}{figure.2.9}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {Image binaire repr\IeC {\'e}sentant la segmentation. Seuil estim\IeC {\'e} \IeC {\`a} 101 apr\IeC {\`e}s 4 it\IeC {\'e}rations.}}}{24}{figure.2.9}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {Image initiale bruit\IeC {\'e}e}}}{24}{figure.2.9}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(e)}{\ignorespaces {Histogramme des niveaux de gris}}}{24}{figure.2.9}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(f)}{\ignorespaces {Image binaire repr\IeC {\'e}sentant la segmentation. Seuil estim\IeC {\'e} \IeC {\`a} 99 apr\IeC {\`e}s 5 it\IeC {\'e}rations.}}}{24}{figure.2.9}}
+\citation{Zahn:1971:GMD:1309266.1309359}
+\@writefile{loa}{\contentsline {algocf}{\numberline {1}{\ignorespaces Calcul du seuil de s\IeC {\'e}paration des segments de l'histogramme.}}{25}{algocfline.1}}
+\newlabel{algo-histo-cochon}{{1}{25}{Analyse d'histogramme\relax }{algocfline.1}{}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.5.2}Partitionnement de graphe}{25}{subsection.2.5.2}}
+\citation{wu1993optimal}
+\citation{wang2001image}
+\citation{wang2003image}
+\citation{felzenszwalb2004efficient}
+\citation{shi2000normalized}
+\citation{shi2000normalized}
+\citation{ford1955simple}
+\citation{boykov2004experimental}
+\citation{chandran2009computational}
+\citation{cherkassky1997implementing}
+\citation{hochbaum2013simplifications}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.10}{\ignorespaces Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par simplification de graphe de type \textit  {Normalized cut} pour un nombre $s$ de segments variant de 2 \IeC {\`a} 5.}}{26}{figure.2.10}}
+\newlabel{fig-graph-cochon}{{2.10}{26}{Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par simplification de graphe de type \textit {Normalized cut} pour un nombre $s$ de segments variant de 2 à 5}{figure.2.10}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {$s = 2$}}}{26}{figure.2.10}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {$s = 3$}}}{26}{figure.2.10}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {$s = 4$}}}{26}{figure.2.10}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {$s = 5$}}}{26}{figure.2.10}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.5.3}kernel-means, mean-shift et apparent\IeC {\'e}s}{26}{subsection.2.5.3}}
+\citation{macqueen1967some}
+\citation{agarwal2002exact}
+\citation{arora1998approximation}
+\citation{pelleg2000x}
+\citation{fukunaga1975estimation}
+\citation{cheng1995mean}
+\citation{foley1994introduction}
+\citation{comaniciu1999mean}
+\citation{comaniciu2002mean}
+\citation{keselman1998extraction}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.11}{\ignorespaces Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par algorithme \textit  {k-means} pour un nombre $s$ de segments variant de 2 \IeC {\`a} 5. Chaque couleur est associ\IeC {\'e}e \IeC {\`a} un segment. Les couleurs sont choisies pour une meilleure visualisation des diff\IeC {\'e}rents segments.}}{27}{figure.2.11}}
+\newlabel{fig-kmeans-cochon}{{2.11}{27}{Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par algorithme \textit {k-means} pour un nombre $s$ de segments variant de 2 à 5. Chaque couleur est associée à un segment. Les couleurs sont choisies pour une meilleure visualisation des différents segments}{figure.2.11}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {$s = 2$}}}{27}{figure.2.11}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {$s = 3$}}}{27}{figure.2.11}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {$s = 4$}}}{27}{figure.2.11}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {$s = 5$}}}{27}{figure.2.11}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.12}{\ignorespaces Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par algorithme \textit  {mean-shift} pour un rayon de voisinage $r$ de 100, 50, 35 et 25 pixels permettant d'obtenir un nombre $s$ de segments variant respectivement de 2 \IeC {\`a} 5. Le volume minimal admis pour un segment est fix\IeC {\'e} \IeC {\`a} 100 pixels. Chaque couleur est associ\IeC {\'e}e \IeC {\`a} un segment. Les couleurs sont choisies pour une meilleure visualisation des diff\IeC {\'e}rents segments.}}{28}{figure.2.12}}
+\newlabel{fig-meanshift-cochon}{{2.12}{28}{Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par algorithme \textit {mean-shift} pour un rayon de voisinage $r$ de 100, 50, 35 et 25 pixels permettant d'obtenir un nombre $s$ de segments variant respectivement de 2 à 5. Le volume minimal admis pour un segment est fixé à 100 pixels. Chaque couleur est associée à un segment. Les couleurs sont choisies pour une meilleure visualisation des différents segments}{figure.2.12}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {$r=100 \Rightarrow s = 2$}}}{28}{figure.2.12}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {$r=50 \Rightarrow s = 3$}}}{28}{figure.2.12}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {$r=35 \Rightarrow s = 4$}}}{28}{figure.2.12}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {$r=25 \Rightarrow s = 5$}}}{28}{figure.2.12}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.5.4}Les contours actifs, ou \textit  {snakes}}{28}{subsection.2.5.4}}
+\citation{KassWT88}
+\citation{osher1988fronts}
+\citation{adalsteinsson1994fast}
+\citation{sethian1996fast}
+\citation{cohen1993surface}
+\citation{ronfard1994region}
+\citation{ChesnaudRB99}
+\citation{GallandBR03}
+\citation{GermainR01}
+\citation{arbelaez2011contour}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.13}{\ignorespaces Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par algorithme dit du \textit  {snake}, dans sa version originale. Les param\IeC {\`e}tres d'\IeC {\'e}lasticti\IeC {\'e}, de raideur et d'attraction ont \IeC {\'e}t\IeC {\'e} fix\IeC {\'e}s respectivement aux valeurs 5, 0.1 et 5. }}{30}{figure.2.13}}
+\newlabel{fig-snake-tradi-cochon}{{2.13}{30}{Segmentation d'une image en niveaux de gris de 128 $\times $ 128 pixels par algorithme dit du \textit {snake}, dans sa version originale. Les paramètres d'élastictié, de raideur et d'attraction ont été fixés respectivement aux valeurs 5, 0.1 et 5. \relax }{figure.2.13}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Les \IeC {\'e}tats initial et suivant chacune des trois premi\IeC {\`e}res it\IeC {\'e}rations}}}{30}{figure.2.13}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {L'\IeC {\'e}tat du contour apr\IeC {\`e}s la septi\IeC {\`e}me it\IeC {\'e}ration}}}{30}{figure.2.13}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {L'\IeC {\'e}tat du contour apr\IeC {\`e}s la dixi\IeC {\`e}me it\IeC {\'e}ration}}}{30}{figure.2.13}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {L'\IeC {\'e}tat du contour apr\IeC {\`e}s la centi\IeC {\`e}me it\IeC {\'e}ration. C'est le contour final.}}}{30}{figure.2.13}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.5.5}M\IeC {\'e}thodes hybrides}{30}{subsection.2.5.5}}
+\citation{fluck2006gpu}
+\citation{lefohn2003interactive}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.6}Les impl\IeC {\'e}mentations GPU des techniques de segmentation}{31}{section.2.6}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.6.1}Calcul d'histogramme}{31}{subsection.2.6.1}}
+\citation{Vineet:2009:FMS:1572769.1572796}
+\citation{dixit2005gpu}
+\citation{4563095}
+\citation{kohli2007dynamic}
+\citation{graphcutscuda}
+\citation{graphcutscuda}
+\citation{4563095}
+\citation{graphcutscuda}
+\citation{graphcutscuda}
+\citation{che2008performance}
+\citation{kddcup99}
+\citation{5170921}
+\citation{che2008performance}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.6.2}Partitionnement de graphe}{32}{subsection.2.6.2}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.6.3}K-means, mean-shift et apparent\IeC {\'e}s}{32}{subsection.2.6.3}}
+\citation{kmeansgpuopengl}
+\citation{li2009mean}
+\citation{vedaldi2008quick}
+\citation{fulkerson2012really}
+\citation{fulkerson2012really}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.14}{\ignorespaces \IeC {\'E}volution du nombre de pixels actifs pour les it\IeC {\'e}ration successives de l'impl\IeC {\'e}mentation de l'algorithme push-relabel de \cite  {graphcutscuda}. Les petites images montrent la localisation des pixels actifs apr\IeC {\`e}s chaque it\IeC {\'e}ration, en blanc.}}{33}{figure.2.14}}
+\newlabel{fig-graphcutscuda}{{2.14}{33}{Évolution du nombre de pixels actifs pour les itération successives de l'implémentation de l'algorithme push-relabel de \cite {graphcutscuda}. Les petites images montrent la localisation des pixels actifs après chaque itération, en blanc}{figure.2.14}{}}
+\citation{fulkerson2012really}
+\citation{fulkerson2012really}
+\citation{xiao2010efficient}
+\citation{lefohn2003inter}
+\citation{lefohn2003interactive}
+\citation{rumpf2001level}
+\citation{rumpf2001level}
+\citation{lefohn2005streaming}
+\citation{cates2004gist}
+\citation{jeong2009scalable}
+\citation{jeong2009scalable}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.15}{\ignorespaces Segmentation d'une image couleur de 512$\times $512 pixels par l'impl\IeC {\'e}mentation GPU quick-shift de \cite  {fulkerson2012really}.}}{34}{figure.2.15}}
+\newlabel{fig-quickshift-yo}{{2.15}{34}{Segmentation d'une image couleur de 512$\times $512 pixels par l'implémentation GPU quick-shift de \cite {fulkerson2012really}}{figure.2.15}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Image originale}}}{34}{figure.2.15}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {$\tau =10$ et $\sigma =2$}}}{34}{figure.2.15}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {$\tau =10$ et $\sigma =10$}}}{34}{figure.2.15}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(d)}{\ignorespaces {$\tau =20$ et $\sigma =10$}}}{34}{figure.2.15}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.6.4}Snakes et Level set}{34}{subsection.2.6.4}}
+\citation{Roberts:2010:WGA:1921479.1921499}
+\citation{lefohn2003inter}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.16}{\ignorespaces Segmentation d'une image couleur de 2256$\times $3008 pixels.}}{35}{figure.2.16}}
+\newlabel{fig-meanshift-castle}{{2.16}{35}{Segmentation d'une image couleur de 2256$\times $3008 pixels}{figure.2.16}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Image originale}}}{35}{figure.2.16}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {Image segment\IeC {\'e}e par mean-shift standard}}}{35}{figure.2.16}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(c)}{\ignorespaces {Image segment\IeC {\'e}e par mean-shift kd-tree}}}{35}{figure.2.16}}
+\citation{snakegvf06}
+\citation{bauer2009segmentation}
+\citation{li2011robust}
+\citation{snakegvfopencl12}
+\citation{snakegvf06}
+\citation{zheng2012fast}
+\newlabel{fig-l7-brain}{{2.17(a)}{36}{Subfigure 2 2.17(a)\relax }{subfigure.2.17.1}{}}
+\newlabel{sub@fig-l7-brain}{{(a)}{36}{Subfigure 2 2.17(a)\relax }{subfigure.2.17.1}{}}
+\newlabel{fig-l7-reins}{{2.17(b)}{36}{Subfigure 2 2.17(b)\relax }{subfigure.2.17.2}{}}
+\newlabel{sub@fig-l7-reins}{{(b)}{36}{Subfigure 2 2.17(b)\relax }{subfigure.2.17.2}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.17}{\ignorespaces Segmentation d'images issues d'examens IRM par la m\IeC {\'e}thode des level set \IeC {\`a} bande \IeC {\'e}troite.}}{36}{figure.2.17}}
+\newlabel{fig-l7-narrow}{{2.17}{36}{Segmentation d'images issues d'examens IRM par la méthode des level set à bande étroite}{figure.2.17}{}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(a)}{\ignorespaces {Cerveau 256$\times $256$\times $256 en 7~s}}}{36}{figure.2.17}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {subfigure}{\numberline{(b)}{\ignorespaces {Reins et aorte, 256$\times $256$\times $272 en 16~s}}}{36}{figure.2.17}}
+\citation{li2011robust}
+\citation{snakegvfopencl12}
+\citation{arbelaez2011contour}
+\citation{5459410}
+\citation{martin2001database}
+\citation{bresenham1965algorithm}
+\citation{martin2001database}
+\citation{martin2001database}
+\@writefile{toc}{\contentsline {subsection}{\numberline {2.6.5}Algorithmes hybrides}{37}{subsection.2.6.5}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.18}{\ignorespaces Extraction de contour par la version GPU de l'algorithme gPb. Les images sont issues de la base BSDS \cite  {martin2001database}}}{38}{figure.2.18}}
+\newlabel{fig-gPb}{{2.18}{38}{Extraction de contour par la version GPU de l'algorithme gPb. Les images sont issues de la base BSDS \cite {martin2001database}\relax }{figure.2.18}{}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {3}La segmentation orient\IeC {\'e}e r\IeC {\'e}gions dans les images bruit\IeC {\'e}es}{39}{chapter.3}}
 \@writefile{lof}{\addvspace {10\p@ }}
 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.1}Pr\IeC {\'e}sentation - existant}{21}{section.3.1}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.2}La parall\IeC {\`e}lisation du snake polygonal}{21}{section.3.2}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {4}Le filtrage des images sur GPU}{23}{chapter.4}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.1}Pr\IeC {\'e}sentation - existant}{39}{section.3.1}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.2}La parall\IeC {\`e}lisation du snake polygonal}{39}{section.3.2}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {4}Le filtrage des images sur GPU}{41}{chapter.4}}
 \@writefile{lof}{\addvspace {10\p@ }}
 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {4.1}Algorithme de r\IeC {\'e}duction de bruit par recherche des lignes de niveaux}{23}{section.4.1}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {4.2}Filtre m\IeC {\'e}dian}{23}{section.4.2}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {4.3}Filtres de convolution}{23}{section.4.3}}
-\bibdata{biblio.bib}
-\@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {5}Conclusion g\IeC {\'e}n\IeC {\'e}rale}{25}{chapter.5}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {4.1}Algorithme de r\IeC {\'e}duction de bruit par recherche des lignes de niveaux}{41}{section.4.1}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {4.2}Filtre m\IeC {\'e}dian}{41}{section.4.2}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {4.3}Filtres de convolution}{41}{section.4.3}}
+\bibstyle{plain}
+\bibdata{biblio}
+\@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {5}Conclusion g\IeC {\'e}n\IeC {\'e}rale}{43}{chapter.5}}
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 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
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