src/smpi/mpi/smpi_comm.cpp

   1 /* Copyright (c) 2010-2019. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "smpi_comm.hpp"
   7 #include "smpi_coll.hpp"
   8 #include "smpi_datatype.hpp"
   9 #include "smpi_request.hpp"
  10 #include "smpi_win.hpp"
  11 #include "smpi_info.hpp"
  12 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
  13 #include "src/surf/HostImpl.hpp"
  14
  15 #include <climits>
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_comm, smpi, "Logging specific to SMPI (comm)");
  18
  19 simgrid::smpi::Comm mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  20 MPI_Comm MPI_COMM_UNINITIALIZED=&mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  21
  22 /* Support for cartesian topology was added, but there are 2 other types of topology, graph et dist graph. In order to
  23  * support them, we have to add a field SMPI_Topo_type, and replace the MPI_Topology field by an union. */
  24
  25 namespace simgrid{
  26 namespace smpi{
  27
  28 std::unordered_map<int, smpi_key_elem> Comm::keyvals_;
  29 int Comm::keyval_id_=0;
  30
  31 Comm::Comm(MPI_Group group, MPI_Topology topo, int smp, int in_id) : group_(group), topo_(topo),is_smp_comm_(smp), id_(in_id)
  32 {
  33   errhandler_      = MPI_ERRORS_ARE_FATAL;
  34   errhandler_->ref();
  35   //First creation of comm is done before SIMIX_run, so only do comms for others
  36   if(in_id==MPI_UNDEFINED && smp==0 && this->rank()!=MPI_UNDEFINED ){
  37     int id;
  38     if(this->rank()==0){
  39       static int global_id_ = 0;
  40       id=global_id_;
  41       global_id_++;
  42     }
  43     colls::bcast(&id, 1, MPI_INT, 0, this);
  44     XBT_DEBUG("Communicator %p has id %d", this, id);
  45     id_=id;//only set here, as we don't want to change it in the middle of the bcast
  46     colls::barrier(this);
  47   }
  48 }
  49
  50 void Comm::destroy(Comm* comm)
  51 {
  52   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
  53     Comm::destroy(smpi_process()->comm_world());
  54     return;
  55   }
  56   Comm::unref(comm);
  57 }
  58
  59 int Comm::dup(MPI_Comm* newcomm){
  60   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
  61     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
  62     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
  63   }
  64   MPI_Group cp = new  Group(this->group());
  65   (*newcomm)   = new  Comm(cp, this->topo());
  66   int ret      = MPI_SUCCESS;
  67
  68   if (not attributes()->empty()) {
  69     int flag=0;
  70     void* value_out=nullptr;
  71     for (auto const& it : *attributes()) {
  72       smpi_key_elem elem = keyvals_.at(it.first);
  73       if (elem != nullptr){
  74         if( elem->copy_fn.comm_copy_fn != MPI_NULL_COPY_FN &&
  75             elem->copy_fn.comm_copy_fn != MPI_COMM_DUP_FN)
  76           ret = elem->copy_fn.comm_copy_fn(this, it.first, elem->extra_state, it.second, &value_out, &flag);
  77         else if ( elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != MPI_NULL_COPY_FN &&
  78                   *(int*)*elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != 1){
  79           value_out=(int*)xbt_malloc(sizeof(int));
  80           elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort(this, it.first, elem->extra_state, it.second, value_out, &flag,&ret);
  81         }
  82         if (ret != MPI_SUCCESS) {
  83           Comm::destroy(*newcomm);
  84           *newcomm = MPI_COMM_NULL;
  85           return ret;
  86         }
  87         if (elem->copy_fn.comm_copy_fn == MPI_COMM_DUP_FN ||
  88            ((elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != MPI_NULL_COPY_FN) && *(int*)*elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort == 1)){
  89           elem->refcount++;
  90           (*newcomm)->attributes()->insert({it.first, it.second});
  91         }else if (flag){
  92           elem->refcount++;
  93           (*newcomm)->attributes()->insert({it.first, value_out});
  94         }
  95       }
  96     }
  97   }
  98   //duplicate info if present
  99   if(info_!=MPI_INFO_NULL)
 100     (*newcomm)->info_ = new simgrid::smpi::Info(info_);
 101   //duplicate errhandler
 102   (*newcomm)->set_errhandler(errhandler_);
 103   return ret;
 104 }
 105
 106 int Comm::dup_with_info(MPI_Info info, MPI_Comm* newcomm){
 107   int ret = dup(newcomm);
 108   if(ret != MPI_SUCCESS)
 109     return ret;
 110   if((*newcomm)->info_!=MPI_INFO_NULL){
 111     simgrid::smpi::Info::unref((*newcomm)->info_);
 112     (*newcomm)->info_=MPI_INFO_NULL;
 113   }
 114   if(info != MPI_INFO_NULL){
 115     info->ref();
 116     (*newcomm)->info_=info;
 117   }
 118   return ret;
 119 }
 120
 121 MPI_Group Comm::group()
 122 {
 123   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 124     return smpi_process()->comm_world()->group();
 125   return group_;
 126 }
 127
 128 int Comm::size()
 129 {
 130   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 131     return smpi_process()->comm_world()->size();
 132   return group_->size();
 133 }
 134
 135 int Comm::rank()
 136 {
 137   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 138     return smpi_process()->comm_world()->rank();
 139   return group_->rank(s4u::Actor::self());
 140 }
 141
 142 int Comm::id()
 143 {
 144   return id_;
 145 }
 146
 147 void Comm::get_name (char* name, int* len)
 148 {
 149   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 150     smpi_process()->comm_world()->get_name(name, len);
 151     return;
 152   }
 153   if(this == MPI_COMM_WORLD && name_.empty()) {
 154     strncpy(name, "MPI_COMM_WORLD", 15);
 155     *len = 14;
 156   } else if(this == MPI_COMM_SELF && name_.empty()) {
 157     strncpy(name, "MPI_COMM_SELF", 14);
 158     *len = 13;
 159   } else {
 160     *len = snprintf(name, MPI_MAX_NAME_STRING+1, "%s", name_.c_str());
 161   }
 162 }
 163
 164 void Comm::set_name (const char* name)
 165 {
 166   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 167     smpi_process()->comm_world()->set_name(name);
 168     return;
 169   }
 170   name_.replace (0, MPI_MAX_NAME_STRING+1, name);
 171 }
 172
 173
 174 void Comm::set_leaders_comm(MPI_Comm leaders){
 175   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 176     smpi_process()->comm_world()->set_leaders_comm(leaders);
 177     return;
 178   }
 179   leaders_comm_=leaders;
 180 }
 181
 182 int* Comm::get_non_uniform_map(){
 183   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 184     return smpi_process()->comm_world()->get_non_uniform_map();
 185   return non_uniform_map_;
 186 }
 187
 188 int* Comm::get_leaders_map(){
 189   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 190     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_map();
 191   return leaders_map_;
 192 }
 193
 194 MPI_Comm Comm::get_leaders_comm(){
 195   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 196     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_comm();
 197   return leaders_comm_;
 198 }
 199
 200 MPI_Comm Comm::get_intra_comm(){
 201   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD)
 202     return smpi_process()->comm_intra();
 203   else return intra_comm_;
 204 }
 205
 206 int Comm::is_uniform(){
 207   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 208     return smpi_process()->comm_world()->is_uniform();
 209   return is_uniform_;
 210 }
 211
 212 int Comm::is_blocked(){
 213   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 214     return smpi_process()->comm_world()->is_blocked();
 215   return is_blocked_;
 216 }
 217
 218 int Comm::is_smp_comm(){
 219   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 220     return smpi_process()->comm_world()->is_smp_comm();
 221   return is_smp_comm_;
 222 }
 223
 224 MPI_Comm Comm::split(int color, int key)
 225 {
 226   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 227     return smpi_process()->comm_world()->split(color, key);
 228   int system_tag = -123;
 229   int* recvbuf;
 230
 231   MPI_Group group_root = nullptr;
 232   MPI_Group group_out  = nullptr;
 233   MPI_Group group      = this->group();
 234   int myrank           = this->rank();
 235   int size             = this->size();
 236   /* Gather all colors and keys on rank 0 */
 237   int* sendbuf = xbt_new(int, 2);
 238   sendbuf[0] = color;
 239   sendbuf[1] = key;
 240   if (myrank == 0) {
 241     recvbuf = xbt_new(int, 2 * size);
 242   } else {
 243     recvbuf = nullptr;
 244   }
 245   gather__default(sendbuf, 2, MPI_INT, recvbuf, 2, MPI_INT, 0, this);
 246   xbt_free(sendbuf);
 247   /* Do the actual job */
 248   if (myrank == 0) {
 249     MPI_Group* group_snd = xbt_new(MPI_Group, size);
 250     std::vector<std::pair<int, int>> rankmap;
 251     rankmap.reserve(size);
 252     for (int i = 0; i < size; i++) {
 253       if (recvbuf[2 * i] != MPI_UNDEFINED) {
 254         rankmap.clear();
 255         for (int j = i + 1; j < size; j++) {
 256           if(recvbuf[2 * i] == recvbuf[2 * j]) {
 257             recvbuf[2 * j] = MPI_UNDEFINED;
 258             rankmap.push_back({recvbuf[2 * j + 1], j});
 259           }
 260         }
 261         /* Add self in the group */
 262         recvbuf[2 * i] = MPI_UNDEFINED;
 263         rankmap.push_back({recvbuf[2 * i + 1], i});
 264         std::sort(begin(rankmap), end(rankmap));
 265         group_out = new Group(rankmap.size());
 266         if (i == 0) {
 267           group_root = group_out; /* Save root's group */
 268         }
 269         for (unsigned j = 0; j < rankmap.size(); j++) {
 270           s4u::Actor* actor = group->actor(rankmap[j].second);
 271           group_out->set_mapping(actor, j);
 272         }
 273         MPI_Request* requests = xbt_new(MPI_Request, rankmap.size());
 274         int reqs              = 0;
 275         for (auto const& rank : rankmap) {
 276           if (rank.second != 0) {
 277             group_snd[reqs]=new  Group(group_out);
 278             requests[reqs] = Request::isend(&(group_snd[reqs]), 1, MPI_PTR, rank.second, system_tag, this);
 279             reqs++;
 280           }
 281         }
 282         if(i != 0 && group_out != MPI_COMM_WORLD->group() && group_out != MPI_GROUP_EMPTY)
 283           Group::unref(group_out);
 284
 285         Request::waitall(reqs, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 286         xbt_free(requests);
 287       }
 288     }
 289     xbt_free(recvbuf);
 290     xbt_free(group_snd);
 291     group_out = group_root; /* exit with root's group */
 292   } else {
 293     if(color != MPI_UNDEFINED) {
 294       Request::recv(&group_out, 1, MPI_PTR, 0, system_tag, this, MPI_STATUS_IGNORE);
 295     } /* otherwise, exit with group_out == nullptr */
 296   }
 297   return group_out!=nullptr ? new  Comm(group_out, nullptr) : MPI_COMM_NULL;
 298 }
 299
 300 void Comm::ref(){
 301   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 302     smpi_process()->comm_world()->ref();
 303     return;
 304   }
 305   group_->ref();
 306   refcount_++;
 307 }
 308
 309 void Comm::cleanup_smp(){
 310   if (intra_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 311     Comm::unref(intra_comm_);
 312   if (leaders_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 313     Comm::unref(leaders_comm_);
 314   xbt_free(non_uniform_map_);
 315   delete[] leaders_map_;
 316 }
 317
 318 void Comm::unref(Comm* comm){
 319   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 320     Comm::unref(smpi_process()->comm_world());
 321     return;
 322   }
 323   comm->refcount_--;
 324   Group::unref(comm->group_);
 325
 326   if(comm->refcount_==0){
 327     comm->cleanup_smp();
 328     comm->cleanup_attr<Comm>();
 329     if (comm->info_ != MPI_INFO_NULL)
 330       simgrid::smpi::Info::unref(comm->info_);
 331     if (comm->errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 332       simgrid::smpi::Errhandler::unref(comm->errhandler_);
 333     delete comm->topo_; // there's no use count on topos
 334     delete comm;
 335   }
 336 }
 337
 338 MPI_Comm Comm::find_intra_comm(int * leader){
 339   //get the indices of all processes sharing the same simix host
 340   auto& actor_list        = sg_host_self()->pimpl_->actor_list_;
 341   int intra_comm_size     = 0;
 342   int min_index           = INT_MAX; // the minimum index will be the leader
 343   for (auto& actor : actor_list) {
 344     int index = actor.get_pid();
 345     if (this->group()->rank(actor.ciface()) != MPI_UNDEFINED) { // Is this process in the current group?
 346       intra_comm_size++;
 347       if (index < min_index)
 348         min_index = index;
 349     }
 350   }
 351   XBT_DEBUG("number of processes deployed on my node : %d", intra_comm_size);
 352   MPI_Group group_intra = new  Group(intra_comm_size);
 353   int i = 0;
 354   for (auto& actor : actor_list) {
 355     if (this->group()->rank(actor.ciface()) != MPI_UNDEFINED) {
 356       group_intra->set_mapping(actor.ciface(), i);
 357       i++;
 358     }
 359   }
 360   *leader=min_index;
 361   return new  Comm(group_intra, nullptr, 1);
 362 }
 363
 364 void Comm::init_smp(){
 365   int leader = -1;
 366   int i = 0;
 367   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 368     smpi_process()->comm_world()->init_smp();
 369
 370   int comm_size = this->size();
 371
 372   // If we are in replay - perform an ugly hack
 373   // tell SimGrid we are not in replay for a while, because we need the buffers to be copied for the following calls
 374   bool replaying = false; //cache data to set it back again after
 375   if(smpi_process()->replaying()){
 376     replaying = true;
 377     smpi_process()->set_replaying(false);
 378   }
 379
 380   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 381     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 382     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 383   }
 384   // identify neighbors in comm
 385   MPI_Comm comm_intra = find_intra_comm(&leader);
 386
 387
 388   int* leaders_map = new int[comm_size];
 389   int* leader_list = new int[comm_size];
 390   std::fill_n(leaders_map, comm_size, 0);
 391   std::fill_n(leader_list, comm_size, -1);
 392
 393   allgather__ring(&leader, 1, MPI_INT , leaders_map, 1, MPI_INT, this);
 394
 395   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 396     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 397     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 398   }
 399
 400   if(leaders_map_==nullptr){
 401     leaders_map_= leaders_map;
 402   }else{
 403     delete[] leaders_map;
 404   }
 405   int leader_group_size = 0;
 406   for(i=0; i<comm_size; i++){
 407     int already_done = 0;
 408     for (int j = 0; j < leader_group_size; j++) {
 409       if (leaders_map_[i] == leader_list[j]) {
 410         already_done = 1;
 411       }
 412     }
 413     if (already_done == 0) {
 414       leader_list[leader_group_size] = leaders_map_[i];
 415       leader_group_size++;
 416     }
 417   }
 418   xbt_assert(leader_group_size > 0);
 419   std::sort(leader_list, leader_list + leader_group_size);
 420
 421   MPI_Group leaders_group = new  Group(leader_group_size);
 422
 423   MPI_Comm leader_comm = MPI_COMM_NULL;
 424   if(MPI_COMM_WORLD!=MPI_COMM_UNINITIALIZED && this!=MPI_COMM_WORLD){
 425     //create leader_communicator
 426     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 427       leaders_group->set_mapping(s4u::Actor::by_pid(leader_list[i]).get(), i);
 428     leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr,1);
 429     this->set_leaders_comm(leader_comm);
 430     this->set_intra_comm(comm_intra);
 431
 432     // create intracommunicator
 433   }else{
 434     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 435       leaders_group->set_mapping(s4u::Actor::by_pid(leader_list[i]).get(), i);
 436
 437     if(this->get_leaders_comm()==MPI_COMM_NULL){
 438       leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr,1);
 439       this->set_leaders_comm(leader_comm);
 440     }else{
 441       leader_comm=this->get_leaders_comm();
 442       Group::unref(leaders_group);
 443     }
 444     smpi_process()->set_comm_intra(comm_intra);
 445   }
 446
 447   // Are the nodes uniform ? = same number of process/node
 448   int my_local_size=comm_intra->size();
 449   if(comm_intra->rank()==0) {
 450     int is_uniform       = 1;
 451     int* non_uniform_map = xbt_new0(int,leader_group_size);
 452     allgather__ring(&my_local_size, 1, MPI_INT,
 453         non_uniform_map, 1, MPI_INT, leader_comm);
 454     for(i=0; i < leader_group_size; i++) {
 455       if(non_uniform_map[0] != non_uniform_map[i]) {
 456         is_uniform = 0;
 457         break;
 458       }
 459     }
 460     if(is_uniform==0 && this->is_uniform()!=0){
 461       non_uniform_map_ = non_uniform_map;
 462     }else{
 463       xbt_free(non_uniform_map);
 464     }
 465     is_uniform_=is_uniform;
 466   }
 467   bcast__scatter_LR_allgather(&(is_uniform_),1, MPI_INT, 0, comm_intra );
 468
 469   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 470     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 471     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 472   }
 473   // Are the ranks blocked ? = allocated contiguously on the SMP nodes
 474   int is_blocked=1;
 475   int prev=this->group()->rank(comm_intra->group()->actor(0));
 476   for (i = 1; i < my_local_size; i++) {
 477     int that = this->group()->rank(comm_intra->group()->actor(i));
 478     if (that != prev + 1) {
 479       is_blocked = 0;
 480       break;
 481     }
 482     prev = that;
 483   }
 484
 485   int global_blocked;
 486   allreduce__default(&is_blocked, &(global_blocked), 1, MPI_INT, MPI_LAND, this);
 487
 488   if(MPI_COMM_WORLD==MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD){
 489     if(this->rank()==0){
 490       is_blocked_ = global_blocked;
 491     }
 492   }else{
 493     is_blocked_=global_blocked;
 494   }
 495   delete[] leader_list;
 496
 497   if(replaying)
 498     smpi_process()->set_replaying(true);
 499 }
 500
 501 MPI_Comm Comm::f2c(int id) {
 502   if(id == -2) {
 503     return MPI_COMM_SELF;
 504   } else if(id==0){
 505     return MPI_COMM_WORLD;
 506   } else if(F2C::f2c_lookup() != nullptr && id >= 0) {
 507     char key[KEY_SIZE];
 508     const auto& lookup = F2C::f2c_lookup();
 509     auto comm          = lookup->find(get_key(key, id));
 510     return comm == lookup->end() ? MPI_COMM_NULL : static_cast<MPI_Comm>(comm->second);
 511   } else {
 512     return MPI_COMM_NULL;
 513   }
 514 }
 515
 516 void Comm::free_f(int id) {
 517   char key[KEY_SIZE];
 518   F2C::f2c_lookup()->erase(get_key(key, id));
 519 }
 520
 521 void Comm::add_rma_win(MPI_Win win){
 522   rma_wins_.push_back(win);
 523 }
 524
 525 void Comm::remove_rma_win(MPI_Win win){
 526   rma_wins_.remove(win);
 527 }
 528
 529 void Comm::finish_rma_calls(){
 530   for (auto const& it : rma_wins_) {
 531     if(it->rank()==this->rank()){//is it ours (for MPI_COMM_WORLD)?
 532       int finished = it->finish_comms();
 533       XBT_DEBUG("Barrier for rank %d - Finished %d RMA calls",this->rank(), finished);
 534     }
 535   }
 536 }
 537
 538 MPI_Info Comm::info()
 539 {
 540   if (info_ == MPI_INFO_NULL)
 541     info_ = new Info();
 542   info_->ref();
 543   return info_;
 544 }
 545
 546 void Comm::set_info(MPI_Info info)
 547 {
 548   if (info_ != MPI_INFO_NULL)
 549     simgrid::smpi::Info::unref(info);
 550   info_ = info;
 551   if (info_ != MPI_INFO_NULL)
 552     info->ref();
 553 }
 554
 555 MPI_Errhandler Comm::errhandler()
 556 {
 557   if (errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 558     errhandler_->ref();
 559   return errhandler_;
 560 }
 561
 562 void Comm::set_errhandler(MPI_Errhandler errhandler)
 563 {
 564   if (errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 565     simgrid::smpi::Errhandler::unref(errhandler_);
 566   errhandler_ = errhandler;
 567   if (errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 568     errhandler_->ref();
 569 }
 570
 571 MPI_Comm Comm::split_type(int type, int /*key*/, MPI_Info)
 572 {
 573   //MPI_UNDEFINED can be given to some nodes... but we need them to still perform the smp part which is collective
 574   if(type != MPI_COMM_TYPE_SHARED && type != MPI_UNDEFINED){
 575     return MPI_COMM_NULL;
 576   }
 577   int leader=0;
 578   MPI_Comm res= this->find_intra_comm(&leader);
 579   if(type != MPI_UNDEFINED)
 580     return res;
 581   else{
 582     xbt_assert(res->refcount_ == 1); // ensure the next call to Comm::destroy really frees the comm
 583     Comm::destroy(res);
 584     return MPI_COMM_NULL;
 585   }
 586 }
 587
 588 } // namespace smpi
 589 } // namespace simgrid