]> AND Private Git Repository - chloroplast13.git/blob - population_Table.tex
Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Private GIT Repository
modification section 2
[chloroplast13.git] / population_Table.tex
1 \begin{center}  
2   
3   \begin{table}
4     \tiny
5     \caption[NCBI Genomes Families]{List of family groups of Chloroplast Genomes from NCBI\label{Tab2}}
6     \begin{minipage}{0.50\textwidth}
7       \setlength{\tabcolsep}{4pt}
8       \begin{tabular}{|p{0.1cm}|p{0.1cm}|p{1.3cm}|p{3cm}|}
9       \hline
10       {{F.}}&{{\#}} & {{Acc. No}} & {{Scientific Name}} \\ 
11       \hline
12         %Entering First line
13       \parbox[t]{1mm}{\multirow{11}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Brown Algae}}} &\multirow{11}{*}{11}  & NC\_001713.1 & Odontella sinensis \\ 
14       & & NC\_008588.1 & Phaeodactylum tricornutum \\ 
15       & & NC\_010772.1 & Heterosigma akashiwo \\ 
16       & & NC\_011600.1 & Vaucheria litorea \\ 
17       & & NC\_012903.1 & Aureoumbra lagunensis \\ 
18       &  & NC\_014808.1 & Thalassiosira oceanica \\ 
19       & & NC\_015403.1 & Fistulifera sp \\ 
20       & & NC\_016731.1 & Synedra acus \\ 
21       & & NC\_016735.1 & Fucus vesiculosus \\ 
22       & & NC\_018523.1 & Saccharina japonica \\ 
23       & & NC\_020014.1 & Nannochloropsis gadtina \\ 
24       \hline
25       % Entering second group
26       \parbox[t]{1mm}{\multirow{3}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F1}}} &
27       \multirow{3}{*}{3} & NC\_000925.1 & Porphyra purpurea \\ 
28        &  & NC\_001840.1 & Cyanidium caldarium \\ 
29       & & NC\_006137.1 & Gracilaria tenuistipitata \\ 
30       \hline
31       % Entering third group
32       \parbox[t]{1mm}{\multirow{17}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Green Algae}}} &
33       \multirow{17}{*}{17} & NC\_000927.1 & Nephroselmis olivacea \\ 
34       & & NC\_002186.1 & Mesotigma viride \\ 
35       & & NC\_005353.1 & Chlamydomonas reinhardtii \\ 
36       & & NC\_008097.1 & Chara vulgaris \\ 
37       & & NC\_008099.1 & Oltmannsiellopsis viridis \\ 
38       & & NC\_008114.1 & Pseudoclonium akinetum \\ 
39       & & NC\_008289.1 & Ostreococcus tauri \\ 
40       & & NC\_008372.1 & Stigeoclonium helveticum \\ 
41       & & NC\_008822.1 & Chlorokybus atmophyticus \\ 
42       & & NC\_011031.1 & Oedogonium cardiacum \\ 
43       & & NC\_012097.1 & Pycnococcus provaseolii \\ 
44       & & NC\_012099.1 & Pyramimonas parkeae \\ 
45       & & NC\_012568.1 & Micromonas pusilla \\ 
46       & & NC\_014346.1 & Floydiella terrestris \\ 
47       & & NC\_015645.1 & Schizomeris leibleinii \\ 
48       & & NC\_016732.1 & Dunaliella salina \\ 
49       & & NC\_016733.1 & Pedinomonas minor \\ % 
50       \hline
51       % Entering fourth group
52       \parbox[t]{1mm}{\multirow{3}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F2}}} &
53       \multirow{3}{*}{3} & NC\_001319.1 & Marchantia polymorpha \\ 
54        &  & NC\_004543.1 & Anthoceros formosae \\ 
55       & & NC\_005087.1 & Physcomitrella patens \\ %
56       \hline
57       % Entering fifth group
58       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F3}}} &
59       \multirow{2}{*}{2} & NC\_014267.1 & Kryptoperidinium foliaceum \\ 
60       & 
61       & NC\_014287.1 & Durinskia baltica \\ 
62       \hline
63
64       % Entering sixth group
65       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F4}}}     &
66       \multirow{2}{*}{2} & NC\_001603.2 & Euglena gracilis \\ 
67       &  & NC\_020018.1 & Monomorphina aenigmatica \\ 
68        \hline
69        % Entering seventh group
70        \parbox[t]{1mm}{\multirow{5}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Fern}}}     &       \multirow{5}{*}{5}
71        & NC\_003386.1 & Psilotum nudum \\ 
72       & & NC\_008829.1 & Angiopteris evecta \\
73       &  & NC\_014348.1 & Pteridium aquilinum \\ 
74       & & NC\_014699.1 & Equisetum arvense \\ 
75       & & NC\_017006.1 & Mankyua chejuensis \\ 
76       \hline
77     % Entering tenth group
78        & & & \\
79       \parbox[t]{1mm}{\multirow{1}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F5}}}
80  & 1 & NC\_007288.1 & Emiliana huxleyi\\
81        & & & \\
82  \hline
83       % Entering eleventh group
84       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F6}}}
85        & \multirow{2}{*}{2} & NC\_014675.1 & Isoetes flaccida \\
86       & & NC\_006861.1 & Huperzia lucidula \\
87       \hline
88  
89
90     \end{tabular}
91   \end{minipage}    
92   \begin{minipage}{0.45\textwidth}
93    \begin{tabular}{|p{0.1cm}|p{0.1cm}|p{1.2cm}|p{2.7cm}|}
94       \hline
95       {{F.}}&{{\#}} & {{Acc. No}} & {{Scientific Name}} \\ 
96       \hline
97
98       % Entering eighth group
99       \parbox[t]{1mm}{\multirow{45}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Angiosperms}}}  
100       & 
101       \multirow{45}{*}{45} & NC\_007898.3 & Solanum lyopersicum \\
102       & & NC\_001568.1 & Epifagus virginiana \\ 
103       & & NC\_001666.2 & Zea Mays \\ 
104       & & NC\_005086.1 & Amborella trichopoda \\ 
105       & & NC\_006050.1 & Nymphaea alba \\ 
106       & & NC\_006290.1 & Panax ginseng \\ 
107       & & NC\_007578.1 & Lactuca sativa \\ 
108       & & NC\_007957.1 & vitis vinifera \\ 
109       & & NC\_007977.1 & Helianthus annuus \\ 
110       & & NC\_008325.1 & Daucus carota \\ 
111       & & NC\_008336.1 & Nandina domestica \\ 
112       & & NC\_008359.1 & Morus indica \\ 
113       & & NC\_008407.1 & Jasminum nudiflorum \\ 
114       & & NC\_008456.1 & Drimys granadensis \\ 
115       & & NC\_008457.1 & Piper cenocladum \\ 
116       & & NC\_009601.1 & Dioscorea elephantipes \\ 
117       & & NC\_009765.1 & Cuscuta gronovii \\ 
118       & & NC\_009808.1 & Ipomea purpurea \\ 
119       & & NC\_010361.1 & Oenothera biennis \\ 
120       & & NC\_010433.1 & Manihot esculenta \\ 
121       & & NC\_010442.1 & Trachelium caeruleum \\ 
122       & & NC\_013707.2 & Olea europea \\ 
123       & & NC\_013823.1 & Typha latifolia \\ 
124       & & NC\_014570.1 & Eucalyptus \\ 
125       & & NC\_014674.1 & Castanea mollissima \\ 
126       & & NC\_014676.2 & Theobroma cacao \\ 
127       & & NC\_015830.1 & Bambusa emeiensis \\ 
128       & & NC\_015899.1 & Wolffia australiana \\ 
129       & & NC\_016433.2 & Sesamum indicum \\ 
130       & & NC\_016468.1 & Boea hygrometrica \\ 
131       & & NC\_016670.1 & Gossypium darwinii \\ 
132       & & NC\_016727.1 & Silene vulgaris \\ 
133       & & NC\_016734.1 & Brassica napus \\ 
134       & & NC\_016736.1 & Ricinus communis \\ 
135       & & NC\_016753.1 & Colocasia esculenta \\ 
136       & & NC\_017609.1 & Phalaenopsis equestris \\ 
137       & & NC\_018357.1 & Magnolia denudata \\ 
138       & & NC\_019601.1 & Fragaria chiloensis \\ 
139       & & NC\_008796.1 & Ranunculus macranthus \\ 
140       & & NC\_013991.2 & Phoenix dactylifera \\ 
141       & & NC\_016068.1 & Nicotiana undulata \\ 
142       \hline
143       % Entering ninth group
144       \parbox[t]{1mm}{\multirow{7}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Gymnosperms}}}
145       & 
146       \multirow{7}{*}{7}& NC\_009618.1 & Cycas taitungensis \\ 
147       & & NC\_011942.1 & Gnetum parvifolium \\ 
148       & & NC\_016058.1 & Larix decidua \\ 
149       & & NC\_016063.1 & Cephalotaxus wilsoniana \\ 
150       & & NC\_016065.1 & Taiwania cryptomerioides \\ 
151       & & NC\_016069.1 & Picea morrisonicola \\ 
152       & & NC\_016986.1 & Gingko biloba \\ 
153       \hline
154      \end{tabular}
155   \end{minipage}
156  
157   \scriptsize 
158   \noindent where families F1, F2, F3, F4, F5, and F6 are 
159   Red Algae,
160   Brypoytes, 
161   Dinoflagellates,
162   Euglena,
163   Haptophytes, and Lycopodiophyta respectively.
164   \normalsize
165   \end{table}
166 \end{center}  
167