]> AND Private Git Repository - chloroplast13.git/blob - Paper2/population_Table.tex
Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Private GIT Repository
adding the directory of paper2
[chloroplast13.git] / Paper2 / population_Table.tex
1   \begin{table}
2     \tiny
3     \caption[NCBI Genomes Families]{List of chloroplast genomes of photosynthetic Eucaryotes lineages from NCBI\label{Tab2}}
4     \begin{minipage}{0.50\textwidth}
5       \setlength{\tabcolsep}{4pt}
6       \begin{tabular}{|p{0.1cm}|p{0.2cm}|p{1.35cm}|p{2.65cm}|}
7       \hline
8       {{F.}}&{{\#}} & {{Acc. No}} & {{Scientific Name}} \\ 
9       \hline
10         %Entering First line
11       \parbox[t]{1mm}{\multirow{11}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Brown Algae}}} &\multirow{11}{*}{11}  & NC\_001713.1 & \textit{Odontella sinensis} \\ 
12       & & NC\_008588.1 & \textit{Phaeodactylum tricornutum} \\ 
13       & & NC\_010772.1 & \textit{Heterosigma akashiwo} \\ 
14       & & NC\_011600.1 & \textit{Vaucheria litorea} \\ 
15       & & NC\_012903.1 & \textit{Aureoumbra lagunensis} \\ 
16       &  & NC\_014808.1 & \textit{Thalassiosira oceanica} \\ 
17       & & NC\_015403.1 & \textit{Fistulifera sp} \\ 
18       & & NC\_016731.1 & \textit{Synedra acus} \\ 
19       & & NC\_016735.1 & \textit{Fucus vesiculosus} \\ 
20       & & NC\_018523.1 & \textit{Saccharina japonica} \\ 
21       & & NC\_020014.1 & \textit{Nannochloropsis gadtina} \\ 
22       \hline
23       % Entering second group
24       \parbox[t]{1mm}{\multirow{3}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F1}}} &
25       \multirow{3}{*}{3} & NC\_000925.1 & \textit{Porphyra purpurea} \\ 
26        &  & NC\_001840.1 & \textit{Cyanidium caldarium} \\ 
27       & & NC\_006137.1 & \textit{Gracilaria tenuistipitata} \\ 
28       \hline
29       % Entering third group
30       \parbox[t]{1mm}{\multirow{17}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Green Algae}}} &
31       \multirow{17}{*}{17} & NC\_000927.1 & \textit{Nephroselmis olivacea} \\ 
32       & & NC\_002186.1 & \textit{Mesotigma viride} \\ 
33       & & NC\_005353.1 & \textit{Chlamydomonas reinhardtii} \\ 
34       & & NC\_008097.1 & \textit{Chara vulgaris} \\ 
35       & & NC\_008099.1 & \textit{Oltmannsiellopsis viridis} \\ 
36       & & NC\_008114.1 & \textit{Pseudoclonium akinetum} \\ 
37       & & NC\_008289.1 & \textit{Ostreococcus tauri} \\ 
38       & & NC\_008372.1 & \textit{Stigeoclonium helveticum} \\ 
39       & & NC\_008822.1 & \textit{Chlorokybus atmophyticus} \\ 
40       & & NC\_011031.1 & \textit{Oedogonium cardiacum} \\ 
41       & & NC\_012097.1 & \textit{Pycnococcus provaseolii} \\ 
42       & & NC\_012099.1 & \textit{Pyramimonas parkeae} \\ 
43       & & NC\_012568.1 & \textit{Micromonas pusilla} \\ 
44       & & NC\_014346.1 & \textit{Floydiella terrestris} \\ 
45       & & NC\_015645.1 & \textit{Schizomeris leibleinii} \\ 
46       & & NC\_016732.1 & \textit{Dunaliella salina} \\ 
47       & & NC\_016733.1 & \textit{Pedinomonas minor} \\ % 
48       \hline
49       % Entering fourth group
50       \parbox[t]{1mm}{\multirow{3}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F2}}} &
51       \multirow{3}{*}{3} & NC\_001319.1 & \textit{Marchantia polymorpha} \\ 
52        &  & NC\_004543.1 & \textit{Anthoceros formosae} \\ 
53       & & NC\_005087.1 & \textit{Physcomitrella patens} \\ %
54       \hline
55       % Entering fifth group
56       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F3}}} &
57       \multirow{2}{*}{2} & NC\_014267.1 & \textit{Kryptoperidinium foliaceum} \\ 
58       & 
59       & NC\_014287.1 & \textit{Durinskia baltica} \\ 
60       \hline
61
62       % Entering sixth group
63       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F4}}}     &
64       \multirow{2}{*}{2} & NC\_001603.2 & \textit{Euglena gracilis} \\ 
65       &  & NC\_020018.1 & \textit{Monomorphina aenigmatica} \\ 
66        \hline
67        % Entering seventh group
68        \parbox[t]{1mm}{\multirow{5}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Ferns}}}     &       \multirow{5}{*}{5}
69        & NC\_003386.1 & \textit{Psilotum nudum} \\ 
70       & & NC\_008829.1 & \textit{Angiopteris evecta} \\
71       &  & NC\_014348.1 & \textit{Pteridium aquilinum} \\ 
72       & & NC\_014699.1 & \textit{Equisetum arvense} \\ 
73       & & NC\_017006.1 & \textit{Mankyua chejuensis} \\ 
74       \hline
75     % Entering tenth group
76        & & & \\
77       \parbox[t]{1mm}{\multirow{1}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F5}}}
78  & 1 & NC\_007288.1 & \textit{Emiliana huxleyi}\\
79        & & & \\
80  \hline
81       % Entering eleventh group
82       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F6}}}
83        & \multirow{2}{*}{2} & NC\_014675.1 & \textit{Isoetes flaccida} \\
84       & & NC\_006861.1 & \textit{Huperzia lucidula} \\
85       \hline
86     \end{tabular}
87   \end{minipage}    
88   \begin{minipage}{0.60\textwidth}
89    \setlength{\tabcolsep}{4pt}
90    \begin{tabular}{|p{0.2cm}|p{0.2cm}|p{1.45cm}|p{2.4cm}|}
91       \hline
92       {{F.}}&{{\#}} & {{Acc. No}} & {{Scientific Name}} \\ 
93       \hline
94
95       % Entering eighth group
96       \parbox[t]{1mm}{\multirow{45}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Angiosperms}}}  
97       & 
98       \multirow{45}{*}{45} & NC\_007898.3 & \textit{Solanum lyopersicum} \\
99       & & NC\_001568.1 & \textit{Epifagus virginiana} \\ 
100       & & NC\_001666.2 & \textit{Zea Mays} \\ 
101       & & NC\_005086.1 & \textit{Amborella trichopoda} \\ 
102       & & NC\_006050.1 & \textit{Nymphaea alba} \\ 
103       & & NC\_006290.1 & \textit{Panax ginseng} \\ 
104       & & NC\_007578.1 & \textit{Lactuca sativa} \\ 
105       & & NC\_007957.1 & \textit{Vitis vinifera} \\ 
106       & & NC\_007977.1 & \textit{Helianthus annuus} \\ 
107       & & NC\_008325.1 & \textit{Daucus carota} \\ 
108       & & NC\_008336.1 & \textit{Nandina domestica} \\ 
109       & & NC\_008359.1 & \textit{Morus indica} \\ 
110       & & NC\_008407.1 & \textit{Jasminum nudiflorum} \\ 
111       & & NC\_008456.1 & \textit{Drimys granadensis} \\ 
112       & & NC\_008457.1 & \textit{Piper cenocladum} \\ 
113       & & NC\_009601.1 & \textit{Dioscorea elephantipes} \\ 
114       & & NC\_009765.1 & \textit{Cuscuta gronovii} \\ 
115       & & NC\_009808.1 & \textit{Ipomea purpurea} \\ 
116       & & NC\_010361.1 & \textit{Oenothera biennis} \\ 
117       & & NC\_010433.1 & \textit{Manihot esculenta} \\ 
118       & & NC\_010442.1 & \textit{Trachelium caeruleum} \\ 
119       & & NC\_013707.2 & \textit{Olea europea} \\ 
120       & & NC\_013823.1 & \textit{Typha latifolia} \\ 
121       & & NC\_014570.1 & \textit{Eucalyptus} \\ 
122       & & NC\_014674.1 & \textit{Castanea mollissima} \\ 
123       & & NC\_014676.2 & \textit{Theobroma cacao} \\ 
124       & & NC\_015830.1 & \textit{Bambusa emeiensis} \\ 
125       & & NC\_015899.1 & \textit{Wolffia australiana} \\ 
126       & & NC\_016433.2 & \textit{Sesamum indicum} \\ 
127       & & NC\_016468.1 & \textit{Boea hygrometrica} \\ 
128       & & NC\_016670.1 & \textit{Gossypium darwinii} \\ 
129       & & NC\_016727.1 & \textit{Silene vulgaris} \\ 
130       & & NC\_016734.1 & \textit{Brassica napus} \\ 
131       & & NC\_016736.1 & \textit{Ricinus communis} \\ 
132       & & NC\_016753.1 & \textit{Colocasia esculenta} \\ 
133       & & NC\_017609.1 & \textit{Phalaenopsis equestris} \\ 
134       & & NC\_018357.1 & \textit{Magnolia denudata} \\ 
135       & & NC\_019601.1 & \textit{Fragaria chiloensis} \\ 
136       & & NC\_008796.1 & \textit{Ranunculus macranthus} \\ 
137       & & NC\_013991.2 & \textit{Phoenix dactylifera} \\ 
138       & & NC\_016068.1 & \textit{Nicotiana undulata} \\ 
139       \hline
140       % Entering ninth group
141       \parbox[t]{1mm}{\multirow{7}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Gymnosperms}}}
142       & 
143       \multirow{7}{*}{7}& NC\_009618.1 & \textit{Cycas taitungensis} \\ 
144       & & NC\_011942.1 & \textit{Gnetum parvifolium} \\ 
145       & & NC\_016058.1 & \textit{Larix decidua} \\ 
146       & & NC\_016063.1 & \textit{Cephalotaxus wilsoniana} \\ 
147       & & NC\_016065.1 & \textit{Taiwania cryptomerioides} \\ 
148       & & NC\_016069.1 & \textit{Picea morrisonicola} \\ 
149       & & NC\_016986.1 & \textit{Gingko biloba} \\ 
150       \hline
151      \end{tabular}
152   \end{minipage}
153  
154   \scriptsize 
155   \noindent where lineages F1, F2, F3, F4, F5, and F6 are 
156   \textit{Red Algae},
157   \textit{Bryophytes}, 
158   \textit{Dinoflagellates},
159   \textit{Euglena},
160   \textit{Haptophytes}, and \textit{Lycophytes} respectively.
161   \normalsize
162   \end{table}
163