]> AND Private Git Repository - chloroplast13.git/blob - population_Table.tex
Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Private GIT Repository
6a65f007e17de906f9198be3192acecfbb20b99f
[chloroplast13.git] / population_Table.tex
1 \begin{center}  
2   \begin{table}
3     \tiny
4     \caption[NCBI Genomes Families]{List of family groups of Chloroplast Genomes from NCBI\label{Tab2}}
5     \begin{minipage}{0.50\textwidth}
6       \setlength{\tabcolsep}{4pt}
7       \begin{tabular}{|p{0.1cm}|p{0.1cm}|p{1.3cm}|p{3cm}|}
8       \hline
9       {{F.}}&{{\#}} & {{Acc. No}} & {{Scientific Name}} \\ 
10       \hline
11         %Entering First line
12       \parbox[t]{1mm}{\multirow{11}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Brown Algae}}} &\multirow{11}{*}{11}  & NC\_001713.1 & Odontella sinensis \\ 
13       & & NC\_008588.1 & Phaeodactylum tricornutum \\ 
14       & & NC\_010772.1 & Heterosigma akashiwo \\ 
15       & & NC\_011600.1 & Vaucheria litorea \\ 
16       & & NC\_012903.1 & Aureoumbra lagunensis \\ 
17       &  & NC\_014808.1 & Thalassiosira oceanica \\ 
18       & & NC\_015403.1 & Fistulifera sp \\ 
19       & & NC\_016731.1 & Synedra acus \\ 
20       & & NC\_016735.1 & Fucus vesiculosus \\ 
21       & & NC\_018523.1 & Saccharina japonica \\ 
22       & & NC\_020014.1 & Nannochloropsis gadtina \\ 
23       \hline
24       % Entering second group
25       \parbox[t]{1mm}{\multirow{3}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F1}}} &
26       \multirow{3}{*}{3} & NC\_000925.1 & Porphyra purpurea \\ 
27        &  & NC\_001840.1 & Cyanidium caldarium \\ 
28       & & NC\_006137.1 & Gracilaria tenuistipitata \\ 
29       \hline
30       % Entering third group
31       \parbox[t]{1mm}{\multirow{17}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Green Algae}}} &
32       \multirow{17}{*}{17} & NC\_000927.1 & Nephroselmis olivacea \\ 
33       & & NC\_002186.1 & Mesotigma viride \\ 
34       & & NC\_005353.1 & Chlamydomonas reinhardtii \\ 
35       & & NC\_008097.1 & Chara vulgaris \\ 
36       & & NC\_008099.1 & Oltmannsiellopsis viridis \\ 
37       & & NC\_008114.1 & Pseudoclonium akinetum \\ 
38       & & NC\_008289.1 & Ostreococcus tauri \\ 
39       & & NC\_008372.1 & Stigeoclonium helveticum \\ 
40       & & NC\_008822.1 & Chlorokybus atmophyticus \\ 
41       & & NC\_011031.1 & Oedogonium cardiacum \\ 
42       & & NC\_012097.1 & Pycnococcus provaseolii \\ 
43       & & NC\_012099.1 & Pyramimonas parkeae \\ 
44       & & NC\_012568.1 & Micromonas pusilla \\ 
45       & & NC\_014346.1 & Floydiella terrestris \\ 
46       & & NC\_015645.1 & Schizomeris leibleinii \\ 
47       & & NC\_016732.1 & Dunaliella salina \\ 
48       & & NC\_016733.1 & Pedinomonas minor \\ % 
49       \hline
50       % Entering fourth group
51       \parbox[t]{1mm}{\multirow{3}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F2}}} &
52       \multirow{3}{*}{3} & NC\_001319.1 & Marchantia polymorpha \\ 
53        &  & NC\_004543.1 & Anthoceros formosae \\ 
54       & & NC\_005087.1 & Physcomitrella patens \\ %
55       \hline
56       % Entering fifth group
57       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F3}}} &
58       \multirow{2}{*}{2} & NC\_014267.1 & Kryptoperidinium foliaceum \\ 
59       & 
60       & NC\_014287.1 & Durinskia baltica \\ 
61       \hline
62
63       % Entering sixth group
64       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F4}}}     &
65       \multirow{2}{*}{2} & NC\_001603.2 & Euglena gracilis \\ 
66       &  & NC\_020018.1 & Monomorphina aenigmatica \\ 
67        \hline
68        % Entering seventh group
69        \parbox[t]{1mm}{\multirow{5}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Fern}}}     &       \multirow{5}{*}{5}
70        & NC\_003386.1 & Psilotum nudum \\ 
71       & & NC\_008829.1 & Angiopteris evecta \\
72       &  & NC\_014348.1 & Pteridium aquilinum \\ 
73       & & NC\_014699.1 & Equisetum arvense \\ 
74       & & NC\_017006.1 & Mankyua chejuensis \\ 
75       \hline
76     % Entering tenth group
77        & & & \\
78       \parbox[t]{1mm}{\multirow{1}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F5}}}
79  & 1 & NC\_007288.1 & Emiliana huxleyi\\
80        & & & \\
81  \hline
82       % Entering eleventh group
83       \parbox[t]{1mm}{\multirow{2}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{F6}}}
84        & \multirow{2}{*}{2} & NC\_014675.1 & Isoetes flaccida \\
85       & & NC\_006861.1 & Huperzia lucidula \\
86       \hline
87  
88
89     \end{tabular}
90   \end{minipage}    
91   \begin{minipage}{0.45\textwidth}
92    \begin{tabular}{|p{0.1cm}|p{0.1cm}|p{1.2cm}|p{2.7cm}|}
93       \hline
94       {{F.}}&{{\#}} & {{Acc. No}} & {{Scientific Name}} \\ 
95       \hline
96
97       % Entering eighth group
98       \parbox[t]{1mm}{\multirow{45}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Angiosperms}}}  
99       & 
100       \multirow{45}{*}{45} & NC\_007898.3 & Solanum lyopersicum \\
101       & & NC\_001568.1 & Epifagus virginiana \\ 
102       & & NC\_001666.2 & Zea Mays \\ 
103       & & NC\_005086.1 & Amborella trichopoda \\ 
104       & & NC\_006050.1 & Nymphaea alba \\ 
105       & & NC\_006290.1 & Panax ginseng \\ 
106       & & NC\_007578.1 & Lactuca sativa \\ 
107       & & NC\_007957.1 & vitis vinifera \\ 
108       & & NC\_007977.1 & Helianthus annuus \\ 
109       & & NC\_008325.1 & Daucus carota \\ 
110       & & NC\_008336.1 & Nandina domestica \\ 
111       & & NC\_008359.1 & Morus indica \\ 
112       & & NC\_008407.1 & Jasminum nudiflorum \\ 
113       & & NC\_008456.1 & Drimys granadensis \\ 
114       & & NC\_008457.1 & Piper cenocladum \\ 
115       & & NC\_009601.1 & Dioscorea elephantipes \\ 
116       & & NC\_009765.1 & Cuscuta gronovii \\ 
117       & & NC\_009808.1 & Ipomea purpurea \\ 
118       & & NC\_010361.1 & Oenothera biennis \\ 
119       & & NC\_010433.1 & Manihot esculenta \\ 
120       & & NC\_010442.1 & Trachelium caeruleum \\ 
121       & & NC\_013707.2 & Olea europea \\ 
122       & & NC\_013823.1 & Typha latifolia \\ 
123       & & NC\_014570.1 & Eucalyptus \\ 
124       & & NC\_014674.1 & Castanea mollissima \\ 
125       & & NC\_014676.2 & Theobroma cacao \\ 
126       & & NC\_015830.1 & Bambusa emeiensis \\ 
127       & & NC\_015899.1 & Wolffia australiana \\ 
128       & & NC\_016433.2 & Sesamum indicum \\ 
129       & & NC\_016468.1 & Boea hygrometrica \\ 
130       & & NC\_016670.1 & Gossypium darwinii \\ 
131       & & NC\_016727.1 & Silene vulgaris \\ 
132       & & NC\_016734.1 & Brassica napus \\ 
133       & & NC\_016736.1 & Ricinus communis \\ 
134       & & NC\_016753.1 & Colocasia esculenta \\ 
135       & & NC\_017609.1 & Phalaenopsis equestris \\ 
136       & & NC\_018357.1 & Magnolia denudata \\ 
137       & & NC\_019601.1 & Fragaria chiloensis \\ 
138       & & NC\_008796.1 & Ranunculus macranthus \\ 
139       & & NC\_013991.2 & Phoenix dactylifera \\ 
140       & & NC\_016068.1 & Nicotiana undulata \\ 
141       \hline
142       % Entering ninth group
143       \parbox[t]{1mm}{\multirow{7}{*}{\rotatebox[origin=c]{90}{Gymnosperms}}}
144       & 
145       \multirow{7}{*}{7}& NC\_009618.1 & Cycas taitungensis \\ 
146       & & NC\_011942.1 & Gnetum parvifolium \\ 
147       & & NC\_016058.1 & Larix decidua \\ 
148       & & NC\_016063.1 & Cephalotaxus wilsoniana \\ 
149       & & NC\_016065.1 & Taiwania cryptomerioides \\ 
150       & & NC\_016069.1 & Picea morrisonicola \\ 
151       & & NC\_016986.1 & Gingko biloba \\ 
152       \hline
153      \end{tabular}
154   \end{minipage}
155  
156   \scriptsize 
157   \noindent where families F1, F2, F3, F4, F5, and F6 are 
158   Red Algae,
159   Brypoytes, 
160   Dinoflagellates,
161   Euglena,
162   Haptophytes, and Lycopodiophyta respectively.
163   \normalsize
164   \end{table}
165 \end{center}  
166