]> AND Private Git Repository - chloroplast13.git/commitdiff
Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Private GIT Repository
update version with discussion
authorbassam al-kindy <bassam.al-kindy@lifc>
Mon, 2 Dec 2013 15:36:25 +0000 (16:36 +0100)
committerbassam al-kindy <bassam.al-kindy@lifc>
Mon, 2 Dec 2013 15:36:25 +0000 (16:36 +0100)
intro.tex
main.tex

index a0a6050e2dc47323f60b3dd4da1ee366e98bece0..ddb2fcb6e91ff0a8e98e658dddfe76d0292d031a 100644 (file)
--- a/intro.tex
+++ b/intro.tex
@@ -4,4 +4,23 @@ build a genes  content evolutionary tree. More precisely,  we focus on
 the following  questions considering a  collection of 99~chloroplasts
 annotated from NCBI \cite{Sayers01012011} and Dogma \cite{RDogma}: how
 can  we identify the  best core  genome and  what is  the evolutionary
-scenario of these chloroplasts.
+scenario of these chloroplasts.\\
+Chloroplast (such as mitochondria) are fondamental key elements in 
+living organisms history. Indeed, chlorplast in Eucaryotes are organites responsible for 
+photosynthesis. Photosynthesis is the main way to produce organic matter 
+from mineral matter, using solar energy. Consequently photosynthetic 
+organisms are at the base of most ecosystems trophic chains and 
+photosynthesis in eucaryotes allowed a great speciation in the lineage 
+(to a great biodiversity). From an ecological point of view, 
+photosynthetic organisms are at the origin of the presence of dioxygen 
+in the atmosphere (allowing extant life) and are the main source of mid- 
+to long term carbon stockage (using atmospheric CO2, important in the 
+context of climate change). Chloroplast found in Eucaryots have an endosymbiotic origin, meaning 
+that they are a fusion of a photosynthetic bacteria (Cyanobacteria) and 
+a eucaryotic cell (enable to produce organic matter = heterotrophic). 
+This fusion or First Endiosymbiosis ended in a Great diversification of 
+a lineage comprising Red Algae, Green Algae and Land Plants (terrestrial).
+Several Second Enbiosymbioses occurred then: two involving a Red 
+Algae and other heterotrophic eucaryotes and giving birth to both Brown 
+Algae and Dinoflagellates lineages; another involving a Green Algae and 
+a heterotrophic eucaryot and giving birth to Euglens.
\ No newline at end of file
index 605134f9b6ecb936dc9d1950a028cdf660f5b9da..963d74dfb8831779f58f122a3d79b2dc8170cb35 100755 (executable)
--- a/main.tex
+++ b/main.tex
@@ -52,7 +52,8 @@ Universit\'{e} de Franche-Comt\'{e}, France \\
 
 % \section{Second Stage: to Find Closed Genomes}
 % \input{closedgenomes}
-
+\section{Discussion}
+\input{discussion.tex}
 \section{Conclusion}\label{sec:concl}
 
 \bibliographystyle{plain}