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modifs après christophe
[hdrcouchot.git] / demandeInscription / synthese.tex
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81
82 \begin{document}
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84
85 \title{Mémoire de synthèse des activités de recherche et d'encadrement}
86 \author{Jean-Fran\c{c}ois {\sc Couchot}}
87
88
89 %\lstset{language=C}
90 \maketitle
91
92 \section{Curriculum vit{\ae}}
93
94
95 \subsection{Contacts}
96 \begin{itemize}
97 \item \textbf{web:} \url{http://members.femto-st.fr/jf-couchot/}
98 \item \textbf{courrier:} 
99 %\begin{minipage}[t]{10cm} 
100 FEMTO-ST, dpt DISC, IUT BM, 19 rue du maréchal Juin, 90000 Belfort
101 %\end{minipage}
102 \item \textbf{mail:} \url{couchot@femto-st.fr}
103 \item\textbf {tel:}       (+33) (0)3 84 58 77 38
104 \item\textbf {gsm:} (+33) (0)6 76 06 68 94 
105 \end{itemize}
106
107 \subsection{Diplômes universitaires}
108 \begin{itemize}
109 \item{\bf{91:}} Baccalauréat série C mention AB, Besançon.
110 \item{\bf{95:}} Maîtrise de mathématiques pures, Université de
111   Franche-Comté (UFC).
112 \item{\bf{96:}} 
113 CAPES de mathématiques, IUFM d'Auvergne.
114 \item{\bf{02:}} 
115 Maîtrise d'informatique, mention B (UFC). 
116 \item{\bf{02:}}
117  DEA Informatique, option {\em Génie Logiciel} (UFC). Stage intitulé {\em Atteignabilité d'états et spécifications
118 logico-ensemblistes}. Major de promotion, mention TB. 
119 \item{\bf{avril 06:}}
120  Doctorat en  informatique au Laboratoire d'Informatique 
121 de l'Université de Franche Comté (devenu département DISC de FEMTO-ST), 
122 sur la {\em vérification d'invariants par superposition}, 
123 mention très honorable.
124 \end{itemize}
125
126
127 \subsection{Fonctions et expériences professionnelles}
128 \begin{itemize}
129 \item{\bf{95-00:}} Enseignant en mathématiques dans le secondaire,
130   successivement à Aurillac(15), Beaune(21), Belfort(90) et 
131   Montbéliard(25).  
132 \item{\bf{sept. 00-06:}} PrCe $71^{ème}$ section, Unité de Formation
133   et de Recherche (UFR) Sciences du 
134   Langage de l'Homme et de la Société (SLHS) à l'UFC. 
135 \item{\bf{sept. 06-07:}} Post-doctorant INRIA (projet ProVal) sur le
136   thème de l'intégration de preuves interactives dans des preuves
137   automatiques (et vice-versa). %pour la vérification de programmes C embarqués.
138 \item{\bf{sept. 07-08:}} PrCe $71^{ème}$ section, UFR SLHS à l'UFC. 
139 \item{\bf{sept. 08-\ldots:}} Maître de Conférences $27^{ème}$ section, IUT de Belfort-Montbéliard (IUT BM), au département d'informatique (UFC). 
140 \item{\bf{nov. 10- nov. 14:}} \'Elu au Conseil d'Institut de l'IUT BM. 
141  \end{itemize}
142
143
144 \newpage
145 \section{Nom et type de l'équipe de recherche}
146
147 Je suis membre de l'équipe Algorithmique Numérique Distribuée (AND) du 
148 Département d'Informatique des Systèmes Complexes (DISC)
149 du laboratoire FEMTO-ST. 
150 Je relève de l'école doctorale 37 Sciences Pour l'Ingénieur et Microtechniques (SPIM) de l'UFC.
151
152
153
154 \subsection{Avis du directeur de l'équipe}\label{sec:avis:directeur:equipe}
155
156 \subsection{Avis du directeur de recherche}\label{sec:avis:directeur:recherhce}
157
158 \subsection{Avis du directeur de l'école doctorale}\label{sec:avis:directeur:spim}
159
160
161 \newpage
162 \section{Résumé de la thématique de la thèse d'université}
163 On considère en entrée de la démarche une description
164 mathématique d'un programme: par exemple une fonction enrichie avec  
165 une  spécification du contexte dans lequel elle est invoquée (la pré-condition) et 
166 une spécification exprimant quelles  propriétés sont garanties en retour (la
167 post-condition). Lorsque pré-condition et post-condition sont équivalentes,
168 on parle d'invariant.
169 La thématique de \emph{vérification de programmes par preuve automatique} 
170 consiste à tout d'abord construire des formules mathématiques 
171 qui doivent être vraies si et seulement si 
172 la post-condition est établie par le programme sous hypothèse de pré-condition,
173 puis ensuite à 
174 décharger ces formules dans des prouveurs de théorèmes. 
175 Cette thématique est au c{\oe}ur des travaux de recherche effectués
176 pendant mon doctorat et le post-doctorat qui a suivi à l'INRIA.
177
178
179
180 Durant mon travail de thèse intitulée 
181 {\em vérification d'invariants par superposition}, 
182 j'ai proposé différentes traductions en logique équationnelle~\cite{cdgr03:ij,cddg+04:ip,cg04:np,couchot04:onp} 
183 des obligations de preuve,  
184 dans l'objectif de faire converger
185 le plus rapidement possible un prouveur par superposition qui les décharge.
186 J'ai démontré la correction et la complétude partielle de la démarche et 
187 ai montré que la démarche supplante celles basées sur la  
188 logique WS1S et l'outil MONA. 
189 J'ai appliqué ceci à la  vérification de protocoles notamment d'exclusion
190 mutuelle~\cite{CGK05} définis à l'aide de spécifications ensemblistes B~\cite{cdgr04:onp}.
191
192
193
194
195
196 \subsection*{Publications issues de ces recherches}
197  
198
199 \begin{thebibliography}{9}
200 \bibitem{CGK05}
201 Jean-Fran\c{c}ois Couchot, Alain Giorgetti, and Nikolai Kosmatov.
202 \newblock A uniform deductive approach for parameterized protocol safety.
203 \newblock In David~F. Redmiles, Thomas Ellman, and Andrea Zisman, editors, {\em
204   ASE}, pages 364--367. ACM, 2005.
205
206
207 \bibitem{cddg+04:ip}
208 Jean-Fran\c{c}ois Couchot, Fr\'ed\'eric Dadeau, D.~D\'eharbe, Alain Giorgetti,
209   and S.~Ranise.
210 \newblock Proving and debugging set-based specifications.
211 \newblock In A.~Cavalcanti and P.~Machado, editors, {\em WMF'03 proceedings},
212   volume~95 of {\em ENTCS, Electronic Notes in Theoretical Computer Science},
213   pages 189--208, Campina Grande, Brazil, May 2004.
214
215 \bibitem{cdgr03:ij}
216 Jean-Fran\c{c}ois Couchot, D.~D\'eharbe, Alain Giorgetti, and S.~Ranise.
217 \newblock Scalable automated proving and debugging of set-based specifications.
218 \newblock {\em Journal of the Brazilian Computer Society (JBCS)}, 9(2):17--36,
219   November 2003.
220 \newblock ISSN 0104-6500.
221
222 \bibitem{cg04:np}
223 Jean-Fran\c{c}ois Couchot and Alain Giorgetti.
224 \newblock Analyse d'atteignabilit\'e d\'eductive.
225 \newblock In Jacques Julliand, editor, {\em Congr\`es Approches Formelles dans
226   l'Assistance au D\'eveloppement de Logiciels, AFADL'04}, pages 269--283,
227   Besan\c{c}on, France, June 2004.
228
229 \bibitem{cdgr04:onp}
230 Jean-Fran\c{c}ois Couchot, D.~D\'eharbe, Alain Giorgetti, and S.~Ranise.
231 \newblock {B}arvey: {V}\'erification automatique de consistance de machines
232   abstraites {B}.
233 \newblock In Jacques Julliand, editor, {\em AFADL'04, Approches Formelles dans
234   l'Assistance au D\'eveloppement de Logiciels,} pages 369--372, Besan\c{c}on,
235   France, June 2004.
236 \newblock Session outils.
237
238
239 \bibitem{couchot04:onp}
240 Jean-Fran\c{c}ois Couchot.
241 \newblock V\'erification d'invariant par superposition.
242 \newblock In {\em {MAJECSTIC}'04, {MA}nifestation de {JE}unes {C}hercheurs
243   {STIC}}, Calais, France, October 2004.
244 \newblock Actes en ligne sur { t
245   http://lil.univ-littoral.fr/\~{}lewandowski/majecstic/programme.html}.
246
247
248 \end{thebibliography}
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264 \newpage
265 \section{Exposé des recherches réalisées au cours de la période postdoctorale}
266
267 Entre avril 2006 et aujourd'hui, les recherches réalisées ont concerné plusieurs domaines synthétisés ci-après. Le premier travail (Sec.~\ref{sub:verif}) 
268 est une suite directe des travaux de thèse. Suivent six sections
269 (de la Sec.~\ref{sub:sdd} à la Sec.~\ref{sub:hash}) sur les systèmes 
270 dynamiques discrets et leurs applications, thématique 
271 pour laquelle j'ai été recruté dans l'équipe AND du département
272 DISC. Enfin la section~\ref{sub:gen} présente comment je me suis investi dans 
273 le  domaine de la bio-informatique à l'aide de compétences connexes.
274 Ces travaux ont été valorisés par des publications dont les références sont données à la section~\ref{sec:publi} et synthéthisées à la figure~\ref{fig:bilan}.
275
276 \subsection{Vérification de programmes par 
277   preuve automatique}\label{sub:verif}
278
279 Lors de mon post-doctorat à l'INRIA, j'ai d'abord montré qu'il était possible
280 d'instancier des contre-exemples~\cite{BCDG07} et de voir 
281 si ceux-ci sont atteignables~\cite{CouchotD07IFM} lorsque 
282 l'obligation de preuve à vérifier n'est pas établie.
283 Ceci peut aider l'ingénieur à corriger ses modèles.
284 Je  me suis ensuite intéressé  à la
285 logique du premier ordre polymorphe. 
286 Dans ce but, j'ai présenté un réducteur de logique
287 polymorphe vers de la logique sans sorte et de la logique multi-sortes
288 du premier ordre, préservant la correction et la
289 complétude~\cite{couchot07cade}. 
290 Toujours pendant mon post-doctorat, face au problème d'explosion
291 combinatoire rencontré  
292 lors de déduction automatique, j'ai présenté une approche
293 de réduction de
294 formules~\cite{couchot07FTP, cgs09:ip} de type SMT-LIB
295 basée sur la sélection des hypothèses les plus  
296 pertinentes.   
297 L'approche a été implantée et validée sur un exemple industriel réel
298 de 5000 lignes de Code C annoté fourni par Dassault aviation.
299
300
301
302
303
304
305
306 \subsection{Convergence de systèmes  dynamiques discrets}\label{sub:sdd}
307
308 Un système dynamique discret (SDD) est une fonction $f$ 
309 du $n$-cube ($\{0,1\}^n$) dans lui même et un mode opératoire
310 (parallèle, unaire, généralisé) qui peut être itéré 
311 en synchrone ou en asynchrone.
312 %Ils ont été étudiés à de maintes reprises ~\cite{Rob95,Bah00,bcv02}.
313 Pour chacun de ces modes, il existe des critères  (suffisants) de convergence
314 globale ou locale, souvent basés sur le fait que  $f$ 
315 est un opérateur contractant dans un espace.
316
317 Les modes  asynchrones ont une dynamique avec plus de liberté 
318 puisqu'ils autorisent chaque élément à modifier sa valeur avant 
319 de connaître les valeurs des autres éléments dont il dépend. 
320 Cependant, lorsque les calculs à effectuer sur certains n{\oe}uds
321 sont coûteux en temps et/ou que les temps de communication sont élevés,   
322 ces modes peuvent présenter une convergence plus rapide que le cas synchrone.  
323
324 J'ai formalisé le mode des 
325 \emph{itérations mixtes} (introduit par Pr. J. M.  Bahi en 2005 notamment)
326 qui combine synchronisme et asynchronisme.
327 Intuitivement, les n{\oe}uds qui pourraient engendrer des cycles dans 
328 les itérations asynchrones sont regroupés dans une même classe. 
329 Les noeuds à l'intérieur de celle-ci seront itérés de manière 
330 synchrone et les itérations asynchrones sont conservées entre les groupes. 
331 Pour gommer les  différences entre les n{\oe}uds d'une même classe
332 lorsqu'ils  sont vus depuis des n{\oe}uds extérieurs, j'ai défini le 
333 mode des \emph{itérations mixtes avec délais uniformes}.
334 J'ai pu ainsi énoncer puis démontrer un théorème 
335 établissant que pour des conditions classiques de convergence des itérations
336 synchrones d'une fonction $f$, les itérations mixtes à délai uniforme
337 convergent aussi vers le même point fixe.
338 Ceci a été synthétisé dans~\cite{BCVC10:ir}. 
339
340
341 L'étude de convergence de SDDs de modèles de petite taille 
342 est simple à vérifier pratiquement pour le mode synchrone parallèle: 
343 l'espace d'intérêt est fini.  
344 C'est beaucoup plus complexe lorsqu'on traite des itérations
345 unaires, voire généralisées
346 asynchrones et mixtes prenant de plus en compte les délais. 
347 Des méthodes de simulation basées sur des stratégies et des délais générés aléatoirement avaient déjà été présentées.
348 Cependant, comme ces implantations ne sont pas exhaustives, elles ne sont intéressantes que lorsqu'elles fournissent un contre-exemple. 
349 Lorsqu'elles exhibent une convergence,  
350 cela ne permet que de donner une intuition de convergence, pas  une preuve.
351 Autant que je sache, aucune démarche de preuve formelle automatique 
352 de convergence n'avait jamais été établie. 
353
354
355 J'ai démontré qu'on peut simuler 
356 des SDDs selon tous les modes pour établir 
357 formellement leur convergence (ou pas).
358 Cette simulation est basée sur l'outil SPIN de \emph{Model-Checking}.
359 Pour traiter le problème d'explosion 
360 combinatoire, les outils de cette classe 
361 appliquent des méthodes d'ordre partiel, d'abstraction,
362 de quotientage selon une relation d'équivalence.
363 J'ai présenté pour cela une démarche de traduction d'un SDD  
364 dans SPIN.
365 J'ai énoncé puis prouvé ensuite la  correction et la complétude de la démarche.
366 Des données pratiques comme la complexité et des synthèses d'expérimentation
367 ont aussi été fournies.
368 Ceci a été synthétisé dans~\cite{Cou10:ir}
369
370
371 \subsection{Construction de fonctions chaotiques}
372 Je me suis intéressé ensuite à l'étude du problème dual 
373 de l'étude de divergence d'un SDD.
374 Le Pr. C. Guyeux de l'équipe AND a proposé dans sa thèse en 2010
375 une caractérisation des fonctions $f$ de $\{0,1\}^n$ dans lui-même 
376 dont les itérations sont chaotiques selon Devanney pour un  mode donné: 
377 il est nécessaire et suffisant que son graphe des itérations soit
378 fortement connexe.  
379 J'ai proposé plusieurs méthodes de construction de 
380 fonctions ayant de tels graphes d'itérations~\cite{bcgr11:ip,chgw+14:onp}.
381
382 Dans la première~\cite{bcgr11:ip},
383 l'algorithme enlève des arcs et vérifie ensuite que  
384 la forte connexité est maintenue.
385 Même si cet algorithme retourne toujours des fonctions dont le graphe 
386 des itérations est fortement connexe, il n'en est pas pour autant efficace 
387 car il  nécessite une vérification à posteriori de la 
388 forte connexité sur le graphe entier composé de  $2^n$ sommets.
389 La seconde méthode propose une solution à ce problème en présentant
390 des conditions suffisantes sur un graphe à $n$ sommets
391 qui permettent d'obtenir des graphes d'itérations fortement connexes.
392 Ce théorème a aussi été prouvé dans~\cite{bcgr11:ip}
393 et des instanciations effectives 
394 ont été produites. 
395 Une troisième méthode~\cite{chgw+14:onp} s'appuie sur les codes 
396 de Gray, ou de manière équivalente sur les cycles hamiltoniens du graphe des
397 itérations.
398 % : un cycle qui visite chaque n{\oe}ud exactement une fois est un  
399 % \emph{cycle hamiltonien}.
400 %La démarche consiste à enlever du graphe un de ses cycles hamiltoniens dont 
401 %la démarche de génération est un problème connu. 
402
403 Ces méthodes ont permis d'étendre à l'infini la classe des fonctions 
404 dont les itérations sont chaotiques.
405
406
407 \subsection{Apprentissage par réseaux neuronaux}
408 Nous disposons grâce aux travaux présentés à la section précédente d'un grand
409 nombre de fonctions dont les itérations sont chaotiques.
410 Nous avons entrepris d'étudier ces itérations et plus particulièrement leur 
411 apprentissage par un réseau de neurones. 
412 J'ai notamment pu contribuer à montrer pratiquement qu'il
413 est très difficile (voir impossible) de les prédire 
414 à l'aide d'outils d'intelligence artificielle~\cite{bcgs12:ij}.
415
416
417 Nous nous sommes attaqués parallèlement 
418 à un problème physique d'optimisation de  
419 l'écoulement d'un flux d'air le long d'un véhicule. 
420 Ce flux peut être modifié si l'on active des injecteurs d'air placés 
421 par exemple sur le becquet du véhicule. 
422 Le flux d'air peut être modélisé à l'aide d'équations de Navier-Stokes
423 dont on ne connaît pas de méthode analytique de résolution. 
424 De plus, le nombre de Reynolds calculé dans cette situation fait apparaître 
425 que le régime est extrêmement turbulent, donc difficile à prévoir.
426 Nous avons souhaité 
427 continuer nos expériences d'apprentissage à l'aide 
428 de réseau de neurones dans ce contexte.
429  Il est apparu comme judicieux de mémoriser les configurations
430 représentant l'état des actionneurs à l'aide de nombres binaires.
431 De plus les codes de Gray (dont deux mots adjacents ne diffèrent que d'un 
432 bit) se sont présentés comme une des manières de mémoriser les sorties du 
433 réseau de neurones comme un seul nombre binaire.
434 Or trouver un chemin hamiltonien 
435 (comme étudié dans la partie précédente) dans un
436 $n$-cube revient à trouver un code 
437 de Gray dans un mot de $n$-bits. Les compétences acquises lors du travail 
438 sur les chemins hamiltoniens ont ainsi pu être réutilisées et approfondies.
439 Les résultats pratiques quant à l'utilisation de ces codes se sont cependant 
440 révélés comme moins pertinents que l'utilisation de $n$ sorties.
441 Ceci a été valorisé dans les publications~\cite{cds12:ip,cds13:ij}.
442
443 \subsection{Génération de nombres pseudo-aléatoires}
444 Au commencement de ce travail, notre équipe disposait d'un générateur de nombres 
445 pseudo-aléatoires (PRNG) 
446 basé sur une seule fonction dont nous avions prouvé la chaoticité 
447 des itérations, à savoir la négation booléenne vectorielle. Cependant pour 
448 réussir les tests statistiques dédiés aux PRNGs, il était nécessaire d'itérer 
449 un grand nombre (arbitraire) de fois cette fonction entre deux 
450 sorties. 
451
452 Avec la production d'une grande collection de fonctions à itérations chaotiques, 
453 j'ai proposé de répondre à la question suivante: comment engendrer des fonctions 
454 dont les itérations vont produire des nombres simulant correctement l'aléa.
455 J'ai d'abord caractérisé les fonctions dont les itérations produisent des nombres 
456 selon une distribution uniforme~\cite{bcgr11:ip}. Pour cela il a fallu réécrire
457 l'algorithme de génération comme une marche aléatoire dans une partie du $n$-cube,
458 de se ramener à une chaîne de Markov puis d'utiliser la théorie élaborée sur ce sujet 
459 pour conclure. Par la même occasion, nous avons démontré que certaines fonctions 
460 chaotiques ne peuvent pas produire un aléa suivant une distribution uniforme.
461 La sortie est biaisée.
462
463 J'ai proposé ensuite des méthodes permettant de trouver de telles 
464 fonctions en commençant par filtrer celles qui ne disposent pas 
465 de cette caractéristique parmi toutes les fonctions chaotiques qui peuvent 
466 être engendrées~\cite{bcgr11:ip}. J'ai démontré ensuite que supprimer 
467 un cycle hamiltonien dans un $n$-cube permettait d'engendrer directement 
468 des fonctions avec une telle caractéristique~\cite{chgw+14:oip}.
469 De plus, je me suis attaché à montrer l'importance 
470 de l'équilibrage du chemin hamiltonien à enlever. 
471
472  
473 Les qualités statistiques des générateurs produits  
474 ont été évalués avec succès~\cite{bcgw11:ip,chgw+14:onp,chgw+14:oip}
475  en se confrontant à 
476 des batteries de tests telles que Die-Hard, NIST, TestU01.
477
478 Plus récemment, nous avons entrepris de trouver des bornes du temps d'arrêt
479 d'obtention d'une distribution uniforme d'un générateur 
480 construit en enlevant un chemin hamiltonien équilibré dans un $n$-cube. Le travail 
481 en collaboration avec Pr. P.-C. Heam du DISC
482 est en cours de soumission
483 dans un  journal international.
484
485 Enfin j'ai été sollicité pour encadrer une thèse sur l'implantation 
486 de générateurs de nombre pseudo-aléatoires à bases d'itérations 
487 chaotiques sur des circuits logiques 
488 programmables. J'ai commencé ce travail en encadrant une étude exhaustive 
489 de toutes les instances d'implantations de cette classe.
490 Ce travail complet théorique et pratique est terminé aujourd'hui et 
491 est en cours de soumission dans un journal international.
492
493
494
495
496
497
498 \subsection{Masquage d'information}\label{sub:ih}
499
500 La propriété de transitivité des fonctions chaotiques implique que l'on peut 
501 atteindre tout point depuis le voisinage de n'importe quel point.
502 Lorsqu'on cherche à embarquer une marque dans un média, 
503 si l'on souhaite de plus que celle-ci soit robuste, \textit{i.e.},
504 ne puisse pas être enlevée facilement, il paraît naturel d'embarquer 
505 cette marque sur une grande partie du média. 
506 L'utilisation de fonctions chaotiques
507 paraît alors judicieuse.
508
509 J'ai participé à la formalisation de la méthode de
510 marquage de médias~\cite{bcg11b:ip,bcg11:ij} et particularisé
511 ceci à des images numériques fournissant un 
512 nouveau contexte pour l'étude théorique et mathématique d'algorithmes de marquage.
513 La chaos-sécurité a été introduite comme une nouvelle propriété 
514 de tels algorithmes de marquage.
515 Nous avons de plus montré la robustesse d'un tel marquage dans les 
516 domaines fréquentiels usuels (DWT ou DCT).
517
518 Des instances de ces algorithmes ont été présentées en sélectionnant de manière 
519 pertinente les fonctions à itérer soit pour garantir une robustesse 
520 élevée~\cite{bcfg12b:ip,bcfg+13:ip} soit pour masquer l'information dans le média 
521 et être le moins détectable possible~\cite{bcfg12a:ip}. 
522
523 D'autre méthodes de watermarking ont été investies, 
524 particulièrement celles basées sur la Quantization Index Modulation (QIM), méthodes 
525 étant supposées comme les plus robustes. Mes principales contributions 
526 sur ce travail --en collaboration avec Dr R. Darazy de l'Université Antonine au Liban
527 et en co-encadrant le stage de M2 de Ahmad Bittar--,
528 ont été 
529 d'intégrer ceci à du marquage de document PDF puis de 
530 présenter ce problème comme un problème d'optimisation. 
531 Grâce à une telle présentation nous avons pu trouver les paramètre optimaux
532 des méthodes QIM assurant à la fois robustesse et indétectabilité.
533 Le travail est en cours de soumission dans un  journal international.
534
535 Lorsque l'objectif visé est l'indétectabilité, on parle de \emph{stéganographie}.
536 Ce domaine a été adressé en critiquant notamment les scénarios usuels d'évaluation
537 des algorithmes de stéganographie. J'ai proposé un cadre complémentaire permettant 
538 d'évaluer ces schémas de masquage~\cite{fccg15:ip}.
539 Ceci se réalise en co-encadrant le doctorat de Y. Fadil.
540
541 J'ai de plus participé à l'élaboration de l'algorithme STABYLO~\cite{ccg15:ij}
542 qui est un schéma de
543 stéganographie basé sur l'enfouissement de l'information dans les contours 
544 présents dans une image. 
545 Ce travail est en collaboration avec Pr. R. Couturier.
546 Mes contributions ont principalement été la formalisation de l'algorithme et 
547 son étude de complexité. Grâce a l'optimisation de cette dernière,
548 nous avons  pu montrer 
549 que cet algorithme présente un excellent compromis entre sécurité
550 fournie et complexité.  
551
552 \subsection{Les fonctions de hachage}\label{sub:hash}
553 Une fonction qui calcule une empreinte servant à identifier rapidement toute 
554 donnée fournie en entrée est une fonction de hachage. On utilise ce genre
555 de fonctions dès qu'on veut comparer des éléments de grande taille car il 
556 suffit de comparer leurs empreintes (généralement de taille plus réduite).  
557 Une telle fonction doit induire de grandes variations dans l'empreinte 
558 lorsque l'entrée varie même très peu. C'est l'effet avalanche. Cette 
559 condition fait penser à la forte sensibilité aux conditions initiales
560 d'une fonction chaotique.
561
562 Forts de nos compétences sur les fonctions dont les itérations sont 
563 chaotiques, nous avons proposé de nouvelles fonctions de hachage.
564 Celles-ci combinent des outils classiques utilisés dans les
565 fonctions de hachage 
566 usuelles et des itérations de systèmes dynamiques discrets étudiés 
567 au préalable.
568 Nous avons prouvé que ces fonctions sont résistantes à la 
569 seconde pré-image. Leur complexité, polynomiale en la taille 
570 du message et la taille de l'empreinte, a été évaluée et correspond
571 à ce que l'on attend d'une telle fonction.
572 Nous avons de plus vérifié statistiquement le critère d'avalanche.
573 Ces résultats ont été valorisés dans les publications~\cite{bcg11:ip,bcg12:ij}.
574
575
576
577
578 \subsection{Application à la génomique}\label{sub:gen}
579
580 Ayant acquis des compétences sur certaines structures de mathématiques 
581 discrètes (particulièrement théorie des graphes, 
582 relations d'équivalence,\ldots), j'ai pu contribuer en bio-informatique
583 en les réappliquant notamment.
584
585 Une de mes premières pistes de travail a été de proposer une méthode automatique 
586 de construction d'un ensemble de gènes communs (nommés core-génome) 
587 à une famille de génomes.
588 La méthode s'appuie sur la construction du graphe de  similarité
589 entre les gènes quotienté selon une relation d'équivalence pour en
590 réduire sa taille. Chaque gène est assimilé à son représentant de
591 classe dans chaque génome. Le core-génome se déduit comme  l'intersection 
592 de tous les génomes. Ceci a donné lieu aux 
593 publications~\cite{acgs13:onp,akgcs+14:oip,acgm+14:ij}.
594
595 L'approche précédente souffrait de n'engendrer que des core-génomes de (trop)
596 petits cardinaux. J'ai contribué notamment 
597 à l'amélioration de la méthode en proposant une étape d'optimisation issue 
598 d'une adaptation discrète la méthode d'essaims particulaires~\cite{aagp+15:ip}.
599 D'autres travaux (dont la première étape est cette construction de 
600 core-génome) ont été ensuite réalisés, principalement dans le but de 
601 construire des arbre phylogénétiques de qualité~\cite{agcs+15:ip,aangc+15:ip}.
602
603
604 Tous ces travaux ont été réalisés en collaboration avec M. Salomon et en co-encadrant 
605 le doctorat de B. Alkindy.
606
607
608
609
610 \newpage
611 \section{Perspectives de recherche}
612
613
614
615
616 \subsection{Les codes de Gray}
617 L'utilisation des codes de Gray dans une démarche d'apprentissage 
618 (d'écoulement d'air ou  de fonctions chaotiques) ne s'est pas révélée comme 
619 concluante. Dans chacun des cas, la distance de Hamming entre deux 
620 configurations voisines peut être très petite tandis que le chemin (dans le 
621 cycle  hamiltonien) qui les relie peut être long et ce même 
622 pour des codes équilibrés.
623 Je propose de travailler sur ce problème discret en mesurant la qualité 
624 du code de Gray à l'aide d'une fonction basée sur la longueur des chemins
625 (du cycle hamiltonien) entre les configurations voisines.
626 Je pense ainsi réduire ce problème à un problème d'optimisation et dégager 
627 une démarche de génération, comme je l'ai fait en bio-informatique.
628  
629 Jusqu'à présent, la production de codes de Gray équilibrés pour la génération 
630 de nombres pseudo-aléatoires bute sur des problèmes d'explosion combinatoire:
631 les seuls algorithmes connus répondant à ce problème nécessitent a priori
632 plus de $10^{36}$ évaluations pour $n=8$. 
633 Il n'est ainsi pas raisonnable de mettre en  
634 pratique ce genre d'approche lorsque chacune de ces évaluations prend 1s.
635 On peut peut-être
636 se contenter de codes ``presque'' équilibrés , à défaut de pouvoir 
637 trouver ceux qui seront équilibrés.
638 Je propose d'investiguer  
639 dans cette thématique en exploitant des approches itératives permettant 
640 d'obtenir des optimums locaux et trouver ainsi des codes presque équilibrés.
641
642
643  
644 \subsection{Génération de nombres pseudo-aléatoires}
645
646 La démarche actuelle de génération de nombres pseudo-aléatoires
647 consiste à marcher dans une partie d'un $n$-cube en choisissant son chemin
648 à l'aide d'un générateur fourni en entrée. Or ces générateurs sont tous des 
649 fonctions de $\{0,1\}^n$ dans lui-même. Cette approche
650 semble pouvoir se réécrire
651 comme un produit synchrone de deux automates.
652 L'intérêt d'une telle réécriture est qu'on pourrait exploiter 
653 tous les résultats théoriques et pratiques déjà connus dans la communauté
654 des automates. 
655 Je pense investiguer cette voie pour améliorer notre approche, 
656 s'affranchir, à terme, de tout autre générateur et améliorer la
657 connaissance à ce sujet.
658 Les propriété établies notamment sur les temps d'arrêt devraient être conservées.
659 Il restera à le prouver.
660
661
662 Jusqu'à présent, une seule expérimentation d'implantation de nos générateurs 
663 sur des dispositifs physiques comme les FPGAs a été réalisée. Celle-ci 
664 s'est faite automatiquement à l'aide de l'outil Matlab. Si le code engendré
665 sur le circuit est bien une implantation fidèle à la spécification,
666 il n'en est pas pour autant efficace: le nombre de bits générés par surface
667 est plutôt faible. Nous allons exploiter les meilleures démarches mises en 
668 exergue lors de la rédaction d'un état de l'art exhaustif sur les PRNGs 
669 implantés sur FPGA pour produire du code optimisé. 
670 Je prévois de réaliser ceci dans la thèse de M. Bakiri, en cours.
671
672 Pour générer une fonction dont la matrice de Markov est doublement
673 stochastique, nous avons proposé principalement deux méthodes 
674 (génération puis test, suppression de chemin hamiltonien dans un $n$-cube).  
675 Ces deux méthodes ne passent pas à l'échelle, même pour des $n$ de petite taille.
676 Je pense attaquer ce problème algébriquement et en programmation logique avec 
677 contraintes. Dans le premier cas, on peut remarquer qu'un matrice
678 composée de $1$ uniquement 
679 en $(i,i+1)$ est une réponse triviale au problème. Je pense continuer l'étude 
680 de ce genre de matrices et proposer une méthode plus générale de génération.
681 Je prévois de réaliser ce travail avec M. S. Contassot, Pr. à l'Université de Lorraine.
682 Le département DISC et l'équipe VESONTIO 
683 a de fortes compétences en programmation logique avec 
684 contraintes. J'ai déjà démontré que ce problème peut être soluble par cette
685 approche, sans avoir pour autant réussi à le faire.
686 Je prévois des collaborations avec l'équipe VESONTIO du DISC sur ce sujet.
687
688
689 Enfin, marcher dans une partie d'un $n$-cube est le modèle théorique que 
690 nous avons établi pour notre classe de générateurs. On pourrait cependant 
691 penser à ``sauter'' dans ce $n$-cube, c'est-à-dire modifier plusieurs bits 
692 en une seule itération. J'ai commencé à étudier ce modèle avec les résultats
693 pratiques suivants: le nombre d'itérations suffisant pour un mélange 
694 correct est plus petit que celui obtenu en marchant. De plus,  
695 il diminue à mesure que $n$ augmente ce qui n'est pas le cas en marchant.
696 Pour l'instant, nous n'avons pas réussi à obtenir des bornes
697 du temps d'arrêt. Je propose d'investiguer aussi dans cette direction.
698
699
700
701 \subsection{Masquage d'information}
702
703 Concernant le marquage de données, plusieurs approches duales cohabitent pour 
704 établir ou non la sécurité d'un algorithme 
705 de cette classe: les probabilistes (stego-securité par ex.), 
706 les métriques (chaos-securité par ex.),
707 les cryptographiques (mesure de fuite d'information).
708 Notre approche n'a pas encore été évaluée selon cette dernière métrique, ce 
709 que je propose de faire. 
710
711 Concernant l'indétectabilité, je propose de travailler à la fois sur 
712 la stéganographie et sur la stéganalyse.
713 Nos expériences sur les schémas les plus efficaces de stéganographie 
714 nous font penser qu'embarquer un message dans les contours comme cela l'a été fait pour 
715 STABYLO est perfectible: on sait depuis qu'il existe des fonctions mathématiques 
716 qui modélisent ces contours. Lorsqu'on modifie sans garde la valeur des bits de ces 
717 contours,  la ``continuité'' des fonctions qui les modélisent peut être perdue et 
718 le message peut s'en trouver détectable. Que je sache, aucune approche de stéganographie 
719 basée sur la continuité des fonctions de contours n'a jamais été proposée. 
720 Je propose donc d'investiguer dans cette voie.
721
722 Les démarches de stéganalyse sont souvent composées de 2 étapes: 
723 caractérisation puis classification. 
724 On extrait au préalable une grande quantité des caractéristiques du média 
725 puis on utilise une méthode de 
726 classification basée sur celles-ci. La communauté voit souvent cette 
727 seconde étape comme une boite noire et se concentre 
728 sur la construction de l'ensemble des caractéristiques les plus discriminantes.
729 Autant que je sache, les méthodes algébriques 
730 de réduction de domaine (analyse par composant principaux, SVD) 
731 ont rarement été utilisées comme une étape intermédiaire entre la caractérisation et 
732 la classification. Ces méthodes ont déjà été 
733 appliquées avec succès lorsqu'elles sont combinées avec des méthodes 
734 d'apprentissage, par exemple dans de la reconnaissance faciale.
735 Je propose d'étudier cette piste dans ce domaine. 
736 Ceci se réalisera notamment au travers du doctorat de Y. Fadil.
737
738
739
740
741 \newpage
742 \section{Insertion dans l'équipe de recherche} 
743
744 La thématique principale de ma thèse et du post-doctorat qui a suivi 
745 était la vérification de programmes par preuve automatique, soit de 
746 la logique informatique.
747 Suite à mon recrutement dans l'équipe AND, mes recherches se sont réorientées
748 autour des SDDs et donc de l'analyse numérique plus généralement.
749 En plus des publications obtenues avec les membres de l'équipe AND, 
750 ce qui suit récapitule quelques éléments permettant 
751 d'apprécier mon insertion dans l'équipe AND
752
753
754
755
756 J'ai monté une collaboration active avec l'Université Antonine au Liban. 
757 J'y ai été invité en mai 2013. J'ai par la suite co-encadré trois stages de 
758 Master 2 recherche avec des membres de cette université.
759 J'ai un article en cours de soumission résumant un travail en collaboration 
760 avec un ancien étudiant et un enseignant chercheur de cette université.
761
762 Je suis membre du GDR codes et cryptographie. J'ai à ce titre 
763 participé aux Journées Codes et Stéganographie en 2012 (Rennes) 
764 où j'ai présenté le travail 
765 de \og Steganography: secure and robust algorithms \fg{} et en 2013 (Paris).
766
767
768 J'ai co-organisé avec J. Bahi et C. Guyeux 
769 \og The First Workshop on Information Hiding Techniques 
770 for Internet Anonymity and Privacy (IHTIAP) \fg{} à Venise en juin 2012.
771 Le comité de programme était composé
772 de 18 chercheurs internationaux (dont je faisais aussi partie). 
773 Il s'est  déroulé sur 1 journée.
774
775
776 J'ai fait partie des comités de programme de conférences 
777 comme \og international conference on evolving internet \fg{} 
778 (2012, 2013,2014 )\ldots 
779 J'ai été session chair de \og international conference on evolving internet\fg{}
780 en 2011 et  IHTIAP en 2012
781
782 J'ai reviewé des articles pour les journaux internationaux 
783 suivants: The computer Journal, Springer Multimedia Tool and application, 
784 Springer Annals in Telecommunication\ldots
785
786
787 Je suis régulièrement membre de jury des épreuves TIPE, épreuves communes
788 à 90 concours d'ingénieurs (sessions 2012 et  2015) et fournis  
789 à chaque session des sujets scientifiques pour l'épreuve.
790
791
792
793 \newpage
794 \section{Encadrement et co-encadrement d'étudiants} 
795
796 \subsection{Thèse d'université}
797
798 Je co-encadre (à hauteur de 40\%) avec Michel Salomon (40\%) et  
799 Jacques M. Bahi  (20\%) le doctorat de Bassam Alkindy
800 sur les combinaisons d'approches pour la prédiction de l'évolution génomique.        
801 Le doctorat a commencé en septembre 2012 et devrait être soutenu en 
802 novembre 2015.  
803 Ce travail de thèse a donné lieu à 6 publications dans des conférences 
804 internationales.
805
806
807 Je co-encadre (à hauteur de 50\%) avec Christophe Guyeux (50\%)
808 le doctorat de  Youssra Fadil
809 sur
810 l'étude du comportement des outils d'intelligence artificielle
811 face à des dynamiques complexes.       
812 Le doctorat a commencé en décembre 2013 et devrait être soutenu en 
813 décembre 2016. 
814 Ce travail de thèse a donné lieu à 1 publication dans une conférence
815 internationale.
816                 
817
818 Je co-encadre (à hauteur de 50\%) avec Christophe Guyeux (50\%)
819 le doctorat de  Mohamed Bakiri
820 sur
821 l'implémentation matérielle de générateurs de nombres pseudo-aléatoires basés sur les itérations chaotiques.
822 Le doctorat a commencé en septembre 2014 et devrait être soutenu en 
823 aout 2017.      
824 Ce travail de thèse a donné lieu à 1 publication dans un journal international 
825 en cours de soumission.
826
827 \subsection{Master 2 recherche}
828
829
830 J'ai co-encadré (à hauteur de 34\%) avec Raphael Couturier (33\%) et 
831 Rony Darazi -- Université Antonine au Liban--(33\%)
832 le stage de recherche de Master 2 de  Ahmad Bittar
833 sur
834 la 
835 Steganography in PDF documents based on Unprintable Control ASCII Codes.
836 Le stage a commencé le 01 mai 2013 et a été soutenu le 30 septembre 2013. 
837 Ce travail de Master a donné lieu à 1 publication dans un journal international 
838 en cours de soumission (en révision mineure).
839
840
841
842
843 J'ai co-encadré (à hauteur de 80\%) avec   
844 Talar Atechian -- Université Antonine au Liban--(20\%)
845 le stage de recherche de Master 2 de Hussein Nasser
846 sur
847 une  
848 Critical Analysis of Distributed Algorithm for Sensor
849 Network Lifetime Maximization.
850 Le stage a commencé le 01 avril 2014 et a été soutenu le 31 août 2014. 
851
852
853 Je co-encadre (à hauteur de 80\%) avec   
854 Talar Atechian -- Université Antonine au Liban--(20\%)
855 le stage de recherche de Master 2 de Khaled Daher 
856 sur la désynchronisation du calcul d'optimisation de la durée de vie 
857 d'un réseau de capteurs.
858 Le stage a commencé le 01 avril 2015 et sera soutenu le 31 août 2015. 
859
860
861
862 \newpage
863 \section{Participation à des tâches d'intérêt collectif}
864
865 Depuis septembre 2000, je suis titulaire à l'Université de Franche-Comté,
866 soit sur un poste de PrCe (de 2000 à 2008, sauf l'année 2006-2007) soit sur
867 un poste de MdC. J'ai assuré un grand nombre d'enseignements de la première
868 année de licence ou de DUT jusqu'en seconde année de Master. 
869 Depuis mon
870 recrutement comme MdC, j'ai recentré mes enseignements autour 
871 de mes thématiques de recherche, à savoir essentiellement les 
872 mathématiques discrètes.
873 La répartition moyenne de mes enseignements 
874 sur les quatre dernières années  est la suivante:
875 \begin{itemize}
876 \item 6\% en le master Informatique Mobile et Répartie (UFR STGI), 
877   dans l'UE de
878   \og Modélisation et d'Evaluation des Systèmes Informatiques \fg{};
879 \item 7\% en Licence Pro Conception des Application Multi-tiers (LP CAM) à l'IUT BM dans l'UE de \og Développement d'applications mobiles\fg{};
880 \item 15\% en encadrement de projets tutorés ou de stage;
881 \item 28\% en DUT d'informatique  dans l'UE de 
882 \og conception et développement d'applications mobiles\fg{}; 
883 \item 44\% en DUT d'informatique  dans les UEs de 
884 \og mathématiques discrètes \fg{} et 
885 de
886 \og  modélisations mathématiques \fg{}.
887 \end{itemize}
888
889 J'ai aussi la responsabilité de toutes les UE données ci-dessus et 
890 suis de plus le coordinateur des enseignements de mathématiques 
891 au département d'informatique de l'IUT BM. 
892 Depuis septembre 2014, je suis le responsable du parcours TeProw
893 de la LP CAM  localisée 
894 à l'IUT BM. Cette licence 
895 a aussi un parcours à l'UFR ST. Je coordonne toute l'organisation 
896 de cette licence avec mon collègue de Besançon. 
897
898
899 J'ai été membre élu du conseil d'institut de l'IUT BM 
900 de novembre 2010 à novembre 2014. A ce titre j'ai participé à la vie administrative de l'IUT, 
901 aux commissions de recrutement d'enseignants et  d'enseignants-chercheurs\ldots
902 Depuis septembre 2014,  je suis élu au conseil du département d'informatique 
903 de l'IUT BM. 
904
905
906
907
908
909 \newpage
910 \section{Publications après la thèse}\label{sec:publi}
911
912 \subsection{Journaux internationaux avec comité de sélection}
913
914 \begin{thebibliography}{CHG{\etalchar{+}}14b}
915
916 \makeatletter
917 \addtocounter{\@listctr}{6}
918 \makeatother
919
920 \bibitem{bcg12:ij}
921 Jacques Bahi, Jean-Fran\c{c}ois Couchot, and Christophe Guyeux.
922 \newblock Quality analysis of a chaotic proven keyed hash function.
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925
926
927 \bibitem{bcg11:ij}
928 Jacques Bahi, Jean-Fran\c{c}ois Couchot, and Christophe Guyeux.
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930 \newblock {\em The Computer Journal}, 55(6):653--666, 2012.
931
932 \bibitem{bcgs12:ij}
933 Jacques Bahi, Jean-Fran\c{c}ois Couchot, Christophe Guyeux, and Michel Salomon.
934 \newblock Neural networks and chaos: Construction, evaluation of chaotic
935   networks, and prediction of chaos with multilayer feedforward network.
936 \newblock {\em Chaos, An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science},
937   22(1):013122--1 -- 013122--9, March 2012.
938 \newblock 9 pages.
939
940
941
942 \bibitem{ccg15:ij}
943 Jean-Fran\c{c}ois Couchot, Rapha\"el Couturier, and Christophe Guyeux.
944 \newblock {STABYLO}: {STeganography with Adaptive, Bbs, and binarY embedding at
945   LOw cost}.
946 \newblock {\em Annals of Telecommunications}, 2015.
947 \newblock Available online. Paper version to appear.
948
949
950 \bibitem{cds13:ij}
951 Jean-Fran\c{c}ois Couchot, Karine Deschinkel, and Michel Salomon.
952 \newblock Active {MEMS}-based flow control using artificial neural network.
953 \newblock {\em Mechatronics}, 23(7):898--905, October 2013.
954 \newblock Available online. Paper version to appear.
955
956 \end{thebibliography}
957
958 \subsection{Conférences internationales avec comité de sélection}
959
960 \begin{thebibliography}{CHG{\etalchar{+}}14b}
961 \makeatletter
962 \addtocounter{\@listctr}{11}
963 \makeatother
964
965 \bibitem{aangc+15:ip}
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1124 \newblock To appear.
1125
1126 \end{thebibliography}
1127
1128 \subsection{Communications orales invitées}
1129
1130 J'ai été invité:
1131 \begin{itemize}
1132
1133 \item au Workshop \og Théorie des réseaux booléens et ses applications en biologie\fg{}  
1134 à Nice en novembre 2014;
1135
1136 \item à la journée \og Advances in Mobile Technologies Day\fg{}  par l'Université Antonine  (Liban) en mai 2013;
1137
1138 \item au Séminaire MDSC (Modèles Discrets pour les Systèmes Complexes)
1139   du laboratoire I3S sur le sujet \og Efficiently dealing with SMT-LIB provers in software verification\fg{} en décembre 2007.
1140 \end{itemize}
1141
1142 \subsection{Communications diverses}
1143 \begin{thebibliography}{CHG{\etalchar{+}}14b}
1144
1145 \makeatletter
1146 \addtocounter{\@listctr}{31}
1147 \makeatother
1148
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1179
1180
1181 \end{thebibliography}
1182
1183
1184 \begin{figure}[h]
1185 \begin{center}
1186 \begin{tabular}{|c|c|c|c|c|}
1187 \hline
1188 & \multicolumn{2}{|c|}{Internationaux} &  {Nationaux} &  \\
1189 \hline
1190 & Journaux & Conférences  & 
1191 Conférences  &  \\
1192 \hline
1193 Pendant le doctorat &
1194 %journaux
1195 \cite{cdgr03:ij}
1196 &
1197 % conf inter
1198 \cite{cddg+04:ip,CGK05}
1199
1200 &
1201 % conf nat
1202 \cite{cdgr04:onp,cg04:np}
1203
1204 &
1205 % divers
1206 \cite{couchot04:onp}
1207
1208 \\ \hline  
1209 En post-doctorat & 
1210 %journaux
1211
1212 &
1213 % conf inter
1214 \cite{BCDG07,CouchotD07IFM,cgs09:ip,couchot07FTP,couchot07cade}
1215
1216 &
1217 % conf nat
1218
1219
1220 &
1221 % divers
1222
1223
1224 \\ \hline  
1225
1226 &
1227 %journaux
1228 &
1229 % conf inter
1230 \cite{aangc+15:ip,aagp+15:ip,acgm+14:ij,
1231   akgcs+14:oip,agcs+15:ip}
1232
1233 &
1234 % conf nat
1235
1236
1237 &
1238 % divers
1239
1240 %%%%%%%%%%%%%%
1241
1242 \\ %\cline{3-3}  
1243
1244 Au DISC à FEMTO-ST&
1245 %journaux
1246 \cite{bcg12:ij,bcg11:ij,bcgs12:ij,ccg15:ij,cds13:ij}
1247
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254 &
1255 % conf inter
1256 \cite{bcfg+13:ip,bcfg12a:ip,bcfg12b:ip,bcg11:ip,bcg11b:ip}
1257
1258 &
1259 % conf nat
1260
1261
1262 &
1263 % divers
1264 \cite{acgs13:onp,BCVC10:ir,chgw+14:onp,Cou10:ir}
1265
1266
1267
1268 \\ %\hline  
1269
1270 &
1271 %journaux
1272
1273 &
1274 % conf inter
1275 \cite{bcgr11:ip,bcgw11:ip,cds12:ip,chgw+14:oip,fccg15:ip}
1276
1277 &
1278 % conf nat
1279
1280
1281 &
1282 % divers
1283
1284
1285
1286 %%%%%%%%%%%%%
1287
1288
1289 \\ \hline  
1290 \end{tabular}
1291 \end{center}
1292 \caption{Bilan synthétique des publications}\label{fig:bilan}
1293 \end{figure}
1294
1295
1296
1297
1298 % \newpage
1299 % \section{Avis du directeur de l'Equipe}\label{sec:avis:directeur}
1300
1301 %\bibliographystyle{plain}
1302 %\0\bibliography{abbrev,biblioand}
1303
1304
1305
1306 \end{document}