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Private GIT Repository
2644e4bfc8d3e56ba1784d805bd03bacff864a15
[kahina_paper2.git] / paper.tex
1
2 %% bare_conf.tex
3 %% V1.4b
4 %% 2015/08/26
5 %% by Michael Shell
6 %% See:
7 %% http://www.michaelshell.org/
8 %% for current contact information.
9 %%
10 %% This is a skeleton file demonstrating the use of IEEEtran.cls
11 %% (requires IEEEtran.cls version 1.8b or later) with an IEEE
12 %% conference paper.
13 %%
14 %% Support sites:
15 %% http://www.michaelshell.org/tex/ieeetran/
16 %% http://www.ctan.org/pkg/ieeetran
17 %% and
18 %% http://www.ieee.org/
19
20 %%*************************************************************************
21 %% Legal Notice:
22 %% This code is offered as-is without any warranty either expressed or
23 %% implied; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
24 %% FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE! 
25 %% User assumes all risk.
26 %% In no event shall the IEEE or any contributor to this code be liable for
27 %% any damages or losses, including, but not limited to, incidental,
28 %% consequential, or any other damages, resulting from the use or misuse
29 %% of any information contained here.
30 %%
31 %% All comments are the opinions of their respective authors and are not
32 %% necessarily endorsed by the IEEE.
33 %%
34 %% This work is distributed under the LaTeX Project Public License (LPPL)
35 %% ( http://www.latex-project.org/ ) version 1.3, and may be freely used,
36 %% distributed and modified. A copy of the LPPL, version 1.3, is included
37 %% in the base LaTeX documentation of all distributions of LaTeX released
38 %% 2003/12/01 or later.
39 %% Retain all contribution notices and credits.
40 %% ** Modified files should be clearly indicated as such, including  **
41 %% ** renaming them and changing author support contact information. **
42 %%*************************************************************************
43
44
45 % *** Authors should verify (and, if needed, correct) their LaTeX system  ***
46 % *** with the testflow diagnostic prior to trusting their LaTeX platform ***
47 % *** with production work. The IEEE's font choices and paper sizes can   ***
48 % *** trigger bugs that do not appear when using other class files.       ***                          ***
49 % The testflow support page is at:
50 % http://www.michaelshell.org/tex/testflow/
51
52
53
54 \documentclass[conference]{IEEEtran}
55 % Some Computer Society conferences also require the compsoc mode option,
56 % but others use the standard conference format.
57 %
58 % If IEEEtran.cls has not been installed into the LaTeX system files,
59 % manually specify the path to it like:
60 % \documentclass[conference]{../sty/IEEEtran}
61
62
63
64
65
66 % Some very useful LaTeX packages include:
67 % (uncomment the ones you want to load)
68
69
70 % *** MISC UTILITY PACKAGES ***
71 %
72 %\usepackage{ifpdf}
73 % Heiko Oberdiek's ifpdf.sty is very useful if you need conditional
74 % compilation based on whether the output is pdf or dvi.
75 % usage:
76 % \ifpdf
77 %   % pdf code
78 % \else
79 %   % dvi code
80 % \fi
81 % The latest version of ifpdf.sty can be obtained from:
82 % http://www.ctan.org/pkg/ifpdf
83 % Also, note that IEEEtran.cls V1.7 and later provides a builtin
84 % \ifCLASSINFOpdf conditional that works the same way.
85 % When switching from latex to pdflatex and vice-versa, the compiler may
86 % have to be run twice to clear warning/error messages.
87
88
89
90
91
92
93 % *** CITATION PACKAGES ***
94 %
95 %\usepackage{cite}
96 % cite.sty was written by Donald Arseneau
97 % V1.6 and later of IEEEtran pre-defines the format of the cite.sty package
98 % \cite{} output to follow that of the IEEE. Loading the cite package will
99 % result in citation numbers being automatically sorted and properly
100 % "compressed/ranged". e.g., [1], [9], [2], [7], [5], [6] without using
101 % cite.sty will become [1], [2], [5]--[7], [9] using cite.sty. cite.sty's
102 % \cite will automatically add leading space, if needed. Use cite.sty's
103 % noadjust option (cite.sty V3.8 and later) if you want to turn this off
104 % such as if a citation ever needs to be enclosed in parenthesis.
105 % cite.sty is already installed on most LaTeX systems. Be sure and use
106 % version 5.0 (2009-03-20) and later if using hyperref.sty.
107 % The latest version can be obtained at:
108 % http://www.ctan.org/pkg/cite
109 % The documentation is contained in the cite.sty file itself.
110
111
112
113
114
115
116 % *** GRAPHICS RELATED PACKAGES ***
117 %
118 \ifCLASSINFOpdf
119    \usepackage[pdftex]{graphicx}
120    
121   % declare the path(s) where your graphic files are
122   % \graphicspath{{../pdf/}{../jpeg/}}
123   % and their extensions so you won't have to specify these with
124   % every instance of \includegraphics
125   % \DeclareGraphicsExtensions{.pdf,.jpeg,.png}
126 \else
127   % or other class option (dvipsone, dvipdf, if not using dvips). graphicx
128   % will default to the driver specified in the system graphics.cfg if no
129   % driver is specified.
130   % \usepackage[dvips]{graphicx}
131   % declare the path(s) where your graphic files are
132   % \graphicspath{{../eps/}}
133   % and their extensions so you won't have to specify these with
134   % every instance of \includegraphics
135   % \DeclareGraphicsExtensions{.eps}
136 \fi
137 % graphicx was written by David Carlisle and Sebastian Rahtz. It is
138 % required if you want graphics, photos, etc. graphicx.sty is already
139 % installed on most LaTeX systems. The latest version and documentation
140 % can be obtained at: 
141 % http://www.ctan.org/pkg/graphicx
142 % Another good source of documentation is "Using Imported Graphics in
143 % LaTeX2e" by Keith Reckdahl which can be found at:
144 % http://www.ctan.org/pkg/epslatex
145 %
146 % latex, and pdflatex in dvi mode, support graphics in encapsulated
147 % postscript (.eps) format. pdflatex in pdf mode supports graphics
148 % in .pdf, .jpeg, .png and .mps (metapost) formats. Users should ensure
149 % that all non-photo figures use a vector format (.eps, .pdf, .mps) and
150 % not a bitmapped formats (.jpeg, .png). The IEEE frowns on bitmapped formats
151 % which can result in "jaggedy"/blurry rendering of lines and letters as
152 % well as large increases in file sizes.
153 %
154 % You can find documentation about the pdfTeX application at:
155 % http://www.tug.org/applications/pdftex
156
157
158
159
160
161 % *** MATH PACKAGES ***
162 %
163 \usepackage{amsmath}
164 % A popular package from the American Mathematical Society that provides
165 % many useful and powerful commands for dealing with mathematics.
166 %
167 % Note that the amsmath package sets \interdisplaylinepenalty to 10000
168 % thus preventing page breaks from occurring within multiline equations. Use:
169 %\interdisplaylinepenalty=2500
170 % after loading amsmath to restore such page breaks as IEEEtran.cls normally
171 % does. amsmath.sty is already installed on most LaTeX systems. The latest
172 % version and documentation can be obtained at:
173 % http://www.ctan.org/pkg/amsmath
174
175
176
177
178
179 % *** SPECIALIZED LIST PACKAGES ***
180 %
181
182 % algorithmic.sty was written by Peter Williams and Rogerio Brito.
183 % This package provides an algorithmic environment fo describing algorithms.
184 % You can use the algorithmic environment in-text or within a figure
185 % environment to provide for a floating algorithm. Do NOT use the algorithm
186 % floating environment provided by algorithm.sty (by the same authors) or
187 % algorithm2e.sty (by Christophe Fiorio) as the IEEE does not use dedicated
188 % algorithm float types and packages that provide these will not provide
189 % correct IEEE style captions. The latest version and documentation of
190 % algorithmic.sty can be obtained at:
191 % http://www.ctan.org/pkg/algorithms
192 % Also of interest may be the (relatively newer and more customizable)
193 % algorithmicx.sty package by Szasz Janos:
194 % http://www.ctan.org/pkg/algorithmicx
195 \usepackage[ruled,vlined]{algorithm2e}
196
197
198
199 % *** ALIGNMENT PACKAGES ***
200 %
201 %\usepackage{array}
202 % Frank Mittelbach's and David Carlisle's array.sty patches and improves
203 % the standard LaTeX2e array and tabular environments to provide better
204 % appearance and additional user controls. As the default LaTeX2e table
205 % generation code is lacking to the point of almost being broken with
206 % respect to the quality of the end results, all users are strongly
207 % advised to use an enhanced (at the very least that provided by array.sty)
208 % set of table tools. array.sty is already installed on most systems. The
209 % latest version and documentation can be obtained at:
210 % http://www.ctan.org/pkg/array
211
212
213 % IEEEtran contains the IEEEeqnarray family of commands that can be used to
214 % generate multiline equations as well as matrices, tables, etc., of high
215 % quality.
216
217
218
219
220 % *** SUBFIGURE PACKAGES ***
221 %\ifCLASSOPTIONcompsoc
222 %  \usepackage[caption=false,font=normalsize,labelfont=sf,textfont=sf]{subfig}
223 %\else
224 %  \usepackage[caption=false,font=footnotesize]{subfig}
225 %\fi
226 % subfig.sty, written by Steven Douglas Cochran, is the modern replacement
227 % for subfigure.sty, the latter of which is no longer maintained and is
228 % incompatible with some LaTeX packages including fixltx2e. However,
229 % subfig.sty requires and automatically loads Axel Sommerfeldt's caption.sty
230 % which will override IEEEtran.cls' handling of captions and this will result
231 % in non-IEEE style figure/table captions. To prevent this problem, be sure
232 % and invoke subfig.sty's "caption=false" package option (available since
233 % subfig.sty version 1.3, 2005/06/28) as this is will preserve IEEEtran.cls
234 % handling of captions.
235 % Note that the Computer Society format requires a larger sans serif font
236 % than the serif footnote size font used in traditional IEEE formatting
237 % and thus the need to invoke different subfig.sty package options depending
238 % on whether compsoc mode has been enabled.
239 %
240 % The latest version and documentation of subfig.sty can be obtained at:
241 % http://www.ctan.org/pkg/subfig
242
243
244
245
246 % *** FLOAT PACKAGES ***
247 %
248 %\usepackage{fixltx2e}
249 % fixltx2e, the successor to the earlier fix2col.sty, was written by
250 % Frank Mittelbach and David Carlisle. This package corrects a few problems
251 % in the LaTeX2e kernel, the most notable of which is that in current
252 % LaTeX2e releases, the ordering of single and double column floats is not
253 % guaranteed to be preserved. Thus, an unpatched LaTeX2e can allow a
254 % single column figure to be placed prior to an earlier double column
255 % figure.
256 % Be aware that LaTeX2e kernels dated 2015 and later have fixltx2e.sty's
257 % corrections already built into the system in which case a warning will
258 % be issued if an attempt is made to load fixltx2e.sty as it is no longer
259 % needed.
260 % The latest version and documentation can be found at:
261 % http://www.ctan.org/pkg/fixltx2e
262
263
264 %\usepackage{stfloats}
265 % stfloats.sty was written by Sigitas Tolusis. This package gives LaTeX2e
266 % the ability to do double column floats at the bottom of the page as well
267 % as the top. (e.g., "\begin{figure*}[!b]" is not normally possible in
268 % LaTeX2e). It also provides a command:
269 %\fnbelowfloat
270 % to enable the placement of footnotes below bottom floats (the standard
271 % LaTeX2e kernel puts them above bottom floats). This is an invasive package
272 % which rewrites many portions of the LaTeX2e float routines. It may not work
273 % with other packages that modify the LaTeX2e float routines. The latest
274 % version and documentation can be obtained at:
275 % http://www.ctan.org/pkg/stfloats
276 % Do not use the stfloats baselinefloat ability as the IEEE does not allow
277 % \baselineskip to stretch. Authors submitting work to the IEEE should note
278 % that the IEEE rarely uses double column equations and that authors should try
279 % to avoid such use. Do not be tempted to use the cuted.sty or midfloat.sty
280 % packages (also by Sigitas Tolusis) as the IEEE does not format its papers in
281 % such ways.
282 % Do not attempt to use stfloats with fixltx2e as they are incompatible.
283 % Instead, use Morten Hogholm'a dblfloatfix which combines the features
284 % of both fixltx2e and stfloats:
285 %
286 % \usepackage{dblfloatfix}
287 % The latest version can be found at:
288 % http://www.ctan.org/pkg/dblfloatfix
289
290
291
292
293 % *** PDF, URL AND HYPERLINK PACKAGES ***
294 %
295 %\usepackage{url}
296 % url.sty was written by Donald Arseneau. It provides better support for
297 % handling and breaking URLs. url.sty is already installed on most LaTeX
298 % systems. The latest version and documentation can be obtained at:
299 % http://www.ctan.org/pkg/url
300 % Basically, \url{my_url_here}.
301
302
303
304
305 % *** Do not adjust lengths that control margins, column widths, etc. ***
306 % *** Do not use packages that alter fonts (such as pslatex).         ***
307 % There should be no need to do such things with IEEEtran.cls V1.6 and later.
308 % (Unless specifically asked to do so by the journal or conference you plan
309 % to submit to, of course. )
310
311
312 % correct bad hyphenation here
313 \hyphenation{op-tical net-works semi-conduc-tor}
314 %\usepackage{graphicx}
315 \bibliographystyle{IEEEtran}
316 % argument is your BibTeX string definitions and bibliography database(s)
317 %\bibliography{IEEEabrv,../bib/paper}
318 %\bibliographystyle{elsarticle-num}
319
320
321
322
323 \usepackage{amsfonts}
324 \usepackage[utf8]{inputenc}
325 \usepackage[T1]{fontenc}
326 \usepackage[textsize=footnotesize]{todonotes}
327 \newcommand{\LZK}[2][inline]{%
328   \todo[color=red!10,#1]{\sffamily\textbf{LZK:} #2}\xspace}
329 \newcommand{\RC}[2][inline]{%
330   \todo[color=blue!10,#1]{\sffamily\textbf{RC:} #2}\xspace}
331 \newcommand{\KG}[2][inline]{%
332   \todo[color=green!10,#1]{\sffamily\textbf{KG:} #2}\xspace}
333 \newcommand{\AS}[2][inline]{%
334   \todo[color=orange!10,#1]{\sffamily\textbf{AS:} #2}\xspace}
335
336
337
338
339
340 \begin{document}
341 %
342 % paper title
343 % Titles are generally capitalized except for words such as a, an, and, as,
344 % at, but, by, for, in, nor, of, on, or, the, to and up, which are usually
345 % not capitalized unless they are the first or last word of the title.
346 % Linebreaks \\ can be used within to get better formatting as desired.
347 % Do not put math or special symbols in the title.
348 \title{Two parallel implementations of Ehrlich-Aberth algorithm for root-finding of polynomials on multiple GPUs with OpenMP and MPI}
349
350
351 % author names and affiliations
352 % use a multiple column layout for up to three different
353 % affiliations
354 \author{\IEEEauthorblockN{Kahina Guidouche, Abderrahmane Sider }
355   \IEEEauthorblockA{Laboratoire LIMED\\
356     Faculté des sciences exactes\\
357     Université de Bejaia, 06000, Algeria\\
358 Email: \{kahina.ghidouche,ar.sider\}@univ-bejaia.dz}
359 \and
360 \IEEEauthorblockN{Lilia Ziane Khodja, Raphaël Couturier}
361 \IEEEauthorblockA{FEMTO-ST Institute\\
362   University of   Bourgogne Franche-Comte, France\\
363 Email: zianekhodja.lilia@gmail.com\\ raphael.couturier@univ-fcomte.fr}}
364
365 % conference papers do not typically use \thanks and this command
366 % is locked out in conference mode. If really needed, such as for
367 % the acknowledgment of grants, issue a \IEEEoverridecommandlockouts
368 % after \documentclass
369
370 % for over three affiliations, or if they all won't fit within the width
371 % of the page, use this alternative format:
372
373 %\author{\IEEEauthorblockN{Michael Shell\IEEEauthorrefmark{1},
374 %Homer Simpson\IEEEauthorrefmark{2},
375 %James Kirk\IEEEauthorrefmark{3}, 
376 %Montgomery Scott\IEEEauthorrefmark{3} and
377 %Eldon Tyrell\IEEEauthorrefmark{4}}
378 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{1}School of Electrical and Computer Engineering\\
379 %Georgia Institute of Technology,
380 %Atlanta, Georgia 30332--0250\\ Email: see http://www.michaelshell.org/contact.html}
381 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{2}Twentieth Century Fox, Springfield, USA\\
382 %Email: homer@thesimpsons.com}
383 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{3}Starfleet Academy, San Francisco, California 96678-2391\\
384 %Telephone: (800) 555--1212, Fax: (888) 555--1212}
385 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{4}Tyrell Inc., 123 Replicant Street, Los Angeles, California 90210--4321}}
386
387
388
389
390 % use for special paper notices
391 %\IEEEspecialpapernotice{(Invited Paper)}
392
393
394
395
396 % make the title area
397 \maketitle
398
399 % As a general rule, do not put math, special symbols or citations
400 % in the abstract
401 \begin{abstract}
402 Finding roots of polynomials is a very important part of solving
403 real-life problems but it is not so easy for polynomials of high
404 degrees. In this paper, we present two different parallel algorithms
405 of the Ehrlich-Aberth method to find roots of sparse and fully defined
406 polynomials of high degrees. Both algorithms are based on CUDA
407 technology to be implemented on multi-GPU computing platforms but each
408 using different parallel paradigms: OpenMP or MPI. The experiments
409 show a quasi-linear speedup by using up-to 4 GPU devices compared to 1
410 GPU to find roots of polynomials of degree up-to 1.4
411 million. Moreover, other experiments show it is possible to find roots
412 of polynomials of degree up-to 5 millions.
413 \end{abstract}
414
415 % no keywords
416 \LZK{Faut pas mettre des keywords?}
417
418
419
420
421 % For peer review papers, you can put extra information on the cover
422 % page as needed:
423 % \ifCLASSOPTIONpeerreview
424 % \begin{center} \bfseries EDICS Category: 3-BBND \end{center}
425 % \fi
426 %
427 % For peerreview papers, this IEEEtran command inserts a page break and
428 % creates the second title. It will be ignored for other modes.
429 \IEEEpeerreviewmaketitle
430
431
432 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
433 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
434 \section{Introduction}
435 %Polynomials are mathematical algebraic structures that play an important role in science and engineering by capturing physical phenomena and expressing any outcome as a function of some unknown variables. Formally speaking, a polynomial $p(x)$ of degree $n$ having $n$ coefficients in the complex plane $\mathbb{C}$ is:
436 %\begin{equation}
437 %p(x)=\sum_{i=0}^{n}{a_ix^i}.
438 %\end{equation}
439 %\LZK{Dans ce cas le polynôme a $n+1$ coefficients et non pas $n$!}
440
441 %The issue of finding the roots of polynomials of very high degrees arises in many complex problems in various fields, such as algebra, biology, finance, physics or climatology [1]. In algebra for example, finding eigenvalues or eigenvectors of any real/complex matrix amounts to that of finding the roots of the so-called characteristic polynomial.
442
443 Finding roots of polynomials of very high degrees arises in many complex problems in various domains such as algebra, biology or physics. A polynomial $p(x)$ in $\mathbb{C}$ in one variable $x$ is an algebraic expression in $x$ of the form:
444 \begin{equation}
445 p(x) = \displaystyle\sum^n_{i=0}{a_ix^i},a_n\neq 0, 
446 \end{equation}
447 where $\{a_i\}_{0\leq i\leq n}$ are complex coefficients and $n$ is a high integer number. If $a_n\neq0$ then $n$ is called the degree of the polynomial. The root-finding problem consists in finding the $n$ different values of the unknown variable $x$ for which $p(x)=0$. Such values are called roots of $p(x)$. Let $\{z_i\}_{1\leq i\leq n}$ be the roots of polynomial $p(x)$, then $p(x)$ can be written as :
448 \begin{equation}
449  p(x)=a_n\displaystyle\prod_{i=1}^n(x-z_i), a_n\neq 0.
450 \end{equation}
451 %\LZK{Pourquoi $a_0a_n\neq 0$ ?: $a_0$ pour la premiere equation et $a_n$ pour la deuxieme equation }
452
453 %The problem of finding the roots of polynomials can be encountered in numerous applications. \LZK{A mon avis on peut supprimer cette phrase}
454 Most of the numerical methods that deal with the polynomial root-finding problem are simultaneous methods, \textit{i.e.} the iterative methods to find simultaneous approximations of the $n$ polynomial roots. These methods start from the initial approximations of all $n$ polynomial roots and give a sequence of approximations that converge to the roots of the polynomial. Two examples of well-known simultaneous methods for root-finding problem of polynomials are  Durand-Kerner method~\cite{Durand60,Kerner66} and Ehrlich-Aberth method~\cite{Ehrlich67,Aberth73}.
455 %\LZK{Pouvez-vous donner des références pour les deux méthodes?, c'est fait}
456
457 %The first method of this group is Durand-Kerner method:
458 %\begin{equation}
459 %\label{DK}
460 % DK: z_i^{k+1}=z_{i}^{k}-\frac{P(z_i^{k})}{\prod_{i\neq j}(z_i^{k}-z_j^{k})},   i = 1, \ldots, n,
461 %\end{equation}
462 %where $z_i^k$ is the $i^{th}$ root of the polynomial $p$ at the iteration $k$. Another method discovered by Borsch-Supan~\cite{ Borch-Supan63} and also described by Ehrlich~\cite{Ehrlich67} and Aberth~\cite{Aberth73} uses a different iteration form as follows:
463 %%\begin{center}
464 %\begin{equation}
465 %\label{Eq:EA}
466  %EA: z_i^{k+1}=z_i^{k}-\frac{1}{{\frac {P'(z_i^{k})} {P(z_i^{k})}}-{\sum_{i\neq j}\frac{1}{(z_i^{k}-z_j^{k})}}}, i = 1, \ldots, n,
467 %\end{equation}
468 %%\end{center}
469 %where $p'(z)$ is the polynomial derivative of $p$ evaluated in the point $z$.
470
471 %Aberth, Ehrlich and Farmer-Loizou~\cite{Loizou83} have proved that
472 %the Ehrlich-Aberth method (EA) has a cubic order of convergence for simple roots whereas the Durand-Kerner has a quadratic order of %convergence.
473
474 The main problem of the simultaneous methods is that the necessary
475 time needed for the convergence increases with the increasing of the
476 polynomial's degree. Many authors have treated the problem of
477 implementing  simultaneous methods in
478 parallel. Freeman~\cite{Freeman89} implemented and compared
479 Durand-Kerner method, Ehrlich-Aberth method and another method of the
480 fourth order of convergence proposed by Farmer and
481 Loizou~\cite{Loizou83} on a 8-processor linear chain, for polynomials
482 of degree up-to 8. The method of Farmer and Loizou~\cite{Loizou83}
483 often diverges, but the first two methods (Durand-Kerner and
484 Ehrlich-Aberth methods) have a speed-up equals to 5.5. Later, Freeman
485 and Bane~\cite{Freemanall90} considered asynchronous algorithms in
486 which each processor continues to update its approximations even
487 though the latest values of other approximations $z^{k}_{i}$ have not
488 been received from the other processors, in contrast with synchronous
489 algorithms where it would wait those values before making a new
490 iteration. Couturier et al.~\cite{Raphaelall01} proposed two methods
491 of parallelization for a shared memory architecture with OpenMP and
492 for a distributed memory one with MPI. They are able to compute the
493 roots of sparse polynomials of degree 10,000 in 116 seconds with
494 OpenMP and 135 seconds with MPI only by using 8 personal computers and
495 2 communications per iteration. The authors showed an interesting
496 speedup comparing to the sequential implementation which takes up-to
497 3,300 seconds to obtain same results. 
498 \RC{si on donne des temps faut donner le proc, comme c'est vieux à mon avis faut supprimer ca, votre avis?} 
499 \LZK{Supprimons ces détails et mettons une référence s'il y en a une}
500
501 Very few work had been performed since then until the appearing of the Compute Unified Device Architecture (CUDA)~\cite{CUDA15}, a parallel computing platform and a programming model invented by NVIDIA. The computing power of GPUs (Graphics Processing Units) has exceeded that of traditional processors CPUs. However, CUDA adopts a totally new computing architecture to use the hardware resources provided by the GPU in order to offer a stronger computing ability to the massive data computing. Ghidouche et al.~\cite{Kahinall14} proposed an implementation of the Durand-Kerner method on a single GPU. Their main results showed that a parallel CUDA implementation is about 10 times faster than the sequential implementation on a single CPU for sparse polynomials of degree 48,000.
502
503 %Finding polynomial roots rapidly and accurately is the main objective of our work. In this paper we propose the parallelization of Ehrlich-Aberth method using two parallel programming paradigms OpenMP and MPI on multi-GPU platforms. We consider two architectures: shared memory and distributed memory computers. The first parallel algorithm is implemented on shared memory computers by using OpenMP API. It is based on threads created from the same system process, such that each thread is attached to one GPU. In this case the communications between GPUs are done by OpenMP threads through shared memory. The second parallel algorithm uses the MPI API, such that each GPU is attached and managed by a MPI process. The GPUs exchange their data by message-passing communications. This latter approach is more used on distributed memory clusters to solve very complex problems that are too large for traditional supercomputers, which are very expensive to build and run.
504 %\LZK{Cette partie est réécrite. \\ Sinon qu'est ce qui a été fait pour l'accuracy dans ce papier (Finding polynomial roots rapidly and accurately is the main objective of our work.)?}
505 %\LZK{Les contributions ne sont pas définies !!}
506
507 %In this paper we propose the parallelization of Ehrlich-Aberth method using two parallel programming paradigms OpenMP and MPI on CUDA multi-GPU platforms. Our CUDA-MPI and CUDA-OpenMP codes are the first implementations of Ehrlich-Aberth method with multiple GPUs for finding roots of polynomials. Our major contributions include:
508 %\LZK{Pourquoi la méthode Ehrlich-Aberth et pas autres? the Ehrlich-Aberth have very good convergence  and it is suitable to be implemented in parallel computers.}
509 In this paper we propose the parallelization of Ehrlich-Aberth method which has a good convergence and it is suitable to be implemented in parallel computers. We use two parallel programming paradigms OpenMP and MPI on CUDA multi-GPU platforms. Our CUDA-MPI and CUDA-OpenMP codes are the first implementations of Ehrlich-Aberth method with multiple GPUs for finding roots of polynomials. Our major contributions include:
510 \LZK{J'ai ajouté une phrase pour justifier notre choix de la méthode Ehrlich-Aberth. A revérifier.}
511  \begin{itemize}
512  %\item An improvements for the Ehrlich-Aberth method using the exponential logarithm in order to be able to solve sparse and full polynomial of degree up to 1, 000, 000.\RC{j'ai envie de virer ca, car c'est pas la nouveauté dans ce papier}
513  %\item A parallel implementation of Ehrlich-Aberth method on single GPU with CUDA.\RC{idem}
514 \item The parallel implementation of Ehrlich-Aberth algorithm on a multi-GPU platform with a shared memory using OpenMP API. It is based on threads created from the same system process, such that each thread is attached to one GPU. In this case the communications between GPUs are done by OpenMP threads through shared memory.
515 \item The parallel implementation of Ehrlich-Aberth algorithm on a multi-GPU platform with a distributed memory using MPI API, such that each GPU is attached and managed by a MPI process. The GPUs exchange their data by message-passing communications. 
516  \end{itemize}
517 This latter approach is more used on clusters to solve very complex problems that are too large for traditional supercomputers, which are very expensive to build and run.
518 \LZK{Pas d'autres contributions possibles? J'ai supprimé les deux premiers points proposés précédemment.}
519
520 %This paper is organized as follows. In Section~\ref{sec2} we recall the Ehrlich-Aberth method. In section~\ref{sec3} we present EA algorithm on single GPU. In section~\ref{sec4} we propose the EA algorithm implementation on Multi-GPU for (OpenMP-CUDA) approach and (MPI-CUDA) approach. In sectioné\ref{sec5} we present our experiments and discus it. Finally, Section~\ref{sec6} concludes this paper and gives some hints for future research directions in this topic.}
521
522 The paper is organized as follows. In Section~\ref{sec2} we present three different parallel programming models OpenMP, MPI and CUDA. In Section~\ref{sec3} we present the implementation of the Ehrlich-Aberth algorithm on a single GPU. In Section~\ref{sec4} we present the parallel implementations of the Ehrlich-Aberth algorithm on multiple GPUs using the OpenMP and MPI approaches. In section~\ref{sec5} we present our experiments and discuss them. Finally, Section~\ref{sec6} concludes this paper and gives some hints for future research directions in this topic. 
523 %\LZK{A revoir toute cette organization: je viens de la revoir}
524
525 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
526 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
527  
528 \section{Parallel programming models}
529 \label{sec2}
530 Our objective consists in implementing a root-finding algorithm of polynomials on multiple GPUs. To this end, it is primordial to know how to manage CUDA contexts of different GPUs. A direct method for controlling the various GPUs is to use as many threads or processes as GPU devices. We investigate two parallel paradigms: OpenMP and MPI. In this case, the GPU indices are defined according to the identifiers of the OpenMP threads or the ranks of the MPI processes. In this section we present the parallel programming models: OpenMP, MPI and CUDA.
531  
532 \subsection{OpenMP}
533 %Open Multi-Processing (OpenMP) is a shared memory architecture API that provides multi thread capacity~\cite{openmp13}. OpenMP is a portable approach for parallel programming on shared memory systems based on compiler directives, that can be included in order to parallelize a loop. In this way, a set of loops can be distributed along the different threads that will access to different data allocated in local shared memory. One of the advantages of OpenMP is its global view of application memory address space that allows relatively fast development of parallel applications with easier maintenance. However, it is often difficult to get high rates of performance in large scale applications. Although usage of OpenMP  threads and managed data explicitly done with MPI can be considered, this approcache undermines the advantages of OpenMP.
534
535 %\subsection{OpenMP} 
536 %OpenMP is a shared memory programming API based on threads from
537 %the same system process. Designed for multiprocessor shared memory UMA or
538 %NUMA [10], it relies on the execution model SPMD ( Single Program, Multiple Data Stream )
539 %where the thread "master" and threads "slaves" asynchronously execute their codes
540 %communicate / synchronize via shared memory [7]. It also helps to build
541 %the loop parallelism and is very suitable for an incremental code parallelization
542 %Sequential natively. Threads share some or all of the available memory and can
543 %have private memory areas [6].
544
545 OpenMP (Open Multi-processing) is an application programming interface for parallel programming~\cite{openmp13}. It is a portable approach based on the multithreading designed for shared memory computers, where a master thread forks a number of slave threads which execute blocks of code in parallel. An OpenMP program alternates sequential regions and parallel regions of code, where the sequential regions are executed by the master thread and the parallel ones may be executed by multiple threads. During the execution of an OpenMP program the threads communicate their data (read and modified) in the shared memory. One advantage of OpenMP is the global view of the memory address space of an application. This allows relatively a fast development of parallel applications with easier maintenance. However, it is often difficult to get high rates of performances in large scale-applications. 
546
547 \subsection{MPI} 
548 %The MPI (Message Passing Interface) library allows to create computer programs that run on a distributed memory architecture. The various processes have their own environment of execution and execute their code in a asynchronous way, according to the MIMD model  (Multiple Instruction streams, Multiple Data streams); they communicate and synchronize by exchanging messages~\cite{Peter96}. MPI messages are explicitly sent, while the exchanges are implicit within the framework of a multi-thread programming environment like OpenMP or Pthreads.
549
550 MPI (Message Passing Interface) is a portable message passing style of the parallel programming designed especially for the distributed memory architectures~\cite{Peter96}. In most MPI implementations, a computation contains a fixed set of processes created at the initialization of the program in such way one process is created per processor. The processes synchronize their computations and communicate by sending/receiving messages to/from other processes. In this case, the data are explicitly exchanged by message passing while the data exchanges are implicit in a multithread programming model like OpenMP and Pthreads. However in the MPI programming model, the processes may either execute different programs referred to as multiple program multiple data (MPMD) or every process executes the same program (SPMD). The MPI approach is one of most used HPC programming model to solve large scale and complex applications.
551  
552 \subsection{CUDA}
553 %CUDA (is an acronym of the Compute Unified Device Architecture) is a parallel computing architecture developed by NVIDIA~\cite{CUDA10}.The unit of execution in CUDA is called a thread. Each thread executes a kernel by the streaming processors in parallel. In CUDA, a group of threads that are executed together is called a thread block, and the computational grid consists of a grid of thread blocks. Additionally, a thread block can use the shared memory on a single multiprocessor while the grid executes a single CUDA program logically in parallel. Thus in CUDA programming, it is necessary to design carefully the arrangement of the thread blocks in order to ensure low latency and a proper usage of shared memory, since it can be shared only in a thread block scope. The effective bandwidth of each memory space depends on the memory access pattern. Since the global memory has lower bandwidth than the shared memory, the global memory accesses should be minimized.
554
555 CUDA (Compute Unified Device Architecture) is a parallel computing architecture developed by NVIDIA~\cite{CUDA15} for GPUs. It provides a high level GPGPU-based programming model to program GPUs for general purpose computations and non-graphic applications. The GPU is viewed as an accelerator such that data-parallel operations of a CUDA program running on a CPU are off-loaded onto GPU and executed by this later. The data-parallel operations executed by GPUs are called kernels. The same kernel is executed in parallel by a large number of threads organized in grids of thread blocks, such that each GPU multiprocessor executes one or more thread blocks in SIMD fashion (Single Instruction, Multiple Data) and in turn each core of the multiprocessor executes one or more threads within a block. Threads within a block can cooperate by sharing data through a fast shared memory and coordinate their execution through synchronization points. In contrast, within a grid of thread blocks, there is no synchronization at all between blocks. The GPU only works on data filled in the global memory and the final results of the kernel executions must be transferred out of the GPU. In the GPU, the global memory has lower bandwidth than the shared memory associated to each multiprocessor. Thus in the CUDA programming, it is necessary to design carefully the arrangement of the thread blocks in order to ensure low latency and a proper usage of the shared memory, and the global memory accesses should be minimized.
556
557 %We introduced three paradigms of parallel programming. Our objective consists in implementing a root finding polynomial algorithm on multiple GPUs. To this end, it is primordial to know how to manage CUDA contexts of different GPUs. A direct method for controlling the various GPUs is to use as many threads or processes as GPU devices. We can choose the GPU index based on the identifier of OpenMP thread or the rank of the MPI process. Both approaches will be investigated.
558
559 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
560 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
561
562 \section{The Ehrlich-Aberth algorithm on a GPU}
563 \label{sec3}
564
565 \subsection{The Ehrlich-Aberth method}
566 %A cubically convergent iteration method to find zeros of
567 %polynomials was proposed by O. Aberth~\cite{Aberth73}. The
568 %Ehrlich-Aberth (EA is short) method contains 4 main steps, presented in what
569 %follows.
570
571 %The Aberth method is a purely algebraic derivation. 
572 %To illustrate the derivation, we let $w_{i}(z)$ be the product of linear factors 
573
574 %\begin{equation}
575 %w_{i}(z)=\prod_{j=1,j \neq i}^{n} (z-x_{j})
576 %\end{equation}
577
578 %And let a rational function $R_{i}(z)$ be the correction term of the
579 %Weistrass method~\cite{Weierstrass03}
580
581 %\begin{equation}
582 %R_{i}(z)=\frac{p(z)}{w_{i}(z)} , i=1,2,...,n.
583 %\end{equation}
584
585 %Differentiating the rational function $R_{i}(z)$ and applying the
586 %Newton method, we have:
587
588 %\begin{equation}
589 %\frac{R_{i}(z)}{R_{i}^{'}(z)}= \frac{p(z)}{p^{'}(z)-p(z)\frac{w_{i}(z)}{w_{i}^{'}(z)}}= \frac{p(z)}{p^{'}(z)-p(z) \sum _{j=1,j \neq i}^{n}\frac{1}{z-x_{j}}}, i=1,2,...,n
590 %\end{equation}
591 %where R_{i}^{'}(z)is the rational function derivative of F evaluated in the point z 
592 %Substituting $x_{j}$ for $z_{j}$ we obtain the Aberth iteration method.% 
593
594
595 %\subsubsection{Polynomials Initialization}
596 %The initialization of a polynomial $p(z)$ is done by setting each of the $n$ complex coefficients %$a_{i}$:
597
598 %\begin{equation}
599 %\label{eq:SimplePolynome}
600 %  p(z)=\sum{a_{i}z^{n-i}} , a_{n} \neq 0,a_{0}=1, a_{i}\subset C
601 %\end{equation}
602
603
604 %\subsubsection{Vector $Z^{(0)}$ Initialization}
605 %\label{sec:vec_initialization}
606 %As for any iterative method, we need to choose $n$ initial guess points $z^{0}_{i}, i = 1, . . . , %n.$
607 %The initial guess is very important since the number of steps needed by the iterative method to %reach
608 %a given approximation strongly depends on it.
609 %In~\cite{Aberth73} the Ehrlich-Aberth iteration is started by selecting $n$
610 %equi-distant points on a circle of center 0 and radius r, where r is
611 %an upper bound to the moduli of the zeros. Later, Bini and al.~\cite{Bini96}
612 %performed this choice by selecting complex numbers along different
613 %circles which relies on the result of~\cite{Ostrowski41}.
614
615 %\begin{equation}
616 %\label{eq:radiusR}
617 %%\begin{align}
618 %\sigma_{0}=\frac{u+v}{2};u=\frac{\sum_{i=1}^{n}u_{i}}{n.max_{i=1}^{n}u_{i}};
619 %v=\frac{\sum_{i=0}^{n-1}v_{i}}{n.min_{i=0}^{n-1}v_{i}};\\
620 %%\end{align}
621 %\end{equation}
622 %Where:
623 %\begin{equation}
624 %u_{i}=2.|a_{i}|^{\frac{1}{i}};
625 %v_{i}=\frac{|\frac{a_{n}}{a_{i}}|^{\frac{1}{n-i}}}{2}.
626 %\end{equation}
627
628 %\subsubsection{Iterative Function}
629 %The operator used by the Aberth method  corresponds to the
630 %equation~\ref{Eq:EA1}, it enables the convergence towards
631 %the polynomials zeros, provided all the roots are distinct.
632
633 %Here we give a second form of the iterative function used by the Ehrlich-Aberth method: 
634
635 %\begin{equation}
636 %\label{Eq:EA-1}
637 %EA: z^{k+1}_{i}=z_{i}^{k}-\frac{\frac{p(z_{i}^{k})}{p'(z_{i}^{k})}}
638 %{1-\frac{p(z_{i}^{k})}{p'(z_{i}^{k})}\sum_{j=1,j\neq i}^{j=n}{\frac{1}{(z_{i}^{k}-z_{j}^{k})}}}, %i=1,. . . .,n
639 %\end{equation}
640
641 %\subsubsection{Convergence Condition}
642 %The convergence condition determines the termination of the algorithm. It consists in stopping the %iterative function  when the roots are sufficiently stable. We consider that the method converges %sufficiently when:
643
644 %\begin{equation}
645 %\label{eq:AAberth-Conv-Cond}
646 %\forall i \in [1,n];\vert\frac{z_{i}^{k}-z_{i}^{k-1}}{z_{i}^{k}}\vert<\xi
647 %\end{equation}
648
649
650 %\begin{figure}[htbp]
651 %\centering
652  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{EA-Algorithm}
653 %\caption{The Ehrlich-Aberth algorithm on single GPU}
654 %\label{fig:03}
655 %\end{figure}
656
657 %the Ehrlich-Aberth method is an iterative  method, contain 4 steps, start from the initial approximations of all the roots of the polynomial,the second step initialize the solution vector $Z$ using the Guggenheimer method to assure the distinction of the initial vector roots, than in step 3 we apply the the iterative function based on the Newton's method and Weiestrass operator~\cite{,}, witch will make it possible to converge to the roots solution, provided that all the root are different.
658
659 The Ehrlich-Aberth method is a simultaneous method~\cite{Aberth73} using the following iteration
660 \begin{equation}
661 \label{Eq:EA1}
662 z^{k+1}_{i}=z_{i}^{k}-\frac{\frac{p(z_{i}^{k})}{p'(z_{i}^{k})}}
663 {1-\frac{p(z_{i}^{k})}{p'(z_{i}^{k})}\sum_{j=1,j\neq i}^{j=n}{\frac{1}{(z_{i}^{k}-z_{j}^{k})}}}, i=1,\ldots,n
664 \end{equation}
665
666 This method contains 4 steps. The first step consists in the
667 initializing the polynomial.\LZK{Pas compris?? \RC{changé}}.
668 The second step initializes the solution vector $Z$ using the
669 Guggenheimer method~\cite{Gugg86} to ensure that initial roots are all
670 distinct from each other. \LZK{Quelle est la différence entre la 1st
671   step et la 2nd step? Que veut dire " to ensure the distinction of
672   the initial vector roots"? \RC{reformulé}} 
673 In step 3, the iterative function based on the Newton's
674 method~\cite{newt70} and Weiestrass operator~\cite{Weierstrass03} is
675 applied. In our case, the  Ehrlich-Aberth is applied as in (\ref{Eq:EA1}).
676 Iterations of the EA method will converge to the roots of the
677 considered polynomial.\LZK{On ne peut pas expliquer un peu plus
678   comment? Donner des formules comment elle se base sur la méthode de
679   Newton et de l'opérateur de  Weiestrass? \RC{amélioré}}
680 \LZK{Elle est où la 4th step??}
681 \LZK{Conclusion: Méthode mal présentée et j'ai presque rien compris!
682   \RC{après} }
683
684
685 In order to stop the iterative function, a stop condition is applied,
686 this is the 4th step. This condition checks that all the root modules
687 are lower than a fixed value $\epsilon$.
688
689 \begin{equation}
690 \label{eq:Aberth-Conv-Cond}
691 \forall i\in[1,n],~\vert\frac{z_i^k-z_i^{k-1}}{z_i^k}\vert<\epsilon
692 \end{equation}
693
694 \LZK{On ne dit pas plutôt "the relative errors" à la place de "root
695   modules"? Raph nous confirmera quelle critère d'arrêt a
696   utilisé. \RC{normalement c'est bon, l'erreur est calculée avec le
697     module de chaque racine}}
698
699 \subsection{Improving Ehrlich-Aberth method}
700 With high degree polynomials, the Ehrlich-Aberth method suffers from floating point overflows due to the mantissa of floating points representations. This induces errors in the computation of $p(z)$ when $z$ is large.
701  
702 %Experimentally, it is very difficult to solve polynomials with the Ehrlich-Aberth method and have roots which except the circle of unit, represented by the radius $r$ evaluated as: 
703
704 %\begin{equation}
705 %\label{R.EL}
706 %R = exp(log(DBL\_MAX)/(2*n) );
707 %\end{equation}
708
709
710
711 % where \verb=DBL_MAX= stands for the maximum representable \verb=double= value.
712  
713 In order to solve this problem, we propose to modify the iterative
714 function by using the logarithm and the exponential of a complex and
715 we propose a new version of the Ehrlich-Aberth method.  This method
716 allows us to exceed the computation of the polynomials of degree
717 100,000 and to reach a degree up to more than 1,000,000. The reformulation of the iteration~(\ref{Eq:EA1}) of the Ehrlich-Aberth method with exponential and logarithm is defined as follows, for $i=1,\dots,n$:
718
719 \begin{equation}
720 \label{Log_H2}
721 z^{k+1}_i = z_i^k - \exp(\ln(p(z_i^k)) - \ln(p'(z^k_i)) - \ln(1-Q(z^k_i))),
722 \end{equation}
723
724 where:
725
726 \begin{equation}
727 \label{Log_H1}
728 Q(z^k_i) = \exp(\ln(p(z^k_i)) - \ln(p'(z^k_i)) + \ln(\sum_{i\neq j}^n\frac{1}{z^k_i-z^k_j})).
729 \end{equation}
730
731
732 %We propose to use the logarithm and the exponential of a complex in order to compute the power at a high exponent. 
733 Using the logarithm  and the exponential operators, we can replace any
734 multiplications and divisions with additions and
735 subtractions. Consequently, computations manipulate lower values in absolute
736 values~\cite{Karimall98}. \LZK{Je n'ai pas compris cette dernière
737   phrase? \RC{changé : on veut dire on manipule des valeurs plus petites en valeur absolues}}
738
739 %This problem was discussed earlier in~\cite{Karimall98} for the Durand-Kerner method. The authors
740 %propose to use the logarithm and the exponential of a complex in order to compute the power at a high exponent. Using the logarithm  and the exponential operators, we can replace any multiplications and divisions with additions and subtractions. Consequently, computations manipulate lower absolute values and the roots for large polynomial degrees can be looked for successfully~\cite{Karimall98}.
741
742 \subsection{The Ehrlich-Aberth parallel implementation on CUDA}
743 %We introduced three paradigms of parallel programming.
744
745 Our objective consists in implementing a root finding polynomial
746 algorithm on multiple GPUs. To this end, it is primordial to know how
747 to manage CUDA contexts of different GPUs. A direct method for
748 controlling the various GPUs is to use as many threads or processes as
749 GPU devices. We can choose the GPU index based on the identifier of
750 OpenMP thread or the rank of the MPI process. Both approaches will be
751 investigated. \LZK{Répétition! Le même texte est déjà écrit comme
752   intro dans la section II. Sinon ici on parle seulement de
753   l'implémentation cuda sans mpi et openmp! \RC{Je suis d'accord à
754     revoir après, quand les 2 parties suivantes seront plus stables}}
755
756
757
758
759 Like any parallel code, a GPU parallel implementation first requires to determine the sequential code and the data-parallel operations of a algorithm. In fact, all the operations that are easy to execute in parallel must be made by the GPU to accelerate the execution, like the steps 3 and 4. On the other hand, all the sequential operations and the operations that have data dependencies between CUDA threads or recursive computations must be executed by only one CUDA thread or a CPU thread (the steps 1 and 2).\LZK{La méthode est déjà mal présentée, dans ce cas c'est encore plus difficile de comprendre que représentent ces différentes étapes!} Initially, we specify the organization of parallel threads by specifying the dimension of the grid \verb+Dimgrid+, the number of blocks per grid \verb+DimBlock+ and the number of threads per block.
760
761 The code is organized as kernels which are parts of code that are run on GPU devices. For step 3, there are two kernels, the first is named \textit{save} is used to save vector $Z^{K-1}$ and the second one is
762 named \textit{update} and is used to update the $Z^{K}$ vector. For
763 step 4, a kernel tests the convergence of the method. In order to
764 compute the function H, we have two possibilities: either to use the
765 Jacobi mode, or the Gauss-Seidel mode of iterating which uses the most
766 recent computed roots. It is well known that the Gauss-Seidel mode
767 converges more quickly. So, we use Gauss-Seidel iterations. To
768 parallelize the code, we create kernels and many functions to be
769 executed on the GPU for all the operations dealing with the
770 computation on complex numbers and the evaluation of the
771 polynomials. As said previously, we manage both functions of
772 evaluation: the normal method, based on the method of
773 Horner and the method based on the logarithm of the polynomial. All
774 these methods were rather long to implement, as the development of
775 corresponding kernels with CUDA is longer than on a CPU host. This
776 comes in particular from the fact that it is very difficult to debug
777 CUDA running threads like threads on a CPU host. In the following
778 paragraph Algorithm~\ref{alg1-cuda} shows the GPU parallel
779 implementation of Ehrlich-Aberth method.
780 \LZK{Vaut mieux expliquer l'implémentation en faisant référence à l'algo séquentiel que de parler des différentes steps.}
781
782 \begin{algorithm}[htpb]
783 \label{alg1-cuda}
784 \LinesNumbered
785 \SetAlgoNoLine
786 \caption{CUDA Algorithm to find roots with the Ehrlich-Aberth method}
787
788 \KwIn{$Z^{0}$ (Initial root's vector), $\varepsilon$ (Error tolerance
789   threshold), P (Polynomial to solve), Pu (Derivative of P), $n$ (Polynomial degrees), $\Delta z_{max}$ (Maximum value of stop condition)}
790
791 \KwOut {$Z$ (Solution root's vector), $ZPrec$ (Previous solution root's vector)}
792
793 %\BlankLine
794
795 Initialization of P\;
796 Initialization of Pu\;
797 Initialization of the solution vector $Z^{0}$\;
798 Allocate and copy initial data to the GPU global memory\;
799 \While {$\Delta z_{max} > \epsilon$}{
800    $ ZPres=kernel\_save(Z)$\;
801    $ Z=kernel\_update(Z,P,Pu)$\;
802  $\Delta z_{max}=kernel\_testConv(Z,ZPrec)$\;
803
804 }
805 Copy results from GPU memory to CPU memory\;
806 \end{algorithm}
807 \RC{Si l'algo vous convient, il faudrait le détailler précisément}
808  
809 \section{The EA algorithm on Multiple GPUs}
810 \label{sec4}
811 \subsection{an OpenMP-CUDA approach}
812 Our OpenMP-CUDA implementation of EA algorithm is based on the hybrid
813 OpenMP and CUDA programming model.  All the data are shared with
814 OpenMP amoung all the OpenMP threads. The shared data are the solution
815 vector $Z$, the polynomial to solve $P$, and the error vector $\Delta
816 z$. The number of OpenMP threads is equal to the number of GPUs, each
817 OpenMP thread binds to one GPU, and it controls a part of the shared
818 memory. More precisely each OpenMP thread will be responsible to
819 update its owns part of the vector Z. This part is call $Z_{loc}$ in
820 the following. Then all GPUs will have a grid of computation organized
821 according to the device performance and the size of data on which it
822 runs the computation kernels.
823
824 To compute one iteration of the EA method each GPU performs the
825 followings steps. First roots are shared with OpenMP and the
826 computation of the local size for each GPU is performed (lines 5-7 in
827 Algo\ref{alg2-cuda-openmp}). Each thread starts by copying all the
828 previous roots inside its GPU (line 9). Then each GPU will copy the
829 previous roots (line 10) and it will compute an iteration of the EA
830 method on its own roots (line 11).  For that all the other roots are
831 used. The convergence is checked on the new roots (line 12). At the end
832 of an iteration, the updated roots are copied from the GPU to the
833 CPU (line 14) by direcly updating its own roots in the shared memory
834 arrays containing all the roots.
835
836 %In principle a grid is set by two parameter DimGrid, the number of block per grid, DimBloc: the number of threads per block. The following schema  shows the architecture of (CUDA,OpenMP).
837
838 %\begin{figure}[htbp]
839 %\centering
840  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{OpenMP-CUDA}
841 %\caption{The OpenMP-CUDA architecture}
842 %\label{fig:03}
843 %\end{figure}
844 %Each thread OpenMP compute the kernels on GPUs,than after each iteration they copy out the data from GPU memory to CPU shared memory. The kernels are re-runs is up to the roots converge sufficiently. Here are below the corresponding algorithm:
845
846 %% \RC{Surement à virer ou réécrire pour etre compris sans algo}
847 %% $num\_gpus$ OpenMP threads  are created using
848 %% \verb=omp_set_num_threads();=function (step $3$, Algorithm
849 %% \ref{alg2-cuda-openmp}), the shared memory is created using
850 %% \verb=#pragma omp parallel shared()= OpenMP function (line $5$,
851 %% Algorithm\ref{alg2-cuda-openmp}), then each OpenMP thread allocates
852 %% memory and copies initial data from CPU memory to GPU global memory,
853 %% executes the kernels on GPU, but computes only his portion of roots
854 %% indicated with variable \textit{index} initialized in (line 5,
855 %% Algorithm \ref{alg2-cuda-openmp}), used as input data in the
856 %% $kernel\_update$ (line 10, Algorithm \ref{alg2-cuda-openmp}). After
857 %% each iteration, all OpenMP threads synchronize using
858 %% \verb=#pragma omp barrier;= to gather all the correct values of
859 %% $\Delta z$, thus allowing the computation the maximum stop condition
860 %% on vector $\Delta z$ (line 12, Algorithm
861 %% \ref{alg2-cuda-openmp}). Finally, threads copy the results from GPU
862 %% memories to CPU memory. The OpenMP threads execute kernels until the
863 %% roots sufficiently converge.
864
865
866 \begin{algorithm}[h]
867 \label{alg2-cuda-openmp}
868 \LinesNumbered
869 \SetAlgoNoLine
870 \caption{CUDA-OpenMP Algorithm to find roots with the Ehrlich-Aberth method}
871
872 \KwIn{$Z^{0}$ (Initial root's vector), $\varepsilon$ (Error tolerance
873   threshold), P (Polynomial to solve), Pu (Derivative of P), $n$ (Polynomial degree), $\Delta z$ ( Vector of errors for stop condition), $num\_gpus$ (number of OpenMP threads/ Number of GPUs), $Size$ (number of roots)}
874
875 \KwOut {$Z$ ( Root's vector), $ZPrec$ (Previous root's vector)}
876
877 \BlankLine
878
879 Initialization of P\;
880 Initialization of Pu\;
881 Initialization of the solution vector $Z^{0}$\;
882 Start of a parallel part with OpenMP (Z, $\Delta z$, P are shared variables)\;
883 gpu\_id=cudaGetDevice()\; 
884 Allocate memory on GPU\;
885 Compute local size and offet according to gpu\_id\;
886 \While {$error > \epsilon$}{
887   copy Z from CPU to GPU\;
888 $ ZPrec_{loc}=kernel\_save(Z_{loc})$\;
889 $ Z_{loc}=kernel\_update(Z,P,Pu)$\;
890 $\Delta z[gpu\_id] = kernel\_testConv(Z_{loc},ZPrec_{loc})$\;
891 $  error= Max(\Delta z)$\;
892   copy $Z_{loc}$ from GPU to Z in CPU
893 }
894 \end{algorithm}
895
896
897
898 \subsection{an MPI-CUDA approach}
899 %\begin{figure}[htbp]
900 %\centering
901  % \includegraphics[angle=-90,width=0.2\textwidth]{MPI-CUDA}
902 %\caption{The MPI-CUDA architecture }
903 %\label{fig:03}
904 %\end{figure}
905 Our parallel implementation of EA to find root of polynomials using a CUDA-MPI approach is a data parallel approach. It splits input data of the polynomial to solve among MPI processes. In Algorithm \ref{alg2-cuda-mpi}, input data are the polynomial to solve $P$, the solution vector $Z$, the previous solution vector $ZPrev$, and the value of errors of stop condition $\Delta z$. Let $p$ denote the number of MPI processes on and $n$ the degree of the polynomial to be solved. The algorithm performs a simple data partitioning by creating $p$ portions, of at most $\lceil n/p \rceil$ roots to find per MPI process, for each $Z$ and $ZPrec$. Consequently, each MPI process of rank $k$ will have its own solution vector $Z_{k}$ and $ZPrec$, the error related to the stop condition $\Delta z_{k}$, enabling each MPI process to compute $\lceil n/p \rceil$ roots.
906
907 Since a GPU works only on data already allocated in its memory, all local input data, $Z_{k}$, $ZPrec$ and $\Delta z_{k}$, must be transferred from CPU memories to the corresponding GPU memories. Afterwards, the same EA algorithm (Algorithm \ref{alg1-cuda}) is run by all processes but on different polynomial subset of roots $ p(x)_{k}=\sum_{i=1}^{n} a_{i}x^{i}, k=1,...,p$.  Each MPI process executes the  loop \verb=(While(...)...do)= containing the CUDA kernels but each MPI process  computes only its own portion of the roots according to the rule ``''owner computes``''. The local range of roots is indicated with the \textit{index} variable initialized at (line 5, Algorithm \ref{alg2-cuda-mpi}), and passed as an input variable to $kernel\_update$ (line 10, Algorithm \ref{alg2-cuda-mpi}). After each iteration, MPI processes synchronize  (\verb=MPI_Allreduce= function) by a reduction on $\Delta z_{k}$ in order to compute the maximum error related to the stop condition.   Finally, processes copy the values of new computed roots  from GPU memories to CPU memories, then communicate their results to other processes with \verb=MPI_Alltoall= broadcast. If the stop condition is not verified ($error > \epsilon$) then processes stay withing the loop \verb= while(...)...do= until all the roots sufficiently converge.
908
909 \begin{algorithm}[htpb]
910 \label{alg2-cuda-mpi}
911 %\LinesNumbered
912 \caption{CUDA-MPI Algorithm to find roots with the Ehrlich-Aberth method}
913
914 \KwIn{$Z^{0}$ (Initial root's vector), $\varepsilon$ (Error tolerance
915   threshold), P (Polynomial to solve), Pu (Derivative of P), $n$ (Polynomial degrees), $\Delta z$ ( error of stop condition), $num_gpus$ (number of MPI processes/ number of GPUs), Size (number of roots)}
916
917 \KwOut {$Z$ (Solution root's vector), $ZPrec$ (Previous solution root's vector)}
918
919 \BlankLine
920 Initialization of P\;
921 Initialization of Pu\;
922 Initialization of the solution vector $Z^{0}$\;
923 Distribution of Z\;
924 Allocate memory to GPU\;
925 \While {$error > \epsilon$}{
926 copy Z from CPU to GPU\;
927 $ZPrec_{loc}=kernel\_save(Z_{loc})$\;
928 $Z_{loc}=kernel\_update(Z,P,Pu)$\;
929 $\Delta z=kernel\_testConv(Z_{loc},ZPrec_{loc})$\;
930 $error=MPI\_Reduce(\Delta z)$\;
931 Copy $Z_{loc}$ from GPU to CPU\;
932 $Z=MPI\_AlltoAll(Z_{loc})$\;
933 }
934 \end{algorithm}
935
936
937 \section{Experiments}
938 \label{sec5}
939 We study two categories of polynomials: sparse polynomials and full polynomials.\\
940 {\it A sparse polynomial} is a polynomial for which only some coefficients are not null. In this paper, we consider sparse polynomials for which the roots are distributed on 2 distinct circles:
941 \begin{equation}
942         \forall \alpha_{1} \alpha_{2} \in C,\forall n_{1},n_{2} \in N^{*}; P(z)= (z^{n_{1}}-\alpha_{1})(z^{n_{2}}-\alpha_{2})
943 \end{equation}\noindent
944 {\it A full polynomial} is, in contrast, a polynomial for which all the coefficients are not null. A full polynomial is defined by:
945 %%\begin{equation}
946         %%\forall \alpha_{i} \in C,\forall n_{i}\in N^{*}; P(z)= \sum^{n}_{i=1}(z^{n^{i}}.a_{i})
947 %%\end{equation}
948
949 \begin{equation}
950      {\Large \forall a_{i} \in C, i\in N;  p(x)=\sum^{n}_{i=0} a_{i}.x^{i}} 
951 \end{equation}
952
953 For our test, 4 cards GPU tesla Kepler K40 are used.  In order to
954 evaluate both the GPU and Multi-GPU approaches, we performed a set of
955 experiments on a single GPU and multiple GPUs using OpenMP or MPI with
956 the EA algorithm, for both sparse and full polynomials of different
957 sizes.  All experimental results obtained are perfomed with double
958 precision float data and the convergence threshold of the EA method is
959 set to $10^{-7}$.  The initialization values of the vector solution of
960 the methods are given by Guggenheimer method~\cite{Gugg86}.
961
962
963 \subsection{Evaluation of the CUDA-OpenMP approach}
964
965 Here we report some experiments witt full and sparse polynomials of
966 different degrees with multiple GPUs.
967 \subsubsection{Execution times of the EA method to solve sparse polynomials on multiple GPUs}
968  
969 In this experiments we report the execution time of the EA algorithm, on single GPU and multi-GPUs with (2,3,4) GPUs, for different sparse polynomial degrees ranging from 100,000 to 1,400,000.
970
971 \begin{figure}[htbp]
972 \centering
973   \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Sparse_omp}
974 \caption{Execution time in seconds of the Ehrlich-Aberth method to
975   solve sparse polynomials on multiple GPUs with CUDA-OpenMP.}
976 \label{fig:01}
977 \end{figure}
978
979 Figure~\ref{fig:01} shows that the CUDA-OpenMP approach scales well
980 with multiple GPUs. This version allows us to solve sparse polynomials
981 of very high degrees.
982
983 \subsubsection{Execution times of the EA method to solve full polynomials on multiple GPUs}
984
985 These experiments show the execution times of the EA algorithm, on a single GPU and on multiple GPUs using the CUDA OpenMP approach for full polynomials of degrees ranging from 100,000 to 1,400,000.
986
987 \begin{figure}[htbp]
988 \centering
989   \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Full_omp}
990 \caption{Execution time in seconds of the Ehrlich-Aberth method to
991   solve full polynomials on multiple GPUs with CUDA-OpenMP.}
992 \label{fig:02}
993 \end{figure}
994
995 In Figure~\ref{fig:02}, we can observe that with full polynomials the EA version with
996 CUDA-OpenMP scales also well. Using 4 GPUs allows us to achieve a
997 quasi-linear speedup.
998
999 \subsection{Evaluation of the CUDA-MPI approach}
1000 In this part we perform some experiments to evaluate the CUDA-MPI
1001 approach to solve full and sparse polynomials of degrees ranging from
1002 100,000 to 1,400,000.
1003
1004 \subsubsection{Execution times of the EA method to solve sparse polynomials on multiple GPUs}
1005
1006 \begin{figure}[htbp]
1007 \centering
1008   \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Sparse_mpi}
1009 \caption{Execution time in seconds of the Ehrlich-Aberth method to
1010   solve sparse polynomials on multiple GPUs with CUDA-MPI.}
1011 \label{fig:03}
1012 \end{figure}
1013 Figure~\ref{fig:03} shows the execution times of te EA algorithm,
1014 for a single GPU, and multiple GPUs (2, 3, 4) with the CUDA-MPI approach.
1015
1016 \subsubsection{Execution time of the Ehrlich-Aberth method for solving full polynomials on multiple GPUs using the Multi-GPU appraoch}
1017
1018 \begin{figure}[htbp]
1019 \centering
1020  \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Full_mpi}
1021 \caption{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for
1022   full polynomials on  multiple GPUs with CUDA-MPI.}
1023 \label{fig:04}
1024 \end{figure}
1025
1026 In Figure~\ref{fig:04}, we can also observe that the CUDA-MPI approach
1027 is also efficient to solve full polynimails on multiple GPUs.
1028
1029 \subsection{Comparison of  the CUDA-OpenMP and the CUDA-MPI approaches}
1030
1031 In the previuos section we saw that both approches are very effecient
1032 to  reduce the execution times the  sparse and full polynomials. In
1033 this section we try to compare these two approaches.
1034
1035 \subsubsection{Solving sparse polynomials}
1036 In this experiment three sparse polynomials of size 200K, 800K and 1,4M are investigated.
1037 \begin{figure}[htbp]
1038 \centering
1039  \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Sparse}
1040 \caption{Execution times  to solvs sparse polynomials of three
1041   distinct sizes on multiple GPUs using MPI and OpenMP with the
1042   Ehrlich-Aberth method}
1043 \label{fig:05}
1044 \end{figure}
1045 In Figure~\ref{fig:05} there is one curve for CUDA-MPI and another one
1046 for CUDA-OpenMP. We can see that the results are quite similar between
1047 OpenMP and MPI for the polynomials size of 200K. For the size of 800K,
1048 the MPI version is a little bit slower than the OpenMP approach but for
1049 the 1,4 millions size, there is a slight advantage for the MPI
1050 version.
1051
1052 \subsubsection{Solving full polynomials}
1053 \begin{figure}[htbp]
1054 \centering
1055  \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Full}
1056 \caption{Execution time for solving full polynomials of three distinct sizes on multiple GPUs using MPI and OpenMP approaches using Ehrlich-Aberth}
1057 \label{fig:06}
1058 \end{figure}
1059 In Figure~\ref{fig:06}, we can see that when it comes to full polynomials, both approaches are almost equivalent.
1060
1061 \subsubsection{Solving sparse and full polynomials of the same size with CUDA-MPI}
1062
1063 In this experiment we compare the execution time of the EA algorithm
1064 according to the number of GPUs to solve sparse and full
1065 polynomials on multiples GPUs using MPI. We chose three sparse and full
1066 polynomials of size 200K, 800K and 1,4M.
1067 \begin{figure}[htbp]
1068 \centering
1069  \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{MPI}
1070 \caption{Execution times to solve sparse and full polynomials of three distinct sizes on multiple GPUs using MPI.}
1071 \label{fig:07}
1072 \end{figure}
1073 In Figure~\ref{fig:07} we can see that CUDA-MPI can solve sparse and
1074 full polynomials of high degrees, the execution times with sparse
1075 polynomial are very low compared to full polynomials. With sparse
1076 polynomials the number of monomials is reduced, consequently the number
1077 of operations is reduced and the execution time decreases.
1078
1079 \subsubsection{Solving sparse and full polynomials of the same size with CUDA-OpenMP}
1080
1081 \begin{figure}[htbp]
1082 \centering
1083  \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{OMP}
1084 \caption{Execution time for solving sparse and full polynomials of three distinct sizes on multiple GPUs using OpenMP}
1085 \label{fig:08}
1086 \end{figure}
1087
1088 Figure ~\ref{fig:08} shows the impact of sparsity on the effectiveness of the CUDA-OpenMP approach. We can see that the impact follows the same pattern, a difference in execution time in favor of the sparse polynomials. 
1089
1090 \subsection{Scalability of the EA method on multiple GPUs to solve very high degree polynomials}
1091 These experiments report the execution times of the EA method for
1092 sparse and full polynomials ranging from 1,000,000 to 5,000,000.
1093 \begin{figure}[htbp]
1094 \centering
1095  \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{big}
1096  \caption{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving full polynomials of high degree on 4 GPUs for sizes ranging from 1M to 5M}
1097 \label{fig:09}
1098 \end{figure}
1099 In Figure~\ref{fig:09} we can see that both approaches are scalable
1100 and can solve very high degree polynomials. In addition, with full polynomial as well as sparse ones, both
1101 approaches give very similar results.
1102
1103 %SIDER JE viens de virer \c ca For sparse polynomials here are a noticeable difference in favour of MPI when the degree is
1104 %above 4 millions. Between 1  and 3 millions, OpenMP is more effecient.
1105 %Under 1 million, OpenMPI and MPI are almost equivalent.
1106
1107 %SIDER : il faut une explication sur les différences ici aussi.
1108  
1109 %for sparse and full polynomials
1110 % An example of a floating figure using the graphicx package.
1111 % Note that \label must occur AFTER (or within) \caption.
1112 % For figures, \caption should occur after the \includegraphics.
1113 % Note that IEEEtran v1.7 and later has special internal code that
1114 % is designed to preserve the operation of \label within \caption
1115 % even when the captionsoff option is in effect. However, because
1116 % of issues like this, it may be the safest practice to put all your
1117 % \label just after \caption rather than within \caption{}.
1118 %
1119 % Reminder: the "draftcls" or "draftclsnofoot", not "draft", class
1120 % option should be used if it is desired that the figures are to be
1121 % displayed while in draft mode.
1122 %
1123 %\begin{figure}[!t]
1124 %\centering
1125 %\includegraphics[width=2.5in]{myfigure}
1126 % where an .eps filename suffix will be assumed under latex, 
1127 % and a .pdf suffix will be assumed for pdflatex; or what has been declared
1128 % via \DeclareGraphicsExtensions.
1129 %\caption{Simulation results for the network.}
1130 %\label{fig_sim}
1131 %\end{figure}
1132
1133 % Note that the IEEE typically puts floats only at the top, even when this
1134 % results in a large percentage of a column being occupied by floats.
1135
1136
1137 % An example of a double column floating figure using two subfigures.
1138 % (The subfig.sty package must be loaded for this to work.)
1139 % The subfigure \label commands are set within each subfloat command,
1140 % and the \label for the overall figure must come after \caption.
1141 % \hfil is used as a separator to get equal spacing.
1142 % Watch out that the combined width of all the subfigures on a 
1143 % line do not exceed the text width or a line break will occur.
1144 %
1145 %\begin{figure*}[!t]
1146 %\centering
1147 %\subfloat[Case I]{\includegraphics[width=2.5in]{box}%
1148 %\label{fig_first_case}}
1149 %\hfil
1150 %\subfloat[Case II]{\includegraphics[width=2.5in]{box}%
1151 %\label{fig_second_case}}
1152 %\caption{Simulation results for the network.}
1153 %\label{fig_sim}
1154 %\end{figure*}
1155 %
1156 % Note that often IEEE papers with subfigures do not employ subfigure
1157 % captions (using the optional argument to \subfloat[]), but instead will
1158 % reference/describe all of them (a), (b), etc., within the main caption.
1159 % Be aware that for subfig.sty to generate the (a), (b), etc., subfigure
1160 % labels, the optional argument to \subfloat must be present. If a
1161 % subcaption is not desired, just leave its contents blank,
1162 % e.g., \subfloat[].
1163
1164
1165 % An example of a floating table. Note that, for IEEE style tables, the
1166 % \caption command should come BEFORE the table and, given that table
1167 % captions serve much like titles, are usually capitalized except for words
1168 % such as a, an, and, as, at, but, by, for, in, nor, of, on, or, the, to
1169 % and up, which are usually not capitalized unless they are the first or
1170 % last word of the caption. Table text will default to \footnotesize as
1171 % the IEEE normally uses this smaller font for tables.
1172 % The \label must come after \caption as always.
1173 %
1174 %\begin{table}[!t]
1175 %% increase table row spacing, adjust to taste
1176 %\renewcommand{\arraystretch}{1.3}
1177 % if using array.sty, it might be a good idea to tweak the value of
1178 % \extrarowheight as needed to properly center the text within the cells
1179 %\caption{An Example of a Table}
1180 %\label{table_example}
1181 %\centering
1182 %% Some packages, such as MDW tools, offer better commands for making tables
1183 %% than the plain LaTeX2e tabular which is used here.
1184 %\begin{tabular}{|c||c|}
1185 %\hline
1186 %One & Two\\
1187 %\hline
1188 %Three & Four\\
1189 %\hline
1190 %\end{tabular}
1191 %\end{table}
1192
1193
1194 % Note that the IEEE does not put floats in the very first column
1195 % - or typically anywhere on the first page for that matter. Also,
1196 % in-text middle ("here") positioning is typically not used, but it
1197 % is allowed and encouraged for Computer Society conferences (but
1198 % not Computer Society journals). Most IEEE journals/conferences use
1199 % top floats exclusively. 
1200 % Note that, LaTeX2e, unlike IEEE journals/conferences, places
1201 % footnotes above bottom floats. This can be corrected via the
1202 % \fnbelowfloat command of the stfloats package.
1203
1204
1205
1206
1207 \section{Conclusion}
1208 \label{sec6}
1209 In this paper, we have presented a parallel implementation of
1210 Ehrlich-Aberth algorithm to solve full and sparse polynomials, on
1211 single GPU with CUDA and on multiple GPUs using two parallel
1212 paradigms: shared memory with OpenMP and distributed memory with
1213 MPI. These architectures were addressed by a CUDA-OpenMP approach and
1214 CUDA-MPI approach, respectively.  Experiments show that, using
1215 parallel programming model like (OpenMP, MPI). We can efficiently
1216 manage multiple graphics cards to solve the same
1217 problem and accelerate the parallel execution with 4 GPUs and solve a
1218 polynomial of degree up to 5,000,000, four times faster than on single
1219 GPU. 
1220
1221
1222 %In future, we will evaluate our parallel implementation of Ehrlich-Aberth algorithm on other parallel programming model 
1223
1224 Our next objective is to extend the model presented here with clusters
1225 of GPU nodes, with a three-level scheme: inter-node communication via
1226 MPI processes (distributed memory), management of multi-GPU node by
1227 OpenMP threads (shared memory).
1228
1229 %present a communication approach between multiple GPUs. The comparison between MPI and OpenMP as GPUs controllers shows that these
1230 %solutions can effectively manage multiple graphics cards to work together
1231 %to solve the same problem
1232
1233
1234  %than we have presented two communication approach between multiple GPUs.(CUDA-OpenMP) approach and (CUDA-MPI) approach, in the objective to manage multiple graphics cards to work together and solve the same problem. in the objective to manage multiple graphics cards to work together and solve the same problem. 
1235
1236
1237
1238
1239 % conference papers do not normally have an appendix
1240
1241
1242 % use section* for acknowledgment
1243 \section*{Acknowledgment}
1244
1245 Computations have been performed on the supercomputer facilities of
1246 the Mésocentre de calcul de Franche-Comté. We also would like to thank
1247 Nvidia for hardware donation under CUDA Research Center 2014.
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254 % trigger a \newpage just before the given reference
1255 % number - used to balance the columns on the last page
1256 % adjust value as needed - may need to be readjusted if
1257 % the document is modified later
1258 %\IEEEtriggeratref{8}
1259 % The "triggered" command can be changed if desired:
1260 %\IEEEtriggercmd{\enlargethispage{-5in}}
1261
1262 % references section
1263
1264 % can use a bibliography generated by BibTeX as a .bbl file
1265 % BibTeX documentation can be easily obtained at:
1266 % http://mirror.ctan.org/biblio/bibtex/contrib/doc/
1267 % The IEEEtran BibTeX style support page is at:
1268 % http://www.michaelshell.org/tex/ieeetran/bibtex/
1269 %\bibliographystyle{IEEEtran}
1270 % argument is your BibTeX string definitions and bibliography database(s)
1271 %\bibliography{IEEEabrv,../bib/paper}
1272 %\bibliographystyle{./IEEEtran}
1273 \bibliography{mybibfile}
1274
1275 %
1276 % <OR> manually copy in the resultant .bbl file
1277 % set second argument of \begin to the number of references
1278 % (used to reserve space for the reference number labels box)
1279 %\begin{thebibliography}{1}
1280
1281 %\bibitem{IEEEhowto:kopka}
1282 %H.~Kopka and P.~W. Daly, \emph{A Guide to \LaTeX}, 3rd~ed.\hskip 1em plus
1283  % 0.5em minus 0.4em\relax Harlow, England: Addison-Wesley, 1999.
1284   
1285 %\bibitem{IEEEhowto:NVIDIA12} 
1286  %NVIDIA Corporation, \textit{Whitepaper NVIDA’s Next Generation CUDATM Compute
1287 %Architecture: KeplerTM }, 1st ed., 2012.
1288
1289 %\end{thebibliography}
1290
1291
1292
1293
1294 % that's all folks
1295 \end{document}
1296
1297