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Private GIT Repository
2f436392e9e952cd06c8598e1b38db6ae745dc9c
[kahina_paper2.git] / paper.tex
1
2 %% bare_conf.tex
3 %% V1.4b
4 %% 2015/08/26
5 %% by Michael Shell
6 %% See:
7 %% http://www.michaelshell.org/
8 %% for current contact information.
9 %%
10 %% This is a skeleton file demonstrating the use of IEEEtran.cls
11 %% (requires IEEEtran.cls version 1.8b or later) with an IEEE
12 %% conference paper.
13 %%
14 %% Support sites:
15 %% http://www.michaelshell.org/tex/ieeetran/
16 %% http://www.ctan.org/pkg/ieeetran
17 %% and
18 %% http://www.ieee.org/
19
20 %%*************************************************************************
21 %% Legal Notice:
22 %% This code is offered as-is without any warranty either expressed or
23 %% implied; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
24 %% FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE! 
25 %% User assumes all risk.
26 %% In no event shall the IEEE or any contributor to this code be liable for
27 %% any damages or losses, including, but not limited to, incidental,
28 %% consequential, or any other damages, resulting from the use or misuse
29 %% of any information contained here.
30 %%
31 %% All comments are the opinions of their respective authors and are not
32 %% necessarily endorsed by the IEEE.
33 %%
34 %% This work is distributed under the LaTeX Project Public License (LPPL)
35 %% ( http://www.latex-project.org/ ) version 1.3, and may be freely used,
36 %% distributed and modified. A copy of the LPPL, version 1.3, is included
37 %% in the base LaTeX documentation of all distributions of LaTeX released
38 %% 2003/12/01 or later.
39 %% Retain all contribution notices and credits.
40 %% ** Modified files should be clearly indicated as such, including  **
41 %% ** renaming them and changing author support contact information. **
42 %%*************************************************************************
43
44
45 % *** Authors should verify (and, if needed, correct) their LaTeX system  ***
46 % *** with the testflow diagnostic prior to trusting their LaTeX platform ***
47 % *** with production work. The IEEE's font choices and paper sizes can   ***
48 % *** trigger bugs that do not appear when using other class files.       ***                          ***
49 % The testflow support page is at:
50 % http://www.michaelshell.org/tex/testflow/
51
52
53
54 \documentclass[conference]{IEEEtran}
55 % Some Computer Society conferences also require the compsoc mode option,
56 % but others use the standard conference format.
57 %
58 % If IEEEtran.cls has not been installed into the LaTeX system files,
59 % manually specify the path to it like:
60 % \documentclass[conference]{../sty/IEEEtran}
61
62
63
64
65
66 % Some very useful LaTeX packages include:
67 % (uncomment the ones you want to load)
68
69
70 % *** MISC UTILITY PACKAGES ***
71 %
72 %\usepackage{ifpdf}
73 % Heiko Oberdiek's ifpdf.sty is very useful if you need conditional
74 % compilation based on whether the output is pdf or dvi.
75 % usage:
76 % \ifpdf
77 %   % pdf code
78 % \else
79 %   % dvi code
80 % \fi
81 % The latest version of ifpdf.sty can be obtained from:
82 % http://www.ctan.org/pkg/ifpdf
83 % Also, note that IEEEtran.cls V1.7 and later provides a builtin
84 % \ifCLASSINFOpdf conditional that works the same way.
85 % When switching from latex to pdflatex and vice-versa, the compiler may
86 % have to be run twice to clear warning/error messages.
87
88
89
90
91
92
93 % *** CITATION PACKAGES ***
94 %
95 %\usepackage{cite}
96 % cite.sty was written by Donald Arseneau
97 % V1.6 and later of IEEEtran pre-defines the format of the cite.sty package
98 % \cite{} output to follow that of the IEEE. Loading the cite package will
99 % result in citation numbers being automatically sorted and properly
100 % "compressed/ranged". e.g., [1], [9], [2], [7], [5], [6] without using
101 % cite.sty will become [1], [2], [5]--[7], [9] using cite.sty. cite.sty's
102 % \cite will automatically add leading space, if needed. Use cite.sty's
103 % noadjust option (cite.sty V3.8 and later) if you want to turn this off
104 % such as if a citation ever needs to be enclosed in parenthesis.
105 % cite.sty is already installed on most LaTeX systems. Be sure and use
106 % version 5.0 (2009-03-20) and later if using hyperref.sty.
107 % The latest version can be obtained at:
108 % http://www.ctan.org/pkg/cite
109 % The documentation is contained in the cite.sty file itself.
110
111
112
113
114
115
116 % *** GRAPHICS RELATED PACKAGES ***
117 %
118 \ifCLASSINFOpdf
119    \usepackage[pdftex]{graphicx}
120    
121   % declare the path(s) where your graphic files are
122   % \graphicspath{{../pdf/}{../jpeg/}}
123   % and their extensions so you won't have to specify these with
124   % every instance of \includegraphics
125   % \DeclareGraphicsExtensions{.pdf,.jpeg,.png}
126 \else
127   % or other class option (dvipsone, dvipdf, if not using dvips). graphicx
128   % will default to the driver specified in the system graphics.cfg if no
129   % driver is specified.
130   % \usepackage[dvips]{graphicx}
131   % declare the path(s) where your graphic files are
132   % \graphicspath{{../eps/}}
133   % and their extensions so you won't have to specify these with
134   % every instance of \includegraphics
135   % \DeclareGraphicsExtensions{.eps}
136 \fi
137 % graphicx was written by David Carlisle and Sebastian Rahtz. It is
138 % required if you want graphics, photos, etc. graphicx.sty is already
139 % installed on most LaTeX systems. The latest version and documentation
140 % can be obtained at: 
141 % http://www.ctan.org/pkg/graphicx
142 % Another good source of documentation is "Using Imported Graphics in
143 % LaTeX2e" by Keith Reckdahl which can be found at:
144 % http://www.ctan.org/pkg/epslatex
145 %
146 % latex, and pdflatex in dvi mode, support graphics in encapsulated
147 % postscript (.eps) format. pdflatex in pdf mode supports graphics
148 % in .pdf, .jpeg, .png and .mps (metapost) formats. Users should ensure
149 % that all non-photo figures use a vector format (.eps, .pdf, .mps) and
150 % not a bitmapped formats (.jpeg, .png). The IEEE frowns on bitmapped formats
151 % which can result in "jaggedy"/blurry rendering of lines and letters as
152 % well as large increases in file sizes.
153 %
154 % You can find documentation about the pdfTeX application at:
155 % http://www.tug.org/applications/pdftex
156
157
158
159
160
161 % *** MATH PACKAGES ***
162 %
163 \usepackage{amsmath}
164 % A popular package from the American Mathematical Society that provides
165 % many useful and powerful commands for dealing with mathematics.
166 %
167 % Note that the amsmath package sets \interdisplaylinepenalty to 10000
168 % thus preventing page breaks from occurring within multiline equations. Use:
169 %\interdisplaylinepenalty=2500
170 % after loading amsmath to restore such page breaks as IEEEtran.cls normally
171 % does. amsmath.sty is already installed on most LaTeX systems. The latest
172 % version and documentation can be obtained at:
173 % http://www.ctan.org/pkg/amsmath
174
175
176
177
178
179 % *** SPECIALIZED LIST PACKAGES ***
180 %
181 \usepackage{algorithmic}
182 % algorithmic.sty was written by Peter Williams and Rogerio Brito.
183 % This package provides an algorithmic environment fo describing algorithms.
184 % You can use the algorithmic environment in-text or within a figure
185 % environment to provide for a floating algorithm. Do NOT use the algorithm
186 % floating environment provided by algorithm.sty (by the same authors) or
187 % algorithm2e.sty (by Christophe Fiorio) as the IEEE does not use dedicated
188 % algorithm float types and packages that provide these will not provide
189 % correct IEEE style captions. The latest version and documentation of
190 % algorithmic.sty can be obtained at:
191 % http://www.ctan.org/pkg/algorithms
192 % Also of interest may be the (relatively newer and more customizable)
193 % algorithmicx.sty package by Szasz Janos:
194 % http://www.ctan.org/pkg/algorithmicx
195 \usepackage[ruled,vlined]{algorithm2e}
196
197
198
199 % *** ALIGNMENT PACKAGES ***
200 %
201 %\usepackage{array}
202 % Frank Mittelbach's and David Carlisle's array.sty patches and improves
203 % the standard LaTeX2e array and tabular environments to provide better
204 % appearance and additional user controls. As the default LaTeX2e table
205 % generation code is lacking to the point of almost being broken with
206 % respect to the quality of the end results, all users are strongly
207 % advised to use an enhanced (at the very least that provided by array.sty)
208 % set of table tools. array.sty is already installed on most systems. The
209 % latest version and documentation can be obtained at:
210 % http://www.ctan.org/pkg/array
211
212
213 % IEEEtran contains the IEEEeqnarray family of commands that can be used to
214 % generate multiline equations as well as matrices, tables, etc., of high
215 % quality.
216
217
218
219
220 % *** SUBFIGURE PACKAGES ***
221 %\ifCLASSOPTIONcompsoc
222 %  \usepackage[caption=false,font=normalsize,labelfont=sf,textfont=sf]{subfig}
223 %\else
224 %  \usepackage[caption=false,font=footnotesize]{subfig}
225 %\fi
226 % subfig.sty, written by Steven Douglas Cochran, is the modern replacement
227 % for subfigure.sty, the latter of which is no longer maintained and is
228 % incompatible with some LaTeX packages including fixltx2e. However,
229 % subfig.sty requires and automatically loads Axel Sommerfeldt's caption.sty
230 % which will override IEEEtran.cls' handling of captions and this will result
231 % in non-IEEE style figure/table captions. To prevent this problem, be sure
232 % and invoke subfig.sty's "caption=false" package option (available since
233 % subfig.sty version 1.3, 2005/06/28) as this is will preserve IEEEtran.cls
234 % handling of captions.
235 % Note that the Computer Society format requires a larger sans serif font
236 % than the serif footnote size font used in traditional IEEE formatting
237 % and thus the need to invoke different subfig.sty package options depending
238 % on whether compsoc mode has been enabled.
239 %
240 % The latest version and documentation of subfig.sty can be obtained at:
241 % http://www.ctan.org/pkg/subfig
242
243
244
245
246 % *** FLOAT PACKAGES ***
247 %
248 %\usepackage{fixltx2e}
249 % fixltx2e, the successor to the earlier fix2col.sty, was written by
250 % Frank Mittelbach and David Carlisle. This package corrects a few problems
251 % in the LaTeX2e kernel, the most notable of which is that in current
252 % LaTeX2e releases, the ordering of single and double column floats is not
253 % guaranteed to be preserved. Thus, an unpatched LaTeX2e can allow a
254 % single column figure to be placed prior to an earlier double column
255 % figure.
256 % Be aware that LaTeX2e kernels dated 2015 and later have fixltx2e.sty's
257 % corrections already built into the system in which case a warning will
258 % be issued if an attempt is made to load fixltx2e.sty as it is no longer
259 % needed.
260 % The latest version and documentation can be found at:
261 % http://www.ctan.org/pkg/fixltx2e
262
263
264 %\usepackage{stfloats}
265 % stfloats.sty was written by Sigitas Tolusis. This package gives LaTeX2e
266 % the ability to do double column floats at the bottom of the page as well
267 % as the top. (e.g., "\begin{figure*}[!b]" is not normally possible in
268 % LaTeX2e). It also provides a command:
269 %\fnbelowfloat
270 % to enable the placement of footnotes below bottom floats (the standard
271 % LaTeX2e kernel puts them above bottom floats). This is an invasive package
272 % which rewrites many portions of the LaTeX2e float routines. It may not work
273 % with other packages that modify the LaTeX2e float routines. The latest
274 % version and documentation can be obtained at:
275 % http://www.ctan.org/pkg/stfloats
276 % Do not use the stfloats baselinefloat ability as the IEEE does not allow
277 % \baselineskip to stretch. Authors submitting work to the IEEE should note
278 % that the IEEE rarely uses double column equations and that authors should try
279 % to avoid such use. Do not be tempted to use the cuted.sty or midfloat.sty
280 % packages (also by Sigitas Tolusis) as the IEEE does not format its papers in
281 % such ways.
282 % Do not attempt to use stfloats with fixltx2e as they are incompatible.
283 % Instead, use Morten Hogholm'a dblfloatfix which combines the features
284 % of both fixltx2e and stfloats:
285 %
286 % \usepackage{dblfloatfix}
287 % The latest version can be found at:
288 % http://www.ctan.org/pkg/dblfloatfix
289
290
291
292
293 % *** PDF, URL AND HYPERLINK PACKAGES ***
294 %
295 %\usepackage{url}
296 % url.sty was written by Donald Arseneau. It provides better support for
297 % handling and breaking URLs. url.sty is already installed on most LaTeX
298 % systems. The latest version and documentation can be obtained at:
299 % http://www.ctan.org/pkg/url
300 % Basically, \url{my_url_here}.
301
302
303
304
305 % *** Do not adjust lengths that control margins, column widths, etc. ***
306 % *** Do not use packages that alter fonts (such as pslatex).         ***
307 % There should be no need to do such things with IEEEtran.cls V1.6 and later.
308 % (Unless specifically asked to do so by the journal or conference you plan
309 % to submit to, of course. )
310
311
312 % correct bad hyphenation here
313 \hyphenation{op-tical net-works semi-conduc-tor}
314 %\usepackage{graphicx}
315 \bibliographystyle{IEEEtran}
316 % argument is your BibTeX string definitions and bibliography database(s)
317 %\bibliography{IEEEabrv,../bib/paper}
318 %\bibliographystyle{elsarticle-num}
319 \begin{document}
320 %
321 % paper title
322 % Titles are generally capitalized except for words such as a, an, and, as,
323 % at, but, by, for, in, nor, of, on, or, the, to and up, which are usually
324 % not capitalized unless they are the first or last word of the title.
325 % Linebreaks \\ can be used within to get better formatting as desired.
326 % Do not put math or special symbols in the title.
327 \title{A parallel implementation of Ehrlich-Aberth algorithm  for root finding of polynomials
328 on Multi-GPU with OpenMP/MPI}
329
330
331 % author names and affiliations
332 % use a multiple column layout for up to three different
333 % affiliations
334 \author{\IEEEauthorblockN{Michael Shell}
335 \IEEEauthorblockA{School of Electrical and\\Computer Engineering\\
336 Georgia Institute of Technology\\
337 Atlanta, Georgia 30332--0250\\
338 Email: http://www.michaelshell.org/contact.html}
339 \and
340 \IEEEauthorblockN{Homer Simpson}
341 \IEEEauthorblockA{Twentieth Century Fox\\
342 Springfield, USA\\
343 Email: homer@thesimpsons.com}
344 \and
345 \IEEEauthorblockN{James Kirk\\ and Montgomery Scott}
346 \IEEEauthorblockA{Starfleet Academy\\
347 San Francisco, California 96678--2391\\
348 Telephone: (800) 555--1212\\
349 Fax: (888) 555--1212}}
350
351 % conference papers do not typically use \thanks and this command
352 % is locked out in conference mode. If really needed, such as for
353 % the acknowledgment of grants, issue a \IEEEoverridecommandlockouts
354 % after \documentclass
355
356 % for over three affiliations, or if they all won't fit within the width
357 % of the page, use this alternative format:
358
359 %\author{\IEEEauthorblockN{Michael Shell\IEEEauthorrefmark{1},
360 %Homer Simpson\IEEEauthorrefmark{2},
361 %James Kirk\IEEEauthorrefmark{3}, 
362 %Montgomery Scott\IEEEauthorrefmark{3} and
363 %Eldon Tyrell\IEEEauthorrefmark{4}}
364 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{1}School of Electrical and Computer Engineering\\
365 %Georgia Institute of Technology,
366 %Atlanta, Georgia 30332--0250\\ Email: see http://www.michaelshell.org/contact.html}
367 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{2}Twentieth Century Fox, Springfield, USA\\
368 %Email: homer@thesimpsons.com}
369 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{3}Starfleet Academy, San Francisco, California 96678-2391\\
370 %Telephone: (800) 555--1212, Fax: (888) 555--1212}
371 %\IEEEauthorblockA{\IEEEauthorrefmark{4}Tyrell Inc., 123 Replicant Street, Los Angeles, California 90210--4321}}
372
373
374
375
376 % use for special paper notices
377 %\IEEEspecialpapernotice{(Invited Paper)}
378
379
380
381
382 % make the title area
383 \maketitle
384
385 % As a general rule, do not put math, special symbols or citations
386 % in the abstract
387 \begin{abstract}
388 The abstract goes here.
389 \end{abstract}
390
391 % no keywords
392
393
394
395
396 % For peer review papers, you can put extra information on the cover
397 % page as needed:
398 % \ifCLASSOPTIONpeerreview
399 % \begin{center} \bfseries EDICS Category: 3-BBND \end{center}
400 % \fi
401 %
402 % For peerreview papers, this IEEEtran command inserts a page break and
403 % creates the second title. It will be ignored for other modes.
404 \IEEEpeerreviewmaketitle
405
406
407
408 \section{Introduction}
409 Polynomials are mathematical algebraic structures that play an important role in science and engineering by capturing physical phenomena and by expressing any outcome as a function of some unknown variables. Formally speaking,  a polynomial $p(x)$ of degree \textit{n} having $n$ coefficients in the complex plane \textit{C} is :
410 %%\begin{center}
411 \begin{equation}
412      {\Large p(x)=\sum_{i=0}^{n}{a_{i}x^{i}}}.
413 \end{equation}
414 %%\end{center}
415
416 The root finding problem consists in finding the values of all the $n$ different values of the variable $x$ for which \textit{p(x)} is null. Such values are called zeros of $p$. If zeros are $\alpha_{i},\textit{i=1,...,n}$ then $p(x)$ can be written as :
417 \begin{equation}
418      {\Large p(x)=a_{n}\prod_{i=1}^{n}(x-\alpha_{i}), a_{0} a_{n}\neq 0}.
419 \end{equation}
420
421 The problem of finding the roots of polynomials can be encountered in numerous applications. Most of the numerical methods that deal with this problem are simultaneous ones, i.e that find concurrently all of $n$ zeroes. These methods start from the initial approximations of all the roots of the polynomial and give a sequence of approximations that converge to the roots of the polynomial. The first method of this group is Durand-Kerner method:
422 \begin{equation}
423 \label{DK}
424  DK: z_i^{k+1}=z_{i}^{k}-\frac{P(z_i^{k})}{\prod_{i\neq j}(z_i^{k}-z_j^{k})},   i = 1, . . . , n,
425 \end{equation}
426 %%\end{center}
427 where $z_i^k$ is the $i^{th}$ root of the polynomial $p$ at the
428 iteration $k$.
429 Another method discovered by
430 Borsch-Supan~\cite{ Borch-Supan63} and also described and brought
431 in the following form by Ehrlich~\cite{Ehrlich67} and
432 Aberth~\cite{Aberth73} uses a different iteration formula given as:
433 %%\begin{center}
434 \begin{equation}
435 \label{Eq:EA}
436  EA: z_i^{k+1}=z_i^{k}-\frac{1}{{\frac {P'(z_i^{k})} {P(z_i^{k})}}-{\sum_{i\neq j}\frac{1}{(z_i^{k}-z_j^{k})}}}, i = 1, . . . , n,
437 \end{equation}
438 %%\end{center}
439 where $p'(z)$ is the polynomial derivative of $p$ evaluated in the
440 point $z$.
441
442 %Aberth, Ehrlich and Farmer-Loizou~\cite{Loizou83} have proved that
443 %the Ehrlich-Aberth method (EA) has a cubic order of convergence for simple roots whereas the Durand-Kerner has a quadratic order of %convergence.
444
445 The main problem of the simultaneous methods is that the necessary time needed for the convergence is increased with the increasing of the degree of the polynomial. Many authors have treated the problem of implementing  simultaneous methods in parallel. Freeman~\cite{Freeman89} implemented and compared DK, EA and another method of the fourth order proposed by Farmer
446 and Loizou~\cite{Loizou83}, on a 8-processor linear chain, for polynomials of degree up to 8.
447 The third method often diverges, but the first two methods have speed-up equal to 5.5. Later, Freeman and Bane~\cite{Freemanall90} considered asynchronous algorithms, in which each processor continues to update its approximations even though the latest values of other $z^{k}_{i}$ have not been received from the other processors, in contrast with synchronous algorithms where it would wait those values before
448 making a new iteration. Couturier and al.~\cite{Raphaelall01} proposed two methods of parallelization for a shared memory architecture with \textit{OpenMP} and for distributed memory one with \textit{MPI}. They were able to compute the roots of sparse polynomials of degree 10,000 in 116 seconds with \textit{OpenMP} and 135 seconds with \textit{MPI} only by using 8 personal computers and 2 communications per iteration. Comparing to the sequential implementation where it takes up to 3,300 seconds to obtain the same results, the authors show an interesting speedup.
449
450 Very few work had been performed since then until the appearing of the Compute Unified Device Architecture (CUDA)~\cite{CUDA10}, a parallel computing platform and a programming model invented by NVIDIA. The computing power of GPUs (Graphics Processing Unit) has exceeded that of CPUs. However, CUDA adopts a totally new computing architecture to use the hardware resources provided by GPU in order to offer a stronger computing ability to the massive data computing. Ghidouche and al~\cite{Kahinall14} proposed an implementation of the Durand-Kerner method on GPU. Their main result showed that a parallel CUDA implementation is about 10 times faster than the sequential implementation on a single CPU for sparse polynomials of degree 48,000.
451
452 Finding polynomial roots rapidly and accurately is the main objective of our work. In this paper we propose the parallelization of Ehrlich-Aberth method using parallel programming paradigms (OpenMP, MPI) on GPUs. We consider two architectures: shared memory with OpenMP API and distributed memory MPI API. The first approach is based on threads from the same system process, with each thread attached to one GPU and after the various memory allocations, each thread launches its part of computations. To do this we must first load on the GPU required data and after the computations are carried, repatriate the result on the host. The second approach i.e distributed memory with MPI relies on the MPI library which is often used for parallel programming~\cite{Peter96} in
453 cluster systems because it is a message-passing programming language. Each GPU is attached to one MPI process, and a loop is in charge of the distribution of tasks between the MPI processes. This solution can be used on one GPU, or executed on a distributed cluster of GPUs, employing the Message Passing Interface (MPI) to communicate between separate CUDA cards. This solution permits scaling of the problem size to larger classes than would be possible on a single device and demonstrates the performance which users might expect from future
454 HPC architectures where accelerators are deployed. 
455  
456 This paper is organized as follows, in section 2 we recall the Ehrlich-Aberth method. In section 3 we present EA algorithm on single GPU. In section 4 we propose the EA algorithm implementation on Multi-GPU for (OpenMP-CUDA) approach and (MPI-CUDA) approach. In section 5 we present our experiments and discus it. Finally, Section~\ref{sec6} concludes this paper and gives some hints for future research directions in this topic.
457  
458  
459 \section{Parallel Programmings Model}
460  
461 \subsection{OpenMP}
462 Open Multi-Processing (OpenMP) is a shared memory architecture API that provides multi thread capacity~\cite{openmp13}. OpenMP is
463 a portable approach for parallel programming on shared memory systems based on compiler directives, that can be included in order
464 to parallelize a loop. In this way, a set of loops can be distributed along the different threads that will access to different data allocated in local shared memory. One of the advantages of OpenMP is its global view of application memory address space that allows relatively fast development of parallel applications with easier maintenance. However, it is often difficult to get high rates of performance in large scale applications. Although usage of OpenMP  threads and managed data explicitly done with MPI can be considered, this approcache undermines the advantages of OpenMP.
465
466 %\subsection{OpenMP} %L'article en Français Programmation multiGPU – OpenMP versus MPI
467 %OpenMP is a shared memory programming API based on threads from
468 %the same system process. Designed for multiprocessor shared memory UMA or
469 %NUMA [10], it relies on the execution model SPMD ( Single Program, Multiple Data Stream )
470 %where the thread "master" and threads "slaves" asynchronously execute their codes
471 %communicate / synchronize via shared memory [7]. It also helps to build
472 %the loop parallelism and is very suitable for an incremental code parallelization
473 %Sequential natively. Threads share some or all of the available memory and can
474 %have private memory areas [6].
475
476 \subsection{MPI} 
477 The MPI (Message Passing Interface) library allows to create computer programs that run on a distributed memory architecture. The various processes have their own environment of execution and execute their code in a asynchronous way, according to the MIMD model  (Multiple Instruction streams, Multiple Data streams); they communicate and synchronise by exchanging messages~\cite{Peter96}. MPI messages are explicitly sent, while the exchanges are implicit within the framework of a multi-thread programming environment like OpenMP or Pthreads.
478  
479 \subsection{CUDA}%L'article en anglais Multi-GPU and multi-CPU accelerated FDTD scheme for vibroacoustic applications
480 CUDA (an acronym for Compute Unified Device Architecture) is a parallel computing architecture developed by NVIDIA~\cite{NVIDIA12}. The
481 unit of execution in CUDA is called a thread. Each thread executes a kernel by the streaming processors in parallel. In CUDA,
482 a group of threads that are executed together is called a thread block, and the computational grid consists of a grid of thread
483 blocks. Additionally, a thread block can use the shared memory on a single multiprocessor while the grid executes a single
484 CUDA program logically in parallel. Thus in CUDA programming, it is necessary to design carefully the arrangement of the thread
485 blocks in order to ensure low latency and a proper usage of shared memory, since it can be shared only in a thread block
486 scope. The effective bandwidth of each memory space depends on the memory access pattern. Since the global memory has lower
487 bandwidth than the shared memory, the global memory accesses should be minimized.
488
489
490 We introduced three paradigms of parallel programming. Our objective consist to implement an algorithm of root finding polynomial on multiple GPUs. It primordial to know how to manage CUDA contexts of different GPUs. A direct method for controlling the various GPU is to use as many threads or processes as GPU devices. We can choose the GPU index based on the identifier of OpenMP thread or the rank of the MPI process. Both approaches will be investigated.
491
492 \section{The EA algorithm on single GPU}
493 \subsection{the EA method}
494
495 A cubically convergent iteration method to find zeros of
496 polynomials was proposed by O. Aberth~\cite{Aberth73}. The
497 Ehrlich-Aberth method contains 4 main steps, presented in what
498 follows.
499
500 %The Aberth method is a purely algebraic derivation. 
501 %To illustrate the derivation, we let $w_{i}(z)$ be the product of linear factors 
502
503 %\begin{equation}
504 %w_{i}(z)=\prod_{j=1,j \neq i}^{n} (z-x_{j})
505 %\end{equation}
506
507 %And let a rational function $R_{i}(z)$ be the correction term of the
508 %Weistrass method~\cite{Weierstrass03}
509
510 %\begin{equation}
511 %R_{i}(z)=\frac{p(z)}{w_{i}(z)} , i=1,2,...,n.
512 %\end{equation}
513
514 %Differentiating the rational function $R_{i}(z)$ and applying the
515 %Newton method, we have:
516
517 %\begin{equation}
518 %\frac{R_{i}(z)}{R_{i}^{'}(z)}= \frac{p(z)}{p^{'}(z)-p(z)\frac{w_{i}(z)}{w_{i}^{'}(z)}}= \frac{p(z)}{p^{'}(z)-p(z) \sum _{j=1,j \neq i}^{n}\frac{1}{z-x_{j}}}, i=1,2,...,n
519 %\end{equation}
520 %where R_{i}^{'}(z)is the rational function derivative of F evaluated in the point z 
521 %Substituting $x_{j}$ for $z_{j}$ we obtain the Aberth iteration method.% 
522
523
524 \subsubsection{Polynomials Initialization}
525 The initialization of a polynomial $p(z)$ is done by setting each of the $n$ complex coefficients $a_{i}$:
526
527 \begin{equation}
528 \label{eq:SimplePolynome}
529   p(z)=\sum{a_{i}z^{n-i}} , a_{n} \neq 0,a_{0}=1, a_{i}\subset C
530 \end{equation}
531
532
533 \subsubsection{Vector $Z^{(0)}$ Initialization}
534 \label{sec:vec_initialization}
535 As for any iterative method, we need to choose $n$ initial guess points $z^{0}_{i}, i = 1, . . . , n.$
536 The initial guess is very important since the number of steps needed by the iterative method to reach
537 a given approximation strongly depends on it.
538 In~\cite{Aberth73} the Ehrlich-Aberth iteration is started by selecting $n$
539 equi-spaced points on a circle of center 0 and radius r, where r is
540 an upper bound to the moduli of the zeros. Later, Bini and al.~\cite{Bini96}
541 performed this choice by selecting complex numbers along different
542 circles which relies on the result of~\cite{Ostrowski41}.
543
544 \begin{equation}
545 \label{eq:radiusR}
546 %%\begin{align}
547 \sigma_{0}=\frac{u+v}{2};u=\frac{\sum_{i=1}^{n}u_{i}}{n.max_{i=1}^{n}u_{i}};
548 v=\frac{\sum_{i=0}^{n-1}v_{i}}{n.min_{i=0}^{n-1}v_{i}};\\
549 %%\end{align}
550 \end{equation}
551 Where:
552 \begin{equation}
553 u_{i}=2.|a_{i}|^{\frac{1}{i}};
554 v_{i}=\frac{|\frac{a_{n}}{a_{i}}|^{\frac{1}{n-i}}}{2}.
555 \end{equation}
556
557 \subsubsection{Iterative Function}
558 The operator used by the Aberth method is corresponding to the
559 following equation~\ref{Eq:EA1} which will enable the convergence towards
560 polynomial solutions, provided all the roots are distinct.
561
562 %Here we give a second form of the iterative function used by the Ehrlich-Aberth method: 
563
564 \begin{equation}
565 \label{Eq:EA1}
566 EA: z^{k+1}_{i}=z_{i}^{k}-\frac{\frac{p(z_{i}^{k})}{p'(z_{i}^{k})}}
567 {1-\frac{p(z_{i}^{k})}{p'(z_{i}^{k})}\sum_{j=1,j\neq i}^{j=n}{\frac{1}{(z_{i}^{k}-z_{j}^{k})}}}, i=1,. . . .,n
568 \end{equation}
569
570 \subsubsection{Convergence Condition}
571 The convergence condition determines the termination of the algorithm. It consists in stopping the iterative function  when the roots are sufficiently stable. We consider that the method converges sufficiently when:
572
573 \begin{equation}
574 \label{eq:Aberth-Conv-Cond}
575 \forall i \in [1,n];\vert\frac{z_{i}^{k}-z_{i}^{k-1}}{z_{i}^{k}}\vert<\xi
576 \end{equation}
577
578
579 %\begin{figure}[htbp]
580 %\centering
581  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{EA-Algorithm}
582 %\caption{The Ehrlich-Aberth algorithm on single GPU}
583 %\label{fig:03}
584 %\end{figure}
585
586 %the Ehrlich-Aberth method is an iterative  method, contain 4 steps, start from the initial approximations of all the
587 %roots of the polynomial,the second step initialize the solution vector $Z$ using the Guggenheimer method to assure the distinction of the initial vector roots, than in step 3 we apply the the iterative function based on the Newton's method and Weiestrass operator[...,...], wich will make it possible to converge to the roots solution, provided that all the root are different. At the end of each application of the iterative function, a stop condition is verified consists in stopping the iterative process when the whole of the modules of the roots
588 %are lower than a fixed value $ε$ 
589
590
591 \subsection{EA parallel implementation on CUDA}
592 Like any parallel code, a GPU parallel implementation first
593 requires to determine the sequential tasks and the
594 parallelizable parts of the sequential version of the
595 program/algorithm. In our case, all the operations that are easy
596 to execute in parallel must be made by the GPU to accelerate
597 the execution of the application, like the step 3 and step 4. On the other hand, all the
598 sequential operations and the operations that have data
599 dependencies between threads or recursive computations must
600 be executed by only one CUDA or CPU thread (step 1 and step 2). Initially we specifies the organization of threads in parallel, need to specify the dimension of the grid Dimgrid: the number of block per grid and block by DimBlock: the number of threads per block required to process a certain task. 
601
602 we create the kernel, for step 3 we have two kernels, the
603 first named \textit{save} is used to save vector $Z^{K-1}$ and the kernel
604 \textit{update} is used to update the $Z^{K}$ vector. In step 4 a kernel is
605 created to test the convergence of the method. In order to
606 compute function H, we have two possibilities: either to use
607 the Jacobi method, or the Gauss-Seidel method which uses the
608 most recent computed roots. It is well known that the Gauss-
609 Seidel mode converges more quickly. So, we used the Gauss-Seidel mode of iteration. To
610 parallelize the code, we created kernels and many functions to
611 be executed on the GPU for all the operations dealing with the
612 computation on complex numbers and the evaluation of the
613 polynomials. As said previously, we managed both functions
614 of evaluation of a polynomial: the normal method, based on
615 the method of Horner and the method based on the logarithm
616 of the polynomial. All these methods were rather long to
617 implement, as the development of corresponding kernels with
618 CUDA is longer than on a CPU host. This comes in particular
619 from the fact that it is very difficult to debug CUDA running
620 threads like threads on a CPU host. In the following paragraph
621 Algorithm 1 shows the GPU parallel implementation of Ehrlich-Aberth method.
622
623 Algorithm~\ref{alg2-cuda} shows a sketch of the Ehrlich-Aberth method using CUDA.
624
625 \begin{enumerate}
626 \begin{algorithm}[htpb]
627 \label{alg1-cuda}
628 %\LinesNumbered
629 \caption{CUDA Algorithm to find roots with the Ehrlich-Aberth method}
630
631 \KwIn{$Z^{0}$ (Initial root's vector), $\varepsilon$ (Error tolerance
632   threshold), P (Polynomial to solve), Pu (Derivative of P), $n$ (Polynomial degrees), $\Delta z_{max}$ (Maximum value of stop condition)}
633
634 \KwOut {$Z$ (Solution root's vector), $ZPrec$ (Previous solution root's vector)}
635
636 %\BlankLine
637
638 \item Initialization of the of P\;
639 \item Initialization of the of Pu\;
640 \item Initialization of the solution vector $Z^{0}$\;
641 \item Allocate and copy initial data to the GPU global memory\;
642 \item k=0\;
643 \While {$\Delta z_{max} > \epsilon$}{
644 \item Let $\Delta z_{max}=0$\;
645 \item $ kernel\_save(ZPrec,Z)$\;
646 \item  k=k+1\;
647 \item $ kernel\_update(Z,P,Pu)$\;
648 \item $kernel\_testConverge(\Delta z_{max},Z,ZPrec)$\;
649
650 }
651 \item Copy results from GPU memory to CPU memory\;
652 \end{algorithm}
653 \end{enumerate}
654 ~\\ 
655
656
657  
658 \section{The EA algorithm on Multi-GPU}
659
660 \subsection{MGPU (OpenMP-CUDA) approach}
661 Our OpenMP-CUDA implementation of EA algorithm is based on the hybrid OpenMP and CUDA programming model. It works
662 as follows.
663 Based on the metadata, a shared memory is used to make data evenly shared among OpenMP threads. The shared data are the solution vector $Z$, the polynomial to solve $P$. vector of error of stop condition $\Delta z$. Let(T\_omp) number of OpenMP threads is equal to the number of GPUs, each threads OpenMP checks one GPU,  and control a part of the shared memory, that is a part of the vector Z  like: $(n/num\_gpu)$ roots, n: the polynomial's degrees, $num\_gpu$ the number of GPUs. Each OpenMP thread copies its data from host memory to GPU’s device memory.Than every GPU will have a grid of computation organized with its performances and the size of data of which it checks and compute kernels. %In principle a grid is set by two parameter DimGrid, the number of block per grid, DimBloc: the number of threads per block. The following schema  shows the architecture of (CUDA,OpenMP).
664
665 %\begin{figure}[htbp]
666 %\centering
667  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{OpenMP-CUDA}
668 %\caption{The OpenMP-CUDA architecture}
669 %\label{fig:03}
670 %\end{figure}
671 %Each thread OpenMP compute the kernels on GPUs,than after each iteration they copy out the data from GPU memory to CPU shared memory. The kernels are re-runs is up to the roots converge sufficiently. Here are below the corresponding algorithm:
672
673 $num\_gpus$ thread OpenMP are created using \verb=omp_set_num_threads();=function (line,Algorithm \ref{alg2-cuda-openmp}), the shared memory is created using \verb=#pragma omp parallel shared()= OpenMP function (line 5,Algorithm\ref{alg2-cuda-openmp}), than each OpenMP threads allocate and copy initial data from CPU memory to the GPU global memories, execute the kernels on GPU, and compute only his portion of roots indicated with variable \textit{index} initialized in (line 5, Algorithm \ref{alg2-cuda-openmp}), used as input data in the $kernel\_update$ (line 10, Algorithm \ref{alg2-cuda-openmp}). After each iteration, OpenMP threads synchronize using \verb=#pragma omp barrier;= to recuperate all values of vector $\Delta z$, to compute the maximum stop condition in vector $\Delta z$(line 12, Algorithm \ref{alg2-cuda-openmp}).Finally,they copy the results from GPU memories to CPU memory. The OpenMP threads execute kernels until the roots converge sufficiently.  
674 \begin{enumerate}
675 \begin{algorithm}[htpb]
676 \label{alg2-cuda-openmp}
677 %\LinesNumbered
678 \caption{CUDA-OpenMP Algorithm to find roots with the Ehrlich-Aberth method}
679
680 \KwIn{$Z^{0}$ (Initial root's vector), $\varepsilon$ (Error tolerance
681   threshold), P (Polynomial to solve), Pu (Derivative of P), $n$ (Polynomial degrees), $\Delta z$ ( Vector of errors of stop condition), $num_gpus$ (number of OpenMP threads/ number of GPUs), $Size$ (number of roots)}
682
683 \KwOut {$Z$ (Solution root's vector), $ZPrec$ (Previous solution root's vector)}
684
685 \BlankLine
686
687 \item Initialization of the of P\;
688 \item Initialization of the of Pu\;
689 \item Initialization of the solution vector $Z^{0}$\;
690 \verb=omp_set_num_threads(num_gpus);=
691 \verb=#pragma omp parallel shared(Z,$\Delta$ z,P);=
692 \verb=cudaGetDevice(gpu_id);=
693 \item Allocate and copy initial data from CPU memory to the GPU global memories\;
694 \item index= $Size/num\_gpus$\;
695 \item k=0\;
696 \While {$error > \epsilon$}{
697 \item Let $\Delta z=0$\;
698 \item $ kernel\_save(ZPrec,Z)$\;
699 \item  k=k+1\;
700 \item $ kernel\_update(Z,P,Pu,index)$\;
701 \item $kernel\_testConverge(\Delta z[gpu\_id],Z,ZPrec)$\;
702 %\verb=#pragma omp barrier;=
703 \item error= Max($\Delta z$)\;
704 }
705
706 \item Copy results from GPU memories to CPU memory\;
707 \end{algorithm}
708 \end{enumerate}
709 ~\\ 
710
711
712
713 \subsection{Multi-GPU (MPI-CUDA) approach}
714 %\begin{figure}[htbp]
715 %\centering
716  % \includegraphics[angle=-90,width=0.2\textwidth]{MPI-CUDA}
717 %\caption{The MPI-CUDA architecture }
718 %\label{fig:03}
719 %\end{figure}
720 Our parallel implementation of the Ehrlich-Aberth method to find root polynomial using (CUDA-MPI) approach, splits input data of the polynomial to solve between MPI processes. From Algorithm 3, the input data are the polynomial to solve $P$, the solution vector $Z$, the previous solution vector $zPrev$, and the Value of errors of stop condition $\Delta z$. Let $p$ denote the number of MPI processes on and $n$ the size of the polynomial to be solved. The algorithm performs a simple data partitioning by creating $p$ portions, of at most $⌈n/p⌉$ roots to find per MPI process, for each element mentioned above. Consequently, each MPI process $k$ will have its own solution vector $Z_{k}$,polynomial to be solved $p_{k}$, the error of stop condition $\Delta z_{k}$, Than each MPI processes compute only $⌈n/p⌉$ roots.
721
722 Since a GPU works only on data of its memory, all local input data, $Z_{k}, p_{k}$ and $\Delta z_{k}$, must be transferred from CPU memories to the corresponding GPU memories. Afterward, the same EA algorithm (Algorithm 1) is run by all processes but on different sub-polynomial root $ p(x)_{k}=\sum_{i=k(\frac{n}{p})}^{k+1(\frac{n}{p})} a_{i}x^{i}, k=1,...,p$.  Each processes MPI execute the  loop \verb=(While(...)...do)= contain the kernels. Than each process MPI  compute only his portion of roots indicated with variable \textit{index} initialized in (line 5, Algorithm \ref{alg2-cuda-mpi}), used as input data in the $kernel\_update$ (line 10, Algorithm \ref{alg2-cuda-mpi}). After each iteration, MPI processes synchronize using \verb=MPI_Allreduce= function, in order to compute the maximum error stops condition $\Delta z_{k}$ computed by each process MPI line (line, Algorithm\ref{alg2-cuda-mpi}), and  copy the values of new roots computed from GPU memories to CPU memories, than communicate  her results to the neighboring processes,using \verb=MPI_Alltoallv=. If maximum stop condition $error > \epsilon$ the processes stay to execute the loop \verb= while(...)...do= until all the roots converge sufficiently.
723
724 \begin{enumerate}
725 \begin{algorithm}[htpb]
726 \label{alg2-cuda-mpi}
727 %\LinesNumbered
728 \caption{CUDA-MPI Algorithm to find roots with the Ehrlich-Aberth method}
729
730 \KwIn{$Z^{0}$ (Initial root's vector), $\varepsilon$ (Error tolerance
731   threshold), P (Polynomial to solve), Pu (Derivative of P), $n$ (Polynomial degrees), $\Delta z$ ( error of stop condition), $num_gpus$ (number of MPI processes/ number of GPUs), Size (number of roots)}
732
733 \KwOut {$Z$ (Solution root's vector), $ZPrec$ (Previous solution root's vector)}
734
735 \BlankLine
736 \item Initialization of the P\;
737 \item Initialization of the Pu\;
738 \item Initialization of the solution vector $Z^{0}$\;
739 \item Allocate and copy initial data from CPU memories to the GPU global memories\;
740 \item $index= Size/num_gpus$\;
741 \item k=0\;
742 \While {$error > \epsilon$}{
743 \item Let $\Delta z=0$\;
744 \item $ kernel\_save(ZPrec,Z)$\;
745 \item  k=k+1\;
746 \item $ kernel\_update(Z,P,Pu,index)$\;
747 \item $kernel\_testConverge(\Delta z,Z,ZPrec)$\;
748 \item ComputeMaxError($\Delta z$,error)\;
749 \item Copy results from GPU memories to CPU memories\;
750 \item Send $Z[id]$ to all neighboring processes\;
751 \item Receive $Z[j]$ from neighboring process j\;
752
753
754 }
755 \end{algorithm}
756 \end{enumerate}
757 ~\\ 
758
759 \section{experiments}
760 We study two categories of polynomials: sparse polynomials and full polynomials.\\
761 {\it A sparse polynomial} is a polynomial for which only some coefficients are not null. In this paper, we consider sparse polynomials for which the roots are distributed on 2 distinct circles:
762 \begin{equation}
763         \forall \alpha_{1} \alpha_{2} \in C,\forall n_{1},n_{2} \in N^{*}; P(z)= (z^{n_{1}}-\alpha_{1})(z^{n_{2}}-\alpha_{2})
764 \end{equation}\noindent
765 {\it A full polynomial} is, in contrast, a polynomial for which all the coefficients are not null. A full polynomial is defined by:
766 %%\begin{equation}
767         %%\forall \alpha_{i} \in C,\forall n_{i}\in N^{*}; P(z)= \sum^{n}_{i=1}(z^{n^{i}}.a_{i})
768 %%\end{equation}
769
770 \begin{equation}
771      {\Large \forall a_{i} \in C, i\in N;  p(x)=\sum^{n}_{i=0} a_{i}.x^{i}} 
772 \end{equation}
773 For our tests, a CPU Intel(R) Xeon(R) CPU E5620@2.40GHz and a GPU K40 (with 6 Go of ram) are used. 
774
775 We performed a set of experiments on single GPU and Multi-GPU using (OpenMP/MPI) to find roots polynomials with EA algorithm, for both sparse and full polynomials of different sizes. We took into account the execution times and the  polynomial size performed by sum or each experiment.
776 All experimental results obtained from the simulations are made in
777 double precision data, the convergence threshold of the methods is set
778 to $10^{-7}$.
779 %Since we were more interested in the comparison of the
780 %performance behaviors of Ehrlich-Aberth and Durand-Kerner methods on
781 %CPUs versus on GPUs.
782 The initialization values of the vector solution
783 of the methods are given in %Section~\ref{sec:vec_initialization}.
784
785 \subsection{Test with Multi-GPU (CUDA OpenMP) approach}
786
787 In this part we performed  a set of experiments on Multi-GPU (CUDA OpenMP) approach for full and sparse polynomials of different degrees, compare it with Single GPU (CUDA).
788  \subsubsection{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving sparse polynomials on GPUs using shared memory paradigm with OpenMP}
789  
790  In this experiments we report the execution time of the EA algorithm, on single GPU and Multi-GPU with (2,3,4) GPUs, for different sparse polynomial degrees ranging from 100,000 to 1,400,000
791
792 \begin{figure}[htbp]
793 \centering
794   \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Sparse_omp}
795 \caption{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving sparse polynomials on GPUs using shared memory paradigm with OpenMP}
796 \label{fig:01}
797 \end{figure}
798
799 This figure~\ref{fig:01} shows that (CUDA OpenMP) Multi-GPU approach reduce the execution time up to the scale 100 whereas single GPU is of scale 1000 for polynomial who exceed 1,000,000. It shows the advantage to use OpenMP parallel paradigm  to connect the performances of several GPUs and solve a  polynomial of high degrees.   
800
801 \subsubsection{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving full polynomials on GPUs using shared memory paradigm with OpenMP}
802
803 This experiments shows the execution time of the EA algorithm, on single GPU (CUDA) and Multi-GPU (CUDA OpenMP) approach for full polynomials of degrees ranging from 100,000 to 1,400,000
804
805 \begin{figure}[htbp]
806 \centering
807   \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Full_omp}
808 \caption{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving full polynomials on GPUs using shared memory paradigm with OpenMP}
809 \label{fig:03}
810 \end{figure}
811
812 The second test with full polynomial shows a very important saving of time, for a polynomial of degrees 1,4M (CUDA OpenMP) approach with 4 GPUs compute and solve it 4 times as fast as single GPU. We notice that curves are positioned one below the other one, more the number of used GPUs increases more the execution time decreases.
813
814 \subsection{Test with Multi-GPU (CUDA MPI) approach}
815 In this part we perform a set of experiment to compare Multi-GPU (CUDA MPI) approach with single GPU, for solving full and sparse polynomials of degrees ranging from 100,000 to 1,400,000.
816
817 \subsubsection{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving sparse polynomials on GPUs using distributed memory paradigm with MPI}
818
819 \begin{figure}[htbp]
820 \centering
821   \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Sparse_mpi}
822 \caption{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving sparse polynomials on GPUs using distributed memory paradigm with MPI}
823 \label{fig:02}
824 \end{figure}
825 ~\\
826 This figure shows 4 curves of execution time of EA algorithm, a curve with single GPU, 3 curves with Multi-GPUs (2, 3, 4) GPUs. We see clearly that the curve with single GPU is above the other curves, which shows consumption in execution time compared to the Multi-GPU. We can see the approach Multi-GPU (CUDA MPI) reduces the execution time up to the scale 100 for polynomial of degrees more than 1,000,000 whereas single GPU is of the scale 1000.
827 \\
828 \subsubsection{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for solving full polynomials on GPUs using distributed memory paradigm with MPI}
829
830 \begin{figure}[htbp]
831 \centering
832   \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Full_mpi}
833 \caption{Execution times in seconds of the Ehrlich-Aberth method for full polynomials on GPUs using distributed memory paradigm with MPI}
834 \label{fig:04}
835 \end{figure}
836
837
838 this figure shows the execution time of the algorithm EA, on single GPU and Multi-GPUS with (2, 3, 4) GPUs for full polynomials. With (CUDA-MPI) approach we notice that the three curves are distinct from each other, more we use GPUs more the execution time decreases, on the other hand the curve with single GPU is well above the other curves.
839 This is due to the use of parallelization MPI paradigm that divides the polynomial into sub polynomials assigned to each GPU. unlike the single GPU which solves all the polynomial on a single GPU, consequently it engenders more execution time.
840
841 %\begin{figure}[htbp]
842 %\centering
843  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Sparse}
844 %\caption{Comparaison between MPI and OpenMP versions of the Ehrlich-Aberth method for solving sparse plynomials on GPUs}
845 %\label{fig:05}
846 %\end{figure}
847
848 %\begin{figure}[htbp]
849 %\centering
850  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{Full}
851 %\caption{Comparaison between MPI and OpenMP versions of the Ehrlich-Aberth method for solving full polynomials on GPUs}
852 %\label{fig:06}
853 %\end{figure}
854
855 %\begin{figure}[htbp]
856 %\centering
857  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{MPI}
858 %\caption{Comparaison of execution times of the Ehrlich-Aberth method for solving sparse and full polynomials on GPUs with distributed memory paradigm using MPI}
859 %\label{fig:07}
860 %\end{figure}
861
862 %\begin{figure}[htbp]
863 %\centering
864  % \includegraphics[angle=-90,width=0.5\textwidth]{OMP}
865 %\caption{Comparaison of execution times of the Ehrlich-Aberth method for solving sparse and full polynomials on GPUs with shared memory paradigm using OpenMP}
866 %\label{fig:08}
867 %\end{figure}
868
869 % An example of a floating figure using the graphicx package.
870 % Note that \label must occur AFTER (or within) \caption.
871 % For figures, \caption should occur after the \includegraphics.
872 % Note that IEEEtran v1.7 and later has special internal code that
873 % is designed to preserve the operation of \label within \caption
874 % even when the captionsoff option is in effect. However, because
875 % of issues like this, it may be the safest practice to put all your
876 % \label just after \caption rather than within \caption{}.
877 %
878 % Reminder: the "draftcls" or "draftclsnofoot", not "draft", class
879 % option should be used if it is desired that the figures are to be
880 % displayed while in draft mode.
881 %
882 %\begin{figure}[!t]
883 %\centering
884 %\includegraphics[width=2.5in]{myfigure}
885 % where an .eps filename suffix will be assumed under latex, 
886 % and a .pdf suffix will be assumed for pdflatex; or what has been declared
887 % via \DeclareGraphicsExtensions.
888 %\caption{Simulation results for the network.}
889 %\label{fig_sim}
890 %\end{figure}
891
892 % Note that the IEEE typically puts floats only at the top, even when this
893 % results in a large percentage of a column being occupied by floats.
894
895
896 % An example of a double column floating figure using two subfigures.
897 % (The subfig.sty package must be loaded for this to work.)
898 % The subfigure \label commands are set within each subfloat command,
899 % and the \label for the overall figure must come after \caption.
900 % \hfil is used as a separator to get equal spacing.
901 % Watch out that the combined width of all the subfigures on a 
902 % line do not exceed the text width or a line break will occur.
903 %
904 %\begin{figure*}[!t]
905 %\centering
906 %\subfloat[Case I]{\includegraphics[width=2.5in]{box}%
907 %\label{fig_first_case}}
908 %\hfil
909 %\subfloat[Case II]{\includegraphics[width=2.5in]{box}%
910 %\label{fig_second_case}}
911 %\caption{Simulation results for the network.}
912 %\label{fig_sim}
913 %\end{figure*}
914 %
915 % Note that often IEEE papers with subfigures do not employ subfigure
916 % captions (using the optional argument to \subfloat[]), but instead will
917 % reference/describe all of them (a), (b), etc., within the main caption.
918 % Be aware that for subfig.sty to generate the (a), (b), etc., subfigure
919 % labels, the optional argument to \subfloat must be present. If a
920 % subcaption is not desired, just leave its contents blank,
921 % e.g., \subfloat[].
922
923
924 % An example of a floating table. Note that, for IEEE style tables, the
925 % \caption command should come BEFORE the table and, given that table
926 % captions serve much like titles, are usually capitalized except for words
927 % such as a, an, and, as, at, but, by, for, in, nor, of, on, or, the, to
928 % and up, which are usually not capitalized unless they are the first or
929 % last word of the caption. Table text will default to \footnotesize as
930 % the IEEE normally uses this smaller font for tables.
931 % The \label must come after \caption as always.
932 %
933 %\begin{table}[!t]
934 %% increase table row spacing, adjust to taste
935 %\renewcommand{\arraystretch}{1.3}
936 % if using array.sty, it might be a good idea to tweak the value of
937 % \extrarowheight as needed to properly center the text within the cells
938 %\caption{An Example of a Table}
939 %\label{table_example}
940 %\centering
941 %% Some packages, such as MDW tools, offer better commands for making tables
942 %% than the plain LaTeX2e tabular which is used here.
943 %\begin{tabular}{|c||c|}
944 %\hline
945 %One & Two\\
946 %\hline
947 %Three & Four\\
948 %\hline
949 %\end{tabular}
950 %\end{table}
951
952
953 % Note that the IEEE does not put floats in the very first column
954 % - or typically anywhere on the first page for that matter. Also,
955 % in-text middle ("here") positioning is typically not used, but it
956 % is allowed and encouraged for Computer Society conferences (but
957 % not Computer Society journals). Most IEEE journals/conferences use
958 % top floats exclusively. 
959 % Note that, LaTeX2e, unlike IEEE journals/conferences, places
960 % footnotes above bottom floats. This can be corrected via the
961 % \fnbelowfloat command of the stfloats package.
962
963
964
965
966 \section{Conclusion}
967 In this paper, we have presented a parallel implementation of Ehrlich-Aberth algorithm for solving full and sparse polynomials, on single GPU with CUDA and Multi-GPUs using two parallel paradigm, shared memory with OpenMP, distributed memory with MPI.(CUDA-OpenMP) approach and (CUDA-MPI) approach, 
968 We have performed many experiments with the Ehrlich-Aberth method in single GPU, Multi-GPU with (CUDA-OpenMP) approach, Multi-GPU with (CUDA-MPI) approach for sparse and full polynomials. the experiments show that, using parallel programming model like (OpenMP, MPI) can effectively manage multiple graphics cards to work together to solve the same problem and accelerate parallel applications, like (CUDA MPI) approach with 4 GPUs can solve a polynomial of 1,000,000 4 speed up than on single GPU.
969
970
971 In future, we will evaluate our parallel implementation of Ehrlich-Aberth algorithm on other parallel programming model 
972
973
974 %present a communication approach between multiple GPUs. The comparison between MPI and OpenMP as GPUs controllers shows that these
975 %solutions can effectively manage multiple graphics cards to work together
976 %to solve the same problem
977
978
979  %than we have presented two communication approach between multiple GPUs.(CUDA-OpenMP) approach and (CUDA-MPI) approach, in the objective to manage multiple graphics cards to work together and solve the same problem. in the objective to manage multiple graphics cards to work together and solve the same problem. 
980
981
982
983
984 % conference papers do not normally have an appendix
985
986
987 % use section* for acknowledgment
988 \section*{Acknowledgment}
989
990
991 The authors would like to thank...
992
993
994
995
996
997 % trigger a \newpage just before the given reference
998 % number - used to balance the columns on the last page
999 % adjust value as needed - may need to be readjusted if
1000 % the document is modified later
1001 %\IEEEtriggeratref{8}
1002 % The "triggered" command can be changed if desired:
1003 %\IEEEtriggercmd{\enlargethispage{-5in}}
1004
1005 % references section
1006
1007 % can use a bibliography generated by BibTeX as a .bbl file
1008 % BibTeX documentation can be easily obtained at:
1009 % http://mirror.ctan.org/biblio/bibtex/contrib/doc/
1010 % The IEEEtran BibTeX style support page is at:
1011 % http://www.michaelshell.org/tex/ieeetran/bibtex/
1012 %\bibliographystyle{IEEEtran}
1013 % argument is your BibTeX string definitions and bibliography database(s)
1014 %\bibliography{IEEEabrv,../bib/paper}
1015 %\bibliographystyle{./IEEEtran}
1016 \bibliography{mybibfile}
1017
1018 %
1019 % <OR> manually copy in the resultant .bbl file
1020 % set second argument of \begin to the number of references
1021 % (used to reserve space for the reference number labels box)
1022 %\begin{thebibliography}{1}
1023
1024 %\bibitem{IEEEhowto:kopka}
1025 %H.~Kopka and P.~W. Daly, \emph{A Guide to \LaTeX}, 3rd~ed.\hskip 1em plus
1026  % 0.5em minus 0.4em\relax Harlow, England: Addison-Wesley, 1999.
1027   
1028 %\bibitem{IEEEhowto:NVIDIA12} 
1029  %NVIDIA Corporation, \textit{Whitepaper NVIDA’s Next Generation CUDATM Compute
1030 %Architecture: KeplerTM }, 1st ed., 2012.
1031
1032 %\end{thebibliography}
1033
1034
1035
1036
1037 % that's all folks
1038 \end{document}
1039
1040