mabase.bib

   1 % This file was created with JabRef 2.7.
   2 % Encoding: UTF8
   3
   4 @INPROCEEDINGS{AdelsbachKS06,
   5   author = {Andr{\'e} Adelsbach and Stefan Katzenbeisser and Ahmad-Reza Sadeghi},
   6   title = {A Computational Model for Watermark Robustness},
   7   booktitle = {Information Hiding},
   8   year = {2006},
   9   pages = {145-160},
  10   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  11   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
  12   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_10},
  13   owner = {guyeux},
  14   timestamp = {2009.06.29}
  15 }
  16
  17 @inproceedings{bfg12a:ip,
  18 inhal = {no},
  19 domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
  20 equipe = {and},
  21 classement = {ACTI},
  22 author = {Bahi, Jacques and Fang, Xiaole and Guyeux, Christophe},
  23 title = {An optimization technique on pseudorandom generators based on chaotic iterations},
  24 booktitle = {INTERNET'2012, 4-th Int. Conf. on Evolving Internet},
  25 pages = {***--***},
  26 address = {Venice, Italy},
  27 month = jun,
  28 year = 2012,
  29 note = {To appear},
  30
  31 }
  32
  33 @UNPUBLISHED{ANDREW2008,
  34   author = {NIST Special Publication 800-22 rev. 1},
  35   title = {A Statistical Test Suite for Random and Pseudorandom Number Generators
  36         for Cryptographic Applications},
  37   year = {August 2008},
  38   owner = {qianxue},
  39   timestamp = {2009.01.22}
  40 }
  41
  42 @Article{combined_lcg,
  43         title = "Efficient and portable combined random number generators",
  44     author = {},
  45         journal = "Communications of the ACM",
  46         volume = "31",
  47         number = "6",
  48         pages = "742--749",
  49         year = "1988",
  50 }
  51
  52
  53 @INPROCEEDINGS{Fischlin,
  54   author = {Fischlin, R. and Schnorr, C. P.},
  55   title = {Stronger security proofs for RSA and rabin bits},
  56   booktitle = {Proceedings of the 16th annual international conference on Theory
  57         and application of cryptographic techniques},
  58   year = {1997},
  59   series = {EUROCRYPT'97},
  60   pages = {267--279},
  61   address = {Berlin, Heidelberg},
  62   publisher = {Springer-Verlag},
  63   acmid = {1754569},
  64   isbn = {3-540-62975-0},
  65   location = {Konstanz, Germany},
  66   numpages = {13},
  67   url = {http://dl.acm.org/citation.cfm?id=1754542.1754569}
  68 }
  69
  70 @INPROCEEDINGS{BattiatoCGG99,
  71   author = {Sebastiano Battiato and Dario Catalano and Giovanni Gallo and Rosario
  72         Gennaro},
  73   title = {Robust Watermarking for Images Based on Color Manipulation},
  74   booktitle = {Information Hiding},
  75   year = {1999},
  76   pages = {302-317},
  77   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  78   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
  79   owner = {guyeux},
  80   timestamp = {2009.06.29}
  81 }
  82
  83 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05,
  84   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  85   title = {The Return of the Sensitivity Attack},
  86   booktitle = {IWDW},
  87   year = {2005},
  88   pages = {260-274},
  89   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  90   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
  91   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_20},
  92   owner = {guyeux},
  93   timestamp = {2009.06.29}
  94 }
  95
  96 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05bis,
  97   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  98   title = {Fundamentals of Data Hiding Security and Their Application to Spread-Spectrum
  99         Analysis},
 100   booktitle = {IH'05: Information Hiding Workshop},
 101   year = {2005},
 102   pages = {146-160},
 103   publisher = {Lectures Notes in Computer Science, Springer-Verlag},
 104   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 105   crossref = {DBLP:conf/ih/2005},
 106   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11558859_12},
 107   owner = {guyeux},
 108   timestamp = {2009.06.30}
 109 }
 110
 111 @INPROCEEDINGS{CongJQZ06,
 112   author = {Jin Cong and Yan Jiang and Zhiguo Qu and Zhongmei Zhang},
 113   title = {A Wavelet Packets Watermarking Algorithm Based on Chaos Encryption},
 114   booktitle = {ICCSA (1)},
 115   year = {2006},
 116   pages = {921-928},
 117   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 118   crossref = {DBLP:conf/iccsa/2006-1},
 119   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11751540_100}
 120 }
 121
 122 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/DziembowskiP08,
 123   author = {Stefan Dziembowski and Krzysztof Pietrzak},
 124   title = {Leakage-Resilient Cryptography},
 125   booktitle = {FOCS},
 126   year = {2008},
 127   pages = {293-302},
 128   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 129   crossref = {DBLP:conf/focs/2008},
 130   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/FOCS.2008.56}
 131 }
 132
 133 @INCOLLECTION{Filiol10,
 134   author = {Eric Filiol},
 135   title = {Viruses and Malware},
 136   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
 137   year = {2010},
 138   pages = {747-769},
 139   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 140   crossref = {DBLP:reference/icsec/2010},
 141   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4_34}
 142 }
 143
 144 @INPROCEEDINGS{Filiol00,
 145   author = {Eric Filiol},
 146   title = {Decimation Attack of Stream Ciphers},
 147   booktitle = {INDOCRYPT},
 148   year = {2000},
 149   pages = {31-42},
 150   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 151   crossref = {DBLP:conf/indocrypt/2000},
 152   ee = {http://link.springer.de/link/service/series/0558/bibs/1977/19770031.htm}
 153 }
 154
 155 @INPROCEEDINGS{Furon05,
 156   author = {Teddy Furon},
 157   title = {A Survey of Watermarking Security},
 158   booktitle = {IWDW},
 159   year = {2005},
 160   pages = {201-215},
 161   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 162   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
 163   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_16},
 164   owner = {guyeux},
 165   timestamp = {2009.06.29}
 166 }
 167
 168
 169 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HiggsSHS10,
 170   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 171   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 172         prediction},
 173   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 174   year = {2010},
 175   pages = {1-8},
 176   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 177   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 178   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 179 }
 180
 181 @INPROCEEDINGS{Higgs2010,
 182   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 183   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 184         prediction},
 185   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 186   year = {2010},
 187   pages = {1-8},
 188   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 189   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 190   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 191 }
 192
 193 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HorvathC10,
 194   author = {Dragos Horvath and Camelia Chira},
 195   title = {Simplified chain folding models as metaheuristic benchmark for tuning
 196         real protein folding algorithms?},
 197   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 198   year = {2010},
 199   pages = {1-8},
 200   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 201   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 202   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5585932}
 203 }
 204
 205 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/IslamC10,
 206   author = {Md. Kamrul Islam and Madhu Chetty},
 207   title = {Clustered memetic algorithm for protein structure prediction},
 208   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 209   year = {2010},
 210   pages = {1-8},
 211   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 212   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 213   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586187}
 214 }
 215
 216 @INPROCEEDINGS{Ker06,
 217   author = {Andrew D. Ker},
 218   title = {Batch Steganography and Pooled Steganalysis},
 219   booktitle = {Information Hiding},
 220   year = {2006},
 221   pages = {265-281},
 222   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 223   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
 224   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_18},
 225   owner = {guyeux},
 226   timestamp = {2009.06.29}
 227 }
 228
 229 @INPROCEEDINGS{Lin2009,
 230   author = {H.-Y. Lin and T.-C. Chiang},
 231   title = {Cooperative Secure Data Aggregation in Sensor Networks Using Elliptic
 232         Curve Based Cryptosystems},
 233   booktitle = {CDVE},
 234   year = {2009},
 235   pages = {384-387},
 236   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 237   crossref = {DBLP:conf/cdve/2009},
 238   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04265-2_58}
 239 }
 240
 241 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/MaimourPH09,
 242   author = {Moufida Maimour and CongDuc Pham and Doan B. Hoang},
 243   title = {A Congestion Control Framework for Handling Video Surveillance Traffics
 244         on WSN},
 245   booktitle = {CSE (2)},
 246   year = {2009},
 247   pages = {943-948},
 248   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 249   crossref = {DBLP:conf/cse/2009},
 250   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CSE.2009.200}
 251 }
 252
 253 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/MakhoulSP09,
 254   author = {Abdallah Makhoul and Rachid Saadi and CongDuc Pham},
 255   title = {Coverage and adaptive scheduling algorithms for criticality management
 256         on video wireless sensor networks},
 257   booktitle = {ICUMT},
 258   year = {2009},
 259   pages = {1-8},
 260   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 261   crossref = {DBLP:conf/icumt/2009},
 262   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/ICUMT.2009.5345630}
 263 }
 264
 265 @INPROCEEDINGS{Mittelholzer99,
 266   author = {Thomas Mittelholzer},
 267   title = {An Information-Theoretic Approach to Steganography and Watermarking},
 268   booktitle = {Information Hiding},
 269   year = {1999},
 270   pages = {1-16},
 271   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 272   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
 273   owner = {guyeux},
 274   timestamp = {2009.06.29}
 275 }
 276
 277 @INPROCEEDINGS{PellegriniBA10,
 278   author = {Andrea Pellegrini and Valeria Bertacco and Todd M. Austin},
 279   title = {Fault-based attack of RSA authentication},
 280   booktitle = {DATE},
 281   year = {2010},
 282   pages = {855-860},
 283   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 284   crossref = {DBLP:conf/date/2010},
 285   ee = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5456933}
 286 }
 287
 288 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/Perez-HernandezRG10,
 289   author = {Luis Germ{\'a}n P{\'e}rez-Hern{\'a}ndez and Katya Rodr\'{\i}guez-V{\'a}zquez
 290         and Ram{\'o}n Gardu{\~n}o-Ju{\'a}rez},
 291   title = {Estimation of 3D Protein Structure by means of parallel Particle
 292         Swarm Optimization},
 293   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 294   year = {2010},
 295   pages = {1-8},
 296   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 297   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 298   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586549}
 299 }
 300
 301 @INPROCEEDINGS{WangNHZH07,
 302   author = {Chuntao Wang and Jiangqun Ni and Jiwu Huang and Rongyue Zhang and
 303         Meiying Huang},
 304   title = {Robust and High Capacity Image Watermarking Based on Jointly Coding
 305         and Embedding Optimization},
 306   booktitle = {Information Hiding},
 307   year = {2007},
 308   pages = {65-79},
 309   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 310   crossref = {DBLP:conf/ih/2007},
 311   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-77370-2_5},
 312   owner = {guyeux},
 313   timestamp = {2009.06.29}
 314 }
 315
 316 @INPROCEEDINGS{Zhao04,
 317   author = {Jian Zhao and Mingquan Zhou and Hongmei Xie and Jinye Peng and Xin
 318         Zhou},
 319   title = {A Novel Wavelet Image Watermarking Scheme Combined with Chaos Sequence
 320         and Neural Network},
 321   booktitle = {ISNN (2)},
 322   year = {2004},
 323   pages = {663-668},
 324   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 325   crossref = {DBLP:conf/isnn/2004-2},
 326   ee = {http://springerlink.metapress.com/openurl.asp?genre=article{\&}issn=0302-9743{\&}volume=3174{\&}spage=663}
 327 }
 328
 329 @INPROCEEDINGS{Acharya05securecomparison,
 330   author = {Acharya, Mithun and Girao, Joao and Westhoff, Dirk},
 331   title = {Secure Comparison of Encrypted Data in Wireless Sensor Networks},
 332   booktitle = {WIOPT '05: Proceedings of the Third International Symposium on Modeling
 333         and Optimization in Mobile, Ad Hoc, and Wireless Networks},
 334   year = {2005},
 335   pages = {47--53},
 336   address = {Washington, DC, USA},
 337   publisher = {IEEE Computer Society},
 338   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/WIOPT.2005.44},
 339   isbn = {0-7695-2267-X}
 340 }
 341
 342 @INPROCEEDINGS{Acimez07onthe,
 343   author = {Onur Acıi\c{c}mez and \c{C}etin Kaya Ko\c{c} and Jean-Pierre Seifert},
 344   title = {On the power of simple branch prediction analysis },
 345   booktitle = {2007 ACM Symposium on Information, Computer and Communications Security
 346         (ASIACCS'07)},
 347   year = {2007},
 348   pages = {312--320},
 349   publisher = {ACM Press}
 350 }
 351
 352 @ARTICLE{Adler65,
 353   author = {R. L. Adler and A. G. Konheim and M. H. McAndrew},
 354   title = {Topological entropy},
 355   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
 356   year = {1965},
 357   volume = {114},
 358   pages = {309-319},
 359   owner = {guyeux},
 360   timestamp = {2008.05.29}
 361 }
 362
 363 @INPROCEEDINGS{Agrawal04,
 364   author = {Agrawal, Rakesh and Kiernan, Jerry and Srikant, Ramakrishnan and
 365         Xu, Yirong},
 366   title = {Order preserving encryption for numeric data},
 367   booktitle = {SIGMOD '04: Proceedings of the 2004 ACM SIGMOD international conference
 368         on Management of data},
 369   year = {2004},
 370   pages = {563--574},
 371   address = {New York, NY, USA},
 372   publisher = {ACM},
 373   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1007568.1007632},
 374   isbn = {1-58113-859-8},
 375   location = {Paris, France}
 376 }
 377
 378 @ARTICLE{Anfinsen20071973,
 379   author = {Anfinsen, Christian B.},
 380   title = {Principles that Govern the Folding of Protein Chains},
 381   journal = {Science},
 382   year = {1973},
 383   volume = {181},
 384   pages = {223-230},
 385   number = {4096},
 386   doi = {10.1126/science.181.4096.223},
 387   eprint = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.full.pdf},
 388   url = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.short}
 389 }
 390
 391 @ARTICLE{Arques1994,
 392   author = {D. G. Arques and C. J. Michel},
 393   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine autocorrelation function
 394         after and before random mutations.},
 395   journal = {Math Biosci},
 396   year = {1994},
 397   volume = {123},
 398   pages = {103--125},
 399   number = {1},
 400   month = {Sep},
 401   abstract = {The mutation process is a classical evolutionary genetic process.
 402         The type of mutations studied here is the random substitutions of
 403         a purine base R (adenine or guanine) by a pyrimidine base Y (cytosine
 404         or thymine) and reciprocally (transversions). The analytical expressions
 405         derived allow us to analyze in genes the occurrence probabilities
 406         of motifs and d-motifs (two motifs separated by any d bases) on the
 407         R/Y alphabet under transversions. These motif probabilities can be
 408         obtained after transversions (in the evolutionary sense; from the
 409         past to the present) and, unexpectedly, also before transversions
 410         (after back transversions, in the inverse evolutionary sense, from
 411         the present to the past). This theoretical part in Section 2 is a
 412         first generalization of a particular formula recently derived. The
 413         application in Section 3 is based on the analytical expression giving
 414         the autocorrelation function (the d-motif probabilities) before transversions.
 415         It allows us to study primitive genes from actual genes. This approach
 416         solves a biological problem. The protein coding genes of chloroplasts
 417         and mitochondria have a preferential occurrence of the 6-motif YRY(N)6YRY
 418         (maximum of the autocorrelation function for d = 6, N = R or Y) with
 419         a periodicity modulo 3. The YRY(N)6YRY preferential occurrence without
 420         the periodicity modulo 3 is also observed in the RNA coding genes
 421         (ribosomal, transfer, and small nuclear RNA genes) and in the noncoding
 422         genes (introns and 5' regions of eukaryotic nuclei). However, there
 423         are two exceptions to this YRY(N)6YRY rule: the protein coding genes
 424         of eukaryotic nuclei, and prokaryotes, where YRY(N)6YRY has the second
 425         highest value after YRY(N)0YRY (YRYYRY) with a periodicity modulo
 426         3. When we go backward in time with the analytical expression, the
 427         protein coding genes of both eukaryotic nuclei and prokaryotes retrieve
 428         the YRY(N)6YRY preferential occurrence with a periodicity modulo
 429         3 after 0.2 back transversions per base. In other words, the actual
 430         protein coding genes of chloroplasts and mitochondria are similar
 431         to the primitive protein coding genes of eukaryotic nuclei and prokaryotes.
 432         On the other hand, this application represents the first result concerning
 433         the mutation process in the model of DNA sequence evolution we recently
 434         proposed. According to this model, the actual genes on the R/Y alphabet
 435         derive from two successive evolutionary genetic processes: an independent
 436         mixing of a few nonrandom types of oligonucleotides leading to genes
 437         called primitive followed by a mutation process in these primitive
 438         genes.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)},
 439   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 440         France.},
 441   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Mathematics; Models,
 442         Genetic; Mutation; Probability; Proteins, genetics; Purines; Pyrimidines},
 443   language = {eng},
 444   medline-pst = {ppublish},
 445   owner = {guyeux},
 446   pii = {0025-5564(94)90020-5},
 447   pmid = {7949744},
 448   timestamp = {2011.05.05}
 449 }
 450
 451 @ARTICLE{Arques1998,
 452   author = {D. G. Arquès and J. P. Fallot and C. J. Michel},
 453   title = {An evolutionary analytical model of a complementary circular code
 454         simulating the protein coding genes, the 5' and 3' regions.},
 455   journal = {Bull Math Biol},
 456   year = {1998},
 457   volume = {60},
 458   pages = {163--194},
 459   number = {1},
 460   month = {Jan},
 461   abstract = {The self-complementary subset T0 = X0 [symbol: see text] ¿AAA, TTT¿
 462         with X0 = ¿AAC, AAT, ACC, ATC, ATT, CAG, CTC, CTG, GAA, GAC, GAG,
 463         GAT, GCC, GGC, GGT, GTA, GTC, GTT, TAC, TTC¿ of 22 trinucleotides
 464         has a preferential occurrence in the frame 0 (reading frame established
 465         by the ATG start trinucleotide) of protein (coding) genes of both
 466         prokaryotes and eukaryotes. The subsets T1 = X1 [symbol: see text]
 467         ¿CCC¿ and T2 = X2 [symbol: see text] ¿GGG¿ of 21 trinucleotides have
 468         a preferential occurrence in the shifted frames 1 and 2 respectively
 469         (frame 0 shifted by one and two nucleotides respectively in the 5'-3'
 470         direction). T1 and T2 are complementary to each other. The subset
 471         T0 contains the subset X0 which has the rarity property (6 x 10(-8)
 472         to be a complementary maximal circular code with two permutated maximal
 473         circular codes X1 and X2 in the frames 1 and 2 respectively. X0 is
 474         called a C3 code. A quantitative study of these three subsets T0,
 475         T1, T2 in the three frames 0, 1, 2 of protein genes, and the 5' and
 476         3' regions of eukaryotes, shows that their occurrence frequencies
 477         are constant functions of the trinucleotide positions in the sequences.
 478         The frequencies of T0, T1, T2 in the frame 0 of protein genes are
 479         49, 28.5 and 22.5\% respectively. In contrast, the frequencies of
 480         T0, T1, T2 in the 5' and 3' regions of eukaryotes, are independent
 481         of the frame. Indeed, the frequency of T0 in the three frames of
 482         5' (respectively 3') regions is equal to 35.5\% (respectively 38\%)
 483         and is greater than the frequencies T1 and T2, both equal to 32.25\%
 484         (respectively 31\%) in the three frames. Several frequency asymmetries
 485         unexpectedly observed (e.g. the frequency difference between T1 and
 486         T2 in the frame 0), are related to a new property of the subset T0
 487         involving substitutions. An evolutionary analytical model at three
 488         parameters (p, q, t) based on an independent mixing of the 22 codons
 489         (trinucleotides in frame 0) of T0 with equiprobability (1/22) followed
 490         by t approximately 4 substitutions per codon according to the proportions
 491         p approximately 0.1, q approximately 0.1 and r = 1 - p - q approximately
 492         0.8 in the three codon sites respectively, retrieves the frequencies
 493         of T0, T1, T2 observed in the three frames of protein genes and explains
 494         these asymmetries. Furthermore, the same model (0.1, 0.1, t) after
 495         t approximately 22 substitutions per codon, retrieves the statistical
 496         properties observed in the three frames of the 5' and 3' regions.
 497         The complex behaviour of these analytical curves is totally unexpected
 498         and a priori difficult to imagine.},
 499   doi = {10.1006/bulm.1997.0033},
 500   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Marne la Vallée, Institut
 501         Gaspard Monge, Noisy Le Grand, France. arques@univ-mlv.fr},
 502   keywords = {Animals; Biological Evolution; Codon, genetics; Genetic Code; Humans;
 503         Mammals; Models, Genetic; Probability; Proteins, genetics; Rodentia;
 504         Vertebrates},
 505   language = {eng},
 506   medline-pst = {ppublish},
 507   owner = {guyeux},
 508   pii = {S0092-8240(97)90033-1},
 509   pmid = {9530018},
 510   timestamp = {2011.05.05},
 511   url = {http://dx.doi.org/10.1006/bulm.1997.0033}
 512 }
 513
 514 @ARTICLE{Arques1993,
 515   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 516   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine codon probability
 517         after and before random mutations.},
 518   journal = {Bull Math Biol},
 519   year = {1993},
 520   volume = {55},
 521   pages = {1025--1038},
 522   number = {6},
 523   month = {Nov},
 524   abstract = {Recently, we proposed a new model of DNA sequence evolution (Arquès
 525         and Michel. 1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772) according to which
 526         actual genes on the purine/pyrimidine (R/Y) alphabet (R = purine
 527         = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine) are the
 528         result of two successive evolutionary genetic processes: (i) a mixing
 529         (independent) process of non-random oligonucleotides (words of base
 530         length less than 10: YRY(N)6, YRYRYR and YRYYRY are so far identified;
 531         N = R or Y) leading to primitive genes (words of several hundreds
 532         of base length) and followed by (ii) a random mutation process, i.e.,
 533         transformations of a base R (respectively Y) into the base Y (respectively
 534         R) at random sites in these primitive genes. Following this model
 535         the problem investigated here is the study of the variation of the
 536         8 R/Y codon probabilities RRR, ..., YYY under random mutations. Two
 537         analytical expressions solved here allow analysis of this variation
 538         in the classical evolutionary sense (from the past to the present,
 539         i.e., after random mutations), but also in the inverted evolutionary
 540         sense (from the present to the past, i.e., before random mutations).
 541         Different properties are also derived from these formulae. Finally,
 542         a few applications of these formulae are presented. They prove the
 543         proposition in Arquès and Michel (1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772),
 544         Section 3.3.2, with the existence of a maximal mean number of random
 545         mutations per base of the order 0.3 in the protein coding genes.
 546         They also confirm the mixing process of oligonucleotides by excluding
 547         the purine/pyrimidine contiguous and alternating tracts from the
 548         formation process of primitive genes.},
 549   institution = {Université de Franche-Comté, Besançon, France.},
 550   keywords = {Base Sequence; Codon; DNA, chemistry/genetics; Mathematics; Models,
 551         Genetic; Mutation; Probability; Purines; Pyrimidines},
 552   language = {eng},
 553   medline-pst = {ppublish},
 554   owner = {guyeux},
 555   pmid = {8281128},
 556   timestamp = {2011.05.05}
 557 }
 558
 559 @ARTICLE{Arques1993b,
 560   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 561   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 562         common to different eukaryotic gene subpopulations.},
 563   journal = {Biochimie},
 564   year = {1993},
 565   volume = {75},
 566   pages = {399--407},
 567   number = {5},
 568   abstract = {The nucleotide distribution in protein coding genes, introns and transfer
 569         RNA genes of eukaryotic subpopulations (primates, rodent and mammals)
 570         is studied by autocorrelation functions. The autocorrelation function
 571         analysing the occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY (YRY-function)
 572         in protein coding genes and transfer RNA genes of these three eukaryotic
 573         subpopulations retrieves the preferential occurrence of YRY(N)6YRY
 574         (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine,
 575         N = R or Y). The autocorrelation functions analysing the occurrence
 576         probability of the i-motifs RRR(N)iRRR (RRR-function) and YYY(N)iYYY
 577         (YYY-function) identify new non-random genetic statistical properties
 578         in these three eukaryotic subpopulations, mainly: i) in their protein
 579         coding genes: local maxima for i identical to 6 [12] (peaks for i
 580         = 6, 18, 30, 42) with the RRR-function and local maxima for i identical
 581         to 8 [10] (peaks for i = 8, 18, 28) with the YYY-function; and ii)
 582         in their introns: local maxima for i identical to 3 [6] (peaks for
 583         i = 3, 9, 15) and a short linear decrease followed by a large exponential
 584         decrease both with the RRR- and YYY-functions. The non-random properties
 585         identified in eukaryotic intron subpopulations are modelised with
 586         a process of random insertions and deletions of nucleotides simulating
 587         the RNA editing.},
 588   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 589         d'Informatique de Besançon, France.},
 590   keywords = {Animals; Base Sequence; Data Interpretation, Statistical; Genes; Introns;
 591         Mammals; Models, Genetic; Primates; Probability; Proteins, genetics;
 592         RNA Editing; RNA, Transfer, genetics; Rodentia; Sequence Analysis,
 593         DNA},
 594   language = {eng},
 595   medline-pst = {ppublish},
 596   owner = {guyeux},
 597   pii = {0300-9084(93)90173-P},
 598   pmid = {8347726},
 599   timestamp = {2011.05.05}
 600 }
 601
 602 @ARTICLE{Arques1992,
 603   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 604   title = {A simulation of the genetic periodicities modulo 2 and 3 with processes
 605         of nucleotide insertions and deletions.},
 606   journal = {J Theor Biol},
 607   year = {1992},
 608   volume = {156},
 609   pages = {113--127},
 610   number = {1},
 611   month = {May},
 612   abstract = {Recently, a new genetic process termed RNA editing has been identified
 613         showing insertions and deletions of nucleotides in particular RNA
 614         molecules. On the other hand, there are a few non-random statistical
 615         properties in genes: in particular, the periodicity modulo 3 (P3)
 616         associated with an open reading frame, the periodicity modulo 2 (P2)
 617         associated with alternating purine/pyrimidine stretches, the YRY(N)6YRY
 618         preferential occurrence (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 619         = cytosine or thymine, N = R or Y) representing a "code" of the DNA
 620         helix pitch, etc. The problem investigated here is whether a process
 621         of the type RNA editing can lead to the non-random statistical properties
 622         commonly observed in genes. This paper will show in particular that:
 623         The process of insertions and deletions of mononucleotides in the
 624         initial sequence [YRY(N)3]* [series of YRY(N)3] can lead to the periodicity
 625         modulo 2 (P2). The process of insertions and deletions of trinucleotides
 626         in the initial sequence [YRY(N)6]* [series of YRY(N)6] can lead to
 627         the periodicity modulo 3 (P3) and the YRY(N)6YRY preferential occurrence.
 628         Furthermore, these two processes lead to a strong correlation with
 629         the reality, namely the mononucleotide insertion/deletion process,
 630         with the 5' eukaryotic regions and the trinucleotide insertion/deletion
 631         process, with the eukaryotic protein coding genes.},
 632   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 633         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 634   keywords = {Chromosome Deletion; Computer Simulation; Humans; Models, Genetic;
 635         Mutagenesis, genetics; RNA, genetics},
 636   language = {eng},
 637   medline-pst = {ppublish},
 638   owner = {guyeux},
 639   pmid = {1379311},
 640   timestamp = {2011.05.05}
 641 }
 642
 643 @ARTICLE{Arques1990,
 644   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 645   title = {Periodicities in coding and noncoding regions of the genes.},
 646   journal = {J Theor Biol},
 647   year = {1990},
 648   volume = {143},
 649   pages = {307--318},
 650   number = {3},
 651   month = {Apr},
 652   abstract = {Gene population statistical studies of protein coding genes and introns
 653         have identified two types of periodicities on the purine/pyrimidine
 654         alphabet: (i) the modulo 3 periodicity or coding periodicity (periodicity
 655         P3) in protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, viruses,
 656         chloroplasts, mitochondria, plasmids and in introns of viruses and
 657         mitochondria, and (ii) the modulo 2 periodicity (periodicity P2)
 658         in the eukaryotic introns. The periodicity study is herein extended
 659         to the 5' and 3' regions of eukaryotes, prokaryotes and viruses and
 660         shows: (i) the periodicity P3 in the 5' and 3' regions of eukaryotes.
 661         Therefore, these observations suggest a unitary and dynamic concept
 662         for the genes as for a given genome, the 5' and 3' regions have the
 663         genetic information for protein coding genes and for introns: (1)
 664         In the eukaryotic genome, the 5' (P2 and P3) and 3' (P2 and P3) regions
 665         have the information for protein coding genes (P3) and for introns
 666         (P2). The intensity of P3 is high in 5' regions and weak in 3' regions,
 667         while the intensity of P2 is weak in 5' regions and high in 3' regions.
 668         (2) In the prokaryotic genome, the 5' (P3) and 3' (P3) regions have
 669         the information for protein coding genes (P3). (3) In the viral genome,
 670         the 5' (P3) and 3' (P3) regions have the information for protein
 671         coding genes (P3) and for introns (P3). The absence of P2 in viral
 672         introns (in opposition to eukaryotic introns) may be related to the
 673         absence of P2 in 5' and 3' regions of viruses.},
 674   institution = {Université de Franche-Comté, Unité Associée CNRS No. 822, Besançon,
 675         France.},
 676   keywords = {Animals; Base Sequence; Eukaryotic Cells; Genes; Introns; Prokaryotic
 677         Cells; Purine Nucleotides; Pyrimidine Nucleotides; Repetitive Sequences,
 678         Nucleic Acid; Viruses, genetics},
 679   language = {eng},
 680   medline-pst = {ppublish},
 681   owner = {guyeux},
 682   pmid = {2385108},
 683   timestamp = {2011.05.05}
 684 }
 685
 686 @ARTICLE{Arques1990a,
 687   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 688   title = {A model of DNA sequence evolution.},
 689   journal = {Bull Math Biol},
 690   year = {1990},
 691   volume = {52},
 692   pages = {741--772},
 693   number = {6},
 694   abstract = {Statistical studies of gene populations on the purine/pyrimidine alphabet
 695         have shown that the mean occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY
 696         (R = purine, Y = pyrimidine, N = R or Y) is not uniform by varying
 697         i in the range, but presents a maximum at i = 6 in the following
 698         populations: protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, chloroplasts
 699         and mitochondria, and also viral introns, ribosomal RNA genes and
 700         transfer RNA genes (Arquès and Michel, 1987b, J. theor. Biol. 128,
 701         457-461). From the "universality" of this observation, we suggested
 702         that the oligonucleotide YRY(N)6 is a primitive one and that it has
 703         a central function in DNA sequence evolution (Arquès and Michel,
 704         1987b, J. theor. Biol. 128, 457-461). Following this idea, we introduce
 705         a concept of a model of DNA sequence evolution which will be validated
 706         according to a schema presented in three parts. In the first part,
 707         using the last version of the gene database, the YRY(N)6YRY preferential
 708         occurrence (maximum at i = 6) is confirmed for the populations mentioned
 709         above and is extended to some newly analysed populations: chloroplast
 710         introns, chloroplast 5' regions, mitochondrial 5' regions and small
 711         nuclear RNA genes. On the other hand, the YRY(N)6YRY preferential
 712         occurrence and periodicities are used in order to classify 18 gene
 713         populations. In the second part, we will demonstrate that several
 714         statistical features characterizing different gene populations (in
 715         particular the YRY(N)6YRY preferential occurrence and the periodicities)
 716         can be retrieved from a simple Markov model based on the mixing of
 717         the two oligonucleotides YRY(N)6 and YRY(N)3 and based on the percentages
 718         of RYR and YRY in the unspecified trinucleotides (N)3 of YRY(N)6
 719         and YRY(N)3. Several properties are identified and prove in particular
 720         that the oligonucleotide mixing is an independent process and that
 721         several different features are functions of a unique parameter. In
 722         the third part, the return of the model to the reality shows a strong
 723         correlation between reality and simulation concerning the presence
 724         of a large alternating purine/pyrimidine stretches and of periodicities.
 725         It also contributes to a greater understanding of biological reality,
 726         e.g. the presence or the absence of large alternating purine/pyrimidine
 727         stretches can be explained as being a simple consequence of the mixing
 728         of two particular oligonucleotides. Finally, we believe that such
 729         an approach is the first step toward a unified model of DNA sequence
 730         evolution allowing the molecular understanding of both the origin
 731         of life and the actual biological reality.},
 732   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 733         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 734   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Genetics, Population;
 735         Models, Genetic},
 736   language = {eng},
 737   medline-pst = {ppublish},
 738   owner = {guyeux},
 739   pmid = {2279193},
 740   timestamp = {2011.05.05}
 741 }
 742
 743 @ARTICLE{Arques1993a,
 744   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel and K. Orieux},
 745   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 746         common to different populations of eukaryotic non-coding genes.},
 747   journal = {J Theor Biol},
 748   year = {1993},
 749   volume = {161},
 750   pages = {329--342},
 751   number = {3},
 752   month = {Apr},
 753   abstract = {The autocorrelation function analysing the occurrence probability
 754         of the i-motif YRY(N)iYRY in genes allows the identification of mainly
 755         two periodicities modulo 2, 3 and the preferential occurrence of
 756         the motif YRY(N)6YRY (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 757         = cytosine or thymine, N = R or Y). These non-random genetic statistical
 758         properties can be simulated by an independent mixing of the three
 759         oligonucleotides YRYRYR, YRYYRY and YRY(N)6 (Arquès & Michel, 1990b).
 760         The problem investigated in this study is whether new properties
 761         can be identified in genes with other autocorrelation functions and
 762         also simulated with an oligonucleotide mixing model. The two autocorrelation
 763         functions analysing the occurrence probability of the i-motifs RRR(N)iRRR
 764         and YYY(N)iYYY simultaneously identify three new non-random genetic
 765         statistical properties: a short linear decrease, local maxima for
 766         i identical to 3[6] (i = 3, 9, etc) and a large exponential decrease.
 767         Furthermore, these properties are common to three different populations
 768         of eukaryotic non-coding genes: 5' regions, introns and 3' regions
 769         (see section 2). These three non-random properties can also be simulated
 770         by an independent mixing of the four oligonucleotides R8, Y8, RRRYRYRRR,
 771         YYYRYRYYY and large alternating R/Y series. The short linear decrease
 772         is a result of R8 and Y8, the local maxima for i identical to 3[6],
 773         of RRRYRYRRR and YYYRYRYYY, and the large exponential decrease, of
 774         large alternating R/Y series (section 3). The biological meaning
 775         of these results and their relation to the previous oligonucleotide
 776         mixing model are presented in the Discussion.},
 777   doi = {10.1006/jtbi.1993.1059},
 778   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 779         d'Informatique de Besançon, France.},
 780   keywords = {Animals; Biological Evolution; Genes, genetics; Models, Genetic; Models,
 781         Statistical; Mutation, genetics; Oligonucleotides, genetics; Probability},
 782   language = {eng},
 783   medline-pst = {ppublish},
 784   owner = {guyeux},
 785   pii = {S0022-5193(83)71059-3},
 786   pmid = {8331957},
 787   timestamp = {2011.05.05},
 788   url = {http://dx.doi.org/10.1006/jtbi.1993.1059}
 789 }
 790
 791 @ARTICLE{Arroyo08,
 792   author = {David Arroyo and Gonzalo Alvarez and Veronica Fernandez},
 793   title = {On the inadequacy of the logistic map for cryptographic applications},
 794   journal = {X Reunión Española sobre Criptología y Seguridad de la Información
 795         (X RECSI)},
 796   year = {2008},
 797   volume = {1},
 798   pages = {77-82},
 799   owner = {christophe},
 800   timestamp = {2010.03.01}
 801 }
 802
 803 @MISC{Backofen99algorithmicapproach,
 804   author = {R. Backofen and S. Will and P. Clote},
 805   title = {Algorithmic Approach To Quantifying The Hydrophobic Force Contribution
 806         In Protein Folding},
 807   year = {1999}
 808 }
 809
 810
 811 @inproceedings{Blum:1985:EPP:19478.19501,
 812  author = {Blum, Manuel and Goldwasser, Shafi},
 813  title = {An efficient probabilistic public key encryption scheme which hides all partial information},
 814  booktitle = {Proceedings of CRYPTO 84 on Advances in cryptology},
 815  year = {1985},
 816  isbn = {0-387-15658-5},
 817  location = {Santa Barbara, California, United States},
 818  pages = {289--302},
 819  numpages = {14},
 820  url = {http://dl.acm.org/citation.cfm?id=19478.19501},
 821  acmid = {19501},
 822  publisher = {Springer-Verlag New York, Inc.},
 823  address = {New York, NY, USA},
 824  keywords = {chosen cyphertext attack, integer factorization, partial information, passive adversaries, probabilistic encryption},
 825 }
 826
 827
 828 @INPROCEEDINGS{bcgr11:ip,
 829   author = {Bahi, Jacques M. and Couchot, Jean-fran\c{c}ois and Guyeux, Christophe
 830         and Richard, Adrien},
 831   title = {On the Link Between Strongly Connected Iteration Graphs and Chaotic
 832         Boolean Discrete-Time Dynamical Systems},
 833   booktitle = {FCT'11, 18th Int. Symp. on Fundamentals of Computation Theory},
 834   year = {2011},
 835   volume = {*},
 836   series = {LNCS},
 837   pages = {***--***},
 838   address = {Oslo, Norway},
 839   month = aug,
 840   note = {To appear},
 841   classement = {ACTI},
 842   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 843   equipe = {and},
 844   inhal = {no}
 845 }
 846
 847 @ARTICLE{bg10:ij,
 848   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 849   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
 850   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
 851   year = {2010},
 852   volume = {4},
 853   pages = {167--181},
 854   number = {2},
 855   classement = {ACLI},
 856   doi = {10.1260/1748-3018.4.2.167},
 857   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 858   equipe = {and},
 859   impact-factor = {#},
 860   inhal = {no},
 861   isi-acro = {#},
 862   url = {http://dx.doi.org/10.1260/1748-3018.4.2.167}
 863 }
 864
 865 @INPROCEEDINGS{guyeux10ter,
 866   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
 867   title = {A new chaos-based watermarking algorithm},
 868   booktitle = {SECRYPT'10, Int. conf. on security and cryptography},
 869   year = {2010},
 870   pages = {455--458},
 871   address = {Athens, Greece},
 872   month = jul,
 873   publisher = {SciTePress},
 874   classement = {ACTI},
 875   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 876   equipe = {and},
 877   inhal = {no}
 878 }
 879
 880 @INPROCEEDINGS{bgc11:ip,
 881   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Cote, Nathalie},
 882   title = {Chaos of Protein Folding},
 883   booktitle = {IJCNN 2011, Int. Joint Conf. on Neural Networks},
 884   year = {2011},
 885   pages = {***--***},
 886   address = {San Jose, California, United States},
 887   month = jul,
 888   note = {To appear},
 889   classement = {ACTI},
 890   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 891   equipe = {and},
 892   inhal = {no}
 893 }
 894
 895 @INPROCEEDINGS{guyeux10bis,
 896   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 897   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 898         Networks},
 899   booktitle = {SENSORCOMM'10, 4-th Int. Conf. on Sensor Technologies and Applications},
 900   year = {2010},
 901   pages = {472--477},
 902   address = {Venice-Mestre, Italy},
 903   month = jul,
 904   classement = {ACTI},
 905   doi = {10.1109/SENSORCOMM.2010.76},
 906   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 907   equipe = {and},
 908   inhal = {no},
 909   url = {http://dx.doi.org/10.1109/SENSORCOMM.2010.76}
 910 }
 911
 912 @INPROCEEDINGS{guyeuxVictoria,
 913   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 914   title = {Secure Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. Homomorphism
 915         versus Watermarking Approach},
 916   booktitle = {ADHOCNETS 2010, 2nd Int. Conf. on Ad Hoc Networks},
 917   year = {2010},
 918   volume = {49},
 919   series = {Lecture Notes in ICST},
 920   pages = {344--358},
 921   address = {Victoria, Canada},
 922   month = aug,
 923   classement = {ACTI},
 924   doi = {10.1007/978-3-642-17994-5_23},
 925   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 926   equipe = {and},
 927   inhal = {no},
 928   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5_23}
 929 }
 930
 931 @INPROCEEDINGS{bgs11:ip,
 932   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Salomon, Michel},
 933   title = {Building a Chaotic Proven Neural Network},
 934   booktitle = {ICCANS 2011, IEEE Int. Conf. on Computer Applications and Network
 935         Security},
 936   year = {2011},
 937   pages = {***--***},
 938   address = {Maldives, Maldives},
 939   month = may,
 940   classement = {ACTI},
 941   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 942   equipe = {and},
 943   inhal = {no}
 944 }
 945
 946 @INPROCEEDINGS{bgw10:ip,
 947   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 948   title = {A Pseudo Random Numbers Generator Based on Chaotic Iterations. Application
 949         to Watermarking},
 950   booktitle = {WISM 2010, Int. Conf. on Web Information Systems and Mining},
 951   year = {2010},
 952   volume = {6318},
 953   series = {LNCS},
 954   pages = {202--211},
 955   address = {Sanya, China},
 956   month = oct,
 957   classement = {ACTI},
 958   doi = {10.1007/978-3-642-16515-3_26},
 959   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 960   equipe = {and},
 961   inhal = {no},
 962   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-16515-3_26}
 963 }
 964
 965 @INPROCEEDINGS{bgw09:ip,
 966   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 967   title = {A novel pseudo-random generator based on discrete chaotic iterations},
 968   booktitle = {INTERNET'09, 1-st Int. Conf. on Evolving Internet},
 969   year = {2009},
 970   pages = {71--76},
 971   address = {Cannes, France},
 972   month = aug,
 973   classement = {ACTI},
 974   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 975   equipe = {and},
 976   inhal = {no}
 977 }
 978
 979 @INPROCEEDINGS{bmg10:onp,
 980   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 981   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 982         Networks for critical applications},
 983   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 984         et Applications Critiques de Surveillance},
 985   year = {2010},
 986   address = {Bayonne, France},
 987   month = jun,
 988   note = {Communication orale},
 989   classement = {COM},
 990   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 991   equipe = {and},
 992   inhal = {no}
 993 }
 994
 995 @INPROCEEDINGS{guyeuxBayonne,
 996   author = {Bahi, Jacques M. and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 997   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 998         Networks for critical applications},
 999   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
1000         et Applications Critiques de Surveillance},
1001   year = {2010},
1002   address = {Bayonne, France},
1003   month = jun,
1004   note = {Communication orale},
1005   classement = {COM},
1006   equipe = {and},
1007   inhal = {no}
1008 }
1009
1010 @ARTICLE{bs10:ij,
1011   author = {Bahi, Jacques M. and Salomon, Michel},
1012   title = {A Decentralized Energy-based Diffusion Algorithm to Increase the
1013         Lifetime of {MANETs}},
1014   journal = {Computer Networks Journal},
1015   year = {2010},
1016   pages = {***--***},
1017   note = {Accepted manuscript. To appear},
1018   classement = {ACLI},
1019   equipe = {and},
1020   impact-factor = {1.201},
1021   inhal = {no},
1022   isi-acro = {#},
1023   publisher = {Elsevier}
1024 }
1025
1026 @ARTICLE{Bahi2000,
1027   author = {J. M. Bahi},
1028   title = {Boolean totally asynchronous iterations},
1029   journal = {Int. Journal of Mathematical Algorithms},
1030   year = {2000},
1031   volume = {1},
1032   pages = {331--346},
1033   owner = {guyeux},
1034   timestamp = {17/02/2008}
1035 }
1036
1037 @ARTICLE{Bahi2000bis,
1038   author = {Jacques M. Bahi},
1039   title = {Asynchronous iterative algorithms for nonexpansive linear systems},
1040   journal = {Journal of Parallel and Distributed Computing},
1041   year = {2000},
1042   volume = {60},
1043   pages = {92--112},
1044   owner = {guyeux},
1045   timestamp = {2009.01.10}
1046 }
1047
1048 @ARTICLE{Bahi1999,
1049   author = {J. M. Bahi},
1050   title = {Parallel synchronous chaotic iterations for singular linear systems},
1051   journal = {Parallel Algorithms and Applications},
1052   year = {1999},
1053   volume = {14},
1054   pages = {19--35},
1055   owner = {guyeux},
1056   timestamp = {17/02/2008}
1057 }
1058
1059 @ARTICLE{Bahi1998,
1060   author = {Jacques M. Bahi},
1061   title = {Algorithmes paralleles asynchrones pour les systemes singuliers},
1062   journal = {Comptes Rendus de l'Academie des Sciences},
1063   year = {1998},
1064   volume = {t. 326, serie 1},
1065   pages = {1421--1425},
1066   owner = {guyeux},
1067   timestamp = {2009.01.18}
1068 }
1069
1070 @PHDTHESIS{bahi98,
1071   author = {Jacques M. Bahi},
1072   title = {Méthodes itératives dans des espaces produits. Application au calcul
1073         parallèle},
1074   school = {Université de Franche-Comté},
1075   year = {1998},
1076   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1077   owner = {christophe},
1078   timestamp = {2010.08.24}
1079 }
1080
1081 @PHDTHESIS{bahi91,
1082   author = {Jacques M. Bahi},
1083   title = {Algorithmes asynchrones pour des systèmes différentiels-algébriques.
1084         Simulation numérique sur des exemples de circuits électriques},
1085   school = {Université de Franche-Comté},
1086   year = {1991},
1087   owner = {christophe},
1088   timestamp = {2010.08.24}
1089 }
1090
1091 @ARTICLE{bcv06:ij,
1092   author = {Jacques M. Bahi and Sylvain Contassot-Vivier},
1093   title = {Basins of attraction in fully asynchronous discrete-time discrete-state
1094         dynamic networks},
1095   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1096   year = {2006},
1097   volume = {17},
1098   pages = {397--408},
1099   number = {2},
1100   inhal = {no},
1101   owner = {guyeux},
1102   timestamp = {2009.12.04}
1103 }
1104
1105 @ARTICLE{Bahi2002,
1106   author = {J.~M. Bahi and S. Contassot-Vivier},
1107   title = {Stability of fully asynchronous discrete-time discrete state dynamic
1108         networks},
1109   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1110   year = {2002},
1111   volume = {13(6)},
1112   pages = {1353-1363},
1113   owner = {guyeux},
1114   timestamp = {2009.02.14}
1115 }
1116
1117 @TECHREPORT{bcgg10:ir,
1118   author = {Bahi, J. M. and Couchot, J.-F. and Grasset, O. and Guyeux, C.},
1119   title = {{D}iscrete {D}ynamical {S}ystems: {N}ecessary {D}ivergence {C}onditions
1120         for {S}ynchronous {I}terations},
1121   institution = {LIFC - Laboratoire d'{I}nformatique de l'{U}niversit\'{e} de {F}ranche
1122         {C}omt\'{e}},
1123   year = {2010},
1124   type = {Research Report},
1125   number = {RR2010-04},
1126   month = sep,
1127   pdf = {/~publis/papers/pub/2010/RR2010-04.pdf}
1128 }
1129
1130 @ARTICLE{guyeux09,
1131   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1132   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
1133   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
1134   year = {2010},
1135   volume = {4},
1136   pages = {167--181},
1137   number = {2},
1138   classement = {ACLNI},
1139   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1140   equipe = {and},
1141   impact-factor = {#},
1142   inhal = {no},
1143   isi-acro = {#}
1144 }
1145
1146 @INPROCEEDINGS{guyeux10,
1147   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1148   title = {Topological chaos and chaotic iterations, application to Hash functions},
1149   booktitle = {WCCI'10, IEEE World Congress on Computational Intelligence},
1150   year = {2010},
1151   pages = {1--7},
1152   address = {Barcelona, Spain},
1153   month = jul,
1154   note = {Best paper award},
1155   classement = {ACTI},
1156   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1157   equipe = {and},
1158   inhal = {no}
1159 }
1160
1161 @MISC{ih10,
1162   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1163   title = {A chaos-based approach for information hiding security.},
1164   howpublished = {arXiv},
1165   month = {April},
1166   year = {2010},
1167   institution = {Computer Science Laboratory LIFC, University of Franche-Comte, France}
1168 }
1169
1170 @ARTICLE{arxiv,
1171   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1172   title = {A watermarking algorithm satisfying topological chaos properties},
1173   journal = {CoRR},
1174   year = {2008},
1175   volume = {abs/0810.4713},
1176   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1177   ee = {http://arxiv.org/abs/0810.4713}
1178 }
1179
1180 @ARTICLE{Bahi2008,
1181   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1182   title = {Chaotic iterations and topological chaos},
1183   year = {2008},
1184   abstract = {Chaotic iterations have been introduced on the one hand by Chazan,
1185         Miranker [5] and Miellou [9] in a numerical analysis context, and
1186         on the other hand by Robert [11] and Pellegrin [10] in the discrete
1187         dynamical systems framework. In both cases, the objective was to
1188         derive conditions of convergence of such iterations to a fixed state.
1189         In this paper, a new point of view is presented, the goal here is
1190         to derive conditions under which chaotic iterations admit a chaotic
1191         behaviour in a rigorous mathematical sense. Contrary to what has
1192         been studied in the literature, convergence is not desired. More
1193         precisely, we establish in this paper a link between the concept
1194         of chaotic iterations on a finite set and the notion of topological
1195         chaos [8], [6], [7]. We are motivated by concrete applications of
1196         our approach, such as the use of chaotic boolean iterations in the
1197         computer security field. Indeed, the concept of chaos is used in
1198         many areas of data security without real rigorous theoretical foundations,
1199         and without using the fundamental properties that allow chaos. The
1200         wish of this paper is to bring a bit more mathematical rigour in
1201         this field.},
1202   citeseerurl = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1203   comment = {arXiv},
1204   comments = {6 pages},
1205   eprint = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1206   oai2identifier = {0810.3154},
1207   owner = {guyeux},
1208   timestamp = {2008.10.23},
1209   url = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}}
1210 }
1211
1212 @ARTICLE{arxivRNNchaos,
1213   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux and Michel Salomon},
1214   title = {Building a Chaotic Proved Neural Network},
1215   journal = {CoRR},
1216   year = {2011},
1217   volume = {abs/1101.4351},
1218   ee = {http://arxiv.org/abs/1101.4351}
1219 }
1220
1221 @INPROCEEDINGS{guyeuxTaiwan10,
1222   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
1223   title = {Improving random number generators by chaotic iterations. Application
1224         in data hiding},
1225   booktitle = {ICCASM 2010, Int. Conf. on Computer Application and System Modeling},
1226   year = {2010},
1227   pages = {V13-643--V13-647},
1228   address = {Taiyuan, China},
1229   month = oct,
1230   classement = {ACTI},
1231   doi = {10.1109/ICCASM.2010.5622199},
1232   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1233   equipe = {and},
1234   inhal = {no},
1235   url = {http://dx.doi.org/10.1109/ICCASM.2010.5622199}
1236 }
1237
1238 @ARTICLE{Bahi2009,
1239   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1240   title = {A stochastic model of gene evolution with time dependent pseudochaotic
1241         mutations.},
1242   journal = {Bull Math Biol},
1243   year = {2009},
1244   volume = {71},
1245   pages = {681--700},
1246   number = {3},
1247   month = {Apr},
1248   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1249         in which a random subset of the 64 possible trinucleotides mutates
1250         at each evolutionary time t according to some time dependent substitution
1251         probabilities. Therefore, at each time t, the numbers and the types
1252         of mutable trinucleotides are unknown. Thus, the mutation matrix
1253         changes at each time t. This pseudochaotic model developed generalizes
1254         the standard model in which all the trinucleotides mutate at each
1255         time t. It determines the occurrence probabilities at time t of trinucleotides
1256         which pseudochaotically mutate according to 3 time dependent substitution
1257         parameters associated with the 3 trinucleotide sites. The main result
1258         proves that under suitable assumptions, this pseudochaotic model
1259         converges to a uniform probability vector identical to that of the
1260         standard model. Furthermore, an application of this pseudochaotic
1261         model allows an evolutionary study of the 3 circular codes identified
1262         in both eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1263         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1264         frames in genes locally, i.e., anywhere in genes and particularly
1265         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1266         After a certain evolutionary time and with particular time dependent
1267         functions for the 3 substitution parameters, precisely an exponential
1268         decrease in the 1st and 2nd trinucleotide sites and an exponential
1269         increase in the 3rd one, this pseudochaotic model retrieves the main
1270         statistical properties of the 3 circular codes observed in genes.
1271         Furthermore, it leads to a circular code asymmetry stronger than
1272         the standard model (nonpseudochaotic) and, therefore, to a better
1273         correlation with the genes.},
1274   doi = {10.1007/s11538-008-9376-4},
1275   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1276         90016, Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1277   keywords = {Evolution, Molecular; Genes; Models, Genetic; Mutation; Stochastic
1278         Processes},
1279   language = {eng},
1280   medline-pst = {ppublish},
1281   owner = {guyeux},
1282   pmid = {19198957},
1283   timestamp = {2011.05.05},
1284   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-008-9376-4}
1285 }
1286
1287 @ARTICLE{Bahi2008a,
1288   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1289   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations.},
1290   journal = {J Theor Biol},
1291   year = {2008},
1292   volume = {255},
1293   pages = {53--63},
1294   number = {1},
1295   month = {Nov},
1296   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1297         in which the mutations are chaotic, i.e. a random subset of the 64
1298         possible trinucleotides mutates at each evolutionary time t according
1299         to some substitution probabilities. Therefore, at each time t, the
1300         numbers and the types of mutable trinucleotides are unknown. Thus,
1301         the mutation matrix changes at each time t. The chaotic model developed
1302         generalizes the standard model in which all the trinucleotides mutate
1303         at each time t. It determines the occurrence probabilities at time
1304         t of trinucleotides which chaotically mutate according to three substitution
1305         parameters associated with the three trinucleotide sites. Two theorems
1306         prove that this chaotic model has a probability vector at each time
1307         t and that it converges to a uniform probability vector identical
1308         to that of the standard model. Furthermore, four applications of
1309         this chaotic model (with a uniform random strategy for the 64 trinucleotides
1310         and with a particular strategy for the three stop codons) allow an
1311         evolutionary study of the three circular codes identified in both
1312         eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1313         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1314         frames in genes locally, i.e. anywhere in genes and particularly
1315         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1316         After a certain evolutionary time and with particular values for
1317         the three substitution parameters, the chaotic models retrieve the
1318         main statistical properties of the three circular codes observed
1319         in genes. These applications also allow an evolutionary comparison
1320         between the standard and chaotic models.},
1321   doi = {10.1016/j.jtbi.2008.07.028},
1322   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1323         90016 Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1324   keywords = {Animals; Computer Simulation; DNA, Circular, genetics; Evolution,
1325         Molecular; Genetic Code; Models, Genetic; Mutation; Nonlinear Dynamics;
1326         Stochastic Processes; Time},
1327   language = {eng},
1328   medline-pst = {ppublish},
1329   owner = {guyeux},
1330   pii = {S0022-5193(08)00395-0},
1331   pmid = {18706428},
1332   timestamp = {2011.05.05},
1333   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2008.07.028}
1334 }
1335
1336 @ARTICLE{Bahi2008bis,
1337   author = {Bahi, J. M. and Michel, C. J.},
1338   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations},
1339   journal = {Journal of Theoretical Biology},
1340   year = {2008},
1341   volume = {255},
1342   pages = {53-63},
1343   owner = {guyeux},
1344   timestamp = {2009.01.10}
1345 }
1346
1347 @ARTICLE{Bahi2004,
1348   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1349   title = {A stochastic gene evolution model with time dependent mutations.},
1350   journal = {Bull Math Biol},
1351   year = {2004},
1352   volume = {66},
1353   pages = {763--778},
1354   number = {4},
1355   month = {Jul},
1356   abstract = {We develop here a new class of gene evolution models in which the
1357         nucleotide mutations are time dependent. These models allow to study
1358         nonlinear gene evolution by accelerating or decelerating the mutation
1359         rates at different evolutionary times. They generalize the previous
1360         ones which are based on constant mutation rates. The stochastic model
1361         developed in this class determines at some time t the occurrence
1362         probabilities of trinucleotides mutating according to 3 time dependent
1363         substitution parameters associated with the 3 trinucleotide sites.
1364         Therefore, it allows to simulate the evolution of the circular code
1365         recently observed in genes. By varying the class of function for
1366         the substitution parameters, 1 among 12 models retrieves after mutation
1367         the statistical properties of the observed circular code in the 3
1368         frames of actual genes. In this model, the mutation rate in the 3rd
1369         trinucleotide site increases during gene evolution while the mutation
1370         rates in the 1st and 2nd sites decrease. This property agrees with
1371         the actual degeneracy of the genetic code. This approach can easily
1372         be generalized to study evolution of motifs of various lengths, e.g.,
1373         dicodons, etc., with time dependent mutations.},
1374   doi = {10.1016/j.bulm.2003.10.004},
1375   institution = {LIFC - FRE CNRS 2661, IUT de Belfort, Université de Franche-Comté,
1376         BP 527, 90016 Belfort Cédex, France. bahi@iut-bm.univ-fcomte.fr},
1377   keywords = {Codon, genetics; Evolution, Molecular; Genes, genetics; Genetic Code,
1378         genetics; Models, Genetic; Mutation; Stochastic Processes},
1379   language = {eng},
1380   medline-pst = {ppublish},
1381   owner = {guyeux},
1382   pii = {S0092824003001174},
1383   pmid = {15210317},
1384   timestamp = {2011.05.05},
1385   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.bulm.2003.10.004}
1386 }
1387
1388 @ARTICLE{Banks92,
1389   author = {J. Banks and J. Brooks and G. Cairns and P. Stacey},
1390   title = {On Devaney's Definition of Chaos},
1391   journal = {Amer. Math. Monthly},
1392   year = {1992},
1393   volume = {99},
1394   pages = {332--334},
1395   keywords = {(c+),},
1396   owner = {guyeux},
1397   timestamp = {27/01/2008}
1398 }
1399
1400 @MISC{Nist10,
1401   author = {E. Barker and A. Roginsky},
1402   title = {DRAFT NIST Special Publication 800-131 Recommendation for the Transitioning
1403         of Cryptographic Algorithms and Key Sizes},
1404   year = {2010},
1405   owner = {christophe},
1406   timestamp = {2010.08.18}
1407 }
1408
1409 @ARTICLE{BarniBF03,
1410   author = {Mauro Barni and Franco Bartolini and Teddy Furon},
1411   title = {A general framework for robust watermarking security},
1412   journal = {Signal Processing},
1413   year = {2003},
1414   volume = {83},
1415   pages = {2069-2084},
1416   number = {10},
1417   note = {Special issue on Security of Data Hiding Technologies, invited paper},
1418   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1419   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/S0165-1684(03)00168-3},
1420   owner = {guyeux},
1421   timestamp = {2009.06.30}
1422 }
1423
1424 @ARTICLE{Baudet78,
1425   author = {Baudet, G\'{e}rard M.},
1426   title = {Asynchronous Iterative Methods for Multiprocessors},
1427   journal = {J. ACM},
1428   year = {1978},
1429   volume = {25},
1430   pages = {226--244},
1431   number = {2},
1432   address = {New York, NY, USA},
1433   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/322063.322067},
1434   issn = {0004-5411},
1435   publisher = {ACM}
1436 }
1437
1438 @PHDTHESIS{Baz98,
1439   author = {Didier El Baz},
1440   title = {Contribution à l'algorithmique parallèle. Le concept d'asynchronisme
1441         : étude théorique, mise en œuvre, et application},
1442   school = {Institut national polytechnique de Toulouse},
1443   year = {1998},
1444   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1445   owner = {christophe},
1446   timestamp = {2010.08.24}
1447 }
1448
1449 @ARTICLE{bhr09c:bl,
1450   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1451   title = {Contention awareness and fault-tolerant scheduling for precedence
1452         constrained tasks in heterogeneous systems},
1453   journal = {Parallel Computing},
1454   year = {2009},
1455   volume = {35},
1456   pages = {83--108},
1457   number = {2},
1458   classement = {*},
1459   doi = {10.1016/j.parco.2008.11.001},
1460   equipe = {and},
1461   inhal = {no},
1462   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.parco.2008.11.001}
1463 }
1464
1465 @INPROCEEDINGS{bhr08b:bl,
1466   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1467   title = {Fault tolerant scheduling of precedence task graphs on heterogeneous
1468         platforms},
1469   booktitle = {IPDPS'08},
1470   year = {2008},
1471   pages = {1--8},
1472   publisher = {IEEE Computer Society Press},
1473   classement = {*},
1474   equipe = {and},
1475   inhal = {no}
1476 }
1477
1478 @INPROCEEDINGS{Berger98,
1479   author = {Berger, Bonnie and Leighton, Tom},
1480   title = {Protein folding in the hydrophobic-hydrophilic (HP) is NP-complete},
1481   booktitle = {Proceedings of the second annual international conference on Computational
1482         molecular biology},
1483   year = {1998},
1484   series = {RECOMB '98},
1485   pages = {30--39},
1486   address = {New York, NY, USA},
1487   publisher = {ACM},
1488   acmid = {279080},
1489   isbn = {0-89791-976-9},
1490   location = {New York, New York, United States},
1491   numpages = {10}
1492 }
1493
1494 @BOOK{Bertsekas89,
1495   title = {Parallel and distributed computation: numerical methods},
1496   publisher = {Prentice-Hall, Inc.},
1497   year = {1989},
1498   author = {Bertsekas, Dimitri P. and Tsitsiklis, John N.},
1499   address = {Upper Saddle River, NJ, USA},
1500   isbn = {0-13-648700-9}
1501 }
1502
1503 @MISC{Bertsekas88paralleland,
1504   author = {Dimitri P. Bertsekas and John N. Tsitsiklis},
1505   title = {Parallel and distributed iterative algorithms: a selective survey},
1506   year = {1988}
1507 }
1508
1509 @UNPUBLISHED{F.a,
1510   author = {F. Blanchard and E. Glasner and S. Kolyada and A.Maass},
1511   title = {On Li-Yorke pairs},
1512   note = {Preprint},
1513   optkey = {2000},
1514   owner = {guyeux},
1515   timestamp = {2008.01.02}
1516 }
1517
1518 @UNPUBLISHED{F.,
1519   author = {F. Blanchard and B. Host and S. Ruette},
1520   title = {Asymptotic pairs in positive-entropy systems},
1521   note = {Preprint},
1522   optannote = {to appear in Ergod. Th. Dynam. Sys.},
1523   optkey = {2000},
1524   owner = {guyeux},
1525   timestamp = {2008.01.02}
1526 }
1527
1528 @ARTICLE{BFibe,
1529   author = {Dan Boneh and Matt Franklin},
1530   title = {Identity-Based Encryption from the {Weil} Pairing},
1531   journal = {SIAM J. of Computing},
1532   year = {2003},
1533   volume = {32},
1534   pages = {586-615},
1535   number = {3},
1536   note = {Extended abstract in Crypto'01}
1537 }
1538
1539 @INCOLLECTION{boneh,
1540   author = {Boneh, Dan and Goh, Eu-Jin and Nissim, Kobbi},
1541   title = {Evaluating 2-DNF Formulas on Ciphertexts},
1542   year = {2005},
1543   pages = {325--341},
1544   abstract = {Let ψ be a 2-DNF formula on boolean variables x 1,..., x n ∈ {0,1}.
1545         We present a homomorphic public key encryption scheme that allows
1546         the public evaluation of ψ given an encryption of the variables x
1547         1,..., x n. In other words, given the encryption of the bits x 1,...,
1548         x n, anyone can create the encryption of ψ( x 1,..., x n). More generally,
1549         we can evaluate quadratic multi-variate polynomials on ciphertexts
1550         provided the resulting value falls within a small set. We present
1551         a number of applications of the system: 1 In a database of size n,
1552         the total communication in the basic step of the Kushilevitz-Ostrovsky
1553         PIR protocol is reduced from to . 2 An efficient election system
1554         based on homomorphic encryption where voters do not need to include
1555         non-interactive zero knowledge proofs that their ballots are valid.
1556         The election system is proved secure without random oracles but still
1557         efficient. 3 A protocol for universally verifiable computation.},
1558   citeulike-article-id = {2719460},
1559   citeulike-linkout-0 = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg},
1560   journal = {Theory of Cryptography},
1561   keywords = {homomorphic, pairings},
1562   posted-at = {2008-04-25 21:53:15},
1563   priority = {2},
1564   url = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg}
1565 }
1566
1567 @ARTICLE{Bonneau01,
1568   author = {Bonneau, Richard and Baker, David},
1569   title = {AB INITIO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION: Progress and Prospects},
1570   journal = {Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure},
1571   year = {2001},
1572   volume = {30},
1573   pages = {173-189},
1574   number = {1},
1575   doi = {10.1146/annurev.biophys.30.1.173}
1576 }
1577
1578 @ARTICLE{Bowen,
1579   author = {R. Bowen},
1580   title = {Entropy for group endomorphisms and homogeneous spaces},
1581   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1582   year = {1971},
1583   volume = {153},
1584   pages = {401-414},
1585   owner = {guyeux},
1586   timestamp = {15/02/2008}
1587 }
1588
1589 @ARTICLE{Bowen1971,
1590   author = {R. Bowen},
1591   title = {Periodic points and measures for Axiom A diffeomorphisms},
1592   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1593   year = {1971},
1594   volume = {154},
1595   pages = {377-397},
1596   owner = {guyeux},
1597   timestamp = {15/02/2008}
1598 }
1599
1600 @ARTICLE{Braxenthaler97,
1601   author = {Michael Braxenthaler and R. Ron Unger and Ditza Auerbach and John
1602         Moult},
1603   title = {Chaos in protein dynamics},
1604   journal = {Proteins-structure Function and Bioinformatics},
1605   year = {1997},
1606   volume = {29},
1607   pages = {417--425},
1608   doi = {10.1002/(SICI)1097-0134(199712)29:4<417::AID-PROT2>3.3.CO;2-O},
1609   masid = {2824140}
1610 }
1611
1612 @INPROCEEDINGS{Brumley03remotetiming,
1613   author = {David Brumley and Dan Boneh},
1614   title = {Remote Timing Attacks are Practical},
1615   booktitle = {Proceedings of the 12th USENIX Security Symposium},
1616   year = {2003},
1617   pages = {1--14}
1618 }
1619
1620 @ARTICLE{Bohm1991375,
1621   author = {Gerald Böhm},
1622   title = {Protein folding and deterministic chaos: Limits of protein folding
1623         simulations and calculations},
1624   journal = {Chaos, Solitons \& Fractals},
1625   year = {1991},
1626   volume = {1},
1627   pages = {375 - 382},
1628   number = {4},
1629   doi = {DOI: 10.1016/0960-0779(91)90028-8},
1630   issn = {0960-0779},
1631   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TJ4-46CBXVT-1X/2/370489c218e4c2732cd9b620ef50c696}
1632 }
1633
1634 @INCOLLECTION{Cachin2004,
1635   author = {Cachin, Christian},
1636   title = {An Information-Theoretic Model for Steganography},
1637   booktitle = {Information Hiding},
1638   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1639   year = {1998},
1640   volume = {1525},
1641   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1642   pages = {306-318},
1643   affiliation = {MIT Laboratory for Computer Science 545 Technology Square Cambridge
1644         MA 02139 USA}
1645 }
1646
1647 @ARTICLE{Cam2006,
1648   author = {H. Cam and S. Ozdemir and P. Nair and D. Muthuavinashinappan and
1649         H. O. Sanli},
1650   title = {ESPDA: Energy-efficient secure pattern based data aggregation for
1651         wireless sensor networks.},
1652   journal = {Computer Communication journal (29)},
1653   year = {2006},
1654   pages = {446-455}
1655 }
1656
1657 @ARTICLE{CarletCZ98,
1658   author = {Claude Carlet and Pascale Charpin and Victor Zinoviev},
1659   title = {Codes, Bent Functions and Permutations Suitable For DES-like Cryptosystems},
1660   journal = {Des. Codes Cryptography},
1661   year = {1998},
1662   volume = {15},
1663   pages = {125-156},
1664   number = {2},
1665   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de}
1666 }
1667
1668 @INPROCEEDINGS{Castelluccia05efficientaggregation,
1669   author = {Claude Castelluccia},
1670   title = {Efficient aggregation of encrypted data in wireless sensor networks},
1671   booktitle = {MobiQuitous},
1672   year = {2005},
1673   pages = {109--117},
1674   publisher = {IEEE Computer Society}
1675 }
1676
1677 @ARTICLE{Cayre2008,
1678   author = {Cayre, F. and Bas, P.},
1679   title = {Kerckhoffs-Based Embedding Security Classes for WOA Data Hiding},
1680   journal = {IEEE Transactions on Information Forensics and Security},
1681   year = {2008},
1682   volume = {3},
1683   pages = {1--15},
1684   number = {1},
1685   doi = {10.1109/TIFS.2007.916006},
1686   issn = {1556-6013},
1687   keywords = {cryptography, random sequences, spread spectrum communication, telecommunication
1688         security, watermarking, Kerckhoffs-based embedding security classes,
1689         WOA Data Hiding, pseudorandom sequences, spread-spectrum techniques,
1690         steganography security, watermark-only-attack, watermarking, Security,
1691         spread-spectrum (SS) watermarking},
1692   owner = {guyeux},
1693   timestamp = {2009.06.29}
1694 }
1695
1696 @ARTICLE{Cayre2005,
1697   author = {Cayre, F. and Fontaine, C. and Furon, T.},
1698   title = {Watermarking security: theory and practice},
1699   journal = {IEEE Transactions on Signal Processing},
1700   year = {2005},
1701   volume = {53},
1702   pages = {3976--3987},
1703   number = {10},
1704   doi = {10.1109/TSP.2005.855418},
1705   issn = {1053-587X},
1706   keywords = {blind source separation, cryptography, watermarking, Fisher information
1707         matrix, blind source separation, cryptanalysis, information theory,
1708         spread spectrum techniques, substitutive scheme, watermarking security,
1709         Blind source separation, Fisher information matrix, equivocation,
1710         security, watermarking},
1711   owner = {guyeux},
1712   timestamp = {2009.06.29}
1713 }
1714
1715 @ARTICLE{Chajakis91,
1716   author = {Chajakis, Emmanuel D. and Zenios, Stavros A.},
1717   title = {Synchronous and asynchronous implementations of relaxation algorithms
1718         for nonlinear network optimization},
1719   journal = {Parallel Comput.},
1720   year = {1991},
1721   volume = {17},
1722   pages = {873--894},
1723   number = {8},
1724   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1725   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/S0167-8191(05)80072-9},
1726   issn = {0167-8191},
1727   publisher = {Elsevier Science Publishers B. V.}
1728 }
1729
1730 @ARTICLE{Chan2007,
1731   author = {Chan, Haowen and Perrig, Adrian and Przydatek, Bartosz and Song,
1732         Dawn},
1733   title = {SIA: Secure information aggregation in sensor networks},
1734   journal = {J. Comput. Secur.},
1735   year = {2007},
1736   volume = {15},
1737   pages = {69--102},
1738   number = {1},
1739   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1740   issn = {0926-227X},
1741   publisher = {IOS Press}
1742 }
1743
1744 @ARTICLE{Chandramouli06,
1745   author = {R. Chandramouli and S. Bapatla and K.P. Subbalakshmi},
1746   title = {Battery power-aware encryption},
1747   journal = {ACM transactions on information and system security},
1748   year = {2006},
1749   pages = {162--180},
1750   owner = {christophe},
1751   timestamp = {2010.07.31}
1752 }
1753
1754 @ARTICLE{Charpin85,
1755   author = {Pascale Charpin},
1756   title = {A description of some extended cyclic codes with application to Reed-Solomon
1757         codes},
1758   journal = {Discrete Mathematics},
1759   year = {1985},
1760   volume = {56},
1761   pages = {117-124},
1762   number = {2-3},
1763   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1764   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/0012-365X(85)90019-6}
1765 }
1766
1767 @ARTICLE{Chazan69,
1768   author = {D. Chazan and W. Miranker},
1769   title = {Chaotic relaxation},
1770   journal = {Linear algebra and its applications},
1771   year = {1969},
1772   pages = {199-222},
1773   owner = {guyeux},
1774   timestamp = {2008.05.22}
1775 }
1776
1777 @ARTICLE{Cheon2006,
1778   author = {Cheon, Jung Hee and Kim, Woo-Hwan and Nam, Hyun Soo},
1779   title = {Known-plaintext cryptanalysis of the Domingo-Ferrer algebraic privacy
1780         homomorphism scheme},
1781   journal = {Inf. Process. Lett.},
1782   year = {2006},
1783   volume = {97},
1784   pages = {118--123},
1785   number = {3},
1786   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1787   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ipl.2005.09.016},
1788   issn = {0020-0190},
1789   publisher = {Elsevier North-Holland, Inc.}
1790 }
1791
1792 @MISC{Cheon03acryptanalysis,
1793   author = {Jung Hee Cheon and Hyun Soo Nam},
1794   title = {A Cryptanalysis of the Original Domingo-Ferrer's Algebraic Privacy
1795         Homomorphism},
1796   year = {2003}
1797 }
1798
1799 @ARTICLE{Cheung05,
1800   author = {R.C.C. Cheung and N.J. Telle and W. Luk and P.Y.K. Cheung},
1801   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
1802   journal = {IEEE Trans. on Very Large Scale Integration Systems},
1803   year = {2005},
1804   volume = {13},
1805   pages = {1048-1059},
1806   number = {9}
1807 }
1808
1809 @ARTICLE{Chivian2005,
1810   author = {Chivian, Dylan and Kim, David E. and Malmström, Lars and Schonbrun,
1811         Jack and Rohl, Carol A. and Baker, David},
1812   title = {Prediction of CASP6 structures using automated robetta protocols},
1813   journal = {Proteins},
1814   year = {2005},
1815   volume = {61},
1816   pages = {157--166},
1817   number = {S7},
1818   issn = {1097-0134},
1819   keywords = {Rosetta, fragment assembly, de novo modeling, homology modeling, parametric
1820         alignment ensemble},
1821   owner = {christophe},
1822   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
1823   timestamp = {2011.01.22},
1824   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20733}
1825 }
1826
1827 @ARTICLE{Zhu06,
1828   author = {Congxu, Zhu and Xuefeng, Liao and Zhihua, Li},
1829   title = {Chaos-based multipurpose image watermarking algorithm},
1830   journal = {Wuhan University Journal of Natural Sciences},
1831   year = {2006},
1832   volume = {11},
1833   pages = {1675-1678},
1834   note = {10.1007/BF02831848},
1835   abstract = {To achieve the goal of image content authentication and copyright
1836         protection simultaneously, this paper presents a novel image dual
1837         watermarking method based on chaotic map. Firstly, the host image
1838         was split into many nonoverlapping small blocks, and the block-wise
1839         discrete cosine transform (DCT) is computed. Secondly, the robust
1840         watermarks, shuffled by the chaotic sequences, are embedded in the
1841         DC coefficients of blocks to achieve the goal of copyright protection.
1842         The semi-fragile watermarks, generated by chaotic map, are embedded
1843         in the AC coefficients of blocks to obtain the aim of image authentication.
1844         Both of them can be extracted without the original image. Simulation
1845         results demonstrate the effectiveness of our algorithm in terms of
1846         robustness and fragility.},
1847   affiliation = {Central South University School of Information Science and Engineering
1848         410083 Changsha, Hunan China},
1849   issn = {1007-1202},
1850   issue = {6},
1851   keyword = {Mathematics, general},
1852   publisher = {Wuhan University, co-published with Springer},
1853   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF02831848}
1854 }
1855
1856 @ARTICLE{Conley1978,
1857   author = {C. Conley},
1858   title = {Isolated invariant sets and the Morse index},
1859   journal = {CBMS Regional Conference. AMS.},
1860   year = {1978},
1861   optvolume = {38},
1862   owner = {guyeux},
1863   timestamp = {2008.01.02}
1864 }
1865
1866 @ARTICLE{Cornu2002,
1867   author = {Philippe Cornu and André Smolarz},
1868   title = {Image characterization by texture},
1869   journal = {Traitement du signal},
1870   year = {2002},
1871   volume = {19},
1872   pages = {29-35},
1873   file = {:/home/guyeux/Documents/Bibliotheque/These/Watermarking/Caractérisation d'images par textures associées.pdf:PDF},
1874   owner = {guyeux},
1875   timestamp = {2008.05.12}
1876 }
1877
1878 @INPROCEEDINGS{Cox99,
1879   author = {Ingemar Cox and Matt L. Miller and Andrew L. Mckellips},
1880   title = {Watermarking as Communications With Side Information},
1881   booktitle = {Proceedings of the IEEE},
1882   year = {1999},
1883   pages = {1127--1141},
1884   owner = {christophe},
1885   timestamp = {2010.03.06}
1886 }
1887
1888 @ARTICLE{Cox97securespread,
1889   author = {Ingemar J. Cox and Senior Member and Joe Kilian and F. Thomson Leighton
1890         and Talal Shamoon},
1891   title = {Secure spread spectrum watermarking for multimedia},
1892   journal = {IEEE Transactions on Image Processing},
1893   year = {1997},
1894   volume = {6},
1895   pages = {1673--1687}
1896 }
1897
1898 @ARTICLE{Cramer96,
1899   author = {Christopher Cramer and Erol Gelenbe and Hakan Bakircioglu},
1900   title = {Video Compression with Random Neural Networks},
1901   journal = {Neural Networks for Identification, Control, and Robotics, International
1902         Workshop},
1903   year = {1996},
1904   volume = {0},
1905   pages = {0476},
1906   address = {Los Alamitos, CA, USA},
1907   isbn = {0-8186-7456-3},
1908   publisher = {IEEE Computer Society}
1909 }
1910
1911 @INPROCEEDINGS{Crescenzi98,
1912   author = {Crescenzi, Pierluigi and Goldman, Deborah and Papadimitriou, Christos
1913         and Piccolboni, Antonio and Yannakakis, Mihalis},
1914   title = {On the complexity of protein folding (extended abstract)},
1915   booktitle = {Proceedings of the thirtieth annual ACM symposium on Theory of computing},
1916   year = {1998},
1917   series = {STOC '98},
1918   pages = {597--603},
1919   address = {New York, NY, USA},
1920   publisher = {ACM},
1921   acmid = {276875},
1922   isbn = {0-89791-962-9},
1923   location = {Dallas, Texas, United States},
1924   numpages = {7}
1925 }
1926
1927 @ARTICLE{Dawei2004,
1928   author = {Zhao Dawei and Chen Guanrong and Liu Wenbo},
1929   title = {A chaos-based robust wavelet-domain watermarking algorithm},
1930   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
1931   year = {2004},
1932   volume = {22},
1933   pages = {47-54},
1934   owner = {guyeux},
1935   timestamp = {2008.10.07}
1936 }
1937
1938 @MISC{1011.1638,
1939   author = {Anthony Desnos and Robert Erra and Eric Filiol},
1940   title = {Processor-Dependent Malware... and codes},
1941   year = {2010},
1942   comment = {arXiv:1011.1638},
1943   eprint = {arXiv:1011.1638}
1944 }
1945
1946 @BOOK{devaney,
1947   title = {An Introduction to Chaotic Dynamical Systems},
1948   publisher = {Addison-Wesley},
1949   year = {1989},
1950   author = {Devaney, Robert L.},
1951   address = {Redwood City, CA},
1952   edition = {2nd}
1953 }
1954
1955 @ARTICLE{diffie76,
1956   author = {Whitfield Diffie and Martin E. Hellman},
1957   title = {New Directions in Cryptography},
1958   journal = {IEEE Transactions on Information Theory},
1959   year = {1976},
1960   volume = {IT-22},
1961   pages = {644--654},
1962   number = {6},
1963   date = {November 1976},
1964   owner = {guyeux},
1965   timestamp = {2009.06.30},
1966   url = {citeseer.ist.psu.edu/diffie76new.html}
1967 }
1968
1969 @INCOLLECTION{Dijk10,
1970   author = {van Dijk, Marten and Gentry, Craig and Halevi, Shai and Vaikuntanathan,
1971         Vinod},
1972   title = {Fully Homomorphic Encryption over the Integers},
1973   booktitle = {Advances in Cryptology – EUROCRYPT 2010},
1974   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1975   year = {2010},
1976   editor = {Gilbert, Henri},
1977   volume = {6110},
1978   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1979   pages = {24-43},
1980   abstract = {We construct a simple fully homomorphic encryption scheme, using only
1981         elementary modular arithmetic. We use Gentry’s technique to construct
1982         a fully homomorphic scheme from a bootstrappable somewhat homomorphic
1983         scheme. However, instead of using ideal lattices over a polynomial
1984         ring, our bootstrappable encryption scheme merely uses addition and
1985         multiplication over the integers. The main appeal of our scheme is
1986         the conceptual simplicity. We reduce the security of our scheme to
1987         finding an approximate integer gcd – i.e., given a list of integers
1988         that are near-multiples of a hidden integer, output that hidden integer.
1989         We investigate the hardness of this task, building on earlier work
1990         of Howgrave-Graham.},
1991   affiliation = {MIT CSAIL}
1992 }
1993
1994 @ARTICLE{Dill1985,
1995   author = {Dill, KA},
1996   title = {Theory for the folding and stability of globular proteins.},
1997   journal = {Biochemistry},
1998   year = {1985},
1999   volume = {24},
2000   pages = {1501-9--},
2001   number = {6},
2002   month = mar,
2003   abstract = {Using lattice statistical mechanics, we develop theory to account
2004         for the folding of a heteropolymer molecule such as a protein to
2005         the globular and soluble state. Folding is assumed to be driven by
2006         the association of solvophobic monomers to avoid solvent and opposed
2007         by the chain configurational entropy. Theory predicts a phase transition
2008         as a function of temperature or solvent character. Molecules that
2009         are too short or too long or that have too few solvophobic residues
2010         are predicted not to fold. Globular molecules should have a largely
2011         solvophobic core, but there is an entropic tendency for some residues
2012         to be "out of place", particularly in small molecules. For long chains,
2013         molecules comprised of globular domains are predicted to be thermodynamically
2014         more stable than spherical molecules. The number of accessible conformations
2015         in the globular state is calculated to be an exceedingly small fraction
2016         of the number available to the random coil. Previous estimates of
2017         this number, which have motivated kinetic theories of folding, err
2018         by many tens of orders of magnitude.},
2019   comment = {Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
2020   keywords = {Mathematics, Models, Chemical, Polymers, Protein Conformation},
2021   owner = {christophe},
2022   timestamp = {2011.01.22},
2023   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/3986190}
2024 }
2025
2026 @ARTICLE{Dill1995,
2027   author = {Dill, KA and Bromberg, S and Yue, K and Fiebig, KM and Yee, DP and
2028         Thomas, PD and Chan, HS},
2029   title = {Principles of protein folding--a perspective from simple exact models.},
2030   journal = {Protein Sci},
2031   year = {1995},
2032   volume = {4},
2033   pages = {561-602--},
2034   number = {4},
2035   month = apr,
2036   abstract = {General principles of protein structure, stability, and folding kinetics
2037         have recently been explored in computer simulations of simple exact
2038         lattice models. These models represent protein chains at a rudimentary
2039         level, but they involve few parameters, approximations, or implicit
2040         biases, and they allow complete explorations of conformational and
2041         sequence spaces. Such simulations have resulted in testable predictions
2042         that are sometimes unanticipated: The folding code is mainly binary
2043         and delocalized throughout the amino acid sequence. The secondary
2044         and tertiary structures of a protein are specified mainly by the
2045         sequence of polar and nonpolar monomers. More specific interactions
2046         may refine the structure, rather than dominate the folding code.
2047         Simple exact models can account for the properties that characterize
2048         protein folding: two-state cooperativity, secondary and tertiary
2049         structures, and multistage folding kinetics--fast hydrophobic collapse
2050         followed by slower annealing. These studies suggest the possibility
2051         of creating "foldable" chain molecules other than proteins. The encoding
2052         of a unique compact chain conformation may not require amino acids;
2053         it may require only the ability to synthesize specific monomer sequences
2054         in which at least one monomer type is solvent-averse.},
2055   address = {Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California,
2056         San Francisco 94143-1204, USA.},
2057   comment = {Review,Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't,
2058         Non-P.H.S.,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
2059   keywords = {Amino Acid Sequence, Biological Evolution, Hydrogen Bonding, Models,
2060         Molecular, Molecular Sequence Data, Mutation, Protein Conformation,
2061         Protein Denaturation, Protein Folding, Temperature, Thermodynamics},
2062   owner = {christophe},
2063   timestamp = {2011.01.22},
2064   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/7613459}
2065 }
2066
2067 @INPROCEEDINGS{Dobbertin96,
2068   author = {Dobbertin, Hans},
2069   title = {Cryptanalysis of MD4},
2070   booktitle = {Proceedings of the Third International Workshop on Fast Software
2071         Encryption},
2072   year = {1996},
2073   pages = {53--69},
2074   address = {London, UK},
2075   publisher = {Springer-Verlag},
2076   isbn = {3-540-60865-6}
2077 }
2078
2079 @INPROCEEDINGS{DomingoFerrer2002,
2080   author = {Domingo-Ferrer, Josep},
2081   title = {A Provably Secure Additive and Multiplicative Privacy Homomorphism},
2082   booktitle = {ISC '02: Proceedings of the 5th International Conference on Information
2083         Security},
2084   year = {2002},
2085   pages = {471--483},
2086   address = {London, UK},
2087   publisher = {Springer-Verlag},
2088   isbn = {3-540-44270-7}
2089 }
2090
2091 @ARTICLE{Dubchak1995,
2092   author = {I. Dubchak and I. Muchnik and S. R. Holbrook and S. H. Kim},
2093   title = {Prediction of protein folding class using global description of amino
2094         acid sequence.},
2095   journal = {Proc Natl Acad Sci U S A},
2096   year = {1995},
2097   volume = {92},
2098   pages = {8700--8704},
2099   number = {19},
2100   month = {Sep},
2101   __markedentry = {[guyeux]},
2102   abstract = {We present a method for predicting protein folding class based on
2103         global protein chain description and a voting process. Selection
2104         of the best descriptors was achieved by a computer-simulated neural
2105         network trained on a data base consisting of 83 folding classes.
2106         Protein-chain descriptors include overall composition, transition,
2107         and distribution of amino acid attributes, such as relative hydrophobicity,
2108         predicted secondary structure, and predicted solvent exposure. Cross-validation
2109         testing was performed on 15 of the largest classes. The test shows
2110         that proteins were assigned to the correct class (correct positive
2111         prediction) with an average accuracy of 71.7\%, whereas the inverse
2112         prediction of proteins as not belonging to a particular class (correct
2113         negative prediction) was 90-95\% accurate. When tested on 254 structures
2114         used in this study, the top two predictions contained the correct
2115         class in 91\% of the cases.},
2116   institution = {Department of Chemistry, University of California, Berkeley 94720,
2117         USA.},
2118   keywords = {Amino Acid Sequence; Amino Acids, chemistry; Computer Simulation;
2119         Databases, Factual; Models, Chemical; Neural Networks (Computer);
2120         Protein Folding; Protein Structure, Secondary; Proteins, chemistry/classification;
2121         Reproducibility of Results; Solvents},
2122   language = {eng},
2123   medline-pst = {ppublish},
2124   owner = {guyeux},
2125   pmid = {7568000},
2126   timestamp = {2011.07.18}
2127 }
2128
2129 @BOOK{Dudley,
2130   title = {Real analysis and probability},
2131   publisher = {Cambridge University Press},
2132   author = {Richard M. Dudley},
2133   optpages = {209},
2134   owner = {guyeux},
2135   timestamp = {2008.01.02}
2136 }
2137
2138 @ARTICLE{Tarazi84,
2139   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2140   title = {Algorithmes mixtes asynchrones. Etude de convergence monotone},
2141   journal = {Numerische Mathematik},
2142   year = {1984},
2143   volume = {44},
2144   pages = {363-369},
2145   note = {10.1007/BF01405568},
2146   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2147         Box 5969 Kuwait},
2148   issn = {0029-599X},
2149   issue = {3},
2150   keyword = {Mathematics and Statistics},
2151   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2152   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01405568}
2153 }
2154
2155 @ARTICLE{Tarazi82,
2156   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2157   title = {Some convergence results for asynchronous algorithms},
2158   journal = {Numerische Mathematik},
2159   year = {1982},
2160   volume = {39},
2161   pages = {325-340},
2162   note = {10.1007/BF01407866},
2163   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2164         Box 5969 Kuwait Kuwait},
2165   issn = {0029-599X},
2166   issue = {3},
2167   keyword = {Mathematics and Statistics},
2168   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2169   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01407866}
2170 }
2171
2172 @ARTICLE{Fei2005,
2173   author = {Peng Fei and Qiu Shui-Sheng and Long Min},
2174   title = {A secure digital signature algorithm based on elliptic curve and
2175         chaotic mappings},
2176   journal = {Circuits Systems Signal Processing},
2177   year = {2005},
2178   volume = {24, No. 5},
2179   pages = {585--597},
2180   owner = {guyeux},
2181   timestamp = {2009.01.16}
2182 }
2183
2184 @BOOK{Feigenbaum1908,
2185   title = {Universal behavior in nonlinear systems},
2186   publisher = {Los Alamos Science},
2187   year = {1908},
2188   author = {Feigenbaum},
2189   owner = {guyeux},
2190   timestamp = {2008.01.02}
2191 }
2192
2193 @ARTICLE{Felsenstein1980,
2194   author = {J. Felsenstein},
2195   title = {A view of population genetics.},
2196   journal = {Science},
2197   year = {1980},
2198   volume = {208},
2199   pages = {1253},
2200   number = {4449},
2201   month = {Jun},
2202   doi = {10.1126/science.208.4449.1253},
2203   language = {eng},
2204   medline-pst = {ppublish},
2205   owner = {guyeux},
2206   pii = {208/4449/1253},
2207   pmid = {17830806},
2208   timestamp = {2011.05.05},
2209   url = {http://dx.doi.org/10.1126/science.208.4449.1253}
2210 }
2211
2212 @BOOK{Filiol09,
2213   title = {Les virus informatiques : techniques virales et antivirales avancées},
2214   year = {2009},
2215   editor = {Springer},
2216   author = {Eric Filiol},
2217   owner = {christophe},
2218   timestamp = {2010.10.13}
2219 }
2220
2221 @INPROCEEDINGS{FiliolBlackHat,
2222   author = {Eric Filiol},
2223   title = {Passive and Active Leakage of Secret Data from Non Networked Computer},
2224   booktitle = {Black Hat},
2225   year = {2008},
2226   owner = {christophe},
2227   timestamp = {2010.11.28}
2228 }
2229
2230 @PHDTHESIS{Formenti2003,
2231   author = {Enrico Formenti},
2232   title = {De l'algorithmique du chaos dans les systèmes dynamiques discrets},
2233   school = {Université de Provence},
2234   year = {2003},
2235   owner = {guyeux},
2236   timestamp = {2008.01.02}
2237 }
2238
2239 @PHDTHESIS{Formenti1998,
2240   author = {Enrico Formenti},
2241   title = {Automates cellulaires et chaos : de la vision topologique à la vision
2242         algorithmique},
2243   school = {\'Ecole Normale Supérieure de Lyon},
2244   year = {1998},
2245   optmonth = {Octobre},
2246   owner = {guyeux},
2247   timestamp = {2008.01.02}
2248 }
2249
2250 @ARTICLE{Frey2006,
2251   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2252   title = {Identification of circular codes in bacterial genomes and their use
2253         in a factorization method for retrieving the reading frames of genes.},
2254   journal = {Comput Biol Chem},
2255   year = {2006},
2256   volume = {30},
2257   pages = {87--101},
2258   number = {2},
2259   month = {Apr},
2260   abstract = {We developed a statistical method that allows each trinucleotide to
2261         be associated with a unique frame among the three possible ones in
2262         a (protein coding) gene. An extensive gene study in 175 complete
2263         bacterial genomes based on this statistical approach resulted in
2264         identification of 72 new circular codes. Finding a circular code
2265         enables an immediate retrieval of the reading frame locally anywhere
2266         in a gene. No knowledge of location of the start codon is required
2267         and a short window of only a few nucleotides is sufficient for automatic
2268         retrieval. We have therefore developed a factorization method (that
2269         explores previously found circular codes) for retrieving the reading
2270         frames of bacterial genes. Its principle is new and easy to understand.
2271         Neither complex treatment nor specific information on the nucleotide
2272         sequences is necessary. Moreover, the method can be used for short
2273         regions in nucleotide sequences (less than 25 nucleotides in protein
2274         coding genes). Selected additional properties of circular codes and
2275         their possible biological consequences are also discussed.},
2276   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001},
2277   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2278         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2279         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2280   keywords = {Base Sequence; Computational Biology; Genes, Bacterial; Genome, Bacterial;
2281         Genomics, statistics /&/ numerical data; Models, Genetic; Models,
2282         Statistical; Reading Frames},
2283   language = {eng},
2284   medline-pst = {ppublish},
2285   owner = {guyeux},
2286   pii = {S1476-9271(05)00111-8},
2287   pmid = {16439185},
2288   timestamp = {2011.05.05},
2289   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001}
2290 }
2291
2292 @ARTICLE{Frey2006a,
2293   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2294   title = {An analytical model of gene evolution with six mutation parameters:
2295         an application to archaeal circular codes.},
2296   journal = {Comput Biol Chem},
2297   year = {2006},
2298   volume = {30},
2299   pages = {1--11},
2300   number = {1},
2301   month = {Feb},
2302   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
2303         mutation matrix 64 x 64 with six substitution parameters associated
2304         with the transitions and transversions in the three trinucleotide
2305         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
2306         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
2307         x 64 with three parameters. It determines at some time t the exact
2308         occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly according
2309         to six substitution parameters. An application of this model allows
2310         an evolutionary study of the common circular code COM and the 15
2311         archaeal circular codes X which have been recently identified in
2312         several archaeal genomes. The main property of a circular code is
2313         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
2314         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
2315         with a window of a few nucleotides. In genes, the circular code is
2316         superimposed on the traditional genetic one. Very unexpectedly, the
2317         evolutionary model demonstrates that the archaeal circular codes
2318         can derive from the common circular code subjected to random substitutions
2319         with particular values for six substitutions parameters. It has a
2320         strong correlation with the statistical observations of three archaeal
2321         codes in actual genes. Furthermore, the properties of these substitution
2322         rates allow proposal of an evolutionary classification of the 15
2323         archaeal codes into three main classes according to this model. In
2324         almost all the cases, they agree with the actual degeneracy of the
2325         genetic code with substitutions more frequent in the third trinucleotide
2326         site and with transitions more frequent that transversions in any
2327         trinucleotide site.},
2328   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001},
2329   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2330         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2331         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2332   keywords = {Archaea, genetics; DNA, Circular; Evolution, Molecular; Genetic Code;
2333         Genome, Archaeal; Models, Genetic; Mutation; Trinucleotide Repeats},
2334   language = {eng},
2335   medline-pst = {ppublish},
2336   owner = {guyeux},
2337   pii = {S1476-9271(05)00083-6},
2338   pmid = {16324886},
2339   timestamp = {2011.05.05},
2340   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001}
2341 }
2342
2343 @INPROCEEDINGS{fgb11:ip,
2344   author = {Friot, Nicolas and Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2345   title = {Chaotic Iterations for Steganography - Stego-security and chaos-security},
2346   booktitle = {SECRYPT'2011, Int. Conf. on Security and Cryptography},
2347   year = {2011},
2348   pages = {***--***},
2349   address = {Sevilla, Spain},
2350   month = jul,
2351   note = {To appear},
2352   classement = {ACTI},
2353   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2354   equipe = {and},
2355   inhal = {no}
2356 }
2357
2358 @MISC{Frisch,
2359   author = {Alain Frisch},
2360   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2361   year = {1998},
2362   note = {Rapport de tipe},
2363   file = {Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:Chaos/Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:PDF},
2364   keywords = {Chaos, Entropie Topologique, Tipe},
2365   owner = {guyeux},
2366   timestamp = {2008.01.02},
2367   url = {http://alain.frisch.fr/math.html}
2368 }
2369
2370 @MISC{Frisch98,
2371   author = {Alain Frisch},
2372   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2373   year = {1998},
2374   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2375   url = {\url{http://alain.frisch.fr/math.html}}
2376 }
2377
2378 @ARTICLE{Frommer97asynchronousweighted,
2379   author = {Andreas Frommer and Hartmut Schwandt and Daniel and Daniel B. Szyld},
2380   title = {Asynchronous Weighted Additive Schwarz Methods},
2381   journal = {Electronic Transactions on Numerical Analysis},
2382   year = {1997},
2383   volume = {5},
2384   pages = {48--61}
2385 }
2386
2387 @MISC{Frommer94asynchronoustwo-stage,
2388   author = {Andreas Frommer and Daniel B. Szyld},
2389   title = {Asynchronous Two-Stage Iterative Methods},
2390   year = {1994}
2391 }
2392
2393 @BOOK{J1992,
2394   title = {Introduction to Chaos and Coherence},
2395   publisher = {IOP Publishing},
2396   year = {1992},
2397   author = {J. Frøyland},
2398   owner = {guyeux},
2399   timestamp = {2008.01.02}
2400 }
2401
2402 @MISC{Furon2002,
2403   author = {T. Furon},
2404   title = {Security analysis},
2405   year = {2002},
2406   note = {European Project IST-1999-10987 CERTIMARK, Deliverable D.5.5},
2407   owner = {guyeux},
2408   timestamp = {2009.06.30}
2409 }
2410
2411 @ARTICLE{Furon08,
2412   author = {Furon, Teddy and Bas, Patrick},
2413   title = {Broken arrows},
2414   journal = {EURASIP J. Inf. Secur.},
2415   year = {2008},
2416   volume = {2008},
2417   pages = {1--13},
2418   address = {New York, NY, United States},
2419   doi = {http://dx.doi.org/10.1155/2008/597040},
2420   issn = {1687-4161},
2421   owner = {christophe},
2422   publisher = {Hindawi Publishing Corp.},
2423   timestamp = {2010.03.06}
2424 }
2425
2426 @ARTICLE{P1150442004,
2427   author = {G.S.El-Taweel and H.M. Onsi and M.Samy and M.G. Darwish},
2428   title = {Secure and Non-Blind Watermarking Scheme for Color Images Based on
2429         DWT},
2430   journal = {ICGST International Journal on Graphics, Vision and Image Processing},
2431   year = {2005},
2432   volume = {05},
2433   pages = {1--5},
2434   month = {April},
2435   issue = {4},
2436   owner = {christophe},
2437   timestamp = {2010.03.07}
2438 }
2439
2440 @INPROCEEDINGS{Gentry09,
2441   author = {Gentry, Craig},
2442   title = {Fully homomorphic encryption using ideal lattices},
2443   booktitle = {STOC '09: Proceedings of the 41st annual ACM symposium on Theory
2444         of computing},
2445   year = {2009},
2446   pages = {169--178},
2447   address = {New York, NY, USA},
2448   publisher = {ACM},
2449   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1536414.1536440},
2450   isbn = {978-1-60558-506-2},
2451   location = {Bethesda, MD, USA}
2452 }
2453
2454 @INPROCEEDINGS{Girao04,
2455   author = {J. Girao and M. Schneider and D. Westhoff},
2456   title = {CDA: Concealed data aggregation in wireless sensor networks},
2457   booktitle = {Proceedings of the ACM Workshop on Wireless Security},
2458   year = {2004},
2459   owner = {christophe},
2460   timestamp = {2010.07.31}
2461 }
2462
2463 @CONFERENCE{Gotsman88,
2464   author = {C. Gotsman and D. Lehmann and E. Shamir},
2465   title = {Asynchronous Dynamics of Random Boolean Networks},
2466   booktitle = {San Diego '88 Neural Networks Conference},
2467   year = {1988},
2468   owner = {guyeux},
2469   timestamp = {30/03/2008}
2470 }
2471
2472 @ARTICLE{Guckenheimer1979,
2473   author = {J. Guckenheimer},
2474   title = {Sensitive dependence to initial conditions for one-dimensional maps},
2475   journal = {Comm. Math. Phys.},
2476   year = {1979},
2477   optpages = {133-160},
2478   owner = {guyeux},
2479   timestamp = {2008.01.02}
2480 }
2481
2482 @BOOK{J.1983,
2483   title = {Nonlinear oscillations, dynamical systems, and bifurcations of vector
2484         fields},
2485   publisher = {Springer Verlag},
2486   year = {1983},
2487   author = {J. Guckenheimer and P. Holmes},
2488   owner = {guyeux},
2489   timestamp = {2008.01.02}
2490 }
2491
2492 @ARTICLE{Guo20093201,
2493   author = {Wei Guo and Xiaoming Wang and Dake He and Yang Cao},
2494   title = {Cryptanalysis on a parallel keyed hash function based on chaotic
2495         maps},
2496   journal = {Physics Letters A},
2497   year = {2009},
2498   volume = {373},
2499   pages = {3201 - 3206},
2500   number = {36},
2501   abstract = {This Letter analyzes the security of a novel parallel keyed hash function
2502         based on chaotic maps, proposed by Xiao et al. to improve the efficiency
2503         in parallel computing environment. We show how to devise forgery
2504         attacks on Xiao's scheme with differential cryptanalysis and give
2505         the experiment results of two kinds of forgery attacks firstly. Furthermore,
2506         we discuss the problem of weak keys in the scheme and demonstrate
2507         how to utilize weak keys to construct collision.},
2508   issn = {0375-9601},
2509   keywords = {Cryptanalysis}
2510 }
2511
2512 @PHDTHESIS{GuyeuxThese10,
2513   author = {Christophe Guyeux},
2514   title = {Le d\'{e}sordre des it\'{e}rations chaotiques et leur utilit\'{e}
2515         en s\'{e}curit\'{e} informatique},
2516   school = {Universit\'{e} de Franche-Comt\'{e}},
2517   year = {2010},
2518   owner = {christophe},
2519   timestamp = {2010.12.21}
2520 }
2521
2522 @MISC{gb11:onp,
2523   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2524   title = {\'Etude topologique de l'\'etalement de spectre},
2525   howpublished = {Journ\'ees Codes et St\'eganographie, \'Ecoles Militaires de Saint-Cyr,
2526         Co\"etquidan},
2527   month = jan,
2528   year = {2011},
2529   classement = {COM},
2530   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2531   equipe = {and},
2532   inhal = {no}
2533 }
2534
2535 @INPROCEEDINGS{bg10:ip,
2536   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2537   title = {An improved watermarking algorithm for Internet applications},
2538   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
2539   year = {2010},
2540   pages = {119--124},
2541   address = {Valencia, Spain},
2542   month = sep,
2543   classement = {ACTI},
2544   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2545   equipe = {and},
2546   inhal = {no}
2547 }
2548
2549 @INPROCEEDINGS{gfb10:ip,
2550   author = {Guyeux, Christophe and Friot, Nicolas and Bahi, Jacques},
2551   title = {Chaotic iterations versus Spread-spectrum: chaos and stego security},
2552   booktitle = {IIH-MSP'10, 6-th Int. Conf. on Intelligent Information Hiding and
2553         Multimedia Signal Processing},
2554   year = {2010},
2555   pages = {208--211},
2556   address = {Darmstadt, Germany},
2557   month = oct,
2558   classement = {ACTI},
2559   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2560   equipe = {and},
2561   inhal = {no}
2562 }
2563
2564 @ARTICLE{friot10,
2565   author = {Christophe Guyeux and Nicolas Friot and Jacques M. Bahi},
2566   title = {A more secure information hiding scheme than spread-spectrum obtained
2567         by chaos-security},
2568   journal = {arXiv 0032565},
2569   year = {2010},
2570   owner = {guyeux},
2571   timestamp = {2010.04.30}
2572 }
2573
2574 @BOOK{ECC,
2575   title = {Guide to Elliptic Curve Cryptography},
2576   publisher = {Springer Professional Computing},
2577   year = {2004},
2578   editor = {Springer},
2579   author = {D. Hankerson and A. Menezes and S. Vanstone},
2580   owner = {christophe},
2581   timestamp = {2010.07.31}
2582 }
2583
2584 @ARTICLE{Hasegawa1985,
2585   author = {M. Hasegawa and H. Kishino and T. Yano},
2586   title = {Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial
2587         DNA.},
2588   journal = {J Mol Evol},
2589   year = {1985},
2590   volume = {22},
2591   pages = {160--174},
2592   number = {2},
2593   abstract = {A new statistical method for estimating divergence dates of species
2594         from DNA sequence data by a molecular clock approach is developed.
2595         This method takes into account effectively the information contained
2596         in a set of DNA sequence data. The molecular clock of mitochondrial
2597         DNA (mtDNA) was calibrated by setting the date of divergence between
2598         primates and ungulates at the Cretaceous-Tertiary boundary (65 million
2599         years ago), when the extinction of dinosaurs occurred. A generalized
2600         least-squares method was applied in fitting a model to mtDNA sequence
2601         data, and the clock gave dates of 92.3 +/- 11.7, 13.3 +/- 1.5, 10.9
2602         +/- 1.2, 3.7 +/- 0.6, and 2.7 +/- 0.6 million years ago (where the
2603         second of each pair of numbers is the standard deviation) for the
2604         separation of mouse, gibbon, orangutan, gorilla, and chimpanzee,
2605         respectively, from the line leading to humans. Although there is
2606         some uncertainty in the clock, this dating may pose a problem for
2607         the widely believed hypothesis that the pipedal creature Australopithecus
2608         afarensis, which lived some 3.7 million years ago at Laetoli in Tanzania
2609         and at Hadar in Ethiopia, was ancestral to man and evolved after
2610         the human-ape splitting. Another likelier possibility is that mtDNA
2611         was transferred through hybridization between a proto-human and a
2612         proto-chimpanzee after the former had developed bipedalism.},
2613   keywords = {Animals; Biological Evolution; DNA, Mitochondrial, genetics; Genes;
2614         Haplorhini, genetics; Humans; Mathematics; Models, Genetic; Nucleic
2615         Acid Hybridization; Primates, genetics; Proteins, genetics; Species
2616         Specificity},
2617   language = {eng},
2618   medline-pst = {ppublish},
2619   owner = {guyeux},
2620   pmid = {3934395},
2621   timestamp = {2011.05.05}
2622 }
2623
2624 @BOOK{R1994,
2625   title = {A First Course in Discrete Dynamical Systems},
2626   publisher = {Springer-Verlag},
2627   year = {1994},
2628   author = {R. Homlgren},
2629   optpages = {106},
2630   owner = {guyeux},
2631   timestamp = {2008.01.02}
2632 }
2633
2634 @INCOLLECTION{Hoque09,
2635   author = {Hoque, Md. and Chetty, Madhu and Sattar, Abdul},
2636   title = {Genetic Algorithm in Ab Initio Protein Structure Prediction Using
2637         Low Resolution Model: A Review},
2638   booktitle = {Biomedical Data and Applications},
2639   publisher = {Springer Berlin Heidelberg},
2640   year = {2009},
2641   editor = {Sidhu, Amandeep and Dillon, Tharam},
2642   volume = {224},
2643   series = {Studies in Computational Intelligence},
2644   pages = {317-342},
2645   affiliation = {IIIS, Griffith University, Nathan, QLD-4111 Australia}
2646 }
2647
2648 @CONFERENCE{Houmansadr09,
2649   author = {A. Houmansadr and N. Kiyavash and N. Borisov},
2650   title = {Rainbow: A robust and invisible non-blind watermark for network flows},
2651   booktitle = {NDSS’09: 16th Annual Network and Distributed System Security Symposium},
2652   year = {2009},
2653   owner = {christophe},
2654   timestamp = {2010.03.07}
2655 }
2656
2657 @ARTICLE{Huang,
2658   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J.},
2659   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2660   journal = {Wireless Networks},
2661   abstract = {Abstract\&nbsp;\&nbsp;This paper proposes a secure encrypted-data
2662         aggregation scheme for wireless sensor networks. Our design for data
2663         aggregation eliminates redundant sensor readings without using encryption
2664         and maintains data secrecy and privacy during transmission. Conventional
2665         aggregation functions operate when readings are received in plaintext.
2666         If readings are encrypted, aggregation requires decryption creating
2667         extra overhead and key management issues. In contrast to conventional
2668         schemes, our proposed scheme provides security and privacy, and duplicate
2669         instances of original readings will be aggregated into a single packet.
2670         Our scheme is resilient to known-plaintext attacks, chosen-plaintext
2671         attacks, ciphertext-only attacks and man-in-the-middle attacks. Our
2672         experiments show that our proposed aggregation method significantly
2673         reduces communication overhead and can be practically implemented
2674         in on-the-shelf sensor platforms.},
2675   citeulike-article-id = {4499496},
2676   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2677   citeulike-linkout-1 = {http://www.springerlink.com/content/g573138072642u63},
2678   doi = {10.1007/s11276-009-0177-y},
2679   posted-at = {2009-05-10 09:55:44},
2680   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y}
2681 }
2682
2683 @ARTICLE{Huang10,
2684   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J. D.},
2685   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2686   journal = {Wirel. Netw.},
2687   year = {2010},
2688   volume = {16},
2689   pages = {915--927},
2690   number = {4},
2691   address = {Hingham, MA, USA},
2692   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2693   issn = {1022-0038},
2694   publisher = {Kluwer Academic Publishers}
2695 }
2696
2697 @ARTICLE{W.2001,
2698   author = {W. Huang and X. Ye},
2699   title = {Homeomorphisms with the whole compacta being scrambled sets},
2700   journal = {Ergod. Th. Dynam. Systems},
2701   year = {2001},
2702   optnumber = {1},
2703   optpages = {77-91},
2704   optvolume = {21},
2705   owner = {guyeux},
2706   timestamp = {2008.01.02}
2707 }
2708
2709 @ARTICLE{Hurley1982,
2710   author = {M. Hurley},
2711   title = {Attractors, persistence and density of their bassin},
2712   journal = {Transactions of AMS},
2713   year = {1982},
2714   optpages = {247-271},
2715   optvolume = {269},
2716   owner = {guyeux},
2717   timestamp = {2008.01.02}
2718 }
2719
2720 @INPROCEEDINGS{Islam:2009:NMA:1695134.1695181,
2721   author = {Islam, Md. Kamrul and Chetty, Madhu},
2722   title = {Novel Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction},
2723   booktitle = {Proceedings of the 22nd Australasian Joint Conference on Advances
2724         in Artificial Intelligence},
2725   year = {2009},
2726   series = {AI '09},
2727   pages = {412--421},
2728   address = {Berlin, Heidelberg},
2729   publisher = {Springer-Verlag},
2730   acmid = {1695181},
2731   isbn = {978-3-642-10438-1},
2732   keywords = {Guided search space, Memetic Algorithm, Modified fitness function,
2733         Pair-wise-interchange, Schema preservation, Tabu Search},
2734   location = {Melbourne, Australia},
2735   numpages = {10}
2736 }
2737
2738 @PHDTHESIS{Jacquemard77,
2739   author = {C. Jacquemard},
2740   title = {Contribution à l'étude d'algorithmes à convergence monotone},
2741   school = {Université de Franche-Comté},
2742   year = {1977},
2743   owner = {christophe},
2744   timestamp = {2010.08.25}
2745 }
2746
2747 @BOOK{Jukes69,
2748   title = {{Evolution of Protein Molecules}},
2749   publisher = {Academy Press},
2750   year = {1969},
2751   editor = {Munro, H. N.},
2752   author = {Jukes, T. H. and Cantor, C. R.},
2753   booktitle = {Evolution of Protein Molecules},
2754   citeulike-article-id = {1673661},
2755   keywords = {compbio, fresco},
2756   posted-at = {2007-09-19 06:23:18},
2757   priority = {2}
2758 }
2759
2760 @INPROCEEDINGS{Kalker2001,
2761   author = {Kalker, T.},
2762   title = {Considerations on watermarking security},
2763   year = {2001},
2764   pages = {201--206},
2765   abstract = {In this paper we address the usually implicit assumption that digital
2766         watermarking has as its main target copyright and copy protection
2767         applications. From these target applications a great many conclusions
2768         are drawn about the required security of a watermarking system, and
2769         in fact, a considerably percentage of the watermarking literature
2770         has this very topic as its main focus of attention. In this paper
2771         we take a step back, and try to do a more careful analysis of the
2772         'watermarking-is-for-security-applications' paradigm. The intention
2773         of this paper is to discuss the meaning of the concept security in
2774         the context of watermarking, and try to show that one has to be careful
2775         in using analogies from the related field of cryptography},
2776   citeulike-article-id = {1226513},
2777   journal = {2001 IEEE Fourth Workshop on Multimedia Signal Processing},
2778   keywords = {security, wateramarking},
2779   owner = {guyeux},
2780   posted-at = {2007-04-14 14:30:06},
2781   priority = {2},
2782   timestamp = {2009.06.30}
2783 }
2784
2785 @ARTICLE{Kerckhoffs83,
2786   author = {Kerckhoffs, Auguste},
2787   title = {La cryptographie militaire},
2788   journal = {Journal des sciences militaires},
2789   year = {1883},
2790   volume = {IX},
2791   pages = {5--83},
2792   month = {January},
2793   abstract = {pp. 161–191, Feb. 1883.},
2794   citeulike-article-id = {505508},
2795   keywords = {cryptography, master},
2796   owner = {guyeux},
2797   posted-at = {2006-02-15 04:49:15},
2798   priority = {2},
2799   timestamp = {2009.06.30}
2800 }
2801
2802 @ARTICLE{Kimura80,
2803   author = {Kimura, Motoo},
2804   title = {A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions
2805         through comparative studies of nucleotide sequences},
2806   journal = {Journal of Molecular Evolution},
2807   year = {1980},
2808   volume = {16},
2809   pages = {111-120},
2810   note = {10.1007/BF01731581},
2811   affiliation = {National Institute of Genetics 411 Mishima Japan},
2812   issn = {0022-2844},
2813   issue = {2},
2814   keyword = {Biomedical and Life Sciences},
2815   publisher = {Springer New York},
2816   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01731581}
2817 }
2818
2819 @ARTICLE{Knudsen94,
2820   author = {Knudsen},
2821   title = {Chaos Without Nonperiodicity},
2822   journal = {Amer. Math. Monthly},
2823   year = {1994},
2824   volume = {101},
2825   owner = {guyeux},
2826   timestamp = {27/01/2008}
2827 }
2828
2829 @PHDTHESIS{Knudsen1994a,
2830   author = {C. Knudsen},
2831   title = {Aspects of noninvertible dynamics and chaos},
2832   school = {Technical University of Denmark},
2833   year = {1994},
2834   owner = {guyeux},
2835   timestamp = {2008.01.02}
2836 }
2837
2838 @ARTICLE{Kocarev06,
2839   author = {L. Kocarev and J. Szczepanski and J.M. Amigo and I. Tomovski},
2840   title = {Discrete Chaos - I: Theory},
2841   journal = {IEEE Trans. on Circuits Systems},
2842   year = {2006},
2843   volume = {53},
2844   pages = {1300-1309},
2845   owner = {christophe},
2846   timestamp = {2010.10.10}
2847 }
2848
2849 @INPROCEEDINGS{Kocher95cryptanalysisof,
2850   author = {Paul C. Kocher},
2851   title = {Cryptanalysis of Diffie-Hellman, RSA, DSS, and Other Systems Using
2852         Timing Attacks (Extended Abstract)},
2853   booktitle = {Advances in Cryptology, CRYPTO '95: 15th Annual International Cryptology
2854         Conference},
2855   year = {1995},
2856   pages = {27--31},
2857   publisher = {Springer-Verlag}
2858 }
2859
2860 @ARTICLE{Kullback1951,
2861   author = {Kullback, Solomon and Leibler, Richard A.},
2862   title = {On Information and Sufficiency},
2863   journal = {The Annals of Mathematical Statistics},
2864   year = {1951},
2865   volume = {22},
2866   pages = {79--86},
2867   number = {1},
2868   citeulike-article-id = {3245942},
2869   keywords = {file-import-08-09-12},
2870   owner = {guyeux},
2871   posted-at = {2008-09-12 14:30:37},
2872   priority = {2},
2873   timestamp = {2009.06.29}
2874 }
2875
2876 @MISC{ledoux,
2877   author = {Eshter Ledoux},
2878   title = {Introduction à la théorie du chaos},
2879   year = {2002},
2880   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2881   url = {\url{http://www.nux.be/eledoux/mem/node1.html}}
2882 }
2883
2884 @BOOK{Lehning1997,
2885   title = {Analyse en dimension finie},
2886   publisher = {Masson},
2887   year = {1997},
2888   author = {Lehning},
2889   optpages = {28},
2890   optvolume = {4},
2891   owner = {guyeux},
2892   timestamp = {2008.01.02}
2893 }
2894
2895 @ARTICLE{Lenstra01,
2896   author = {A.K. Lenstra and E.R. Verheul},
2897   title = {Selecting Cryptographic Key Sizes},
2898   journal = {Jour. of the International Association for Cryptologic Research},
2899   year = {2001},
2900   volume = {14},
2901   pages = {255-293},
2902   number = {4}
2903 }
2904
2905 @ARTICLE{Pitts59,
2906   author = {Lettvin, J.Y. and Maturana, H.R. and McCulloch, W.S. and Pitts, W.H.},
2907   title = {What the Frog's Eye Tells the Frog's Brain},
2908   journal = {Proceedings of the IRE},
2909   year = {1959},
2910   volume = {47},
2911   pages = {1940--51},
2912   number = {11},
2913   owner = {christophe},
2914   timestamp = {2010.12.21}
2915 }
2916
2917 @ARTICLE{Li75,
2918   author = {T. Y. Li and J. A. Yorke},
2919   title = {Period three implies chaos},
2920   journal = {Amer. Math. Monthly},
2921   year = {1975},
2922   volume = {82},
2923   pages = {985--992},
2924   number = {10},
2925   owner = {guyeux},
2926   timestamp = {27/01/2008}
2927 }
2928
2929 @ARTICLE{Xiao10,
2930   author = {Li, Yantao and Deng, Shaojiang and Xiao, Di},
2931   title = {A novel Hash algorithm construction based on chaotic neural network},
2932   journal = {Neural Computing and Applications},
2933   year = {2010},
2934   pages = {1-9},
2935   affiliation = {Chongqing University College of Computer Science 400044 Chongqing
2936         China},
2937   issn = {0941-0643},
2938   keyword = {Computer Science},
2939   publisher = {Springer London}
2940 }
2941
2942 @INPROCEEDINGS{Lin09,
2943   author = {Lin, Hua-Yi and Chiang, Tzu-Chiang},
2944   title = {Cooperative secure data aggregation in sensor networks using elliptic
2945         curve based cryptosystems},
2946   booktitle = {CDVE'09: Proceedings of the 6th international conference on Cooperative
2947         design, visualization, and engineering},
2948   year = {2009},
2949   pages = {384--387},
2950   address = {Berlin, Heidelberg},
2951   publisher = {Springer-Verlag},
2952   isbn = {3-642-04264-3, 978-3-642-04264-5},
2953   location = {Luxembourg, Luxembourg}
2954 }
2955
2956 @INPROCEEDINGS{Liu2008,
2957   author = {Liu, An and Ning, Peng},
2958   title = {TinyECC: A Configurable Library for Elliptic Curve Cryptography in
2959         Wireless Sensor Networks},
2960   booktitle = {7th International Conference on Information Processing in Sensor
2961         Networks (IPSN 2008)},
2962   year = {2008},
2963   pages = {245--256},
2964   month = {April},
2965   citeulike-article-id = {3041699},
2966   howpublished = {SPOTS Track},
2967   keywords = {hagg},
2968   posted-at = {2008-07-25 05:25:05},
2969   priority = {2}
2970 }
2971
2972 @ARTICLE{Liu2007bis,
2973   author = {Shao-Hui Liu and Hong-Xun Yao and Wen Gao and Yong-Liang Liu},
2974   title = {An image fragile watermark scheme based on chaotic image pattern
2975         and pixel-pairs},
2976   journal = {Applied Mathematics and Computation},
2977   year = {2007},
2978   volume = {185},
2979   pages = {869-882},
2980   owner = {guyeux},
2981   timestamp = {2008.10.07}
2982 }
2983
2984 @INPROCEEDINGS{Liu07,
2985   author = {Liu, Zhen and Xi, Lifeng},
2986   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2987   booktitle = {KES '07: Knowledge-Based Intelligent Information and Engineering
2988         Systems and the XVII Italian Workshop on Neural Networks on Proceedings
2989         of the 11th International Conference},
2990   year = {2007},
2991   pages = {202--208},
2992   address = {Berlin, Heidelberg},
2993   publisher = {Springer-Verlag},
2994   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74827-4_26},
2995   isbn = {978-3-540-74826-7},
2996   location = {Vietri sul Mare, Italy}
2997 }
2998
2999 @ARTICLE{Liu2007,
3000   author = {Zhen Liu and Lifeng Xi},
3001   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
3002   journal = {LNAI},
3003   year = {2007},
3004   volume = {4693},
3005   pages = {202-208},
3006   owner = {guyeux},
3007   timestamp = {11/04/2008}
3008 }
3009
3010 @ARTICLE{Lubachevsky86,
3011   author = {Lubachevsky, Boris and Mitra, Debasis},
3012   title = {A chaotic asynchronous algorithm for computing the fixed point of
3013         a nonnegative matrix of unit spectral radius},
3014   journal = {J. ACM},
3015   year = {1986},
3016   volume = {33},
3017   pages = {130--150},
3018   number = {1},
3019   address = {New York, NY, USA},
3020   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/4904.4801},
3021   issn = {0004-5411},
3022   publisher = {ACM}
3023 }
3024
3025 @ARTICLE{Larger10,
3026   author = {{L}arger, {L}. and {D}udley, {J}.{M}.},
3027   title = { {N}onlinear dynamics {O}ptoelectronic chaos},
3028   journal = {{N}ature },
3029   year = {2010},
3030   volume = {465 },
3031   pages = {41-42 },
3032   number = {7294 },
3033   month = {05},
3034   abstract = {{O}ptoelectronic circuits with delayed feedback provide a convenient
3035         bench-top platform to study a wide range of nonlinear dynamic systems,
3036         from ultrastable clocks to complex chaotic devices.},
3037   affiliation = {{F}ranche-{C}omt{\'e} {\'E}lectronique {M}{\'e}canique, {T}hermique
3038         et {O}ptique - {S}ciences et {T}echnologies - {FEMTO}-{ST} - {CNRS}
3039         : {UMR}6174 - {U}niversit{\'e} de {F}ranche-{C}omt{\'e} - {U}niversit{\'e}
3040         de {T}echnologie de {B}elfort-{M}ontbeliard - {E}cole {N}ationale
3041         {S}up{\'e}rieure de {M}{\'e}canique et des {M}icrotechniques },
3042   audience = {internationale },
3043   day = {05},
3044   doi = {10.1038/465041a },
3045   hal_id = {hal-00517696},
3046   language = {{A}nglais},
3047   url = {http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00517696/en/}
3048 }
3049
3050 @INPROCEEDINGS{Mahoney00,
3051   author = {Mahoney, Matthew V.},
3052   title = {Fast Text Compression with Neural Networks},
3053   booktitle = {Proceedings of the Thirteenth International Florida Artificial Intelligence
3054         Research Society Conference},
3055   year = {2000},
3056   pages = {230--234},
3057   publisher = {AAAI Press},
3058   acmid = {707654},
3059   isbn = {1-57735-113-4},
3060   numpages = {5}
3061 }
3062
3063 @INPROCEEDINGS{msp10:bl,
3064   author = {Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid and Pham, Congduc},
3065   title = {Risk Management in Intrusion Detection Applications with Wireless
3066         Video Sensor Networks},
3067   booktitle = {WCNC'10 IEEE Int. Conf.},
3068   year = {2010},
3069   pages = {***--***},
3070   address = {Sydney, Australia},
3071   month = apr,
3072   note = {To appear},
3073   classement = {*},
3074   equipe = {and},
3075   inhal = {no}
3076 }
3077
3078 @ARTICLE{Malvar03,
3079   author = {H.S. Malvar and D. Florêncio},
3080   title = {Improved Spread Spectrum: A New Modulation Technique for Robust Watermarking},
3081   journal = {IEEE Trans. Signal Proceeding},
3082   year = {2003},
3083   volume = {53},
3084   pages = {898--905},
3085   owner = {christophe},
3086   timestamp = {2010.03.07}
3087 }
3088
3089 @ARTICLE{Marsaglia2003,
3090   author = {G. Marsaglia},
3091   title = {Xorshift RNGs},
3092   journal = {Journal of Statistical Software},
3093   year = {2003},
3094   volume = {8(14)},
3095   pages = {1--6},
3096   owner = {qianxue},
3097   timestamp = {2009.10.28}
3098 }
3099
3100 @ARTICLE{Marsaglia1996,
3101   author = {G. Marsaglia},
3102   title = {DIEHARD: a battery of tests of randomness.},
3103   journal = {http://stat.fsu.edu/~geo/diehard.html},
3104   year = {1996},
3105   owner = {qianxue},
3106   timestamp = {2009.11.09}
3107 }
3108
3109 @ARTICLE{Simard07testu01:a,
3110     author = {Richard Simard and Université De Montréal},
3111     title = {TestU01: A C library for empirical testing of random number generators},
3112     journal = {ACM Transactions on Mathematical Software},
3113     year = {2007},
3114     pages = {2007}
3115 }
3116
3117 @ARTICLE{DefiningChaos,
3118   author = {M. Martelli and M. Dang and T. Seph},
3119   title = {Defining chaos},
3120   journal = {Mathematics Magazine},
3121   year = {1998},
3122   volume = {71},
3123   pages = {112--122},
3124   owner = {christophe},
3125   timestamp = {2010.08.11}
3126 }
3127
3128 @ARTICLE{Michel2007c,
3129   author = {Christian J Michel},
3130   title = {An analytical model of gene evolution with 9 mutation parameters:
3131         an application to the amino acids coded by the common circular code.},
3132   journal = {Bull Math Biol},
3133   year = {2007},
3134   volume = {69},
3135   pages = {677--698},
3136   number = {2},
3137   month = {Feb},
3138   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
3139         mutation matrix 64 x 64 with nine substitution parameters associated
3140         with the three types of substitutions in the three trinucleotide
3141         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
3142         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
3143         x 64 with three and six parameters. It determines at some time t
3144         the exact occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly
3145         according to these nine substitution parameters. An application of
3146         this model allows an evolutionary study of the common circular code
3147         [Formula: see text] of eukaryotes and prokaryotes and its 12 coded
3148         amino acids. The main property of this code [Formula: see text] is
3149         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
3150         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
3151         with a window of a few nucleotides. However, since its identification
3152         in 1996, amino acid information coded by [Formula: see text] has
3153         never been studied. Very unexpectedly, this evolutionary model demonstrates
3154         that random substitutions in this code [Formula: see text] and with
3155         particular values for the nine substitutions parameters retrieve
3156         after a certain time of evolution a frequency distribution of these
3157         12 amino acids very close to the one coded by the actual genes.},
3158   doi = {10.1007/s11538-006-9147-z},
3159   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
3160         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
3161         67400 Illkirch, France. michel@dpt-info.u-strasbg.fr},
3162   keywords = {Amino Acids, genetics; Codon, genetics; Eukaryotic Cells; Evolution,
3163         Molecular; Models, Genetic; Prokaryotic Cells},
3164   language = {eng},
3165   medline-pst = {ppublish},
3166   owner = {guyeux},
3167   pmid = {16952018},
3168   timestamp = {2011.05.05},
3169   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-006-9147-z}
3170 }
3171
3172 @ARTICLE{Miellou75,
3173   author = {J.-C. Miellou},
3174   title = {Algorithmes de relaxation chaotique \`{a} retards},
3175   journal = {Rairo},
3176   year = {1975},
3177   volume = {R1},
3178   pages = {148-162},
3179   owner = {guyeux},
3180   timestamp = {2008.05.22}
3181 }
3182
3183 @ARTICLE{Miellou75b,
3184   author = {Miellou, J.-C.},
3185   title = {Itérations chaotiques à retards, étude de la convergence dans le
3186         cas d'espaces partiellement ordonnés},
3187   journal = {C.R.A.S. Paris},
3188   year = {1975},
3189   volume = {280},
3190   pages = {233--236},
3191   owner = {christophe},
3192   timestamp = {2010.08.17}
3193 }
3194
3195 @ARTICLE{Spiteri85,
3196   author = {Jean-Claude Miellou and Pierre Spitéri},
3197   title = {Un critère de convergence pour des méthodes générales de point fixe},
3198   journal = {Rairo -- Modélisation mathématique et analyse numérique},
3199   year = {1985},
3200   volume = {19},
3201   pages = {645--669},
3202   number = {4},
3203   owner = {christophe},
3204   timestamp = {2010.10.13}
3205 }
3206
3207 @ARTICLE{Mooney08,
3208   author = {Aidan Mooney and John G. Keating and Ioannis Pitas},
3209   title = {A comparative study of chaotic and white noise signals in digital
3210         watermarking},
3211   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
3212   year = {2008},
3213   volume = {35},
3214   pages = {913-921},
3215   owner = {christophe},
3216   timestamp = {2010.03.01}
3217 }
3218
3219 @ARTICLE{Nakashima2003,
3220   author = {Nakashima, Y. and Tachibana, R. and Babaguchi, N.},
3221   title = {Watermarked Movie Soundtrack Finds the Position of the Camcorder
3222         in a Theater},
3223   journal = {IEEE Transactions on Multimedia},
3224   year = {2009},
3225   note = {Accepted for future publication Multimedia}
3226 }
3227
3228 @INCOLLECTION{springerlink:10.1007/978-3-642-04431-1_16,
3229   author = {Nelson, Michael and Nahapetian, Ani and Koushanfar, Farinaz and Potkonjak,
3230         Miodrag},
3231   title = {SVD-Based Ghost Circuitry Detection},
3232   booktitle = {Information Hiding},
3233   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
3234   year = {2009},
3235   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Sadeghi, Ahmad-Reza},
3236   volume = {5806},
3237   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3238   pages = {221-234},
3239   note = {10.1007/978-3-642-04431-1_16},
3240   affiliation = {Computer Science Department, UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA},
3241   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04431-1_16}
3242 }
3243
3244 @INPROCEEDINGS{Perez-Hernandez09,
3245   author = {P\'{e}rez-Hern\'{a}ndez, Luis Germ\'{a}n and Rodr\'{\i}guez-V\'{a}zquez,
3246         Katya and Gardu\~{n}o-Ju\'{a}rez, Ram\'{o}n},
3247   title = {Parallel particle swarm optimization applied to the protein folding
3248         problem},
3249   booktitle = {Proceedings of the 11th Annual conference on Genetic and evolutionary
3250         computation},
3251   year = {2009},
3252   series = {GECCO '09},
3253   pages = {1791--1792},
3254   address = {New York, NY, USA},
3255   publisher = {ACM},
3256   acmid = {1570163},
3257   isbn = {978-1-60558-325-9},
3258   keywords = {bioinformatics, biology and chemistry, combinatorial optimization,
3259         parallelization, swarm intelligence},
3260   location = {Montreal, Qu\&\#233;bec, Canada},
3261   numpages = {2}
3262 }
3263
3264 @PHDTHESIS{Pellegrin1986,
3265   author = {D. Pellegrin},
3266   title = {Algorithmique discr\`{e}te et r\'{e}seaux d'automates},
3267   school = {Grenoble},
3268   year = {1986},
3269   owner = {guyeux},
3270   timestamp = {2008.05.22}
3271 }
3272
3273 @ARTICLE{Peng2005,
3274   author = {F. Peng and S.-S. Qiu and M. Long},
3275   title = {One way Hash function construction based on two-dimensional hyperchaotic
3276         mappings},
3277   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3278   year = {2005},
3279   volume = {54},
3280   pages = {98--104},
3281   owner = {guyeux},
3282   timestamp = {2009.01.16}
3283 }
3284
3285 @INPROCEEDINGS{Perez06,
3286   author = {Luis Perez-Freire and F. Pérez-gonzalez and Pedro Comesaña},
3287   title = {Secret Dither Estimation in Lattice-Quantization Data Hiding: A Set-Membership
3288         Approach},
3289   booktitle = {Security, Steganography, and Watermarking of Multimedia Contents},
3290   year = {2006},
3291   editor = {Edward J. Delp and Ping W. Wong},
3292   address = {San Jose, California, USA},
3293   month = {January},
3294   organization = {SPIE},
3295   owner = {guyeux},
3296   timestamp = {2009.06.30}
3297 }
3298
3299 @INPROCEEDINGS{Perez-Freire06,
3300   author = {Luis Perez-Freire and Pedro Comesana and Juan Ramon Troncoso-Pastoriza
3301         and Fernando Perez-Gonzalez},
3302   title = {Watermarking Security: a Survey},
3303   booktitle = {LNCS Transactions on Data Hiding and Multimedia Security},
3304   year = {2006},
3305   owner = {guyeux},
3306   timestamp = {2009.06.29}
3307 }
3308
3309 @PROCEEDINGS{Peter07,
3310   title = {On Concealed Data Aggregation for WSNs},
3311   year = {2007},
3312   author = {Peter, Steffen and Piotrowski, Krzysztof and Langendoerfer, Peter},
3313   booktitle = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3314         4th IEEE},
3315   citeulike-article-id = {2281643},
3316   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45},
3317   citeulike-linkout-1 = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs\_all.jsp?arnumber=4199133},
3318   doi = {10.1109/CCNC.2007.45},
3319   journal = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3320         4th IEEE},
3321   keywords = {hagg},
3322   pages = {192--196},
3323   posted-at = {2008-01-23 19:36:19},
3324   priority = {3},
3325   url = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45}
3326 }
3327
3328 @ARTICLE{pms11:ij,
3329   author = {Pham, Congduc and Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid},
3330   title = {Risk-based Adaptive Scheduling in Randomly Deployed Video Sensor
3331         Networks for Critical Surveillance Applications},
3332   journal = {Journal of Network and Computer Applications},
3333   year = {2011},
3334   volume = {*},
3335   pages = {***--***},
3336   number = {*},
3337   note = {Accepted manuscript. To appear},
3338   classement = {ACLI},
3339   equipe = {and},
3340   impact-factor = {1.111},
3341   inhal = {no},
3342   isi-acro = {J NETW COMPU APPL},
3343   publisher = {Springer}
3344 }
3345
3346 @MISC{Poe,
3347   author = {Edgar Alan Poe},
3348   title = {The Raven},
3349   month = {April},
3350   year = {1839},
3351   note = {American Museum (Baltimore)},
3352   owner = {christophe},
3353   timestamp = {2010.11.23}
3354 }
3355
3356 @ARTICLE{Perez-Freire2006:Security,
3357   author = {L. P{\'e}rez-Freire and F. P{\'e}rez-González and T. Furon and P.
3358         Comesaña},
3359   title = {Security of lattice-based data hiding against the known message attack},
3360   journal = {IEEE Trans. on Information Forensics and Security},
3361   year = {2006},
3362   volume = {1},
3363   pages = {421-439},
3364   number = {4},
3365   month = {dec},
3366   owner = {guyeux},
3367   timestamp = {2009.12.06}
3368 }
3369
3370 @MISC{Quisquater02sidechannel,
3371   author = {J-J. Quisquater and D. Samyde and Université Catholique De Louvain
3372         and Groupe Crypto},
3373   title = {Side Channel Cryptanalysis},
3374   year = {2002}
3375 }
3376
3377 @ARTICLE{Raynal2001,
3378   author = {Frédéric Raynal and Fabien A. P. Petitcolas and Caroline Fontaine},
3379   title = {Evaluation automatique des méthodes de tatouage},
3380   journal = {Traitement du signal},
3381   year = {2001},
3382   volume = {18},
3383   pages = {271-282},
3384   owner = {guyeux},
3385   timestamp = {2008.05.21}
3386 }
3387
3388 @MISC{rijmen05,
3389   author = {Vincent Rijmen and Elisabeth Oswald},
3390   title = {Update on SHA-1},
3391   howpublished = {Cryptology ePrint Archive, Report 2005/010},
3392   year = {2005},
3393   note = {\url{http://eprint.iacr.org/}}
3394 }
3395
3396 @BOOK{Robert,
3397   title = {Discrete Iterations, a Metric Study},
3398   publisher = {Springer-Verlag},
3399   year = {1986},
3400   editor = {Berlin Heidelberg New-York},
3401   author = {François Robert},
3402   volume = {6},
3403   series = {Series in Computational Mathematics}
3404 }
3405
3406 @BOOK{Robert1986,
3407   title = {Discrete Iterations: A Metric Study},
3408   year = {1986},
3409   editor = {Springer-Verlag},
3410   author = {F. Robert},
3411   volume = {6},
3412   series = {Springer Series in Computational Mathematics},
3413   owner = {guyeux},
3414   timestamp = {17/02/2008}
3415 }
3416
3417 @ARTICLE{Rudenko08,
3418   author = {Rudenko, O. and Snytkin, M.},
3419   title = {Image compression based on the neural network art},
3420   journal = {Cybernetics and Systems Analysis},
3421   year = {2008},
3422   volume = {44},
3423   pages = {797-802},
3424   affiliation = {Kharkov National University of Radio Electronics Kharkov Ukraine},
3425   issn = {1060-0396},
3426   issue = {6},
3427   keyword = {Computer Science},
3428   publisher = {Springer New York}
3429 }
3430
3431 @PHDTHESIS{Ruette2001,
3432   author = {Sylvie Ruette},
3433   title = {Chaos en dynamique topologique, en particulier sur l'intervalle,
3434         mesures d'entropie maximale},
3435   school = {Université d'Aix-Marseille II},
3436   year = {2001},
3437   optmonth = {Novembre},
3438   owner = {guyeux},
3439   timestamp = {2008.01.02}
3440 }
3441
3442 @MASTERSTHESIS{Saulnier02,
3443   author = {Boris Saulnier},
3444   title = {Entropie topologique},
3445   school = {DEA Sémantique, Preuves et Langages, Paris 7},
3446   year = {2002},
3447   owner = {christophe},
3448   timestamp = {2010.08.12}
3449 }
3450
3451 @ARTICLE{Schmitz2001,
3452   author = {Roland Schmitz},
3453   title = {Use of chaotic dynamical systems in cryptography},
3454   journal = {Journal of Franklin Institute},
3455   year = {2001},
3456   volume = {338},
3457   pages = {429-441},
3458   owner = {guyeux},
3459   timestamp = {17/02/2008}
3460 }
3461
3462 @BOOK{Schwartz80,
3463   title = {Analyse: topologie g\'{e}n\'{e}rale et analyse fonctionnelle},
3464   publisher = {Hermann},
3465   year = {1980},
3466   editor = {Hermann},
3467   author = {Laurent Schwartz},
3468   owner = {christophe},
3469   timestamp = {2010.09.15}
3470 }
3471
3472 @ARTICLE{Shannon49,
3473   author = {Shannon, Claude E.},
3474   title = {Communication Theory of Secrecy Systems},
3475   journal = {Bell Systems Technical Journal},
3476   year = {1949},
3477   volume = {28},
3478   pages = {656--715},
3479   citeulike-article-id = {507362},
3480   keywords = {master, secrecy\_systems, teoria-informacao, theory\_communication,
3481         theory\_cryptography},
3482   owner = {guyeux},
3483   posted-at = {2006-02-16 23:24:09},
3484   priority = {2},
3485   timestamp = {2009.06.29}
3486 }
3487
3488 @ARTICLE{Shmygelska05,
3489   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger},
3490   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3491         polar protein folding problem},
3492   journal = {BMC Bioinformatics},
3493   year = {2005},
3494   volume = {6},
3495   pages = {30},
3496   number = {1},
3497   abstract = {BACKGROUND:The protein folding problem is a fundamental problems in
3498         computational molecular biology and biochemical physics. Various
3499         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3500         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3501         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3502         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3503         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3504         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3505         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3506         simple model - the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3507         (HP) model.RESULTS:We present an improvement of our previous ACO
3508         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3509         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3510         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3511         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3512         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3513         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3514         a more diverse set of native conformations.CONCLUSIONS:The application
3515         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3516         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3517         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3518         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3519         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3520         for more complex and realistic models of protein structure holds
3521         significant promise.},
3522   doi = {10.1186/1471-2105-6-30},
3523   issn = {1471-2105},
3524   pubmedid = {15710037}
3525 }
3526
3527 @OTHER{Shmygelska2005Feb,
3528   __markedentry = {[christophe]},
3529   abstract = {Abstract Background The protein folding problem is a fundamental problems
3530         in computational molecular biology and biochemical physics. Various
3531         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3532         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3533         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3534         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3535         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3536         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3537         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3538         simple model – the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3539         (HP) model. Results We present an improvement of our previous ACO
3540         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3541         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3542         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3543         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3544         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3545         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3546         a more diverse set of native conformations. Conclusions The application
3547         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3548         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3549         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3550         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3551         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3552         for more complex and realistic models of protein structure holds
3553         significant promise.},
3554   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger H},
3555   journal = {BMC Bioinformatics. 2005 Feb 14},
3556   number = {1},
3557   owner = {christophe},
3558   pages = {30},
3559   timestamp = {2011.01.24},
3560   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3561         polar protein folding problem},
3562   volume = {6},
3563   year = {2005 Feb}
3564 }
3565
3566 @ARTICLE{Shujun1,
3567   author = {Li Shujun and Li Qi and Li Wenmin and Mou Xuanqin and Cai Yuanlong},
3568   title = {Statistical Properties of Digital Piecewise Linear Chaotic Maps and
3569         Their Roles in Cryptography and Pseudo-Random Coding},
3570   journal = {Proceedings of the 8th IMA International Conference on Cryptography
3571         and Coding},
3572   year = {2001},
3573   volume = {1},
3574   pages = {205--221},
3575   owner = {christophe},
3576   timestamp = {2010.03.06}
3577 }
3578
3579 @INPROCEEDINGS{Simmons83,
3580   author = {Gustavus J. Simmons},
3581   title = {The Prisoners' Problem and the Subliminal Channel},
3582   booktitle = {Advances in Cryptology, Proc. CRYPTO'83},
3583   year = {1984},
3584   pages = {51--67},
3585   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3586   owner = {guyeux},
3587   timestamp = {2009.06.29}
3588 }
3589
3590 @ARTICLE{Solak2004389,
3591   author = {Ercan Solak},
3592   title = {On the security of a class of discrete-time chaotic cryptosystems},
3593   journal = {Physics Letters A},
3594   year = {2004},
3595   volume = {320},
3596   pages = {389 - 395},
3597   number = {5-6},
3598   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2003.11.008},
3599   issn = {0375-9601},
3600   keywords = {Communication using chaos},
3601   owner = {guyeux},
3602   timestamp = {2009.12.12},
3603   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4B22RC9-2/2/99a0af737c9b6ba8af47ae4d3c7a326d}
3604 }
3605
3606 @PHDTHESIS{Spiteri74,
3607   author = {Pierre Spitéri},
3608   title = {Contribution à l'étude de la stabilite au sens de liapounov de certains
3609         systemes differentiels non lineaires},
3610   school = {Université de Franche-Comté},
3611   year = {1974},
3612   owner = {christophe},
3613   timestamp = {2010.10.13}
3614 }
3615
3616 @BOOK{Stewart1989,
3617   title = {Does God Play Dices ?: the mathematics of chaos},
3618   publisher = {Penguin},
3619   year = {1989},
3620   author = {Ian Stewart},
3621   owner = {guyeux},
3622   timestamp = {2008.01.02}
3623 }
3624
3625 @BOOK{Stinson02,
3626   title = {Cryptography: Theory and Practice, Second Edition},
3627   publisher = {{Chapman \& Hall/CRC}},
3628   year = {2002},
3629   author = {Stinson, Douglas R.},
3630   month = {February},
3631   abstract = {{Douglas R. Stinson's <I>Cryptography: Theory and Practice</I> is
3632         a mathematically intensive examination of cryptography, including
3633         ciphers, the Data Encryption Standard (DES), public key cryptography,
3634         one-way hash functions, and digital signatures. Stinson's explication
3635         of "zero-sum proofs"--a process by which one person lets another
3636         person know that he or she has a password without actually revealing
3637         any information--is especially good.<P> If you are new to the math
3638         behind cryptography but want to tackle it, the author covers all
3639         of the required background to understand the real mathematics here.
3640         <I>Cryptography</I> includes extensive exercises with each chapter
3641         and makes an ideal introduction for any math-literate person willing
3642         to get acquainted with this material.} {<P>Major advances over the
3643         last five years precipitated this major revision of the bestselling
3644         Cryptography: Theory and Practice. With more than 40 percent new
3645         or updated material, the second edition now provides an even more
3646         comprehensive treatment of modern cryptography. It focuses on the
3647         new Advanced Encryption Standards and features an entirely new chapter
3648         on that subject. Another new chapter explores the applications of
3649         secret sharing schemes, including ramp schemes, visual cryptography,
3650         threshold cryptography, and broadcast encryption. This is an ideal
3651         introductory text for both computer science and mathematics students
3652         and a valuable reference for professionals.</P>}},
3653   citeulike-article-id = {2401855},
3654   day = {27},
3655   howpublished = {Hardcover},
3656   isbn = {1584882069},
3657   keywords = {security},
3658   posted-at = {2008-02-20 08:28:49},
3659   priority = {0},
3660   url = {http://www.amazon.com/exec/obidos/redirect?tag=citeulike07-20\&path=ASIN/1584882069}
3661 }
3662
3663 @INPROCEEDINGS{Takana90,
3664   author = {K. Tanaka and Y. Nakamura and K. Matsui},
3665   title = {Embedding Secret Information into a Dithered Multi-level Image},
3666   booktitle = {IEEE Military Communications Conference},
3667   year = {1990},
3668   owner = {christophe},
3669   timestamp = {2010.08.05}
3670 }
3671
3672 @PHDTHESIS{ElTarazi81,
3673   author = {M. N. El Tarazi},
3674   title = {Contraction et ordre partiel pour l'étude d'algorithmes synchrones
3675         et asynchrones en analyse numérique},
3676   school = {Faculté des Sciences et Techniques de l'Université de Franche-Comté,
3677         Besançon},
3678   year = {1981},
3679   owner = {christophe},
3680   timestamp = {2010.08.17}
3681 }
3682
3683 @INPROCEEDINGS{Unger93,
3684   author = {Unger, Ron and Moult, John},
3685   title = {Genetic Algorithm for 3D Protein Folding Simulations},
3686   booktitle = {Proceedings of the 5th International Conference on Genetic Algorithms},
3687   year = {1993},
3688   pages = {581--588},
3689   address = {San Francisco, CA, USA},
3690   publisher = {Morgan Kaufmann Publishers Inc.},
3691   acmid = {657747},
3692   isbn = {1-55860-299-2},
3693   numpages = {8}
3694 }
3695
3696 @MISC{Van93electronicwater,
3697   author = {Tirkel Rankin Van},
3698   title = {Electronic Water Mark},
3699   year = {1993}
3700 }
3701
3702 @ARTICLE{Venkatesan2007397,
3703   author = {R.C. Venkatesan},
3704   title = {Encryption of covert information into multiple statistical distributions},
3705   journal = {Physics Letters A},
3706   year = {2007},
3707   volume = {370},
3708   pages = {397 - 404},
3709   number = {5-6},
3710   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.05.117},
3711   issn = {0375-9601},
3712   keywords = {Statistical encryption/decryption},
3713   owner = {guyeux},
3714   timestamp = {2009.12.12},
3715   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4P4FV2M-1/2/cd11a2ec144526e3c4552d2a7e7906cc}
3716 }
3717
3718 @ARTICLE{pitas,
3719   author = {G. Voyatzis and I. Pitas},
3720   title = {Chaotic watermarks for embedding in the spatial digital image domain},
3721   journal = {Proceedings of IEEE ICIP},
3722   year = {1998},
3723   volume = {2},
3724   pages = {432-436},
3725   owner = {christophe},
3726   timestamp = {2010.03.06}
3727 }
3728
3729 @INCOLLECTION{Wagner03,
3730   author = {Wagner, David},
3731   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3732   booktitle = {Information Security},
3733   publisher = {Springer Berlin, Heidelberg},
3734   year = {2003},
3735   volume = {2851},
3736   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3737   pages = {234-239},
3738   abstract = {We use linear algebra to show that an algebraic privacy homomorphism
3739         proposed by Domingo-Ferrer is insecure for some parameter settings.},
3740   affiliation = {University of California, Berkeley USA}
3741 }
3742
3743 @INPROCEEDINGS{Wagner03cryptanalysisof,
3744   author = {David Wagner},
3745   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3746   booktitle = {Proc. Sixth Information Security Conf. (ISC03},
3747   year = {2003},
3748   pages = {234--239}
3749 }
3750
3751 @ARTICLE{Wang_ellipticcurve,
3752   author = {Haodong Wang and Bo Sheng and Qun Li},
3753   title = {Elliptic curve cryptography-based access control in sensor networks},
3754   journal = {Int. J. Security and Networks}
3755 }
3756
3757 @INPROCEEDINGS{wbg10:ip,
3758   author = {Wang, Qianxue and Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Fang,
3759         Xiaole},
3760   title = {Randomness quality of {CI} chaotic generators. Application to Internet
3761         security},
3762   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
3763   year = {2010},
3764   pages = {125--130},
3765   address = {Valencia, Spain},
3766   month = sep,
3767   publisher = {IEEE Computer Society Press},
3768   note = {Best Paper award},
3769   classement = {ACTI},
3770   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
3771   equipe = {and},
3772   inhal = {no}
3773 }
3774
3775 @ARTICLE{Wang2003,
3776   author = {X. M. Wang and J. S. Zhang and W. F. Zhang},
3777   title = {One-way hash function construction based on the extended chaotic
3778         maps switch},
3779   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3780   year = {2003},
3781   volume = {52, No. 11},
3782   pages = {2737--2742},
3783   owner = {guyeux},
3784   timestamp = {2009.01.16}
3785 }
3786
3787 @ARTICLE{Girao06,
3788   author = {Westhoff, Dirk and Girao, Joao and Acharya, Mithun},
3789   title = {Concealed Data Aggregation for Reverse Multicast Traffic in Sensor
3790         Networks: Encryption, Key Distribution, and Routing Adaptation},
3791   journal = {IEEE Transactions on Mobile Computing},
3792   year = {2006},
3793   volume = {5},
3794   pages = {1417--1431},
3795   number = {10},
3796   address = {Piscataway, NJ, USA},
3797   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/TMC.2006.144},
3798   issn = {1536-1233},
3799   publisher = {IEEE Educational Activities Department}
3800 }
3801
3802 @MISC{web:lyapunov,
3803   author = {Wikipédia},
3804   title = {Exposant de Lyapunov -- Site web d'André Lévesque},
3805   year = {2010},
3806   note = {[En ligne; Page disponible le 9-septembre-2010]},
3807   url = {\url{http://math.cmaisonneuve.qc.ca/alevesque/chaos_fract/Lyapunov/Exposant.html}}
3808 }
3809
3810 @MISC{wiki:complet,
3811   author = {Wikipédia},
3812   title = {Espace complet --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3813   year = {2010},
3814   note = {[En ligne; Page disponible le 9-août-2010]},
3815   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Espace_complet&oldid=52734266}}
3816 }
3817
3818 @MISC{wiki:densite,
3819   author = {Wikipédia},
3820   title = {Densité (mathématiques) --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3821   year = {2010},
3822   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3823   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Densit%C3%A9_(math%C3%A9matiques)&oldid=53938121}}
3824 }
3825
3826 @MISC{wiki:fisher,
3827   author = {Wikipédia},
3828   title = {Information de Fisher --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3829   year = {2010},
3830   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3831   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Information_de_Fisher&oldid=52877871}}
3832 }
3833
3834 @MISC{wiki:Kerkhoffs,
3835   author = {Wikipédia},
3836   title = {Principe de Kerckhoffs --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3837   year = {2010},
3838   note = {[En ligne; Page disponible le 20-août-2010]},
3839   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Principe_de_Kerckhoffs&oldid=52133114}}
3840 }
3841
3842 @MISC{wiki:sarkovskii,
3843   author = {Wikipédia},
3844   title = {Théorème de Sarkovskii --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3845   year = {2010},
3846   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3847   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Th%C3%A9or%C3%A8me_de_Sarkovskii&oldid=54196167}}
3848 }
3849
3850 @MISC{wiki:steganographie,
3851   author = {Wikipédia},
3852   title = {Stéganographie --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3853   year = {2010},
3854   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3855   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=St%C3%A9ganographie&oldid=54724435}}
3856 }
3857
3858 @MISC{wiki:tatouage,
3859   author = {Wikipédia},
3860   title = {Tatouage numérique --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3861   year = {2010},
3862   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3863   url = {https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Tatouage_num%C3%A9rique&oldid=55484940}
3864 }
3865
3866 @MISC{wiki:testsHypothese,
3867   author = {Wikipédia},
3868   title = {Test d'hypothèse --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3869   year = {2010},
3870   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3871   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Test_d%27hypoth%C3%A8se&oldid=55344108}}
3872 }
3873
3874 @ARTICLE{Wu2007bis,
3875   author = {Xianyong Wu and Zhi-Hong Guan},
3876   title = {A novel digital watermark algorithm based on chaotic maps},
3877   journal = {Physics Letters A},
3878   year = {2007},
3879   volume = {365},
3880   pages = {403 - 406},
3881   number = {5-6},
3882   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.01.034},
3883   issn = {0375-9601},
3884   keywords = {Watermarking},
3885   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4MY0MF3-8/2/0b4d1298fa84337d2e59b3fefe26f583}
3886 }
3887
3888 @INPROCEEDINGS{Wu2007,
3889   author = {Wu, Xianyong and Guan, Zhi-Hong and Wu, Zhengping},
3890   title = {A Chaos Based Robust Spatial Domain Watermarking Algorithm},
3891   booktitle = {ISNN '07: Proceedings of the 4th international symposium on Neural
3892         Networks},
3893   year = {2007},
3894   pages = {113--119},
3895   address = {Berlin, Heidelberg},
3896   publisher = {Springer-Verlag},
3897   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-72393-6_15},
3898   isbn = {978-3-540-72392-9},
3899   location = {Nanjing, China}
3900 }
3901
3902 @ARTICLE{Xiao20092288,
3903   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3904   title = {Parallel keyed hash function construction based on chaotic neural
3905         network},
3906   journal = {Neurocomputing},
3907   year = {2009},
3908   volume = {72},
3909   pages = {2288 - 2296},
3910   number = {10-12},
3911   note = {Lattice Computing and Natural Computing (JCIS 2007) / Neural Networks
3912         in Intelligent Systems Designn (ISDA 2007)},
3913   abstract = {Recently, various hash functions based on chaos or neural networks
3914         were proposed. Nevertheless, none of them works efficiently in parallel
3915         computing environment. In this paper, an algorithm for parallel keyed
3916         hash function construction based on chaotic neural network is proposed.
3917         The mechanism of changeable-parameter and self-synchronization establishes
3918         a close relation between the hash value bit and message, and the
3919         algorithm structure ensures the uniform sensitivity of the hash value
3920         to the message blocks at different positions. The proposed algorithm
3921         can satisfy the performance requirements of hash function. These
3922         properties make it a promising choice for hashing on parallel computing
3923         platform.},
3924   issn = {0925-2312},
3925   keywords = {Chaotic neural network}
3926 }
3927
3928 @ARTICLE{Xiao20094346,
3929   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3930   title = {Improving the security of a parallel keyed hash function based on
3931         chaotic maps},
3932   journal = {Physics Letters A},
3933   year = {2009},
3934   volume = {373},
3935   pages = {4346 - 4353},
3936   number = {47},
3937   issn = {0375-9601},
3938   keywords = {Hash function},
3939   owner = {guyeux},
3940   timestamp = {2009.12.12}
3941 }
3942
3943 @ARTICLE{Xiao20102254,
3944   author = {Di Xiao and Frank Y. Shih and Xiaofeng Liao},
3945   title = {A chaos-based hash function with both modification detection and
3946         localization capabilities},
3947   journal = {Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation},
3948   year = {2010},
3949   volume = {15},
3950   pages = {2254 - 2261},
3951   number = {9},
3952   abstract = {Recently, a variety of chaos-based hash functions have been proposed.
3953         Nevertheless, none of them can realize modification localization.
3954         In this paper, a hash function with both modification detection and
3955         localization capabilities is proposed, which can also support the
3956         parallel processing mode. By using the mechanism of changeable-parameter
3957         and self-synchronization, the keystream can establish a close relation
3958         with the algorithm key, the content, and the order of each message
3959         unit. Theoretical analysis and computer simulation indicate that
3960         the proposed algorithm can satisfy the performance requirements of
3961         hash functions.},
3962   issn = {1007-5704},
3963   keywords = {Hash function}
3964 }
3965
3966 @INPROCEEDINGS{Yu06,
3967   author = {Yu, Yu and Leiwo, Jussipekka and Premkumar, Benjamin},
3968   title = {A Study on the Security of Privacy Homomorphism},
3969   booktitle = {ITNG '06: Proceedings of the Third International Conference on Information
3970         Technology: New Generations},
3971   year = {2006},
3972   pages = {470--475},
3973   address = {Washington, DC, USA},
3974   publisher = {IEEE Computer Society},
3975   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/ITNG.2006.19},
3976   isbn = {0-7695-2497-4}
3977 }
3978
3979 @ARTICLE{Zhang2008658,
3980   author = {Wei Zhang and Yonghe Liu and Sajal K. Das and Pradip De},
3981   title = {Secure data aggregation in wireless sensor networks: A watermark
3982         based authentication supportive approach},
3983   journal = {Pervasive and Mobile Computing},
3984   year = {2008},
3985   volume = {4},
3986   pages = {658 - 680},
3987   number = {5},
3988   doi = {DOI: 10.1016/j.pmcj.2008.05.005},
3989   issn = {1574-1192},
3990   keywords = {Wireless sensor networks},
3991   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B7MF1-4SKB3MD-1/2/b73948dcaa3eb63a2c21d09041882625}
3992 }
3993
3994 @ARTICLE{Zhang2005,
3995   author = {Zhang, Yang and Arakaki, Adrian K. and Skolnick, Jeffrey},
3996   title = {TASSER: An automated method for the prediction of protein tertiary
3997         structures in CASP6},
3998   journal = {Proteins},
3999   year = {2005},
4000   volume = {61},
4001   pages = {91--98},
4002   number = {S7},
4003   issn = {1097-0134},
4004   keywords = {comparative modeling, threading, ab initio prediction, TASSER, PROSPECTOR_3},
4005   owner = {christophe},
4006   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
4007   timestamp = {2011.01.22},
4008   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20724}
4009 }
4010
4011 @ARTICLE{Zhou1997429,
4012   author = {Chang-song Zhou and Tian-lun Chen},
4013   title = {Extracting information masked by chaos and contaminated with noise:
4014         Some considerations on the security of communication approaches using
4015         chaos},
4016   journal = {Physics Letters A},
4017   year = {1997},
4018   volume = {234},
4019   pages = {429 - 435},
4020   number = {6},
4021   issn = {0375-9601},
4022   keywords = {Communication},
4023   owner = {guyeux},
4024   timestamp = {2009.12.12}
4025 }
4026
4027 @ARTICLE{Zhou96,
4028   author = {Zhou, Huai-bei and Wang, Lu},
4029   title = {Chaos in Biomolecular Dynamics},
4030   journal = {The Journal of Physical Chemistry},
4031   year = {1996},
4032   volume = {100},
4033   pages = {8101-8105},
4034   number = {20},
4035   doi = {10.1021/jp953409x}
4036 }
4037
4038 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iwdw/2005,
4039   title = {IWDW'05: 4th International Workshop on Digital Watermarking},
4040   year = {2005},
4041   editor = {Mauro Barni and Ingemar J. Cox and Ton Kalker and Hyoung Joong Kim},
4042   volume = {3710},
4043   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4044   address = {Siena, Italy},
4045   publisher = {Springer},
4046   month = {September 15-17},
4047   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4048   booktitle = {IWDW},
4049   isbn = {3-540-28768-X},
4050   owner = {guyeux},
4051   timestamp = {2009.06.29}
4052 }
4053
4054 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2006,
4055   title = {IH 2006: Information Hiding, 8th International Workshop},
4056   year = {2007},
4057   editor = {Jan Camenisch and Christian S. Collberg and Neil F. Johnson and Phil
4058         Sallee},
4059   volume = {4437},
4060   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4061   address = {Alexandria, VA, USA},
4062   publisher = {Springer},
4063   month = {July},
4064   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4065   booktitle = {Information Hiding},
4066   isbn = {978-3-540-74123-7},
4067   owner = {guyeux},
4068   timestamp = {2009.06.29}
4069 }
4070
4071 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2007,
4072   title = {Information Hiding, 9th International Workshop, IH 2007, Saint Malo,
4073         France, June 11-13, 2007, Revised Selected Papers},
4074   year = {2008},
4075   editor = {Teddy Furon and Fran\c{c}ois Cayre and Gwena{\"e}l J. Do{\"e}rr and
4076         Patrick Bas},
4077   volume = {4567},
4078   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4079   publisher = {Springer},
4080   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4081   booktitle = {Information Hiding},
4082   isbn = {978-3-540-77369-6},
4083   owner = {guyeux},
4084   timestamp = {2009.06.29}
4085 }
4086
4087 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iccsa/2006-1,
4088   title = {Computational Science and Its Applications - ICCSA 2006, International
4089         Conference, Glasgow, UK, May 8-11, 2006, Proceedings, Part I},
4090   year = {2006},
4091   editor = {Marina L. Gavrilova and Osvaldo Gervasi and Vipin Kumar and Chih
4092         Jeng Kenneth Tan and David Taniar and Antonio Lagan{\`a} and Youngsong
4093         Mun and Hyunseung Choo},
4094   volume = {3980},
4095   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4096   publisher = {Springer},
4097   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4098   booktitle = {ICCSA (1)},
4099   isbn = {3-540-34070-X}
4100 }
4101
4102 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/secrypt/2010,
4103   title = {SECRYPT 2010 - Proceedings of the International Conference on Security
4104         and Cryptography, Athens, Greece, July 26-28, 2010, SECRYPT is part
4105         of ICETE - The International Joint Conference on e-Business and Telecommunications},
4106   year = {2010},
4107   editor = {Sokratis K. Katsikas and Pierangela Samarati},
4108   publisher = {SciTePress},
4109   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4110   booktitle = {SECRYPT},
4111   isbn = {978-989-8425-18-8}
4112 }
4113
4114 @BOOK{Katzenbeisser00,
4115   title = {Information Hiding Techniques for Steganography and Digital Watermarking},
4116   publisher = {Artech House, Inc.},
4117   year = {2000},
4118   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Petitcolas, Fabien A.},
4119   address = {Norwood, MA, USA},
4120   isbn = {1580530354}
4121 }
4122
4123 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/1999,
4124   title = {IH'99: 3rd International Workshop on Information Hiding},
4125   year = {2000},
4126   editor = {Andreas Pfitzmann},
4127   volume = {1768},
4128   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4129   address = {Dresden, Germany},
4130   publisher = {Springer},
4131   month = {September 29 - October 1.},
4132   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4133   booktitle = {Information Hiding},
4134   isbn = {3-540-67182-X},
4135   owner = {guyeux},
4136   timestamp = {2009.06.29}
4137 }
4138
4139 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/indocrypt/2000,
4140   title = {Progress in Cryptology - INDOCRYPT 2000, First International Conference
4141         in Cryptology in India, Calcutta, India, December 10-13, 2000, Proceedings},
4142   year = {2000},
4143   editor = {Bimal K. Roy and Eiji Okamoto},
4144   volume = {1977},
4145   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4146   publisher = {Springer},
4147   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4148   booktitle = {INDOCRYPT},
4149   isbn = {3-540-41452-5}
4150 }
4151
4152 @BOOK{DBLP:reference/icsec/2010,
4153   title = {Handbook of Information and Communication Security},
4154   publisher = {Springer},
4155   year = {2010},
4156   editor = {Peter P. Stavroulakis and Mark Stamp},
4157   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4158   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
4159   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4},
4160   isbn = {978-3-642-04116-7}
4161 }
4162
4163 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/isnn/2004-2,
4164   title = {Advances in Neural Networks - ISNN 2004, International Symposium
4165         on Neural Networks, Dalian, China, August 19-21, 2004, Proceedings,
4166         Part II},
4167   year = {2004},
4168   editor = {Fuliang Yin and Jun Wang and Chengan Guo},
4169   volume = {3174},
4170   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4171   publisher = {Springer},
4172   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4173   booktitle = {ISNN (2)},
4174   isbn = {3-540-22843-8}
4175 }
4176
4177 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/adhocnets/2010,
4178   title = {Ad Hoc Networks - Second International Conference, ADHOCNETS 2010,
4179         Victoria, BC, Canada, August 18-20, 2010, Revised Selected Papers},
4180   year = {2010},
4181   editor = {Jun Zheng and David Simplot-Ryl and Victor C. M. Leung},
4182   volume = {49},
4183   series = {Lecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social Informatics
4184         and Telecommunications Engineering},
4185   publisher = {Springer},
4186   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4187   booktitle = {ADHOCNETS},
4188   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5},
4189   isbn = {978-3-642-17993-8}
4190 }
4191
4192 @INPROCEEDINGS{,
4193   owner = {guyeux},
4194   timestamp = {2011.03.29}
4195 }
4196
4197 @MISC{Delicious,
4198   title = {Delicious social bookmarking, http://delicious.com/},
4199   comment = {http://delicious.com/},
4200   type = {web page},
4201   url = {http://delicious.com/}
4202 }
4203
4204 @MISC{Frick,
4205   title = {The Frick Collection, http://www.frick.org/},
4206   comment = {http://www.frick.org/},
4207   type = {web page},
4208   url = {http://www.frick.org/}
4209 }
4210
4211 @PROCEEDINGS{2010,
4212   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4213         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4214   year = {2010},
4215   publisher = {IEEE},
4216   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4217   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4218 }
4219
4220 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4221   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4222         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4223   year = {2010},
4224   publisher = {IEEE},
4225   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4226   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4227 }
4228
4229 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/date/2010,
4230   title = {Design, Automation and Test in Europe, DATE 2010, Dresden, Germany,
4231         March 8-12, 2010},
4232   year = {2010},
4233   publisher = {IEEE},
4234   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4235   booktitle = {DATE}
4236 }
4237
4238 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/2009,
4239   title = {Proceedings IEEE CSE'09, 12th IEEE International Conference on Computational
4240         Science and Engineering, August 29-31, 2009, Vancouver, BC, Canada},
4241   year = {2009},
4242   publisher = {IEEE Computer Society},
4243   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4244   booktitle = {CSE}
4245 }
4246
4247 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/2009,
4248   title = {Proceedings of the International Conference on Ultra Modern Telecommunications,
4249         ICUMT 2009, 12-14 October 2009, St. Petersburg, Russia},
4250   year = {2009},
4251   publisher = {IEEE},
4252   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4253   booktitle = {ICUMT}
4254 }
4255
4256 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/2008,
4257   title = {49th Annual IEEE Symposium on Foundations of Computer Science, FOCS
4258         2008, October 25-28, 2008, Philadelphia, PA, USA},
4259   year = {2008},
4260   publisher = {IEEE Computer Society},
4261   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4262   booktitle = {FOCS}
4263 }
4264
4265 @comment{jabref-meta: selector_publisher:}
4266
4267 @comment{jabref-meta: selector_author:}
4268
4269 @comment{jabref-meta: selector_journal:}
4270
4271 @comment{jabref-meta: selector_keywords:Chaos;Entropie Topologique;Tip
4272
4273
4274
4275
4276 @InProceedings{Pang:2008:cec,
4277   author =      "Wai-Man Pang and Tien-Tsin Wong and Pheng-Ann Heng",
4278   title =       "Generating Massive High-Quality Random Numbers using
4279                  {GPU}",
4280   booktitle =   "2008 IEEE World Congress on Computational
4281                  Intelligence",
4282   year =        "2008",
4283   editor =      "Jun Wang",
4284   address =     "Hong Kong",
4285   organization = "IEEE Computational Intelligence Society",
4286   publisher =   "IEEE Press",
4287
4288 }
4289
4290 @Article{LEcuyerS07,
4291   title =       "Test{U01}: {A} {C} library for empirical testing of
4292                  random number generators",
4293   author =      "Pierre L'Ecuyer and Richard J. Simard",
4294   journal =     "ACM Trans. Math. Softw",
4295   year =        "2007",
4296   number =      "4",
4297   volume =      "33",
4298   bibdate =     "2007-11-06",
4299   bibsource =   "DBLP,
4300                  http://dblp.uni-trier.de/db/journals/toms/toms33.html#LEcuyerS07",
4301   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1268776.1268777",
4302 }
4303
4304 @Article{ZRKB10,
4305         author =                         {A. Zhmurov and K. Rybnikov and Y. Kholodov and V. Barsegov},
4306         title =                          {Generation of Random Numbers on Graphics Processors: Forced Indentation In Silico of the Bacteriophage HK97},
4307         journal =                {J. Phys. Chem. B},
4308         year =                           {2011},
4309         volume =         {115},
4310         number =         {18},
4311         pages =                  {5278--5288},
4312 }
4313
4314
4315
4316 @comment {regarder : Pseudo-Random Number Generation for Brownian Dynamics and Dissipative Particle Dynamics Simulations on GPU Devices}
4317 @comment {CL Phillips, JA Anderson… - Journal of Computational Physics, 2011 - Elsevier}
4318
4319 @InProceedings{conf/fpga/ThomasHL09,
4320   title =       "A comparison of {CPU}s, {GPU}s, {FPGA}s, and massively
4321                  parallel processor arrays for random number
4322                  generation",
4323   author =      "David B. Thomas and Lee W. Howes and Wayne Luk",
4324 booktitle =     "Proceedings of the {ACM}/{SIGDA} 17th International
4325                  Symposium on Field Programmable Gate Arrays, {FPGA}
4326                  2009, Monterey, California, {USA}, February 22-24,
4327                  2009",
4328   bibdate =     "2010-06-29",
4329   publisher =   "ACM",
4330   year =        "2009",
4331   editor =      "Paul Chow and Peter Y. K. Cheung",
4332   ISBN =        "978-1-60558-410-2",
4333   pages =       "63--72",
4334   URL =         "http://doi.acm.org/10.1145/1508128.1508139",
4335 }
4336
4337
4338
4339 @InProceedings{Jenkins96,
4340   author =      "Jenkins",
4341   title =       "{ISAAC}",
4342   booktitle =   "IWFSE: International Workshop on Fast Software
4343                  Encryption, LNCS",
4344   year =        "1996",
4345 }
4346
4347 @manual{Nvid10,
4348  author = {Nvidia},
4349  title = {Cuda cublas library},
4350  year = {2011},
4351  Note = {Version 4.0},
4352  }
4353
4354 @manual{curand11,
4355  author = {Nvidia},
4356  title = {Curand library},
4357  year = {2011},
4358  Note = {Version 4.0},
4359  }
4360
4361
4362
4363 @Article{BBS,
4364         author =                         {Lenore Blum and Manuel Blum and Michael Shub},
4365         title =                          {A Simple Unpredictable Pseudo-Random Number Generator},
4366         journal =                {SIAM Journal on Computing},
4367         year =                           {1986},
4368         volume =         {15},
4369         pages =                  {364--383},
4370 }
4371
4372 @Book{Goldreich,
4373   author =       {Oded Goldreich},
4374   ALTeditor =    {},
4375   title =        {Foundations of Cryptography: Basic Tools},
4376   publisher =    {Cambridge University Press},
4377   year =         {2007},
4378 }
4379
4380