mabase.bib

   1 % This file was created with JabRef 2.6.
   2 % Encoding: UTF8
   3
   4 @INPROCEEDINGS{AdelsbachKS06,
   5   author = {Andr{\'e} Adelsbach and Stefan Katzenbeisser and Ahmad-Reza Sadeghi},
   6   title = {A Computational Model for Watermark Robustness},
   7   booktitle = {Information Hiding},
   8   year = {2006},
   9   pages = {145-160},
  10   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  11   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
  12   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_10},
  13   owner = {guyeux},
  14   timestamp = {2009.06.29}
  15 }
  16
  17 @INPROCEEDINGS{BattiatoCGG99,
  18   author = {Sebastiano Battiato and Dario Catalano and Giovanni Gallo and Rosario
  19         Gennaro},
  20   title = {Robust Watermarking for Images Based on Color Manipulation},
  21   booktitle = {Information Hiding},
  22   year = {1999},
  23   pages = {302-317},
  24   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  25   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
  26   owner = {guyeux},
  27   timestamp = {2009.06.29}
  28 }
  29
  30 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05,
  31   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  32   title = {The Return of the Sensitivity Attack},
  33   booktitle = {IWDW},
  34   year = {2005},
  35   pages = {260-274},
  36   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  37   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
  38   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_20},
  39   owner = {guyeux},
  40   timestamp = {2009.06.29}
  41 }
  42
  43 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05bis,
  44   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  45   title = {Fundamentals of Data Hiding Security and Their Application to Spread-Spectrum
  46         Analysis},
  47   booktitle = {IH'05: Information Hiding Workshop},
  48   year = {2005},
  49   pages = {146-160},
  50   publisher = {Lectures Notes in Computer Science, Springer-Verlag},
  51   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  52   crossref = {DBLP:conf/ih/2005},
  53   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11558859_12},
  54   owner = {guyeux},
  55   timestamp = {2009.06.30}
  56 }
  57
  58 @INPROCEEDINGS{CongJQZ06,
  59   author = {Jin Cong and Yan Jiang and Zhiguo Qu and Zhongmei Zhang},
  60   title = {A Wavelet Packets Watermarking Algorithm Based on Chaos Encryption},
  61   booktitle = {ICCSA (1)},
  62   year = {2006},
  63   pages = {921-928},
  64   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  65   crossref = {DBLP:conf/iccsa/2006-1},
  66   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11751540_100}
  67 }
  68
  69 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/DziembowskiP08,
  70   author = {Stefan Dziembowski and Krzysztof Pietrzak},
  71   title = {Leakage-Resilient Cryptography},
  72   booktitle = {FOCS},
  73   year = {2008},
  74   pages = {293-302},
  75   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  76   crossref = {DBLP:conf/focs/2008},
  77   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/FOCS.2008.56}
  78 }
  79
  80 @INCOLLECTION{Filiol10,
  81   author = {Eric Filiol},
  82   title = {Viruses and Malware},
  83   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
  84   year = {2010},
  85   pages = {747-769},
  86   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  87   crossref = {DBLP:reference/icsec/2010},
  88   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4_34}
  89 }
  90
  91 @INPROCEEDINGS{Filiol00,
  92   author = {Eric Filiol},
  93   title = {Decimation Attack of Stream Ciphers},
  94   booktitle = {INDOCRYPT},
  95   year = {2000},
  96   pages = {31-42},
  97   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  98   crossref = {DBLP:conf/indocrypt/2000},
  99   ee = {http://link.springer.de/link/service/series/0558/bibs/1977/19770031.htm}
 100 }
 101
 102 @INPROCEEDINGS{Furon05,
 103   author = {Teddy Furon},
 104   title = {A Survey of Watermarking Security},
 105   booktitle = {IWDW},
 106   year = {2005},
 107   pages = {201-215},
 108   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 109   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
 110   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_16},
 111   owner = {guyeux},
 112   timestamp = {2009.06.29}
 113 }
 114
 115 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HiggsSHS10,
 116   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 117   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 118         prediction},
 119   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 120   year = {2010},
 121   pages = {1-8},
 122   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 123   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 124   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 125 }
 126
 127 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HiggsSHS10,
 128   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 129   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 130         prediction},
 131   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 132   year = {2010},
 133   pages = {1-8},
 134   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 135   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 136   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 137 }
 138
 139 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HorvathC10,
 140   author = {Dragos Horvath and Camelia Chira},
 141   title = {Simplified chain folding models as metaheuristic benchmark for tuning
 142         real protein folding algorithms?},
 143   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 144   year = {2010},
 145   pages = {1-8},
 146   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 147   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 148   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5585932}
 149 }
 150
 151 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/IslamC10,
 152   author = {Md. Kamrul Islam and Madhu Chetty},
 153   title = {Clustered memetic algorithm for protein structure prediction},
 154   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 155   year = {2010},
 156   pages = {1-8},
 157   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 158   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 159   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586187}
 160 }
 161
 162 @INPROCEEDINGS{Ker06,
 163   author = {Andrew D. Ker},
 164   title = {Batch Steganography and Pooled Steganalysis},
 165   booktitle = {Information Hiding},
 166   year = {2006},
 167   pages = {265-281},
 168   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 169   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
 170   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_18},
 171   owner = {guyeux},
 172   timestamp = {2009.06.29}
 173 }
 174
 175 @INPROCEEDINGS{Lin2009,
 176   author = {H.-Y. Lin and T.-C. Chiang},
 177   title = {Cooperative Secure Data Aggregation in Sensor Networks Using Elliptic
 178         Curve Based Cryptosystems},
 179   booktitle = {CDVE},
 180   year = {2009},
 181   pages = {384-387},
 182   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 183   crossref = {DBLP:conf/cdve/2009},
 184   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04265-2_58}
 185 }
 186
 187 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/MaimourPH09,
 188   author = {Moufida Maimour and CongDuc Pham and Doan B. Hoang},
 189   title = {A Congestion Control Framework for Handling Video Surveillance Traffics
 190         on WSN},
 191   booktitle = {CSE (2)},
 192   year = {2009},
 193   pages = {943-948},
 194   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 195   crossref = {DBLP:conf/cse/2009},
 196   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CSE.2009.200}
 197 }
 198
 199 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/MakhoulSP09,
 200   author = {Abdallah Makhoul and Rachid Saadi and CongDuc Pham},
 201   title = {Coverage and adaptive scheduling algorithms for criticality management
 202         on video wireless sensor networks},
 203   booktitle = {ICUMT},
 204   year = {2009},
 205   pages = {1-8},
 206   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 207   crossref = {DBLP:conf/icumt/2009},
 208   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/ICUMT.2009.5345630}
 209 }
 210
 211 @INPROCEEDINGS{Mittelholzer99,
 212   author = {Thomas Mittelholzer},
 213   title = {An Information-Theoretic Approach to Steganography and Watermarking},
 214   booktitle = {Information Hiding},
 215   year = {1999},
 216   pages = {1-16},
 217   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 218   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
 219   owner = {guyeux},
 220   timestamp = {2009.06.29}
 221 }
 222
 223 @INPROCEEDINGS{PellegriniBA10,
 224   author = {Andrea Pellegrini and Valeria Bertacco and Todd M. Austin},
 225   title = {Fault-based attack of RSA authentication},
 226   booktitle = {DATE},
 227   year = {2010},
 228   pages = {855-860},
 229   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 230   crossref = {DBLP:conf/date/2010},
 231   ee = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5456933}
 232 }
 233
 234 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/Perez-HernandezRG10,
 235   author = {Luis Germ{\'a}n P{\'e}rez-Hern{\'a}ndez and Katya Rodr\'{\i}guez-V{\'a}zquez
 236         and Ram{\'o}n Gardu{\~n}o-Ju{\'a}rez},
 237   title = {Estimation of 3D Protein Structure by means of parallel Particle
 238         Swarm Optimization},
 239   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 240   year = {2010},
 241   pages = {1-8},
 242   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 243   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 244   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586549}
 245 }
 246
 247 @INPROCEEDINGS{WangNHZH07,
 248   author = {Chuntao Wang and Jiangqun Ni and Jiwu Huang and Rongyue Zhang and
 249         Meiying Huang},
 250   title = {Robust and High Capacity Image Watermarking Based on Jointly Coding
 251         and Embedding Optimization},
 252   booktitle = {Information Hiding},
 253   year = {2007},
 254   pages = {65-79},
 255   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 256   crossref = {DBLP:conf/ih/2007},
 257   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-77370-2_5},
 258   owner = {guyeux},
 259   timestamp = {2009.06.29}
 260 }
 261
 262 @INPROCEEDINGS{Zhao04,
 263   author = {Jian Zhao and Mingquan Zhou and Hongmei Xie and Jinye Peng and Xin
 264         Zhou},
 265   title = {A Novel Wavelet Image Watermarking Scheme Combined with Chaos Sequence
 266         and Neural Network},
 267   booktitle = {ISNN (2)},
 268   year = {2004},
 269   pages = {663-668},
 270   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 271   crossref = {DBLP:conf/isnn/2004-2},
 272   ee = {http://springerlink.metapress.com/openurl.asp?genre=article{\&}issn=0302-9743{\&}volume=3174{\&}spage=663}
 273 }
 274
 275 @INPROCEEDINGS{Acharya05securecomparison,
 276   author = {Acharya, Mithun and Girao, Joao and Westhoff, Dirk},
 277   title = {Secure Comparison of Encrypted Data in Wireless Sensor Networks},
 278   booktitle = {WIOPT '05: Proceedings of the Third International Symposium on Modeling
 279         and Optimization in Mobile, Ad Hoc, and Wireless Networks},
 280   year = {2005},
 281   pages = {47--53},
 282   address = {Washington, DC, USA},
 283   publisher = {IEEE Computer Society},
 284   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/WIOPT.2005.44},
 285   isbn = {0-7695-2267-X}
 286 }
 287
 288 @INPROCEEDINGS{Acimez07onthe,
 289   author = {Onur Acıi\c{c}mez and \c{C}etin Kaya Ko\c{c} and Jean-Pierre Seifert},
 290   title = {On the power of simple branch prediction analysis },
 291   booktitle = {2007 ACM Symposium on Information, Computer and Communications Security
 292         (ASIACCS'07)},
 293   year = {2007},
 294   pages = {312--320},
 295   publisher = {ACM Press}
 296 }
 297
 298 @ARTICLE{Adler65,
 299   author = {R. L. Adler and A. G. Konheim and M. H. McAndrew},
 300   title = {Topological entropy},
 301   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
 302   year = {1965},
 303   volume = {114},
 304   pages = {309-319},
 305   owner = {guyeux},
 306   timestamp = {2008.05.29}
 307 }
 308
 309 @INPROCEEDINGS{Agrawal04,
 310   author = {Agrawal, Rakesh and Kiernan, Jerry and Srikant, Ramakrishnan and
 311         Xu, Yirong},
 312   title = {Order preserving encryption for numeric data},
 313   booktitle = {SIGMOD '04: Proceedings of the 2004 ACM SIGMOD international conference
 314         on Management of data},
 315   year = {2004},
 316   pages = {563--574},
 317   address = {New York, NY, USA},
 318   publisher = {ACM},
 319   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1007568.1007632},
 320   isbn = {1-58113-859-8},
 321   location = {Paris, France}
 322 }
 323
 324 @ARTICLE{Anfinsen20071973,
 325   author = {Anfinsen, Christian B.},
 326   title = {Principles that Govern the Folding of Protein Chains},
 327   journal = {Science},
 328   year = {1973},
 329   volume = {181},
 330   pages = {223-230},
 331   number = {4096},
 332   doi = {10.1126/science.181.4096.223},
 333   eprint = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.full.pdf},
 334   url = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.short}
 335 }
 336
 337 @ARTICLE{Arques1994,
 338   author = {D. G. Arques and C. J. Michel},
 339   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine autocorrelation function
 340         after and before random mutations.},
 341   journal = {Math Biosci},
 342   year = {1994},
 343   volume = {123},
 344   pages = {103--125},
 345   number = {1},
 346   month = {Sep},
 347   abstract = {The mutation process is a classical evolutionary genetic process.
 348         The type of mutations studied here is the random substitutions of
 349         a purine base R (adenine or guanine) by a pyrimidine base Y (cytosine
 350         or thymine) and reciprocally (transversions). The analytical expressions
 351         derived allow us to analyze in genes the occurrence probabilities
 352         of motifs and d-motifs (two motifs separated by any d bases) on the
 353         R/Y alphabet under transversions. These motif probabilities can be
 354         obtained after transversions (in the evolutionary sense; from the
 355         past to the present) and, unexpectedly, also before transversions
 356         (after back transversions, in the inverse evolutionary sense, from
 357         the present to the past). This theoretical part in Section 2 is a
 358         first generalization of a particular formula recently derived. The
 359         application in Section 3 is based on the analytical expression giving
 360         the autocorrelation function (the d-motif probabilities) before transversions.
 361         It allows us to study primitive genes from actual genes. This approach
 362         solves a biological problem. The protein coding genes of chloroplasts
 363         and mitochondria have a preferential occurrence of the 6-motif YRY(N)6YRY
 364         (maximum of the autocorrelation function for d = 6, N = R or Y) with
 365         a periodicity modulo 3. The YRY(N)6YRY preferential occurrence without
 366         the periodicity modulo 3 is also observed in the RNA coding genes
 367         (ribosomal, transfer, and small nuclear RNA genes) and in the noncoding
 368         genes (introns and 5' regions of eukaryotic nuclei). However, there
 369         are two exceptions to this YRY(N)6YRY rule: the protein coding genes
 370         of eukaryotic nuclei, and prokaryotes, where YRY(N)6YRY has the second
 371         highest value after YRY(N)0YRY (YRYYRY) with a periodicity modulo
 372         3. When we go backward in time with the analytical expression, the
 373         protein coding genes of both eukaryotic nuclei and prokaryotes retrieve
 374         the YRY(N)6YRY preferential occurrence with a periodicity modulo
 375         3 after 0.2 back transversions per base. In other words, the actual
 376         protein coding genes of chloroplasts and mitochondria are similar
 377         to the primitive protein coding genes of eukaryotic nuclei and prokaryotes.
 378         On the other hand, this application represents the first result concerning
 379         the mutation process in the model of DNA sequence evolution we recently
 380         proposed. According to this model, the actual genes on the R/Y alphabet
 381         derive from two successive evolutionary genetic processes: an independent
 382         mixing of a few nonrandom types of oligonucleotides leading to genes
 383         called primitive followed by a mutation process in these primitive
 384         genes.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)},
 385   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 386         France.},
 387   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Mathematics; Models,
 388         Genetic; Mutation; Probability; Proteins, genetics; Purines; Pyrimidines},
 389   language = {eng},
 390   medline-pst = {ppublish},
 391   owner = {guyeux},
 392   pii = {0025-5564(94)90020-5},
 393   pmid = {7949744},
 394   timestamp = {2011.05.05}
 395 }
 396
 397 @ARTICLE{Arques1998,
 398   author = {D. G. Arquès and J. P. Fallot and C. J. Michel},
 399   title = {An evolutionary analytical model of a complementary circular code
 400         simulating the protein coding genes, the 5' and 3' regions.},
 401   journal = {Bull Math Biol},
 402   year = {1998},
 403   volume = {60},
 404   pages = {163--194},
 405   number = {1},
 406   month = {Jan},
 407   abstract = {The self-complementary subset T0 = X0 [symbol: see text] ¿AAA, TTT¿
 408         with X0 = ¿AAC, AAT, ACC, ATC, ATT, CAG, CTC, CTG, GAA, GAC, GAG,
 409         GAT, GCC, GGC, GGT, GTA, GTC, GTT, TAC, TTC¿ of 22 trinucleotides
 410         has a preferential occurrence in the frame 0 (reading frame established
 411         by the ATG start trinucleotide) of protein (coding) genes of both
 412         prokaryotes and eukaryotes. The subsets T1 = X1 [symbol: see text]
 413         ¿CCC¿ and T2 = X2 [symbol: see text] ¿GGG¿ of 21 trinucleotides have
 414         a preferential occurrence in the shifted frames 1 and 2 respectively
 415         (frame 0 shifted by one and two nucleotides respectively in the 5'-3'
 416         direction). T1 and T2 are complementary to each other. The subset
 417         T0 contains the subset X0 which has the rarity property (6 x 10(-8)
 418         to be a complementary maximal circular code with two permutated maximal
 419         circular codes X1 and X2 in the frames 1 and 2 respectively. X0 is
 420         called a C3 code. A quantitative study of these three subsets T0,
 421         T1, T2 in the three frames 0, 1, 2 of protein genes, and the 5' and
 422         3' regions of eukaryotes, shows that their occurrence frequencies
 423         are constant functions of the trinucleotide positions in the sequences.
 424         The frequencies of T0, T1, T2 in the frame 0 of protein genes are
 425         49, 28.5 and 22.5\% respectively. In contrast, the frequencies of
 426         T0, T1, T2 in the 5' and 3' regions of eukaryotes, are independent
 427         of the frame. Indeed, the frequency of T0 in the three frames of
 428         5' (respectively 3') regions is equal to 35.5\% (respectively 38\%)
 429         and is greater than the frequencies T1 and T2, both equal to 32.25\%
 430         (respectively 31\%) in the three frames. Several frequency asymmetries
 431         unexpectedly observed (e.g. the frequency difference between T1 and
 432         T2 in the frame 0), are related to a new property of the subset T0
 433         involving substitutions. An evolutionary analytical model at three
 434         parameters (p, q, t) based on an independent mixing of the 22 codons
 435         (trinucleotides in frame 0) of T0 with equiprobability (1/22) followed
 436         by t approximately 4 substitutions per codon according to the proportions
 437         p approximately 0.1, q approximately 0.1 and r = 1 - p - q approximately
 438         0.8 in the three codon sites respectively, retrieves the frequencies
 439         of T0, T1, T2 observed in the three frames of protein genes and explains
 440         these asymmetries. Furthermore, the same model (0.1, 0.1, t) after
 441         t approximately 22 substitutions per codon, retrieves the statistical
 442         properties observed in the three frames of the 5' and 3' regions.
 443         The complex behaviour of these analytical curves is totally unexpected
 444         and a priori difficult to imagine.},
 445   doi = {10.1006/bulm.1997.0033},
 446   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Marne la Vallée, Institut
 447         Gaspard Monge, Noisy Le Grand, France. arques@univ-mlv.fr},
 448   keywords = {Animals; Biological Evolution; Codon, genetics; Genetic Code; Humans;
 449         Mammals; Models, Genetic; Probability; Proteins, genetics; Rodentia;
 450         Vertebrates},
 451   language = {eng},
 452   medline-pst = {ppublish},
 453   owner = {guyeux},
 454   pii = {S0092-8240(97)90033-1},
 455   pmid = {9530018},
 456   timestamp = {2011.05.05},
 457   url = {http://dx.doi.org/10.1006/bulm.1997.0033}
 458 }
 459
 460 @ARTICLE{Arques1993,
 461   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 462   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine codon probability
 463         after and before random mutations.},
 464   journal = {Bull Math Biol},
 465   year = {1993},
 466   volume = {55},
 467   pages = {1025--1038},
 468   number = {6},
 469   month = {Nov},
 470   abstract = {Recently, we proposed a new model of DNA sequence evolution (Arquès
 471         and Michel. 1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772) according to which
 472         actual genes on the purine/pyrimidine (R/Y) alphabet (R = purine
 473         = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine) are the
 474         result of two successive evolutionary genetic processes: (i) a mixing
 475         (independent) process of non-random oligonucleotides (words of base
 476         length less than 10: YRY(N)6, YRYRYR and YRYYRY are so far identified;
 477         N = R or Y) leading to primitive genes (words of several hundreds
 478         of base length) and followed by (ii) a random mutation process, i.e.,
 479         transformations of a base R (respectively Y) into the base Y (respectively
 480         R) at random sites in these primitive genes. Following this model
 481         the problem investigated here is the study of the variation of the
 482         8 R/Y codon probabilities RRR, ..., YYY under random mutations. Two
 483         analytical expressions solved here allow analysis of this variation
 484         in the classical evolutionary sense (from the past to the present,
 485         i.e., after random mutations), but also in the inverted evolutionary
 486         sense (from the present to the past, i.e., before random mutations).
 487         Different properties are also derived from these formulae. Finally,
 488         a few applications of these formulae are presented. They prove the
 489         proposition in Arquès and Michel (1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772),
 490         Section 3.3.2, with the existence of a maximal mean number of random
 491         mutations per base of the order 0.3 in the protein coding genes.
 492         They also confirm the mixing process of oligonucleotides by excluding
 493         the purine/pyrimidine contiguous and alternating tracts from the
 494         formation process of primitive genes.},
 495   institution = {Université de Franche-Comté, Besançon, France.},
 496   keywords = {Base Sequence; Codon; DNA, chemistry/genetics; Mathematics; Models,
 497         Genetic; Mutation; Probability; Purines; Pyrimidines},
 498   language = {eng},
 499   medline-pst = {ppublish},
 500   owner = {guyeux},
 501   pmid = {8281128},
 502   timestamp = {2011.05.05}
 503 }
 504
 505 @ARTICLE{Arques1993b,
 506   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 507   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 508         common to different eukaryotic gene subpopulations.},
 509   journal = {Biochimie},
 510   year = {1993},
 511   volume = {75},
 512   pages = {399--407},
 513   number = {5},
 514   abstract = {The nucleotide distribution in protein coding genes, introns and transfer
 515         RNA genes of eukaryotic subpopulations (primates, rodent and mammals)
 516         is studied by autocorrelation functions. The autocorrelation function
 517         analysing the occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY (YRY-function)
 518         in protein coding genes and transfer RNA genes of these three eukaryotic
 519         subpopulations retrieves the preferential occurrence of YRY(N)6YRY
 520         (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine,
 521         N = R or Y). The autocorrelation functions analysing the occurrence
 522         probability of the i-motifs RRR(N)iRRR (RRR-function) and YYY(N)iYYY
 523         (YYY-function) identify new non-random genetic statistical properties
 524         in these three eukaryotic subpopulations, mainly: i) in their protein
 525         coding genes: local maxima for i identical to 6 [12] (peaks for i
 526         = 6, 18, 30, 42) with the RRR-function and local maxima for i identical
 527         to 8 [10] (peaks for i = 8, 18, 28) with the YYY-function; and ii)
 528         in their introns: local maxima for i identical to 3 [6] (peaks for
 529         i = 3, 9, 15) and a short linear decrease followed by a large exponential
 530         decrease both with the RRR- and YYY-functions. The non-random properties
 531         identified in eukaryotic intron subpopulations are modelised with
 532         a process of random insertions and deletions of nucleotides simulating
 533         the RNA editing.},
 534   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 535         d'Informatique de Besançon, France.},
 536   keywords = {Animals; Base Sequence; Data Interpretation, Statistical; Genes; Introns;
 537         Mammals; Models, Genetic; Primates; Probability; Proteins, genetics;
 538         RNA Editing; RNA, Transfer, genetics; Rodentia; Sequence Analysis,
 539         DNA},
 540   language = {eng},
 541   medline-pst = {ppublish},
 542   owner = {guyeux},
 543   pii = {0300-9084(93)90173-P},
 544   pmid = {8347726},
 545   timestamp = {2011.05.05}
 546 }
 547
 548 @ARTICLE{Arques1992,
 549   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 550   title = {A simulation of the genetic periodicities modulo 2 and 3 with processes
 551         of nucleotide insertions and deletions.},
 552   journal = {J Theor Biol},
 553   year = {1992},
 554   volume = {156},
 555   pages = {113--127},
 556   number = {1},
 557   month = {May},
 558   abstract = {Recently, a new genetic process termed RNA editing has been identified
 559         showing insertions and deletions of nucleotides in particular RNA
 560         molecules. On the other hand, there are a few non-random statistical
 561         properties in genes: in particular, the periodicity modulo 3 (P3)
 562         associated with an open reading frame, the periodicity modulo 2 (P2)
 563         associated with alternating purine/pyrimidine stretches, the YRY(N)6YRY
 564         preferential occurrence (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 565         = cytosine or thymine, N = R or Y) representing a "code" of the DNA
 566         helix pitch, etc. The problem investigated here is whether a process
 567         of the type RNA editing can lead to the non-random statistical properties
 568         commonly observed in genes. This paper will show in particular that:
 569         The process of insertions and deletions of mononucleotides in the
 570         initial sequence [YRY(N)3]* [series of YRY(N)3] can lead to the periodicity
 571         modulo 2 (P2). The process of insertions and deletions of trinucleotides
 572         in the initial sequence [YRY(N)6]* [series of YRY(N)6] can lead to
 573         the periodicity modulo 3 (P3) and the YRY(N)6YRY preferential occurrence.
 574         Furthermore, these two processes lead to a strong correlation with
 575         the reality, namely the mononucleotide insertion/deletion process,
 576         with the 5' eukaryotic regions and the trinucleotide insertion/deletion
 577         process, with the eukaryotic protein coding genes.},
 578   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 579         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 580   keywords = {Chromosome Deletion; Computer Simulation; Humans; Models, Genetic;
 581         Mutagenesis, genetics; RNA, genetics},
 582   language = {eng},
 583   medline-pst = {ppublish},
 584   owner = {guyeux},
 585   pmid = {1379311},
 586   timestamp = {2011.05.05}
 587 }
 588
 589 @ARTICLE{Arques1990,
 590   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 591   title = {Periodicities in coding and noncoding regions of the genes.},
 592   journal = {J Theor Biol},
 593   year = {1990},
 594   volume = {143},
 595   pages = {307--318},
 596   number = {3},
 597   month = {Apr},
 598   abstract = {Gene population statistical studies of protein coding genes and introns
 599         have identified two types of periodicities on the purine/pyrimidine
 600         alphabet: (i) the modulo 3 periodicity or coding periodicity (periodicity
 601         P3) in protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, viruses,
 602         chloroplasts, mitochondria, plasmids and in introns of viruses and
 603         mitochondria, and (ii) the modulo 2 periodicity (periodicity P2)
 604         in the eukaryotic introns. The periodicity study is herein extended
 605         to the 5' and 3' regions of eukaryotes, prokaryotes and viruses and
 606         shows: (i) the periodicity P3 in the 5' and 3' regions of eukaryotes.
 607         Therefore, these observations suggest a unitary and dynamic concept
 608         for the genes as for a given genome, the 5' and 3' regions have the
 609         genetic information for protein coding genes and for introns: (1)
 610         In the eukaryotic genome, the 5' (P2 and P3) and 3' (P2 and P3) regions
 611         have the information for protein coding genes (P3) and for introns
 612         (P2). The intensity of P3 is high in 5' regions and weak in 3' regions,
 613         while the intensity of P2 is weak in 5' regions and high in 3' regions.
 614         (2) In the prokaryotic genome, the 5' (P3) and 3' (P3) regions have
 615         the information for protein coding genes (P3). (3) In the viral genome,
 616         the 5' (P3) and 3' (P3) regions have the information for protein
 617         coding genes (P3) and for introns (P3). The absence of P2 in viral
 618         introns (in opposition to eukaryotic introns) may be related to the
 619         absence of P2 in 5' and 3' regions of viruses.},
 620   institution = {Université de Franche-Comté, Unité Associée CNRS No. 822, Besançon,
 621         France.},
 622   keywords = {Animals; Base Sequence; Eukaryotic Cells; Genes; Introns; Prokaryotic
 623         Cells; Purine Nucleotides; Pyrimidine Nucleotides; Repetitive Sequences,
 624         Nucleic Acid; Viruses, genetics},
 625   language = {eng},
 626   medline-pst = {ppublish},
 627   owner = {guyeux},
 628   pmid = {2385108},
 629   timestamp = {2011.05.05}
 630 }
 631
 632 @ARTICLE{Arques1990a,
 633   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 634   title = {A model of DNA sequence evolution.},
 635   journal = {Bull Math Biol},
 636   year = {1990},
 637   volume = {52},
 638   pages = {741--772},
 639   number = {6},
 640   abstract = {Statistical studies of gene populations on the purine/pyrimidine alphabet
 641         have shown that the mean occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY
 642         (R = purine, Y = pyrimidine, N = R or Y) is not uniform by varying
 643         i in the range, but presents a maximum at i = 6 in the following
 644         populations: protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, chloroplasts
 645         and mitochondria, and also viral introns, ribosomal RNA genes and
 646         transfer RNA genes (Arquès and Michel, 1987b, J. theor. Biol. 128,
 647         457-461). From the "universality" of this observation, we suggested
 648         that the oligonucleotide YRY(N)6 is a primitive one and that it has
 649         a central function in DNA sequence evolution (Arquès and Michel,
 650         1987b, J. theor. Biol. 128, 457-461). Following this idea, we introduce
 651         a concept of a model of DNA sequence evolution which will be validated
 652         according to a schema presented in three parts. In the first part,
 653         using the last version of the gene database, the YRY(N)6YRY preferential
 654         occurrence (maximum at i = 6) is confirmed for the populations mentioned
 655         above and is extended to some newly analysed populations: chloroplast
 656         introns, chloroplast 5' regions, mitochondrial 5' regions and small
 657         nuclear RNA genes. On the other hand, the YRY(N)6YRY preferential
 658         occurrence and periodicities are used in order to classify 18 gene
 659         populations. In the second part, we will demonstrate that several
 660         statistical features characterizing different gene populations (in
 661         particular the YRY(N)6YRY preferential occurrence and the periodicities)
 662         can be retrieved from a simple Markov model based on the mixing of
 663         the two oligonucleotides YRY(N)6 and YRY(N)3 and based on the percentages
 664         of RYR and YRY in the unspecified trinucleotides (N)3 of YRY(N)6
 665         and YRY(N)3. Several properties are identified and prove in particular
 666         that the oligonucleotide mixing is an independent process and that
 667         several different features are functions of a unique parameter. In
 668         the third part, the return of the model to the reality shows a strong
 669         correlation between reality and simulation concerning the presence
 670         of a large alternating purine/pyrimidine stretches and of periodicities.
 671         It also contributes to a greater understanding of biological reality,
 672         e.g. the presence or the absence of large alternating purine/pyrimidine
 673         stretches can be explained as being a simple consequence of the mixing
 674         of two particular oligonucleotides. Finally, we believe that such
 675         an approach is the first step toward a unified model of DNA sequence
 676         evolution allowing the molecular understanding of both the origin
 677         of life and the actual biological reality.},
 678   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 679         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 680   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Genetics, Population;
 681         Models, Genetic},
 682   language = {eng},
 683   medline-pst = {ppublish},
 684   owner = {guyeux},
 685   pmid = {2279193},
 686   timestamp = {2011.05.05}
 687 }
 688
 689 @ARTICLE{Arques1993a,
 690   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel and K. Orieux},
 691   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 692         common to different populations of eukaryotic non-coding genes.},
 693   journal = {J Theor Biol},
 694   year = {1993},
 695   volume = {161},
 696   pages = {329--342},
 697   number = {3},
 698   month = {Apr},
 699   abstract = {The autocorrelation function analysing the occurrence probability
 700         of the i-motif YRY(N)iYRY in genes allows the identification of mainly
 701         two periodicities modulo 2, 3 and the preferential occurrence of
 702         the motif YRY(N)6YRY (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 703         = cytosine or thymine, N = R or Y). These non-random genetic statistical
 704         properties can be simulated by an independent mixing of the three
 705         oligonucleotides YRYRYR, YRYYRY and YRY(N)6 (Arquès & Michel, 1990b).
 706         The problem investigated in this study is whether new properties
 707         can be identified in genes with other autocorrelation functions and
 708         also simulated with an oligonucleotide mixing model. The two autocorrelation
 709         functions analysing the occurrence probability of the i-motifs RRR(N)iRRR
 710         and YYY(N)iYYY simultaneously identify three new non-random genetic
 711         statistical properties: a short linear decrease, local maxima for
 712         i identical to 3[6] (i = 3, 9, etc) and a large exponential decrease.
 713         Furthermore, these properties are common to three different populations
 714         of eukaryotic non-coding genes: 5' regions, introns and 3' regions
 715         (see section 2). These three non-random properties can also be simulated
 716         by an independent mixing of the four oligonucleotides R8, Y8, RRRYRYRRR,
 717         YYYRYRYYY and large alternating R/Y series. The short linear decrease
 718         is a result of R8 and Y8, the local maxima for i identical to 3[6],
 719         of RRRYRYRRR and YYYRYRYYY, and the large exponential decrease, of
 720         large alternating R/Y series (section 3). The biological meaning
 721         of these results and their relation to the previous oligonucleotide
 722         mixing model are presented in the Discussion.},
 723   doi = {10.1006/jtbi.1993.1059},
 724   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 725         d'Informatique de Besançon, France.},
 726   keywords = {Animals; Biological Evolution; Genes, genetics; Models, Genetic; Models,
 727         Statistical; Mutation, genetics; Oligonucleotides, genetics; Probability},
 728   language = {eng},
 729   medline-pst = {ppublish},
 730   owner = {guyeux},
 731   pii = {S0022-5193(83)71059-3},
 732   pmid = {8331957},
 733   timestamp = {2011.05.05},
 734   url = {http://dx.doi.org/10.1006/jtbi.1993.1059}
 735 }
 736
 737 @ARTICLE{Arroyo08,
 738   author = {David Arroyo and Gonzalo Alvarez and Veronica Fernandez},
 739   title = {On the inadequacy of the logistic map for cryptographic applications},
 740   journal = {X Reunión Española sobre Criptología y Seguridad de la Información
 741         (X RECSI)},
 742   year = {2008},
 743   volume = {1},
 744   pages = {77-82},
 745   owner = {christophe},
 746   timestamp = {2010.03.01}
 747 }
 748
 749 @MISC{Backofen99algorithmicapproach,
 750   author = {R. Backofen and S. Will and P. Clote},
 751   title = {Algorithmic Approach To Quantifying The Hydrophobic Force Contribution
 752         In Protein Folding},
 753   year = {1999}
 754 }
 755
 756 @INPROCEEDINGS{bcgr11:ip,
 757   author = {Bahi, Jacques and Couchot, Jean-fran\c{c}ois and Guyeux, Christophe
 758         and Richard, Adrien},
 759   title = {On the Link Between Strongly Connected Iteration Graphs and Chaotic
 760         Boolean Discrete-Time Dynamical Systems},
 761   booktitle = {FCT'11, 18th Int. Symp. on Fundamentals of Computation Theory},
 762   year = {2011},
 763   volume = {*},
 764   series = {LNCS},
 765   pages = {***--***},
 766   address = {Oslo, Norway},
 767   month = aug,
 768   note = {To appear},
 769   classement = {ACTI},
 770   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 771   equipe = {and},
 772   inhal = {no}
 773 }
 774
 775 @INPROCEEDINGS{guyeux10ter,
 776   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe},
 777   title = {A new chaos-based watermarking algorithm},
 778   booktitle = {SECRYPT'10, Int. conf. on security and cryptography},
 779   year = {2010},
 780   pages = {455--458},
 781   address = {Athens, Greece},
 782   month = jul,
 783   publisher = {SciTePress},
 784   classement = {ACTI},
 785   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 786   equipe = {and},
 787   inhal = {no}
 788 }
 789
 790 @INPROCEEDINGS{bgc11:ip,
 791   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Cote, Nathalie},
 792   title = {Chaos of Protein Folding},
 793   booktitle = {IJCNN 2011, Int. Joint Conf. on Neural Networks},
 794   year = {2011},
 795   pages = {***--***},
 796   address = {San Jose, California, United States},
 797   month = jul,
 798   note = {To appear},
 799   classement = {ACTI},
 800   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 801   equipe = {and},
 802   inhal = {no}
 803 }
 804
 805 @INPROCEEDINGS{guyeux10bis,
 806   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 807   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 808         Networks},
 809   booktitle = {SENSORCOMM'10, 4-th Int. Conf. on Sensor Technologies and Applications},
 810   year = {2010},
 811   pages = {472--477},
 812   address = {Venice-Mestre, Italy},
 813   month = jul,
 814   classement = {ACTI},
 815   doi = {10.1109/SENSORCOMM.2010.76},
 816   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 817   equipe = {and},
 818   inhal = {no},
 819   url = {http://dx.doi.org/10.1109/SENSORCOMM.2010.76}
 820 }
 821
 822 @INPROCEEDINGS{guyeuxVictoria,
 823   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 824   title = {Secure Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. Homomorphism
 825         versus Watermarking Approach},
 826   booktitle = {ADHOCNETS 2010, 2nd Int. Conf. on Ad Hoc Networks},
 827   year = {2010},
 828   volume = {49},
 829   series = {Lecture Notes in ICST},
 830   pages = {344--358},
 831   address = {Victoria, Canada},
 832   month = aug,
 833   classement = {ACTI},
 834   doi = {10.1007/978-3-642-17994-5_23},
 835   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 836   equipe = {and},
 837   inhal = {no},
 838   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5_23}
 839 }
 840
 841 @INPROCEEDINGS{bgs11:ip,
 842   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Salomon, Michel},
 843   title = {Building a Chaotic Proven Neural Network},
 844   booktitle = {ICCANS 2011, IEEE Int. Conf. on Computer Applications and Network
 845         Security},
 846   year = {2011},
 847   pages = {***--***},
 848   address = {Maldives, Maldives},
 849   month = may,
 850   classement = {ACTI},
 851   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 852   equipe = {and},
 853   inhal = {no}
 854 }
 855
 856 @INPROCEEDINGS{bgw10:ip,
 857   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 858   title = {A Pseudo Random Numbers Generator Based on Chaotic Iterations. Application
 859         to Watermarking},
 860   booktitle = {WISM 2010, Int. Conf. on Web Information Systems and Mining},
 861   year = {2010},
 862   volume = {6318},
 863   series = {LNCS},
 864   pages = {202--211},
 865   address = {Sanya, China},
 866   month = oct,
 867   classement = {ACTI},
 868   doi = {10.1007/978-3-642-16515-3_26},
 869   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 870   equipe = {and},
 871   inhal = {no},
 872   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-16515-3_26}
 873 }
 874
 875 @INPROCEEDINGS{bgw09:ip,
 876   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 877   title = {A novel pseudo-random generator based on discrete chaotic iterations},
 878   booktitle = {INTERNET'09, 1-st Int. Conf. on Evolving Internet},
 879   year = {2009},
 880   pages = {71--76},
 881   address = {Cannes, France},
 882   month = aug,
 883   classement = {ACTI},
 884   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 885   equipe = {and},
 886   inhal = {no}
 887 }
 888
 889 @INPROCEEDINGS{bmg10:onp,
 890   author = {Bahi, Jacques and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 891   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 892         Networks for critical applications},
 893   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 894         et Applications Critiques de Surveillance},
 895   year = {2010},
 896   address = {Bayonne, France},
 897   month = jun,
 898   note = {Communication orale},
 899   classement = {COM},
 900   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 901   equipe = {and},
 902   inhal = {no}
 903 }
 904
 905 @INPROCEEDINGS{guyeuxBayonne,
 906   author = {Bahi, Jacques and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 907   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 908         Networks for critical applications},
 909   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 910         et Applications Critiques de Surveillance},
 911   year = {2010},
 912   address = {Bayonne, France},
 913   month = jun,
 914   note = {Communication orale},
 915   classement = {COM},
 916   equipe = {and},
 917   inhal = {no}
 918 }
 919
 920 @ARTICLE{bs10:ij,
 921   author = {Bahi, Jacques and Salomon, Michel},
 922   title = {A Decentralized Energy-based Diffusion Algorithm to Increase the
 923         Lifetime of {MANETs}},
 924   journal = {Computer Networks Journal},
 925   year = {2010},
 926   pages = {***--***},
 927   note = {Accepted manuscript. To appear},
 928   classement = {ACLI},
 929   equipe = {and},
 930   impact-factor = {1.201},
 931   inhal = {no},
 932   isi-acro = {#},
 933   publisher = {Elsevier}
 934 }
 935
 936 @ARTICLE{Bahi2000,
 937   author = {J. M. Bahi},
 938   title = {Boolean totally asynchronous iterations},
 939   journal = {Int. Journal of Mathematical Algorithms},
 940   year = {2000},
 941   volume = {1},
 942   pages = {331--346},
 943   owner = {guyeux},
 944   timestamp = {17/02/2008}
 945 }
 946
 947 @ARTICLE{Bahi2000bis,
 948   author = {Jacques M. Bahi},
 949   title = {Asynchronous iterative algorithms for nonexpansive linear systems},
 950   journal = {Journal of Parallel and Distributed Computing},
 951   year = {2000},
 952   volume = {60},
 953   pages = {92--112},
 954   owner = {guyeux},
 955   timestamp = {2009.01.10}
 956 }
 957
 958 @ARTICLE{Bahi1999,
 959   author = {J. M. Bahi},
 960   title = {Parallel synchronous chaotic iterations for singular linear systems},
 961   journal = {Parallel Algorithms and Applications},
 962   year = {1999},
 963   volume = {14},
 964   pages = {19--35},
 965   owner = {guyeux},
 966   timestamp = {17/02/2008}
 967 }
 968
 969 @ARTICLE{Bahi1998,
 970   author = {Jacques M. Bahi},
 971   title = {Algorithmes paralleles asynchrones pour les systemes singuliers},
 972   journal = {Comptes Rendus de l'Academie des Sciences},
 973   year = {1998},
 974   volume = {t. 326, serie 1},
 975   pages = {1421--1425},
 976   owner = {guyeux},
 977   timestamp = {2009.01.18}
 978 }
 979
 980 @PHDTHESIS{bahi98,
 981   author = {Jacques M. Bahi},
 982   title = {Méthodes itératives dans des espaces produits. Application au calcul
 983         parallèle},
 984   school = {Université de Franche-Comté},
 985   year = {1998},
 986   type = {Habilitation à diriger des recherches},
 987   owner = {christophe},
 988   timestamp = {2010.08.24}
 989 }
 990
 991 @PHDTHESIS{bahi91,
 992   author = {Jacques M. Bahi},
 993   title = {Algorithmes asynchrones pour des systèmes différentiels-algébriques.
 994         Simulation numérique sur des exemples de circuits électriques},
 995   school = {Université de Franche-Comté},
 996   year = {1991},
 997   owner = {christophe},
 998   timestamp = {2010.08.24}
 999 }
1000
1001 @ARTICLE{bcv06:ij,
1002   author = {Jacques M. Bahi and Sylvain Contassot-Vivier},
1003   title = {Basins of attraction in fully asynchronous discrete-time discrete-state
1004         dynamic networks},
1005   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1006   year = {2006},
1007   volume = {17},
1008   pages = {397--408},
1009   number = {2},
1010   inhal = {no},
1011   owner = {guyeux},
1012   timestamp = {2009.12.04}
1013 }
1014
1015 @ARTICLE{Bahi2002,
1016   author = {J.~M. Bahi and S. Contassot-Vivier},
1017   title = {Stability of fully asynchronous discrete-time discrete state dynamic
1018         networks},
1019   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1020   year = {2002},
1021   volume = {13(6)},
1022   pages = {1353-1363},
1023   owner = {guyeux},
1024   timestamp = {2009.02.14}
1025 }
1026
1027 @TECHREPORT{bcgg10:ir,
1028   author = {Bahi, J. M. and Couchot, J.-F. and Grasset, O. and Guyeux, C.},
1029   title = {{D}iscrete {D}ynamical {S}ystems: {N}ecessary {D}ivergence {C}onditions
1030         for {S}ynchronous {I}terations},
1031   institution = {LIFC - Laboratoire d'{I}nformatique de l'{U}niversit\'{e} de {F}ranche
1032         {C}omt\'{e}},
1033   year = {2010},
1034   type = {Research Report},
1035   number = {RR2010-04},
1036   month = sep,
1037   pdf = {/~publis/papers/pub/2010/RR2010-04.pdf}
1038 }
1039
1040 @ARTICLE{guyeux09,
1041   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1042   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
1043   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
1044   year = {2010},
1045   volume = {4},
1046   pages = {167--181},
1047   number = {2},
1048   classement = {ACLNI},
1049   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1050   equipe = {and},
1051   impact-factor = {#},
1052   inhal = {no},
1053   isi-acro = {#}
1054 }
1055
1056 @INPROCEEDINGS{guyeux10,
1057   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1058   title = {Topological chaos and chaotic iterations, application to Hash functions},
1059   booktitle = {WCCI'10, IEEE World Congress on Computational Intelligence},
1060   year = {2010},
1061   pages = {1--7},
1062   address = {Barcelona, Spain},
1063   month = jul,
1064   note = {Best paper award},
1065   classement = {ACTI},
1066   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1067   equipe = {and},
1068   inhal = {no}
1069 }
1070
1071 @MISC{ih10,
1072   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1073   title = {A chaos-based approach for information hiding security.},
1074   howpublished = {arXiv},
1075   month = {April},
1076   year = {2010},
1077   institution = {Computer Science Laboratory LIFC, University of Franche-Comte, France}
1078 }
1079
1080 @ARTICLE{arxiv,
1081   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1082   title = {A watermarking algorithm satisfying topological chaos properties},
1083   journal = {CoRR},
1084   year = {2008},
1085   volume = {abs/0810.4713},
1086   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1087   ee = {http://arxiv.org/abs/0810.4713}
1088 }
1089
1090 @ARTICLE{Bahi2008,
1091   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1092   title = {Chaotic iterations and topological chaos},
1093   year = {2008},
1094   abstract = {Chaotic iterations have been introduced on the one hand by Chazan,
1095         Miranker [5] and Miellou [9] in a numerical analysis context, and
1096         on the other hand by Robert [11] and Pellegrin [10] in the discrete
1097         dynamical systems framework. In both cases, the objective was to
1098         derive conditions of convergence of such iterations to a fixed state.
1099         In this paper, a new point of view is presented, the goal here is
1100         to derive conditions under which chaotic iterations admit a chaotic
1101         behaviour in a rigorous mathematical sense. Contrary to what has
1102         been studied in the literature, convergence is not desired. More
1103         precisely, we establish in this paper a link between the concept
1104         of chaotic iterations on a finite set and the notion of topological
1105         chaos [8], [6], [7]. We are motivated by concrete applications of
1106         our approach, such as the use of chaotic boolean iterations in the
1107         computer security field. Indeed, the concept of chaos is used in
1108         many areas of data security without real rigorous theoretical foundations,
1109         and without using the fundamental properties that allow chaos. The
1110         wish of this paper is to bring a bit more mathematical rigour in
1111         this field.},
1112   citeseerurl = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1113   comment = {arXiv},
1114   comments = {6 pages},
1115   eprint = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1116   oai2identifier = {0810.3154},
1117   owner = {guyeux},
1118   timestamp = {2008.10.23},
1119   url = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}}
1120 }
1121
1122 @ARTICLE{arxivRNNchaos,
1123   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux and Michel Salomon},
1124   title = {Building a Chaotic Proved Neural Network},
1125   journal = {CoRR},
1126   year = {2011},
1127   volume = {abs/1101.4351},
1128   ee = {http://arxiv.org/abs/1101.4351}
1129 }
1130
1131 @INPROCEEDINGS{guyeuxTaiwan10,
1132   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
1133   title = {Improving random number generators by chaotic iterations. Application
1134         in data hiding},
1135   booktitle = {ICCASM 2010, Int. Conf. on Computer Application and System Modeling},
1136   year = {2010},
1137   pages = {V13-643--V13-647},
1138   address = {Taiyuan, China},
1139   month = oct,
1140   classement = {ACTI},
1141   doi = {10.1109/ICCASM.2010.5622199},
1142   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1143   equipe = {and},
1144   inhal = {no},
1145   url = {http://dx.doi.org/10.1109/ICCASM.2010.5622199}
1146 }
1147
1148 @ARTICLE{Bahi2009,
1149   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1150   title = {A stochastic model of gene evolution with time dependent pseudochaotic
1151         mutations.},
1152   journal = {Bull Math Biol},
1153   year = {2009},
1154   volume = {71},
1155   pages = {681--700},
1156   number = {3},
1157   month = {Apr},
1158   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1159         in which a random subset of the 64 possible trinucleotides mutates
1160         at each evolutionary time t according to some time dependent substitution
1161         probabilities. Therefore, at each time t, the numbers and the types
1162         of mutable trinucleotides are unknown. Thus, the mutation matrix
1163         changes at each time t. This pseudochaotic model developed generalizes
1164         the standard model in which all the trinucleotides mutate at each
1165         time t. It determines the occurrence probabilities at time t of trinucleotides
1166         which pseudochaotically mutate according to 3 time dependent substitution
1167         parameters associated with the 3 trinucleotide sites. The main result
1168         proves that under suitable assumptions, this pseudochaotic model
1169         converges to a uniform probability vector identical to that of the
1170         standard model. Furthermore, an application of this pseudochaotic
1171         model allows an evolutionary study of the 3 circular codes identified
1172         in both eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1173         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1174         frames in genes locally, i.e., anywhere in genes and particularly
1175         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1176         After a certain evolutionary time and with particular time dependent
1177         functions for the 3 substitution parameters, precisely an exponential
1178         decrease in the 1st and 2nd trinucleotide sites and an exponential
1179         increase in the 3rd one, this pseudochaotic model retrieves the main
1180         statistical properties of the 3 circular codes observed in genes.
1181         Furthermore, it leads to a circular code asymmetry stronger than
1182         the standard model (nonpseudochaotic) and, therefore, to a better
1183         correlation with the genes.},
1184   doi = {10.1007/s11538-008-9376-4},
1185   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1186         90016, Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1187   keywords = {Evolution, Molecular; Genes; Models, Genetic; Mutation; Stochastic
1188         Processes},
1189   language = {eng},
1190   medline-pst = {ppublish},
1191   owner = {guyeux},
1192   pmid = {19198957},
1193   timestamp = {2011.05.05},
1194   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-008-9376-4}
1195 }
1196
1197 @ARTICLE{Bahi2008a,
1198   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1199   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations.},
1200   journal = {J Theor Biol},
1201   year = {2008},
1202   volume = {255},
1203   pages = {53--63},
1204   number = {1},
1205   month = {Nov},
1206   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1207         in which the mutations are chaotic, i.e. a random subset of the 64
1208         possible trinucleotides mutates at each evolutionary time t according
1209         to some substitution probabilities. Therefore, at each time t, the
1210         numbers and the types of mutable trinucleotides are unknown. Thus,
1211         the mutation matrix changes at each time t. The chaotic model developed
1212         generalizes the standard model in which all the trinucleotides mutate
1213         at each time t. It determines the occurrence probabilities at time
1214         t of trinucleotides which chaotically mutate according to three substitution
1215         parameters associated with the three trinucleotide sites. Two theorems
1216         prove that this chaotic model has a probability vector at each time
1217         t and that it converges to a uniform probability vector identical
1218         to that of the standard model. Furthermore, four applications of
1219         this chaotic model (with a uniform random strategy for the 64 trinucleotides
1220         and with a particular strategy for the three stop codons) allow an
1221         evolutionary study of the three circular codes identified in both
1222         eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1223         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1224         frames in genes locally, i.e. anywhere in genes and particularly
1225         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1226         After a certain evolutionary time and with particular values for
1227         the three substitution parameters, the chaotic models retrieve the
1228         main statistical properties of the three circular codes observed
1229         in genes. These applications also allow an evolutionary comparison
1230         between the standard and chaotic models.},
1231   doi = {10.1016/j.jtbi.2008.07.028},
1232   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1233         90016 Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1234   keywords = {Animals; Computer Simulation; DNA, Circular, genetics; Evolution,
1235         Molecular; Genetic Code; Models, Genetic; Mutation; Nonlinear Dynamics;
1236         Stochastic Processes; Time},
1237   language = {eng},
1238   medline-pst = {ppublish},
1239   owner = {guyeux},
1240   pii = {S0022-5193(08)00395-0},
1241   pmid = {18706428},
1242   timestamp = {2011.05.05},
1243   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2008.07.028}
1244 }
1245
1246 @ARTICLE{Bahi2008bis,
1247   author = {Bahi, J. M. and Michel, C. J.},
1248   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations},
1249   journal = {Journal of Theoretical Biology},
1250   year = {2008},
1251   volume = {255},
1252   pages = {53-63},
1253   owner = {guyeux},
1254   timestamp = {2009.01.10}
1255 }
1256
1257 @ARTICLE{Bahi2004,
1258   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1259   title = {A stochastic gene evolution model with time dependent mutations.},
1260   journal = {Bull Math Biol},
1261   year = {2004},
1262   volume = {66},
1263   pages = {763--778},
1264   number = {4},
1265   month = {Jul},
1266   abstract = {We develop here a new class of gene evolution models in which the
1267         nucleotide mutations are time dependent. These models allow to study
1268         nonlinear gene evolution by accelerating or decelerating the mutation
1269         rates at different evolutionary times. They generalize the previous
1270         ones which are based on constant mutation rates. The stochastic model
1271         developed in this class determines at some time t the occurrence
1272         probabilities of trinucleotides mutating according to 3 time dependent
1273         substitution parameters associated with the 3 trinucleotide sites.
1274         Therefore, it allows to simulate the evolution of the circular code
1275         recently observed in genes. By varying the class of function for
1276         the substitution parameters, 1 among 12 models retrieves after mutation
1277         the statistical properties of the observed circular code in the 3
1278         frames of actual genes. In this model, the mutation rate in the 3rd
1279         trinucleotide site increases during gene evolution while the mutation
1280         rates in the 1st and 2nd sites decrease. This property agrees with
1281         the actual degeneracy of the genetic code. This approach can easily
1282         be generalized to study evolution of motifs of various lengths, e.g.,
1283         dicodons, etc., with time dependent mutations.},
1284   doi = {10.1016/j.bulm.2003.10.004},
1285   institution = {LIFC - FRE CNRS 2661, IUT de Belfort, Université de Franche-Comté,
1286         BP 527, 90016 Belfort Cédex, France. bahi@iut-bm.univ-fcomte.fr},
1287   keywords = {Codon, genetics; Evolution, Molecular; Genes, genetics; Genetic Code,
1288         genetics; Models, Genetic; Mutation; Stochastic Processes},
1289   language = {eng},
1290   medline-pst = {ppublish},
1291   owner = {guyeux},
1292   pii = {S0092824003001174},
1293   pmid = {15210317},
1294   timestamp = {2011.05.05},
1295   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.bulm.2003.10.004}
1296 }
1297
1298 @ARTICLE{Banks92,
1299   author = {J. Banks and J. Brooks and G. Cairns and P. Stacey},
1300   title = {On Devaney's Definition of Chaos},
1301   journal = {Amer. Math. Monthly},
1302   year = {1992},
1303   volume = {99},
1304   pages = {332--334},
1305   keywords = {(c+),},
1306   owner = {guyeux},
1307   timestamp = {27/01/2008}
1308 }
1309
1310 @MISC{Nist10,
1311   author = {E. Barker and A. Roginsky},
1312   title = {DRAFT NIST Special Publication 800-131 Recommendation for the Transitioning
1313         of Cryptographic Algorithms and Key Sizes},
1314   year = {2010},
1315   owner = {christophe},
1316   timestamp = {2010.08.18}
1317 }
1318
1319 @ARTICLE{BarniBF03,
1320   author = {Mauro Barni and Franco Bartolini and Teddy Furon},
1321   title = {A general framework for robust watermarking security},
1322   journal = {Signal Processing},
1323   year = {2003},
1324   volume = {83},
1325   pages = {2069-2084},
1326   number = {10},
1327   note = {Special issue on Security of Data Hiding Technologies, invited paper},
1328   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1329   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/S0165-1684(03)00168-3},
1330   owner = {guyeux},
1331   timestamp = {2009.06.30}
1332 }
1333
1334 @ARTICLE{Baudet78,
1335   author = {Baudet, G\'{e}rard M.},
1336   title = {Asynchronous Iterative Methods for Multiprocessors},
1337   journal = {J. ACM},
1338   year = {1978},
1339   volume = {25},
1340   pages = {226--244},
1341   number = {2},
1342   address = {New York, NY, USA},
1343   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/322063.322067},
1344   issn = {0004-5411},
1345   publisher = {ACM}
1346 }
1347
1348 @PHDTHESIS{Baz98,
1349   author = {Didier El Baz},
1350   title = {Contribution à l'algorithmique parallèle. Le concept d'asynchronisme
1351         : étude théorique, mise en œuvre, et application},
1352   school = {Institut national polytechnique de Toulouse},
1353   year = {1998},
1354   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1355   owner = {christophe},
1356   timestamp = {2010.08.24}
1357 }
1358
1359 @ARTICLE{bhr09c:bl,
1360   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1361   title = {Contention awareness and fault-tolerant scheduling for precedence
1362         constrained tasks in heterogeneous systems},
1363   journal = {Parallel Computing},
1364   year = {2009},
1365   volume = {35},
1366   pages = {83--108},
1367   number = {2},
1368   classement = {*},
1369   doi = {10.1016/j.parco.2008.11.001},
1370   equipe = {and},
1371   inhal = {no},
1372   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.parco.2008.11.001}
1373 }
1374
1375 @INPROCEEDINGS{bhr08b:bl,
1376   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1377   title = {Fault tolerant scheduling of precedence task graphs on heterogeneous
1378         platforms},
1379   booktitle = {IPDPS'08},
1380   year = {2008},
1381   pages = {1--8},
1382   publisher = {IEEE Computer Society Press},
1383   classement = {*},
1384   equipe = {and},
1385   inhal = {no}
1386 }
1387
1388 @INPROCEEDINGS{Berger98,
1389   author = {Berger, Bonnie and Leighton, Tom},
1390   title = {Protein folding in the hydrophobic-hydrophilic (HP) is NP-complete},
1391   booktitle = {Proceedings of the second annual international conference on Computational
1392         molecular biology},
1393   year = {1998},
1394   series = {RECOMB '98},
1395   pages = {30--39},
1396   address = {New York, NY, USA},
1397   publisher = {ACM},
1398   acmid = {279080},
1399   isbn = {0-89791-976-9},
1400   location = {New York, New York, United States},
1401   numpages = {10}
1402 }
1403
1404 @BOOK{Bertsekas89,
1405   title = {Parallel and distributed computation: numerical methods},
1406   publisher = {Prentice-Hall, Inc.},
1407   year = {1989},
1408   author = {Bertsekas, Dimitri P. and Tsitsiklis, John N.},
1409   address = {Upper Saddle River, NJ, USA},
1410   isbn = {0-13-648700-9}
1411 }
1412
1413 @MISC{Bertsekas88paralleland,
1414   author = {Dimitri P. Bertsekas and John N. Tsitsiklis},
1415   title = {Parallel and distributed iterative algorithms: a selective survey},
1416   year = {1988}
1417 }
1418
1419 @UNPUBLISHED{F.a,
1420   author = {F. Blanchard and E. Glasner and S. Kolyada and A.Maass},
1421   title = {On Li-Yorke pairs},
1422   note = {Preprint},
1423   optkey = {2000},
1424   owner = {guyeux},
1425   timestamp = {2008.01.02}
1426 }
1427
1428 @UNPUBLISHED{F.,
1429   author = {F. Blanchard and B. Host and S. Ruette},
1430   title = {Asymptotic pairs in positive-entropy systems},
1431   note = {Preprint},
1432   optannote = {to appear in Ergod. Th. Dynam. Sys.},
1433   optkey = {2000},
1434   owner = {guyeux},
1435   timestamp = {2008.01.02}
1436 }
1437
1438 @ARTICLE{BFibe,
1439   author = {Dan Boneh and Matt Franklin},
1440   title = {Identity-Based Encryption from the {Weil} Pairing},
1441   journal = {SIAM J. of Computing},
1442   year = {2003},
1443   volume = {32},
1444   pages = {586-615},
1445   number = {3},
1446   note = {Extended abstract in Crypto'01}
1447 }
1448
1449 @INCOLLECTION{boneh,
1450   author = {Boneh, Dan and Goh, Eu-Jin and Nissim, Kobbi},
1451   title = {Evaluating 2-DNF Formulas on Ciphertexts},
1452   year = {2005},
1453   pages = {325--341},
1454   abstract = {Let ψ be a 2-DNF formula on boolean variables x 1,..., x n ∈ {0,1}.
1455         We present a homomorphic public key encryption scheme that allows
1456         the public evaluation of ψ given an encryption of the variables x
1457         1,..., x n. In other words, given the encryption of the bits x 1,...,
1458         x n, anyone can create the encryption of ψ( x 1,..., x n). More generally,
1459         we can evaluate quadratic multi-variate polynomials on ciphertexts
1460         provided the resulting value falls within a small set. We present
1461         a number of applications of the system: 1 In a database of size n,
1462         the total communication in the basic step of the Kushilevitz-Ostrovsky
1463         PIR protocol is reduced from to . 2 An efficient election system
1464         based on homomorphic encryption where voters do not need to include
1465         non-interactive zero knowledge proofs that their ballots are valid.
1466         The election system is proved secure without random oracles but still
1467         efficient. 3 A protocol for universally verifiable computation.},
1468   citeulike-article-id = {2719460},
1469   citeulike-linkout-0 = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg},
1470   journal = {Theory of Cryptography},
1471   keywords = {homomorphic, pairings},
1472   posted-at = {2008-04-25 21:53:15},
1473   priority = {2},
1474   url = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg}
1475 }
1476
1477 @ARTICLE{Bonneau01,
1478   author = {Bonneau, Richard and Baker, David},
1479   title = {AB INITIO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION: Progress and Prospects},
1480   journal = {Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure},
1481   year = {2001},
1482   volume = {30},
1483   pages = {173-189},
1484   number = {1},
1485   doi = {10.1146/annurev.biophys.30.1.173}
1486 }
1487
1488 @ARTICLE{Bowen,
1489   author = {R. Bowen},
1490   title = {Entropy for group endomorphisms and homogeneous spaces},
1491   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1492   year = {1971},
1493   volume = {153},
1494   pages = {401-414},
1495   owner = {guyeux},
1496   timestamp = {15/02/2008}
1497 }
1498
1499 @ARTICLE{Bowen1971,
1500   author = {R. Bowen},
1501   title = {Periodic points and measures for Axiom A diffeomorphisms},
1502   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1503   year = {1971},
1504   volume = {154},
1505   pages = {377-397},
1506   owner = {guyeux},
1507   timestamp = {15/02/2008}
1508 }
1509
1510 @ARTICLE{Braxenthaler97,
1511   author = {Michael Braxenthaler and R. Ron Unger and Ditza Auerbach and John
1512         Moult},
1513   title = {Chaos in protein dynamics},
1514   journal = {Proteins-structure Function and Bioinformatics},
1515   year = {1997},
1516   volume = {29},
1517   pages = {417--425},
1518   doi = {10.1002/(SICI)1097-0134(199712)29:4<417::AID-PROT2>3.3.CO;2-O},
1519   masid = {2824140}
1520 }
1521
1522 @INPROCEEDINGS{Brumley03remotetiming,
1523   author = {David Brumley and Dan Boneh},
1524   title = {Remote Timing Attacks are Practical},
1525   booktitle = {Proceedings of the 12th USENIX Security Symposium},
1526   year = {2003},
1527   pages = {1--14}
1528 }
1529
1530 @ARTICLE{Bohm1991375,
1531   author = {Gerald Böhm},
1532   title = {Protein folding and deterministic chaos: Limits of protein folding
1533         simulations and calculations},
1534   journal = {Chaos, Solitons \& Fractals},
1535   year = {1991},
1536   volume = {1},
1537   pages = {375 - 382},
1538   number = {4},
1539   doi = {DOI: 10.1016/0960-0779(91)90028-8},
1540   issn = {0960-0779},
1541   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TJ4-46CBXVT-1X/2/370489c218e4c2732cd9b620ef50c696}
1542 }
1543
1544 @INCOLLECTION{Cachin2004,
1545   author = {Cachin, Christian},
1546   title = {An Information-Theoretic Model for Steganography},
1547   booktitle = {Information Hiding},
1548   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1549   year = {1998},
1550   volume = {1525},
1551   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1552   pages = {306-318},
1553   affiliation = {MIT Laboratory for Computer Science 545 Technology Square Cambridge
1554         MA 02139 USA}
1555 }
1556
1557 @ARTICLE{Cam2006,
1558   author = {H. Cam and S. Ozdemir and P. Nair and D. Muthuavinashinappan and
1559         H. O. Sanli},
1560   title = {ESPDA: Energy-efficient secure pattern based data aggregation for
1561         wireless sensor networks.},
1562   journal = {Computer Communication journal (29)},
1563   year = {2006},
1564   pages = {446-455}
1565 }
1566
1567 @ARTICLE{CarletCZ98,
1568   author = {Claude Carlet and Pascale Charpin and Victor Zinoviev},
1569   title = {Codes, Bent Functions and Permutations Suitable For DES-like Cryptosystems},
1570   journal = {Des. Codes Cryptography},
1571   year = {1998},
1572   volume = {15},
1573   pages = {125-156},
1574   number = {2},
1575   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de}
1576 }
1577
1578 @INPROCEEDINGS{Castelluccia05efficientaggregation,
1579   author = {Claude Castelluccia},
1580   title = {Efficient aggregation of encrypted data in wireless sensor networks},
1581   booktitle = {MobiQuitous},
1582   year = {2005},
1583   pages = {109--117},
1584   publisher = {IEEE Computer Society}
1585 }
1586
1587 @ARTICLE{Cayre2008,
1588   author = {Cayre, F. and Bas, P.},
1589   title = {Kerckhoffs-Based Embedding Security Classes for WOA Data Hiding},
1590   journal = {IEEE Transactions on Information Forensics and Security},
1591   year = {2008},
1592   volume = {3},
1593   pages = {1--15},
1594   number = {1},
1595   doi = {10.1109/TIFS.2007.916006},
1596   issn = {1556-6013},
1597   keywords = {cryptography, random sequences, spread spectrum communication, telecommunication
1598         security, watermarking, Kerckhoffs-based embedding security classes,
1599         WOA Data Hiding, pseudorandom sequences, spread-spectrum techniques,
1600         steganography security, watermark-only-attack, watermarking, Security,
1601         spread-spectrum (SS) watermarking},
1602   owner = {guyeux},
1603   timestamp = {2009.06.29}
1604 }
1605
1606 @ARTICLE{Cayre2005,
1607   author = {Cayre, F. and Fontaine, C. and Furon, T.},
1608   title = {Watermarking security: theory and practice},
1609   journal = {IEEE Transactions on Signal Processing},
1610   year = {2005},
1611   volume = {53},
1612   pages = {3976--3987},
1613   number = {10},
1614   doi = {10.1109/TSP.2005.855418},
1615   issn = {1053-587X},
1616   keywords = {blind source separation, cryptography, watermarking, Fisher information
1617         matrix, blind source separation, cryptanalysis, information theory,
1618         spread spectrum techniques, substitutive scheme, watermarking security,
1619         Blind source separation, Fisher information matrix, equivocation,
1620         security, watermarking},
1621   owner = {guyeux},
1622   timestamp = {2009.06.29}
1623 }
1624
1625 @ARTICLE{Chajakis91,
1626   author = {Chajakis, Emmanuel D. and Zenios, Stavros A.},
1627   title = {Synchronous and asynchronous implementations of relaxation algorithms
1628         for nonlinear network optimization},
1629   journal = {Parallel Comput.},
1630   year = {1991},
1631   volume = {17},
1632   pages = {873--894},
1633   number = {8},
1634   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1635   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/S0167-8191(05)80072-9},
1636   issn = {0167-8191},
1637   publisher = {Elsevier Science Publishers B. V.}
1638 }
1639
1640 @ARTICLE{Chan2007,
1641   author = {Chan, Haowen and Perrig, Adrian and Przydatek, Bartosz and Song,
1642         Dawn},
1643   title = {SIA: Secure information aggregation in sensor networks},
1644   journal = {J. Comput. Secur.},
1645   year = {2007},
1646   volume = {15},
1647   pages = {69--102},
1648   number = {1},
1649   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1650   issn = {0926-227X},
1651   publisher = {IOS Press}
1652 }
1653
1654 @ARTICLE{Chandramouli06,
1655   author = {R. Chandramouli and S. Bapatla and K.P. Subbalakshmi},
1656   title = {Battery power-aware encryption},
1657   journal = {ACM transactions on information and system security},
1658   year = {2006},
1659   pages = {162--180},
1660   owner = {christophe},
1661   timestamp = {2010.07.31}
1662 }
1663
1664 @ARTICLE{Charpin85,
1665   author = {Pascale Charpin},
1666   title = {A description of some extended cyclic codes with application to Reed-Solomon
1667         codes},
1668   journal = {Discrete Mathematics},
1669   year = {1985},
1670   volume = {56},
1671   pages = {117-124},
1672   number = {2-3},
1673   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1674   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/0012-365X(85)90019-6}
1675 }
1676
1677 @ARTICLE{Chazan69,
1678   author = {D. Chazan and W. Miranker},
1679   title = {Chaotic relaxation},
1680   journal = {Linear algebra and its applications},
1681   year = {1969},
1682   pages = {199-222},
1683   owner = {guyeux},
1684   timestamp = {2008.05.22}
1685 }
1686
1687 @ARTICLE{Cheon2006,
1688   author = {Cheon, Jung Hee and Kim, Woo-Hwan and Nam, Hyun Soo},
1689   title = {Known-plaintext cryptanalysis of the Domingo-Ferrer algebraic privacy
1690         homomorphism scheme},
1691   journal = {Inf. Process. Lett.},
1692   year = {2006},
1693   volume = {97},
1694   pages = {118--123},
1695   number = {3},
1696   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1697   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ipl.2005.09.016},
1698   issn = {0020-0190},
1699   publisher = {Elsevier North-Holland, Inc.}
1700 }
1701
1702 @MISC{Cheon03acryptanalysis,
1703   author = {Jung Hee Cheon and Hyun Soo Nam},
1704   title = {A Cryptanalysis of the Original Domingo-Ferrer's Algebraic Privacy
1705         Homomorphism},
1706   year = {2003}
1707 }
1708
1709 @ARTICLE{Cheung05,
1710   author = {R.C.C. Cheung and N.J. Telle and W. Luk and P.Y.K. Cheung},
1711   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
1712   journal = {IEEE Trans. on Very Large Scale Integration Systems},
1713   year = {2005},
1714   volume = {13},
1715   pages = {1048-1059},
1716   number = {9}
1717 }
1718
1719 @ARTICLE{Chivian2005,
1720   author = {Chivian, Dylan and Kim, David E. and Malmström, Lars and Schonbrun,
1721         Jack and Rohl, Carol A. and Baker, David},
1722   title = {Prediction of CASP6 structures using automated robetta protocols},
1723   journal = {Proteins},
1724   year = {2005},
1725   volume = {61},
1726   pages = {157--166},
1727   number = {S7},
1728   issn = {1097-0134},
1729   keywords = {Rosetta, fragment assembly, de novo modeling, homology modeling, parametric
1730         alignment ensemble},
1731   owner = {christophe},
1732   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
1733   timestamp = {2011.01.22},
1734   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20733}
1735 }
1736
1737 @ARTICLE{Zhu06,
1738   author = {Congxu, Zhu and Xuefeng, Liao and Zhihua, Li},
1739   title = {Chaos-based multipurpose image watermarking algorithm},
1740   journal = {Wuhan University Journal of Natural Sciences},
1741   year = {2006},
1742   volume = {11},
1743   pages = {1675-1678},
1744   note = {10.1007/BF02831848},
1745   abstract = {To achieve the goal of image content authentication and copyright
1746         protection simultaneously, this paper presents a novel image dual
1747         watermarking method based on chaotic map. Firstly, the host image
1748         was split into many nonoverlapping small blocks, and the block-wise
1749         discrete cosine transform (DCT) is computed. Secondly, the robust
1750         watermarks, shuffled by the chaotic sequences, are embedded in the
1751         DC coefficients of blocks to achieve the goal of copyright protection.
1752         The semi-fragile watermarks, generated by chaotic map, are embedded
1753         in the AC coefficients of blocks to obtain the aim of image authentication.
1754         Both of them can be extracted without the original image. Simulation
1755         results demonstrate the effectiveness of our algorithm in terms of
1756         robustness and fragility.},
1757   affiliation = {Central South University School of Information Science and Engineering
1758         410083 Changsha, Hunan China},
1759   issn = {1007-1202},
1760   issue = {6},
1761   keyword = {Mathematics, general},
1762   publisher = {Wuhan University, co-published with Springer},
1763   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF02831848}
1764 }
1765
1766 @ARTICLE{Conley1978,
1767   author = {C. Conley},
1768   title = {Isolated invariant sets and the Morse index},
1769   journal = {CBMS Regional Conference. AMS.},
1770   year = {1978},
1771   optvolume = {38},
1772   owner = {guyeux},
1773   timestamp = {2008.01.02}
1774 }
1775
1776 @ARTICLE{Cornu2002,
1777   author = {Philippe Cornu and André Smolarz},
1778   title = {Image characterization by texture},
1779   journal = {Traitement du signal},
1780   year = {2002},
1781   volume = {19},
1782   pages = {29-35},
1783   file = {:/home/guyeux/Documents/Bibliotheque/These/Watermarking/Caractérisation d'images par textures associées.pdf:PDF},
1784   owner = {guyeux},
1785   timestamp = {2008.05.12}
1786 }
1787
1788 @INPROCEEDINGS{Cox99,
1789   author = {Ingemar Cox and Matt L. Miller and Andrew L. Mckellips},
1790   title = {Watermarking as Communications With Side Information},
1791   booktitle = {Proceedings of the IEEE},
1792   year = {1999},
1793   pages = {1127--1141},
1794   owner = {christophe},
1795   timestamp = {2010.03.06}
1796 }
1797
1798 @ARTICLE{Cox97securespread,
1799   author = {Ingemar J. Cox and Senior Member and Joe Kilian and F. Thomson Leighton
1800         and Talal Shamoon},
1801   title = {Secure spread spectrum watermarking for multimedia},
1802   journal = {IEEE Transactions on Image Processing},
1803   year = {1997},
1804   volume = {6},
1805   pages = {1673--1687}
1806 }
1807
1808 @ARTICLE{Cramer96,
1809   author = {Christopher Cramer and Erol Gelenbe and Hakan Bakircioglu},
1810   title = {Video Compression with Random Neural Networks},
1811   journal = {Neural Networks for Identification, Control, and Robotics, International
1812         Workshop},
1813   year = {1996},
1814   volume = {0},
1815   pages = {0476},
1816   address = {Los Alamitos, CA, USA},
1817   isbn = {0-8186-7456-3},
1818   publisher = {IEEE Computer Society}
1819 }
1820
1821 @INPROCEEDINGS{Crescenzi98,
1822   author = {Crescenzi, Pierluigi and Goldman, Deborah and Papadimitriou, Christos
1823         and Piccolboni, Antonio and Yannakakis, Mihalis},
1824   title = {On the complexity of protein folding (extended abstract)},
1825   booktitle = {Proceedings of the thirtieth annual ACM symposium on Theory of computing},
1826   year = {1998},
1827   series = {STOC '98},
1828   pages = {597--603},
1829   address = {New York, NY, USA},
1830   publisher = {ACM},
1831   acmid = {276875},
1832   isbn = {0-89791-962-9},
1833   location = {Dallas, Texas, United States},
1834   numpages = {7}
1835 }
1836
1837 @ARTICLE{Dawei2004,
1838   author = {Zhao Dawei and Chen Guanrong and Liu Wenbo},
1839   title = {A chaos-based robust wavelet-domain watermarking algorithm},
1840   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
1841   year = {2004},
1842   volume = {22},
1843   pages = {47-54},
1844   owner = {guyeux},
1845   timestamp = {2008.10.07}
1846 }
1847
1848 @MISC{1011.1638,
1849   author = {Anthony Desnos and Robert Erra and Eric Filiol},
1850   title = {Processor-Dependent Malware... and codes},
1851   year = {2010},
1852   comment = {arXiv:1011.1638},
1853   eprint = {arXiv:1011.1638}
1854 }
1855
1856 @BOOK{devaney,
1857   title = {An Introduction to Chaotic Dynamical Systems},
1858   publisher = {Addison-Wesley},
1859   year = {1989},
1860   author = {Devaney, Robert L.},
1861   address = {Redwood City, CA},
1862   edition = {2nd}
1863 }
1864
1865 @ARTICLE{diffie76,
1866   author = {Whitfield Diffie and Martin E. Hellman},
1867   title = {New Directions in Cryptography},
1868   journal = {IEEE Transactions on Information Theory},
1869   year = {1976},
1870   volume = {IT-22},
1871   pages = {644--654},
1872   number = {6},
1873   date = {November 1976},
1874   owner = {guyeux},
1875   timestamp = {2009.06.30},
1876   url = {citeseer.ist.psu.edu/diffie76new.html}
1877 }
1878
1879 @INCOLLECTION{Dijk10,
1880   author = {van Dijk, Marten and Gentry, Craig and Halevi, Shai and Vaikuntanathan,
1881         Vinod},
1882   title = {Fully Homomorphic Encryption over the Integers},
1883   booktitle = {Advances in Cryptology – EUROCRYPT 2010},
1884   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1885   year = {2010},
1886   editor = {Gilbert, Henri},
1887   volume = {6110},
1888   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1889   pages = {24-43},
1890   abstract = {We construct a simple fully homomorphic encryption scheme, using only
1891         elementary modular arithmetic. We use Gentry’s technique to construct
1892         a fully homomorphic scheme from a bootstrappable somewhat homomorphic
1893         scheme. However, instead of using ideal lattices over a polynomial
1894         ring, our bootstrappable encryption scheme merely uses addition and
1895         multiplication over the integers. The main appeal of our scheme is
1896         the conceptual simplicity. We reduce the security of our scheme to
1897         finding an approximate integer gcd – i.e., given a list of integers
1898         that are near-multiples of a hidden integer, output that hidden integer.
1899         We investigate the hardness of this task, building on earlier work
1900         of Howgrave-Graham.},
1901   affiliation = {MIT CSAIL}
1902 }
1903
1904 @ARTICLE{Dill1985,
1905   author = {Dill, KA},
1906   title = {Theory for the folding and stability of globular proteins.},
1907   journal = {Biochemistry},
1908   year = {1985},
1909   volume = {24},
1910   pages = {1501-9--},
1911   number = {6},
1912   month = mar,
1913   abstract = {Using lattice statistical mechanics, we develop theory to account
1914         for the folding of a heteropolymer molecule such as a protein to
1915         the globular and soluble state. Folding is assumed to be driven by
1916         the association of solvophobic monomers to avoid solvent and opposed
1917         by the chain configurational entropy. Theory predicts a phase transition
1918         as a function of temperature or solvent character. Molecules that
1919         are too short or too long or that have too few solvophobic residues
1920         are predicted not to fold. Globular molecules should have a largely
1921         solvophobic core, but there is an entropic tendency for some residues
1922         to be "out of place", particularly in small molecules. For long chains,
1923         molecules comprised of globular domains are predicted to be thermodynamically
1924         more stable than spherical molecules. The number of accessible conformations
1925         in the globular state is calculated to be an exceedingly small fraction
1926         of the number available to the random coil. Previous estimates of
1927         this number, which have motivated kinetic theories of folding, err
1928         by many tens of orders of magnitude.},
1929   comment = {Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
1930   keywords = {Mathematics, Models, Chemical, Polymers, Protein Conformation},
1931   owner = {christophe},
1932   timestamp = {2011.01.22},
1933   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/3986190}
1934 }
1935
1936 @ARTICLE{Dill1995,
1937   author = {Dill, KA and Bromberg, S and Yue, K and Fiebig, KM and Yee, DP and
1938         Thomas, PD and Chan, HS},
1939   title = {Principles of protein folding--a perspective from simple exact models.},
1940   journal = {Protein Sci},
1941   year = {1995},
1942   volume = {4},
1943   pages = {561-602--},
1944   number = {4},
1945   month = apr,
1946   abstract = {General principles of protein structure, stability, and folding kinetics
1947         have recently been explored in computer simulations of simple exact
1948         lattice models. These models represent protein chains at a rudimentary
1949         level, but they involve few parameters, approximations, or implicit
1950         biases, and they allow complete explorations of conformational and
1951         sequence spaces. Such simulations have resulted in testable predictions
1952         that are sometimes unanticipated: The folding code is mainly binary
1953         and delocalized throughout the amino acid sequence. The secondary
1954         and tertiary structures of a protein are specified mainly by the
1955         sequence of polar and nonpolar monomers. More specific interactions
1956         may refine the structure, rather than dominate the folding code.
1957         Simple exact models can account for the properties that characterize
1958         protein folding: two-state cooperativity, secondary and tertiary
1959         structures, and multistage folding kinetics--fast hydrophobic collapse
1960         followed by slower annealing. These studies suggest the possibility
1961         of creating "foldable" chain molecules other than proteins. The encoding
1962         of a unique compact chain conformation may not require amino acids;
1963         it may require only the ability to synthesize specific monomer sequences
1964         in which at least one monomer type is solvent-averse.},
1965   address = {Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California,
1966         San Francisco 94143-1204, USA.},
1967   comment = {Review,Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't,
1968         Non-P.H.S.,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
1969   keywords = {Amino Acid Sequence, Biological Evolution, Hydrogen Bonding, Models,
1970         Molecular, Molecular Sequence Data, Mutation, Protein Conformation,
1971         Protein Denaturation, Protein Folding, Temperature, Thermodynamics},
1972   owner = {christophe},
1973   timestamp = {2011.01.22},
1974   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/7613459}
1975 }
1976
1977 @INPROCEEDINGS{Dobbertin96,
1978   author = {Dobbertin, Hans},
1979   title = {Cryptanalysis of MD4},
1980   booktitle = {Proceedings of the Third International Workshop on Fast Software
1981         Encryption},
1982   year = {1996},
1983   pages = {53--69},
1984   address = {London, UK},
1985   publisher = {Springer-Verlag},
1986   isbn = {3-540-60865-6}
1987 }
1988
1989 @INPROCEEDINGS{DomingoFerrer2002,
1990   author = {Domingo-Ferrer, Josep},
1991   title = {A Provably Secure Additive and Multiplicative Privacy Homomorphism},
1992   booktitle = {ISC '02: Proceedings of the 5th International Conference on Information
1993         Security},
1994   year = {2002},
1995   pages = {471--483},
1996   address = {London, UK},
1997   publisher = {Springer-Verlag},
1998   isbn = {3-540-44270-7}
1999 }
2000
2001 @ARTICLE{Dubchak1995,
2002   author = {I. Dubchak and I. Muchnik and S. R. Holbrook and S. H. Kim},
2003   title = {Prediction of protein folding class using global description of amino
2004         acid sequence.},
2005   journal = {Proc Natl Acad Sci U S A},
2006   year = {1995},
2007   volume = {92},
2008   pages = {8700--8704},
2009   number = {19},
2010   month = {Sep},
2011   __markedentry = {[guyeux]},
2012   abstract = {We present a method for predicting protein folding class based on
2013         global protein chain description and a voting process. Selection
2014         of the best descriptors was achieved by a computer-simulated neural
2015         network trained on a data base consisting of 83 folding classes.
2016         Protein-chain descriptors include overall composition, transition,
2017         and distribution of amino acid attributes, such as relative hydrophobicity,
2018         predicted secondary structure, and predicted solvent exposure. Cross-validation
2019         testing was performed on 15 of the largest classes. The test shows
2020         that proteins were assigned to the correct class (correct positive
2021         prediction) with an average accuracy of 71.7\%, whereas the inverse
2022         prediction of proteins as not belonging to a particular class (correct
2023         negative prediction) was 90-95\% accurate. When tested on 254 structures
2024         used in this study, the top two predictions contained the correct
2025         class in 91\% of the cases.},
2026   institution = {Department of Chemistry, University of California, Berkeley 94720,
2027         USA.},
2028   keywords = {Amino Acid Sequence; Amino Acids, chemistry; Computer Simulation;
2029         Databases, Factual; Models, Chemical; Neural Networks (Computer);
2030         Protein Folding; Protein Structure, Secondary; Proteins, chemistry/classification;
2031         Reproducibility of Results; Solvents},
2032   language = {eng},
2033   medline-pst = {ppublish},
2034   owner = {guyeux},
2035   pmid = {7568000},
2036   timestamp = {2011.07.18}
2037 }
2038
2039 @BOOK{Dudley,
2040   title = {Real analysis and probability},
2041   publisher = {Cambridge University Press},
2042   author = {Richard M. Dudley},
2043   optpages = {209},
2044   owner = {guyeux},
2045   timestamp = {2008.01.02}
2046 }
2047
2048 @ARTICLE{Tarazi84,
2049   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2050   title = {Algorithmes mixtes asynchrones. Etude de convergence monotone},
2051   journal = {Numerische Mathematik},
2052   year = {1984},
2053   volume = {44},
2054   pages = {363-369},
2055   note = {10.1007/BF01405568},
2056   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2057         Box 5969 Kuwait},
2058   issn = {0029-599X},
2059   issue = {3},
2060   keyword = {Mathematics and Statistics},
2061   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2062   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01405568}
2063 }
2064
2065 @ARTICLE{Tarazi82,
2066   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2067   title = {Some convergence results for asynchronous algorithms},
2068   journal = {Numerische Mathematik},
2069   year = {1982},
2070   volume = {39},
2071   pages = {325-340},
2072   note = {10.1007/BF01407866},
2073   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2074         Box 5969 Kuwait Kuwait},
2075   issn = {0029-599X},
2076   issue = {3},
2077   keyword = {Mathematics and Statistics},
2078   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2079   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01407866}
2080 }
2081
2082 @ARTICLE{Fei2005,
2083   author = {Peng Fei and Qiu Shui-Sheng and Long Min},
2084   title = {A secure digital signature algorithm based on elliptic curve and
2085         chaotic mappings},
2086   journal = {Circuits Systems Signal Processing},
2087   year = {2005},
2088   volume = {24, No. 5},
2089   pages = {585--597},
2090   owner = {guyeux},
2091   timestamp = {2009.01.16}
2092 }
2093
2094 @BOOK{Feigenbaum1908,
2095   title = {Universal behavior in nonlinear systems},
2096   publisher = {Los Alamos Science},
2097   year = {1908},
2098   author = {Feigenbaum},
2099   owner = {guyeux},
2100   timestamp = {2008.01.02}
2101 }
2102
2103 @ARTICLE{Felsenstein1980,
2104   author = {J. Felsenstein},
2105   title = {A view of population genetics.},
2106   journal = {Science},
2107   year = {1980},
2108   volume = {208},
2109   pages = {1253},
2110   number = {4449},
2111   month = {Jun},
2112   doi = {10.1126/science.208.4449.1253},
2113   language = {eng},
2114   medline-pst = {ppublish},
2115   owner = {guyeux},
2116   pii = {208/4449/1253},
2117   pmid = {17830806},
2118   timestamp = {2011.05.05},
2119   url = {http://dx.doi.org/10.1126/science.208.4449.1253}
2120 }
2121
2122 @BOOK{Filiol09,
2123   title = {Les virus informatiques : techniques virales et antivirales avancées},
2124   year = {2009},
2125   editor = {Springer},
2126   author = {Eric Filiol},
2127   owner = {christophe},
2128   timestamp = {2010.10.13}
2129 }
2130
2131 @INPROCEEDINGS{FiliolBlackHat,
2132   author = {Eric Filiol},
2133   title = {Passive and Active Leakage of Secret Data from Non Networked Computer},
2134   booktitle = {Black Hat},
2135   year = {2008},
2136   owner = {christophe},
2137   timestamp = {2010.11.28}
2138 }
2139
2140 @PHDTHESIS{Formenti2003,
2141   author = {Enrico Formenti},
2142   title = {De l'algorithmique du chaos dans les systèmes dynamiques discrets},
2143   school = {Université de Provence},
2144   year = {2003},
2145   owner = {guyeux},
2146   timestamp = {2008.01.02}
2147 }
2148
2149 @PHDTHESIS{Formenti1998,
2150   author = {Enrico Formenti},
2151   title = {Automates cellulaires et chaos : de la vision topologique à la vision
2152         algorithmique},
2153   school = {\'Ecole Normale Supérieure de Lyon},
2154   year = {1998},
2155   optmonth = {Octobre},
2156   owner = {guyeux},
2157   timestamp = {2008.01.02}
2158 }
2159
2160 @ARTICLE{Frey2006,
2161   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2162   title = {Identification of circular codes in bacterial genomes and their use
2163         in a factorization method for retrieving the reading frames of genes.},
2164   journal = {Comput Biol Chem},
2165   year = {2006},
2166   volume = {30},
2167   pages = {87--101},
2168   number = {2},
2169   month = {Apr},
2170   abstract = {We developed a statistical method that allows each trinucleotide to
2171         be associated with a unique frame among the three possible ones in
2172         a (protein coding) gene. An extensive gene study in 175 complete
2173         bacterial genomes based on this statistical approach resulted in
2174         identification of 72 new circular codes. Finding a circular code
2175         enables an immediate retrieval of the reading frame locally anywhere
2176         in a gene. No knowledge of location of the start codon is required
2177         and a short window of only a few nucleotides is sufficient for automatic
2178         retrieval. We have therefore developed a factorization method (that
2179         explores previously found circular codes) for retrieving the reading
2180         frames of bacterial genes. Its principle is new and easy to understand.
2181         Neither complex treatment nor specific information on the nucleotide
2182         sequences is necessary. Moreover, the method can be used for short
2183         regions in nucleotide sequences (less than 25 nucleotides in protein
2184         coding genes). Selected additional properties of circular codes and
2185         their possible biological consequences are also discussed.},
2186   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001},
2187   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2188         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2189         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2190   keywords = {Base Sequence; Computational Biology; Genes, Bacterial; Genome, Bacterial;
2191         Genomics, statistics /&/ numerical data; Models, Genetic; Models,
2192         Statistical; Reading Frames},
2193   language = {eng},
2194   medline-pst = {ppublish},
2195   owner = {guyeux},
2196   pii = {S1476-9271(05)00111-8},
2197   pmid = {16439185},
2198   timestamp = {2011.05.05},
2199   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001}
2200 }
2201
2202 @ARTICLE{Frey2006a,
2203   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2204   title = {An analytical model of gene evolution with six mutation parameters:
2205         an application to archaeal circular codes.},
2206   journal = {Comput Biol Chem},
2207   year = {2006},
2208   volume = {30},
2209   pages = {1--11},
2210   number = {1},
2211   month = {Feb},
2212   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
2213         mutation matrix 64 x 64 with six substitution parameters associated
2214         with the transitions and transversions in the three trinucleotide
2215         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
2216         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
2217         x 64 with three parameters. It determines at some time t the exact
2218         occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly according
2219         to six substitution parameters. An application of this model allows
2220         an evolutionary study of the common circular code COM and the 15
2221         archaeal circular codes X which have been recently identified in
2222         several archaeal genomes. The main property of a circular code is
2223         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
2224         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
2225         with a window of a few nucleotides. In genes, the circular code is
2226         superimposed on the traditional genetic one. Very unexpectedly, the
2227         evolutionary model demonstrates that the archaeal circular codes
2228         can derive from the common circular code subjected to random substitutions
2229         with particular values for six substitutions parameters. It has a
2230         strong correlation with the statistical observations of three archaeal
2231         codes in actual genes. Furthermore, the properties of these substitution
2232         rates allow proposal of an evolutionary classification of the 15
2233         archaeal codes into three main classes according to this model. In
2234         almost all the cases, they agree with the actual degeneracy of the
2235         genetic code with substitutions more frequent in the third trinucleotide
2236         site and with transitions more frequent that transversions in any
2237         trinucleotide site.},
2238   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001},
2239   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2240         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2241         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2242   keywords = {Archaea, genetics; DNA, Circular; Evolution, Molecular; Genetic Code;
2243         Genome, Archaeal; Models, Genetic; Mutation; Trinucleotide Repeats},
2244   language = {eng},
2245   medline-pst = {ppublish},
2246   owner = {guyeux},
2247   pii = {S1476-9271(05)00083-6},
2248   pmid = {16324886},
2249   timestamp = {2011.05.05},
2250   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001}
2251 }
2252
2253 @INPROCEEDINGS{fgb11:ip,
2254   author = {Friot, Nicolas and Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2255   title = {Chaotic Iterations for Steganography - Stego-security and chaos-security},
2256   booktitle = {SECRYPT'2011, Int. Conf. on Security and Cryptography},
2257   year = {2011},
2258   pages = {***--***},
2259   address = {Sevilla, Spain},
2260   month = jul,
2261   note = {To appear},
2262   classement = {ACTI},
2263   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2264   equipe = {and},
2265   inhal = {no}
2266 }
2267
2268 @MISC{Frisch,
2269   author = {Alain Frisch},
2270   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2271   year = {1998},
2272   note = {Rapport de tipe},
2273   file = {Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:Chaos/Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:PDF},
2274   keywords = {Chaos, Entropie Topologique, Tipe},
2275   owner = {guyeux},
2276   timestamp = {2008.01.02},
2277   url = {http://alain.frisch.fr/math.html}
2278 }
2279
2280 @MISC{Frisch98,
2281   author = {Alain Frisch},
2282   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2283   year = {1998},
2284   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2285   url = {\url{http://alain.frisch.fr/math.html}}
2286 }
2287
2288 @ARTICLE{Frommer97asynchronousweighted,
2289   author = {Andreas Frommer and Hartmut Schwandt and Daniel and Daniel B. Szyld},
2290   title = {Asynchronous Weighted Additive Schwarz Methods},
2291   journal = {Electronic Transactions on Numerical Analysis},
2292   year = {1997},
2293   volume = {5},
2294   pages = {48--61}
2295 }
2296
2297 @MISC{Frommer94asynchronoustwo-stage,
2298   author = {Andreas Frommer and Daniel B. Szyld},
2299   title = {Asynchronous Two-Stage Iterative Methods},
2300   year = {1994}
2301 }
2302
2303 @BOOK{J1992,
2304   title = {Introduction to Chaos and Coherence},
2305   publisher = {IOP Publishing},
2306   year = {1992},
2307   author = {J. Frøyland},
2308   owner = {guyeux},
2309   timestamp = {2008.01.02}
2310 }
2311
2312 @MISC{Furon2002,
2313   author = {T. Furon},
2314   title = {Security analysis},
2315   year = {2002},
2316   note = {European Project IST-1999-10987 CERTIMARK, Deliverable D.5.5},
2317   owner = {guyeux},
2318   timestamp = {2009.06.30}
2319 }
2320
2321 @ARTICLE{Furon08,
2322   author = {Furon, Teddy and Bas, Patrick},
2323   title = {Broken arrows},
2324   journal = {EURASIP J. Inf. Secur.},
2325   year = {2008},
2326   volume = {2008},
2327   pages = {1--13},
2328   address = {New York, NY, United States},
2329   doi = {http://dx.doi.org/10.1155/2008/597040},
2330   issn = {1687-4161},
2331   owner = {christophe},
2332   publisher = {Hindawi Publishing Corp.},
2333   timestamp = {2010.03.06}
2334 }
2335
2336 @ARTICLE{P1150442004,
2337   author = {G.S.El-Taweel and H.M. Onsi and M.Samy and M.G. Darwish},
2338   title = {Secure and Non-Blind Watermarking Scheme for Color Images Based on
2339         DWT},
2340   journal = {ICGST International Journal on Graphics, Vision and Image Processing},
2341   year = {2005},
2342   volume = {05},
2343   pages = {1--5},
2344   month = {April},
2345   issue = {4},
2346   owner = {christophe},
2347   timestamp = {2010.03.07}
2348 }
2349
2350 @INPROCEEDINGS{Gentry09,
2351   author = {Gentry, Craig},
2352   title = {Fully homomorphic encryption using ideal lattices},
2353   booktitle = {STOC '09: Proceedings of the 41st annual ACM symposium on Theory
2354         of computing},
2355   year = {2009},
2356   pages = {169--178},
2357   address = {New York, NY, USA},
2358   publisher = {ACM},
2359   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1536414.1536440},
2360   isbn = {978-1-60558-506-2},
2361   location = {Bethesda, MD, USA}
2362 }
2363
2364 @INPROCEEDINGS{Girao04,
2365   author = {J. Girao and M. Schneider and D. Westhoff},
2366   title = {CDA: Concealed data aggregation in wireless sensor networks},
2367   booktitle = {Proceedings of the ACM Workshop on Wireless Security},
2368   year = {2004},
2369   owner = {christophe},
2370   timestamp = {2010.07.31}
2371 }
2372
2373 @CONFERENCE{Gotsman88,
2374   author = {C. Gotsman and D. Lehmann and E. Shamir},
2375   title = {Asynchronous Dynamics of Random Boolean Networks},
2376   booktitle = {San Diego '88 Neural Networks Conference},
2377   year = {1988},
2378   owner = {guyeux},
2379   timestamp = {30/03/2008}
2380 }
2381
2382 @ARTICLE{Guckenheimer1979,
2383   author = {J. Guckenheimer},
2384   title = {Sensitive dependence to initial conditions for one-dimensional maps},
2385   journal = {Comm. Math. Phys.},
2386   year = {1979},
2387   optpages = {133-160},
2388   owner = {guyeux},
2389   timestamp = {2008.01.02}
2390 }
2391
2392 @BOOK{J.1983,
2393   title = {Nonlinear oscillations, dynamical systems, and bifurcations of vector
2394         fields},
2395   publisher = {Springer Verlag},
2396   year = {1983},
2397   author = {J. Guckenheimer and P. Holmes},
2398   owner = {guyeux},
2399   timestamp = {2008.01.02}
2400 }
2401
2402 @ARTICLE{Guo20093201,
2403   author = {Wei Guo and Xiaoming Wang and Dake He and Yang Cao},
2404   title = {Cryptanalysis on a parallel keyed hash function based on chaotic
2405         maps},
2406   journal = {Physics Letters A},
2407   year = {2009},
2408   volume = {373},
2409   pages = {3201 - 3206},
2410   number = {36},
2411   abstract = {This Letter analyzes the security of a novel parallel keyed hash function
2412         based on chaotic maps, proposed by Xiao et al. to improve the efficiency
2413         in parallel computing environment. We show how to devise forgery
2414         attacks on Xiao's scheme with differential cryptanalysis and give
2415         the experiment results of two kinds of forgery attacks firstly. Furthermore,
2416         we discuss the problem of weak keys in the scheme and demonstrate
2417         how to utilize weak keys to construct collision.},
2418   issn = {0375-9601},
2419   keywords = {Cryptanalysis}
2420 }
2421
2422 @PHDTHESIS{GuyeuxThese10,
2423   author = {Christophe Guyeux},
2424   title = {Le d\'{e}sordre des it\'{e}rations chaotiques et leur utilit\'{e}
2425         en s\'{e}curit\'{e} informatique},
2426   school = {Universit\'{e} de Franche-Comt\'{e}},
2427   year = {2010},
2428   owner = {christophe},
2429   timestamp = {2010.12.21}
2430 }
2431
2432 @MISC{gb11:onp,
2433   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2434   title = {\'Etude topologique de l'\'etalement de spectre},
2435   howpublished = {Journ\'ees Codes et St\'eganographie, \'Ecoles Militaires de Saint-Cyr,
2436         Co\"etquidan},
2437   month = jan,
2438   year = {2011},
2439   classement = {COM},
2440   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2441   equipe = {and},
2442   inhal = {no}
2443 }
2444
2445 @INPROCEEDINGS{bg10:ip,
2446   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2447   title = {An improved watermarking algorithm for Internet applications},
2448   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
2449   year = {2010},
2450   pages = {119--124},
2451   address = {Valencia, Spain},
2452   month = sep,
2453   classement = {ACTI},
2454   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2455   equipe = {and},
2456   inhal = {no}
2457 }
2458
2459 @INPROCEEDINGS{gfb10:ip,
2460   author = {Guyeux, Christophe and Friot, Nicolas and Bahi, Jacques},
2461   title = {Chaotic iterations versus Spread-spectrum: chaos and stego security},
2462   booktitle = {IIH-MSP'10, 6-th Int. Conf. on Intelligent Information Hiding and
2463         Multimedia Signal Processing},
2464   year = {2010},
2465   pages = {208--211},
2466   address = {Darmstadt, Germany},
2467   month = oct,
2468   classement = {ACTI},
2469   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2470   equipe = {and},
2471   inhal = {no}
2472 }
2473
2474 @ARTICLE{friot10,
2475   author = {Christophe Guyeux and Nicolas Friot and Jacques M. Bahi},
2476   title = {A more secure information hiding scheme than spread-spectrum obtained
2477         by chaos-security},
2478   journal = {arXiv 0032565},
2479   year = {2010},
2480   owner = {guyeux},
2481   timestamp = {2010.04.30}
2482 }
2483
2484 @BOOK{ECC,
2485   title = {Guide to Elliptic Curve Cryptography},
2486   publisher = {Springer Professional Computing},
2487   year = {2004},
2488   editor = {Springer},
2489   author = {D. Hankerson and A. Menezes and S. Vanstone},
2490   owner = {christophe},
2491   timestamp = {2010.07.31}
2492 }
2493
2494 @ARTICLE{Hasegawa1985,
2495   author = {M. Hasegawa and H. Kishino and T. Yano},
2496   title = {Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial
2497         DNA.},
2498   journal = {J Mol Evol},
2499   year = {1985},
2500   volume = {22},
2501   pages = {160--174},
2502   number = {2},
2503   abstract = {A new statistical method for estimating divergence dates of species
2504         from DNA sequence data by a molecular clock approach is developed.
2505         This method takes into account effectively the information contained
2506         in a set of DNA sequence data. The molecular clock of mitochondrial
2507         DNA (mtDNA) was calibrated by setting the date of divergence between
2508         primates and ungulates at the Cretaceous-Tertiary boundary (65 million
2509         years ago), when the extinction of dinosaurs occurred. A generalized
2510         least-squares method was applied in fitting a model to mtDNA sequence
2511         data, and the clock gave dates of 92.3 +/- 11.7, 13.3 +/- 1.5, 10.9
2512         +/- 1.2, 3.7 +/- 0.6, and 2.7 +/- 0.6 million years ago (where the
2513         second of each pair of numbers is the standard deviation) for the
2514         separation of mouse, gibbon, orangutan, gorilla, and chimpanzee,
2515         respectively, from the line leading to humans. Although there is
2516         some uncertainty in the clock, this dating may pose a problem for
2517         the widely believed hypothesis that the pipedal creature Australopithecus
2518         afarensis, which lived some 3.7 million years ago at Laetoli in Tanzania
2519         and at Hadar in Ethiopia, was ancestral to man and evolved after
2520         the human-ape splitting. Another likelier possibility is that mtDNA
2521         was transferred through hybridization between a proto-human and a
2522         proto-chimpanzee after the former had developed bipedalism.},
2523   keywords = {Animals; Biological Evolution; DNA, Mitochondrial, genetics; Genes;
2524         Haplorhini, genetics; Humans; Mathematics; Models, Genetic; Nucleic
2525         Acid Hybridization; Primates, genetics; Proteins, genetics; Species
2526         Specificity},
2527   language = {eng},
2528   medline-pst = {ppublish},
2529   owner = {guyeux},
2530   pmid = {3934395},
2531   timestamp = {2011.05.05}
2532 }
2533
2534 @BOOK{R1994,
2535   title = {A First Course in Discrete Dynamical Systems},
2536   publisher = {Springer-Verlag},
2537   year = {1994},
2538   author = {R. Homlgren},
2539   optpages = {106},
2540   owner = {guyeux},
2541   timestamp = {2008.01.02}
2542 }
2543
2544 @INCOLLECTION{Hoque09,
2545   author = {Hoque, Md. and Chetty, Madhu and Sattar, Abdul},
2546   title = {Genetic Algorithm in Ab Initio Protein Structure Prediction Using
2547         Low Resolution Model: A Review},
2548   booktitle = {Biomedical Data and Applications},
2549   publisher = {Springer Berlin Heidelberg},
2550   year = {2009},
2551   editor = {Sidhu, Amandeep and Dillon, Tharam},
2552   volume = {224},
2553   series = {Studies in Computational Intelligence},
2554   pages = {317-342},
2555   affiliation = {IIIS, Griffith University, Nathan, QLD-4111 Australia}
2556 }
2557
2558 @CONFERENCE{Houmansadr09,
2559   author = {A. Houmansadr and N. Kiyavash and N. Borisov},
2560   title = {Rainbow: A robust and invisible non-blind watermark for network flows},
2561   booktitle = {NDSS’09: 16th Annual Network and Distributed System Security Symposium},
2562   year = {2009},
2563   owner = {christophe},
2564   timestamp = {2010.03.07}
2565 }
2566
2567 @ARTICLE{Huang,
2568   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J.},
2569   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2570   journal = {Wireless Networks},
2571   abstract = {Abstract\&nbsp;\&nbsp;This paper proposes a secure encrypted-data
2572         aggregation scheme for wireless sensor networks. Our design for data
2573         aggregation eliminates redundant sensor readings without using encryption
2574         and maintains data secrecy and privacy during transmission. Conventional
2575         aggregation functions operate when readings are received in plaintext.
2576         If readings are encrypted, aggregation requires decryption creating
2577         extra overhead and key management issues. In contrast to conventional
2578         schemes, our proposed scheme provides security and privacy, and duplicate
2579         instances of original readings will be aggregated into a single packet.
2580         Our scheme is resilient to known-plaintext attacks, chosen-plaintext
2581         attacks, ciphertext-only attacks and man-in-the-middle attacks. Our
2582         experiments show that our proposed aggregation method significantly
2583         reduces communication overhead and can be practically implemented
2584         in on-the-shelf sensor platforms.},
2585   citeulike-article-id = {4499496},
2586   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2587   citeulike-linkout-1 = {http://www.springerlink.com/content/g573138072642u63},
2588   doi = {10.1007/s11276-009-0177-y},
2589   posted-at = {2009-05-10 09:55:44},
2590   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y}
2591 }
2592
2593 @ARTICLE{Huang10,
2594   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J. D.},
2595   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2596   journal = {Wirel. Netw.},
2597   year = {2010},
2598   volume = {16},
2599   pages = {915--927},
2600   number = {4},
2601   address = {Hingham, MA, USA},
2602   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2603   issn = {1022-0038},
2604   publisher = {Kluwer Academic Publishers}
2605 }
2606
2607 @ARTICLE{W.2001,
2608   author = {W. Huang and X. Ye},
2609   title = {Homeomorphisms with the whole compacta being scrambled sets},
2610   journal = {Ergod. Th. Dynam. Systems},
2611   year = {2001},
2612   optnumber = {1},
2613   optpages = {77-91},
2614   optvolume = {21},
2615   owner = {guyeux},
2616   timestamp = {2008.01.02}
2617 }
2618
2619 @ARTICLE{Hurley1982,
2620   author = {M. Hurley},
2621   title = {Attractors, persistence and density of their bassin},
2622   journal = {Transactions of AMS},
2623   year = {1982},
2624   optpages = {247-271},
2625   optvolume = {269},
2626   owner = {guyeux},
2627   timestamp = {2008.01.02}
2628 }
2629
2630 @INPROCEEDINGS{Islam:2009:NMA:1695134.1695181,
2631   author = {Islam, Md. Kamrul and Chetty, Madhu},
2632   title = {Novel Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction},
2633   booktitle = {Proceedings of the 22nd Australasian Joint Conference on Advances
2634         in Artificial Intelligence},
2635   year = {2009},
2636   series = {AI '09},
2637   pages = {412--421},
2638   address = {Berlin, Heidelberg},
2639   publisher = {Springer-Verlag},
2640   acmid = {1695181},
2641   isbn = {978-3-642-10438-1},
2642   keywords = {Guided search space, Memetic Algorithm, Modified fitness function,
2643         Pair-wise-interchange, Schema preservation, Tabu Search},
2644   location = {Melbourne, Australia},
2645   numpages = {10}
2646 }
2647
2648 @PHDTHESIS{Jacquemard77,
2649   author = {C. Jacquemard},
2650   title = {Contribution à l'étude d'algorithmes à convergence monotone},
2651   school = {Université de Franche-Comté},
2652   year = {1977},
2653   owner = {christophe},
2654   timestamp = {2010.08.25}
2655 }
2656
2657 @BOOK{Jukes69,
2658   title = {{Evolution of Protein Molecules}},
2659   publisher = {Academy Press},
2660   year = {1969},
2661   editor = {Munro, H. N.},
2662   author = {Jukes, T. H. and Cantor, C. R.},
2663   booktitle = {Evolution of Protein Molecules},
2664   citeulike-article-id = {1673661},
2665   keywords = {compbio, fresco},
2666   posted-at = {2007-09-19 06:23:18},
2667   priority = {2}
2668 }
2669
2670 @INPROCEEDINGS{Kalker2001,
2671   author = {Kalker, T.},
2672   title = {Considerations on watermarking security},
2673   year = {2001},
2674   pages = {201--206},
2675   abstract = {In this paper we address the usually implicit assumption that digital
2676         watermarking has as its main target copyright and copy protection
2677         applications. From these target applications a great many conclusions
2678         are drawn about the required security of a watermarking system, and
2679         in fact, a considerably percentage of the watermarking literature
2680         has this very topic as its main focus of attention. In this paper
2681         we take a step back, and try to do a more careful analysis of the
2682         'watermarking-is-for-security-applications' paradigm. The intention
2683         of this paper is to discuss the meaning of the concept security in
2684         the context of watermarking, and try to show that one has to be careful
2685         in using analogies from the related field of cryptography},
2686   citeulike-article-id = {1226513},
2687   journal = {2001 IEEE Fourth Workshop on Multimedia Signal Processing},
2688   keywords = {security, wateramarking},
2689   owner = {guyeux},
2690   posted-at = {2007-04-14 14:30:06},
2691   priority = {2},
2692   timestamp = {2009.06.30}
2693 }
2694
2695 @ARTICLE{Kerckhoffs83,
2696   author = {Kerckhoffs, Auguste},
2697   title = {La cryptographie militaire},
2698   journal = {Journal des sciences militaires},
2699   year = {1883},
2700   volume = {IX},
2701   pages = {5--83},
2702   month = {January},
2703   abstract = {pp. 161–191, Feb. 1883.},
2704   citeulike-article-id = {505508},
2705   keywords = {cryptography, master},
2706   owner = {guyeux},
2707   posted-at = {2006-02-15 04:49:15},
2708   priority = {2},
2709   timestamp = {2009.06.30}
2710 }
2711
2712 @ARTICLE{Kimura80,
2713   author = {Kimura, Motoo},
2714   title = {A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions
2715         through comparative studies of nucleotide sequences},
2716   journal = {Journal of Molecular Evolution},
2717   year = {1980},
2718   volume = {16},
2719   pages = {111-120},
2720   note = {10.1007/BF01731581},
2721   affiliation = {National Institute of Genetics 411 Mishima Japan},
2722   issn = {0022-2844},
2723   issue = {2},
2724   keyword = {Biomedical and Life Sciences},
2725   publisher = {Springer New York},
2726   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01731581}
2727 }
2728
2729 @ARTICLE{Knudsen94,
2730   author = {Knudsen},
2731   title = {Chaos Without Nonperiodicity},
2732   journal = {Amer. Math. Monthly},
2733   year = {1994},
2734   volume = {101},
2735   owner = {guyeux},
2736   timestamp = {27/01/2008}
2737 }
2738
2739 @PHDTHESIS{Knudsen1994a,
2740   author = {C. Knudsen},
2741   title = {Aspects of noninvertible dynamics and chaos},
2742   school = {Technical University of Denmark},
2743   year = {1994},
2744   owner = {guyeux},
2745   timestamp = {2008.01.02}
2746 }
2747
2748 @ARTICLE{Kocarev06,
2749   author = {L. Kocarev and J. Szczepanski and J.M. Amigo and I. Tomovski},
2750   title = {Discrete Chaos - I: Theory},
2751   journal = {IEEE Trans. on Circuits Systems},
2752   year = {2006},
2753   volume = {53},
2754   pages = {1300-1309},
2755   owner = {christophe},
2756   timestamp = {2010.10.10}
2757 }
2758
2759 @INPROCEEDINGS{Kocher95cryptanalysisof,
2760   author = {Paul C. Kocher},
2761   title = {Cryptanalysis of Diffie-Hellman, RSA, DSS, and Other Systems Using
2762         Timing Attacks (Extended Abstract)},
2763   booktitle = {Advances in Cryptology, CRYPTO '95: 15th Annual International Cryptology
2764         Conference},
2765   year = {1995},
2766   pages = {27--31},
2767   publisher = {Springer-Verlag}
2768 }
2769
2770 @ARTICLE{Kullback1951,
2771   author = {Kullback, Solomon and Leibler, Richard A.},
2772   title = {On Information and Sufficiency},
2773   journal = {The Annals of Mathematical Statistics},
2774   year = {1951},
2775   volume = {22},
2776   pages = {79--86},
2777   number = {1},
2778   citeulike-article-id = {3245942},
2779   keywords = {file-import-08-09-12},
2780   owner = {guyeux},
2781   posted-at = {2008-09-12 14:30:37},
2782   priority = {2},
2783   timestamp = {2009.06.29}
2784 }
2785
2786 @MISC{ledoux,
2787   author = {Eshter Ledoux},
2788   title = {Introduction à la théorie du chaos},
2789   year = {2002},
2790   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2791   url = {\url{http://www.nux.be/eledoux/mem/node1.html}}
2792 }
2793
2794 @BOOK{Lehning1997,
2795   title = {Analyse en dimension finie},
2796   publisher = {Masson},
2797   year = {1997},
2798   author = {Lehning},
2799   optpages = {28},
2800   optvolume = {4},
2801   owner = {guyeux},
2802   timestamp = {2008.01.02}
2803 }
2804
2805 @ARTICLE{Lenstra01,
2806   author = {A.K. Lenstra and E.R. Verheul},
2807   title = {Selecting Cryptographic Key Sizes},
2808   journal = {Jour. of the International Association for Cryptologic Research},
2809   year = {2001},
2810   volume = {14},
2811   pages = {255-293},
2812   number = {4}
2813 }
2814
2815 @ARTICLE{Pitts59,
2816   author = {Lettvin, J.Y. and Maturana, H.R. and McCulloch, W.S. and Pitts, W.H.},
2817   title = {What the Frog's Eye Tells the Frog's Brain},
2818   journal = {Proceedings of the IRE},
2819   year = {1959},
2820   volume = {47},
2821   pages = {1940--51},
2822   number = {11},
2823   owner = {christophe},
2824   timestamp = {2010.12.21}
2825 }
2826
2827 @ARTICLE{Li75,
2828   author = {T. Y. Li and J. A. Yorke},
2829   title = {Period three implies chaos},
2830   journal = {Amer. Math. Monthly},
2831   year = {1975},
2832   volume = {82},
2833   pages = {985--992},
2834   number = {10},
2835   owner = {guyeux},
2836   timestamp = {27/01/2008}
2837 }
2838
2839 @ARTICLE{Xiao10,
2840   author = {Li, Yantao and Deng, Shaojiang and Xiao, Di},
2841   title = {A novel Hash algorithm construction based on chaotic neural network},
2842   journal = {Neural Computing and Applications},
2843   year = {2010},
2844   pages = {1-9},
2845   affiliation = {Chongqing University College of Computer Science 400044 Chongqing
2846         China},
2847   issn = {0941-0643},
2848   keyword = {Computer Science},
2849   publisher = {Springer London}
2850 }
2851
2852 @INPROCEEDINGS{Lin09,
2853   author = {Lin, Hua-Yi and Chiang, Tzu-Chiang},
2854   title = {Cooperative secure data aggregation in sensor networks using elliptic
2855         curve based cryptosystems},
2856   booktitle = {CDVE'09: Proceedings of the 6th international conference on Cooperative
2857         design, visualization, and engineering},
2858   year = {2009},
2859   pages = {384--387},
2860   address = {Berlin, Heidelberg},
2861   publisher = {Springer-Verlag},
2862   isbn = {3-642-04264-3, 978-3-642-04264-5},
2863   location = {Luxembourg, Luxembourg}
2864 }
2865
2866 @INPROCEEDINGS{Liu2008,
2867   author = {Liu, An and Ning, Peng},
2868   title = {TinyECC: A Configurable Library for Elliptic Curve Cryptography in
2869         Wireless Sensor Networks},
2870   booktitle = {7th International Conference on Information Processing in Sensor
2871         Networks (IPSN 2008)},
2872   year = {2008},
2873   pages = {245--256},
2874   month = {April},
2875   citeulike-article-id = {3041699},
2876   howpublished = {SPOTS Track},
2877   keywords = {hagg},
2878   posted-at = {2008-07-25 05:25:05},
2879   priority = {2}
2880 }
2881
2882 @ARTICLE{Liu2007bis,
2883   author = {Shao-Hui Liu and Hong-Xun Yao and Wen Gao and Yong-Liang Liu},
2884   title = {An image fragile watermark scheme based on chaotic image pattern
2885         and pixel-pairs},
2886   journal = {Applied Mathematics and Computation},
2887   year = {2007},
2888   volume = {185},
2889   pages = {869-882},
2890   owner = {guyeux},
2891   timestamp = {2008.10.07}
2892 }
2893
2894 @INPROCEEDINGS{Liu07,
2895   author = {Liu, Zhen and Xi, Lifeng},
2896   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2897   booktitle = {KES '07: Knowledge-Based Intelligent Information and Engineering
2898         Systems and the XVII Italian Workshop on Neural Networks on Proceedings
2899         of the 11th International Conference},
2900   year = {2007},
2901   pages = {202--208},
2902   address = {Berlin, Heidelberg},
2903   publisher = {Springer-Verlag},
2904   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74827-4_26},
2905   isbn = {978-3-540-74826-7},
2906   location = {Vietri sul Mare, Italy}
2907 }
2908
2909 @ARTICLE{Liu2007,
2910   author = {Zhen Liu and Lifeng Xi},
2911   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2912   journal = {LNAI},
2913   year = {2007},
2914   volume = {4693},
2915   pages = {202-208},
2916   owner = {guyeux},
2917   timestamp = {11/04/2008}
2918 }
2919
2920 @ARTICLE{Lubachevsky86,
2921   author = {Lubachevsky, Boris and Mitra, Debasis},
2922   title = {A chaotic asynchronous algorithm for computing the fixed point of
2923         a nonnegative matrix of unit spectral radius},
2924   journal = {J. ACM},
2925   year = {1986},
2926   volume = {33},
2927   pages = {130--150},
2928   number = {1},
2929   address = {New York, NY, USA},
2930   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/4904.4801},
2931   issn = {0004-5411},
2932   publisher = {ACM}
2933 }
2934
2935 @ARTICLE{Larger10,
2936   author = {{L}arger, {L}. and {D}udley, {J}.{M}.},
2937   title = { {N}onlinear dynamics {O}ptoelectronic chaos},
2938   journal = {{N}ature },
2939   year = {2010},
2940   volume = {465 },
2941   pages = {41-42 },
2942   number = {7294 },
2943   month = {05},
2944   abstract = {{O}ptoelectronic circuits with delayed feedback provide a convenient
2945         bench-top platform to study a wide range of nonlinear dynamic systems,
2946         from ultrastable clocks to complex chaotic devices.},
2947   affiliation = {{F}ranche-{C}omt{\'e} {\'E}lectronique {M}{\'e}canique, {T}hermique
2948         et {O}ptique - {S}ciences et {T}echnologies - {FEMTO}-{ST} - {CNRS}
2949         : {UMR}6174 - {U}niversit{\'e} de {F}ranche-{C}omt{\'e} - {U}niversit{\'e}
2950         de {T}echnologie de {B}elfort-{M}ontbeliard - {E}cole {N}ationale
2951         {S}up{\'e}rieure de {M}{\'e}canique et des {M}icrotechniques },
2952   audience = {internationale },
2953   day = {05},
2954   doi = {10.1038/465041a },
2955   hal_id = {hal-00517696},
2956   language = {{A}nglais},
2957   url = {http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00517696/en/}
2958 }
2959
2960 @INPROCEEDINGS{Mahoney00,
2961   author = {Mahoney, Matthew V.},
2962   title = {Fast Text Compression with Neural Networks},
2963   booktitle = {Proceedings of the Thirteenth International Florida Artificial Intelligence
2964         Research Society Conference},
2965   year = {2000},
2966   pages = {230--234},
2967   publisher = {AAAI Press},
2968   acmid = {707654},
2969   isbn = {1-57735-113-4},
2970   numpages = {5}
2971 }
2972
2973 @INPROCEEDINGS{msp10:bl,
2974   author = {Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid and Pham, Congduc},
2975   title = {Risk Management in Intrusion Detection Applications with Wireless
2976         Video Sensor Networks},
2977   booktitle = {WCNC'10 IEEE Int. Conf.},
2978   year = {2010},
2979   pages = {***--***},
2980   address = {Sydney, Australia},
2981   month = apr,
2982   note = {To appear},
2983   classement = {*},
2984   equipe = {and},
2985   inhal = {no}
2986 }
2987
2988 @ARTICLE{Malvar03,
2989   author = {H.S. Malvar and D. Florêncio},
2990   title = {Improved Spread Spectrum: A New Modulation Technique for Robust Watermarking},
2991   journal = {IEEE Trans. Signal Proceeding},
2992   year = {2003},
2993   volume = {53},
2994   pages = {898--905},
2995   owner = {christophe},
2996   timestamp = {2010.03.07}
2997 }
2998
2999 @ARTICLE{Marsaglia2003,
3000   author = {G. Marsaglia},
3001   title = {Xorshift RNGs},
3002   journal = {Journal of Statistical Software},
3003   year = {2003},
3004   volume = {8(14)},
3005   pages = {1--6},
3006   owner = {qianxue},
3007   timestamp = {2009.10.28}
3008 }
3009
3010 @ARTICLE{Marsaglia1996,
3011   author = {G. Marsaglia},
3012   title = {DIEHARD: a battery of tests of randomness.},
3013   journal = {http://stat.fsu.edu/~geo/diehard.html},
3014   year = {1996},
3015   owner = {qianxue},
3016   timestamp = {2009.11.09}
3017 }
3018
3019 @ARTICLE{DefiningChaos,
3020   author = {M. Martelli and M. Dang and T. Seph},
3021   title = {Defining chaos},
3022   journal = {Mathematics Magazine},
3023   year = {1998},
3024   volume = {71},
3025   pages = {112--122},
3026   owner = {christophe},
3027   timestamp = {2010.08.11}
3028 }
3029
3030 @ARTICLE{Michel2007c,
3031   author = {Christian J Michel},
3032   title = {An analytical model of gene evolution with 9 mutation parameters:
3033         an application to the amino acids coded by the common circular code.},
3034   journal = {Bull Math Biol},
3035   year = {2007},
3036   volume = {69},
3037   pages = {677--698},
3038   number = {2},
3039   month = {Feb},
3040   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
3041         mutation matrix 64 x 64 with nine substitution parameters associated
3042         with the three types of substitutions in the three trinucleotide
3043         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
3044         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
3045         x 64 with three and six parameters. It determines at some time t
3046         the exact occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly
3047         according to these nine substitution parameters. An application of
3048         this model allows an evolutionary study of the common circular code
3049         [Formula: see text] of eukaryotes and prokaryotes and its 12 coded
3050         amino acids. The main property of this code [Formula: see text] is
3051         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
3052         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
3053         with a window of a few nucleotides. However, since its identification
3054         in 1996, amino acid information coded by [Formula: see text] has
3055         never been studied. Very unexpectedly, this evolutionary model demonstrates
3056         that random substitutions in this code [Formula: see text] and with
3057         particular values for the nine substitutions parameters retrieve
3058         after a certain time of evolution a frequency distribution of these
3059         12 amino acids very close to the one coded by the actual genes.},
3060   doi = {10.1007/s11538-006-9147-z},
3061   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
3062         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
3063         67400 Illkirch, France. michel@dpt-info.u-strasbg.fr},
3064   keywords = {Amino Acids, genetics; Codon, genetics; Eukaryotic Cells; Evolution,
3065         Molecular; Models, Genetic; Prokaryotic Cells},
3066   language = {eng},
3067   medline-pst = {ppublish},
3068   owner = {guyeux},
3069   pmid = {16952018},
3070   timestamp = {2011.05.05},
3071   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-006-9147-z}
3072 }
3073
3074 @ARTICLE{Miellou75,
3075   author = {J.-C. Miellou},
3076   title = {Algorithmes de relaxation chaotique \`{a} retards},
3077   journal = {Rairo},
3078   year = {1975},
3079   volume = {R1},
3080   pages = {148-162},
3081   owner = {guyeux},
3082   timestamp = {2008.05.22}
3083 }
3084
3085 @ARTICLE{Miellou75b,
3086   author = {Miellou, J.-C.},
3087   title = {Itérations chaotiques à retards, étude de la convergence dans le
3088         cas d'espaces partiellement ordonnés},
3089   journal = {C.R.A.S. Paris},
3090   year = {1975},
3091   volume = {280},
3092   pages = {233--236},
3093   owner = {christophe},
3094   timestamp = {2010.08.17}
3095 }
3096
3097 @ARTICLE{Spiteri85,
3098   author = {Jean-Claude Miellou and Pierre Spitéri},
3099   title = {Un critère de convergence pour des méthodes générales de point fixe},
3100   journal = {Rairo -- Modélisation mathématique et analyse numérique},
3101   year = {1985},
3102   volume = {19},
3103   pages = {645--669},
3104   number = {4},
3105   owner = {christophe},
3106   timestamp = {2010.10.13}
3107 }
3108
3109 @ARTICLE{Mooney08,
3110   author = {Aidan Mooney and John G. Keating and Ioannis Pitas},
3111   title = {A comparative study of chaotic and white noise signals in digital
3112         watermarking},
3113   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
3114   year = {2008},
3115   volume = {35},
3116   pages = {913-921},
3117   owner = {christophe},
3118   timestamp = {2010.03.01}
3119 }
3120
3121 @ARTICLE{Nakashima2003,
3122   author = {Nakashima, Y. and Tachibana, R. and Babaguchi, N.},
3123   title = {Watermarked Movie Soundtrack Finds the Position of the Camcorder
3124         in a Theater},
3125   journal = {IEEE Transactions on Multimedia},
3126   year = {2009},
3127   note = {Accepted for future publication Multimedia}
3128 }
3129
3130 @INCOLLECTION{springerlink:10.1007/978-3-642-04431-1_16,
3131   author = {Nelson, Michael and Nahapetian, Ani and Koushanfar, Farinaz and Potkonjak,
3132         Miodrag},
3133   title = {SVD-Based Ghost Circuitry Detection},
3134   booktitle = {Information Hiding},
3135   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
3136   year = {2009},
3137   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Sadeghi, Ahmad-Reza},
3138   volume = {5806},
3139   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3140   pages = {221-234},
3141   note = {10.1007/978-3-642-04431-1_16},
3142   affiliation = {Computer Science Department, UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA},
3143   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04431-1_16}
3144 }
3145
3146 @INPROCEEDINGS{Perez-Hernandez09,
3147   author = {P\'{e}rez-Hern\'{a}ndez, Luis Germ\'{a}n and Rodr\'{\i}guez-V\'{a}zquez,
3148         Katya and Gardu\~{n}o-Ju\'{a}rez, Ram\'{o}n},
3149   title = {Parallel particle swarm optimization applied to the protein folding
3150         problem},
3151   booktitle = {Proceedings of the 11th Annual conference on Genetic and evolutionary
3152         computation},
3153   year = {2009},
3154   series = {GECCO '09},
3155   pages = {1791--1792},
3156   address = {New York, NY, USA},
3157   publisher = {ACM},
3158   acmid = {1570163},
3159   isbn = {978-1-60558-325-9},
3160   keywords = {bioinformatics, biology and chemistry, combinatorial optimization,
3161         parallelization, swarm intelligence},
3162   location = {Montreal, Qu\&\#233;bec, Canada},
3163   numpages = {2}
3164 }
3165
3166 @PHDTHESIS{Pellegrin1986,
3167   author = {D. Pellegrin},
3168   title = {Algorithmique discr\`{e}te et r\'{e}seaux d'automates},
3169   school = {Grenoble},
3170   year = {1986},
3171   owner = {guyeux},
3172   timestamp = {2008.05.22}
3173 }
3174
3175 @ARTICLE{Peng2005,
3176   author = {F. Peng and S.-S. Qiu and M. Long},
3177   title = {One way Hash function construction based on two-dimensional hyperchaotic
3178         mappings},
3179   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3180   year = {2005},
3181   volume = {54},
3182   pages = {98--104},
3183   owner = {guyeux},
3184   timestamp = {2009.01.16}
3185 }
3186
3187 @INPROCEEDINGS{Perez06,
3188   author = {Luis Perez-Freire and F. Pérez-gonzalez and Pedro Comesaña},
3189   title = {Secret Dither Estimation in Lattice-Quantization Data Hiding: A Set-Membership
3190         Approach},
3191   booktitle = {Security, Steganography, and Watermarking of Multimedia Contents},
3192   year = {2006},
3193   editor = {Edward J. Delp and Ping W. Wong},
3194   address = {San Jose, California, USA},
3195   month = {January},
3196   organization = {SPIE},
3197   owner = {guyeux},
3198   timestamp = {2009.06.30}
3199 }
3200
3201 @INPROCEEDINGS{Perez-Freire06,
3202   author = {Luis Perez-Freire and Pedro Comesana and Juan Ramon Troncoso-Pastoriza
3203         and Fernando Perez-Gonzalez},
3204   title = {Watermarking Security: a Survey},
3205   booktitle = {LNCS Transactions on Data Hiding and Multimedia Security},
3206   year = {2006},
3207   owner = {guyeux},
3208   timestamp = {2009.06.29}
3209 }
3210
3211 @PROCEEDINGS{Peter07,
3212   title = {On Concealed Data Aggregation for WSNs},
3213   year = {2007},
3214   author = {Peter, Steffen and Piotrowski, Krzysztof and Langendoerfer, Peter},
3215   booktitle = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3216         4th IEEE},
3217   citeulike-article-id = {2281643},
3218   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45},
3219   citeulike-linkout-1 = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs\_all.jsp?arnumber=4199133},
3220   doi = {10.1109/CCNC.2007.45},
3221   journal = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3222         4th IEEE},
3223   keywords = {hagg},
3224   pages = {192--196},
3225   posted-at = {2008-01-23 19:36:19},
3226   priority = {3},
3227   url = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45}
3228 }
3229
3230 @ARTICLE{pms11:ij,
3231   author = {Pham, Congduc and Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid},
3232   title = {Risk-based Adaptive Scheduling in Randomly Deployed Video Sensor
3233         Networks for Critical Surveillance Applications},
3234   journal = {Journal of Network and Computer Applications},
3235   year = {2011},
3236   volume = {*},
3237   pages = {***--***},
3238   number = {*},
3239   note = {Accepted manuscript. To appear},
3240   classement = {ACLI},
3241   equipe = {and},
3242   impact-factor = {1.111},
3243   inhal = {no},
3244   isi-acro = {J NETW COMPU APPL},
3245   publisher = {Springer}
3246 }
3247
3248 @MISC{Poe,
3249   author = {Edgar Alan Poe},
3250   title = {The Raven},
3251   month = {April},
3252   year = {1839},
3253   note = {American Museum (Baltimore)},
3254   owner = {christophe},
3255   timestamp = {2010.11.23}
3256 }
3257
3258 @ARTICLE{Perez-Freire2006:Security,
3259   author = {L. P{\'e}rez-Freire and F. P{\'e}rez-González and T. Furon and P.
3260         Comesaña},
3261   title = {Security of lattice-based data hiding against the known message attack},
3262   journal = {IEEE Trans. on Information Forensics and Security},
3263   year = {2006},
3264   volume = {1},
3265   pages = {421-439},
3266   number = {4},
3267   month = {dec},
3268   owner = {guyeux},
3269   timestamp = {2009.12.06}
3270 }
3271
3272 @MISC{Quisquater02sidechannel,
3273   author = {J-J. Quisquater and D. Samyde and Université Catholique De Louvain
3274         and Groupe Crypto},
3275   title = {Side Channel Cryptanalysis},
3276   year = {2002}
3277 }
3278
3279 @ARTICLE{Raynal2001,
3280   author = {Frédéric Raynal and Fabien A. P. Petitcolas and Caroline Fontaine},
3281   title = {Evaluation automatique des méthodes de tatouage},
3282   journal = {Traitement du signal},
3283   year = {2001},
3284   volume = {18},
3285   pages = {271-282},
3286   owner = {guyeux},
3287   timestamp = {2008.05.21}
3288 }
3289
3290 @MISC{rijmen05,
3291   author = {Vincent Rijmen and Elisabeth Oswald},
3292   title = {Update on SHA-1},
3293   howpublished = {Cryptology ePrint Archive, Report 2005/010},
3294   year = {2005},
3295   note = {\url{http://eprint.iacr.org/}}
3296 }
3297
3298 @BOOK{Robert,
3299   title = {Discrete Iterations, a Metric Study},
3300   publisher = {Springer-Verlag},
3301   year = {1986},
3302   editor = {Berlin Heidelberg New-York},
3303   author = {François Robert},
3304   volume = {6},
3305   series = {Series in Computational Mathematics}
3306 }
3307
3308 @BOOK{Robert1986,
3309   title = {Discrete Iterations: A Metric Study},
3310   year = {1986},
3311   editor = {Springer-Verlag},
3312   author = {F. Robert},
3313   volume = {6},
3314   series = {Springer Series in Computational Mathematics},
3315   owner = {guyeux},
3316   timestamp = {17/02/2008}
3317 }
3318
3319 @ARTICLE{Rudenko08,
3320   author = {Rudenko, O. and Snytkin, M.},
3321   title = {Image compression based on the neural network art},
3322   journal = {Cybernetics and Systems Analysis},
3323   year = {2008},
3324   volume = {44},
3325   pages = {797-802},
3326   affiliation = {Kharkov National University of Radio Electronics Kharkov Ukraine},
3327   issn = {1060-0396},
3328   issue = {6},
3329   keyword = {Computer Science},
3330   publisher = {Springer New York}
3331 }
3332
3333 @PHDTHESIS{Ruette2001,
3334   author = {Sylvie Ruette},
3335   title = {Chaos en dynamique topologique, en particulier sur l'intervalle,
3336         mesures d'entropie maximale},
3337   school = {Université d'Aix-Marseille II},
3338   year = {2001},
3339   optmonth = {Novembre},
3340   owner = {guyeux},
3341   timestamp = {2008.01.02}
3342 }
3343
3344 @MASTERSTHESIS{Saulnier02,
3345   author = {Boris Saulnier},
3346   title = {Entropie topologique},
3347   school = {DEA Sémantique, Preuves et Langages, Paris 7},
3348   year = {2002},
3349   owner = {christophe},
3350   timestamp = {2010.08.12}
3351 }
3352
3353 @ARTICLE{Schmitz2001,
3354   author = {Roland Schmitz},
3355   title = {Use of chaotic dynamical systems in cryptography},
3356   journal = {Journal of Franklin Institute},
3357   year = {2001},
3358   volume = {338},
3359   pages = {429-441},
3360   owner = {guyeux},
3361   timestamp = {17/02/2008}
3362 }
3363
3364 @BOOK{Schwartz80,
3365   title = {Analyse: topologie g\'{e}n\'{e}rale et analyse fonctionnelle},
3366   publisher = {Hermann},
3367   year = {1980},
3368   editor = {Hermann},
3369   author = {Laurent Schwartz},
3370   owner = {christophe},
3371   timestamp = {2010.09.15}
3372 }
3373
3374 @ARTICLE{Shannon49,
3375   author = {Shannon, Claude E.},
3376   title = {Communication Theory of Secrecy Systems},
3377   journal = {Bell Systems Technical Journal},
3378   year = {1949},
3379   volume = {28},
3380   pages = {656--715},
3381   citeulike-article-id = {507362},
3382   keywords = {master, secrecy\_systems, teoria-informacao, theory\_communication,
3383         theory\_cryptography},
3384   owner = {guyeux},
3385   posted-at = {2006-02-16 23:24:09},
3386   priority = {2},
3387   timestamp = {2009.06.29}
3388 }
3389
3390 @ARTICLE{Shmygelska05,
3391   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger},
3392   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3393         polar protein folding problem},
3394   journal = {BMC Bioinformatics},
3395   year = {2005},
3396   volume = {6},
3397   pages = {30},
3398   number = {1},
3399   abstract = {BACKGROUND:The protein folding problem is a fundamental problems in
3400         computational molecular biology and biochemical physics. Various
3401         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3402         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3403         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3404         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3405         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3406         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3407         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3408         simple model - the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3409         (HP) model.RESULTS:We present an improvement of our previous ACO
3410         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3411         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3412         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3413         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3414         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3415         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3416         a more diverse set of native conformations.CONCLUSIONS:The application
3417         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3418         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3419         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3420         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3421         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3422         for more complex and realistic models of protein structure holds
3423         significant promise.},
3424   doi = {10.1186/1471-2105-6-30},
3425   issn = {1471-2105},
3426   pubmedid = {15710037}
3427 }
3428
3429 @OTHER{Shmygelska2005Feb,
3430   __markedentry = {[christophe]},
3431   abstract = {Abstract Background The protein folding problem is a fundamental problems
3432         in computational molecular biology and biochemical physics. Various
3433         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3434         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3435         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3436         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3437         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3438         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3439         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3440         simple model – the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3441         (HP) model. Results We present an improvement of our previous ACO
3442         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3443         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3444         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3445         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3446         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3447         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3448         a more diverse set of native conformations. Conclusions The application
3449         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3450         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3451         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3452         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3453         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3454         for more complex and realistic models of protein structure holds
3455         significant promise.},
3456   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger H},
3457   journal = {BMC Bioinformatics. 2005 Feb 14},
3458   number = {1},
3459   owner = {christophe},
3460   pages = {30},
3461   timestamp = {2011.01.24},
3462   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3463         polar protein folding problem},
3464   volume = {6},
3465   year = {2005 Feb}
3466 }
3467
3468 @ARTICLE{Shujun1,
3469   author = {Li Shujun and Li Qi and Li Wenmin and Mou Xuanqin and Cai Yuanlong},
3470   title = {Statistical Properties of Digital Piecewise Linear Chaotic Maps and
3471         Their Roles in Cryptography and Pseudo-Random Coding},
3472   journal = {Proceedings of the 8th IMA International Conference on Cryptography
3473         and Coding},
3474   year = {2001},
3475   volume = {1},
3476   pages = {205--221},
3477   owner = {christophe},
3478   timestamp = {2010.03.06}
3479 }
3480
3481 @INPROCEEDINGS{Simmons83,
3482   author = {Gustavus J. Simmons},
3483   title = {The Prisoners' Problem and the Subliminal Channel},
3484   booktitle = {Advances in Cryptology, Proc. CRYPTO'83},
3485   year = {1984},
3486   pages = {51--67},
3487   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3488   owner = {guyeux},
3489   timestamp = {2009.06.29}
3490 }
3491
3492 @ARTICLE{Solak2004389,
3493   author = {Ercan Solak},
3494   title = {On the security of a class of discrete-time chaotic cryptosystems},
3495   journal = {Physics Letters A},
3496   year = {2004},
3497   volume = {320},
3498   pages = {389 - 395},
3499   number = {5-6},
3500   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2003.11.008},
3501   issn = {0375-9601},
3502   keywords = {Communication using chaos},
3503   owner = {guyeux},
3504   timestamp = {2009.12.12},
3505   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4B22RC9-2/2/99a0af737c9b6ba8af47ae4d3c7a326d}
3506 }
3507
3508 @PHDTHESIS{Spiteri74,
3509   author = {Pierre Spitéri},
3510   title = {Contribution à l'étude de la stabilite au sens de liapounov de certains
3511         systemes differentiels non lineaires},
3512   school = {Université de Franche-Comté},
3513   year = {1974},
3514   owner = {christophe},
3515   timestamp = {2010.10.13}
3516 }
3517
3518 @BOOK{Stewart1989,
3519   title = {Does God Play Dices ?: the mathematics of chaos},
3520   publisher = {Penguin},
3521   year = {1989},
3522   author = {Ian Stewart},
3523   owner = {guyeux},
3524   timestamp = {2008.01.02}
3525 }
3526
3527 @BOOK{Stinson02,
3528   title = {Cryptography: Theory and Practice, Second Edition},
3529   publisher = {{Chapman \& Hall/CRC}},
3530   year = {2002},
3531   author = {Stinson, Douglas R.},
3532   month = {February},
3533   abstract = {{Douglas R. Stinson's <I>Cryptography: Theory and Practice</I> is
3534         a mathematically intensive examination of cryptography, including
3535         ciphers, the Data Encryption Standard (DES), public key cryptography,
3536         one-way hash functions, and digital signatures. Stinson's explication
3537         of "zero-sum proofs"--a process by which one person lets another
3538         person know that he or she has a password without actually revealing
3539         any information--is especially good.<P> If you are new to the math
3540         behind cryptography but want to tackle it, the author covers all
3541         of the required background to understand the real mathematics here.
3542         <I>Cryptography</I> includes extensive exercises with each chapter
3543         and makes an ideal introduction for any math-literate person willing
3544         to get acquainted with this material.} {<P>Major advances over the
3545         last five years precipitated this major revision of the bestselling
3546         Cryptography: Theory and Practice. With more than 40 percent new
3547         or updated material, the second edition now provides an even more
3548         comprehensive treatment of modern cryptography. It focuses on the
3549         new Advanced Encryption Standards and features an entirely new chapter
3550         on that subject. Another new chapter explores the applications of
3551         secret sharing schemes, including ramp schemes, visual cryptography,
3552         threshold cryptography, and broadcast encryption. This is an ideal
3553         introductory text for both computer science and mathematics students
3554         and a valuable reference for professionals.</P>}},
3555   citeulike-article-id = {2401855},
3556   day = {27},
3557   howpublished = {Hardcover},
3558   isbn = {1584882069},
3559   keywords = {security},
3560   posted-at = {2008-02-20 08:28:49},
3561   priority = {0},
3562   url = {http://www.amazon.com/exec/obidos/redirect?tag=citeulike07-20\&path=ASIN/1584882069}
3563 }
3564
3565 @INPROCEEDINGS{Takana90,
3566   author = {K. Tanaka and Y. Nakamura and K. Matsui},
3567   title = {Embedding Secret Information into a Dithered Multi-level Image},
3568   booktitle = {IEEE Military Communications Conference},
3569   year = {1990},
3570   owner = {christophe},
3571   timestamp = {2010.08.05}
3572 }
3573
3574 @PHDTHESIS{ElTarazi81,
3575   author = {M. N. El Tarazi},
3576   title = {Contraction et ordre partiel pour l'étude d'algorithmes synchrones
3577         et asynchrones en analyse numérique},
3578   school = {Faculté des Sciences et Techniques de l'Université de Franche-Comté,
3579         Besançon},
3580   year = {1981},
3581   owner = {christophe},
3582   timestamp = {2010.08.17}
3583 }
3584
3585 @INPROCEEDINGS{Unger93,
3586   author = {Unger, Ron and Moult, John},
3587   title = {Genetic Algorithm for 3D Protein Folding Simulations},
3588   booktitle = {Proceedings of the 5th International Conference on Genetic Algorithms},
3589   year = {1993},
3590   pages = {581--588},
3591   address = {San Francisco, CA, USA},
3592   publisher = {Morgan Kaufmann Publishers Inc.},
3593   acmid = {657747},
3594   isbn = {1-55860-299-2},
3595   numpages = {8}
3596 }
3597
3598 @MISC{Van93electronicwater,
3599   author = {Tirkel Rankin Van},
3600   title = {Electronic Water Mark},
3601   year = {1993}
3602 }
3603
3604 @ARTICLE{Venkatesan2007397,
3605   author = {R.C. Venkatesan},
3606   title = {Encryption of covert information into multiple statistical distributions},
3607   journal = {Physics Letters A},
3608   year = {2007},
3609   volume = {370},
3610   pages = {397 - 404},
3611   number = {5-6},
3612   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.05.117},
3613   issn = {0375-9601},
3614   keywords = {Statistical encryption/decryption},
3615   owner = {guyeux},
3616   timestamp = {2009.12.12},
3617   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4P4FV2M-1/2/cd11a2ec144526e3c4552d2a7e7906cc}
3618 }
3619
3620 @ARTICLE{pitas,
3621   author = {G. Voyatzis and I. Pitas},
3622   title = {Chaotic watermarks for embedding in the spatial digital image domain},
3623   journal = {Proceedings of IEEE ICIP},
3624   year = {1998},
3625   volume = {2},
3626   pages = {432-436},
3627   owner = {christophe},
3628   timestamp = {2010.03.06}
3629 }
3630
3631 @INCOLLECTION{Wagner03,
3632   author = {Wagner, David},
3633   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3634   booktitle = {Information Security},
3635   publisher = {Springer Berlin, Heidelberg},
3636   year = {2003},
3637   volume = {2851},
3638   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3639   pages = {234-239},
3640   abstract = {We use linear algebra to show that an algebraic privacy homomorphism
3641         proposed by Domingo-Ferrer is insecure for some parameter settings.},
3642   affiliation = {University of California, Berkeley USA}
3643 }
3644
3645 @INPROCEEDINGS{Wagner03cryptanalysisof,
3646   author = {David Wagner},
3647   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3648   booktitle = {Proc. Sixth Information Security Conf. (ISC03},
3649   year = {2003},
3650   pages = {234--239}
3651 }
3652
3653 @ARTICLE{Wang_ellipticcurve,
3654   author = {Haodong Wang and Bo Sheng and Qun Li},
3655   title = {Elliptic curve cryptography-based access control in sensor networks},
3656   journal = {Int. J. Security and Networks}
3657 }
3658
3659 @INPROCEEDINGS{wbg10:ip,
3660   author = {Wang, Qianxue and Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Fang,
3661         Xiaole},
3662   title = {Randomness quality of {CI} chaotic generators. Application to Internet
3663         security},
3664   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
3665   year = {2010},
3666   pages = {125--130},
3667   address = {Valencia, Spain},
3668   month = sep,
3669   publisher = {IEEE Computer Society Press},
3670   note = {Best Paper award},
3671   classement = {ACTI},
3672   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
3673   equipe = {and},
3674   inhal = {no}
3675 }
3676
3677 @ARTICLE{Wang2003,
3678   author = {X. M. Wang and J. S. Zhang and W. F. Zhang},
3679   title = {One-way hash function construction based on the extended chaotic
3680         maps switch},
3681   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3682   year = {2003},
3683   volume = {52, No. 11},
3684   pages = {2737--2742},
3685   owner = {guyeux},
3686   timestamp = {2009.01.16}
3687 }
3688
3689 @ARTICLE{Girao06,
3690   author = {Westhoff, Dirk and Girao, Joao and Acharya, Mithun},
3691   title = {Concealed Data Aggregation for Reverse Multicast Traffic in Sensor
3692         Networks: Encryption, Key Distribution, and Routing Adaptation},
3693   journal = {IEEE Transactions on Mobile Computing},
3694   year = {2006},
3695   volume = {5},
3696   pages = {1417--1431},
3697   number = {10},
3698   address = {Piscataway, NJ, USA},
3699   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/TMC.2006.144},
3700   issn = {1536-1233},
3701   publisher = {IEEE Educational Activities Department}
3702 }
3703
3704 @MISC{web:lyapunov,
3705   author = {Wikipédia},
3706   title = {Exposant de Lyapunov -- Site web d'André Lévesque},
3707   year = {2010},
3708   note = {[En ligne; Page disponible le 9-septembre-2010]},
3709   url = {\url{http://math.cmaisonneuve.qc.ca/alevesque/chaos_fract/Lyapunov/Exposant.html}}
3710 }
3711
3712 @MISC{wiki:complet,
3713   author = {Wikipédia},
3714   title = {Espace complet --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3715   year = {2010},
3716   note = {[En ligne; Page disponible le 9-août-2010]},
3717   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Espace_complet&oldid=52734266}}
3718 }
3719
3720 @MISC{wiki:densite,
3721   author = {Wikipédia},
3722   title = {Densité (mathématiques) --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3723   year = {2010},
3724   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3725   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Densit%C3%A9_(math%C3%A9matiques)&oldid=53938121}}
3726 }
3727
3728 @MISC{wiki:fisher,
3729   author = {Wikipédia},
3730   title = {Information de Fisher --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3731   year = {2010},
3732   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3733   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Information_de_Fisher&oldid=52877871}}
3734 }
3735
3736 @MISC{wiki:Kerkhoffs,
3737   author = {Wikipédia},
3738   title = {Principe de Kerckhoffs --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3739   year = {2010},
3740   note = {[En ligne; Page disponible le 20-août-2010]},
3741   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Principe_de_Kerckhoffs&oldid=52133114}}
3742 }
3743
3744 @MISC{wiki:sarkovskii,
3745   author = {Wikipédia},
3746   title = {Théorème de Sarkovskii --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3747   year = {2010},
3748   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3749   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Th%C3%A9or%C3%A8me_de_Sarkovskii&oldid=54196167}}
3750 }
3751
3752 @MISC{wiki:steganographie,
3753   author = {Wikipédia},
3754   title = {Stéganographie --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3755   year = {2010},
3756   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3757   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=St%C3%A9ganographie&oldid=54724435}}
3758 }
3759
3760 @MISC{wiki:tatouage,
3761   author = {Wikipédia},
3762   title = {Tatouage numérique --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3763   year = {2010},
3764   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3765   url = {https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Tatouage_num%C3%A9rique&oldid=55484940}
3766 }
3767
3768 @MISC{wiki:testsHypothese,
3769   author = {Wikipédia},
3770   title = {Test d'hypothèse --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3771   year = {2010},
3772   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3773   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Test_d%27hypoth%C3%A8se&oldid=55344108}}
3774 }
3775
3776 @ARTICLE{Wu2007bis,
3777   author = {Xianyong Wu and Zhi-Hong Guan},
3778   title = {A novel digital watermark algorithm based on chaotic maps},
3779   journal = {Physics Letters A},
3780   year = {2007},
3781   volume = {365},
3782   pages = {403 - 406},
3783   number = {5-6},
3784   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.01.034},
3785   issn = {0375-9601},
3786   keywords = {Watermarking},
3787   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4MY0MF3-8/2/0b4d1298fa84337d2e59b3fefe26f583}
3788 }
3789
3790 @INPROCEEDINGS{Wu2007,
3791   author = {Wu, Xianyong and Guan, Zhi-Hong and Wu, Zhengping},
3792   title = {A Chaos Based Robust Spatial Domain Watermarking Algorithm},
3793   booktitle = {ISNN '07: Proceedings of the 4th international symposium on Neural
3794         Networks},
3795   year = {2007},
3796   pages = {113--119},
3797   address = {Berlin, Heidelberg},
3798   publisher = {Springer-Verlag},
3799   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-72393-6_15},
3800   isbn = {978-3-540-72392-9},
3801   location = {Nanjing, China}
3802 }
3803
3804 @ARTICLE{Xiao20092288,
3805   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3806   title = {Parallel keyed hash function construction based on chaotic neural
3807         network},
3808   journal = {Neurocomputing},
3809   year = {2009},
3810   volume = {72},
3811   pages = {2288 - 2296},
3812   number = {10-12},
3813   note = {Lattice Computing and Natural Computing (JCIS 2007) / Neural Networks
3814         in Intelligent Systems Designn (ISDA 2007)},
3815   abstract = {Recently, various hash functions based on chaos or neural networks
3816         were proposed. Nevertheless, none of them works efficiently in parallel
3817         computing environment. In this paper, an algorithm for parallel keyed
3818         hash function construction based on chaotic neural network is proposed.
3819         The mechanism of changeable-parameter and self-synchronization establishes
3820         a close relation between the hash value bit and message, and the
3821         algorithm structure ensures the uniform sensitivity of the hash value
3822         to the message blocks at different positions. The proposed algorithm
3823         can satisfy the performance requirements of hash function. These
3824         properties make it a promising choice for hashing on parallel computing
3825         platform.},
3826   issn = {0925-2312},
3827   keywords = {Chaotic neural network}
3828 }
3829
3830 @ARTICLE{Xiao20094346,
3831   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3832   title = {Improving the security of a parallel keyed hash function based on
3833         chaotic maps},
3834   journal = {Physics Letters A},
3835   year = {2009},
3836   volume = {373},
3837   pages = {4346 - 4353},
3838   number = {47},
3839   issn = {0375-9601},
3840   keywords = {Hash function},
3841   owner = {guyeux},
3842   timestamp = {2009.12.12}
3843 }
3844
3845 @ARTICLE{Xiao20102254,
3846   author = {Di Xiao and Frank Y. Shih and Xiaofeng Liao},
3847   title = {A chaos-based hash function with both modification detection and
3848         localization capabilities},
3849   journal = {Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation},
3850   year = {2010},
3851   volume = {15},
3852   pages = {2254 - 2261},
3853   number = {9},
3854   abstract = {Recently, a variety of chaos-based hash functions have been proposed.
3855         Nevertheless, none of them can realize modification localization.
3856         In this paper, a hash function with both modification detection and
3857         localization capabilities is proposed, which can also support the
3858         parallel processing mode. By using the mechanism of changeable-parameter
3859         and self-synchronization, the keystream can establish a close relation
3860         with the algorithm key, the content, and the order of each message
3861         unit. Theoretical analysis and computer simulation indicate that
3862         the proposed algorithm can satisfy the performance requirements of
3863         hash functions.},
3864   issn = {1007-5704},
3865   keywords = {Hash function}
3866 }
3867
3868 @INPROCEEDINGS{Yu06,
3869   author = {Yu, Yu and Leiwo, Jussipekka and Premkumar, Benjamin},
3870   title = {A Study on the Security of Privacy Homomorphism},
3871   booktitle = {ITNG '06: Proceedings of the Third International Conference on Information
3872         Technology: New Generations},
3873   year = {2006},
3874   pages = {470--475},
3875   address = {Washington, DC, USA},
3876   publisher = {IEEE Computer Society},
3877   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/ITNG.2006.19},
3878   isbn = {0-7695-2497-4}
3879 }
3880
3881 @ARTICLE{Zhang2008658,
3882   author = {Wei Zhang and Yonghe Liu and Sajal K. Das and Pradip De},
3883   title = {Secure data aggregation in wireless sensor networks: A watermark
3884         based authentication supportive approach},
3885   journal = {Pervasive and Mobile Computing},
3886   year = {2008},
3887   volume = {4},
3888   pages = {658 - 680},
3889   number = {5},
3890   doi = {DOI: 10.1016/j.pmcj.2008.05.005},
3891   issn = {1574-1192},
3892   keywords = {Wireless sensor networks},
3893   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B7MF1-4SKB3MD-1/2/b73948dcaa3eb63a2c21d09041882625}
3894 }
3895
3896 @ARTICLE{Zhang2005,
3897   author = {Zhang, Yang and Arakaki, Adrian K. and Skolnick, Jeffrey},
3898   title = {TASSER: An automated method for the prediction of protein tertiary
3899         structures in CASP6},
3900   journal = {Proteins},
3901   year = {2005},
3902   volume = {61},
3903   pages = {91--98},
3904   number = {S7},
3905   issn = {1097-0134},
3906   keywords = {comparative modeling, threading, ab initio prediction, TASSER, PROSPECTOR_3},
3907   owner = {christophe},
3908   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
3909   timestamp = {2011.01.22},
3910   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20724}
3911 }
3912
3913 @ARTICLE{Zhou1997429,
3914   author = {Chang-song Zhou and Tian-lun Chen},
3915   title = {Extracting information masked by chaos and contaminated with noise:
3916         Some considerations on the security of communication approaches using
3917         chaos},
3918   journal = {Physics Letters A},
3919   year = {1997},
3920   volume = {234},
3921   pages = {429 - 435},
3922   number = {6},
3923   issn = {0375-9601},
3924   keywords = {Communication},
3925   owner = {guyeux},
3926   timestamp = {2009.12.12}
3927 }
3928
3929 @ARTICLE{Zhou96,
3930   author = {Zhou, Huai-bei and Wang, Lu},
3931   title = {Chaos in Biomolecular Dynamics},
3932   journal = {The Journal of Physical Chemistry},
3933   year = {1996},
3934   volume = {100},
3935   pages = {8101-8105},
3936   number = {20},
3937   doi = {10.1021/jp953409x}
3938 }
3939
3940 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iwdw/2005,
3941   title = {IWDW'05: 4th International Workshop on Digital Watermarking},
3942   year = {2005},
3943   editor = {Mauro Barni and Ingemar J. Cox and Ton Kalker and Hyoung Joong Kim},
3944   volume = {3710},
3945   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3946   address = {Siena, Italy},
3947   publisher = {Springer},
3948   month = {September 15-17},
3949   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3950   booktitle = {IWDW},
3951   isbn = {3-540-28768-X},
3952   owner = {guyeux},
3953   timestamp = {2009.06.29}
3954 }
3955
3956 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2006,
3957   title = {IH 2006: Information Hiding, 8th International Workshop},
3958   year = {2007},
3959   editor = {Jan Camenisch and Christian S. Collberg and Neil F. Johnson and Phil
3960         Sallee},
3961   volume = {4437},
3962   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3963   address = {Alexandria, VA, USA},
3964   publisher = {Springer},
3965   month = {July},
3966   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3967   booktitle = {Information Hiding},
3968   isbn = {978-3-540-74123-7},
3969   owner = {guyeux},
3970   timestamp = {2009.06.29}
3971 }
3972
3973 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2007,
3974   title = {Information Hiding, 9th International Workshop, IH 2007, Saint Malo,
3975         France, June 11-13, 2007, Revised Selected Papers},
3976   year = {2008},
3977   editor = {Teddy Furon and Fran\c{c}ois Cayre and Gwena{\"e}l J. Do{\"e}rr and
3978         Patrick Bas},
3979   volume = {4567},
3980   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3981   publisher = {Springer},
3982   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3983   booktitle = {Information Hiding},
3984   isbn = {978-3-540-77369-6},
3985   owner = {guyeux},
3986   timestamp = {2009.06.29}
3987 }
3988
3989 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iccsa/2006-1,
3990   title = {Computational Science and Its Applications - ICCSA 2006, International
3991         Conference, Glasgow, UK, May 8-11, 2006, Proceedings, Part I},
3992   year = {2006},
3993   editor = {Marina L. Gavrilova and Osvaldo Gervasi and Vipin Kumar and Chih
3994         Jeng Kenneth Tan and David Taniar and Antonio Lagan{\`a} and Youngsong
3995         Mun and Hyunseung Choo},
3996   volume = {3980},
3997   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3998   publisher = {Springer},
3999   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4000   booktitle = {ICCSA (1)},
4001   isbn = {3-540-34070-X}
4002 }
4003
4004 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/secrypt/2010,
4005   title = {SECRYPT 2010 - Proceedings of the International Conference on Security
4006         and Cryptography, Athens, Greece, July 26-28, 2010, SECRYPT is part
4007         of ICETE - The International Joint Conference on e-Business and Telecommunications},
4008   year = {2010},
4009   editor = {Sokratis K. Katsikas and Pierangela Samarati},
4010   publisher = {SciTePress},
4011   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4012   booktitle = {SECRYPT},
4013   isbn = {978-989-8425-18-8}
4014 }
4015
4016 @BOOK{Katzenbeisser00,
4017   title = {Information Hiding Techniques for Steganography and Digital Watermarking},
4018   publisher = {Artech House, Inc.},
4019   year = {2000},
4020   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Petitcolas, Fabien A.},
4021   address = {Norwood, MA, USA},
4022   isbn = {1580530354}
4023 }
4024
4025 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/1999,
4026   title = {IH'99: 3rd International Workshop on Information Hiding},
4027   year = {2000},
4028   editor = {Andreas Pfitzmann},
4029   volume = {1768},
4030   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4031   address = {Dresden, Germany},
4032   publisher = {Springer},
4033   month = {September 29 - October 1.},
4034   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4035   booktitle = {Information Hiding},
4036   isbn = {3-540-67182-X},
4037   owner = {guyeux},
4038   timestamp = {2009.06.29}
4039 }
4040
4041 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/indocrypt/2000,
4042   title = {Progress in Cryptology - INDOCRYPT 2000, First International Conference
4043         in Cryptology in India, Calcutta, India, December 10-13, 2000, Proceedings},
4044   year = {2000},
4045   editor = {Bimal K. Roy and Eiji Okamoto},
4046   volume = {1977},
4047   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4048   publisher = {Springer},
4049   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4050   booktitle = {INDOCRYPT},
4051   isbn = {3-540-41452-5}
4052 }
4053
4054 @BOOK{DBLP:reference/icsec/2010,
4055   title = {Handbook of Information and Communication Security},
4056   publisher = {Springer},
4057   year = {2010},
4058   editor = {Peter P. Stavroulakis and Mark Stamp},
4059   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4060   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
4061   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4},
4062   isbn = {978-3-642-04116-7}
4063 }
4064
4065 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/isnn/2004-2,
4066   title = {Advances in Neural Networks - ISNN 2004, International Symposium
4067         on Neural Networks, Dalian, China, August 19-21, 2004, Proceedings,
4068         Part II},
4069   year = {2004},
4070   editor = {Fuliang Yin and Jun Wang and Chengan Guo},
4071   volume = {3174},
4072   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4073   publisher = {Springer},
4074   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4075   booktitle = {ISNN (2)},
4076   isbn = {3-540-22843-8}
4077 }
4078
4079 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/adhocnets/2010,
4080   title = {Ad Hoc Networks - Second International Conference, ADHOCNETS 2010,
4081         Victoria, BC, Canada, August 18-20, 2010, Revised Selected Papers},
4082   year = {2010},
4083   editor = {Jun Zheng and David Simplot-Ryl and Victor C. M. Leung},
4084   volume = {49},
4085   series = {Lecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social Informatics
4086         and Telecommunications Engineering},
4087   publisher = {Springer},
4088   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4089   booktitle = {ADHOCNETS},
4090   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5},
4091   isbn = {978-3-642-17993-8}
4092 }
4093
4094 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4095   owner = {guyeux},
4096   timestamp = {2011.03.29}
4097 }
4098
4099 @MISC{Delicious,
4100   title = {Delicious social bookmarking, http://delicious.com/},
4101   comment = {http://delicious.com/},
4102   type = {web page},
4103   url = {http://delicious.com/}
4104 }
4105
4106 @MISC{Frick,
4107   title = {The Frick Collection, http://www.frick.org/},
4108   comment = {http://www.frick.org/},
4109   type = {web page},
4110   url = {http://www.frick.org/}
4111 }
4112
4113 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4114   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4115         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4116   year = {2010},
4117   publisher = {IEEE},
4118   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4119   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4120 }
4121
4122 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4123   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4124         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4125   year = {2010},
4126   publisher = {IEEE},
4127   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4128   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4129 }
4130
4131 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/date/2010,
4132   title = {Design, Automation and Test in Europe, DATE 2010, Dresden, Germany,
4133         March 8-12, 2010},
4134   year = {2010},
4135   publisher = {IEEE},
4136   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4137   booktitle = {DATE}
4138 }
4139
4140 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/2009,
4141   title = {Proceedings IEEE CSE'09, 12th IEEE International Conference on Computational
4142         Science and Engineering, August 29-31, 2009, Vancouver, BC, Canada},
4143   year = {2009},
4144   publisher = {IEEE Computer Society},
4145   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4146   booktitle = {CSE}
4147 }
4148
4149 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/2009,
4150   title = {Proceedings of the International Conference on Ultra Modern Telecommunications,
4151         ICUMT 2009, 12-14 October 2009, St. Petersburg, Russia},
4152   year = {2009},
4153   publisher = {IEEE},
4154   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4155   booktitle = {ICUMT}
4156 }
4157
4158 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/2008,
4159   title = {49th Annual IEEE Symposium on Foundations of Computer Science, FOCS
4160         2008, October 25-28, 2008, Philadelphia, PA, USA},
4161   year = {2008},
4162   publisher = {IEEE Computer Society},
4163   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4164   booktitle = {FOCS}
4165 }
4166
4167 @inproceedings{FCT11,
4168 inhal = {no},
4169 domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
4170 equipe = {and},
4171 classement = {ACTI},
4172 author = {Bahi, Jacques and Couchot, Jean-fran\c{c}ois and Guyeux, Christophe and Richard, Adrien},
4173 title = {On the Link Between Strongly Connected Iteration Graphs and Chaotic Boolean Discrete-Time Dynamical Systems},
4174 booktitle = {FCT'11, 18th Int. Symp. on Fundamentals of Computation Theory},
4175 series = {LNCS},
4176 volume = {*},
4177 pages = {***--***},
4178 address = {Oslo, Norway},
4179 month = aug,
4180 year = 2011,
4181 note = {To appear},
4182
4183 }
4184
4185 @comment{jabref-meta: selector_publisher:}
4186
4187 @comment{jabref-meta: selector_author:}
4188
4189 @comment{jabref-meta: selector_journal:}
4190
4191 @comment{jabref-meta: selector_keywords:Chaos;Entropie Topologique;Tip
4192 e;}
4193