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Private GIT Repository
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[ancetre.git] / main.tex
1 \documentclass{article}
2 \usepackage{subfig}
3 \usepackage{color}
4 \usepackage{graphicx}
5 \usepackage{url}
6 \usepackage{cite}
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8 % correct bad hyphenation here
9 \hyphenation{op-tical net-works semi-conduc-tor}
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12 \begin{document}
13 \title{Ancetre}
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16 \author{Jean-Fran\c cois Couchot,  and  Christophe Guyeux*\\
17   FEMTO-ST Institute, UMR 6174 CNRS\\
18   Computer Science Laboratory DISC,
19   University of Franche-Comt\'{e},
20   Besan\c con, France.\\
21   \{jean-francois.couchot,  christophe.guyeux\}@femto-st.fr\\
22  $*:$ Authors in alphabetic order.\\
23 }
24 \newcommand{\JFC}[1]{\begin{color}{green}\textit{}\end{color}}
25 \newcommand{\RC}[1]{\begin{color}{red}\textit{}\end{color}}
26 \newcommand{\CG}[1]{\begin{color}{blue}\textit{}\end{color}}
27 % make the title area
28 \maketitle
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33 %IEEEtran, journal, \LaTeX, paper, template.
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35 \maketitle
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37 \begin{abstract}
38 \end{abstract}
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47 \section{Introduction}\label{sec:intro}
48 %\input{intro.tex}
49 \input{art}
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51 \section{Presentation of the Proposed Approach}\label{sec:ourapproach}
52
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54 \section{Experiments}\label{sec:experiments}
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56
57
58 \section{First Stage: Genomes as Lists of Homologous Classes}
59
60 \section{Second Stage: to Find Closed Genomes}
61
62 \section{Third Stage: Reconstruction of Ancestral Synteny Blocs for the two Closest Genomes}
63
64 \section{Fourth Stage: Filling holes in the Obtained Ancestral Genome}
65
66 \section{Last Stage: to Reproduce the Process until Obtaining the Last Common Ancestor of the given set of Genomes}
67
68 \section{Conclusion}\label{sec:concl}
69
70
71 \bibliographystyle{plain}
72 \bibliography{biblio}
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76 \end{document}
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