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azerazerzer
authorJean-François Couchot <couchot@couchot.iut-bm.univ-fcomte.fr>
Fri, 22 May 2015 08:26:03 +0000 (10:26 +0200)
committerJean-François Couchot <couchot@couchot.iut-bm.univ-fcomte.fr>
Fri, 22 May 2015 08:26:03 +0000 (10:26 +0200)
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1  2 
main.tex
sdd.tex

diff --combined main.tex
index 0893d3b0f4388f4792fedbf6b9be69b0c2d0fdf1,a31f0bd8962debdbd302597e10104ef33fd924cf..27c159c8017829f0a7909829d1402375a90a4494
+++ b/main.tex
  \newcommand{\Bool}[0]{\ensuremath{\mathds{B}}}
  \newcommand{\rel}[0]{\ensuremath{{\mathcal{R}}}}
  \newcommand{\Gall}[0]{\ensuremath{\mathcal{G}}}
 -\newcommand{\Sec}[1]{Sect\,\ref{#1}}
 +\newcommand{\Sec}[1]{Section\,\ref{#1}}
  \newcommand{\Fig}[1]{{\sc Figure}~\ref{#1}}
  \newcommand{\Alg}[1]{Algorithme~\ref{#1}}
  \newcommand{\Tab}[1]{Tableau~\ref{#1}}
@@@ -139,12 -139,9 +139,12 @@@ Blabla blabla
  
  \mainmatter
  
 -\part{Système Booléens}
 +\part{Réseaux Discrets}
  
 -\chapter{Iterations discrètes de Systèmes Dynamiques booléens}
 +
 +
 +\chapter{Iterations discrètes de réseaux booléens}
 +\JFC{chapeau à refaire}
  \section{Formalisation}
  \input{sdd}
  
  
  
  \section{Conclusion}
 +\JFC{Conclusion à refaire}
 +
  Introduire de l'asynchronisme peut permettre de réduire le temps 
  d'exécution global, mais peut aussi introduire de la divergence. 
  Dans ce chapitre, nous avons exposé comment construire un mode combinant les
@@@ -165,7 -160,7 +165,7 @@@ de l'asynchronisme en terme de vitesse 
  
  
  
 -\chapter[Preuve de convergence de systèmes booléens]{Preuve automatique de  convergence de systèmes booléens}\label{chap:promela}
 +\chapter[Preuve de convergence de systèmes booléens]{Preuve automatique de  convergence}\label{chap:promela}
  \input{modelchecking}
  
  
@@@ -178,14 -173,23 +178,23 @@@ au chaos
  
  \chapter{Characterisation des systèmes 
    discrets chaotiques}
+ La première section  rappelle ce que sont les systèmes dynamiques chaotiques.
  Dire que cette caractérisation dépend du type de stratégie : unaire (TIPE), 
  généralisée (TSI).  Pour chacune d'elle, 
  on introduit une distance différente.
  
  On montre qu'on a des résultats similaires.
  
+ \section{Systèmes dynamiques chaotiques selon Devaney}
+ \label{subsec:Devaney}
+ \input{devaney}
+ \section{Schéma unaire}
  \input{12TIPE}
  
+ \section{Schéma généralisé}
+ \input{15TSI}
  
  
  générer des fonctions vérifiant ceci (TIPE12 juste sur le résultat d'adrien).
  
  
  
 -% \part{Conclusion et Perspectives}
 +
 + \part{Conclusion et Perspectives}
 +
 +\JFC{Perspectives pour SDD->Promela}
 +Among drawbacks of the method,  one can argue that bounded delays is only 
 +realistic in practice for close systems. 
 +However, in real large scale distributed systems where bandwidth is weak, 
 +this restriction is too strong. In that case, one should only consider that 
 +matrix $s^{t}$ follows the  iterations of the system, \textit{i.e.},
 +for all $i$, $j$, $1 \le i \le j \le n$,  we have$
 +\lim\limits_{t \to \infty} s_{ij}^t = + \infty$. 
 +One challenge of this work should consist in weakening this constraint. 
 +We plan as future work to take into account other automatic approaches 
 +to discharge proofs notably by deductive analysis~\cite{CGK05}. 
 +
  
  % \chapter{Conclusion}
  
  \input{annexecontinuite.tex}
  
  
  \section{Caractérisation des fonctions $f$ rendant chaotique $G_f$ dans $(\mathcal{X},d)$}\label{anx:chaos:unaire}
  \input{caracunaire.tex}
  
  
+ \section{Preuve que $d$ est une distance sur $\mathcal{X}$}\label{anx:distance:generalise}
+ \input{preuveDistanceGeneralisee}
  
+ \section{Caractérisation des fonctions $f$ rendant chaotique $G_f$ dans $(\mathcal{X},d)$}\label{anx:chaos:generalise}
+ \input{caracgeneralise.tex}
  
  
  
diff --combined sdd.tex
index c1651027c6dce5248529fffa7995f52feb76be8e,eb51e976503cd687809ef51356dfc8b4ad9adb62..2352fadd17bb7a6c86e3ffe315fb07f88bbe31c7
+++ b/sdd.tex
@@@ -23,32 -23,32 +23,32 @@@ de conjonction \og . \fg{} e
  unaire de négation \og $\overline{\mathstrut\enskip}$ \fg{}.
  
  
- Soit $n$ un entier naturel.
- On introduit quelques notations à propos d'éléments de $\Bool^n$. 
- L'ensemble $\{1,\dots, n\}$ sera par la suite noté $[n]$.
+ Soit ${\mathsf{N}}$ un entier naturel.
+ On introduit quelques notations à propos d'éléments de $\Bool^{\mathsf{N}}$. 
+ L'ensemble $\{1,\dots, {\mathsf{N}}\}$ sera par la suite noté $[{\mathsf{N}}]$.
  Le $i^{\textrm{ème}}$ composant d'un élément 
- $x \in \Bool^n$ s'écrit  $x_i$.
- Si l'ensemble $I$ est une partie de $[n]$, alors 
- $\overline{x}^I$ est l'élément $y\in  \Bool^n$
+ $x \in \Bool^{\mathsf{N}}$ s'écrit  $x_i$.
+ Si l'ensemble $I$ est une partie de $[{\mathsf{N}}]$, alors 
+ $\overline{x}^I$ est l'élément $y\in  \Bool^{\mathsf{N}}$
  tel que $y_i = 1 - x_i$ si $i\in I$ et  
  $y_i = x_i$ sinon. 
- On considère les deux abréviations $\overline{x}$ pour $\overline{x}^{[n]}$ 
+ On considère les deux abréviations $\overline{x}$ pour $\overline{x}^{[{\mathsf{N}}]}$ 
  (chaque composant de $\overline{x}$ est nié:
  c'est une négation composante à composante)
- et $\overline{x}^i$ pour $\overline{x}^{\{i\}}$ pour $i \in [n]$
+ et $\overline{x}^i$ pour $\overline{x}^{\{i\}}$ pour $i \in [{\mathsf{N}}]$
  (seul $x_i$ est nié dans $\overline{x}$).
- Pour tout $x$ et  $y$ dans  $\Bool^n$, l'ensemble 
- $\Delta(x, y)$,  contient les $i \in [n]$
+ Pour tout $x$ et  $y$ dans  $\Bool^{\mathsf{N}}$, l'ensemble 
+ $\Delta(x, y)$,  contient les $i \in [{\mathsf{N}}]$
  tels que $x_i \neq y_i$.
- Soit enfin $f : \Bool^n \rightarrow \Bool^n$. Son $i^{\textrm{ème}}$ composant
- est nommé $f_i$ qui est une fonction de $\Bool^n$ dans $\Bool$.
+ Soit enfin $f : \Bool^n \rightarrow \Bool^{\mathsf{N}}$. Son $i^{\textrm{ème}}$ composant
+ est nommé $f_i$ qui est une fonction de $\Bool^{\mathsf{N}}$ dans $\Bool$.
  Pour chaque 
- $x$ dans $\Bool^n$, l'ensemble 
+ $x$ dans $\Bool^{\mathsf{N}}$, l'ensemble 
  $\Delta f(x)$ est défini par $\Delta f(x) = \Delta(x,f(x))$.
  On peut admettre que $f (x) = \overline{x}^{\Delta f(x)}$ .
  
  \begin{xpl}\label{xpl:1}
- On considère $n= 3$ et $f:\Bool^3 \rightarrow \Bool^3$ telle que
+ On considère ${\mathsf{N}}= 3$ et $f:\Bool^3 \rightarrow \Bool^3$ telle que
  $f(x)=(f_1(x),f_2(x),f_3(x))$ avec  
  $$\begin{array}{rcl}
  f_1(x_1, x_2, x_3) &=& (\overline{x_1} + \overline{x_2}).x_3 \textrm{, }\\
@@@ -110,58 -110,64 +110,64 @@@ d'éléments étudiés (gènes, protéi
  Un réseau booléen  est 
  défini à partir d'une fonction booléenne:
  \[
- f:\Bool^n\to\Bool^n,\qquad x=(x_1,\dots,x_n)\mapsto f(x)=(f_1(x),\dots,f_n(x)),
+ f:\Bool^{\mathsf{N}}\to\Bool^{\mathsf{N}},\qquad x=(x_1,\dots,x_{\mathsf{N}})\mapsto f(x)=(f_1(x),\dots,f_{\mathsf{N}}(x)),
  \]
- et un  {\emph{schéma itératif}} ou  encore \emph{mode de  mise à jour}. À  partir d'une configuration initiale $x^0\in\Bool^n$,  la suite $(x^{t})^{t
+ et un  {\emph{schéma itératif}} ou  encore \emph{mode de  mise à jour}. À  partir d'une configuration initiale $x^0\in\Bool^{\mathsf{N}}$,  la suite $(x^{t})^{t
    \in  \Nats}$ des  configurations  du  système est  construite  selon l'un  des
  schémas suivants :
  \begin{itemize}
  \item \textbf{Schéma parallèle  synchrone :} basé sur la  relation de récurrence
-   $x^{t+1}=f(x^t)$. Tous  les $x_i$, $1 \le  i \le n$,  sont ainsi mis à  jour à
+   $x^{t+1}=f(x^t)$. Tous  les $x_i$, $1 \le  i \le {\mathsf{N}}$,  sont ainsi mis à  jour à
    chaque itération en utilisant l'état global précédent du système $x^t$.
  \item \textbf{Schéma  unaire :} ce schéma  est parfois 
    qualifié de chaotique 
    dans  la littérature. 
    Il  consiste à modifier la valeur 
-   d'un unique élément $i$,  $1 \le i \le  n$, à
+   d'un unique élément $i$,  $1 \le i \le  {\mathsf{N}}$, à
    chaque itération. Le choix de l'élément qui est modifié à chaque itération est
    défini  par une  suite 
    $S  = \left(s^t\right)^{t \in  \mathds{N}}$ qui est  une séquence
-   d'indices dans $[n]$. Cette suite est appelée \emph{stratégie unaire}. 
-   Il est basé sur la relation définie pour tout $i \in [n]$ par
-   $$
+   d'indices dans $[{\mathsf{N}}]$. Cette suite est appelée \emph{stratégie unaire}. 
+   Il est basé sur la relation définie pour tout $i \in [{\mathsf{N}}]$ par
+   
+ \begin{equation}
    x^{t+1}_i=
    \left\{ \begin{array}{l}
        f_i(x^t) \textrm{ si } i=s^t, \\
        x^t_i\textrm{ sinon.}
      \end{array}
-   \right.$$
+   \right.
+ \label{eq:schema:unaire}
+ \end{equation}
  
  
  
  \item \textbf{Schéma généralisé:}  dans ce schéma, ce sont les valeurs  
-   d'un ensemble d'éléments de $[n]$ qui sont modifiées à  chaque  itération.
+   d'un ensemble d'éléments de $[{\mathsf{N}}]$ qui sont modifiées à  chaque  itération.
    Dans  le  cas  particulier où  c'est la valeur d'un  singleton
-   $\{k\}$, $1 \le k  \le n$, qui est modifiée à
+   $\{k\}$, $1 \le k  \le {\mathsf{N}}$, qui est modifiée à
    chaque  itération, on retrouve le
    mode unaire. Dans le second cas particulier où ce sont les valeurs de 
-   tous les éléments de $\{1, \ldots,  n\}$ qui sont  modifiées
+   tous les éléments de $\{1, \ldots,  {\mathsf{N}}\}$ qui sont  modifiées
    à chaque  itération, on retrouve  le mode
    parallèle.  Ce mode généralise donc les deux modes précédents.  
    Plus formellement,  à  la  $t^{\textrm{ème}}$
    itération, seuls les éléments de la partie 
-   $s^{t} \in \mathcal{P}([n])$ sont mis à
+   $s^{t} \in \mathcal{P}([{\mathsf{N}}])$ sont mis à
    jour.  La  suite $S  = \left(s^t\right)^{t \in  \mathds{N}}$ est  une séquence
    de sous-ensembles 
-   de   $[n]$   appelée   \emph{stratégie généralisée}.
-   Il est basé sur la relation définie pour tout $i \in [n]$ par
-   $$
+   de   $[{\mathsf{N}}]$   appelée   \emph{stratégie généralisée}.
+   Il est basé sur la relation définie pour tout $i \in [{\mathsf{N}}]$ par
+   \begin{equation}
    x^{t+1}_i=
    \left\{ \begin{array}{l}
        f_i(x^t) \textrm{ si } i \in s^t, \\
        x^t_i\textrm{ sinon.}
      \end{array}
-   \right.$$
+   \right.
+ \label{eq:schema:generalise}
+ \end{equation}
  
  
  
@@@ -176,22 -182,22 +182,22 @@@ La section suivante détaille comment r
  
  
  
- Pour un entier naturel $n$ et une 
- fonction $f : B^n \rightarrow B^n$, plusieurs évolutions sont possibles
+ Pour un entier naturel ${\mathsf{N}}$ et une 
+ fonction $f : B^{\mathsf{N}} \rightarrow B^{\mathsf{N}}$, plusieurs évolutions sont possibles
  en fonction du schéma itératif retenu. 
  Celles-ci sont représentées par un graphe orienté dont les noeuds 
- sont les éléments de $\Bool^n$ (voir \textsc{Figure}~\ref{fig:xpl:graphs}).
+ sont les éléments de $\Bool^{\mathsf{N}}$ (voir \textsc{Figure}~\ref{fig:xpl:graphs}).
  
  
  \begin{itemize}
  \item Le \emph{graphe des itérations synchrones} de $f$, noté $\textsc{gis}(f)$ 
- est le graphe orienté de $\Bool^n$ qui contient un arc $x \rightarrow y$ si 
+ est le graphe orienté de $\Bool^{\mathsf{N}}$ qui contient un arc $x \rightarrow y$ si 
  et seulement si $y=f(x)$.
  \item Le \emph{graphe des itérations unaires} de $f$, noté $\textsc{giu}(f)$
- est le graphe orienté de $\Bool^n$ qui contient un arc $x \rightarrow y$ si 
+ est le graphe orienté de $\Bool^{\mathsf{N}}$ qui contient un arc $x \rightarrow y$ si 
  et seulement s'il existe $x \in \Delta f(x)$ tel que $y = \overline{x}^i$.
  \item Le \emph{graphe des itérations généralisées} de $f$, noté $\textsc{gig}(f)$
- est le graphe orienté de $\Bool^n$ qui contient un arc $x \rightarrow y$ si 
+ est le graphe orienté de $\Bool^{\mathsf{N}}$ qui contient un arc $x \rightarrow y$ si 
  et seulement s'il existe un ensemble $I\subseteq \Delta f(x)$ tel que 
  $y = \overline{x}^I$. On peut remarquer que ce graphe contient comme 
  sous-graphe à la fois celui des itérations synchrones et celui 
@@@ -209,7 -215,7 +215,7 @@@ d'images (\textsc{Table}~\ref{table:xpl
  La \textsc{Figure}~\ref{fig:xpl:graphs} donne les trois graphes d'itérations 
  associés à $f$.
  
 -\begin{figure}[ht]
 +\begin{figure}%[ht]
    \begin{center}
      \subfigure[$\textsc{gis}(f)$]{
        \begin{minipage}{0.33\textwidth}
@@@ -251,7 -257,7 +257,7 @@@ On remarque le cycle $((101,111),(111,0
  \subsection{Attracteurs}
  
  On dit que le point 
- $x \in \Bool^n$ est un \emph{point fixe} de $f$ si  $x = f (x)$.
+ $x \in \Bool^{\mathsf{N}}$ est un \emph{point fixe} de $f$ si  $x = f (x)$.
  Les points fixes sont particulièrement intéressants car ils correspondent 
  aux états stables:
  dans chaque graphe d'itérations, le point $x$ est un point fixe 
@@@ -259,12 -265,12 +265,12 @@@ si et seulement si il est son seul succ
  
  
  
- Soit $\Gamma$ un graphe d'itérations (synchrones, unaires ou généralisées)
+ Soit un graphe d'itérations (synchrones, unaires ou généralisées)
  de $f$. 
- Les \emph{attracteurs}  de $\Gamma$ sont les 
+ Les \emph{attracteurs}  de ce graphe sont les 
  plus petits sous-ensembles (au sens de l'inclusion) non vides
- $A \subseteq \Bool^n$ tels que pour tout arc
- $x \rightarrow y$ de $\Gamma$, si $x$ est un élément de $A$, alors 
+ $A \subseteq \Bool^{\mathsf{N}}$ tels que pour tout arc
+ $x \rightarrow y$, si $x$ est un élément de $A$, alors 
  $y$ aussi.
  Un attracteur qui contient au moins deux éléments  est dit \emph{cyclique}.
  On en déduit qu'un attracteur cyclique ne contient pas de point fixe.
@@@ -277,12 -283,12 +283,12 @@@ On a la proposition suivante
  
  \begin{theorem}\label{Prop:attracteur}
  Le point $x$ est un point fixe si et seulement si 
- $\{x\}$ est un attracteur de $\Gamma$.
- En d'autres termes, les attracteurs non cycliques de $\Gamma$ 
+ $\{x\}$ est un attracteur du graphe d'itération (synchrone, unaire, généralisé).
+ En d'autres termes, les attracteurs non cycliques de celui-ci 
  sont les points fixes de $f$.
- Ainsi pour chaque $x\in \Bool^n$, il existe au moins un chemin 
+ Ainsi pour chaque $x\in \Bool^{\mathsf{N}}$, il existe au moins un chemin 
  depuis $x$ qui atteint un attracteur.
- Ainsi $\Gamma$ contient toujours au moins un attracteur.
+ Ainsi tout graphe d'itérations contient toujours au moins un attracteur.
  \end{theorem}
  
  
@@@ -300,7 -306,7 +306,7 @@@ Les interactions entre les composants d
  système peuvent être mémorisées 
  dans la {\emph{matrice jacobienne discrète}} $f'$.
  Celle-ci est définie comme étant la fonction  qui  à chaque 
- configuration $x\in\Bool^n$ associe la matrice de taille 
+ configuration $x\in\Bool^{\mathsf{N}}$ associe la matrice de taille 
  $n\times n$ telle que 
  \begin{equation}
  f'(x)=(f'_{ij}(x)),\qquad 
@@@ -314,7 -320,7 +320,7 @@@ $\overline{x}^j_j$ et $x_j$ sont consid
   dans $\Z$.
  Lorsqu'on supprime les signes dans la matrice jacobienne discrète, 
  on obtient une matrice notée $B(f)$ aussi de taille 
- $n\times n$.
+ ${\mathsf{N}}\times {\mathsf{N}}$.
  Celle-ci mémorise uniquement 
  l'existence d'une dépendance de tel élément vis à vis de 
   tel élément.
@@@ -323,7 -329,7 +329,7 @@@ les uns par rapport aux autres. Cette m
  \emph{matrice d'incidence}.  
  
  \begin{theorem}
- Si $f_i$ ne dépend pas de $x_j$, alors pour tout $x\in [n]$, 
+ Si $f_i$ ne dépend pas de $x_j$, alors pour tout $x\in [{\mathsf{N}}]$, 
  $f_i(\overline{x}^j)$ est égal à  $f_i(x)$, \textit{i.e}, 
  $f'_{ij}(x)=0$. Ainsi $B(f)_{ij}$ est nulle. La réciproque est aussi vraie.
  \end{theorem} 
  
  En outre, les interactions peuvent se  représenter à l'aide d'un 
  graphe $\Gamma(f)$ orienté et signé défini ainsi: 
- l'ensemble des sommets est 
- $[n]$ et il existe un arc de $j$ à $i$ de signe
+ l'ensemble des sommet %s est 
+ $[{\mathsf{N}}]$ et il existe un arc de $j$ à $i$ de signe
   $s\in\{-1,1\}$, noté $(j,s,i)$, si $f_{ij}(x)=s$ pour au moins
- un $x\in\Bool^n$. 
+ un $x\in\Bool^{\mathsf{N}}$. 
  
  On note que la présence de 
  deux arcs de signes opposés entre deux sommets donnés 
@@@ -414,7 -420,7 +420,7 @@@ $x_1$ et  de $x_3
  Ainsi la seconde ligne (resp. la troisième ligne) de $B(f)$ est $1~0~1$ (resp. est $1~1~1$). 
  La \textsc{Figure}~(\ref{fig:f:incidence}) donne la matrice d'incidence complète. 
  
 -\begin{figure}[ht]
 +\begin{figure}%[ht]
    \begin{center}
       \subfigure[Matrice jacobienne]{
         \begin{minipage}{0.90\textwidth}
@@@ -515,28 -521,28 +521,28 @@@ arc positif (resp. un arc négatif) de 
  \subsection{Conditions de convergence}\label{sec:Robert:async}
  
  Parmi les itérations unaires caractérisées par leurs stratégies
- $S=(s^t)^{t \in \Nats}$ d'éléments appartenant à $[n]$,
+ $S=(s^t)^{t \in \Nats}$ d'éléments appartenant à $[{\mathsf{N}}]$,
  sont jugées intéressantes 
  celles qui activent au moins une fois
- chacun des $i\in[n]$. Dans le cas contraire, un élément n'est jamais modifié. 
+ chacun des $i\in[{\mathsf{N}}]$. Dans le cas contraire, un élément n'est jamais modifié. 
  
  Plus formellement, une séquence finie $S=(s^t)^{t \in \Nats}$
- est dite \emph{complète} relativement à $[n]$ si 
- tout indice de $[n]$
+ est dite \emph{complète} relativement à $[{\mathsf{N}}]$ si 
+ tout indice de $[{\mathsf{N}}]$
  s'y retrouve au moins une fois.
  
  Parmi toutes les stratégies unaires de 
- $[n]^{\Nats}$, on qualifie de:
+ $[{\mathsf{N}}]^{\Nats}$, on qualifie de:
  \begin{itemize}
  \item \emph{périodiques} celles 
  qui sont constituées par une répétition indéfinie 
- d'une même séquence $S$ complète relativement à $[n]$.
+ d'une même séquence $S$ complète relativement à $[{\mathsf{N}}]$.
  En particulier toute séquence périodique est complète.
  \item \emph{pseudo-périodiques} celles 
  qui sont constituées par une succession indéfinie de séquences 
  (de longueur éventuellement variable non supposée bornée) complètes.
  Autrement dit dans chaque stratégie pseudo-périodique, chaque indice de
- $1$ à $n$ revient indéfiniment.
+ $1$ à ${\mathsf{N}}$ revient indéfiniment.
  \end{itemize}
  
  
@@@ -547,14 -553,14 +553,14 @@@ dans le mode des itérations unaires
  \begin{theorem}\label{Th:conv:GIU}
  Si le graphe $\Gamma(f)$ n'a pas de cycle et si la stratégie unaire est
  pseudo-périodique, alors tout chemin de $\textsc{giu}(f)$ atteint 
- l'unique point fixe $\zeta$ en au plus $n$ pseudo-périodes.
+ l'unique point fixe $\zeta$ en au plus ${\mathsf{N}}$ pseudo-périodes.
  \end{theorem}
  
  Le qualificatif \emph{pseudo-périodique} peut aisément 
  s'étendre aux stratégies généralisées comme suit.
  Lorsqu'une stratégie généralisée est constituée d'une 
- succession indéfinie de séquences de parties de $[n]$ 
- dont l'union est $[n]$, cette stratégie est {pseudo-périodique}.
+ succession indéfinie de séquences de parties de $[{\mathsf{N}}]$ 
+ dont l'union est $[{\mathsf{N}}]$, cette stratégie est {pseudo-périodique}.
  J. Bahi~\cite{Bah00} a démontré le théorème suivant:
  
  \begin{theorem}\label{Th:Bahi}