mabase.bib

   1 % This file was created with JabRef 2.7.
   2 % Encoding: UTF8
   3
   4 @INPROCEEDINGS{AdelsbachKS06,
   5   author = {Andr{\'e} Adelsbach and Stefan Katzenbeisser and Ahmad-Reza Sadeghi},
   6   title = {A Computational Model for Watermark Robustness},
   7   booktitle = {Information Hiding},
   8   year = {2006},
   9   pages = {145-160},
  10   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  11   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
  12   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_10},
  13   owner = {guyeux},
  14   timestamp = {2009.06.29}
  15 }
  16
  17 @INPROCEEDINGS{BattiatoCGG99,
  18   author = {Sebastiano Battiato and Dario Catalano and Giovanni Gallo and Rosario
  19         Gennaro},
  20   title = {Robust Watermarking for Images Based on Color Manipulation},
  21   booktitle = {Information Hiding},
  22   year = {1999},
  23   pages = {302-317},
  24   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  25   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
  26   owner = {guyeux},
  27   timestamp = {2009.06.29}
  28 }
  29
  30 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05,
  31   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  32   title = {The Return of the Sensitivity Attack},
  33   booktitle = {IWDW},
  34   year = {2005},
  35   pages = {260-274},
  36   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  37   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
  38   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_20},
  39   owner = {guyeux},
  40   timestamp = {2009.06.29}
  41 }
  42
  43 @INPROCEEDINGS{ComesanaPP05bis,
  44   author = {Pedro Comesa{\~n}a and Luis P{\'e}rez-Freire and Fernando P{\'e}rez-Gonz{\'a}lez},
  45   title = {Fundamentals of Data Hiding Security and Their Application to Spread-Spectrum
  46         Analysis},
  47   booktitle = {IH'05: Information Hiding Workshop},
  48   year = {2005},
  49   pages = {146-160},
  50   publisher = {Lectures Notes in Computer Science, Springer-Verlag},
  51   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  52   crossref = {DBLP:conf/ih/2005},
  53   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11558859_12},
  54   owner = {guyeux},
  55   timestamp = {2009.06.30}
  56 }
  57
  58 @INPROCEEDINGS{CongJQZ06,
  59   author = {Jin Cong and Yan Jiang and Zhiguo Qu and Zhongmei Zhang},
  60   title = {A Wavelet Packets Watermarking Algorithm Based on Chaos Encryption},
  61   booktitle = {ICCSA (1)},
  62   year = {2006},
  63   pages = {921-928},
  64   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  65   crossref = {DBLP:conf/iccsa/2006-1},
  66   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11751540_100}
  67 }
  68
  69 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/DziembowskiP08,
  70   author = {Stefan Dziembowski and Krzysztof Pietrzak},
  71   title = {Leakage-Resilient Cryptography},
  72   booktitle = {FOCS},
  73   year = {2008},
  74   pages = {293-302},
  75   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  76   crossref = {DBLP:conf/focs/2008},
  77   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/FOCS.2008.56}
  78 }
  79
  80 @INCOLLECTION{Filiol10,
  81   author = {Eric Filiol},
  82   title = {Viruses and Malware},
  83   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
  84   year = {2010},
  85   pages = {747-769},
  86   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  87   crossref = {DBLP:reference/icsec/2010},
  88   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4_34}
  89 }
  90
  91 @INPROCEEDINGS{Filiol00,
  92   author = {Eric Filiol},
  93   title = {Decimation Attack of Stream Ciphers},
  94   booktitle = {INDOCRYPT},
  95   year = {2000},
  96   pages = {31-42},
  97   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
  98   crossref = {DBLP:conf/indocrypt/2000},
  99   ee = {http://link.springer.de/link/service/series/0558/bibs/1977/19770031.htm}
 100 }
 101
 102 @INPROCEEDINGS{Furon05,
 103   author = {Teddy Furon},
 104   title = {A Survey of Watermarking Security},
 105   booktitle = {IWDW},
 106   year = {2005},
 107   pages = {201-215},
 108   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 109   crossref = {DBLP:conf/iwdw/2005},
 110   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/11551492_16},
 111   owner = {guyeux},
 112   timestamp = {2009.06.29}
 113 }
 114
 115 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HiggsSHS10,
 116   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 117   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 118         prediction},
 119   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 120   year = {2010},
 121   pages = {1-8},
 122   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 123   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 124   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 125 }
 126
 127 @INPROCEEDINGS{Higgs2010,
 128   author = {Trent Higgs and Bela Stantic and Tamjidul Hoque and Abdul Sattar},
 129   title = {Genetic algorithm feature-based resampling for protein structure
 130         prediction},
 131   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 132   year = {2010},
 133   pages = {1-8},
 134   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 135   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 136   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586149}
 137 }
 138
 139 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/HorvathC10,
 140   author = {Dragos Horvath and Camelia Chira},
 141   title = {Simplified chain folding models as metaheuristic benchmark for tuning
 142         real protein folding algorithms?},
 143   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 144   year = {2010},
 145   pages = {1-8},
 146   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 147   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 148   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5585932}
 149 }
 150
 151 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/IslamC10,
 152   author = {Md. Kamrul Islam and Madhu Chetty},
 153   title = {Clustered memetic algorithm for protein structure prediction},
 154   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 155   year = {2010},
 156   pages = {1-8},
 157   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 158   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 159   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586187}
 160 }
 161
 162 @INPROCEEDINGS{Ker06,
 163   author = {Andrew D. Ker},
 164   title = {Batch Steganography and Pooled Steganalysis},
 165   booktitle = {Information Hiding},
 166   year = {2006},
 167   pages = {265-281},
 168   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 169   crossref = {DBLP:conf/ih/2006},
 170   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74124-4_18},
 171   owner = {guyeux},
 172   timestamp = {2009.06.29}
 173 }
 174
 175 @INPROCEEDINGS{Lin2009,
 176   author = {H.-Y. Lin and T.-C. Chiang},
 177   title = {Cooperative Secure Data Aggregation in Sensor Networks Using Elliptic
 178         Curve Based Cryptosystems},
 179   booktitle = {CDVE},
 180   year = {2009},
 181   pages = {384-387},
 182   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 183   crossref = {DBLP:conf/cdve/2009},
 184   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04265-2_58}
 185 }
 186
 187 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/MaimourPH09,
 188   author = {Moufida Maimour and CongDuc Pham and Doan B. Hoang},
 189   title = {A Congestion Control Framework for Handling Video Surveillance Traffics
 190         on WSN},
 191   booktitle = {CSE (2)},
 192   year = {2009},
 193   pages = {943-948},
 194   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 195   crossref = {DBLP:conf/cse/2009},
 196   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CSE.2009.200}
 197 }
 198
 199 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/MakhoulSP09,
 200   author = {Abdallah Makhoul and Rachid Saadi and CongDuc Pham},
 201   title = {Coverage and adaptive scheduling algorithms for criticality management
 202         on video wireless sensor networks},
 203   booktitle = {ICUMT},
 204   year = {2009},
 205   pages = {1-8},
 206   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 207   crossref = {DBLP:conf/icumt/2009},
 208   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/ICUMT.2009.5345630}
 209 }
 210
 211 @INPROCEEDINGS{Mittelholzer99,
 212   author = {Thomas Mittelholzer},
 213   title = {An Information-Theoretic Approach to Steganography and Watermarking},
 214   booktitle = {Information Hiding},
 215   year = {1999},
 216   pages = {1-16},
 217   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 218   crossref = {DBLP:conf/ih/1999},
 219   owner = {guyeux},
 220   timestamp = {2009.06.29}
 221 }
 222
 223 @INPROCEEDINGS{PellegriniBA10,
 224   author = {Andrea Pellegrini and Valeria Bertacco and Todd M. Austin},
 225   title = {Fault-based attack of RSA authentication},
 226   booktitle = {DATE},
 227   year = {2010},
 228   pages = {855-860},
 229   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 230   crossref = {DBLP:conf/date/2010},
 231   ee = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5456933}
 232 }
 233
 234 @INPROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/Perez-HernandezRG10,
 235   author = {Luis Germ{\'a}n P{\'e}rez-Hern{\'a}ndez and Katya Rodr\'{\i}guez-V{\'a}zquez
 236         and Ram{\'o}n Gardu{\~n}o-Ju{\'a}rez},
 237   title = {Estimation of 3D Protein Structure by means of parallel Particle
 238         Swarm Optimization},
 239   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation},
 240   year = {2010},
 241   pages = {1-8},
 242   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 243   crossref = {DBLP:conf/cec/2010},
 244   ee = {http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586549}
 245 }
 246
 247 @INPROCEEDINGS{WangNHZH07,
 248   author = {Chuntao Wang and Jiangqun Ni and Jiwu Huang and Rongyue Zhang and
 249         Meiying Huang},
 250   title = {Robust and High Capacity Image Watermarking Based on Jointly Coding
 251         and Embedding Optimization},
 252   booktitle = {Information Hiding},
 253   year = {2007},
 254   pages = {65-79},
 255   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 256   crossref = {DBLP:conf/ih/2007},
 257   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-77370-2_5},
 258   owner = {guyeux},
 259   timestamp = {2009.06.29}
 260 }
 261
 262 @INPROCEEDINGS{Zhao04,
 263   author = {Jian Zhao and Mingquan Zhou and Hongmei Xie and Jinye Peng and Xin
 264         Zhou},
 265   title = {A Novel Wavelet Image Watermarking Scheme Combined with Chaos Sequence
 266         and Neural Network},
 267   booktitle = {ISNN (2)},
 268   year = {2004},
 269   pages = {663-668},
 270   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
 271   crossref = {DBLP:conf/isnn/2004-2},
 272   ee = {http://springerlink.metapress.com/openurl.asp?genre=article{\&}issn=0302-9743{\&}volume=3174{\&}spage=663}
 273 }
 274
 275 @INPROCEEDINGS{Acharya05securecomparison,
 276   author = {Acharya, Mithun and Girao, Joao and Westhoff, Dirk},
 277   title = {Secure Comparison of Encrypted Data in Wireless Sensor Networks},
 278   booktitle = {WIOPT '05: Proceedings of the Third International Symposium on Modeling
 279         and Optimization in Mobile, Ad Hoc, and Wireless Networks},
 280   year = {2005},
 281   pages = {47--53},
 282   address = {Washington, DC, USA},
 283   publisher = {IEEE Computer Society},
 284   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/WIOPT.2005.44},
 285   isbn = {0-7695-2267-X}
 286 }
 287
 288 @INPROCEEDINGS{Acimez07onthe,
 289   author = {Onur Acıi\c{c}mez and \c{C}etin Kaya Ko\c{c} and Jean-Pierre Seifert},
 290   title = {On the power of simple branch prediction analysis },
 291   booktitle = {2007 ACM Symposium on Information, Computer and Communications Security
 292         (ASIACCS'07)},
 293   year = {2007},
 294   pages = {312--320},
 295   publisher = {ACM Press}
 296 }
 297
 298 @ARTICLE{Adler65,
 299   author = {R. L. Adler and A. G. Konheim and M. H. McAndrew},
 300   title = {Topological entropy},
 301   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
 302   year = {1965},
 303   volume = {114},
 304   pages = {309-319},
 305   owner = {guyeux},
 306   timestamp = {2008.05.29}
 307 }
 308
 309 @INPROCEEDINGS{Agrawal04,
 310   author = {Agrawal, Rakesh and Kiernan, Jerry and Srikant, Ramakrishnan and
 311         Xu, Yirong},
 312   title = {Order preserving encryption for numeric data},
 313   booktitle = {SIGMOD '04: Proceedings of the 2004 ACM SIGMOD international conference
 314         on Management of data},
 315   year = {2004},
 316   pages = {563--574},
 317   address = {New York, NY, USA},
 318   publisher = {ACM},
 319   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1007568.1007632},
 320   isbn = {1-58113-859-8},
 321   location = {Paris, France}
 322 }
 323
 324 @ARTICLE{Anfinsen20071973,
 325   author = {Anfinsen, Christian B.},
 326   title = {Principles that Govern the Folding of Protein Chains},
 327   journal = {Science},
 328   year = {1973},
 329   volume = {181},
 330   pages = {223-230},
 331   number = {4096},
 332   doi = {10.1126/science.181.4096.223},
 333   eprint = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.full.pdf},
 334   url = {http://www.sciencemag.org/content/181/4096/223.short}
 335 }
 336
 337 @ARTICLE{Arques1994,
 338   author = {D. G. Arques and C. J. Michel},
 339   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine autocorrelation function
 340         after and before random mutations.},
 341   journal = {Math Biosci},
 342   year = {1994},
 343   volume = {123},
 344   pages = {103--125},
 345   number = {1},
 346   month = {Sep},
 347   abstract = {The mutation process is a classical evolutionary genetic process.
 348         The type of mutations studied here is the random substitutions of
 349         a purine base R (adenine or guanine) by a pyrimidine base Y (cytosine
 350         or thymine) and reciprocally (transversions). The analytical expressions
 351         derived allow us to analyze in genes the occurrence probabilities
 352         of motifs and d-motifs (two motifs separated by any d bases) on the
 353         R/Y alphabet under transversions. These motif probabilities can be
 354         obtained after transversions (in the evolutionary sense; from the
 355         past to the present) and, unexpectedly, also before transversions
 356         (after back transversions, in the inverse evolutionary sense, from
 357         the present to the past). This theoretical part in Section 2 is a
 358         first generalization of a particular formula recently derived. The
 359         application in Section 3 is based on the analytical expression giving
 360         the autocorrelation function (the d-motif probabilities) before transversions.
 361         It allows us to study primitive genes from actual genes. This approach
 362         solves a biological problem. The protein coding genes of chloroplasts
 363         and mitochondria have a preferential occurrence of the 6-motif YRY(N)6YRY
 364         (maximum of the autocorrelation function for d = 6, N = R or Y) with
 365         a periodicity modulo 3. The YRY(N)6YRY preferential occurrence without
 366         the periodicity modulo 3 is also observed in the RNA coding genes
 367         (ribosomal, transfer, and small nuclear RNA genes) and in the noncoding
 368         genes (introns and 5' regions of eukaryotic nuclei). However, there
 369         are two exceptions to this YRY(N)6YRY rule: the protein coding genes
 370         of eukaryotic nuclei, and prokaryotes, where YRY(N)6YRY has the second
 371         highest value after YRY(N)0YRY (YRYYRY) with a periodicity modulo
 372         3. When we go backward in time with the analytical expression, the
 373         protein coding genes of both eukaryotic nuclei and prokaryotes retrieve
 374         the YRY(N)6YRY preferential occurrence with a periodicity modulo
 375         3 after 0.2 back transversions per base. In other words, the actual
 376         protein coding genes of chloroplasts and mitochondria are similar
 377         to the primitive protein coding genes of eukaryotic nuclei and prokaryotes.
 378         On the other hand, this application represents the first result concerning
 379         the mutation process in the model of DNA sequence evolution we recently
 380         proposed. According to this model, the actual genes on the R/Y alphabet
 381         derive from two successive evolutionary genetic processes: an independent
 382         mixing of a few nonrandom types of oligonucleotides leading to genes
 383         called primitive followed by a mutation process in these primitive
 384         genes.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)},
 385   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 386         France.},
 387   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Mathematics; Models,
 388         Genetic; Mutation; Probability; Proteins, genetics; Purines; Pyrimidines},
 389   language = {eng},
 390   medline-pst = {ppublish},
 391   owner = {guyeux},
 392   pii = {0025-5564(94)90020-5},
 393   pmid = {7949744},
 394   timestamp = {2011.05.05}
 395 }
 396
 397 @ARTICLE{Arques1998,
 398   author = {D. G. Arquès and J. P. Fallot and C. J. Michel},
 399   title = {An evolutionary analytical model of a complementary circular code
 400         simulating the protein coding genes, the 5' and 3' regions.},
 401   journal = {Bull Math Biol},
 402   year = {1998},
 403   volume = {60},
 404   pages = {163--194},
 405   number = {1},
 406   month = {Jan},
 407   abstract = {The self-complementary subset T0 = X0 [symbol: see text] ¿AAA, TTT¿
 408         with X0 = ¿AAC, AAT, ACC, ATC, ATT, CAG, CTC, CTG, GAA, GAC, GAG,
 409         GAT, GCC, GGC, GGT, GTA, GTC, GTT, TAC, TTC¿ of 22 trinucleotides
 410         has a preferential occurrence in the frame 0 (reading frame established
 411         by the ATG start trinucleotide) of protein (coding) genes of both
 412         prokaryotes and eukaryotes. The subsets T1 = X1 [symbol: see text]
 413         ¿CCC¿ and T2 = X2 [symbol: see text] ¿GGG¿ of 21 trinucleotides have
 414         a preferential occurrence in the shifted frames 1 and 2 respectively
 415         (frame 0 shifted by one and two nucleotides respectively in the 5'-3'
 416         direction). T1 and T2 are complementary to each other. The subset
 417         T0 contains the subset X0 which has the rarity property (6 x 10(-8)
 418         to be a complementary maximal circular code with two permutated maximal
 419         circular codes X1 and X2 in the frames 1 and 2 respectively. X0 is
 420         called a C3 code. A quantitative study of these three subsets T0,
 421         T1, T2 in the three frames 0, 1, 2 of protein genes, and the 5' and
 422         3' regions of eukaryotes, shows that their occurrence frequencies
 423         are constant functions of the trinucleotide positions in the sequences.
 424         The frequencies of T0, T1, T2 in the frame 0 of protein genes are
 425         49, 28.5 and 22.5\% respectively. In contrast, the frequencies of
 426         T0, T1, T2 in the 5' and 3' regions of eukaryotes, are independent
 427         of the frame. Indeed, the frequency of T0 in the three frames of
 428         5' (respectively 3') regions is equal to 35.5\% (respectively 38\%)
 429         and is greater than the frequencies T1 and T2, both equal to 32.25\%
 430         (respectively 31\%) in the three frames. Several frequency asymmetries
 431         unexpectedly observed (e.g. the frequency difference between T1 and
 432         T2 in the frame 0), are related to a new property of the subset T0
 433         involving substitutions. An evolutionary analytical model at three
 434         parameters (p, q, t) based on an independent mixing of the 22 codons
 435         (trinucleotides in frame 0) of T0 with equiprobability (1/22) followed
 436         by t approximately 4 substitutions per codon according to the proportions
 437         p approximately 0.1, q approximately 0.1 and r = 1 - p - q approximately
 438         0.8 in the three codon sites respectively, retrieves the frequencies
 439         of T0, T1, T2 observed in the three frames of protein genes and explains
 440         these asymmetries. Furthermore, the same model (0.1, 0.1, t) after
 441         t approximately 22 substitutions per codon, retrieves the statistical
 442         properties observed in the three frames of the 5' and 3' regions.
 443         The complex behaviour of these analytical curves is totally unexpected
 444         and a priori difficult to imagine.},
 445   doi = {10.1006/bulm.1997.0033},
 446   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Marne la Vallée, Institut
 447         Gaspard Monge, Noisy Le Grand, France. arques@univ-mlv.fr},
 448   keywords = {Animals; Biological Evolution; Codon, genetics; Genetic Code; Humans;
 449         Mammals; Models, Genetic; Probability; Proteins, genetics; Rodentia;
 450         Vertebrates},
 451   language = {eng},
 452   medline-pst = {ppublish},
 453   owner = {guyeux},
 454   pii = {S0092-8240(97)90033-1},
 455   pmid = {9530018},
 456   timestamp = {2011.05.05},
 457   url = {http://dx.doi.org/10.1006/bulm.1997.0033}
 458 }
 459
 460 @ARTICLE{Arques1993,
 461   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 462   title = {Analytical expression of the purine/pyrimidine codon probability
 463         after and before random mutations.},
 464   journal = {Bull Math Biol},
 465   year = {1993},
 466   volume = {55},
 467   pages = {1025--1038},
 468   number = {6},
 469   month = {Nov},
 470   abstract = {Recently, we proposed a new model of DNA sequence evolution (Arquès
 471         and Michel. 1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772) according to which
 472         actual genes on the purine/pyrimidine (R/Y) alphabet (R = purine
 473         = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine) are the
 474         result of two successive evolutionary genetic processes: (i) a mixing
 475         (independent) process of non-random oligonucleotides (words of base
 476         length less than 10: YRY(N)6, YRYRYR and YRYYRY are so far identified;
 477         N = R or Y) leading to primitive genes (words of several hundreds
 478         of base length) and followed by (ii) a random mutation process, i.e.,
 479         transformations of a base R (respectively Y) into the base Y (respectively
 480         R) at random sites in these primitive genes. Following this model
 481         the problem investigated here is the study of the variation of the
 482         8 R/Y codon probabilities RRR, ..., YYY under random mutations. Two
 483         analytical expressions solved here allow analysis of this variation
 484         in the classical evolutionary sense (from the past to the present,
 485         i.e., after random mutations), but also in the inverted evolutionary
 486         sense (from the present to the past, i.e., before random mutations).
 487         Different properties are also derived from these formulae. Finally,
 488         a few applications of these formulae are presented. They prove the
 489         proposition in Arquès and Michel (1990b. Bull. math. Biol. 52, 741-772),
 490         Section 3.3.2, with the existence of a maximal mean number of random
 491         mutations per base of the order 0.3 in the protein coding genes.
 492         They also confirm the mixing process of oligonucleotides by excluding
 493         the purine/pyrimidine contiguous and alternating tracts from the
 494         formation process of primitive genes.},
 495   institution = {Université de Franche-Comté, Besançon, France.},
 496   keywords = {Base Sequence; Codon; DNA, chemistry/genetics; Mathematics; Models,
 497         Genetic; Mutation; Probability; Purines; Pyrimidines},
 498   language = {eng},
 499   medline-pst = {ppublish},
 500   owner = {guyeux},
 501   pmid = {8281128},
 502   timestamp = {2011.05.05}
 503 }
 504
 505 @ARTICLE{Arques1993b,
 506   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 507   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 508         common to different eukaryotic gene subpopulations.},
 509   journal = {Biochimie},
 510   year = {1993},
 511   volume = {75},
 512   pages = {399--407},
 513   number = {5},
 514   abstract = {The nucleotide distribution in protein coding genes, introns and transfer
 515         RNA genes of eukaryotic subpopulations (primates, rodent and mammals)
 516         is studied by autocorrelation functions. The autocorrelation function
 517         analysing the occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY (YRY-function)
 518         in protein coding genes and transfer RNA genes of these three eukaryotic
 519         subpopulations retrieves the preferential occurrence of YRY(N)6YRY
 520         (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine = cytosine or thymine,
 521         N = R or Y). The autocorrelation functions analysing the occurrence
 522         probability of the i-motifs RRR(N)iRRR (RRR-function) and YYY(N)iYYY
 523         (YYY-function) identify new non-random genetic statistical properties
 524         in these three eukaryotic subpopulations, mainly: i) in their protein
 525         coding genes: local maxima for i identical to 6 [12] (peaks for i
 526         = 6, 18, 30, 42) with the RRR-function and local maxima for i identical
 527         to 8 [10] (peaks for i = 8, 18, 28) with the YYY-function; and ii)
 528         in their introns: local maxima for i identical to 3 [6] (peaks for
 529         i = 3, 9, 15) and a short linear decrease followed by a large exponential
 530         decrease both with the RRR- and YYY-functions. The non-random properties
 531         identified in eukaryotic intron subpopulations are modelised with
 532         a process of random insertions and deletions of nucleotides simulating
 533         the RNA editing.},
 534   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 535         d'Informatique de Besançon, France.},
 536   keywords = {Animals; Base Sequence; Data Interpretation, Statistical; Genes; Introns;
 537         Mammals; Models, Genetic; Primates; Probability; Proteins, genetics;
 538         RNA Editing; RNA, Transfer, genetics; Rodentia; Sequence Analysis,
 539         DNA},
 540   language = {eng},
 541   medline-pst = {ppublish},
 542   owner = {guyeux},
 543   pii = {0300-9084(93)90173-P},
 544   pmid = {8347726},
 545   timestamp = {2011.05.05}
 546 }
 547
 548 @ARTICLE{Arques1992,
 549   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 550   title = {A simulation of the genetic periodicities modulo 2 and 3 with processes
 551         of nucleotide insertions and deletions.},
 552   journal = {J Theor Biol},
 553   year = {1992},
 554   volume = {156},
 555   pages = {113--127},
 556   number = {1},
 557   month = {May},
 558   abstract = {Recently, a new genetic process termed RNA editing has been identified
 559         showing insertions and deletions of nucleotides in particular RNA
 560         molecules. On the other hand, there are a few non-random statistical
 561         properties in genes: in particular, the periodicity modulo 3 (P3)
 562         associated with an open reading frame, the periodicity modulo 2 (P2)
 563         associated with alternating purine/pyrimidine stretches, the YRY(N)6YRY
 564         preferential occurrence (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 565         = cytosine or thymine, N = R or Y) representing a "code" of the DNA
 566         helix pitch, etc. The problem investigated here is whether a process
 567         of the type RNA editing can lead to the non-random statistical properties
 568         commonly observed in genes. This paper will show in particular that:
 569         The process of insertions and deletions of mononucleotides in the
 570         initial sequence [YRY(N)3]* [series of YRY(N)3] can lead to the periodicity
 571         modulo 2 (P2). The process of insertions and deletions of trinucleotides
 572         in the initial sequence [YRY(N)6]* [series of YRY(N)6] can lead to
 573         the periodicity modulo 3 (P3) and the YRY(N)6YRY preferential occurrence.
 574         Furthermore, these two processes lead to a strong correlation with
 575         the reality, namely the mononucleotide insertion/deletion process,
 576         with the 5' eukaryotic regions and the trinucleotide insertion/deletion
 577         process, with the eukaryotic protein coding genes.},
 578   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 579         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 580   keywords = {Chromosome Deletion; Computer Simulation; Humans; Models, Genetic;
 581         Mutagenesis, genetics; RNA, genetics},
 582   language = {eng},
 583   medline-pst = {ppublish},
 584   owner = {guyeux},
 585   pmid = {1379311},
 586   timestamp = {2011.05.05}
 587 }
 588
 589 @ARTICLE{Arques1990,
 590   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 591   title = {Periodicities in coding and noncoding regions of the genes.},
 592   journal = {J Theor Biol},
 593   year = {1990},
 594   volume = {143},
 595   pages = {307--318},
 596   number = {3},
 597   month = {Apr},
 598   abstract = {Gene population statistical studies of protein coding genes and introns
 599         have identified two types of periodicities on the purine/pyrimidine
 600         alphabet: (i) the modulo 3 periodicity or coding periodicity (periodicity
 601         P3) in protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, viruses,
 602         chloroplasts, mitochondria, plasmids and in introns of viruses and
 603         mitochondria, and (ii) the modulo 2 periodicity (periodicity P2)
 604         in the eukaryotic introns. The periodicity study is herein extended
 605         to the 5' and 3' regions of eukaryotes, prokaryotes and viruses and
 606         shows: (i) the periodicity P3 in the 5' and 3' regions of eukaryotes.
 607         Therefore, these observations suggest a unitary and dynamic concept
 608         for the genes as for a given genome, the 5' and 3' regions have the
 609         genetic information for protein coding genes and for introns: (1)
 610         In the eukaryotic genome, the 5' (P2 and P3) and 3' (P2 and P3) regions
 611         have the information for protein coding genes (P3) and for introns
 612         (P2). The intensity of P3 is high in 5' regions and weak in 3' regions,
 613         while the intensity of P2 is weak in 5' regions and high in 3' regions.
 614         (2) In the prokaryotic genome, the 5' (P3) and 3' (P3) regions have
 615         the information for protein coding genes (P3). (3) In the viral genome,
 616         the 5' (P3) and 3' (P3) regions have the information for protein
 617         coding genes (P3) and for introns (P3). The absence of P2 in viral
 618         introns (in opposition to eukaryotic introns) may be related to the
 619         absence of P2 in 5' and 3' regions of viruses.},
 620   institution = {Université de Franche-Comté, Unité Associée CNRS No. 822, Besançon,
 621         France.},
 622   keywords = {Animals; Base Sequence; Eukaryotic Cells; Genes; Introns; Prokaryotic
 623         Cells; Purine Nucleotides; Pyrimidine Nucleotides; Repetitive Sequences,
 624         Nucleic Acid; Viruses, genetics},
 625   language = {eng},
 626   medline-pst = {ppublish},
 627   owner = {guyeux},
 628   pmid = {2385108},
 629   timestamp = {2011.05.05}
 630 }
 631
 632 @ARTICLE{Arques1990a,
 633   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel},
 634   title = {A model of DNA sequence evolution.},
 635   journal = {Bull Math Biol},
 636   year = {1990},
 637   volume = {52},
 638   pages = {741--772},
 639   number = {6},
 640   abstract = {Statistical studies of gene populations on the purine/pyrimidine alphabet
 641         have shown that the mean occurrence probability of the i-motif YRY(N)iYRY
 642         (R = purine, Y = pyrimidine, N = R or Y) is not uniform by varying
 643         i in the range, but presents a maximum at i = 6 in the following
 644         populations: protein coding genes of eukaryotes, prokaryotes, chloroplasts
 645         and mitochondria, and also viral introns, ribosomal RNA genes and
 646         transfer RNA genes (Arquès and Michel, 1987b, J. theor. Biol. 128,
 647         457-461). From the "universality" of this observation, we suggested
 648         that the oligonucleotide YRY(N)6 is a primitive one and that it has
 649         a central function in DNA sequence evolution (Arquès and Michel,
 650         1987b, J. theor. Biol. 128, 457-461). Following this idea, we introduce
 651         a concept of a model of DNA sequence evolution which will be validated
 652         according to a schema presented in three parts. In the first part,
 653         using the last version of the gene database, the YRY(N)6YRY preferential
 654         occurrence (maximum at i = 6) is confirmed for the populations mentioned
 655         above and is extended to some newly analysed populations: chloroplast
 656         introns, chloroplast 5' regions, mitochondrial 5' regions and small
 657         nuclear RNA genes. On the other hand, the YRY(N)6YRY preferential
 658         occurrence and periodicities are used in order to classify 18 gene
 659         populations. In the second part, we will demonstrate that several
 660         statistical features characterizing different gene populations (in
 661         particular the YRY(N)6YRY preferential occurrence and the periodicities)
 662         can be retrieved from a simple Markov model based on the mixing of
 663         the two oligonucleotides YRY(N)6 and YRY(N)3 and based on the percentages
 664         of RYR and YRY in the unspecified trinucleotides (N)3 of YRY(N)6
 665         and YRY(N)3. Several properties are identified and prove in particular
 666         that the oligonucleotide mixing is an independent process and that
 667         several different features are functions of a unique parameter. In
 668         the third part, the return of the model to the reality shows a strong
 669         correlation between reality and simulation concerning the presence
 670         of a large alternating purine/pyrimidine stretches and of periodicities.
 671         It also contributes to a greater understanding of biological reality,
 672         e.g. the presence or the absence of large alternating purine/pyrimidine
 673         stretches can be explained as being a simple consequence of the mixing
 674         of two particular oligonucleotides. Finally, we believe that such
 675         an approach is the first step toward a unified model of DNA sequence
 676         evolution allowing the molecular understanding of both the origin
 677         of life and the actual biological reality.},
 678   institution = {Université de Franche-Comté, Laboratoire d'Informatique de Besançon,
 679         Unité Associée CNRS No 822, France.},
 680   keywords = {Base Sequence; Biological Evolution; DNA, genetics; Genetics, Population;
 681         Models, Genetic},
 682   language = {eng},
 683   medline-pst = {ppublish},
 684   owner = {guyeux},
 685   pmid = {2279193},
 686   timestamp = {2011.05.05}
 687 }
 688
 689 @ARTICLE{Arques1993a,
 690   author = {D. G. Arquès and C. J. Michel and K. Orieux},
 691   title = {Identification and simulation of new non-random statistical properties
 692         common to different populations of eukaryotic non-coding genes.},
 693   journal = {J Theor Biol},
 694   year = {1993},
 695   volume = {161},
 696   pages = {329--342},
 697   number = {3},
 698   month = {Apr},
 699   abstract = {The autocorrelation function analysing the occurrence probability
 700         of the i-motif YRY(N)iYRY in genes allows the identification of mainly
 701         two periodicities modulo 2, 3 and the preferential occurrence of
 702         the motif YRY(N)6YRY (R = purine = adenine or guanine, Y = pyrimidine
 703         = cytosine or thymine, N = R or Y). These non-random genetic statistical
 704         properties can be simulated by an independent mixing of the three
 705         oligonucleotides YRYRYR, YRYYRY and YRY(N)6 (Arquès & Michel, 1990b).
 706         The problem investigated in this study is whether new properties
 707         can be identified in genes with other autocorrelation functions and
 708         also simulated with an oligonucleotide mixing model. The two autocorrelation
 709         functions analysing the occurrence probability of the i-motifs RRR(N)iRRR
 710         and YYY(N)iYYY simultaneously identify three new non-random genetic
 711         statistical properties: a short linear decrease, local maxima for
 712         i identical to 3[6] (i = 3, 9, etc) and a large exponential decrease.
 713         Furthermore, these properties are common to three different populations
 714         of eukaryotic non-coding genes: 5' regions, introns and 3' regions
 715         (see section 2). These three non-random properties can also be simulated
 716         by an independent mixing of the four oligonucleotides R8, Y8, RRRYRYRRR,
 717         YYYRYRYYY and large alternating R/Y series. The short linear decrease
 718         is a result of R8 and Y8, the local maxima for i identical to 3[6],
 719         of RRRYRYRRR and YYYRYRYYY, and the large exponential decrease, of
 720         large alternating R/Y series (section 3). The biological meaning
 721         of these results and their relation to the previous oligonucleotide
 722         mixing model are presented in the Discussion.},
 723   doi = {10.1006/jtbi.1993.1059},
 724   institution = {Equipe de Biologie Théorique, Université de Franche-Comté, Laboratoire
 725         d'Informatique de Besançon, France.},
 726   keywords = {Animals; Biological Evolution; Genes, genetics; Models, Genetic; Models,
 727         Statistical; Mutation, genetics; Oligonucleotides, genetics; Probability},
 728   language = {eng},
 729   medline-pst = {ppublish},
 730   owner = {guyeux},
 731   pii = {S0022-5193(83)71059-3},
 732   pmid = {8331957},
 733   timestamp = {2011.05.05},
 734   url = {http://dx.doi.org/10.1006/jtbi.1993.1059}
 735 }
 736
 737 @ARTICLE{Arroyo08,
 738   author = {David Arroyo and Gonzalo Alvarez and Veronica Fernandez},
 739   title = {On the inadequacy of the logistic map for cryptographic applications},
 740   journal = {X Reunión Española sobre Criptología y Seguridad de la Información
 741         (X RECSI)},
 742   year = {2008},
 743   volume = {1},
 744   pages = {77-82},
 745   owner = {christophe},
 746   timestamp = {2010.03.01}
 747 }
 748
 749 @MISC{Backofen99algorithmicapproach,
 750   author = {R. Backofen and S. Will and P. Clote},
 751   title = {Algorithmic Approach To Quantifying The Hydrophobic Force Contribution
 752         In Protein Folding},
 753   year = {1999}
 754 }
 755
 756 @INPROCEEDINGS{bcgr11:ip,
 757   author = {Bahi, Jacques and Couchot, Jean-fran\c{c}ois and Guyeux, Christophe
 758         and Richard, Adrien},
 759   title = {On the Link Between Strongly Connected Iteration Graphs and Chaotic
 760         Boolean Discrete-Time Dynamical Systems},
 761   booktitle = {FCT'11, 18th Int. Symp. on Fundamentals of Computation Theory},
 762   year = {2011},
 763   volume = {*},
 764   series = {LNCS},
 765   pages = {***--***},
 766   address = {Oslo, Norway},
 767   month = aug,
 768   note = {To appear},
 769   classement = {ACTI},
 770   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 771   equipe = {and},
 772   inhal = {no}
 773 }
 774
 775 @ARTICLE{bg10:ij,
 776   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe},
 777   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
 778   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
 779   year = {2010},
 780   volume = {4},
 781   pages = {167--181},
 782   number = {2},
 783   classement = {ACLI},
 784   doi = {10.1260/1748-3018.4.2.167},
 785   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 786   equipe = {and},
 787   impact-factor = {#},
 788   inhal = {no},
 789   isi-acro = {#},
 790   url = {http://dx.doi.org/10.1260/1748-3018.4.2.167}
 791 }
 792
 793 @INPROCEEDINGS{guyeux10ter,
 794   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe},
 795   title = {A new chaos-based watermarking algorithm},
 796   booktitle = {SECRYPT'10, Int. conf. on security and cryptography},
 797   year = {2010},
 798   pages = {455--458},
 799   address = {Athens, Greece},
 800   month = jul,
 801   publisher = {SciTePress},
 802   classement = {ACTI},
 803   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 804   equipe = {and},
 805   inhal = {no}
 806 }
 807
 808 @INPROCEEDINGS{bgc11:ip,
 809   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Cote, Nathalie},
 810   title = {Chaos of Protein Folding},
 811   booktitle = {IJCNN 2011, Int. Joint Conf. on Neural Networks},
 812   year = {2011},
 813   pages = {***--***},
 814   address = {San Jose, California, United States},
 815   month = jul,
 816   note = {To appear},
 817   classement = {ACTI},
 818   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 819   equipe = {and},
 820   inhal = {no}
 821 }
 822
 823 @INPROCEEDINGS{guyeux10bis,
 824   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 825   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 826         Networks},
 827   booktitle = {SENSORCOMM'10, 4-th Int. Conf. on Sensor Technologies and Applications},
 828   year = {2010},
 829   pages = {472--477},
 830   address = {Venice-Mestre, Italy},
 831   month = jul,
 832   classement = {ACTI},
 833   doi = {10.1109/SENSORCOMM.2010.76},
 834   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 835   equipe = {and},
 836   inhal = {no},
 837   url = {http://dx.doi.org/10.1109/SENSORCOMM.2010.76}
 838 }
 839
 840 @INPROCEEDINGS{guyeuxVictoria,
 841   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Makhoul, Abdallah},
 842   title = {Secure Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. Homomorphism
 843         versus Watermarking Approach},
 844   booktitle = {ADHOCNETS 2010, 2nd Int. Conf. on Ad Hoc Networks},
 845   year = {2010},
 846   volume = {49},
 847   series = {Lecture Notes in ICST},
 848   pages = {344--358},
 849   address = {Victoria, Canada},
 850   month = aug,
 851   classement = {ACTI},
 852   doi = {10.1007/978-3-642-17994-5_23},
 853   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 854   equipe = {and},
 855   inhal = {no},
 856   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5_23}
 857 }
 858
 859 @INPROCEEDINGS{bgs11:ip,
 860   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Salomon, Michel},
 861   title = {Building a Chaotic Proven Neural Network},
 862   booktitle = {ICCANS 2011, IEEE Int. Conf. on Computer Applications and Network
 863         Security},
 864   year = {2011},
 865   pages = {***--***},
 866   address = {Maldives, Maldives},
 867   month = may,
 868   classement = {ACTI},
 869   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 870   equipe = {and},
 871   inhal = {no}
 872 }
 873
 874 @INPROCEEDINGS{bgw10:ip,
 875   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 876   title = {A Pseudo Random Numbers Generator Based on Chaotic Iterations. Application
 877         to Watermarking},
 878   booktitle = {WISM 2010, Int. Conf. on Web Information Systems and Mining},
 879   year = {2010},
 880   volume = {6318},
 881   series = {LNCS},
 882   pages = {202--211},
 883   address = {Sanya, China},
 884   month = oct,
 885   classement = {ACTI},
 886   doi = {10.1007/978-3-642-16515-3_26},
 887   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 888   equipe = {and},
 889   inhal = {no},
 890   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-16515-3_26}
 891 }
 892
 893 @INPROCEEDINGS{bgw09:ip,
 894   author = {Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
 895   title = {A novel pseudo-random generator based on discrete chaotic iterations},
 896   booktitle = {INTERNET'09, 1-st Int. Conf. on Evolving Internet},
 897   year = {2009},
 898   pages = {71--76},
 899   address = {Cannes, France},
 900   month = aug,
 901   classement = {ACTI},
 902   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 903   equipe = {and},
 904   inhal = {no}
 905 }
 906
 907 @INPROCEEDINGS{bmg10:onp,
 908   author = {Bahi, Jacques and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 909   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 910         Networks for critical applications},
 911   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 912         et Applications Critiques de Surveillance},
 913   year = {2010},
 914   address = {Bayonne, France},
 915   month = jun,
 916   note = {Communication orale},
 917   classement = {COM},
 918   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
 919   equipe = {and},
 920   inhal = {no}
 921 }
 922
 923 @INPROCEEDINGS{guyeuxBayonne,
 924   author = {Bahi, Jacques and Makhoul, Abdallah and Guyeux, Christophe},
 925   title = {Efficient and Robust Secure Aggregation of Encrypted Data in Sensor
 926         Networks for critical applications},
 927   booktitle = {RESSACS, Journ\'ee th\'ematique PHC/ResCom sur RESeaux de capteurS
 928         et Applications Critiques de Surveillance},
 929   year = {2010},
 930   address = {Bayonne, France},
 931   month = jun,
 932   note = {Communication orale},
 933   classement = {COM},
 934   equipe = {and},
 935   inhal = {no}
 936 }
 937
 938 @ARTICLE{bs10:ij,
 939   author = {Bahi, Jacques and Salomon, Michel},
 940   title = {A Decentralized Energy-based Diffusion Algorithm to Increase the
 941         Lifetime of {MANETs}},
 942   journal = {Computer Networks Journal},
 943   year = {2010},
 944   pages = {***--***},
 945   note = {Accepted manuscript. To appear},
 946   classement = {ACLI},
 947   equipe = {and},
 948   impact-factor = {1.201},
 949   inhal = {no},
 950   isi-acro = {#},
 951   publisher = {Elsevier}
 952 }
 953
 954 @ARTICLE{Bahi2000,
 955   author = {J. M. Bahi},
 956   title = {Boolean totally asynchronous iterations},
 957   journal = {Int. Journal of Mathematical Algorithms},
 958   year = {2000},
 959   volume = {1},
 960   pages = {331--346},
 961   owner = {guyeux},
 962   timestamp = {17/02/2008}
 963 }
 964
 965 @ARTICLE{Bahi2000bis,
 966   author = {Jacques M. Bahi},
 967   title = {Asynchronous iterative algorithms for nonexpansive linear systems},
 968   journal = {Journal of Parallel and Distributed Computing},
 969   year = {2000},
 970   volume = {60},
 971   pages = {92--112},
 972   owner = {guyeux},
 973   timestamp = {2009.01.10}
 974 }
 975
 976 @ARTICLE{Bahi1999,
 977   author = {J. M. Bahi},
 978   title = {Parallel synchronous chaotic iterations for singular linear systems},
 979   journal = {Parallel Algorithms and Applications},
 980   year = {1999},
 981   volume = {14},
 982   pages = {19--35},
 983   owner = {guyeux},
 984   timestamp = {17/02/2008}
 985 }
 986
 987 @ARTICLE{Bahi1998,
 988   author = {Jacques M. Bahi},
 989   title = {Algorithmes paralleles asynchrones pour les systemes singuliers},
 990   journal = {Comptes Rendus de l'Academie des Sciences},
 991   year = {1998},
 992   volume = {t. 326, serie 1},
 993   pages = {1421--1425},
 994   owner = {guyeux},
 995   timestamp = {2009.01.18}
 996 }
 997
 998 @PHDTHESIS{bahi98,
 999   author = {Jacques M. Bahi},
1000   title = {Méthodes itératives dans des espaces produits. Application au calcul
1001         parallèle},
1002   school = {Université de Franche-Comté},
1003   year = {1998},
1004   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1005   owner = {christophe},
1006   timestamp = {2010.08.24}
1007 }
1008
1009 @PHDTHESIS{bahi91,
1010   author = {Jacques M. Bahi},
1011   title = {Algorithmes asynchrones pour des systèmes différentiels-algébriques.
1012         Simulation numérique sur des exemples de circuits électriques},
1013   school = {Université de Franche-Comté},
1014   year = {1991},
1015   owner = {christophe},
1016   timestamp = {2010.08.24}
1017 }
1018
1019 @ARTICLE{bcv06:ij,
1020   author = {Jacques M. Bahi and Sylvain Contassot-Vivier},
1021   title = {Basins of attraction in fully asynchronous discrete-time discrete-state
1022         dynamic networks},
1023   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1024   year = {2006},
1025   volume = {17},
1026   pages = {397--408},
1027   number = {2},
1028   inhal = {no},
1029   owner = {guyeux},
1030   timestamp = {2009.12.04}
1031 }
1032
1033 @ARTICLE{Bahi2002,
1034   author = {J.~M. Bahi and S. Contassot-Vivier},
1035   title = {Stability of fully asynchronous discrete-time discrete state dynamic
1036         networks},
1037   journal = {IEEE Transactions on Neural Networks},
1038   year = {2002},
1039   volume = {13(6)},
1040   pages = {1353-1363},
1041   owner = {guyeux},
1042   timestamp = {2009.02.14}
1043 }
1044
1045 @TECHREPORT{bcgg10:ir,
1046   author = {Bahi, J. M. and Couchot, J.-F. and Grasset, O. and Guyeux, C.},
1047   title = {{D}iscrete {D}ynamical {S}ystems: {N}ecessary {D}ivergence {C}onditions
1048         for {S}ynchronous {I}terations},
1049   institution = {LIFC - Laboratoire d'{I}nformatique de l'{U}niversit\'{e} de {F}ranche
1050         {C}omt\'{e}},
1051   year = {2010},
1052   type = {Research Report},
1053   number = {RR2010-04},
1054   month = sep,
1055   pdf = {/~publis/papers/pub/2010/RR2010-04.pdf}
1056 }
1057
1058 @ARTICLE{guyeux09,
1059   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1060   title = {Hash Functions Using Chaotic Iterations},
1061   journal = {Journal of Algorithms \& Computational Technology},
1062   year = {2010},
1063   volume = {4},
1064   pages = {167--181},
1065   number = {2},
1066   classement = {ACLNI},
1067   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1068   equipe = {and},
1069   impact-factor = {#},
1070   inhal = {no},
1071   isi-acro = {#}
1072 }
1073
1074 @INPROCEEDINGS{guyeux10,
1075   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe},
1076   title = {Topological chaos and chaotic iterations, application to Hash functions},
1077   booktitle = {WCCI'10, IEEE World Congress on Computational Intelligence},
1078   year = {2010},
1079   pages = {1--7},
1080   address = {Barcelona, Spain},
1081   month = jul,
1082   note = {Best paper award},
1083   classement = {ACTI},
1084   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1085   equipe = {and},
1086   inhal = {no}
1087 }
1088
1089 @MISC{ih10,
1090   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1091   title = {A chaos-based approach for information hiding security.},
1092   howpublished = {arXiv},
1093   month = {April},
1094   year = {2010},
1095   institution = {Computer Science Laboratory LIFC, University of Franche-Comte, France}
1096 }
1097
1098 @ARTICLE{arxiv,
1099   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1100   title = {A watermarking algorithm satisfying topological chaos properties},
1101   journal = {CoRR},
1102   year = {2008},
1103   volume = {abs/0810.4713},
1104   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1105   ee = {http://arxiv.org/abs/0810.4713}
1106 }
1107
1108 @ARTICLE{Bahi2008,
1109   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux},
1110   title = {Chaotic iterations and topological chaos},
1111   year = {2008},
1112   abstract = {Chaotic iterations have been introduced on the one hand by Chazan,
1113         Miranker [5] and Miellou [9] in a numerical analysis context, and
1114         on the other hand by Robert [11] and Pellegrin [10] in the discrete
1115         dynamical systems framework. In both cases, the objective was to
1116         derive conditions of convergence of such iterations to a fixed state.
1117         In this paper, a new point of view is presented, the goal here is
1118         to derive conditions under which chaotic iterations admit a chaotic
1119         behaviour in a rigorous mathematical sense. Contrary to what has
1120         been studied in the literature, convergence is not desired. More
1121         precisely, we establish in this paper a link between the concept
1122         of chaotic iterations on a finite set and the notion of topological
1123         chaos [8], [6], [7]. We are motivated by concrete applications of
1124         our approach, such as the use of chaotic boolean iterations in the
1125         computer security field. Indeed, the concept of chaos is used in
1126         many areas of data security without real rigorous theoretical foundations,
1127         and without using the fundamental properties that allow chaos. The
1128         wish of this paper is to bring a bit more mathematical rigour in
1129         this field.},
1130   citeseerurl = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1131   comment = {arXiv},
1132   comments = {6 pages},
1133   eprint = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}},
1134   oai2identifier = {0810.3154},
1135   owner = {guyeux},
1136   timestamp = {2008.10.23},
1137   url = {\href{http://arxiv.org/abs/0810.3154v1}{arXiv:0810.3154}}
1138 }
1139
1140 @ARTICLE{arxivRNNchaos,
1141   author = {Jacques M. Bahi and Christophe Guyeux and Michel Salomon},
1142   title = {Building a Chaotic Proved Neural Network},
1143   journal = {CoRR},
1144   year = {2011},
1145   volume = {abs/1101.4351},
1146   ee = {http://arxiv.org/abs/1101.4351}
1147 }
1148
1149 @INPROCEEDINGS{guyeuxTaiwan10,
1150   author = {Bahi, Jacques M. and Guyeux, Christophe and Wang, Qianxue},
1151   title = {Improving random number generators by chaotic iterations. Application
1152         in data hiding},
1153   booktitle = {ICCASM 2010, Int. Conf. on Computer Application and System Modeling},
1154   year = {2010},
1155   pages = {V13-643--V13-647},
1156   address = {Taiyuan, China},
1157   month = oct,
1158   classement = {ACTI},
1159   doi = {10.1109/ICCASM.2010.5622199},
1160   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
1161   equipe = {and},
1162   inhal = {no},
1163   url = {http://dx.doi.org/10.1109/ICCASM.2010.5622199}
1164 }
1165
1166 @ARTICLE{Bahi2009,
1167   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1168   title = {A stochastic model of gene evolution with time dependent pseudochaotic
1169         mutations.},
1170   journal = {Bull Math Biol},
1171   year = {2009},
1172   volume = {71},
1173   pages = {681--700},
1174   number = {3},
1175   month = {Apr},
1176   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1177         in which a random subset of the 64 possible trinucleotides mutates
1178         at each evolutionary time t according to some time dependent substitution
1179         probabilities. Therefore, at each time t, the numbers and the types
1180         of mutable trinucleotides are unknown. Thus, the mutation matrix
1181         changes at each time t. This pseudochaotic model developed generalizes
1182         the standard model in which all the trinucleotides mutate at each
1183         time t. It determines the occurrence probabilities at time t of trinucleotides
1184         which pseudochaotically mutate according to 3 time dependent substitution
1185         parameters associated with the 3 trinucleotide sites. The main result
1186         proves that under suitable assumptions, this pseudochaotic model
1187         converges to a uniform probability vector identical to that of the
1188         standard model. Furthermore, an application of this pseudochaotic
1189         model allows an evolutionary study of the 3 circular codes identified
1190         in both eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1191         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1192         frames in genes locally, i.e., anywhere in genes and particularly
1193         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1194         After a certain evolutionary time and with particular time dependent
1195         functions for the 3 substitution parameters, precisely an exponential
1196         decrease in the 1st and 2nd trinucleotide sites and an exponential
1197         increase in the 3rd one, this pseudochaotic model retrieves the main
1198         statistical properties of the 3 circular codes observed in genes.
1199         Furthermore, it leads to a circular code asymmetry stronger than
1200         the standard model (nonpseudochaotic) and, therefore, to a better
1201         correlation with the genes.},
1202   doi = {10.1007/s11538-008-9376-4},
1203   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1204         90016, Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1205   keywords = {Evolution, Molecular; Genes; Models, Genetic; Mutation; Stochastic
1206         Processes},
1207   language = {eng},
1208   medline-pst = {ppublish},
1209   owner = {guyeux},
1210   pmid = {19198957},
1211   timestamp = {2011.05.05},
1212   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-008-9376-4}
1213 }
1214
1215 @ARTICLE{Bahi2008a,
1216   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1217   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations.},
1218   journal = {J Theor Biol},
1219   year = {2008},
1220   volume = {255},
1221   pages = {53--63},
1222   number = {1},
1223   month = {Nov},
1224   abstract = {We develop here a new class of stochastic models of gene evolution
1225         in which the mutations are chaotic, i.e. a random subset of the 64
1226         possible trinucleotides mutates at each evolutionary time t according
1227         to some substitution probabilities. Therefore, at each time t, the
1228         numbers and the types of mutable trinucleotides are unknown. Thus,
1229         the mutation matrix changes at each time t. The chaotic model developed
1230         generalizes the standard model in which all the trinucleotides mutate
1231         at each time t. It determines the occurrence probabilities at time
1232         t of trinucleotides which chaotically mutate according to three substitution
1233         parameters associated with the three trinucleotide sites. Two theorems
1234         prove that this chaotic model has a probability vector at each time
1235         t and that it converges to a uniform probability vector identical
1236         to that of the standard model. Furthermore, four applications of
1237         this chaotic model (with a uniform random strategy for the 64 trinucleotides
1238         and with a particular strategy for the three stop codons) allow an
1239         evolutionary study of the three circular codes identified in both
1240         eukaryotic and prokaryotic genes. A circular code is a particular
1241         set of trinucleotides whose main property is the retrieval of the
1242         frames in genes locally, i.e. anywhere in genes and particularly
1243         without start codons, and automatically with a window of a few nucleotides.
1244         After a certain evolutionary time and with particular values for
1245         the three substitution parameters, the chaotic models retrieve the
1246         main statistical properties of the three circular codes observed
1247         in genes. These applications also allow an evolutionary comparison
1248         between the standard and chaotic models.},
1249   doi = {10.1016/j.jtbi.2008.07.028},
1250   institution = {LIFC-EA 4157, Université de Franche-Comté, IUT de Belfort, BP 527,
1251         90016 Belfort Cedex, France. jacques.bahi@univ-fcomte.fr},
1252   keywords = {Animals; Computer Simulation; DNA, Circular, genetics; Evolution,
1253         Molecular; Genetic Code; Models, Genetic; Mutation; Nonlinear Dynamics;
1254         Stochastic Processes; Time},
1255   language = {eng},
1256   medline-pst = {ppublish},
1257   owner = {guyeux},
1258   pii = {S0022-5193(08)00395-0},
1259   pmid = {18706428},
1260   timestamp = {2011.05.05},
1261   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2008.07.028}
1262 }
1263
1264 @ARTICLE{Bahi2008bis,
1265   author = {Bahi, J. M. and Michel, C. J.},
1266   title = {A stochastic model of gene evolution with chaotic mutations},
1267   journal = {Journal of Theoretical Biology},
1268   year = {2008},
1269   volume = {255},
1270   pages = {53-63},
1271   owner = {guyeux},
1272   timestamp = {2009.01.10}
1273 }
1274
1275 @ARTICLE{Bahi2004,
1276   author = {Jacques M Bahi and Christian J Michel},
1277   title = {A stochastic gene evolution model with time dependent mutations.},
1278   journal = {Bull Math Biol},
1279   year = {2004},
1280   volume = {66},
1281   pages = {763--778},
1282   number = {4},
1283   month = {Jul},
1284   abstract = {We develop here a new class of gene evolution models in which the
1285         nucleotide mutations are time dependent. These models allow to study
1286         nonlinear gene evolution by accelerating or decelerating the mutation
1287         rates at different evolutionary times. They generalize the previous
1288         ones which are based on constant mutation rates. The stochastic model
1289         developed in this class determines at some time t the occurrence
1290         probabilities of trinucleotides mutating according to 3 time dependent
1291         substitution parameters associated with the 3 trinucleotide sites.
1292         Therefore, it allows to simulate the evolution of the circular code
1293         recently observed in genes. By varying the class of function for
1294         the substitution parameters, 1 among 12 models retrieves after mutation
1295         the statistical properties of the observed circular code in the 3
1296         frames of actual genes. In this model, the mutation rate in the 3rd
1297         trinucleotide site increases during gene evolution while the mutation
1298         rates in the 1st and 2nd sites decrease. This property agrees with
1299         the actual degeneracy of the genetic code. This approach can easily
1300         be generalized to study evolution of motifs of various lengths, e.g.,
1301         dicodons, etc., with time dependent mutations.},
1302   doi = {10.1016/j.bulm.2003.10.004},
1303   institution = {LIFC - FRE CNRS 2661, IUT de Belfort, Université de Franche-Comté,
1304         BP 527, 90016 Belfort Cédex, France. bahi@iut-bm.univ-fcomte.fr},
1305   keywords = {Codon, genetics; Evolution, Molecular; Genes, genetics; Genetic Code,
1306         genetics; Models, Genetic; Mutation; Stochastic Processes},
1307   language = {eng},
1308   medline-pst = {ppublish},
1309   owner = {guyeux},
1310   pii = {S0092824003001174},
1311   pmid = {15210317},
1312   timestamp = {2011.05.05},
1313   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.bulm.2003.10.004}
1314 }
1315
1316 @ARTICLE{Banks92,
1317   author = {J. Banks and J. Brooks and G. Cairns and P. Stacey},
1318   title = {On Devaney's Definition of Chaos},
1319   journal = {Amer. Math. Monthly},
1320   year = {1992},
1321   volume = {99},
1322   pages = {332--334},
1323   keywords = {(c+),},
1324   owner = {guyeux},
1325   timestamp = {27/01/2008}
1326 }
1327
1328 @MISC{Nist10,
1329   author = {E. Barker and A. Roginsky},
1330   title = {DRAFT NIST Special Publication 800-131 Recommendation for the Transitioning
1331         of Cryptographic Algorithms and Key Sizes},
1332   year = {2010},
1333   owner = {christophe},
1334   timestamp = {2010.08.18}
1335 }
1336
1337 @ARTICLE{BarniBF03,
1338   author = {Mauro Barni and Franco Bartolini and Teddy Furon},
1339   title = {A general framework for robust watermarking security},
1340   journal = {Signal Processing},
1341   year = {2003},
1342   volume = {83},
1343   pages = {2069-2084},
1344   number = {10},
1345   note = {Special issue on Security of Data Hiding Technologies, invited paper},
1346   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1347   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/S0165-1684(03)00168-3},
1348   owner = {guyeux},
1349   timestamp = {2009.06.30}
1350 }
1351
1352 @ARTICLE{Baudet78,
1353   author = {Baudet, G\'{e}rard M.},
1354   title = {Asynchronous Iterative Methods for Multiprocessors},
1355   journal = {J. ACM},
1356   year = {1978},
1357   volume = {25},
1358   pages = {226--244},
1359   number = {2},
1360   address = {New York, NY, USA},
1361   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/322063.322067},
1362   issn = {0004-5411},
1363   publisher = {ACM}
1364 }
1365
1366 @PHDTHESIS{Baz98,
1367   author = {Didier El Baz},
1368   title = {Contribution à l'algorithmique parallèle. Le concept d'asynchronisme
1369         : étude théorique, mise en œuvre, et application},
1370   school = {Institut national polytechnique de Toulouse},
1371   year = {1998},
1372   type = {Habilitation à diriger des recherches},
1373   owner = {christophe},
1374   timestamp = {2010.08.24}
1375 }
1376
1377 @ARTICLE{bhr09c:bl,
1378   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1379   title = {Contention awareness and fault-tolerant scheduling for precedence
1380         constrained tasks in heterogeneous systems},
1381   journal = {Parallel Computing},
1382   year = {2009},
1383   volume = {35},
1384   pages = {83--108},
1385   number = {2},
1386   classement = {*},
1387   doi = {10.1016/j.parco.2008.11.001},
1388   equipe = {and},
1389   inhal = {no},
1390   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.parco.2008.11.001}
1391 }
1392
1393 @INPROCEEDINGS{bhr08b:bl,
1394   author = {Benoit, Anne and Hakem, Mourad and Robert, Yves},
1395   title = {Fault tolerant scheduling of precedence task graphs on heterogeneous
1396         platforms},
1397   booktitle = {IPDPS'08},
1398   year = {2008},
1399   pages = {1--8},
1400   publisher = {IEEE Computer Society Press},
1401   classement = {*},
1402   equipe = {and},
1403   inhal = {no}
1404 }
1405
1406 @INPROCEEDINGS{Berger98,
1407   author = {Berger, Bonnie and Leighton, Tom},
1408   title = {Protein folding in the hydrophobic-hydrophilic (HP) is NP-complete},
1409   booktitle = {Proceedings of the second annual international conference on Computational
1410         molecular biology},
1411   year = {1998},
1412   series = {RECOMB '98},
1413   pages = {30--39},
1414   address = {New York, NY, USA},
1415   publisher = {ACM},
1416   acmid = {279080},
1417   isbn = {0-89791-976-9},
1418   location = {New York, New York, United States},
1419   numpages = {10}
1420 }
1421
1422 @BOOK{Bertsekas89,
1423   title = {Parallel and distributed computation: numerical methods},
1424   publisher = {Prentice-Hall, Inc.},
1425   year = {1989},
1426   author = {Bertsekas, Dimitri P. and Tsitsiklis, John N.},
1427   address = {Upper Saddle River, NJ, USA},
1428   isbn = {0-13-648700-9}
1429 }
1430
1431 @MISC{Bertsekas88paralleland,
1432   author = {Dimitri P. Bertsekas and John N. Tsitsiklis},
1433   title = {Parallel and distributed iterative algorithms: a selective survey},
1434   year = {1988}
1435 }
1436
1437 @UNPUBLISHED{F.a,
1438   author = {F. Blanchard and E. Glasner and S. Kolyada and A.Maass},
1439   title = {On Li-Yorke pairs},
1440   note = {Preprint},
1441   optkey = {2000},
1442   owner = {guyeux},
1443   timestamp = {2008.01.02}
1444 }
1445
1446 @UNPUBLISHED{F.,
1447   author = {F. Blanchard and B. Host and S. Ruette},
1448   title = {Asymptotic pairs in positive-entropy systems},
1449   note = {Preprint},
1450   optannote = {to appear in Ergod. Th. Dynam. Sys.},
1451   optkey = {2000},
1452   owner = {guyeux},
1453   timestamp = {2008.01.02}
1454 }
1455
1456 @ARTICLE{BFibe,
1457   author = {Dan Boneh and Matt Franklin},
1458   title = {Identity-Based Encryption from the {Weil} Pairing},
1459   journal = {SIAM J. of Computing},
1460   year = {2003},
1461   volume = {32},
1462   pages = {586-615},
1463   number = {3},
1464   note = {Extended abstract in Crypto'01}
1465 }
1466
1467 @INCOLLECTION{boneh,
1468   author = {Boneh, Dan and Goh, Eu-Jin and Nissim, Kobbi},
1469   title = {Evaluating 2-DNF Formulas on Ciphertexts},
1470   year = {2005},
1471   pages = {325--341},
1472   abstract = {Let ψ be a 2-DNF formula on boolean variables x 1,..., x n ∈ {0,1}.
1473         We present a homomorphic public key encryption scheme that allows
1474         the public evaluation of ψ given an encryption of the variables x
1475         1,..., x n. In other words, given the encryption of the bits x 1,...,
1476         x n, anyone can create the encryption of ψ( x 1,..., x n). More generally,
1477         we can evaluate quadratic multi-variate polynomials on ciphertexts
1478         provided the resulting value falls within a small set. We present
1479         a number of applications of the system: 1 In a database of size n,
1480         the total communication in the basic step of the Kushilevitz-Ostrovsky
1481         PIR protocol is reduced from to . 2 An efficient election system
1482         based on homomorphic encryption where voters do not need to include
1483         non-interactive zero knowledge proofs that their ballots are valid.
1484         The election system is proved secure without random oracles but still
1485         efficient. 3 A protocol for universally verifiable computation.},
1486   citeulike-article-id = {2719460},
1487   citeulike-linkout-0 = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg},
1488   journal = {Theory of Cryptography},
1489   keywords = {homomorphic, pairings},
1490   posted-at = {2008-04-25 21:53:15},
1491   priority = {2},
1492   url = {http://www.springerlink.com/content/wtt5caxkr94laxkg}
1493 }
1494
1495 @ARTICLE{Bonneau01,
1496   author = {Bonneau, Richard and Baker, David},
1497   title = {AB INITIO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION: Progress and Prospects},
1498   journal = {Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure},
1499   year = {2001},
1500   volume = {30},
1501   pages = {173-189},
1502   number = {1},
1503   doi = {10.1146/annurev.biophys.30.1.173}
1504 }
1505
1506 @ARTICLE{Bowen,
1507   author = {R. Bowen},
1508   title = {Entropy for group endomorphisms and homogeneous spaces},
1509   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1510   year = {1971},
1511   volume = {153},
1512   pages = {401-414},
1513   owner = {guyeux},
1514   timestamp = {15/02/2008}
1515 }
1516
1517 @ARTICLE{Bowen1971,
1518   author = {R. Bowen},
1519   title = {Periodic points and measures for Axiom A diffeomorphisms},
1520   journal = {Trans. Amer. Math. Soc.},
1521   year = {1971},
1522   volume = {154},
1523   pages = {377-397},
1524   owner = {guyeux},
1525   timestamp = {15/02/2008}
1526 }
1527
1528 @ARTICLE{Braxenthaler97,
1529   author = {Michael Braxenthaler and R. Ron Unger and Ditza Auerbach and John
1530         Moult},
1531   title = {Chaos in protein dynamics},
1532   journal = {Proteins-structure Function and Bioinformatics},
1533   year = {1997},
1534   volume = {29},
1535   pages = {417--425},
1536   doi = {10.1002/(SICI)1097-0134(199712)29:4<417::AID-PROT2>3.3.CO;2-O},
1537   masid = {2824140}
1538 }
1539
1540 @INPROCEEDINGS{Brumley03remotetiming,
1541   author = {David Brumley and Dan Boneh},
1542   title = {Remote Timing Attacks are Practical},
1543   booktitle = {Proceedings of the 12th USENIX Security Symposium},
1544   year = {2003},
1545   pages = {1--14}
1546 }
1547
1548 @ARTICLE{Bohm1991375,
1549   author = {Gerald Böhm},
1550   title = {Protein folding and deterministic chaos: Limits of protein folding
1551         simulations and calculations},
1552   journal = {Chaos, Solitons \& Fractals},
1553   year = {1991},
1554   volume = {1},
1555   pages = {375 - 382},
1556   number = {4},
1557   doi = {DOI: 10.1016/0960-0779(91)90028-8},
1558   issn = {0960-0779},
1559   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TJ4-46CBXVT-1X/2/370489c218e4c2732cd9b620ef50c696}
1560 }
1561
1562 @INCOLLECTION{Cachin2004,
1563   author = {Cachin, Christian},
1564   title = {An Information-Theoretic Model for Steganography},
1565   booktitle = {Information Hiding},
1566   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1567   year = {1998},
1568   volume = {1525},
1569   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1570   pages = {306-318},
1571   affiliation = {MIT Laboratory for Computer Science 545 Technology Square Cambridge
1572         MA 02139 USA}
1573 }
1574
1575 @ARTICLE{Cam2006,
1576   author = {H. Cam and S. Ozdemir and P. Nair and D. Muthuavinashinappan and
1577         H. O. Sanli},
1578   title = {ESPDA: Energy-efficient secure pattern based data aggregation for
1579         wireless sensor networks.},
1580   journal = {Computer Communication journal (29)},
1581   year = {2006},
1582   pages = {446-455}
1583 }
1584
1585 @ARTICLE{CarletCZ98,
1586   author = {Claude Carlet and Pascale Charpin and Victor Zinoviev},
1587   title = {Codes, Bent Functions and Permutations Suitable For DES-like Cryptosystems},
1588   journal = {Des. Codes Cryptography},
1589   year = {1998},
1590   volume = {15},
1591   pages = {125-156},
1592   number = {2},
1593   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de}
1594 }
1595
1596 @INPROCEEDINGS{Castelluccia05efficientaggregation,
1597   author = {Claude Castelluccia},
1598   title = {Efficient aggregation of encrypted data in wireless sensor networks},
1599   booktitle = {MobiQuitous},
1600   year = {2005},
1601   pages = {109--117},
1602   publisher = {IEEE Computer Society}
1603 }
1604
1605 @ARTICLE{Cayre2008,
1606   author = {Cayre, F. and Bas, P.},
1607   title = {Kerckhoffs-Based Embedding Security Classes for WOA Data Hiding},
1608   journal = {IEEE Transactions on Information Forensics and Security},
1609   year = {2008},
1610   volume = {3},
1611   pages = {1--15},
1612   number = {1},
1613   doi = {10.1109/TIFS.2007.916006},
1614   issn = {1556-6013},
1615   keywords = {cryptography, random sequences, spread spectrum communication, telecommunication
1616         security, watermarking, Kerckhoffs-based embedding security classes,
1617         WOA Data Hiding, pseudorandom sequences, spread-spectrum techniques,
1618         steganography security, watermark-only-attack, watermarking, Security,
1619         spread-spectrum (SS) watermarking},
1620   owner = {guyeux},
1621   timestamp = {2009.06.29}
1622 }
1623
1624 @ARTICLE{Cayre2005,
1625   author = {Cayre, F. and Fontaine, C. and Furon, T.},
1626   title = {Watermarking security: theory and practice},
1627   journal = {IEEE Transactions on Signal Processing},
1628   year = {2005},
1629   volume = {53},
1630   pages = {3976--3987},
1631   number = {10},
1632   doi = {10.1109/TSP.2005.855418},
1633   issn = {1053-587X},
1634   keywords = {blind source separation, cryptography, watermarking, Fisher information
1635         matrix, blind source separation, cryptanalysis, information theory,
1636         spread spectrum techniques, substitutive scheme, watermarking security,
1637         Blind source separation, Fisher information matrix, equivocation,
1638         security, watermarking},
1639   owner = {guyeux},
1640   timestamp = {2009.06.29}
1641 }
1642
1643 @ARTICLE{Chajakis91,
1644   author = {Chajakis, Emmanuel D. and Zenios, Stavros A.},
1645   title = {Synchronous and asynchronous implementations of relaxation algorithms
1646         for nonlinear network optimization},
1647   journal = {Parallel Comput.},
1648   year = {1991},
1649   volume = {17},
1650   pages = {873--894},
1651   number = {8},
1652   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1653   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/S0167-8191(05)80072-9},
1654   issn = {0167-8191},
1655   publisher = {Elsevier Science Publishers B. V.}
1656 }
1657
1658 @ARTICLE{Chan2007,
1659   author = {Chan, Haowen and Perrig, Adrian and Przydatek, Bartosz and Song,
1660         Dawn},
1661   title = {SIA: Secure information aggregation in sensor networks},
1662   journal = {J. Comput. Secur.},
1663   year = {2007},
1664   volume = {15},
1665   pages = {69--102},
1666   number = {1},
1667   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1668   issn = {0926-227X},
1669   publisher = {IOS Press}
1670 }
1671
1672 @ARTICLE{Chandramouli06,
1673   author = {R. Chandramouli and S. Bapatla and K.P. Subbalakshmi},
1674   title = {Battery power-aware encryption},
1675   journal = {ACM transactions on information and system security},
1676   year = {2006},
1677   pages = {162--180},
1678   owner = {christophe},
1679   timestamp = {2010.07.31}
1680 }
1681
1682 @ARTICLE{Charpin85,
1683   author = {Pascale Charpin},
1684   title = {A description of some extended cyclic codes with application to Reed-Solomon
1685         codes},
1686   journal = {Discrete Mathematics},
1687   year = {1985},
1688   volume = {56},
1689   pages = {117-124},
1690   number = {2-3},
1691   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
1692   ee = {http://dx.doi.org/10.1016/0012-365X(85)90019-6}
1693 }
1694
1695 @ARTICLE{Chazan69,
1696   author = {D. Chazan and W. Miranker},
1697   title = {Chaotic relaxation},
1698   journal = {Linear algebra and its applications},
1699   year = {1969},
1700   pages = {199-222},
1701   owner = {guyeux},
1702   timestamp = {2008.05.22}
1703 }
1704
1705 @ARTICLE{Cheon2006,
1706   author = {Cheon, Jung Hee and Kim, Woo-Hwan and Nam, Hyun Soo},
1707   title = {Known-plaintext cryptanalysis of the Domingo-Ferrer algebraic privacy
1708         homomorphism scheme},
1709   journal = {Inf. Process. Lett.},
1710   year = {2006},
1711   volume = {97},
1712   pages = {118--123},
1713   number = {3},
1714   address = {Amsterdam, The Netherlands, The Netherlands},
1715   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ipl.2005.09.016},
1716   issn = {0020-0190},
1717   publisher = {Elsevier North-Holland, Inc.}
1718 }
1719
1720 @MISC{Cheon03acryptanalysis,
1721   author = {Jung Hee Cheon and Hyun Soo Nam},
1722   title = {A Cryptanalysis of the Original Domingo-Ferrer's Algebraic Privacy
1723         Homomorphism},
1724   year = {2003}
1725 }
1726
1727 @ARTICLE{Cheung05,
1728   author = {R.C.C. Cheung and N.J. Telle and W. Luk and P.Y.K. Cheung},
1729   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
1730   journal = {IEEE Trans. on Very Large Scale Integration Systems},
1731   year = {2005},
1732   volume = {13},
1733   pages = {1048-1059},
1734   number = {9}
1735 }
1736
1737 @ARTICLE{Chivian2005,
1738   author = {Chivian, Dylan and Kim, David E. and Malmström, Lars and Schonbrun,
1739         Jack and Rohl, Carol A. and Baker, David},
1740   title = {Prediction of CASP6 structures using automated robetta protocols},
1741   journal = {Proteins},
1742   year = {2005},
1743   volume = {61},
1744   pages = {157--166},
1745   number = {S7},
1746   issn = {1097-0134},
1747   keywords = {Rosetta, fragment assembly, de novo modeling, homology modeling, parametric
1748         alignment ensemble},
1749   owner = {christophe},
1750   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
1751   timestamp = {2011.01.22},
1752   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20733}
1753 }
1754
1755 @ARTICLE{Zhu06,
1756   author = {Congxu, Zhu and Xuefeng, Liao and Zhihua, Li},
1757   title = {Chaos-based multipurpose image watermarking algorithm},
1758   journal = {Wuhan University Journal of Natural Sciences},
1759   year = {2006},
1760   volume = {11},
1761   pages = {1675-1678},
1762   note = {10.1007/BF02831848},
1763   abstract = {To achieve the goal of image content authentication and copyright
1764         protection simultaneously, this paper presents a novel image dual
1765         watermarking method based on chaotic map. Firstly, the host image
1766         was split into many nonoverlapping small blocks, and the block-wise
1767         discrete cosine transform (DCT) is computed. Secondly, the robust
1768         watermarks, shuffled by the chaotic sequences, are embedded in the
1769         DC coefficients of blocks to achieve the goal of copyright protection.
1770         The semi-fragile watermarks, generated by chaotic map, are embedded
1771         in the AC coefficients of blocks to obtain the aim of image authentication.
1772         Both of them can be extracted without the original image. Simulation
1773         results demonstrate the effectiveness of our algorithm in terms of
1774         robustness and fragility.},
1775   affiliation = {Central South University School of Information Science and Engineering
1776         410083 Changsha, Hunan China},
1777   issn = {1007-1202},
1778   issue = {6},
1779   keyword = {Mathematics, general},
1780   publisher = {Wuhan University, co-published with Springer},
1781   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF02831848}
1782 }
1783
1784 @ARTICLE{Conley1978,
1785   author = {C. Conley},
1786   title = {Isolated invariant sets and the Morse index},
1787   journal = {CBMS Regional Conference. AMS.},
1788   year = {1978},
1789   optvolume = {38},
1790   owner = {guyeux},
1791   timestamp = {2008.01.02}
1792 }
1793
1794 @ARTICLE{Cornu2002,
1795   author = {Philippe Cornu and André Smolarz},
1796   title = {Image characterization by texture},
1797   journal = {Traitement du signal},
1798   year = {2002},
1799   volume = {19},
1800   pages = {29-35},
1801   file = {:/home/guyeux/Documents/Bibliotheque/These/Watermarking/Caractérisation d'images par textures associées.pdf:PDF},
1802   owner = {guyeux},
1803   timestamp = {2008.05.12}
1804 }
1805
1806 @INPROCEEDINGS{Cox99,
1807   author = {Ingemar Cox and Matt L. Miller and Andrew L. Mckellips},
1808   title = {Watermarking as Communications With Side Information},
1809   booktitle = {Proceedings of the IEEE},
1810   year = {1999},
1811   pages = {1127--1141},
1812   owner = {christophe},
1813   timestamp = {2010.03.06}
1814 }
1815
1816 @ARTICLE{Cox97securespread,
1817   author = {Ingemar J. Cox and Senior Member and Joe Kilian and F. Thomson Leighton
1818         and Talal Shamoon},
1819   title = {Secure spread spectrum watermarking for multimedia},
1820   journal = {IEEE Transactions on Image Processing},
1821   year = {1997},
1822   volume = {6},
1823   pages = {1673--1687}
1824 }
1825
1826 @ARTICLE{Cramer96,
1827   author = {Christopher Cramer and Erol Gelenbe and Hakan Bakircioglu},
1828   title = {Video Compression with Random Neural Networks},
1829   journal = {Neural Networks for Identification, Control, and Robotics, International
1830         Workshop},
1831   year = {1996},
1832   volume = {0},
1833   pages = {0476},
1834   address = {Los Alamitos, CA, USA},
1835   isbn = {0-8186-7456-3},
1836   publisher = {IEEE Computer Society}
1837 }
1838
1839 @INPROCEEDINGS{Crescenzi98,
1840   author = {Crescenzi, Pierluigi and Goldman, Deborah and Papadimitriou, Christos
1841         and Piccolboni, Antonio and Yannakakis, Mihalis},
1842   title = {On the complexity of protein folding (extended abstract)},
1843   booktitle = {Proceedings of the thirtieth annual ACM symposium on Theory of computing},
1844   year = {1998},
1845   series = {STOC '98},
1846   pages = {597--603},
1847   address = {New York, NY, USA},
1848   publisher = {ACM},
1849   acmid = {276875},
1850   isbn = {0-89791-962-9},
1851   location = {Dallas, Texas, United States},
1852   numpages = {7}
1853 }
1854
1855 @ARTICLE{Dawei2004,
1856   author = {Zhao Dawei and Chen Guanrong and Liu Wenbo},
1857   title = {A chaos-based robust wavelet-domain watermarking algorithm},
1858   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
1859   year = {2004},
1860   volume = {22},
1861   pages = {47-54},
1862   owner = {guyeux},
1863   timestamp = {2008.10.07}
1864 }
1865
1866 @MISC{1011.1638,
1867   author = {Anthony Desnos and Robert Erra and Eric Filiol},
1868   title = {Processor-Dependent Malware... and codes},
1869   year = {2010},
1870   comment = {arXiv:1011.1638},
1871   eprint = {arXiv:1011.1638}
1872 }
1873
1874 @BOOK{devaney,
1875   title = {An Introduction to Chaotic Dynamical Systems},
1876   publisher = {Addison-Wesley},
1877   year = {1989},
1878   author = {Devaney, Robert L.},
1879   address = {Redwood City, CA},
1880   edition = {2nd}
1881 }
1882
1883 @ARTICLE{diffie76,
1884   author = {Whitfield Diffie and Martin E. Hellman},
1885   title = {New Directions in Cryptography},
1886   journal = {IEEE Transactions on Information Theory},
1887   year = {1976},
1888   volume = {IT-22},
1889   pages = {644--654},
1890   number = {6},
1891   date = {November 1976},
1892   owner = {guyeux},
1893   timestamp = {2009.06.30},
1894   url = {citeseer.ist.psu.edu/diffie76new.html}
1895 }
1896
1897 @INCOLLECTION{Dijk10,
1898   author = {van Dijk, Marten and Gentry, Craig and Halevi, Shai and Vaikuntanathan,
1899         Vinod},
1900   title = {Fully Homomorphic Encryption over the Integers},
1901   booktitle = {Advances in Cryptology – EUROCRYPT 2010},
1902   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
1903   year = {2010},
1904   editor = {Gilbert, Henri},
1905   volume = {6110},
1906   series = {Lecture Notes in Computer Science},
1907   pages = {24-43},
1908   abstract = {We construct a simple fully homomorphic encryption scheme, using only
1909         elementary modular arithmetic. We use Gentry’s technique to construct
1910         a fully homomorphic scheme from a bootstrappable somewhat homomorphic
1911         scheme. However, instead of using ideal lattices over a polynomial
1912         ring, our bootstrappable encryption scheme merely uses addition and
1913         multiplication over the integers. The main appeal of our scheme is
1914         the conceptual simplicity. We reduce the security of our scheme to
1915         finding an approximate integer gcd – i.e., given a list of integers
1916         that are near-multiples of a hidden integer, output that hidden integer.
1917         We investigate the hardness of this task, building on earlier work
1918         of Howgrave-Graham.},
1919   affiliation = {MIT CSAIL}
1920 }
1921
1922 @ARTICLE{Dill1985,
1923   author = {Dill, KA},
1924   title = {Theory for the folding and stability of globular proteins.},
1925   journal = {Biochemistry},
1926   year = {1985},
1927   volume = {24},
1928   pages = {1501-9--},
1929   number = {6},
1930   month = mar,
1931   abstract = {Using lattice statistical mechanics, we develop theory to account
1932         for the folding of a heteropolymer molecule such as a protein to
1933         the globular and soluble state. Folding is assumed to be driven by
1934         the association of solvophobic monomers to avoid solvent and opposed
1935         by the chain configurational entropy. Theory predicts a phase transition
1936         as a function of temperature or solvent character. Molecules that
1937         are too short or too long or that have too few solvophobic residues
1938         are predicted not to fold. Globular molecules should have a largely
1939         solvophobic core, but there is an entropic tendency for some residues
1940         to be "out of place", particularly in small molecules. For long chains,
1941         molecules comprised of globular domains are predicted to be thermodynamically
1942         more stable than spherical molecules. The number of accessible conformations
1943         in the globular state is calculated to be an exceedingly small fraction
1944         of the number available to the random coil. Previous estimates of
1945         this number, which have motivated kinetic theories of folding, err
1946         by many tens of orders of magnitude.},
1947   comment = {Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
1948   keywords = {Mathematics, Models, Chemical, Polymers, Protein Conformation},
1949   owner = {christophe},
1950   timestamp = {2011.01.22},
1951   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/3986190}
1952 }
1953
1954 @ARTICLE{Dill1995,
1955   author = {Dill, KA and Bromberg, S and Yue, K and Fiebig, KM and Yee, DP and
1956         Thomas, PD and Chan, HS},
1957   title = {Principles of protein folding--a perspective from simple exact models.},
1958   journal = {Protein Sci},
1959   year = {1995},
1960   volume = {4},
1961   pages = {561-602--},
1962   number = {4},
1963   month = apr,
1964   abstract = {General principles of protein structure, stability, and folding kinetics
1965         have recently been explored in computer simulations of simple exact
1966         lattice models. These models represent protein chains at a rudimentary
1967         level, but they involve few parameters, approximations, or implicit
1968         biases, and they allow complete explorations of conformational and
1969         sequence spaces. Such simulations have resulted in testable predictions
1970         that are sometimes unanticipated: The folding code is mainly binary
1971         and delocalized throughout the amino acid sequence. The secondary
1972         and tertiary structures of a protein are specified mainly by the
1973         sequence of polar and nonpolar monomers. More specific interactions
1974         may refine the structure, rather than dominate the folding code.
1975         Simple exact models can account for the properties that characterize
1976         protein folding: two-state cooperativity, secondary and tertiary
1977         structures, and multistage folding kinetics--fast hydrophobic collapse
1978         followed by slower annealing. These studies suggest the possibility
1979         of creating "foldable" chain molecules other than proteins. The encoding
1980         of a unique compact chain conformation may not require amino acids;
1981         it may require only the ability to synthesize specific monomer sequences
1982         in which at least one monomer type is solvent-averse.},
1983   address = {Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California,
1984         San Francisco 94143-1204, USA.},
1985   comment = {Review,Research Support, Non-U.S. Gov't,Research Support, U.S. Gov't,
1986         Non-P.H.S.,Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.,},
1987   keywords = {Amino Acid Sequence, Biological Evolution, Hydrogen Bonding, Models,
1988         Molecular, Molecular Sequence Data, Mutation, Protein Conformation,
1989         Protein Denaturation, Protein Folding, Temperature, Thermodynamics},
1990   owner = {christophe},
1991   timestamp = {2011.01.22},
1992   url = {http://ukpmc.ac.uk/abstract/MED/7613459}
1993 }
1994
1995 @INPROCEEDINGS{Dobbertin96,
1996   author = {Dobbertin, Hans},
1997   title = {Cryptanalysis of MD4},
1998   booktitle = {Proceedings of the Third International Workshop on Fast Software
1999         Encryption},
2000   year = {1996},
2001   pages = {53--69},
2002   address = {London, UK},
2003   publisher = {Springer-Verlag},
2004   isbn = {3-540-60865-6}
2005 }
2006
2007 @INPROCEEDINGS{DomingoFerrer2002,
2008   author = {Domingo-Ferrer, Josep},
2009   title = {A Provably Secure Additive and Multiplicative Privacy Homomorphism},
2010   booktitle = {ISC '02: Proceedings of the 5th International Conference on Information
2011         Security},
2012   year = {2002},
2013   pages = {471--483},
2014   address = {London, UK},
2015   publisher = {Springer-Verlag},
2016   isbn = {3-540-44270-7}
2017 }
2018
2019 @ARTICLE{Dubchak1995,
2020   author = {I. Dubchak and I. Muchnik and S. R. Holbrook and S. H. Kim},
2021   title = {Prediction of protein folding class using global description of amino
2022         acid sequence.},
2023   journal = {Proc Natl Acad Sci U S A},
2024   year = {1995},
2025   volume = {92},
2026   pages = {8700--8704},
2027   number = {19},
2028   month = {Sep},
2029   __markedentry = {[guyeux]},
2030   abstract = {We present a method for predicting protein folding class based on
2031         global protein chain description and a voting process. Selection
2032         of the best descriptors was achieved by a computer-simulated neural
2033         network trained on a data base consisting of 83 folding classes.
2034         Protein-chain descriptors include overall composition, transition,
2035         and distribution of amino acid attributes, such as relative hydrophobicity,
2036         predicted secondary structure, and predicted solvent exposure. Cross-validation
2037         testing was performed on 15 of the largest classes. The test shows
2038         that proteins were assigned to the correct class (correct positive
2039         prediction) with an average accuracy of 71.7\%, whereas the inverse
2040         prediction of proteins as not belonging to a particular class (correct
2041         negative prediction) was 90-95\% accurate. When tested on 254 structures
2042         used in this study, the top two predictions contained the correct
2043         class in 91\% of the cases.},
2044   institution = {Department of Chemistry, University of California, Berkeley 94720,
2045         USA.},
2046   keywords = {Amino Acid Sequence; Amino Acids, chemistry; Computer Simulation;
2047         Databases, Factual; Models, Chemical; Neural Networks (Computer);
2048         Protein Folding; Protein Structure, Secondary; Proteins, chemistry/classification;
2049         Reproducibility of Results; Solvents},
2050   language = {eng},
2051   medline-pst = {ppublish},
2052   owner = {guyeux},
2053   pmid = {7568000},
2054   timestamp = {2011.07.18}
2055 }
2056
2057 @BOOK{Dudley,
2058   title = {Real analysis and probability},
2059   publisher = {Cambridge University Press},
2060   author = {Richard M. Dudley},
2061   optpages = {209},
2062   owner = {guyeux},
2063   timestamp = {2008.01.02}
2064 }
2065
2066 @ARTICLE{Tarazi84,
2067   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2068   title = {Algorithmes mixtes asynchrones. Etude de convergence monotone},
2069   journal = {Numerische Mathematik},
2070   year = {1984},
2071   volume = {44},
2072   pages = {363-369},
2073   note = {10.1007/BF01405568},
2074   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2075         Box 5969 Kuwait},
2076   issn = {0029-599X},
2077   issue = {3},
2078   keyword = {Mathematics and Statistics},
2079   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2080   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01405568}
2081 }
2082
2083 @ARTICLE{Tarazi82,
2084   author = {El Tarazi, Mouhamed Nabih},
2085   title = {Some convergence results for asynchronous algorithms},
2086   journal = {Numerische Mathematik},
2087   year = {1982},
2088   volume = {39},
2089   pages = {325-340},
2090   note = {10.1007/BF01407866},
2091   affiliation = {Department of Mathematics, Faculty of Science Kuwait University P.O.
2092         Box 5969 Kuwait Kuwait},
2093   issn = {0029-599X},
2094   issue = {3},
2095   keyword = {Mathematics and Statistics},
2096   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
2097   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01407866}
2098 }
2099
2100 @ARTICLE{Fei2005,
2101   author = {Peng Fei and Qiu Shui-Sheng and Long Min},
2102   title = {A secure digital signature algorithm based on elliptic curve and
2103         chaotic mappings},
2104   journal = {Circuits Systems Signal Processing},
2105   year = {2005},
2106   volume = {24, No. 5},
2107   pages = {585--597},
2108   owner = {guyeux},
2109   timestamp = {2009.01.16}
2110 }
2111
2112 @BOOK{Feigenbaum1908,
2113   title = {Universal behavior in nonlinear systems},
2114   publisher = {Los Alamos Science},
2115   year = {1908},
2116   author = {Feigenbaum},
2117   owner = {guyeux},
2118   timestamp = {2008.01.02}
2119 }
2120
2121 @ARTICLE{Felsenstein1980,
2122   author = {J. Felsenstein},
2123   title = {A view of population genetics.},
2124   journal = {Science},
2125   year = {1980},
2126   volume = {208},
2127   pages = {1253},
2128   number = {4449},
2129   month = {Jun},
2130   doi = {10.1126/science.208.4449.1253},
2131   language = {eng},
2132   medline-pst = {ppublish},
2133   owner = {guyeux},
2134   pii = {208/4449/1253},
2135   pmid = {17830806},
2136   timestamp = {2011.05.05},
2137   url = {http://dx.doi.org/10.1126/science.208.4449.1253}
2138 }
2139
2140 @BOOK{Filiol09,
2141   title = {Les virus informatiques : techniques virales et antivirales avancées},
2142   year = {2009},
2143   editor = {Springer},
2144   author = {Eric Filiol},
2145   owner = {christophe},
2146   timestamp = {2010.10.13}
2147 }
2148
2149 @INPROCEEDINGS{FiliolBlackHat,
2150   author = {Eric Filiol},
2151   title = {Passive and Active Leakage of Secret Data from Non Networked Computer},
2152   booktitle = {Black Hat},
2153   year = {2008},
2154   owner = {christophe},
2155   timestamp = {2010.11.28}
2156 }
2157
2158 @PHDTHESIS{Formenti2003,
2159   author = {Enrico Formenti},
2160   title = {De l'algorithmique du chaos dans les systèmes dynamiques discrets},
2161   school = {Université de Provence},
2162   year = {2003},
2163   owner = {guyeux},
2164   timestamp = {2008.01.02}
2165 }
2166
2167 @PHDTHESIS{Formenti1998,
2168   author = {Enrico Formenti},
2169   title = {Automates cellulaires et chaos : de la vision topologique à la vision
2170         algorithmique},
2171   school = {\'Ecole Normale Supérieure de Lyon},
2172   year = {1998},
2173   optmonth = {Octobre},
2174   owner = {guyeux},
2175   timestamp = {2008.01.02}
2176 }
2177
2178 @ARTICLE{Frey2006,
2179   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2180   title = {Identification of circular codes in bacterial genomes and their use
2181         in a factorization method for retrieving the reading frames of genes.},
2182   journal = {Comput Biol Chem},
2183   year = {2006},
2184   volume = {30},
2185   pages = {87--101},
2186   number = {2},
2187   month = {Apr},
2188   abstract = {We developed a statistical method that allows each trinucleotide to
2189         be associated with a unique frame among the three possible ones in
2190         a (protein coding) gene. An extensive gene study in 175 complete
2191         bacterial genomes based on this statistical approach resulted in
2192         identification of 72 new circular codes. Finding a circular code
2193         enables an immediate retrieval of the reading frame locally anywhere
2194         in a gene. No knowledge of location of the start codon is required
2195         and a short window of only a few nucleotides is sufficient for automatic
2196         retrieval. We have therefore developed a factorization method (that
2197         explores previously found circular codes) for retrieving the reading
2198         frames of bacterial genes. Its principle is new and easy to understand.
2199         Neither complex treatment nor specific information on the nucleotide
2200         sequences is necessary. Moreover, the method can be used for short
2201         regions in nucleotide sequences (less than 25 nucleotides in protein
2202         coding genes). Selected additional properties of circular codes and
2203         their possible biological consequences are also discussed.},
2204   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001},
2205   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2206         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2207         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2208   keywords = {Base Sequence; Computational Biology; Genes, Bacterial; Genome, Bacterial;
2209         Genomics, statistics /&/ numerical data; Models, Genetic; Models,
2210         Statistical; Reading Frames},
2211   language = {eng},
2212   medline-pst = {ppublish},
2213   owner = {guyeux},
2214   pii = {S1476-9271(05)00111-8},
2215   pmid = {16439185},
2216   timestamp = {2011.05.05},
2217   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.11.001}
2218 }
2219
2220 @ARTICLE{Frey2006a,
2221   author = {Gabriel Frey and Christian J Michel},
2222   title = {An analytical model of gene evolution with six mutation parameters:
2223         an application to archaeal circular codes.},
2224   journal = {Comput Biol Chem},
2225   year = {2006},
2226   volume = {30},
2227   pages = {1--11},
2228   number = {1},
2229   month = {Feb},
2230   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
2231         mutation matrix 64 x 64 with six substitution parameters associated
2232         with the transitions and transversions in the three trinucleotide
2233         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
2234         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
2235         x 64 with three parameters. It determines at some time t the exact
2236         occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly according
2237         to six substitution parameters. An application of this model allows
2238         an evolutionary study of the common circular code COM and the 15
2239         archaeal circular codes X which have been recently identified in
2240         several archaeal genomes. The main property of a circular code is
2241         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
2242         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
2243         with a window of a few nucleotides. In genes, the circular code is
2244         superimposed on the traditional genetic one. Very unexpectedly, the
2245         evolutionary model demonstrates that the archaeal circular codes
2246         can derive from the common circular code subjected to random substitutions
2247         with particular values for six substitutions parameters. It has a
2248         strong correlation with the statistical observations of three archaeal
2249         codes in actual genes. Furthermore, the properties of these substitution
2250         rates allow proposal of an evolutionary classification of the 15
2251         archaeal codes into three main classes according to this model. In
2252         almost all the cases, they agree with the actual degeneracy of the
2253         genetic code with substitutions more frequent in the third trinucleotide
2254         site and with transitions more frequent that transversions in any
2255         trinucleotide site.},
2256   doi = {10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001},
2257   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
2258         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
2259         67400 Illkirch, France. frey@dpt-info.u-strasbg.fr},
2260   keywords = {Archaea, genetics; DNA, Circular; Evolution, Molecular; Genetic Code;
2261         Genome, Archaeal; Models, Genetic; Mutation; Trinucleotide Repeats},
2262   language = {eng},
2263   medline-pst = {ppublish},
2264   owner = {guyeux},
2265   pii = {S1476-9271(05)00083-6},
2266   pmid = {16324886},
2267   timestamp = {2011.05.05},
2268   url = {http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2005.09.001}
2269 }
2270
2271 @INPROCEEDINGS{fgb11:ip,
2272   author = {Friot, Nicolas and Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2273   title = {Chaotic Iterations for Steganography - Stego-security and chaos-security},
2274   booktitle = {SECRYPT'2011, Int. Conf. on Security and Cryptography},
2275   year = {2011},
2276   pages = {***--***},
2277   address = {Sevilla, Spain},
2278   month = jul,
2279   note = {To appear},
2280   classement = {ACTI},
2281   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2282   equipe = {and},
2283   inhal = {no}
2284 }
2285
2286 @MISC{Frisch,
2287   author = {Alain Frisch},
2288   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2289   year = {1998},
2290   note = {Rapport de tipe},
2291   file = {Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:Chaos/Tipe_Entropie Topologique et Definition du Chaos (Alain Frisch).ps:PDF},
2292   keywords = {Chaos, Entropie Topologique, Tipe},
2293   owner = {guyeux},
2294   timestamp = {2008.01.02},
2295   url = {http://alain.frisch.fr/math.html}
2296 }
2297
2298 @MISC{Frisch98,
2299   author = {Alain Frisch},
2300   title = {Entropie topologique et définition du chaos},
2301   year = {1998},
2302   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2303   url = {\url{http://alain.frisch.fr/math.html}}
2304 }
2305
2306 @ARTICLE{Frommer97asynchronousweighted,
2307   author = {Andreas Frommer and Hartmut Schwandt and Daniel and Daniel B. Szyld},
2308   title = {Asynchronous Weighted Additive Schwarz Methods},
2309   journal = {Electronic Transactions on Numerical Analysis},
2310   year = {1997},
2311   volume = {5},
2312   pages = {48--61}
2313 }
2314
2315 @MISC{Frommer94asynchronoustwo-stage,
2316   author = {Andreas Frommer and Daniel B. Szyld},
2317   title = {Asynchronous Two-Stage Iterative Methods},
2318   year = {1994}
2319 }
2320
2321 @BOOK{J1992,
2322   title = {Introduction to Chaos and Coherence},
2323   publisher = {IOP Publishing},
2324   year = {1992},
2325   author = {J. Frøyland},
2326   owner = {guyeux},
2327   timestamp = {2008.01.02}
2328 }
2329
2330 @MISC{Furon2002,
2331   author = {T. Furon},
2332   title = {Security analysis},
2333   year = {2002},
2334   note = {European Project IST-1999-10987 CERTIMARK, Deliverable D.5.5},
2335   owner = {guyeux},
2336   timestamp = {2009.06.30}
2337 }
2338
2339 @ARTICLE{Furon08,
2340   author = {Furon, Teddy and Bas, Patrick},
2341   title = {Broken arrows},
2342   journal = {EURASIP J. Inf. Secur.},
2343   year = {2008},
2344   volume = {2008},
2345   pages = {1--13},
2346   address = {New York, NY, United States},
2347   doi = {http://dx.doi.org/10.1155/2008/597040},
2348   issn = {1687-4161},
2349   owner = {christophe},
2350   publisher = {Hindawi Publishing Corp.},
2351   timestamp = {2010.03.06}
2352 }
2353
2354 @ARTICLE{P1150442004,
2355   author = {G.S.El-Taweel and H.M. Onsi and M.Samy and M.G. Darwish},
2356   title = {Secure and Non-Blind Watermarking Scheme for Color Images Based on
2357         DWT},
2358   journal = {ICGST International Journal on Graphics, Vision and Image Processing},
2359   year = {2005},
2360   volume = {05},
2361   pages = {1--5},
2362   month = {April},
2363   issue = {4},
2364   owner = {christophe},
2365   timestamp = {2010.03.07}
2366 }
2367
2368 @INPROCEEDINGS{Gentry09,
2369   author = {Gentry, Craig},
2370   title = {Fully homomorphic encryption using ideal lattices},
2371   booktitle = {STOC '09: Proceedings of the 41st annual ACM symposium on Theory
2372         of computing},
2373   year = {2009},
2374   pages = {169--178},
2375   address = {New York, NY, USA},
2376   publisher = {ACM},
2377   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/1536414.1536440},
2378   isbn = {978-1-60558-506-2},
2379   location = {Bethesda, MD, USA}
2380 }
2381
2382 @INPROCEEDINGS{Girao04,
2383   author = {J. Girao and M. Schneider and D. Westhoff},
2384   title = {CDA: Concealed data aggregation in wireless sensor networks},
2385   booktitle = {Proceedings of the ACM Workshop on Wireless Security},
2386   year = {2004},
2387   owner = {christophe},
2388   timestamp = {2010.07.31}
2389 }
2390
2391 @CONFERENCE{Gotsman88,
2392   author = {C. Gotsman and D. Lehmann and E. Shamir},
2393   title = {Asynchronous Dynamics of Random Boolean Networks},
2394   booktitle = {San Diego '88 Neural Networks Conference},
2395   year = {1988},
2396   owner = {guyeux},
2397   timestamp = {30/03/2008}
2398 }
2399
2400 @ARTICLE{Guckenheimer1979,
2401   author = {J. Guckenheimer},
2402   title = {Sensitive dependence to initial conditions for one-dimensional maps},
2403   journal = {Comm. Math. Phys.},
2404   year = {1979},
2405   optpages = {133-160},
2406   owner = {guyeux},
2407   timestamp = {2008.01.02}
2408 }
2409
2410 @BOOK{J.1983,
2411   title = {Nonlinear oscillations, dynamical systems, and bifurcations of vector
2412         fields},
2413   publisher = {Springer Verlag},
2414   year = {1983},
2415   author = {J. Guckenheimer and P. Holmes},
2416   owner = {guyeux},
2417   timestamp = {2008.01.02}
2418 }
2419
2420 @ARTICLE{Guo20093201,
2421   author = {Wei Guo and Xiaoming Wang and Dake He and Yang Cao},
2422   title = {Cryptanalysis on a parallel keyed hash function based on chaotic
2423         maps},
2424   journal = {Physics Letters A},
2425   year = {2009},
2426   volume = {373},
2427   pages = {3201 - 3206},
2428   number = {36},
2429   abstract = {This Letter analyzes the security of a novel parallel keyed hash function
2430         based on chaotic maps, proposed by Xiao et al. to improve the efficiency
2431         in parallel computing environment. We show how to devise forgery
2432         attacks on Xiao's scheme with differential cryptanalysis and give
2433         the experiment results of two kinds of forgery attacks firstly. Furthermore,
2434         we discuss the problem of weak keys in the scheme and demonstrate
2435         how to utilize weak keys to construct collision.},
2436   issn = {0375-9601},
2437   keywords = {Cryptanalysis}
2438 }
2439
2440 @PHDTHESIS{GuyeuxThese10,
2441   author = {Christophe Guyeux},
2442   title = {Le d\'{e}sordre des it\'{e}rations chaotiques et leur utilit\'{e}
2443         en s\'{e}curit\'{e} informatique},
2444   school = {Universit\'{e} de Franche-Comt\'{e}},
2445   year = {2010},
2446   owner = {christophe},
2447   timestamp = {2010.12.21}
2448 }
2449
2450 @MISC{gb11:onp,
2451   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2452   title = {\'Etude topologique de l'\'etalement de spectre},
2453   howpublished = {Journ\'ees Codes et St\'eganographie, \'Ecoles Militaires de Saint-Cyr,
2454         Co\"etquidan},
2455   month = jan,
2456   year = {2011},
2457   classement = {COM},
2458   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2459   equipe = {and},
2460   inhal = {no}
2461 }
2462
2463 @INPROCEEDINGS{bg10:ip,
2464   author = {Guyeux, Christophe and Bahi, Jacques},
2465   title = {An improved watermarking algorithm for Internet applications},
2466   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
2467   year = {2010},
2468   pages = {119--124},
2469   address = {Valencia, Spain},
2470   month = sep,
2471   classement = {ACTI},
2472   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2473   equipe = {and},
2474   inhal = {no}
2475 }
2476
2477 @INPROCEEDINGS{gfb10:ip,
2478   author = {Guyeux, Christophe and Friot, Nicolas and Bahi, Jacques},
2479   title = {Chaotic iterations versus Spread-spectrum: chaos and stego security},
2480   booktitle = {IIH-MSP'10, 6-th Int. Conf. on Intelligent Information Hiding and
2481         Multimedia Signal Processing},
2482   year = {2010},
2483   pages = {208--211},
2484   address = {Darmstadt, Germany},
2485   month = oct,
2486   classement = {ACTI},
2487   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
2488   equipe = {and},
2489   inhal = {no}
2490 }
2491
2492 @ARTICLE{friot10,
2493   author = {Christophe Guyeux and Nicolas Friot and Jacques M. Bahi},
2494   title = {A more secure information hiding scheme than spread-spectrum obtained
2495         by chaos-security},
2496   journal = {arXiv 0032565},
2497   year = {2010},
2498   owner = {guyeux},
2499   timestamp = {2010.04.30}
2500 }
2501
2502 @BOOK{ECC,
2503   title = {Guide to Elliptic Curve Cryptography},
2504   publisher = {Springer Professional Computing},
2505   year = {2004},
2506   editor = {Springer},
2507   author = {D. Hankerson and A. Menezes and S. Vanstone},
2508   owner = {christophe},
2509   timestamp = {2010.07.31}
2510 }
2511
2512 @ARTICLE{Hasegawa1985,
2513   author = {M. Hasegawa and H. Kishino and T. Yano},
2514   title = {Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial
2515         DNA.},
2516   journal = {J Mol Evol},
2517   year = {1985},
2518   volume = {22},
2519   pages = {160--174},
2520   number = {2},
2521   abstract = {A new statistical method for estimating divergence dates of species
2522         from DNA sequence data by a molecular clock approach is developed.
2523         This method takes into account effectively the information contained
2524         in a set of DNA sequence data. The molecular clock of mitochondrial
2525         DNA (mtDNA) was calibrated by setting the date of divergence between
2526         primates and ungulates at the Cretaceous-Tertiary boundary (65 million
2527         years ago), when the extinction of dinosaurs occurred. A generalized
2528         least-squares method was applied in fitting a model to mtDNA sequence
2529         data, and the clock gave dates of 92.3 +/- 11.7, 13.3 +/- 1.5, 10.9
2530         +/- 1.2, 3.7 +/- 0.6, and 2.7 +/- 0.6 million years ago (where the
2531         second of each pair of numbers is the standard deviation) for the
2532         separation of mouse, gibbon, orangutan, gorilla, and chimpanzee,
2533         respectively, from the line leading to humans. Although there is
2534         some uncertainty in the clock, this dating may pose a problem for
2535         the widely believed hypothesis that the pipedal creature Australopithecus
2536         afarensis, which lived some 3.7 million years ago at Laetoli in Tanzania
2537         and at Hadar in Ethiopia, was ancestral to man and evolved after
2538         the human-ape splitting. Another likelier possibility is that mtDNA
2539         was transferred through hybridization between a proto-human and a
2540         proto-chimpanzee after the former had developed bipedalism.},
2541   keywords = {Animals; Biological Evolution; DNA, Mitochondrial, genetics; Genes;
2542         Haplorhini, genetics; Humans; Mathematics; Models, Genetic; Nucleic
2543         Acid Hybridization; Primates, genetics; Proteins, genetics; Species
2544         Specificity},
2545   language = {eng},
2546   medline-pst = {ppublish},
2547   owner = {guyeux},
2548   pmid = {3934395},
2549   timestamp = {2011.05.05}
2550 }
2551
2552 @BOOK{R1994,
2553   title = {A First Course in Discrete Dynamical Systems},
2554   publisher = {Springer-Verlag},
2555   year = {1994},
2556   author = {R. Homlgren},
2557   optpages = {106},
2558   owner = {guyeux},
2559   timestamp = {2008.01.02}
2560 }
2561
2562 @INCOLLECTION{Hoque09,
2563   author = {Hoque, Md. and Chetty, Madhu and Sattar, Abdul},
2564   title = {Genetic Algorithm in Ab Initio Protein Structure Prediction Using
2565         Low Resolution Model: A Review},
2566   booktitle = {Biomedical Data and Applications},
2567   publisher = {Springer Berlin Heidelberg},
2568   year = {2009},
2569   editor = {Sidhu, Amandeep and Dillon, Tharam},
2570   volume = {224},
2571   series = {Studies in Computational Intelligence},
2572   pages = {317-342},
2573   affiliation = {IIIS, Griffith University, Nathan, QLD-4111 Australia}
2574 }
2575
2576 @CONFERENCE{Houmansadr09,
2577   author = {A. Houmansadr and N. Kiyavash and N. Borisov},
2578   title = {Rainbow: A robust and invisible non-blind watermark for network flows},
2579   booktitle = {NDSS’09: 16th Annual Network and Distributed System Security Symposium},
2580   year = {2009},
2581   owner = {christophe},
2582   timestamp = {2010.03.07}
2583 }
2584
2585 @ARTICLE{Huang,
2586   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J.},
2587   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2588   journal = {Wireless Networks},
2589   abstract = {Abstract\&nbsp;\&nbsp;This paper proposes a secure encrypted-data
2590         aggregation scheme for wireless sensor networks. Our design for data
2591         aggregation eliminates redundant sensor readings without using encryption
2592         and maintains data secrecy and privacy during transmission. Conventional
2593         aggregation functions operate when readings are received in plaintext.
2594         If readings are encrypted, aggregation requires decryption creating
2595         extra overhead and key management issues. In contrast to conventional
2596         schemes, our proposed scheme provides security and privacy, and duplicate
2597         instances of original readings will be aggregated into a single packet.
2598         Our scheme is resilient to known-plaintext attacks, chosen-plaintext
2599         attacks, ciphertext-only attacks and man-in-the-middle attacks. Our
2600         experiments show that our proposed aggregation method significantly
2601         reduces communication overhead and can be practically implemented
2602         in on-the-shelf sensor platforms.},
2603   citeulike-article-id = {4499496},
2604   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2605   citeulike-linkout-1 = {http://www.springerlink.com/content/g573138072642u63},
2606   doi = {10.1007/s11276-009-0177-y},
2607   posted-at = {2009-05-10 09:55:44},
2608   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y}
2609 }
2610
2611 @ARTICLE{Huang10,
2612   author = {Huang, Shih-I and Shieh, Shiuhpyng and Tygar, J. D.},
2613   title = {Secure encrypted-data aggregation for wireless sensor networks},
2614   journal = {Wirel. Netw.},
2615   year = {2010},
2616   volume = {16},
2617   pages = {915--927},
2618   number = {4},
2619   address = {Hingham, MA, USA},
2620   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/s11276-009-0177-y},
2621   issn = {1022-0038},
2622   publisher = {Kluwer Academic Publishers}
2623 }
2624
2625 @ARTICLE{W.2001,
2626   author = {W. Huang and X. Ye},
2627   title = {Homeomorphisms with the whole compacta being scrambled sets},
2628   journal = {Ergod. Th. Dynam. Systems},
2629   year = {2001},
2630   optnumber = {1},
2631   optpages = {77-91},
2632   optvolume = {21},
2633   owner = {guyeux},
2634   timestamp = {2008.01.02}
2635 }
2636
2637 @ARTICLE{Hurley1982,
2638   author = {M. Hurley},
2639   title = {Attractors, persistence and density of their bassin},
2640   journal = {Transactions of AMS},
2641   year = {1982},
2642   optpages = {247-271},
2643   optvolume = {269},
2644   owner = {guyeux},
2645   timestamp = {2008.01.02}
2646 }
2647
2648 @INPROCEEDINGS{Islam:2009:NMA:1695134.1695181,
2649   author = {Islam, Md. Kamrul and Chetty, Madhu},
2650   title = {Novel Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction},
2651   booktitle = {Proceedings of the 22nd Australasian Joint Conference on Advances
2652         in Artificial Intelligence},
2653   year = {2009},
2654   series = {AI '09},
2655   pages = {412--421},
2656   address = {Berlin, Heidelberg},
2657   publisher = {Springer-Verlag},
2658   acmid = {1695181},
2659   isbn = {978-3-642-10438-1},
2660   keywords = {Guided search space, Memetic Algorithm, Modified fitness function,
2661         Pair-wise-interchange, Schema preservation, Tabu Search},
2662   location = {Melbourne, Australia},
2663   numpages = {10}
2664 }
2665
2666 @PHDTHESIS{Jacquemard77,
2667   author = {C. Jacquemard},
2668   title = {Contribution à l'étude d'algorithmes à convergence monotone},
2669   school = {Université de Franche-Comté},
2670   year = {1977},
2671   owner = {christophe},
2672   timestamp = {2010.08.25}
2673 }
2674
2675 @BOOK{Jukes69,
2676   title = {{Evolution of Protein Molecules}},
2677   publisher = {Academy Press},
2678   year = {1969},
2679   editor = {Munro, H. N.},
2680   author = {Jukes, T. H. and Cantor, C. R.},
2681   booktitle = {Evolution of Protein Molecules},
2682   citeulike-article-id = {1673661},
2683   keywords = {compbio, fresco},
2684   posted-at = {2007-09-19 06:23:18},
2685   priority = {2}
2686 }
2687
2688 @INPROCEEDINGS{Kalker2001,
2689   author = {Kalker, T.},
2690   title = {Considerations on watermarking security},
2691   year = {2001},
2692   pages = {201--206},
2693   abstract = {In this paper we address the usually implicit assumption that digital
2694         watermarking has as its main target copyright and copy protection
2695         applications. From these target applications a great many conclusions
2696         are drawn about the required security of a watermarking system, and
2697         in fact, a considerably percentage of the watermarking literature
2698         has this very topic as its main focus of attention. In this paper
2699         we take a step back, and try to do a more careful analysis of the
2700         'watermarking-is-for-security-applications' paradigm. The intention
2701         of this paper is to discuss the meaning of the concept security in
2702         the context of watermarking, and try to show that one has to be careful
2703         in using analogies from the related field of cryptography},
2704   citeulike-article-id = {1226513},
2705   journal = {2001 IEEE Fourth Workshop on Multimedia Signal Processing},
2706   keywords = {security, wateramarking},
2707   owner = {guyeux},
2708   posted-at = {2007-04-14 14:30:06},
2709   priority = {2},
2710   timestamp = {2009.06.30}
2711 }
2712
2713 @ARTICLE{Kerckhoffs83,
2714   author = {Kerckhoffs, Auguste},
2715   title = {La cryptographie militaire},
2716   journal = {Journal des sciences militaires},
2717   year = {1883},
2718   volume = {IX},
2719   pages = {5--83},
2720   month = {January},
2721   abstract = {pp. 161–191, Feb. 1883.},
2722   citeulike-article-id = {505508},
2723   keywords = {cryptography, master},
2724   owner = {guyeux},
2725   posted-at = {2006-02-15 04:49:15},
2726   priority = {2},
2727   timestamp = {2009.06.30}
2728 }
2729
2730 @ARTICLE{Kimura80,
2731   author = {Kimura, Motoo},
2732   title = {A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions
2733         through comparative studies of nucleotide sequences},
2734   journal = {Journal of Molecular Evolution},
2735   year = {1980},
2736   volume = {16},
2737   pages = {111-120},
2738   note = {10.1007/BF01731581},
2739   affiliation = {National Institute of Genetics 411 Mishima Japan},
2740   issn = {0022-2844},
2741   issue = {2},
2742   keyword = {Biomedical and Life Sciences},
2743   publisher = {Springer New York},
2744   url = {http://dx.doi.org/10.1007/BF01731581}
2745 }
2746
2747 @ARTICLE{Knudsen94,
2748   author = {Knudsen},
2749   title = {Chaos Without Nonperiodicity},
2750   journal = {Amer. Math. Monthly},
2751   year = {1994},
2752   volume = {101},
2753   owner = {guyeux},
2754   timestamp = {27/01/2008}
2755 }
2756
2757 @PHDTHESIS{Knudsen1994a,
2758   author = {C. Knudsen},
2759   title = {Aspects of noninvertible dynamics and chaos},
2760   school = {Technical University of Denmark},
2761   year = {1994},
2762   owner = {guyeux},
2763   timestamp = {2008.01.02}
2764 }
2765
2766 @ARTICLE{Kocarev06,
2767   author = {L. Kocarev and J. Szczepanski and J.M. Amigo and I. Tomovski},
2768   title = {Discrete Chaos - I: Theory},
2769   journal = {IEEE Trans. on Circuits Systems},
2770   year = {2006},
2771   volume = {53},
2772   pages = {1300-1309},
2773   owner = {christophe},
2774   timestamp = {2010.10.10}
2775 }
2776
2777 @INPROCEEDINGS{Kocher95cryptanalysisof,
2778   author = {Paul C. Kocher},
2779   title = {Cryptanalysis of Diffie-Hellman, RSA, DSS, and Other Systems Using
2780         Timing Attacks (Extended Abstract)},
2781   booktitle = {Advances in Cryptology, CRYPTO '95: 15th Annual International Cryptology
2782         Conference},
2783   year = {1995},
2784   pages = {27--31},
2785   publisher = {Springer-Verlag}
2786 }
2787
2788 @ARTICLE{Kullback1951,
2789   author = {Kullback, Solomon and Leibler, Richard A.},
2790   title = {On Information and Sufficiency},
2791   journal = {The Annals of Mathematical Statistics},
2792   year = {1951},
2793   volume = {22},
2794   pages = {79--86},
2795   number = {1},
2796   citeulike-article-id = {3245942},
2797   keywords = {file-import-08-09-12},
2798   owner = {guyeux},
2799   posted-at = {2008-09-12 14:30:37},
2800   priority = {2},
2801   timestamp = {2009.06.29}
2802 }
2803
2804 @MISC{ledoux,
2805   author = {Eshter Ledoux},
2806   title = {Introduction à la théorie du chaos},
2807   year = {2002},
2808   note = {[En ligne; Page disponible le 12-août-2010]},
2809   url = {\url{http://www.nux.be/eledoux/mem/node1.html}}
2810 }
2811
2812 @BOOK{Lehning1997,
2813   title = {Analyse en dimension finie},
2814   publisher = {Masson},
2815   year = {1997},
2816   author = {Lehning},
2817   optpages = {28},
2818   optvolume = {4},
2819   owner = {guyeux},
2820   timestamp = {2008.01.02}
2821 }
2822
2823 @ARTICLE{Lenstra01,
2824   author = {A.K. Lenstra and E.R. Verheul},
2825   title = {Selecting Cryptographic Key Sizes},
2826   journal = {Jour. of the International Association for Cryptologic Research},
2827   year = {2001},
2828   volume = {14},
2829   pages = {255-293},
2830   number = {4}
2831 }
2832
2833 @ARTICLE{Pitts59,
2834   author = {Lettvin, J.Y. and Maturana, H.R. and McCulloch, W.S. and Pitts, W.H.},
2835   title = {What the Frog's Eye Tells the Frog's Brain},
2836   journal = {Proceedings of the IRE},
2837   year = {1959},
2838   volume = {47},
2839   pages = {1940--51},
2840   number = {11},
2841   owner = {christophe},
2842   timestamp = {2010.12.21}
2843 }
2844
2845 @ARTICLE{Li75,
2846   author = {T. Y. Li and J. A. Yorke},
2847   title = {Period three implies chaos},
2848   journal = {Amer. Math. Monthly},
2849   year = {1975},
2850   volume = {82},
2851   pages = {985--992},
2852   number = {10},
2853   owner = {guyeux},
2854   timestamp = {27/01/2008}
2855 }
2856
2857 @ARTICLE{Xiao10,
2858   author = {Li, Yantao and Deng, Shaojiang and Xiao, Di},
2859   title = {A novel Hash algorithm construction based on chaotic neural network},
2860   journal = {Neural Computing and Applications},
2861   year = {2010},
2862   pages = {1-9},
2863   affiliation = {Chongqing University College of Computer Science 400044 Chongqing
2864         China},
2865   issn = {0941-0643},
2866   keyword = {Computer Science},
2867   publisher = {Springer London}
2868 }
2869
2870 @INPROCEEDINGS{Lin09,
2871   author = {Lin, Hua-Yi and Chiang, Tzu-Chiang},
2872   title = {Cooperative secure data aggregation in sensor networks using elliptic
2873         curve based cryptosystems},
2874   booktitle = {CDVE'09: Proceedings of the 6th international conference on Cooperative
2875         design, visualization, and engineering},
2876   year = {2009},
2877   pages = {384--387},
2878   address = {Berlin, Heidelberg},
2879   publisher = {Springer-Verlag},
2880   isbn = {3-642-04264-3, 978-3-642-04264-5},
2881   location = {Luxembourg, Luxembourg}
2882 }
2883
2884 @INPROCEEDINGS{Liu2008,
2885   author = {Liu, An and Ning, Peng},
2886   title = {TinyECC: A Configurable Library for Elliptic Curve Cryptography in
2887         Wireless Sensor Networks},
2888   booktitle = {7th International Conference on Information Processing in Sensor
2889         Networks (IPSN 2008)},
2890   year = {2008},
2891   pages = {245--256},
2892   month = {April},
2893   citeulike-article-id = {3041699},
2894   howpublished = {SPOTS Track},
2895   keywords = {hagg},
2896   posted-at = {2008-07-25 05:25:05},
2897   priority = {2}
2898 }
2899
2900 @ARTICLE{Liu2007bis,
2901   author = {Shao-Hui Liu and Hong-Xun Yao and Wen Gao and Yong-Liang Liu},
2902   title = {An image fragile watermark scheme based on chaotic image pattern
2903         and pixel-pairs},
2904   journal = {Applied Mathematics and Computation},
2905   year = {2007},
2906   volume = {185},
2907   pages = {869-882},
2908   owner = {guyeux},
2909   timestamp = {2008.10.07}
2910 }
2911
2912 @INPROCEEDINGS{Liu07,
2913   author = {Liu, Zhen and Xi, Lifeng},
2914   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2915   booktitle = {KES '07: Knowledge-Based Intelligent Information and Engineering
2916         Systems and the XVII Italian Workshop on Neural Networks on Proceedings
2917         of the 11th International Conference},
2918   year = {2007},
2919   pages = {202--208},
2920   address = {Berlin, Heidelberg},
2921   publisher = {Springer-Verlag},
2922   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74827-4_26},
2923   isbn = {978-3-540-74826-7},
2924   location = {Vietri sul Mare, Italy}
2925 }
2926
2927 @ARTICLE{Liu2007,
2928   author = {Zhen Liu and Lifeng Xi},
2929   title = {Image Information Hiding Encryption Using Chaotic Sequence},
2930   journal = {LNAI},
2931   year = {2007},
2932   volume = {4693},
2933   pages = {202-208},
2934   owner = {guyeux},
2935   timestamp = {11/04/2008}
2936 }
2937
2938 @ARTICLE{Lubachevsky86,
2939   author = {Lubachevsky, Boris and Mitra, Debasis},
2940   title = {A chaotic asynchronous algorithm for computing the fixed point of
2941         a nonnegative matrix of unit spectral radius},
2942   journal = {J. ACM},
2943   year = {1986},
2944   volume = {33},
2945   pages = {130--150},
2946   number = {1},
2947   address = {New York, NY, USA},
2948   doi = {http://doi.acm.org/10.1145/4904.4801},
2949   issn = {0004-5411},
2950   publisher = {ACM}
2951 }
2952
2953 @ARTICLE{Larger10,
2954   author = {{L}arger, {L}. and {D}udley, {J}.{M}.},
2955   title = { {N}onlinear dynamics {O}ptoelectronic chaos},
2956   journal = {{N}ature },
2957   year = {2010},
2958   volume = {465 },
2959   pages = {41-42 },
2960   number = {7294 },
2961   month = {05},
2962   abstract = {{O}ptoelectronic circuits with delayed feedback provide a convenient
2963         bench-top platform to study a wide range of nonlinear dynamic systems,
2964         from ultrastable clocks to complex chaotic devices.},
2965   affiliation = {{F}ranche-{C}omt{\'e} {\'E}lectronique {M}{\'e}canique, {T}hermique
2966         et {O}ptique - {S}ciences et {T}echnologies - {FEMTO}-{ST} - {CNRS}
2967         : {UMR}6174 - {U}niversit{\'e} de {F}ranche-{C}omt{\'e} - {U}niversit{\'e}
2968         de {T}echnologie de {B}elfort-{M}ontbeliard - {E}cole {N}ationale
2969         {S}up{\'e}rieure de {M}{\'e}canique et des {M}icrotechniques },
2970   audience = {internationale },
2971   day = {05},
2972   doi = {10.1038/465041a },
2973   hal_id = {hal-00517696},
2974   language = {{A}nglais},
2975   url = {http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00517696/en/}
2976 }
2977
2978 @INPROCEEDINGS{Mahoney00,
2979   author = {Mahoney, Matthew V.},
2980   title = {Fast Text Compression with Neural Networks},
2981   booktitle = {Proceedings of the Thirteenth International Florida Artificial Intelligence
2982         Research Society Conference},
2983   year = {2000},
2984   pages = {230--234},
2985   publisher = {AAAI Press},
2986   acmid = {707654},
2987   isbn = {1-57735-113-4},
2988   numpages = {5}
2989 }
2990
2991 @INPROCEEDINGS{msp10:bl,
2992   author = {Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid and Pham, Congduc},
2993   title = {Risk Management in Intrusion Detection Applications with Wireless
2994         Video Sensor Networks},
2995   booktitle = {WCNC'10 IEEE Int. Conf.},
2996   year = {2010},
2997   pages = {***--***},
2998   address = {Sydney, Australia},
2999   month = apr,
3000   note = {To appear},
3001   classement = {*},
3002   equipe = {and},
3003   inhal = {no}
3004 }
3005
3006 @ARTICLE{Malvar03,
3007   author = {H.S. Malvar and D. Florêncio},
3008   title = {Improved Spread Spectrum: A New Modulation Technique for Robust Watermarking},
3009   journal = {IEEE Trans. Signal Proceeding},
3010   year = {2003},
3011   volume = {53},
3012   pages = {898--905},
3013   owner = {christophe},
3014   timestamp = {2010.03.07}
3015 }
3016
3017 @ARTICLE{Marsaglia2003,
3018   author = {G. Marsaglia},
3019   title = {Xorshift RNGs},
3020   journal = {Journal of Statistical Software},
3021   year = {2003},
3022   volume = {8(14)},
3023   pages = {1--6},
3024   owner = {qianxue},
3025   timestamp = {2009.10.28}
3026 }
3027
3028 @ARTICLE{Marsaglia1996,
3029   author = {G. Marsaglia},
3030   title = {DIEHARD: a battery of tests of randomness.},
3031   journal = {http://stat.fsu.edu/~geo/diehard.html},
3032   year = {1996},
3033   owner = {qianxue},
3034   timestamp = {2009.11.09}
3035 }
3036
3037 @ARTICLE{DefiningChaos,
3038   author = {M. Martelli and M. Dang and T. Seph},
3039   title = {Defining chaos},
3040   journal = {Mathematics Magazine},
3041   year = {1998},
3042   volume = {71},
3043   pages = {112--122},
3044   owner = {christophe},
3045   timestamp = {2010.08.11}
3046 }
3047
3048 @ARTICLE{Michel2007c,
3049   author = {Christian J Michel},
3050   title = {An analytical model of gene evolution with 9 mutation parameters:
3051         an application to the amino acids coded by the common circular code.},
3052   journal = {Bull Math Biol},
3053   year = {2007},
3054   volume = {69},
3055   pages = {677--698},
3056   number = {2},
3057   month = {Feb},
3058   abstract = {We develop here an analytical evolutionary model based on a trinucleotide
3059         mutation matrix 64 x 64 with nine substitution parameters associated
3060         with the three types of substitutions in the three trinucleotide
3061         sites. It generalizes the previous models based on the nucleotide
3062         mutation matrices 4 x 4 and the trinucleotide mutation matrix 64
3063         x 64 with three and six parameters. It determines at some time t
3064         the exact occurrence probabilities of trinucleotides mutating randomly
3065         according to these nine substitution parameters. An application of
3066         this model allows an evolutionary study of the common circular code
3067         [Formula: see text] of eukaryotes and prokaryotes and its 12 coded
3068         amino acids. The main property of this code [Formula: see text] is
3069         the retrieval of the reading frames in genes, both locally, i.e.
3070         anywhere in genes and in particular without a start codon, and automatically
3071         with a window of a few nucleotides. However, since its identification
3072         in 1996, amino acid information coded by [Formula: see text] has
3073         never been studied. Very unexpectedly, this evolutionary model demonstrates
3074         that random substitutions in this code [Formula: see text] and with
3075         particular values for the nine substitutions parameters retrieve
3076         after a certain time of evolution a frequency distribution of these
3077         12 amino acids very close to the one coded by the actual genes.},
3078   doi = {10.1007/s11538-006-9147-z},
3079   institution = {Equipe de Bioinformatique Théorique, LSIIT (UMR CNRS-ULP 7005), Université
3080         Louis Pasteur de Strasbourg, Pôle API, Boulevard Sébastien Brant,
3081         67400 Illkirch, France. michel@dpt-info.u-strasbg.fr},
3082   keywords = {Amino Acids, genetics; Codon, genetics; Eukaryotic Cells; Evolution,
3083         Molecular; Models, Genetic; Prokaryotic Cells},
3084   language = {eng},
3085   medline-pst = {ppublish},
3086   owner = {guyeux},
3087   pmid = {16952018},
3088   timestamp = {2011.05.05},
3089   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s11538-006-9147-z}
3090 }
3091
3092 @ARTICLE{Miellou75,
3093   author = {J.-C. Miellou},
3094   title = {Algorithmes de relaxation chaotique \`{a} retards},
3095   journal = {Rairo},
3096   year = {1975},
3097   volume = {R1},
3098   pages = {148-162},
3099   owner = {guyeux},
3100   timestamp = {2008.05.22}
3101 }
3102
3103 @ARTICLE{Miellou75b,
3104   author = {Miellou, J.-C.},
3105   title = {Itérations chaotiques à retards, étude de la convergence dans le
3106         cas d'espaces partiellement ordonnés},
3107   journal = {C.R.A.S. Paris},
3108   year = {1975},
3109   volume = {280},
3110   pages = {233--236},
3111   owner = {christophe},
3112   timestamp = {2010.08.17}
3113 }
3114
3115 @ARTICLE{Spiteri85,
3116   author = {Jean-Claude Miellou and Pierre Spitéri},
3117   title = {Un critère de convergence pour des méthodes générales de point fixe},
3118   journal = {Rairo -- Modélisation mathématique et analyse numérique},
3119   year = {1985},
3120   volume = {19},
3121   pages = {645--669},
3122   number = {4},
3123   owner = {christophe},
3124   timestamp = {2010.10.13}
3125 }
3126
3127 @ARTICLE{Mooney08,
3128   author = {Aidan Mooney and John G. Keating and Ioannis Pitas},
3129   title = {A comparative study of chaotic and white noise signals in digital
3130         watermarking},
3131   journal = {Chaos, Solitons and Fractals},
3132   year = {2008},
3133   volume = {35},
3134   pages = {913-921},
3135   owner = {christophe},
3136   timestamp = {2010.03.01}
3137 }
3138
3139 @ARTICLE{Nakashima2003,
3140   author = {Nakashima, Y. and Tachibana, R. and Babaguchi, N.},
3141   title = {Watermarked Movie Soundtrack Finds the Position of the Camcorder
3142         in a Theater},
3143   journal = {IEEE Transactions on Multimedia},
3144   year = {2009},
3145   note = {Accepted for future publication Multimedia}
3146 }
3147
3148 @INCOLLECTION{springerlink:10.1007/978-3-642-04431-1_16,
3149   author = {Nelson, Michael and Nahapetian, Ani and Koushanfar, Farinaz and Potkonjak,
3150         Miodrag},
3151   title = {SVD-Based Ghost Circuitry Detection},
3152   booktitle = {Information Hiding},
3153   publisher = {Springer Berlin / Heidelberg},
3154   year = {2009},
3155   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Sadeghi, Ahmad-Reza},
3156   volume = {5806},
3157   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3158   pages = {221-234},
3159   note = {10.1007/978-3-642-04431-1_16},
3160   affiliation = {Computer Science Department, UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA},
3161   url = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04431-1_16}
3162 }
3163
3164 @INPROCEEDINGS{Perez-Hernandez09,
3165   author = {P\'{e}rez-Hern\'{a}ndez, Luis Germ\'{a}n and Rodr\'{\i}guez-V\'{a}zquez,
3166         Katya and Gardu\~{n}o-Ju\'{a}rez, Ram\'{o}n},
3167   title = {Parallel particle swarm optimization applied to the protein folding
3168         problem},
3169   booktitle = {Proceedings of the 11th Annual conference on Genetic and evolutionary
3170         computation},
3171   year = {2009},
3172   series = {GECCO '09},
3173   pages = {1791--1792},
3174   address = {New York, NY, USA},
3175   publisher = {ACM},
3176   acmid = {1570163},
3177   isbn = {978-1-60558-325-9},
3178   keywords = {bioinformatics, biology and chemistry, combinatorial optimization,
3179         parallelization, swarm intelligence},
3180   location = {Montreal, Qu\&\#233;bec, Canada},
3181   numpages = {2}
3182 }
3183
3184 @PHDTHESIS{Pellegrin1986,
3185   author = {D. Pellegrin},
3186   title = {Algorithmique discr\`{e}te et r\'{e}seaux d'automates},
3187   school = {Grenoble},
3188   year = {1986},
3189   owner = {guyeux},
3190   timestamp = {2008.05.22}
3191 }
3192
3193 @ARTICLE{Peng2005,
3194   author = {F. Peng and S.-S. Qiu and M. Long},
3195   title = {One way Hash function construction based on two-dimensional hyperchaotic
3196         mappings},
3197   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3198   year = {2005},
3199   volume = {54},
3200   pages = {98--104},
3201   owner = {guyeux},
3202   timestamp = {2009.01.16}
3203 }
3204
3205 @INPROCEEDINGS{Perez06,
3206   author = {Luis Perez-Freire and F. Pérez-gonzalez and Pedro Comesaña},
3207   title = {Secret Dither Estimation in Lattice-Quantization Data Hiding: A Set-Membership
3208         Approach},
3209   booktitle = {Security, Steganography, and Watermarking of Multimedia Contents},
3210   year = {2006},
3211   editor = {Edward J. Delp and Ping W. Wong},
3212   address = {San Jose, California, USA},
3213   month = {January},
3214   organization = {SPIE},
3215   owner = {guyeux},
3216   timestamp = {2009.06.30}
3217 }
3218
3219 @INPROCEEDINGS{Perez-Freire06,
3220   author = {Luis Perez-Freire and Pedro Comesana and Juan Ramon Troncoso-Pastoriza
3221         and Fernando Perez-Gonzalez},
3222   title = {Watermarking Security: a Survey},
3223   booktitle = {LNCS Transactions on Data Hiding and Multimedia Security},
3224   year = {2006},
3225   owner = {guyeux},
3226   timestamp = {2009.06.29}
3227 }
3228
3229 @PROCEEDINGS{Peter07,
3230   title = {On Concealed Data Aggregation for WSNs},
3231   year = {2007},
3232   author = {Peter, Steffen and Piotrowski, Krzysztof and Langendoerfer, Peter},
3233   booktitle = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3234         4th IEEE},
3235   citeulike-article-id = {2281643},
3236   citeulike-linkout-0 = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45},
3237   citeulike-linkout-1 = {http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs\_all.jsp?arnumber=4199133},
3238   doi = {10.1109/CCNC.2007.45},
3239   journal = {Consumer Communications and Networking Conference, 2007. CCNC 2007.
3240         4th IEEE},
3241   keywords = {hagg},
3242   pages = {192--196},
3243   posted-at = {2008-01-23 19:36:19},
3244   priority = {3},
3245   url = {http://dx.doi.org/10.1109/CCNC.2007.45}
3246 }
3247
3248 @ARTICLE{pms11:ij,
3249   author = {Pham, Congduc and Makhoul, Abdallah and Saadi, Rachid},
3250   title = {Risk-based Adaptive Scheduling in Randomly Deployed Video Sensor
3251         Networks for Critical Surveillance Applications},
3252   journal = {Journal of Network and Computer Applications},
3253   year = {2011},
3254   volume = {*},
3255   pages = {***--***},
3256   number = {*},
3257   note = {Accepted manuscript. To appear},
3258   classement = {ACLI},
3259   equipe = {and},
3260   impact-factor = {1.111},
3261   inhal = {no},
3262   isi-acro = {J NETW COMPU APPL},
3263   publisher = {Springer}
3264 }
3265
3266 @MISC{Poe,
3267   author = {Edgar Alan Poe},
3268   title = {The Raven},
3269   month = {April},
3270   year = {1839},
3271   note = {American Museum (Baltimore)},
3272   owner = {christophe},
3273   timestamp = {2010.11.23}
3274 }
3275
3276 @ARTICLE{Perez-Freire2006:Security,
3277   author = {L. P{\'e}rez-Freire and F. P{\'e}rez-González and T. Furon and P.
3278         Comesaña},
3279   title = {Security of lattice-based data hiding against the known message attack},
3280   journal = {IEEE Trans. on Information Forensics and Security},
3281   year = {2006},
3282   volume = {1},
3283   pages = {421-439},
3284   number = {4},
3285   month = {dec},
3286   owner = {guyeux},
3287   timestamp = {2009.12.06}
3288 }
3289
3290 @MISC{Quisquater02sidechannel,
3291   author = {J-J. Quisquater and D. Samyde and Université Catholique De Louvain
3292         and Groupe Crypto},
3293   title = {Side Channel Cryptanalysis},
3294   year = {2002}
3295 }
3296
3297 @ARTICLE{Raynal2001,
3298   author = {Frédéric Raynal and Fabien A. P. Petitcolas and Caroline Fontaine},
3299   title = {Evaluation automatique des méthodes de tatouage},
3300   journal = {Traitement du signal},
3301   year = {2001},
3302   volume = {18},
3303   pages = {271-282},
3304   owner = {guyeux},
3305   timestamp = {2008.05.21}
3306 }
3307
3308 @MISC{rijmen05,
3309   author = {Vincent Rijmen and Elisabeth Oswald},
3310   title = {Update on SHA-1},
3311   howpublished = {Cryptology ePrint Archive, Report 2005/010},
3312   year = {2005},
3313   note = {\url{http://eprint.iacr.org/}}
3314 }
3315
3316 @BOOK{Robert,
3317   title = {Discrete Iterations, a Metric Study},
3318   publisher = {Springer-Verlag},
3319   year = {1986},
3320   editor = {Berlin Heidelberg New-York},
3321   author = {François Robert},
3322   volume = {6},
3323   series = {Series in Computational Mathematics}
3324 }
3325
3326 @BOOK{Robert1986,
3327   title = {Discrete Iterations: A Metric Study},
3328   year = {1986},
3329   editor = {Springer-Verlag},
3330   author = {F. Robert},
3331   volume = {6},
3332   series = {Springer Series in Computational Mathematics},
3333   owner = {guyeux},
3334   timestamp = {17/02/2008}
3335 }
3336
3337 @ARTICLE{Rudenko08,
3338   author = {Rudenko, O. and Snytkin, M.},
3339   title = {Image compression based on the neural network art},
3340   journal = {Cybernetics and Systems Analysis},
3341   year = {2008},
3342   volume = {44},
3343   pages = {797-802},
3344   affiliation = {Kharkov National University of Radio Electronics Kharkov Ukraine},
3345   issn = {1060-0396},
3346   issue = {6},
3347   keyword = {Computer Science},
3348   publisher = {Springer New York}
3349 }
3350
3351 @PHDTHESIS{Ruette2001,
3352   author = {Sylvie Ruette},
3353   title = {Chaos en dynamique topologique, en particulier sur l'intervalle,
3354         mesures d'entropie maximale},
3355   school = {Université d'Aix-Marseille II},
3356   year = {2001},
3357   optmonth = {Novembre},
3358   owner = {guyeux},
3359   timestamp = {2008.01.02}
3360 }
3361
3362 @MASTERSTHESIS{Saulnier02,
3363   author = {Boris Saulnier},
3364   title = {Entropie topologique},
3365   school = {DEA Sémantique, Preuves et Langages, Paris 7},
3366   year = {2002},
3367   owner = {christophe},
3368   timestamp = {2010.08.12}
3369 }
3370
3371 @ARTICLE{Schmitz2001,
3372   author = {Roland Schmitz},
3373   title = {Use of chaotic dynamical systems in cryptography},
3374   journal = {Journal of Franklin Institute},
3375   year = {2001},
3376   volume = {338},
3377   pages = {429-441},
3378   owner = {guyeux},
3379   timestamp = {17/02/2008}
3380 }
3381
3382 @BOOK{Schwartz80,
3383   title = {Analyse: topologie g\'{e}n\'{e}rale et analyse fonctionnelle},
3384   publisher = {Hermann},
3385   year = {1980},
3386   editor = {Hermann},
3387   author = {Laurent Schwartz},
3388   owner = {christophe},
3389   timestamp = {2010.09.15}
3390 }
3391
3392 @ARTICLE{Shannon49,
3393   author = {Shannon, Claude E.},
3394   title = {Communication Theory of Secrecy Systems},
3395   journal = {Bell Systems Technical Journal},
3396   year = {1949},
3397   volume = {28},
3398   pages = {656--715},
3399   citeulike-article-id = {507362},
3400   keywords = {master, secrecy\_systems, teoria-informacao, theory\_communication,
3401         theory\_cryptography},
3402   owner = {guyeux},
3403   posted-at = {2006-02-16 23:24:09},
3404   priority = {2},
3405   timestamp = {2009.06.29}
3406 }
3407
3408 @ARTICLE{Shmygelska05,
3409   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger},
3410   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3411         polar protein folding problem},
3412   journal = {BMC Bioinformatics},
3413   year = {2005},
3414   volume = {6},
3415   pages = {30},
3416   number = {1},
3417   abstract = {BACKGROUND:The protein folding problem is a fundamental problems in
3418         computational molecular biology and biochemical physics. Various
3419         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3420         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3421         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3422         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3423         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3424         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3425         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3426         simple model - the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3427         (HP) model.RESULTS:We present an improvement of our previous ACO
3428         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3429         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3430         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3431         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3432         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3433         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3434         a more diverse set of native conformations.CONCLUSIONS:The application
3435         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3436         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3437         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3438         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3439         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3440         for more complex and realistic models of protein structure holds
3441         significant promise.},
3442   doi = {10.1186/1471-2105-6-30},
3443   issn = {1471-2105},
3444   pubmedid = {15710037}
3445 }
3446
3447 @OTHER{Shmygelska2005Feb,
3448   __markedentry = {[christophe]},
3449   abstract = {Abstract Background The protein folding problem is a fundamental problems
3450         in computational molecular biology and biochemical physics. Various
3451         optimisation methods have been applied to formulations of the ab-initio
3452         folding problem that are based on reduced models of protein structure,
3453         including Monte Carlo methods, Evolutionary Algorithms, Tabu Search
3454         and hybrid approaches. In our work, we have introduced an ant colony
3455         optimisation (ACO) algorithm to address the non-deterministic polynomial-time
3456         hard (NP-hard) combinatorial problem of predicting a protein's conformation
3457         from its amino acid sequence under a widely studied, conceptually
3458         simple model – the 2-dimensional (2D) and 3-dimensional (3D) hydrophobic-polar
3459         (HP) model. Results We present an improvement of our previous ACO
3460         algorithm for the 2D HP model and its extension to the 3D HP model.
3461         We show that this new algorithm, dubbed ACO-HPPFP-3, performs better
3462         than previous state-of-the-art algorithms on sequences whose native
3463         conformations do not contain structural nuclei (parts of the native
3464         fold that predominantly consist of local interactions) at the ends,
3465         but rather in the middle of the sequence, and that it generally finds
3466         a more diverse set of native conformations. Conclusions The application
3467         of ACO to this bioinformatics problem compares favourably with specialised,
3468         state-of-the-art methods for the 2D and 3D HP protein folding problem;
3469         our empirical results indicate that our rather simple ACO algorithm
3470         scales worse with sequence length but usually finds a more diverse
3471         ensemble of native states. Therefore the development of ACO algorithms
3472         for more complex and realistic models of protein structure holds
3473         significant promise.},
3474   author = {Shmygelska, Alena and Hoos, Holger H},
3475   journal = {BMC Bioinformatics. 2005 Feb 14},
3476   number = {1},
3477   owner = {christophe},
3478   pages = {30},
3479   timestamp = {2011.01.24},
3480   title = {An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic
3481         polar protein folding problem},
3482   volume = {6},
3483   year = {2005 Feb}
3484 }
3485
3486 @ARTICLE{Shujun1,
3487   author = {Li Shujun and Li Qi and Li Wenmin and Mou Xuanqin and Cai Yuanlong},
3488   title = {Statistical Properties of Digital Piecewise Linear Chaotic Maps and
3489         Their Roles in Cryptography and Pseudo-Random Coding},
3490   journal = {Proceedings of the 8th IMA International Conference on Cryptography
3491         and Coding},
3492   year = {2001},
3493   volume = {1},
3494   pages = {205--221},
3495   owner = {christophe},
3496   timestamp = {2010.03.06}
3497 }
3498
3499 @INPROCEEDINGS{Simmons83,
3500   author = {Gustavus J. Simmons},
3501   title = {The Prisoners' Problem and the Subliminal Channel},
3502   booktitle = {Advances in Cryptology, Proc. CRYPTO'83},
3503   year = {1984},
3504   pages = {51--67},
3505   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3506   owner = {guyeux},
3507   timestamp = {2009.06.29}
3508 }
3509
3510 @ARTICLE{Solak2004389,
3511   author = {Ercan Solak},
3512   title = {On the security of a class of discrete-time chaotic cryptosystems},
3513   journal = {Physics Letters A},
3514   year = {2004},
3515   volume = {320},
3516   pages = {389 - 395},
3517   number = {5-6},
3518   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2003.11.008},
3519   issn = {0375-9601},
3520   keywords = {Communication using chaos},
3521   owner = {guyeux},
3522   timestamp = {2009.12.12},
3523   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4B22RC9-2/2/99a0af737c9b6ba8af47ae4d3c7a326d}
3524 }
3525
3526 @PHDTHESIS{Spiteri74,
3527   author = {Pierre Spitéri},
3528   title = {Contribution à l'étude de la stabilite au sens de liapounov de certains
3529         systemes differentiels non lineaires},
3530   school = {Université de Franche-Comté},
3531   year = {1974},
3532   owner = {christophe},
3533   timestamp = {2010.10.13}
3534 }
3535
3536 @BOOK{Stewart1989,
3537   title = {Does God Play Dices ?: the mathematics of chaos},
3538   publisher = {Penguin},
3539   year = {1989},
3540   author = {Ian Stewart},
3541   owner = {guyeux},
3542   timestamp = {2008.01.02}
3543 }
3544
3545 @BOOK{Stinson02,
3546   title = {Cryptography: Theory and Practice, Second Edition},
3547   publisher = {{Chapman \& Hall/CRC}},
3548   year = {2002},
3549   author = {Stinson, Douglas R.},
3550   month = {February},
3551   abstract = {{Douglas R. Stinson's <I>Cryptography: Theory and Practice</I> is
3552         a mathematically intensive examination of cryptography, including
3553         ciphers, the Data Encryption Standard (DES), public key cryptography,
3554         one-way hash functions, and digital signatures. Stinson's explication
3555         of "zero-sum proofs"--a process by which one person lets another
3556         person know that he or she has a password without actually revealing
3557         any information--is especially good.<P> If you are new to the math
3558         behind cryptography but want to tackle it, the author covers all
3559         of the required background to understand the real mathematics here.
3560         <I>Cryptography</I> includes extensive exercises with each chapter
3561         and makes an ideal introduction for any math-literate person willing
3562         to get acquainted with this material.} {<P>Major advances over the
3563         last five years precipitated this major revision of the bestselling
3564         Cryptography: Theory and Practice. With more than 40 percent new
3565         or updated material, the second edition now provides an even more
3566         comprehensive treatment of modern cryptography. It focuses on the
3567         new Advanced Encryption Standards and features an entirely new chapter
3568         on that subject. Another new chapter explores the applications of
3569         secret sharing schemes, including ramp schemes, visual cryptography,
3570         threshold cryptography, and broadcast encryption. This is an ideal
3571         introductory text for both computer science and mathematics students
3572         and a valuable reference for professionals.</P>}},
3573   citeulike-article-id = {2401855},
3574   day = {27},
3575   howpublished = {Hardcover},
3576   isbn = {1584882069},
3577   keywords = {security},
3578   posted-at = {2008-02-20 08:28:49},
3579   priority = {0},
3580   url = {http://www.amazon.com/exec/obidos/redirect?tag=citeulike07-20\&path=ASIN/1584882069}
3581 }
3582
3583 @INPROCEEDINGS{Takana90,
3584   author = {K. Tanaka and Y. Nakamura and K. Matsui},
3585   title = {Embedding Secret Information into a Dithered Multi-level Image},
3586   booktitle = {IEEE Military Communications Conference},
3587   year = {1990},
3588   owner = {christophe},
3589   timestamp = {2010.08.05}
3590 }
3591
3592 @PHDTHESIS{ElTarazi81,
3593   author = {M. N. El Tarazi},
3594   title = {Contraction et ordre partiel pour l'étude d'algorithmes synchrones
3595         et asynchrones en analyse numérique},
3596   school = {Faculté des Sciences et Techniques de l'Université de Franche-Comté,
3597         Besançon},
3598   year = {1981},
3599   owner = {christophe},
3600   timestamp = {2010.08.17}
3601 }
3602
3603 @INPROCEEDINGS{Unger93,
3604   author = {Unger, Ron and Moult, John},
3605   title = {Genetic Algorithm for 3D Protein Folding Simulations},
3606   booktitle = {Proceedings of the 5th International Conference on Genetic Algorithms},
3607   year = {1993},
3608   pages = {581--588},
3609   address = {San Francisco, CA, USA},
3610   publisher = {Morgan Kaufmann Publishers Inc.},
3611   acmid = {657747},
3612   isbn = {1-55860-299-2},
3613   numpages = {8}
3614 }
3615
3616 @MISC{Van93electronicwater,
3617   author = {Tirkel Rankin Van},
3618   title = {Electronic Water Mark},
3619   year = {1993}
3620 }
3621
3622 @ARTICLE{Venkatesan2007397,
3623   author = {R.C. Venkatesan},
3624   title = {Encryption of covert information into multiple statistical distributions},
3625   journal = {Physics Letters A},
3626   year = {2007},
3627   volume = {370},
3628   pages = {397 - 404},
3629   number = {5-6},
3630   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.05.117},
3631   issn = {0375-9601},
3632   keywords = {Statistical encryption/decryption},
3633   owner = {guyeux},
3634   timestamp = {2009.12.12},
3635   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4P4FV2M-1/2/cd11a2ec144526e3c4552d2a7e7906cc}
3636 }
3637
3638 @ARTICLE{pitas,
3639   author = {G. Voyatzis and I. Pitas},
3640   title = {Chaotic watermarks for embedding in the spatial digital image domain},
3641   journal = {Proceedings of IEEE ICIP},
3642   year = {1998},
3643   volume = {2},
3644   pages = {432-436},
3645   owner = {christophe},
3646   timestamp = {2010.03.06}
3647 }
3648
3649 @INCOLLECTION{Wagner03,
3650   author = {Wagner, David},
3651   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3652   booktitle = {Information Security},
3653   publisher = {Springer Berlin, Heidelberg},
3654   year = {2003},
3655   volume = {2851},
3656   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3657   pages = {234-239},
3658   abstract = {We use linear algebra to show that an algebraic privacy homomorphism
3659         proposed by Domingo-Ferrer is insecure for some parameter settings.},
3660   affiliation = {University of California, Berkeley USA}
3661 }
3662
3663 @INPROCEEDINGS{Wagner03cryptanalysisof,
3664   author = {David Wagner},
3665   title = {Cryptanalysis of an Algebraic Privacy Homomorphism},
3666   booktitle = {Proc. Sixth Information Security Conf. (ISC03},
3667   year = {2003},
3668   pages = {234--239}
3669 }
3670
3671 @ARTICLE{Wang_ellipticcurve,
3672   author = {Haodong Wang and Bo Sheng and Qun Li},
3673   title = {Elliptic curve cryptography-based access control in sensor networks},
3674   journal = {Int. J. Security and Networks}
3675 }
3676
3677 @INPROCEEDINGS{wbg10:ip,
3678   author = {Wang, Qianxue and Bahi, Jacques and Guyeux, Christophe and Fang,
3679         Xiaole},
3680   title = {Randomness quality of {CI} chaotic generators. Application to Internet
3681         security},
3682   booktitle = {INTERNET'2010. The 2nd Int. Conf. on Evolving Internet},
3683   year = {2010},
3684   pages = {125--130},
3685   address = {Valencia, Spain},
3686   month = sep,
3687   publisher = {IEEE Computer Society Press},
3688   note = {Best Paper award},
3689   classement = {ACTI},
3690   domainehal = {INFO:INFO_DC, INFO:INFO_CR, INFO:INFO_MO},
3691   equipe = {and},
3692   inhal = {no}
3693 }
3694
3695 @ARTICLE{Wang2003,
3696   author = {X. M. Wang and J. S. Zhang and W. F. Zhang},
3697   title = {One-way hash function construction based on the extended chaotic
3698         maps switch},
3699   journal = {Acta Phys. Sinici.},
3700   year = {2003},
3701   volume = {52, No. 11},
3702   pages = {2737--2742},
3703   owner = {guyeux},
3704   timestamp = {2009.01.16}
3705 }
3706
3707 @ARTICLE{Girao06,
3708   author = {Westhoff, Dirk and Girao, Joao and Acharya, Mithun},
3709   title = {Concealed Data Aggregation for Reverse Multicast Traffic in Sensor
3710         Networks: Encryption, Key Distribution, and Routing Adaptation},
3711   journal = {IEEE Transactions on Mobile Computing},
3712   year = {2006},
3713   volume = {5},
3714   pages = {1417--1431},
3715   number = {10},
3716   address = {Piscataway, NJ, USA},
3717   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/TMC.2006.144},
3718   issn = {1536-1233},
3719   publisher = {IEEE Educational Activities Department}
3720 }
3721
3722 @MISC{web:lyapunov,
3723   author = {Wikipédia},
3724   title = {Exposant de Lyapunov -- Site web d'André Lévesque},
3725   year = {2010},
3726   note = {[En ligne; Page disponible le 9-septembre-2010]},
3727   url = {\url{http://math.cmaisonneuve.qc.ca/alevesque/chaos_fract/Lyapunov/Exposant.html}}
3728 }
3729
3730 @MISC{wiki:complet,
3731   author = {Wikipédia},
3732   title = {Espace complet --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3733   year = {2010},
3734   note = {[En ligne; Page disponible le 9-août-2010]},
3735   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Espace_complet&oldid=52734266}}
3736 }
3737
3738 @MISC{wiki:densite,
3739   author = {Wikipédia},
3740   title = {Densité (mathématiques) --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3741   year = {2010},
3742   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3743   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Densit%C3%A9_(math%C3%A9matiques)&oldid=53938121}}
3744 }
3745
3746 @MISC{wiki:fisher,
3747   author = {Wikipédia},
3748   title = {Information de Fisher --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3749   year = {2010},
3750   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3751   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Information_de_Fisher&oldid=52877871}}
3752 }
3753
3754 @MISC{wiki:Kerkhoffs,
3755   author = {Wikipédia},
3756   title = {Principe de Kerckhoffs --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3757   year = {2010},
3758   note = {[En ligne; Page disponible le 20-août-2010]},
3759   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Principe_de_Kerckhoffs&oldid=52133114}}
3760 }
3761
3762 @MISC{wiki:sarkovskii,
3763   author = {Wikipédia},
3764   title = {Théorème de Sarkovskii --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3765   year = {2010},
3766   note = {[En ligne; Page disponible le 8-août-2010]},
3767   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Th%C3%A9or%C3%A8me_de_Sarkovskii&oldid=54196167}}
3768 }
3769
3770 @MISC{wiki:steganographie,
3771   author = {Wikipédia},
3772   title = {Stéganographie --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3773   year = {2010},
3774   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3775   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=St%C3%A9ganographie&oldid=54724435}}
3776 }
3777
3778 @MISC{wiki:tatouage,
3779   author = {Wikipédia},
3780   title = {Tatouage numérique --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3781   year = {2010},
3782   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3783   url = {https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Tatouage_num%C3%A9rique&oldid=55484940}
3784 }
3785
3786 @MISC{wiki:testsHypothese,
3787   author = {Wikipédia},
3788   title = {Test d'hypothèse --- Wikipédia{,} l'encyclopédie libre},
3789   year = {2010},
3790   note = {[En ligne; Page disponible le 5-août-2010]},
3791   url = {\url{https://secure.wikimedia.org/wikipedia/fr/w/index.php?title=Test_d%27hypoth%C3%A8se&oldid=55344108}}
3792 }
3793
3794 @ARTICLE{Wu2007bis,
3795   author = {Xianyong Wu and Zhi-Hong Guan},
3796   title = {A novel digital watermark algorithm based on chaotic maps},
3797   journal = {Physics Letters A},
3798   year = {2007},
3799   volume = {365},
3800   pages = {403 - 406},
3801   number = {5-6},
3802   doi = {DOI: 10.1016/j.physleta.2007.01.034},
3803   issn = {0375-9601},
3804   keywords = {Watermarking},
3805   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TVM-4MY0MF3-8/2/0b4d1298fa84337d2e59b3fefe26f583}
3806 }
3807
3808 @INPROCEEDINGS{Wu2007,
3809   author = {Wu, Xianyong and Guan, Zhi-Hong and Wu, Zhengping},
3810   title = {A Chaos Based Robust Spatial Domain Watermarking Algorithm},
3811   booktitle = {ISNN '07: Proceedings of the 4th international symposium on Neural
3812         Networks},
3813   year = {2007},
3814   pages = {113--119},
3815   address = {Berlin, Heidelberg},
3816   publisher = {Springer-Verlag},
3817   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-72393-6_15},
3818   isbn = {978-3-540-72392-9},
3819   location = {Nanjing, China}
3820 }
3821
3822 @ARTICLE{Xiao20092288,
3823   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3824   title = {Parallel keyed hash function construction based on chaotic neural
3825         network},
3826   journal = {Neurocomputing},
3827   year = {2009},
3828   volume = {72},
3829   pages = {2288 - 2296},
3830   number = {10-12},
3831   note = {Lattice Computing and Natural Computing (JCIS 2007) / Neural Networks
3832         in Intelligent Systems Designn (ISDA 2007)},
3833   abstract = {Recently, various hash functions based on chaos or neural networks
3834         were proposed. Nevertheless, none of them works efficiently in parallel
3835         computing environment. In this paper, an algorithm for parallel keyed
3836         hash function construction based on chaotic neural network is proposed.
3837         The mechanism of changeable-parameter and self-synchronization establishes
3838         a close relation between the hash value bit and message, and the
3839         algorithm structure ensures the uniform sensitivity of the hash value
3840         to the message blocks at different positions. The proposed algorithm
3841         can satisfy the performance requirements of hash function. These
3842         properties make it a promising choice for hashing on parallel computing
3843         platform.},
3844   issn = {0925-2312},
3845   keywords = {Chaotic neural network}
3846 }
3847
3848 @ARTICLE{Xiao20094346,
3849   author = {Di Xiao and Xiaofeng Liao and Yong Wang},
3850   title = {Improving the security of a parallel keyed hash function based on
3851         chaotic maps},
3852   journal = {Physics Letters A},
3853   year = {2009},
3854   volume = {373},
3855   pages = {4346 - 4353},
3856   number = {47},
3857   issn = {0375-9601},
3858   keywords = {Hash function},
3859   owner = {guyeux},
3860   timestamp = {2009.12.12}
3861 }
3862
3863 @ARTICLE{Xiao20102254,
3864   author = {Di Xiao and Frank Y. Shih and Xiaofeng Liao},
3865   title = {A chaos-based hash function with both modification detection and
3866         localization capabilities},
3867   journal = {Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation},
3868   year = {2010},
3869   volume = {15},
3870   pages = {2254 - 2261},
3871   number = {9},
3872   abstract = {Recently, a variety of chaos-based hash functions have been proposed.
3873         Nevertheless, none of them can realize modification localization.
3874         In this paper, a hash function with both modification detection and
3875         localization capabilities is proposed, which can also support the
3876         parallel processing mode. By using the mechanism of changeable-parameter
3877         and self-synchronization, the keystream can establish a close relation
3878         with the algorithm key, the content, and the order of each message
3879         unit. Theoretical analysis and computer simulation indicate that
3880         the proposed algorithm can satisfy the performance requirements of
3881         hash functions.},
3882   issn = {1007-5704},
3883   keywords = {Hash function}
3884 }
3885
3886 @INPROCEEDINGS{Yu06,
3887   author = {Yu, Yu and Leiwo, Jussipekka and Premkumar, Benjamin},
3888   title = {A Study on the Security of Privacy Homomorphism},
3889   booktitle = {ITNG '06: Proceedings of the Third International Conference on Information
3890         Technology: New Generations},
3891   year = {2006},
3892   pages = {470--475},
3893   address = {Washington, DC, USA},
3894   publisher = {IEEE Computer Society},
3895   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/ITNG.2006.19},
3896   isbn = {0-7695-2497-4}
3897 }
3898
3899 @ARTICLE{Zhang2008658,
3900   author = {Wei Zhang and Yonghe Liu and Sajal K. Das and Pradip De},
3901   title = {Secure data aggregation in wireless sensor networks: A watermark
3902         based authentication supportive approach},
3903   journal = {Pervasive and Mobile Computing},
3904   year = {2008},
3905   volume = {4},
3906   pages = {658 - 680},
3907   number = {5},
3908   doi = {DOI: 10.1016/j.pmcj.2008.05.005},
3909   issn = {1574-1192},
3910   keywords = {Wireless sensor networks},
3911   url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/B7MF1-4SKB3MD-1/2/b73948dcaa3eb63a2c21d09041882625}
3912 }
3913
3914 @ARTICLE{Zhang2005,
3915   author = {Zhang, Yang and Arakaki, Adrian K. and Skolnick, Jeffrey},
3916   title = {TASSER: An automated method for the prediction of protein tertiary
3917         structures in CASP6},
3918   journal = {Proteins},
3919   year = {2005},
3920   volume = {61},
3921   pages = {91--98},
3922   number = {S7},
3923   issn = {1097-0134},
3924   keywords = {comparative modeling, threading, ab initio prediction, TASSER, PROSPECTOR_3},
3925   owner = {christophe},
3926   publisher = {Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company},
3927   timestamp = {2011.01.22},
3928   url = {http://dx.doi.org/10.1002/prot.20724}
3929 }
3930
3931 @ARTICLE{Zhou1997429,
3932   author = {Chang-song Zhou and Tian-lun Chen},
3933   title = {Extracting information masked by chaos and contaminated with noise:
3934         Some considerations on the security of communication approaches using
3935         chaos},
3936   journal = {Physics Letters A},
3937   year = {1997},
3938   volume = {234},
3939   pages = {429 - 435},
3940   number = {6},
3941   issn = {0375-9601},
3942   keywords = {Communication},
3943   owner = {guyeux},
3944   timestamp = {2009.12.12}
3945 }
3946
3947 @ARTICLE{Zhou96,
3948   author = {Zhou, Huai-bei and Wang, Lu},
3949   title = {Chaos in Biomolecular Dynamics},
3950   journal = {The Journal of Physical Chemistry},
3951   year = {1996},
3952   volume = {100},
3953   pages = {8101-8105},
3954   number = {20},
3955   doi = {10.1021/jp953409x}
3956 }
3957
3958 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iwdw/2005,
3959   title = {IWDW'05: 4th International Workshop on Digital Watermarking},
3960   year = {2005},
3961   editor = {Mauro Barni and Ingemar J. Cox and Ton Kalker and Hyoung Joong Kim},
3962   volume = {3710},
3963   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3964   address = {Siena, Italy},
3965   publisher = {Springer},
3966   month = {September 15-17},
3967   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3968   booktitle = {IWDW},
3969   isbn = {3-540-28768-X},
3970   owner = {guyeux},
3971   timestamp = {2009.06.29}
3972 }
3973
3974 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2006,
3975   title = {IH 2006: Information Hiding, 8th International Workshop},
3976   year = {2007},
3977   editor = {Jan Camenisch and Christian S. Collberg and Neil F. Johnson and Phil
3978         Sallee},
3979   volume = {4437},
3980   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3981   address = {Alexandria, VA, USA},
3982   publisher = {Springer},
3983   month = {July},
3984   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
3985   booktitle = {Information Hiding},
3986   isbn = {978-3-540-74123-7},
3987   owner = {guyeux},
3988   timestamp = {2009.06.29}
3989 }
3990
3991 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/2007,
3992   title = {Information Hiding, 9th International Workshop, IH 2007, Saint Malo,
3993         France, June 11-13, 2007, Revised Selected Papers},
3994   year = {2008},
3995   editor = {Teddy Furon and Fran\c{c}ois Cayre and Gwena{\"e}l J. Do{\"e}rr and
3996         Patrick Bas},
3997   volume = {4567},
3998   series = {Lecture Notes in Computer Science},
3999   publisher = {Springer},
4000   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4001   booktitle = {Information Hiding},
4002   isbn = {978-3-540-77369-6},
4003   owner = {guyeux},
4004   timestamp = {2009.06.29}
4005 }
4006
4007 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/iccsa/2006-1,
4008   title = {Computational Science and Its Applications - ICCSA 2006, International
4009         Conference, Glasgow, UK, May 8-11, 2006, Proceedings, Part I},
4010   year = {2006},
4011   editor = {Marina L. Gavrilova and Osvaldo Gervasi and Vipin Kumar and Chih
4012         Jeng Kenneth Tan and David Taniar and Antonio Lagan{\`a} and Youngsong
4013         Mun and Hyunseung Choo},
4014   volume = {3980},
4015   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4016   publisher = {Springer},
4017   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4018   booktitle = {ICCSA (1)},
4019   isbn = {3-540-34070-X}
4020 }
4021
4022 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/secrypt/2010,
4023   title = {SECRYPT 2010 - Proceedings of the International Conference on Security
4024         and Cryptography, Athens, Greece, July 26-28, 2010, SECRYPT is part
4025         of ICETE - The International Joint Conference on e-Business and Telecommunications},
4026   year = {2010},
4027   editor = {Sokratis K. Katsikas and Pierangela Samarati},
4028   publisher = {SciTePress},
4029   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4030   booktitle = {SECRYPT},
4031   isbn = {978-989-8425-18-8}
4032 }
4033
4034 @BOOK{Katzenbeisser00,
4035   title = {Information Hiding Techniques for Steganography and Digital Watermarking},
4036   publisher = {Artech House, Inc.},
4037   year = {2000},
4038   editor = {Katzenbeisser, Stefan and Petitcolas, Fabien A.},
4039   address = {Norwood, MA, USA},
4040   isbn = {1580530354}
4041 }
4042
4043 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/ih/1999,
4044   title = {IH'99: 3rd International Workshop on Information Hiding},
4045   year = {2000},
4046   editor = {Andreas Pfitzmann},
4047   volume = {1768},
4048   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4049   address = {Dresden, Germany},
4050   publisher = {Springer},
4051   month = {September 29 - October 1.},
4052   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4053   booktitle = {Information Hiding},
4054   isbn = {3-540-67182-X},
4055   owner = {guyeux},
4056   timestamp = {2009.06.29}
4057 }
4058
4059 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/indocrypt/2000,
4060   title = {Progress in Cryptology - INDOCRYPT 2000, First International Conference
4061         in Cryptology in India, Calcutta, India, December 10-13, 2000, Proceedings},
4062   year = {2000},
4063   editor = {Bimal K. Roy and Eiji Okamoto},
4064   volume = {1977},
4065   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4066   publisher = {Springer},
4067   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4068   booktitle = {INDOCRYPT},
4069   isbn = {3-540-41452-5}
4070 }
4071
4072 @BOOK{DBLP:reference/icsec/2010,
4073   title = {Handbook of Information and Communication Security},
4074   publisher = {Springer},
4075   year = {2010},
4076   editor = {Peter P. Stavroulakis and Mark Stamp},
4077   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4078   booktitle = {Handbook of Information and Communication Security},
4079   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-04117-4},
4080   isbn = {978-3-642-04116-7}
4081 }
4082
4083 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/isnn/2004-2,
4084   title = {Advances in Neural Networks - ISNN 2004, International Symposium
4085         on Neural Networks, Dalian, China, August 19-21, 2004, Proceedings,
4086         Part II},
4087   year = {2004},
4088   editor = {Fuliang Yin and Jun Wang and Chengan Guo},
4089   volume = {3174},
4090   series = {Lecture Notes in Computer Science},
4091   publisher = {Springer},
4092   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4093   booktitle = {ISNN (2)},
4094   isbn = {3-540-22843-8}
4095 }
4096
4097 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/adhocnets/2010,
4098   title = {Ad Hoc Networks - Second International Conference, ADHOCNETS 2010,
4099         Victoria, BC, Canada, August 18-20, 2010, Revised Selected Papers},
4100   year = {2010},
4101   editor = {Jun Zheng and David Simplot-Ryl and Victor C. M. Leung},
4102   volume = {49},
4103   series = {Lecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social Informatics
4104         and Telecommunications Engineering},
4105   publisher = {Springer},
4106   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4107   booktitle = {ADHOCNETS},
4108   ee = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-17994-5},
4109   isbn = {978-3-642-17993-8}
4110 }
4111
4112 @INPROCEEDINGS{,
4113   owner = {guyeux},
4114   timestamp = {2011.03.29}
4115 }
4116
4117 @MISC{Delicious,
4118   title = {Delicious social bookmarking, http://delicious.com/},
4119   comment = {http://delicious.com/},
4120   type = {web page},
4121   url = {http://delicious.com/}
4122 }
4123
4124 @MISC{Frick,
4125   title = {The Frick Collection, http://www.frick.org/},
4126   comment = {http://www.frick.org/},
4127   type = {web page},
4128   url = {http://www.frick.org/}
4129 }
4130
4131 @PROCEEDINGS{2010,
4132   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4133         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4134   year = {2010},
4135   publisher = {IEEE},
4136   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4137   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4138 }
4139
4140 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cec/2010,
4141   title = {Proceedings of the IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC
4142         2010, Barcelona, Spain, 18-23 July 2010},
4143   year = {2010},
4144   publisher = {IEEE},
4145   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4146   booktitle = {IEEE Congress on Evolutionary Computation}
4147 }
4148
4149 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/date/2010,
4150   title = {Design, Automation and Test in Europe, DATE 2010, Dresden, Germany,
4151         March 8-12, 2010},
4152   year = {2010},
4153   publisher = {IEEE},
4154   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4155   booktitle = {DATE}
4156 }
4157
4158 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/cse/2009,
4159   title = {Proceedings IEEE CSE'09, 12th IEEE International Conference on Computational
4160         Science and Engineering, August 29-31, 2009, Vancouver, BC, Canada},
4161   year = {2009},
4162   publisher = {IEEE Computer Society},
4163   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4164   booktitle = {CSE}
4165 }
4166
4167 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/icumt/2009,
4168   title = {Proceedings of the International Conference on Ultra Modern Telecommunications,
4169         ICUMT 2009, 12-14 October 2009, St. Petersburg, Russia},
4170   year = {2009},
4171   publisher = {IEEE},
4172   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4173   booktitle = {ICUMT}
4174 }
4175
4176 @PROCEEDINGS{DBLP:conf/focs/2008,
4177   title = {49th Annual IEEE Symposium on Foundations of Computer Science, FOCS
4178         2008, October 25-28, 2008, Philadelphia, PA, USA},
4179   year = {2008},
4180   publisher = {IEEE Computer Society},
4181   bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de},
4182   booktitle = {FOCS}
4183 }
4184
4185 @comment{jabref-meta: selector_publisher:}
4186
4187 @comment{jabref-meta: selector_author:}
4188
4189 @comment{jabref-meta: selector_journal:}
4190
4191 @comment{jabref-meta: selector_keywords:Chaos;Entropie Topologique;Tip
4192 e;}
4193